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基于经典单核苷酸多态性和多位点可变数目串联重复序列分析的中国炭疽芽胞杆菌基因遗传特征分析 被引量:1
1
作者 张恩民 张慧娟 +2 位作者 贺金荣 李伟 魏建春 《疾病监测》 北大核心 2025年第1期92-97,共6页
目的分析中国炭疽芽胞杆菌基因型多态性,掌握中国炭疽芽胞杆菌基因遗传特征。方法收集中国20个省份的炭疽芽胞杆菌菌株,采用经典单核苷酸多态性(canSNP)和多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)进行基因型鉴定,分析不同分离来源菌株基... 目的分析中国炭疽芽胞杆菌基因型多态性,掌握中国炭疽芽胞杆菌基因遗传特征。方法收集中国20个省份的炭疽芽胞杆菌菌株,采用经典单核苷酸多态性(canSNP)和多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)进行基因型鉴定,分析不同分离来源菌株基因型的分布特征;采用Bionumerics 5.1软件进行聚类分析,并计算各位点的Simpson指数。结果533株中国炭疽芽胞杆菌均属于全球炭疽菌基因谱系中的A群,并具有全球12种亚群中的6种亚群,分别为A.Br.001/002、A.Br.Ames、A.Br.Aust94、A.Br.008/009、A.Br.Vollum和A.Br.005/006,其中A.Br.001/002亚群(60.98%)是中国的主要流行谱系,各地区均有分布,A.Br.Aust94(14.26%)、A.Br.008/009(11.82%)和A.Br.Vollum(4.69%)3个亚群主要分离自1980和1990年代的新疆维吾尔自治区(新疆),A.Br.Ames亚群菌株主要来自内蒙古自治区,主要分离自2010年代,A.Br.005/006亚群菌株最少,分离自2019年后。canSNP亚群在中国的地理分布不均衡,新疆、广西壮族自治区、青海省、内蒙古自治区、河北省等具有4~5种亚群,而四川省等10省仅有1种亚群,新疆以A.Br.Aust94和A.Br.008/009为优势亚群,其他地区均以A.Br.001/002为优势亚群。不同分离年代菌株的亚群分布有差异,在以A.Br.001/002为主要流行亚群的基础上,1980和1990年代A.Br.008/009、A.Br.Vollum和A.Br.Aust94相继出现并流行传播,2000年后A.Br.Ames亚群逐渐传播扩散,2019年A.Br.005/006亚群被检测到,显示了炭疽菌株基因型的传播和变异趋势。通过MLVA15分型研究菌株具有91个基因型,结果与canSNP亚群基本一致,且各亚群内MLVA15的分型能力均较好。结论本研究建立了中国炭疽芽胞杆菌canSNP和MLVA基因型数据库,掌握了中国炭疽杆菌基因型分布特征及其传播扩散趋势,为炭疽疫情防控及分子溯源技术提供了参考依据。 展开更多
关键词 炭疽芽胞杆菌 基因分型 经典单核苷酸多态性 多位点可变数目串联重复序列分析 遗传特征 中国
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实时荧光定量PCR法检测炭疽杆菌 被引量:16
2
作者 陈苏红 张敏丽 +3 位作者 牟航 管伟 李鲁 王升启 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第3期268-270,共3页
为建立一种简便而特异的炭疽杆菌检测方法用作临床诊断工具 ,以pXO1质粒上的 pag基因及pXO2质粒上的cap基因为靶合成特异引物 ,用DNA嵌入荧光染料SYBRGreenI进行定量PCR扩增 ,在PCR后进行熔解曲线分析以确定得到的产物是否为目的产物。... 为建立一种简便而特异的炭疽杆菌检测方法用作临床诊断工具 ,以pXO1质粒上的 pag基因及pXO2质粒上的cap基因为靶合成特异引物 ,用DNA嵌入荧光染料SYBRGreenI进行定量PCR扩增 ,在PCR后进行熔解曲线分析以确定得到的产物是否为目的产物。定量PCR条件优化结果为 :引物浓度 0 8μmol/L、Mg2 +5 0mmol/L。该法检测炭疽的灵敏度达 10 3拷贝 ,并能区分炭疽杆菌与其他蜡样杆菌。表明实时荧光定量PCR技术能够快速准确。 展开更多
关键词 炭疽杆菌 聚合酶链反应 定量 实时检测
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贵州省2006-2011年炭疽芽胞杆菌检出情况与致病性研究 被引量:5
3
作者 马青 李世军 +5 位作者 刘英 游旅 韦小瑜 唐光鹏 王定明 陈峥宏 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第6期632-635,共4页
目的了解贵州省2006-2011年炭疽芽胞杆菌感染和分布情况,为贵州省炭疽疫情的预防控制和炭疽病的分子流行病学研究提供科学依据。方法对来自贵州省2006-2011年不同地区的830份疑似炭疽标本(外环境标本667份、患者标本151份和牲畜标本12... 目的了解贵州省2006-2011年炭疽芽胞杆菌感染和分布情况,为贵州省炭疽疫情的预防控制和炭疽病的分子流行病学研究提供科学依据。方法对来自贵州省2006-2011年不同地区的830份疑似炭疽标本(外环境标本667份、患者标本151份和牲畜标本12份),采用传统的革兰染色镜检、普通营养琼脂平板和血琼脂平板培养基分离培养炭疽芽胞杆菌,运用青霉素抑制试验和噬菌体裂解试验对可疑炭疽芽胞杆菌菌落进行鉴定。采用Real-time PCR技术检测88株经传统细菌学方法鉴定为炭疽芽胞杆菌菌株pXO1质粒上的PA基因和pXO2质粒上的CAP基因。结果从830份标本中分离出88株炭疽芽胞杆菌,总检出率为10.60%。2007年分离出炭疽杆菌的阳性标本最多,占36.36%;其次为2009年,占29.55%。阳性标本主要分布在黔西南州,其次为毕节地区和黔南州;册亨县、织金县和望谟县为炭疽杆菌检出数较多的监测县。88株炭疽芽胞杆菌CAP基因均为阳性。除2007年2株炭疽菌株PA基因为阴性外,其余86株PA基因均为阳性。结论贵州省炭疽疫源地面积广大,污染严重;检出的88株炭疽芽胞杆菌中97.73%的菌株同时具有两种毒力质粒,具有强致病性;该研究结果对贵州省炭疽疫情的预防控制及分子流行病学研究具有重要意义。 展开更多
关键词 炭疽 炭疽芽胞杆菌 毒力基因 质粒
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2024年陕西省靖边县一起炭疽疫情调查及病原学分析
4
作者 梁爽 王彩乔 +6 位作者 栾阳 钟瑞 李慎 马琳 朱妮 邱琳 刘东立 《疾病监测》 北大核心 2025年第7期962-968,共7页
目的了解陕西省靖边县一起炭疽疫情的流行病学特征,以及炭疽芽孢杆菌分离株的病原学特征和全基因组溯源情况,以期为该病的防治提供参考。方法2024年8月陕西省靖边县发生1起炭疽疫情,采集涉疫生物、环境样本,进行核酸鉴定和细菌分离,对... 目的了解陕西省靖边县一起炭疽疫情的流行病学特征,以及炭疽芽孢杆菌分离株的病原学特征和全基因组溯源情况,以期为该病的防治提供参考。方法2024年8月陕西省靖边县发生1起炭疽疫情,采集涉疫生物、环境样本,进行核酸鉴定和细菌分离,对分离株进行药物敏感性试验和全基因组测序,对耐药基因、毒力基因作出分析,进行核心基因组多位点序列(cgMLST)分析、核心基因组单核苷酸变异(cgSNP)分析。结果本起炭疽疫情共报告3例皮肤炭疽病例,时间跨度为2024年8月2—21日,共获得3株炭疽芽孢杆菌,分离率为12.00%(3/25);分离株对临床首选药物青霉素、四环素、环丙沙星敏感;全基因组分析发现携带毒力基因capA、capB、capC、dep/capD、capE、cya、inhA、lef和pagA;携带β-内酰胺类(bla)、碳青霉烯类(bla2)、磷霉素(fosB2)、链丝菌素(satA)抗生素耐药基因;cgMLST及cgSNP分析显示3株菌聚为一个Cluster,与2018年西安市鄠邑区、2021年渭南市蒲城县、2020年渭南市临渭区、渭南市澄城县分离株遗传距离较近,与2021年华阴市、2015年延安市甘泉县分离株遗传距离较远。结论本起炭疽疫情是由同一炭疽传染源引起,但与陕西省历史分离株无明显关联,靖边县历史上鲜有炭疽疫情发生,可认定为一个新发现的疫源地,为今后炭疽疫情的长期监测与防治提供依据。 展开更多
关键词 炭疽芽孢杆菌 抗生素耐药分析 全基因组测序 核心基因组多位点序列分型 核心基因组单核苷酸多态性分析
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PCR方法快速检测炭疽芽孢杆菌 被引量:7
5
作者 魏建春 海荣 +1 位作者 张志凯 俞东征 《中国媒介生物学及控制杂志》 CAS CSCD 2002年第2期105-106,共2页
目的 :快速检测炭疽芽孢杆菌。方法 :质粒提取及PCR扩增。结果 :用两对引物扩增 ,阳性样本可分别扩出两条 877bp和 10 89bp左右的条带 ,阴性样本未扩增出。结论 :所采用的方法可快速检测出环境中的炭疽芽孢杆菌 ,并可对其致病性进行评价。
关键词 PCR方法 快速检测 炭疽芽孢杆菌 聚合酶链式反应
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2019-2020年宁夏炭疽芽胞杆菌毒力鉴定及基因分型研究 被引量:6
6
作者 杨聪 高建炜 +6 位作者 马江涛 海娥 邹悦 陈丽莉 李小璐 韩坤 张术斌 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期447-450,457,共5页
目的了解宁夏2019-2020年分离的炭疽芽胞杆菌菌株致病力及基因分型特征,为宁夏皮肤炭疽疫情判定与分子溯源提供实验室依据。方法收集2019-2020年宁夏各地区分离的炭疽芽胞杆菌,对其进行毒力鉴定,并运用MLVA-15和canSNP分型技术进行基因... 目的了解宁夏2019-2020年分离的炭疽芽胞杆菌菌株致病力及基因分型特征,为宁夏皮肤炭疽疫情判定与分子溯源提供实验室依据。方法收集2019-2020年宁夏各地区分离的炭疽芽胞杆菌,对其进行毒力鉴定,并运用MLVA-15和canSNP分型技术进行基因分型研究。结果2019-2020年宁夏分离到的炭疽芽胞杆菌均为强毒株,MLVA-15分型为同一种群,canSNP分型为A.Br.001/002组。结论2019-2020年宁夏分离到的炭疽芽胞杆菌致病力较强,且菌株呈现相同的基因分型特征,提示菌株间存在流行病学关联。此研究结果填补了宁夏炭疽芽胞杆菌实验室检测中菌株致病力及基因分型的空白。 展开更多
关键词 炭疽芽胞杆菌 毒力因子 基因分型
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炭疽芽孢杆菌芽孢适配子的结构与亲和性分析 被引量:3
7
作者 甄蓓 宋亚军 +4 位作者 王津 郭兆彪 张敏丽 俞守义 杨瑞馥 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2001年第6期419-422,共4页
为了对炭疽芽孢杆菌疫苗株A .16R芽孢的适配子进行亲和性分析 ,体外构建了 78个碱基的随机DNA库 ,以炭疽芽孢杆菌疫苗株A .16R芽孢为靶标 ,用SELEX技术进行了 15轮的筛选 ,将筛选到的适配子库进行克隆、测序 ,用Macaw 2 .0 5和DNAsisv2... 为了对炭疽芽孢杆菌疫苗株A .16R芽孢的适配子进行亲和性分析 ,体外构建了 78个碱基的随机DNA库 ,以炭疽芽孢杆菌疫苗株A .16R芽孢为靶标 ,用SELEX技术进行了 15轮的筛选 ,将筛选到的适配子库进行克隆、测序 ,用Macaw 2 .0 5和DNAsisv2 .5软件对每一适配子的保守序列和二级结构进行分析 ,并用生物素 链酶亲和素 辣根酶系统检测 ,根据OD值的高低判定亲和力的大小 ,对每一适配子进行亲和力测定。结果表明 ,适配子的亲和力高低不一 ,OD值最高为 1.2 ,最低为 0 .2 5 ,二级结构分析结果显示 ,茎环和茎等二级结构可能是适配子与芽孢结合的基础 ;其一级结构提示有AGGGG、CCCCG、GGGTT、ACACT等保守序列 。 展开更多
关键词 炭疽芽孢杆菌 适配子 基因 结构 亲和性
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炭疽杆菌PA63蛋白原核表达及抗体检测间接ELISA方法的建立 被引量:3
8
作者 刘东立 马琳 +2 位作者 张恩民 石一 李文涓 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2018年第11期1227-1231,共5页
目的原核表达炭疽杆菌PA63蛋白,以此为包被抗原建立检测相应抗体的间接ELSIA方法,用于炭疽血清免疫学诊断。方法选择炭疽杆菌PA63为目的基因,合成全长序列,构建pCzn1-PA63质粒,克隆至E.coli ArcticExpress表达菌株,优化IPTG表达条件,通... 目的原核表达炭疽杆菌PA63蛋白,以此为包被抗原建立检测相应抗体的间接ELSIA方法,用于炭疽血清免疫学诊断。方法选择炭疽杆菌PA63为目的基因,合成全长序列,构建pCzn1-PA63质粒,克隆至E.coli ArcticExpress表达菌株,优化IPTG表达条件,通过包涵体变性复性,Ni柱纯化获得可溶性PA63蛋白。利用棋盘滴定法确定包被PA63蛋白的最佳浓度及血清最佳稀释度建立间接ELISA方法,对炭疽阳性血清和阴性血清进行检测,计算ROC曲线下面积,确定Cut-off值,灵敏度与特异度。结果成功构建了pCzn1-PA63质粒,IPTG 37℃诱导表达蛋白主要以包涵体形式存在。包涵体经变性、复性,纯化后获得PA63蛋白。用5μg/ml PA63包被酶标板,血清稀释度为1∶50建立的ELISA方法;ROC曲线下面积为0.969(P<0.01),Cut-off值为0.2865时的灵敏度为91.18%(95%可信区间为76.32%-98.14%),特异度为94.64%(95%可信区间为85.13%-98.88%)。结论成功表达具有生物活性的重组炭疽杆菌PA63抗原蛋白,以此为包被抗原建立的间接ELISA检测炭疽PA抗体,具有较高的灵敏度与特异度,可用于炭疽的血清学诊断。 展开更多
关键词 炭疽 保护性抗原 PA63 间接ELISA ROC曲线
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一起疑似炭疽疫苗菌株毒力恢复事件中炭疽芽孢杆菌的毒力鉴定与分析 被引量:4
9
作者 张恩民 湛志飞 +6 位作者 魏强 张锡兴 胡艳红 夏昕 万康林 魏建春 高立冬 《疾病监测》 CAS 2019年第1期76-79,共4页
目的对某校疑似炭疽疫苗菌株毒力恢复事件(事件)中,教学实验使用的炭疽芽孢杆菌毒力及其环境污染情况进行鉴定和调查,为合理处理该事件提供参考依据。方法调查事件发生的情况、采集实验用培养物、冻存菌株和实验室环境样本。对实验用培... 目的对某校疑似炭疽疫苗菌株毒力恢复事件(事件)中,教学实验使用的炭疽芽孢杆菌毒力及其环境污染情况进行鉴定和调查,为合理处理该事件提供参考依据。方法调查事件发生的情况、采集实验用培养物、冻存菌株和实验室环境样本。对实验用培养物进行噬菌体裂解和青霉素敏感试验鉴定;选取炭疽芽孢杆菌的rpoB基因和毒力相关的pagA和capC基因,应用TaqMan荧光探针法对采集样本进行检测。结果实验用培养物的噬菌体裂解试验显示有明显的噬菌斑,青霉素敏感试验显示在青霉素纸片周围有明显的抑菌环,并且培养物和冻存菌株rpoB和pagA基因检测为阳性,capC基因检测为阴性;教学场所的环境样本rpoB、pagA和capC基因检测均为阴性。结论该事件中实验用培养物和冻存菌株均为缺少capC基因的减毒炭疽芽孢杆菌,未发现毒力恢复情况;教学场所中无炭疽芽孢杆菌的污染。 展开更多
关键词 炭疽芽孢杆菌 疫苗 毒力恢复 生物安全
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等位基因特异性PCR方法检测炭疽芽胞杆菌致死因子基因点突变的评价 被引量:3
10
作者 魏建春 张建中 +2 位作者 张恩民 马凤琴 张建华 《中国媒介生物学及控制杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第5期394-397,共4页
目的建立并评价等位基因特异性聚合酶链反应(PCR)在筛选炭疽芽胞杆菌致死基因点突变中的作用。方法等位基因特异性PCR方法。结果等位基因特异性PCR扩增的筛选方法假阳性率较高,其特异性与引物3′端的碱基类型关系不大,与退火温度、模板... 目的建立并评价等位基因特异性聚合酶链反应(PCR)在筛选炭疽芽胞杆菌致死基因点突变中的作用。方法等位基因特异性PCR方法。结果等位基因特异性PCR扩增的筛选方法假阳性率较高,其特异性与引物3′端的碱基类型关系不大,与退火温度、模板浓度等均有关系。高保真Taq DNA聚合酶不能改善这种假阳性。结论等位基因特异性PCR筛选方法影响因素较多,假阳性率高,不适于直接作为点突变的筛选方法。 展开更多
关键词 等位基因特异性聚合酶链反应 点突变 炭疽芽胞杆菌
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辽宁省炭疽疫源性调查和流行趋势分析 被引量:2
11
作者 孙广玖 张眉眉 +1 位作者 姚文清 王英军 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期416-416,共1页
关键词 炭疽芽孢杆菌 流行趋势分析 疫源性 辽宁省 自然状态 传染病 抵抗力
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炭疽杆菌双重实时荧光PCR检测方法的建立 被引量:6
12
作者 谭维国 陈文琦 +5 位作者 吕恒 刘玉 王平 陈凤娟 王长军 张锦海 《东南国防医药》 2013年第6期556-559,共4页
目的建立同时检测炭疽杆菌capA基因、PA基因的双重实时定量荧光PCR方法,用于应对突发传染病疫情和流行病学调查、突发公共卫生事件应急处置的早期检测及防范生物恐怖威胁。方法设计和合成分别针对炭疽杆菌capA基因、PA基因的引物对和荧... 目的建立同时检测炭疽杆菌capA基因、PA基因的双重实时定量荧光PCR方法,用于应对突发传染病疫情和流行病学调查、突发公共卫生事件应急处置的早期检测及防范生物恐怖威胁。方法设计和合成分别针对炭疽杆菌capA基因、PA基因的引物对和荧光双标记探针,构建质粒标准品,通过优化探针、引物浓度、反应体系试剂组分等参数,建立可同时检测capA基因、PA基因的双重实时荧光PCR方法,测试方法的灵敏度和特异性,并在实战检测中应用。结果双重实时荧光定量PCR的炭疽杆菌capA基因、PA基因检测的灵敏度分别可达到每反应5和50拷贝,并具有良好的特异性,在实战应用中亦经过考验。结论双重实时荧光定量PCR技术具有可以同时筛查、经济、快速、特异性强等优点,在炭疽杆菌检测方面有良好应用价值。 展开更多
关键词 炭疽杆菌 双重实时荧光定量聚合酶链反应 检测
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炭疽噬菌体国家参考品的研制 被引量:2
13
作者 魏东 李恪梅 +6 位作者 肖丽华 梁昊宇 裴明玉 庄新海 魏然 翟雷 王国治 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2013年第9期1325-1327,共3页
目的研制炭疽鉴别试验及炭疽活疫苗纯菌检查用炭疽噬菌体国家参考品。方法制备炭疽噬菌体参考品,建立噬菌体参考品效价质量标准,组织4个实验室对该参考品进行协作验证,并对参考品稳定性进行分析。结果研制的炭疽噬菌体国家参考品,其效... 目的研制炭疽鉴别试验及炭疽活疫苗纯菌检查用炭疽噬菌体国家参考品。方法制备炭疽噬菌体参考品,建立噬菌体参考品效价质量标准,组织4个实验室对该参考品进行协作验证,并对参考品稳定性进行分析。结果研制的炭疽噬菌体国家参考品,其效价质量标准应不低于1.0×108PFU/ml;经协作验证,该参考品可有效鉴别3批炭疽活疫苗;该参考品在4℃条件下稳定性较好,37℃稳定性较差。结论研制的炭疽噬菌体国家参考品已被国家有关部门正式批准,可用于炭疽鉴别试验及炭疽活疫苗纯菌检查。 展开更多
关键词 炭疽 噬菌体 效价 参考品
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抗体-适配子混合夹心法检测炭疽芽孢杆菌芽孢的研究 被引量:5
14
作者 甄蓓 张敏丽 +5 位作者 宋亚军 郭兆彪 王津 杜宗敏 俞守义 杨瑞馥 《生物技术通讯》 CAS 2002年第2期123-125,共3页
通过SELEX(SystemEvolutionofLigandsbyEXponentialenrichment)体外筛选技术寻获的能与炭疽芽孢杆菌芽孢特异结合的DNA适配子(aptamer)考察其作为检测分子的能力。利用抗体-适配子混合夹心法,根据显色反应强度,评价适配子检测炭疽芽孢... 通过SELEX(SystemEvolutionofLigandsbyEXponentialenrichment)体外筛选技术寻获的能与炭疽芽孢杆菌芽孢特异结合的DNA适配子(aptamer)考察其作为检测分子的能力。利用抗体-适配子混合夹心法,根据显色反应强度,评价适配子检测炭疽芽孢杆菌芽孢的能力。结果表明,适配子可以作为检测分子检测靶物质的存在。适配子检测范围在2-16μg,芽孢的检测范围在4×104-4×107,当适配子16μg,芽孢量为4×107显色的指示强度最强。说明适配子作为检测用分子,具有潜在的实用价值。 展开更多
关键词 芽孢 适配子 混合免疫夹心法 抗体 炭疽杆菌 检测
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一起炭疽疫情中炭疽病原检测方法的应用与评价 被引量:3
15
作者 张慧娟 梁旭东 +5 位作者 海岩 李忠延 袁海涛 郭长山 东晓晖 魏建春 《中国媒介生物学及控制杂志》 CAS CSCD 2012年第3期231-233,共3页
目的分析总结一起炭疽疫情中应急检测的经验与问题,为炭疽疾病预防控制提供参考依据。方法采集报告的疑似皮肤炭疽患者皮损渗出液和静脉血标本,与病例相关的病死动物和土壤标本,渗出液采集采用载玻片直接蘸取和无菌棉签擦取2种方法,用... 目的分析总结一起炭疽疫情中应急检测的经验与问题,为炭疽疾病预防控制提供参考依据。方法采集报告的疑似皮肤炭疽患者皮损渗出液和静脉血标本,与病例相关的病死动物和土壤标本,渗出液采集采用载玻片直接蘸取和无菌棉签擦取2种方法,用涂片镜检、直接分离培养和肉汤增菌后分离培养细菌以及炭疽芽胞杆菌毒力基因PCR扩增方法检测病原,分析检测结果。结果共采集标本57份,病例标本占91.23%,病死牛肉及剖牛处土壤标本占8.77%。病例标本采集时间距发病时间最短1d,最长23d,平均6.62d。29例疑似皮肤炭疽患者在采样时其中16例(占55.17%)已使用抗生素类药物治疗,4例(占13.79%)未曾使用抗生素。从2例未使用抗生素的患者皮损渗出液和1份病死牛肉中分离到炭疽芽胞杆菌,分离阳性率为5.26%;其中1例患者皮损渗出液涂片镜检阳性;全部标本PCR扩增结果均为阴性。结论标本炭疽芽胞杆菌阳性检出率较低,与采样方法和采样时机关系较大,应加强部门间的沟通协作和人群的健康教育,做到疫情早报告、早确诊、早控制。 展开更多
关键词 炭疽 疫情 应急检测
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炭疽芽孢DNA适配子结构与长度对亲和力的影响 被引量:2
16
作者 甄蓓 宋亚军 +3 位作者 郭兆彪 王津 俞守义 杨瑞馥 《第四军医大学学报》 北大核心 2002年第16期1467-1470,共4页
目的 研究炭疽芽孢适配子结构与长度变化对其与芽孢之间亲和力的影响 .方法 人工合成 f77- 1适配子序列 ,并构建在其 7条突变体序列 ,将这些寡核苷酸序列分别与炭疽芽孢结合 ,利用 TMB显色系统判断读取吸光度 A值 ,确定各序列与芽孢... 目的 研究炭疽芽孢适配子结构与长度变化对其与芽孢之间亲和力的影响 .方法 人工合成 f77- 1适配子序列 ,并构建在其 7条突变体序列 ,将这些寡核苷酸序列分别与炭疽芽孢结合 ,利用 TMB显色系统判断读取吸光度 A值 ,确定各序列与芽孢间亲和力大小 ;同时通过核酸序列分析软件包模拟各序列的二级结构 ,推断适配子的结构与亲和力之间的关系 .结果 适配子 f77- 1与突变体中的 f77- 3与芽孢亲和力较好 ,约是突变体中 f77- 4亲和力的 1 1倍 ,二级结构显示 :f77- 1 ,f77- 3都具有茎环或发卡结构 ,且 3'端都有连续 3个G.结论 适配子 5'端的茎环结构和发卡结构是这些寡核苷酸序列与芽孢结合的结构基础 ,3'端的连续 3个 展开更多
关键词 炭疽芽孢 DNA 适配子 结构 长度 亲和力 炭疽芽孢杆菌
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炭疽毒素受体及其与炭疽毒素的相互作用研究进展 被引量:2
17
作者 屈野 徐俊杰 陈薇 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第8期825-828,共4页
关键词 炭疽毒素受体 相互作用 细菌感染性疾病 炭疽杆菌芽胞 生物恐怖袭击 革兰氏阳性 杆菌感染 炭疽芽胞
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炭疽杆菌双重可视化LAMP检测方法的建立 被引量:3
18
作者 刘玉 陈文琦 +5 位作者 王平 操敏 韩一芳 张琪 张锦海 王长军 《东南国防医药》 2016年第4期341-345,共5页
目的建立同时检测炭疽杆菌cap A基因、PA基因的双重环介导等温扩增(Loop-mediated isothermal amplification,LAMP)方法,用于防范生物恐怖威胁。方法设计和合成分别针对炭疽杆菌cap A基因、PA基因的引物对,通过优化参数,建立可同时检测c... 目的建立同时检测炭疽杆菌cap A基因、PA基因的双重环介导等温扩增(Loop-mediated isothermal amplification,LAMP)方法,用于防范生物恐怖威胁。方法设计和合成分别针对炭疽杆菌cap A基因、PA基因的引物对,通过优化参数,建立可同时检测cap A基因、PA基因的双重LAMP方法,测试敏感性和特异性,并应用于模拟样本和实战检测。结果双重LAMP的检测cap A基因、PA基因的敏感性均可达到50模板拷贝每反应,并具有良好的特异性,在重大保障活动中得到检验。结论双重LAMP方法具有可以同时筛查、简单快速、灵敏度高等优点,在炭疽杆菌检测方面有良好应用前景。 展开更多
关键词 炭疽杆菌 环介导等温扩增 检测
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2024年山西省长治市屯留区一起皮肤炭疽疫情流行病学调查及病原学分析
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作者 申旭燕 杨红霞 +6 位作者 原超普 万晋霞 侯莹 王方 李玲玲 樊荣 张慧娟 《疾病监测》 北大核心 2025年第7期957-961,共5页
目的对2024年山西省长治市屯留区首例疑似皮肤炭疽疫情进行流行病学分析及实验室诊断,为炭疽疫情防控提供重要的数据支撑。方法采用现场流行病学调查方法对炭疽疑似病例和密切接触者进行个案调查;对采集样本进行炭疽芽胞杆菌分离、鉴定... 目的对2024年山西省长治市屯留区首例疑似皮肤炭疽疫情进行流行病学分析及实验室诊断,为炭疽疫情防控提供重要的数据支撑。方法采用现场流行病学调查方法对炭疽疑似病例和密切接触者进行个案调查;对采集样本进行炭疽芽胞杆菌分离、鉴定、实时荧光定量聚合酶链式反应检测和经典单核苷酸多态性(canSNP)分子分型检测。结果本次疫情为人间皮肤炭疽散发疫情,传染源为病死牛,病例因屠宰病死牛感染炭疽。从病死牛相关环境样本中分离到炭疽芽胞杆菌,病例样本及环境样本均检出炭疽芽胞杆菌特异基因,且canSNP分型均为A.Br.Ames基因型。结论根据流行病学调查和实验室诊断结果,该次疫情是因人接触了患有炭疽的病死牛导致的一起聚集性炭疽疫情,建议相关部门加强传染源追踪管理和疫点消毒,并进一步开展相关监测,防止新的炭疽疫源地的形成和扩散。 展开更多
关键词 流行病学调查 炭疽芽胞杆菌 细菌学检测 分子分型
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炭疽杆菌芽孢外壁胶原样蛋白(BclA)的多态性分析 被引量:1
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作者 李冠霖 徐俊杰 +2 位作者 董大勇 宋小红 陈薇 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期100-104,共5页
炭疽杆菌芽孢外壁胶原样蛋白(Bc lA)是芽孢外壁发状菌丝的主要结构成分,也是芽孢的主要免疫原。从国内分离的3株炭疽杆菌中克隆出Bc lA基因并进行了序列分析,结果发现有2株(A16R和40048)的Bc lA与国外报道菌株长度不同,分别含有388个和... 炭疽杆菌芽孢外壁胶原样蛋白(Bc lA)是芽孢外壁发状菌丝的主要结构成分,也是芽孢的主要免疫原。从国内分离的3株炭疽杆菌中克隆出Bc lA基因并进行了序列分析,结果发现有2株(A16R和40048)的Bc lA与国外报道菌株长度不同,分别含有388个和322个氨基酸,72个和50个GXX三氨基酸重复序列,5个和3个含21个氨基酸的(GPT)5GDTGTT重复序列(Bc lA重复)。另一株40022的Bc lA与国外报道的53169株完全一致,含有370个氨基酸,66个GXX重复,5个Bc lA重复。对我国炭疽杆菌Bc lA蛋白多态性的分析为进行炭疽杆菌的基因分型以及研究炭疽芽孢的免疫原性和致病机理打下基础。 展开更多
关键词 炭疽杆菌 BclA蛋白 多态性 芽孢
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