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人类白细胞抗原新等位基因DQB1*06:436和DQB1*02:108的序列分析和确认
1
作者 王满妮 王小芳 +5 位作者 王天菊 尚利侠 陈乐 李昱辉 张嫄 齐珺 《中国组织工程研究》 北大核心 2026年第7期1782-1789,共8页
背景:人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)系统具有高度遗传多态性,在抗原呈递、免疫识别中发挥重要作用,主要应用于造血干细胞移植和器官移植供受者选择、群体遗传学、输血医学等领域。目的:对新等位基因HLA-DQB1*06:436和HLA... 背景:人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)系统具有高度遗传多态性,在抗原呈递、免疫识别中发挥重要作用,主要应用于造血干细胞移植和器官移植供受者选择、群体遗传学、输血医学等领域。目的:对新等位基因HLA-DQB1*06:436和HLA-DQB1*02:108进行确认并分析核苷酸序列。方法:应用DNA测序分型技术对2019年中国造血干细胞捐献者进行入库HLA检测,发现2个样本DQB1位点无完全匹配的等位基因,采用二代测序方法对2个样本的DQB1位点进行序列确认,分析核苷酸差异。结果与结论:样本1 DQB1位点与其同源性最高的HLA-DQB1*06:79:01相比,在第2外显子205位碱基由T替换为G,导致第37位氨基酸由酪氨酸(Tyr)变为天冬氨酸(Asp)。样本2 DQB1位点与其同源性最高的HLA-DQB1*02:01:01:01相比,第3外显子485位碱基发生了G>A突变,第130位氨基酸由精氨酸(Arg)变为谷氨酰胺(Gln)。实验验证2个等位基因均为HLA-DQB1新等位基因,分别被世界卫生组织HLA因子命名委员会命名为HLA-DQ B1*06:436和HLA-DQB1*02:108。 展开更多
关键词 人类白细胞抗原 基因分型 新等位基因 碱基突变 SBT NGS DQB1
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上海市结核分枝杆菌利福平rpoB基因突变特征与耐药水平相关性的研究
2
作者 李静 张阳奕 +7 位作者 杨景卉 吴哲渊 李宁迪 郁晨蕾 王莉莉 沈旭辉 江渊 沈鑫 《中国防痨杂志》 北大核心 2026年第4期485-494,共10页
目的:了解上海市结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)利福平(rifampicin,RFP)rpoB基因突变特征,探索rpoB基因突变类型与利福平耐药水平的关联。方法:选取2020—2022年上海市新登记且培养阳性的肺结核患者菌株,采用简单随机抽... 目的:了解上海市结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)利福平(rifampicin,RFP)rpoB基因突变特征,探索rpoB基因突变类型与利福平耐药水平的关联。方法:选取2020—2022年上海市新登记且培养阳性的肺结核患者菌株,采用简单随机抽样法,对2766株MTB进行最低抑菌浓度(minimal inhibitory concentration,MIC)法药物敏感性试验(简称“药敏试验”),排除重复及试验失败样本后2734株获得有效表型药敏试验结果。进一步从其中纳入462例肺结核患者(176例复治患者及286例初治患者)的菌株进行全基因组测序(whole genome sequencing,WGS),排除12株不合格样本,最终450株MTB纳入RFP耐药基因突变分析。采用Wilcoxon秩和检验分析利福平rpoB基因突变特征与RFP耐药的相关性。结果:450株临床MTB菌株中,139株菌株(包括8株RFP敏感株、18株RFP低水平耐药株和113株RFP高水平耐药株)发生了RFP耐药基因突变,其中95.68%(133/139)的突变发生在利福平rpoB基因的耐药决定区(rifampin resistance-determining region,RRDR)。利福平rpoB基因突变主要位于450、445及435密码子,突变频率分别为60.43%(84/139)、21.58%(30/139)和7.91%(11/139)。Wilcoxon秩和检验结果显示,利福平rpoB基因突变中rpoB_p.Ser450Leu、rpoB_p.Ser450Trp、rpoB_p.His445Asp、rpoB_p.His445Tyr、rpoB_p.Asp435Gly、rpoB_p.Asp435Val、rpoB_p.Asp435Tyr和rpoB_p.Leu452Pro突变均与RFP耐药有显著相关性(P值均<0.05),其中rpoB_p.Ser450Leu、rpoB_p.Ser450Trp、rpoB_p.His445Asp、rpoB_p.His445Tyr和rpoB_p.Asp435Val突变株MIC值中位数均>16μg/ml,表现为高水平耐药;rpoB_p.Asp435Gly、rpoB_p.Asp435Tyr和rpoB_p.Leu452Pro突变株MIC值中位数分别为4μg/ml、1μg/ml和4μg/ml,表现为低水平耐药。在多重密码子突变的RFP耐药株中,70.59%(12/17)的rpoB RRDR突变同时伴有rpoA、rpoC补偿性突变或rpoB non-RRDR突变,所有多重密码子突变株均表现为高水平耐药(MIC>16μg/ml)。对450株MTB菌株的谱系分析结果显示以L2谱系为主,为占88.44%(398/450),L4谱系占10.90%(49/450),L1谱系最少仅0.44%(2/450),检出1株(0.22%)L2和L42种谱系混合株;在RFP耐药菌株中,L2谱系占比更高,92.09%(128/139),L4谱系占7.19%(10/139),未检出L1谱系耐药株。分析亚谱系分布发现,L2谱系以L2.2.1亚谱系为主(55.78%,251/450),而L4谱系则以L4.4.2和L4.5亚谱系为主,分别占4.00%(18/450)和3.56%(16/450)。结论:上海市MTB不同利福平rpoB基因突变类型可导致RFP耐药水平不同。rpoB_p.Ser450Leu、rpoB_p.Ser450Trp、rpoB_p.His445Asp、rpoB_p.His445Tyr和rpoB_p.Asp435Val突变类型均与RFP高水平耐药相关;rpoB_p.Asp435Gly、rpoB_p.Asp435Tyr和rpoB_p.Leu452Pro突变类型均与RFP低水平耐药相关;多重密码子突变尤其携带补偿性突变可能协同增强RFP耐药水平。 展开更多
关键词 分枝杆菌 结核 利福平 突变 基因组 微生物敏感性试验
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基于全基因组测序的青海省结核分枝杆菌耐药基因突变特征分析
3
作者 王朝才 钱骏 +4 位作者 刘巧 徐莉立 蒋明霞 晁秀珍 刘燕 《中国热带医学》 北大核心 2026年第3期350-358,共9页
目的揭示青海省结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,Mtb)的群体结构、耐药特征及传播动态,为该地区高负担结核病精准防控提供分子流行病学依据。方法纳入2015—2024年间青海省194例结核病患者临床分离菌株,采用全基因组测序(whole... 目的揭示青海省结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,Mtb)的群体结构、耐药特征及传播动态,为该地区高负担结核病精准防控提供分子流行病学依据。方法纳入2015—2024年间青海省194例结核病患者临床分离菌株,采用全基因组测序(whole genome sequencing,WGS)技术,通过核心基因组单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)分析,对菌株进行谱系分型、耐药基因突变检测,并构建系统发育树以评估遗传聚类和近期传播事件。结果青海省Mtb菌株总体耐药率为30.4%(59/194),其中单耐药、耐多药(multidrug-resistant tuberculosis,MDR-TB)和准广泛耐药(pre-extensively drug-resistant tuberculosis,Pre-XDR-TB)分别占21.6%、4.1%和0.5%,以链霉素耐药率最高(15.5%)。群体遗传结构分析显示,谱系2(L2)是绝对优势谱系(83.2%,159/191),其中L2.2.1亚谱系最为流行(66.5%)。WGS检测出启动子区突变、非同义突变(氨基酸改变)和同义突变(核苷酸改变),以rpsL、katG和rpoB基因突变为主。WGS耐药突变检测结果与临床治疗结局显著相关(P<0.05)。基于SNP遗传距离≤12的遗传聚类分析识别出16个传播簇,涵盖57株菌株,总聚类率为29.4%。多因素分析表明,Pre-XDR-TB菌株较敏感菌株更易形成传播簇(P<0.05),且2015—2017年的分离株成簇率显著高于2023—2024年。结论青海省Mtb流行以L2谱系克隆传播为主导,患者对常用抗结核药物耐药性高,突变类型多样。需重点关注菌株的近期传播特征,为制定“簇水平干预”精准防控策略提供依据。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 全基因组测序 耐药 基因聚类 进化树
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代谢性脂肪肝炎小鼠肝窦内皮细胞窗孔的超微结构病变研究
4
作者 刘畅 郭宏博 +2 位作者 甘雅玲 聂广军 赵颖 《电子显微学报》 北大核心 2026年第1期53-58,共6页
代谢性脂肪肝炎(metabolic dysfunction-associated steatohepatitis,MASH)是代谢综合征在肝脏的核心病理表现,其特征以肝细胞脂质沉积、炎性浸润及纤维沉积为主。肝窦内皮细胞(liver sinusoidal endothelial cells,LSECs)特有的窗孔结... 代谢性脂肪肝炎(metabolic dysfunction-associated steatohepatitis,MASH)是代谢综合征在肝脏的核心病理表现,其特征以肝细胞脂质沉积、炎性浸润及纤维沉积为主。肝窦内皮细胞(liver sinusoidal endothelial cells,LSECs)特有的窗孔结构(fenestrae)是维持肝窦通透性及物质交换的形态学基础,但其重构与MASH病理改变的关联尚未完全阐明。本研究基于MASH小鼠模型,利用扫描电子显微镜(scanning electron microscope,SEM),系统观察了LSECs窗孔超微结构的演变规律。结果表明,伴随着MASH病程进展,其窗孔发生进行性破坏:孔隙率大幅降低、孔径减小,窗孔异质性极化、闭合及类似“环形山”样结构等病变。以上研究结果揭示,伴随肝脏病变的发生和进展,LSECs出现了“去窗孔化”和复杂的结构改变,强调了肝窦功能障碍在疾病进程中的重要作用。 展开更多
关键词 超微结构 肝脏 肝窦内皮细胞 窗孔 扫描电子显微镜
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基于全基因组测序的20株皮疽诺卡菌β-内酰胺类药物耐药基因分析
5
作者 王璇 马瑜浩 +9 位作者 苏果 刘晓娜 孙丽君 张哲 孙倩 张琳 轩芸 李玉静 郑立恒 柳晓金 《中国热带医学》 北大核心 2026年第3期401-407,共7页
目的基于全基因组测序技术,解析皮疽诺卡菌对β-内酰胺类药物(头孢曲松、亚胺培南)耐药基因特征,探讨其耐药机制,为临床皮疽诺卡菌感染的精准用药提供依据。方法收集2018年10月—2024年12月河北医科大学第二医院、河北省胸科医院、北京... 目的基于全基因组测序技术,解析皮疽诺卡菌对β-内酰胺类药物(头孢曲松、亚胺培南)耐药基因特征,探讨其耐药机制,为临床皮疽诺卡菌感染的精准用药提供依据。方法收集2018年10月—2024年12月河北医科大学第二医院、河北省胸科医院、北京胸科医院临床分离的诺卡菌菌株,经基质辅助激光解析电离飞行时间质谱及16S rRNA基因测序鉴定至种水平以筛选皮疽诺卡菌;采用微量肉汤稀释法进行头孢曲松、亚胺培南药敏试验,并分为耐药组与敏感组;对20株耐药菌株进行全基因组测序,通过SMRT Link v5.0.1软件组装基因组,利用GeneMarkS、Repeat Masker、tRNAscan-SE等工具分析基因组特征,结合ARDB、CARD等耐药数据库鉴定耐药基因,并通过PCR验证耐药基因的准确性。结果共分离鉴定诺卡菌菌株105株,其中皮疽诺卡菌58株(占比55.2%),主要来源于下呼吸道标本(82.8%,48/58)。药敏试验结果显示,58株皮疽诺卡菌对头孢曲松耐药率为65.5%(38/58),对亚胺培南耐药率为41.4%(24/58),最终筛选20株对2种药物均耐药的菌株用于测序。测序结果显示,基因组N50均值为125.6 kb,平均测序深度为50.2×,共预测编码基因均值为6320个,重复序列占比均值为3.2%,鉴定出ncRNA(tRNA、rRNA、sRNA)均值为128个,基因岛均值为18个。耐药基因分析显示,所有20株耐药菌株携带bla_(FAR-1)基因(编码A类β-内酰胺酶),18株携带RbpA、MtrA、vanR-O基因簇;PCR验证显示,bla_(FAR-1)基因与头孢曲松耐药表型符合率为100.00%(20/20),RbpA/MtrA/vanR-O基因簇与亚胺培南耐药表型符合率为90.00%(18/20)。结论皮疽诺卡菌对头孢曲松、亚胺培南耐药率较高,bla_(FAR-1)基因是其对头孢曲松耐药的关键基因,RbpA/MtrA/vanR-O基因簇可能参与亚胺培南耐药机制;全基因组测序可有效解析皮疽诺卡菌耐药基因特征,为临床精准选择β-内酰胺类药物提供分子依据。 展开更多
关键词 诺卡菌属(皮疽诺卡菌) Β-内酰胺酶 全基因组测序 亚胺培南 头孢曲松 细菌耐药
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严重多发伤患者早期救治感染病原谱构成及其对临床预后影响研究
6
作者 丁剑锋 薛建华 秦军 《中国病原生物学杂志》 北大核心 2026年第3期389-393,共5页
目的探究严重多发伤患者早期救治阶段感染病原谱的构成特征,明确主要致病菌的药敏特点及影响患者临床预后的关键因素。方法采用回顾性队列研究设计,选取2022年5月至2025年5月本院急诊科及创伤中心收治的182例严重多发伤患者。根据受伤... 目的探究严重多发伤患者早期救治阶段感染病原谱的构成特征,明确主要致病菌的药敏特点及影响患者临床预后的关键因素。方法采用回顾性队列研究设计,选取2022年5月至2025年5月本院急诊科及创伤中心收治的182例严重多发伤患者。根据受伤后7d内是否发生感染分为118例感染组与64非感染组,采集感染患者痰液、血液等标本进行病原学培养与鉴定,采用纸片扩散法或微量肉汤稀释法开展药敏试验,单因素分析筛选预后相关因素后纳入多因素Logistic回归模型分析独立危险因素。结果182例患者早期感染发生率为64.83%(118/182);感染患者的年龄、ISS评分、机械通气时间及住院时间均显著高于非感染患者(P<0.05)。在118例感染患者中,共检出病原菌179株,其中革兰阴性菌116株(64.80%),革兰阳性菌52株(29.05%),真菌11株(6.15%),全部为念珠菌属。药敏结果显示,鲍曼不动杆菌仅对替加环素、多黏菌素B敏感率>60%,铜绿假单胞菌对哌拉西林/他唑巴坦、头孢哌酮/舒巴坦敏感率>70%,亚胺培南、美罗培南对肺炎克雷伯菌、大肠埃希菌敏感率>85%;万古霉素、利奈唑胺对所有革兰阳性菌敏感率>90%。多因素Logistic回归分析显示,多重耐药菌感染(OR=3.185,95%CI:1.762~5.753,P<0.01)、ISS评分≥25分(OR=2.471,95%CI:1.328~4.598,P<0.01)、感染发生时间≤3d(OR=1.987,95%CI:1.054~3.746,P 0.05)是影响预后的独立危险因素。179株病原菌中多重耐药菌58株(32.40%),多重耐药菌感染组28d病死率(34.48%)明显高于非多重耐药菌感染组(15.22%),差异有统计学意义(χ^(2)=8.320,P<0.01)。结论严重多发伤患者早期感染发生率高,病原谱以革兰阴性菌为主,耐药形势严峻;且多重耐药菌感染、高损伤严重程度评分及伤后极早期感染是导致患者不良预后的关键危险因素,临床需针对性加强早期感染监测与病原学检测,合理选用抗菌药物并强化高风险患者干预,以降低感染危害、改善预后。 展开更多
关键词 严重多发伤 早期救治 感染 病原谱 预后 回顾性研究
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HLA-A/B基因多态性与女性高危型HPV16/18感染和宫颈癌易感性的关联性分析
7
作者 卢庭婷 黄海鹏 +1 位作者 陈基强 张柯媛 《中国免疫学杂志》 北大核心 2026年第3期574-580,共7页
目的:探讨宫颈癌患者HLA-A/B基因多态性与高危型HPV16/18感染及宫颈癌易感性之间的关联。方法:选取2020年1月至2023年6月在广西医科大学第一附属医院确诊的宫颈癌患者作为观察组(n=205),选取同期参加宫颈癌筛查项目的健康女性作为对照组... 目的:探讨宫颈癌患者HLA-A/B基因多态性与高危型HPV16/18感染及宫颈癌易感性之间的关联。方法:选取2020年1月至2023年6月在广西医科大学第一附属医院确诊的宫颈癌患者作为观察组(n=205),选取同期参加宫颈癌筛查项目的健康女性作为对照组(n=97)。PCR和测序法检测受试者HLA-A/B基因进行分型;PCR-荧光标记法检测受试者HPV基因分型;流式细胞术检测受试者宫颈脱落细胞中CD8^(+)T细胞水平及其表面活性抑制分子PD-1、TIM-3阳性率;Spearman相关性分析HLA-A/B基因多态性与宫颈癌患者高危型HPV感染、宫颈癌易感性及CD8^(+)T细胞功能间的相关性。结果:所有受试者中检测到11种HLA-A等位基因和22种HLA-B等位基因。观察组患者HLA-A*02、A*03、A*11、HLA-B*27和B*44等HLA-A/B等位基因出现频率明显高于对照组(均P<0.05)。高危型HPV感染的宫颈癌患者HLA-A*02、A*11、HLA-B*07和B*44等HLAA/B等位基因频率高于非高危型HPV感染的宫颈癌患者(均P<0.05)。Spearman相关性分析表明,HLA-A*02和HLA-A*11与宫颈癌呈正相关(r=0.205、0.138,P=0.013、0.027),HLA-A*02和HLA-B*44分别与高危型和非高危型HPV感染呈正相关(r=0.123、0.253,P=0.008、0.020)、HLA-A*02、HLA-A*11和HLA-B*44分别与颈脱落细胞中CD8^(+)T细胞水平(r=0.115、0.169、0.153,P=0.011、0.025、0.020)、PD-1阳性率(r=0.101、0.136、0.163,P=0.040、0.033、0.031)及TIM-3阳性率(r=0.124、0.201、0.211,P=0.005、0.008、0.009)均呈正相关。结论:携带HLA-A*02和A*11的个体与高危型HPV16/18感染呈显著正相关,而HLA-A*02和HLA-B*44为女性宫颈癌患者的易感基因,可能与CD8^(+)T细胞免疫功能耗竭有关。 展开更多
关键词 宫颈癌 HLA-A/B 易感性 高危型HPV 基因多态性
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宏基因组纳米孔测序在结核浆液性积液诊断及合并感染筛查中的应用价值
8
作者 朱庆东 赵春艳 +5 位作者 黄雪雯 黄爱春 曾春梅 许超艳 兰艳群 宋畅 《中国防痨杂志》 北大核心 2026年第3期335-341,共7页
目的:探究宏基因组纳米孔测序(简称“纳米孔测序”)技术在结核浆液性积液诊断中的应用价值,并评估其在快速、精准鉴定结核分枝杆菌及筛查合并感染病原体方面的优势。方法:纳入2021年10月至2025年5月在南宁市第四人民医院就诊的疑似结核... 目的:探究宏基因组纳米孔测序(简称“纳米孔测序”)技术在结核浆液性积液诊断中的应用价值,并评估其在快速、精准鉴定结核分枝杆菌及筛查合并感染病原体方面的优势。方法:纳入2021年10月至2025年5月在南宁市第四人民医院就诊的疑似结核浆液性积液患者,采集其积液样本进行纳米孔测序,以最终临床诊断结果为参考标准,与传统检测方法(包括抗酸染色、TB-DNA检测、GeneXpert MTB/RIF和分枝杆菌固体培养)进行对比分析。结果:纳米孔测序技术的敏感度(73.1%,19/26)、特异度(100.0%,27/27)、阳性预测值(100.0%,19/19)、阴性预测值(79.4%,27/34)、Kappa值(0.734)的总体诊断效能优于抗酸染色[敏感度为11.5%(3/26)、特异度为100.0%(27/27)、阳性预测值为3/3、阴性预测值为54.0%(27/50)、Kappa值为0.117]、培养[敏感度为30.8%(8/26)、特异度为100.0%(27/27)、阳性预测值为8/8、阴性预测值为60.0%(27/45)、Kappa值为0.312]、TB-DNA检测[敏感度为34.6%(9/26)、特异度为100.0%(27/27)、阳性预测值为9/9、阴性预测值为61.4%(27/44)、Kappa值为0.350]、GeneXpert MTB/RIF[敏感度为34.6%(9/26)、特异度为100.0%(27/27)、阳性预测值为9/9、阴性预测值为61.4%(27/44)、Kappa值为0.350]、结核抗体检测[敏感度为46.2%(12/26)、特异度为81.5%(22/27)、阳性预测值为70.6%(12/17)、阴性预测值为61.1%(22/36)、Kappa值为0.278]。纳米孔测序技术还显示,结核病患者合并非结核分枝杆菌、病毒、真菌、细菌感染等的比例(42.1%,8/19)较高。结论:纳米孔测序技术在结核浆液性积液的诊断中展现出优异的性能,其诊断效能优于传统病原学检测方法,能够有效提高结核病的早期诊断率,并为合并感染的筛查提供新的解决方案。 展开更多
关键词 纳米技术 结核 心包积液 胸腔积液 敏感性与特异性
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跟骨骨折术后切口感染的病原菌耐药性及感染因素分析
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作者 姜洪涛 薛鑫鑫 +3 位作者 聂明洋 王佳宁 王丽颖 李小东 《中国病原生物学杂志》 北大核心 2026年第1期13-16,共4页
目的探讨跟骨骨折术后切口感染的病原菌分布、耐药性、炎性反应指标变化及相关原因。方法选取2019年6月~2024年7月于本院行手术治疗的跟骨骨折患者796例作为研究对象,根据术后是否出现切口感染分为感染组(n=56)和非感染组(n=740),观察... 目的探讨跟骨骨折术后切口感染的病原菌分布、耐药性、炎性反应指标变化及相关原因。方法选取2019年6月~2024年7月于本院行手术治疗的跟骨骨折患者796例作为研究对象,根据术后是否出现切口感染分为感染组(n=56)和非感染组(n=740),观察病原菌分布特征和耐药率;采用Logistic回归分析影响跟骨骨折患者术后切口感染的危险因素。结果796例跟骨骨折患者术后经病原菌检出切口感染56例,分离出病原菌共83株,其中革兰阳性菌、革兰阴性菌、真菌分别为34株(40.96%)、46株(55.42%)、4株(4.82%)。药敏结果显示,金黄色葡萄球菌对青霉素耐药率(81.25%)最高,其次为红霉素(68.75%)、左氧氟沙星(56.25%);表皮葡萄球菌对青霉素耐药率(92.86%)最高,其次为红霉素(64.29%)、复方新诺明(50.00%);大肠埃希菌对氨苄西林耐药率(100.00%)最高,其次为头孢唑啉(86.36%);阴沟肠杆菌对头孢唑啉耐药率(100.00%)最高,其次氨苄西林为(93.33%)。感染组的糖尿病史、术后引流管未放置占比和手术时间、IL-2、CRP、PCT水平均高于非感染组(P<0.05)。多因素Logistic回归分析显示,糖尿病史、术后未放置引流管及IL-2、CRP、PCT水平升高是影响跟骨骨折患者术后切口感染的独立危险因素(P<0.05)。结论跟骨骨折术后切口感染以金黄色葡萄球菌、表皮葡萄球菌、大肠埃希菌、阴沟肠杆菌等病原菌多见,并对青霉素、红霉素、复方新诺明、氨苄西林、头孢唑啉等抗菌药物具有较高的耐药性;且糖尿病史、术后未放置引流管及IL-2、CRP、PCT水平升高是影响术后继发切口感染的危险因素,临床应提高警惕。 展开更多
关键词 跟骨骨折 切口感染 病原菌 耐药性 炎性反应
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人工智能在临床微生物检测中的应用进展
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作者 李惠 宋珍 +1 位作者 赵亚楠 李敏 《四川大学学报(医学版)》 北大核心 2026年第2期313-318,共6页
传统微生物检测技术在检测速度、灵敏度和特异性等方面存在固有局限,已难以应对日益增长的临床需求。近年来,人工智能(artificial intelligence,AI)正加速融入临床微生物检测领域,多项研究证实其在提升病原体识别、预测抗菌药物敏感性... 传统微生物检测技术在检测速度、灵敏度和特异性等方面存在固有局限,已难以应对日益增长的临床需求。近年来,人工智能(artificial intelligence,AI)正加速融入临床微生物检测领域,多项研究证实其在提升病原体识别、预测抗菌药物敏感性以及推动实验室自动化方面展现出巨大潜力。本文系统回顾了经典AI算法及其在该领域的最新应用进展。在视觉数据应用方面,基于深度学习的模型被用于显微镜图像和菌落形态的自动化分析,显著提高了识别效率与判读准确性。在非视觉数据领域,AI在基因组学、转录组学及宏基因组学等多组学数据的解析中取得了突破性进展,广泛应用于病原体的快速鉴定和抗生素耐药性的预测。尽管AI应用前景广阔,但目前在临床微生物检测中的应用仍处于从科研探索向临床转化的初期阶段。本文进一步探讨了AI技术转化过程中面临的关键挑战与机遇,旨在帮助临床专业人员全面了解AI在该领域的发展现状、未来趋势及其潜在影响,以推动其向可靠、可推广的常规检测方法迈进。 展开更多
关键词 人工智能 机器学习 临床微生物检测 抗生素耐药性 综述
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CK-BB和IL-22联合检测对小儿轮状病毒肠炎诊断及病情评估的研究
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作者 廖永强 程均 +3 位作者 俞丹菁 任妹 尹琳洁 冯晓晶 《中国免疫学杂志》 北大核心 2026年第3期676-680,共5页
目的:探究血清肌酸激酶脑型同工酶(CK-BB)和IL-22联合检测对小儿轮状病毒肠炎(RVGE)的诊断及病情评估价值。方法:回顾性选取2022年1月至2022年12月萍乡市人民医院急诊和住院儿科诊治的102例确诊为RVGE的患儿为研究组,40例细菌性肠炎患... 目的:探究血清肌酸激酶脑型同工酶(CK-BB)和IL-22联合检测对小儿轮状病毒肠炎(RVGE)的诊断及病情评估价值。方法:回顾性选取2022年1月至2022年12月萍乡市人民医院急诊和住院儿科诊治的102例确诊为RVGE的患儿为研究组,40例细菌性肠炎患儿为疾病对照组,50例体检儿童为健康对照组。RVGE患儿根据改良Vesikari评分分为轻度感染组(78例)和重度感染组(24例)。ELISA检测血清CK-BB和IL-22水平,散射速率法检测IgG水平,免疫比浊法检测C-反应蛋白(CRP),流式细胞术检测T淋巴细胞亚群。Pearson分析CK-BB与IL-22及体液和细胞免疫指标间的相关性,多因素Logistic回归分析病情程度的独立危险因素,ROC曲线分析CK-BB和IL-22对RVGE病情程度和预后的预测价值。结果:与疾病对照组和健康对照组相比,研究组血清CK-BB、IL-22、CD3^(+)CD8^(+)T细胞水平显著升高(均P<0.05),疾病对照组CRP显著高于研究组和健康对照组(均P<0.05);CK-BB、IL-22和CD3^(+)CD8^(+)T细胞水平随RVGE患儿病情加重而升高,IgA、IgM和CD3^(+)CD4^(+)T细胞水平、CD4^(+)T/CD8^(+)T随RVGE患儿病情加重而降低;CK-BB水平与IL-22和CD3^(+)CD8^(+)T细胞水平呈正相关(r=0.663,0.257,均P<0.05),与IgA、IgM、CD3^(+)CD4^(+)T细胞水平和CD4^(+)T/CD8^(+)T均呈负相关(r=-0.600,-0.838,-0.456,-0.352,均P<0.05);多因素Logistic回归分析发现CK-BB、IL-22、CD4^(+)T/CD8^(+)T和年龄均可作为病情严重程度的独立危险因素,CK-BB和IL-22联合检测对重症评估的AUC为0.940,敏感度和特异度为分别为87.5%和93.6%。结论:CK-BB和IL-22联合检测对RVGE诊断和病情评估具有重要的临床价值。 展开更多
关键词 轮状病毒肠炎 肌酸激酶脑型同工酶 IL-22 病情评估
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胃癌患者免疫治疗相关血流感染的病原谱分布及其影响因素调查
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作者 宋磊 赵琴 刘瑞 《中国病原生物学杂志》 北大核心 2026年第2期216-221,共6页
目的探讨胃癌患者免疫治疗相关血流感染(bloodstream infection,BSI)的病原谱分布及其影响因素,为临床感染防控及经验性抗菌药物选择提供循证依据。方法回顾性分析2024年本院收治并经病理确诊的胃癌患者120例,其中接受免疫治疗者62例(... 目的探讨胃癌患者免疫治疗相关血流感染(bloodstream infection,BSI)的病原谱分布及其影响因素,为临床感染防控及经验性抗菌药物选择提供循证依据。方法回顾性分析2024年本院收治并经病理确诊的胃癌患者120例,其中接受免疫治疗者62例(免疫治疗组),未接受者58例(对照组)。依据美国疾病控制与预防中心(CDC/NHSN 2023版)标准判定实验室确证BSI事件。收集患者一般资料、基础疾病、治疗方案、导管留置情况、抗菌药物及激素使用史、实验室指标等临床信息。血标本经MALDI-TOF质谱(VITEK MS)鉴定病原体,药敏试验依据CLSI M100(2024版)标准判定。组间比较采用χ^(2)检验、t检验及非参数检验;经LASSO回归筛选后纳入多因素Logistic回归模型,计算校正比值比(adjusted odds ratio,aOR)及95%置信区间(CI)。结果共确诊BSI病例24例(总发生率20.00%),其中免疫治疗组16例(25.81%),对照组8例(13.79%),差异有统计学意义(P=0.045)。共分离病原菌24株,其中革兰阴性菌15株(62.50%)、革兰阳性菌7株(29.17%)、真菌2株(8.33%)。主要病原为大肠埃希菌7株(29.17%)、鲍曼不动杆菌3株(12.50%)、铜绿假单胞菌3株(12.50%)、金黄色葡萄球菌3株(12.50%)、凝固酶阴性葡萄球菌2株(8.33%)及白假丝酵母2株(8.33%)。ESBL阳性率为35.71%,CRE检出率15.00%,MRSA检出率30.00%,VRE检出率22.22%,真菌氟康唑耐药率12.50%。免疫治疗组中鲍曼不动杆菌(18.75%vs.6.25%,P=0.042)及真菌(12.50%vs.4.17%,P=0.048)检出率显著升高。多因素Logistic回归分析显示,导管在位时间≥14 d(β=0.82,SE=0.33,Waldχ^(2)=6.11,aOR=2.27,95%CI:1.13~4.56,P=0.017)、既往广谱抗菌药物使用>7 d(β=0.86,SE=0.38,Waldχ^(2)=4.97,aOR=2.36,95%CI:1.09~5.12,P=0.028)及激素治疗≥10 d(β=0.63,SE=0.31,Waldχ^(2)=4.10,aOR=1.88,95%CI:1.01~3.59,P=0.042)为独立危险因素。模型拟合优度良好(AUC=0.809,Hosmer-Lemeshow检验P=0.658)。感染患者28 d病死率为12.50%(3/24),免疫治疗组显著高于对照组(15.63%vs.8.33%,P=0.049)。结论胃癌患者在免疫治疗期间血流感染发生率较高,病原谱以革兰阴性菌为主,其中鲍曼不动杆菌及真菌感染比例升高,耐药菌检出率居高不下。导管长期留置、广谱抗菌药物及激素使用是BSI发生的独立危险因素。临床应加强免疫治疗患者感染风险评估,规范导管管理与抗菌药物应用,以降低感染相关不良结局。 展开更多
关键词 胃癌 免疫治疗 血流感染 病原谱 耐药性
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视黄醇结合蛋白4荧光免疫层析检测技术的建立与应用研究
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作者 郑登滋 叶青 +3 位作者 张珠平 鄢雪梨 林菊珊 黄仁杰 《中国免疫学杂志》 北大核心 2026年第1期186-190,共5页
目的:建立血清视黄醇结合蛋白4(RBP4)的荧光免疫层析快速检测方法,并将其用于心血管疾病诊断研究。方法:采用双抗体夹心原理制备荧光免疫层析试纸条,系统评价线性范围、精密度、准确度、灵敏度、特异性。检测分析48例高血压样本、29例... 目的:建立血清视黄醇结合蛋白4(RBP4)的荧光免疫层析快速检测方法,并将其用于心血管疾病诊断研究。方法:采用双抗体夹心原理制备荧光免疫层析试纸条,系统评价线性范围、精密度、准确度、灵敏度、特异性。检测分析48例高血压样本、29例脑梗死样本及20例健康样本血清RBP4水平与心血管疾病相关性,并评估其诊断效能。结果:该方法对血清中RBP4的线性范围37.5~600 ng/mL,批内变异系数均<12%,批间变异系数均<13%,平均回收率95.6%,灵敏度为0.44 ng/mL,与含胆红素、甘油三酯和血红蛋白的干扰样本无明显交叉反应。相关性分析显示高血压和脑梗死患者血清RBP4水平高于健康对照,血清RBP4水平与高血压和脑梗死具有良好的相关性。ROC曲线分析显示,血清RBP4水平从健康人群中鉴别诊断高血压和脑梗死的AUC分别为0.914和0.850,提示血清RBP4水平诊断高血压的效能优于脑梗死。结论:建立了定量检测RBP4的荧光免疫层析法,有望为心血管疾病中高血压和脑梗死的早期筛查提供一种便捷的检测手段。 展开更多
关键词 视黄醇结合蛋白4 荧光免疫层析 心血管疾病
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产褥期链球菌感染病原菌特点及感染影响因素调查
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作者 孙兰云 茆亚东 +1 位作者 朱巧谋 李晓晨 《中国病原生物学杂志》 北大核心 2026年第4期518-522,共5页
目的探讨产褥期链球菌感染的临床特征、病原菌分布特点及其耐药性,并分析产褥期链球菌感染的独立危险因素。方法本研究采用回顾性病例对照研究设计,纳入2022年12月至2024年12月期间在本院确诊为产褥期链球菌感染的120例患者作为病例组,... 目的探讨产褥期链球菌感染的临床特征、病原菌分布特点及其耐药性,并分析产褥期链球菌感染的独立危险因素。方法本研究采用回顾性病例对照研究设计,纳入2022年12月至2024年12月期间在本院确诊为产褥期链球菌感染的120例患者作为病例组,并纳入同一时期未发生感染的120例产妇作为正常对照组。所有数据均通过医院电子病例管理系统中提取。描述性统计分析患者的临床表现、实验室检查结果及治疗方案。使用多因素Logistic回归模型评估产褥期链球菌感染的独立危险因素。结果共纳入120例产褥期链球菌感染患者与120例正常对照组。病例组患者临床表现以发热(85%)、腹痛(60%)和伤口感染(45%)为主。链球菌分布以B组链球菌(GBS)为主,占60%,其次为A组链球菌(GAS),占25%。耐药性分析显示,链球菌对青霉素敏感性较高(95%),但对红霉素和克林霉素的耐药性分别为20%和12.5%。多因素Logistic回归分析结果显示,患者剖宫产史(OR=1.91,95%CI:1.06-3.43,P=0.031)、糖尿病史(OR=2.35,95%CI:1.12-4.97,P=0.025)和胎膜早破(OR=2.24,95%CI:1.15-4.35,P=0.018)被确认为GBS感染的独立危险因素。此外,产次与GBS感染呈负相关(OR=0.52,95%CI:0.30-0.91,P=0.023),表明经产妇的感染风险较低。结论产褥期链球菌感染以GBS为主,临床表现多样,抗生素耐药性问题日益突出。青霉素仍为首选治疗药物,但需关注红霉素和克林霉素的耐药性。本研究患者的剖宫产史、糖尿病史、产次和胎膜早破是GBS感染的重要危险因素,提示在这些高危人群中需加强产前筛查和合理使用抗生素,以减少感染发生并提高治疗效果。 展开更多
关键词 产褥期感染 链球菌 临床特征 病原菌分布 耐药性
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浅谈病理室间质评活动的现状和对策
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作者 金苏 孙文佳 王明伟 《临床与实验病理学杂志》 北大核心 2026年第1期119-122,共4页
质量控制体系是规范实验室检测流程、确保检测结果有效性的基础。完善的病理室间质评活动,包括提供完整的质控品信息、制定针对性的评价标准、设置个性化的质控项目以及改进质控考察与评价模式,并不断优化室间质评体系,使病理质量控制... 质量控制体系是规范实验室检测流程、确保检测结果有效性的基础。完善的病理室间质评活动,包括提供完整的质控品信息、制定针对性的评价标准、设置个性化的质控项目以及改进质控考察与评价模式,并不断优化室间质评体系,使病理质量控制发展更全面、更系统,达到举办室间质评活动的目的。 展开更多
关键词 室间质评 空间异质性 评价标准 技术质控 诊断质控
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山西省某医院纹带棒杆菌感染的耐药性及基因分析
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作者 李霞 侯辰蕊 +1 位作者 李玉串 姚红 《中国热带医学》 北大核心 2026年第1期107-111,共5页
目的分析山西白求恩医院分离纹带棒杆菌临床菌株的流行病学和分子生物学特点,为临床抗感染治疗提供参考。方法收集山西白求恩医院2021年2月—2023年12月纹带棒杆菌感染患者中分离的纹带棒杆菌菌株,进行抗菌药物敏感性试验,并对血流感染... 目的分析山西白求恩医院分离纹带棒杆菌临床菌株的流行病学和分子生物学特点,为临床抗感染治疗提供参考。方法收集山西白求恩医院2021年2月—2023年12月纹带棒杆菌感染患者中分离的纹带棒杆菌菌株,进行抗菌药物敏感性试验,并对血流感染菌株进行二代测序并分析。结果共收集分离自临床标本的纹带棒杆菌487株,感染部位以肺部为主,共408例(占83.78%),神经科患者占比最高,共266例(占54.62%),抗菌药物敏感性试验结果显示所有菌株均对青霉素、美罗培南、头孢曲松和环丙沙星具有耐药性,对万古霉素和利奈唑胺保持敏感。部分分离株对四环素、克林霉素、庆大霉素和红霉素具有一定敏感性,敏感率分别为34.50%、7.19%、36.34%和16.43%。12株血流感染菌株二代测序及基因组分析,共鉴定出11种抗菌药物耐药基因,所有菌株均携带耐药基因ermX,10株菌株同时携带5种以上耐药基因,并且在菌株中检测到spa和srt毒力基因。进化分析显示,12株纹带棒杆菌的序列类型(se⁃quence types,ST)呈现多样性,但部分菌株在不同科室中检测到相同的ST。结论纹带棒杆菌感染菌均为多重耐药菌,万古霉素及利奈唑胺仍具有较好的抗菌活性,基因组分析携带多种耐药基因。进一步加强纹带棒杆菌感染的筛检与控制措施,对于预防感染传播和优化抗感染治疗至关重要。 展开更多
关键词 纹带棒杆菌 耐药性 耐药基因 二代测序 基因组
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基于BP神经网络构建儿童肺炎支原体混合腺病毒感染的重症肺炎预测模型
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作者 姚国华 刘杰 +3 位作者 张雯 马翠安 魏博涛 高娜 《天津医药》 2026年第4期369-373,共5页
目的基于反向传播法(BP)神经网络构建儿童肺炎支原体(MP)混合腺病毒(ADV)感染的重症肺炎的临床预测模型。方法回顾性分析138例MP混合ADV感染的社区获得性肺炎患儿的临床、实验室及影像学资料,按7∶3将研究对象随机分为训练集(96例)和测... 目的基于反向传播法(BP)神经网络构建儿童肺炎支原体(MP)混合腺病毒(ADV)感染的重症肺炎的临床预测模型。方法回顾性分析138例MP混合ADV感染的社区获得性肺炎患儿的临床、实验室及影像学资料,按7∶3将研究对象随机分为训练集(96例)和测试集(42例),构建BP神经网络预测模型。训练集用沙普利加法解释量化临床特征贡献度,筛选出MP混合ADV的重症肺炎的预测因子。通过测试集的准确率、损失值、混淆矩阵对其进行验证。结果重症组发热持续天数、最高体温、中性粒细胞百分比(N%)、天冬氨酸转氨酶(AST)、乳酸脱氢酶(LDH)、白细胞介素-6(IL-6)、大片炎性实变、住院天数高于非重症组,淋巴细胞百分比(L%)、白蛋白低于非重症组(P<0.05)。基于BP神经网络研究的结果显示发热持续天数、AST、N%、最高体温、大片炎性实变、IL-6、L%、LDH是MP混合ADV感染所致重症肺炎的关键预测因子。在构建儿童重症MP混合ADV临床预测模型上,测试集显示准确率90.48%、损失值0.2332。结论基于BP神经网络成功构建的儿童MP混合ADV感染重症肺炎的预测模型筛选出8项关键预测因子,可为临床早期识别重症病例提供参考。 展开更多
关键词 肺炎 支原体 腺病毒 人 同时感染 模型 统计学 儿童 BP神经网络 沙普利加法解释
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基于全基因组测序的大肠埃希菌配对分离株分子特征分析
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作者 郑礼杰 钱费楠 +3 位作者 许金凤 姚淳 刘海冰 杜鸿 《临床检验杂志》 2026年第2期143-148,共6页
目的回顾性分析13对26株大肠埃希菌的分子特征改变。方法选取2021年6—12月期间江苏大学附属人民医院13例长期住院患者,将每例患者同一病程内前后分离的2株大肠埃希菌进行配对,采用全基因组二代测序及生物信息学方法对菌株的多位点序列... 目的回顾性分析13对26株大肠埃希菌的分子特征改变。方法选取2021年6—12月期间江苏大学附属人民医院13例长期住院患者,将每例患者同一病程内前后分离的2株大肠埃希菌进行配对,采用全基因组二代测序及生物信息学方法对菌株的多位点序列分型(MLST)、核心基因组多位点序列分型(cgMLST)、耐药基因及毒力基因等分子特征进行分析。结果4对(4/13,30.7%)大肠埃希菌发生了ST型的改变,且ST与cgMLST分型的改变符合率100%一致;7对(7/13,53.8%)大肠埃希菌的耐药基因发生改变,主要涉及氨基糖苷类、磺胺类、喹诺酮类、β-内酰胺类耐药基因;7对(7/13,53.8%)的毒力基因发生改变。结论短期内同一患者前后分离自相同或不同感染部位的大肠埃希菌的分子分型、耐药基因和毒力基因显示出动态变化,应加强监测,为精准诊疗提供依据。 展开更多
关键词 大肠埃希菌 全基因组测序 序列分型 耐药基因 毒力基因
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大连市2023年7株百日咳鲍特菌临床分离株全基因特征分析
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作者 侯君 郎兴莹 +2 位作者 陈玉凤 周林 栾明春 《华南预防医学》 2026年第1期74-78,共5页
目的 研究大连市2023年分离的的7株百日咳鲍特菌的全基因组序列特征以及对大环内酯类抗生素的敏感性,为防控百日咳提供科学依据。方法 通过基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)和荧光定量PCR技术鉴定菌株。应用全基因组测序... 目的 研究大连市2023年分离的的7株百日咳鲍特菌的全基因组序列特征以及对大环内酯类抗生素的敏感性,为防控百日咳提供科学依据。方法 通过基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)和荧光定量PCR技术鉴定菌株。应用全基因组测序和E-test法分别测定基因组序列和对大环内酯类抗生素的敏感性。通过BLASTn比对分析主要毒力基因、疫苗相关基因及23S rRNA基因突变,并进行多位点序列分型(MLST)。利用IQ-TREE软件,将分离株与来自NCBI和NMDC数据库的97株国内外菌株(含疫苗株CS、标准株Tohama I)构建系统进化树。结果 7株临床分离株均对红霉素、阿奇霉素和克拉霉素表现为耐药,且其23S rRNA基因均携带A2047G突变。所有菌株均为ptxA1/ptxC2/ptxP3/prn2/fhaB1/fim2-1/fim3A*/tcfA-2/cyaA-2/vag8-2/opmQ-2/brkA-1/bapC-1型别,MLST分型为ST2型。与疫苗株CS相比,分离株在ptxA、ptxC、ptxP、prn及fim3这5个毒力基因的等位基因型上存在差异。系统进化分析显示,7株分离株亲缘关系相近,形成一独立进化分支;与疫苗株CS和标准株Tohama I遗传距离较远。结论 2023年大连地区百日咳鲍特菌临床分离株呈现出对大环内酯类抗生素高水平耐药,疫苗相关基因显著变异,以及由ptxP3基因型所预示的毒力增强等多重特征。未来应加强相关监测,为百日咳防控及新型疫苗开发提供更多理论支撑。 展开更多
关键词 百日咳鲍特菌 全基因组测序 序列特征 大环内酯耐药性
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贵州省14株猪链球菌毒力基因及脉冲场凝胶电泳分型研究
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作者 马青 彭添碧 +3 位作者 刘英 王月 韦小瑜 李世军 《国际检验医学杂志》 2026年第6期674-677,682,共5页
目的 了解贵州省2010-2020年猪链球菌的脉冲场凝胶电泳(PFGE)带型分布和分子流行病学特征。方法 采用PCR实验技术和脉冲场凝胶电泳(PFGE)对14株猪链球菌(猪源4株,人源10株)进行毒力基因检测和PFGE分子分型分析。结果 所有菌株毒力基因sl... 目的 了解贵州省2010-2020年猪链球菌的脉冲场凝胶电泳(PFGE)带型分布和分子流行病学特征。方法 采用PCR实验技术和脉冲场凝胶电泳(PFGE)对14株猪链球菌(猪源4株,人源10株)进行毒力基因检测和PFGE分子分型分析。结果 所有菌株毒力基因sly和epf基因检出率为100.0%,而在10株猪链球菌中未检出mrp基因。PFGE结果显示,14株菌经SmaⅠ酶酶切后产生9~10条DNA条带,聚类分析显示14株猪链球菌呈现出9种PFGE带型,菌株间的相似度在74.5%~100.0%;2013年与2016年的菌株PFGE带型相同,其他各年的菌株PFGE带型均不相同;丹寨县一株菌株与兴义市菌株PFGE带型相同,其余各地区PFGE带型均各不相同。结论 贵州省猪链球菌优势毒力基因型为mrp-sly+epf+。贵州省猪链球菌基因组DNA呈多样性,暂未发现PFGE带型分布与菌株分离的时间、地域和致病血清型有明显相关性。 展开更多
关键词 猪链球菌 脉冲场凝胶电泳 毒力基因 分子分型
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