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甘肃省肃北蒙古族自治县喜马拉雅旱獭疫源地鼠疫耶尔森菌分子流行病学特征研究
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作者 郭丽民 张晓玲 +3 位作者 黄燕妍 赵存寿 张成鑫 付国明 《中国人兽共患病学报》 北大核心 2025年第2期158-163,170,共7页
目的 研究肃北县鼠疫菌差异区段(DFR)、规律成簇的间隔短回文重复序列(CRISPR)及可变数目串联重复序列(VNTR)的基因多态性特征,指导突发鼠疫疫情的溯源。方法 对1973-2017年间肃北县鼠疫疫源地不同动物宿主分离的89株鼠疫菌进行培养,提... 目的 研究肃北县鼠疫菌差异区段(DFR)、规律成簇的间隔短回文重复序列(CRISPR)及可变数目串联重复序列(VNTR)的基因多态性特征,指导突发鼠疫疫情的溯源。方法 对1973-2017年间肃北县鼠疫疫源地不同动物宿主分离的89株鼠疫菌进行培养,提取DNA。分别利用DFR、CRISPR和MLVA基因分型的引物进行PCR反应,通过琼脂糖电泳观察扩增产物有无,与中国鼠疫菌DFR数据库比较确定鼠疫菌DFR基因型;通过PCR产物测序,与在线鼠疫菌CRISPR数据库比对确定CRISPR基因型;通过毛细管电泳计算每株鼠疫菌VNTR的重复数,基于肃北县89株与11株青海省喜马拉雅旱獭疫源地的鼠疫菌VNTR重复数应用BioNumerics7.6构建最小生成树。结果 肃北县89株鼠疫菌可分为6个DFR基因型,分别为8型、7型、1b型、5型、32型和44型,其中8型为肃北县鼠疫疫源地主要基因组型。肃北县89株鼠疫菌经CRISPR分型,可分为3个基因簇和3个基因型,其中Ca35′为肃北县鼠疫疫源地的主要基因簇,基因型为26′,主要分布在肃北蒙古族自治县党城湾镇、鱼儿红乡和石包城乡;Ca7和CaΔ5′为肃北县鼠疫疫源地的次要基因簇,基因型为22和24型,分布在党城湾镇、鱼儿红乡和石包城乡。MLVA聚类分析,肃北县鼠疫菌主要分为3个簇,分别为党城湾镇马场簇、鱼儿红乡簇和党城湾镇簇。结论 DFR、CRISPR和MLVA基因分型方法均能将肃北县鼠疫菌分为主要基因型和次要基因型,具有显著的地区分布特征,基因型多样性较高,种群特征复杂,尤其在鼠疫疫情溯源时给予重视。 展开更多
关键词 肃北县 差异区段 规律成簇的间隔短回文重复序列 多位点可变数目串联重复序列
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青海省鼠疫菌单核苷酸多态性分析
2
作者 何建 靳娟 +5 位作者 李胜 柏吉祥 金泳 张丽 杨晓艳 辛有全 《中华卫生杀虫药械》 2025年第1期103-106,共4页
目的 探讨青海省鼠疫自然疫源地鼠疫菌单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)的基因型及其地区分布。方法 选取青海省地方病预防控制所保存的1954—2020年在不同地区宿主、媒介体内分离的250株鼠疫菌作为实验菌株,采用... 目的 探讨青海省鼠疫自然疫源地鼠疫菌单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)的基因型及其地区分布。方法 选取青海省地方病预防控制所保存的1954—2020年在不同地区宿主、媒介体内分离的250株鼠疫菌作为实验菌株,采用传统的苯酚-氯仿混合抽提法提取鼠疫菌DNA。使用Illumina HiSeq 2000平台对250株鼠疫菌进行全基因测序,根据文献中鼠疫菌全基因组SNPs分析方法,基于133株国内外鼠疫菌株及假结核耶尔森菌IP32953,比对2 298个SNP位点,用MEGA 6.0软件对250株青海省鼠疫菌以及32株参考菌株构建系统发育关系。结果 青海省250株鼠疫菌分布于8个市(州),31个县(区)。其中海西州共66株,海北州共70株,海南州共28株,玉树州共62株,黄南州、果洛州、西宁市、海东市共24株。基于2 298个SNPs位点的聚类结果显示,青海省250株鼠疫菌分布在5个亚分支中,分别为0.PE分支6株(2.0%),1.IN分支235株(94.0%),2.ANT分支4株(1.6%),2.MED分支1株(0.4%),3.ANT分支4株(1.6%)。结论 青海省鼠疫自然疫源地鼠疫菌SNP基因型具有高度多样性,地区分布特征明显。 展开更多
关键词 鼠疫菌 单核苷酸多态性(SNP) SNP基因分型 青海省
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1例多杀巴斯德氏菌混合非结核分枝杆菌肺部感染病例的病原学分析
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作者 郑文颖 叶硕 《中国人兽共患病学报》 北大核心 2025年第4期441-446,共6页
目的报道1例多杀巴斯德氏菌混合非结核分枝杆菌肺部感染病例,研究多杀巴斯德氏菌的病原学特征。方法病例为69岁女性,以支气管扩张伴感染入院,行支气管肺泡灌洗液细菌培养、分枝杆菌分离培养及Dano-seq多重病原体检测后,对多杀巴斯德氏... 目的报道1例多杀巴斯德氏菌混合非结核分枝杆菌肺部感染病例,研究多杀巴斯德氏菌的病原学特征。方法病例为69岁女性,以支气管扩张伴感染入院,行支气管肺泡灌洗液细菌培养、分枝杆菌分离培养及Dano-seq多重病原体检测后,对多杀巴斯德氏菌株进行药敏检测、二代测序及分析。结果培养和Dano-seq多重病原体检测出堪萨斯分枝杆菌、多杀巴斯德氏菌。多杀巴斯德氏菌主要的毒力因子有htrB、rfaE、msbA等21个,耐药基因存在floR、sul2、FosA3等10个,MLST分析pmultocida方案分型为ST12。经构建进化树分析发现与国内主要流行株同源。结论传统分离培养联合二代测序的检测方案有助于快速准确地识别少见病原菌,并提供必要的药敏结果,从而促进罕见病的准确诊治。 展开更多
关键词 多杀巴斯德氏菌 人兽共患病 二代测序 进化树
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ABC转运透性酶DppC2的缺失有利于鼠疫耶尔森氏菌在巨噬细胞内的生存
4
作者 申雷鸣 魏雨萌 +8 位作者 崔一鸣 赵彦婷 姚文武 刘瑾萍 郭阳云 李嘉敏 石佳丽 宋凯 宋亚军 《微生物学报》 北大核心 2025年第9期4060-4074,共15页
【目的】研究dppC2基因在鼠疫耶尔森氏菌(鼠疫菌)巨噬细胞内生存中的作用。【方法】采用自杀质粒同源重组法构建鼠疫菌201株的dppC2基因无痕敲除株(201-ΔdppC2);通过巨噬细胞内生存实验、酸生存实验、过氧化氢生存实验、酶活测定、活... 【目的】研究dppC2基因在鼠疫耶尔森氏菌(鼠疫菌)巨噬细胞内生存中的作用。【方法】采用自杀质粒同源重组法构建鼠疫菌201株的dppC2基因无痕敲除株(201-ΔdppC2);通过巨噬细胞内生存实验、酸生存实验、过氧化氢生存实验、酶活测定、活性氧检测、细胞毒力测定和小鼠攻毒实验等,比较201-ΔdppC2与野生株(201-WT)的表型差异;利用转录组学分析和实时定量逆转录PCR(real-time quantitative reverse transcription PCR,RT-qPCR)分析201-ΔdppC2与201-WT的基因表达差异。【结果】与201-WT相比,201-ΔdppC2在小鼠单核巨噬细胞RAW264.7和人单核细胞白血病细胞THP-1中的胞内生存率显著升高,酸生存率及过氧化氢生存率升高,耐酸基因hdeD以及过氧化物酶相关基因katA和katG的转录水平上调,过氧化氢酶和过氧化物酶的活力升高,细菌及其感染的巨噬细胞RAW264.7胞内活性氧水平降低;对HeLa细胞的毒性降低,但对小鼠的毒力无差异。【结论】dppC2基因缺失后,鼠疫菌对酸性和过氧化氢环境的适应性提高,有利于鼠疫菌在巨噬细胞内的生存和复制。 展开更多
关键词 鼠疫菌 巨噬细胞 dppC2 胁迫环境耐受性
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四川西部高海拔地区鼠形动物携带重要病原体的调查研究
5
作者 李世豪 付邦 +7 位作者 任佳荣 王紫航 宋秀平 方心悦 梁莹 鲁亮 刘小波 刘起勇 《中国人兽共患病学报》 北大核心 2025年第8期879-886,共8页
目的 调查四川西部高海拔地区鼠形动物及其携带8种病原体情况,为当地鼠传疾病防控和病原体监测提供依据。方法 2023年8-11月在四川西部高海拔地区采用夹夜法捕获鼠形动物,采集鼠体肝、肺后提取核酸,使用荧光定量PCR(qPCR)/反转录qPCR(RT... 目的 调查四川西部高海拔地区鼠形动物及其携带8种病原体情况,为当地鼠传疾病防控和病原体监测提供依据。方法 2023年8-11月在四川西部高海拔地区采用夹夜法捕获鼠形动物,采集鼠体肝、肺后提取核酸,使用荧光定量PCR(qPCR)/反转录qPCR(RT-qPCR)法,检测鼠体携带大别班达病毒、汉坦病毒、巴尔通体、土拉弗朗西斯菌、嗜吞噬细胞无形体、莫氏立克次体、恙虫病东方体、致病性钩端螺旋体8种重要病原体。不同组间鼠种的构成比及不同组间病原体阳性率差异的比较用χ^(2)检验。结果 捕获鼠形动物9种共114只,该地区优势鼠种为黑线姬鼠(22.81%)、高山姬鼠(18.42%)、北社鼠(17.54%)、大耳姬鼠(16.67%)、大林姬鼠(13.16%),其他鼠种包括大足鼠(4.39%)、高原松田鼠(4.39%)、川西缺齿鼩(1.75%)、川西白腹鼠(0.88%)。鼠形动物在不同地区、海拔、生境之间的鼠种构成差异都具有统计学意义(χ^(2)_(地区)=112.358, P<0.05;χ^(2)_(海拔)=96.843, P<0.05;χ^(2)_(生境)=48.842, P<0.05)。肝、肺病原检测结果显示,巴尔通体阳性率最高25.44%(29/114),其余7种病原体阳性率在0%~4.39%之间。5只鼠形动物合并感染2种及以上病原体,复合阳性率为4.36%(5/114)。致病性钩端螺旋体在不同鼠种间差异具有统计学意义(χ^(2)=6.568, P=0.028),不同生境中的嗜吞噬细胞无形体阳性率差异具有统计学意义(χ^(2)=7.596, P=0.027),其他病原体在不同鼠种、地区、海拔、生境、性别间阳性率差异无统计学意义(P > 0.05)。结论 四川西部高海拔地区鼠类物种较为丰富,携带多种病原体,并且存在多种病原体复合感染情况,其中巴尔通体阳性率较高。生活区中病原体感染率较高,对人群致病风险较大,应加强鼠类管理和鼠传疾病的监测。 展开更多
关键词 鼠形动物 病原体 鼠传疾病 分布 调查
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鼠疫耶尔森菌多酶等温快速扩增检测方法的建立和应用
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作者 张传宇 扎西 +7 位作者 曹轩烨 刘祎 刘倩 李玲雯 史艳文 王宇萌 刘国宪 李伟 《疾病监测》 北大核心 2025年第5期619-625,共7页
目的建立多酶等温快速扩增(MIRA)结合成簇规律间隔短回文重复序列(CRISPR)/Cas12a核酸检测方法检测鼠疫耶尔森菌,评价方法的灵敏性、特异性,评价方法对鼠疫临床患者和动物鼠疫标本的适用性。方法选择pla和caf1两个靶基因,建立MIRA-CRISP... 目的建立多酶等温快速扩增(MIRA)结合成簇规律间隔短回文重复序列(CRISPR)/Cas12a核酸检测方法检测鼠疫耶尔森菌,评价方法的灵敏性、特异性,评价方法对鼠疫临床患者和动物鼠疫标本的适用性。方法选择pla和caf1两个靶基因,建立MIRA-CRISPR检测方法。其中,caf1基因位于pMT1质粒上,具有高度特异性;而针对pla基因在近缘菌中存在同源序列的问题,利用鼠疫耶尔森菌pla基因特异性核酸位点作为引物3'端的策略来保障pla基因检测鼠疫菌的特异性。通过梯度配比法对该方法进行体积比优化,采用阳性质粒模板评估方法的敏感性,使用包含了鼠疫耶尔森菌近缘菌的非鼠疫耶尔森菌DNA模板评估方法的特异性。最后通过检测6例临床确诊鼠疫患者的血液或淋巴液样本及6份自然疫源地动物肝脏样本,评价该方法的适用性。结果MIRA-CRISPR方法可在30 min内完成检测。当MIRA与CRISPR体系体积比为1∶2时,检测灵敏度达到最优,该方法对阳性质粒模板的检测限为9拷贝(caf1)和2拷贝(pla)。特异性实验表明,该方法能有效区分鼠疫耶尔森菌与其近缘菌株。经实际鼠疫阳性样本和阴性对照验证,所有临床样本(6/6)和动物样本(6/6)均被准确检出,展现出良好的实用性能。结论本研究发展的MIRA-CRISPR具有高灵敏度和高特异性,因此适用于人间鼠疫和动物间鼠疫的检测,尤其是在检测目标DNA含量较低的样本中具有显著优势。 展开更多
关键词 鼠疫耶尔森菌 簇状规则间隔短回文重复序列 多酶恒温核酸快速扩增
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青海省海南州鼠疫耶尔森菌单核苷酸多态性分析
7
作者 张丽 靳娟 +5 位作者 何建 杨晓艳 辛有全 柏吉祥 张晓璐 李胜 《中华卫生杀虫药械》 2025年第3期270-273,共4页
目的基于鼠疫菌全基因组单核苷酸多态性(SNP)分析,了解青海省海南州喜马拉雅旱獭鼠疫疫源地鼠疫菌种群结构,为该地新分离菌株的溯源及鼠疫监测方案的及时调整提供理论依据。方法对海南州31株代表性鼠疫菌进行测序,利用全基因组测序数据... 目的基于鼠疫菌全基因组单核苷酸多态性(SNP)分析,了解青海省海南州喜马拉雅旱獭鼠疫疫源地鼠疫菌种群结构,为该地新分离菌株的溯源及鼠疫监测方案的及时调整提供理论依据。方法对海南州31株代表性鼠疫菌进行测序,利用全基因组测序数据比对2298个SNP位点的变异情况,构建系统发育树,分析该疫源地鼠疫菌种群结构。结果海南州31株鼠疫菌生物型均为古典型,29株鼠疫菌的生态型为青藏高原型,2株为祁连山型;31株鼠疫菌均聚类至1.IN谱系1.IN2分支;1.IN2支群是该地的优势种群,海南州喜马拉雅旱獭鼠疫疫源地稳定存在。结论青海省海南州鼠疫菌菌株保守性高,系统发育的聚类与地理位置对应关系较好,SNP检测方法可以用于鼠疫菌暴发疫情的溯源分析。 展开更多
关键词 鼠疫菌 单核苷酸多态性(SNP) 海南州 鼠疫疫源地 基因分型
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OmniLog TM微生物鉴定系统在青海高原野生型鼠疫噬菌体宿主谱检测中的应用研究 被引量:2
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作者 李存香 祁芝珍 +6 位作者 张青雯 赵海红 马龙 游陪松 杨建国 吴海生 冯建萍 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期21-25,共5页
目的采用两种微量法检测青海高原野生型鼠疫噬菌体的宿主谱,为今后噬菌体生态学研究和基于宿主范围噬菌体分类研究提供科学依据。方法基于OmniLog TM微生物鉴定系统微量法和微量点滴法,检测3株鼠疫噬菌体对2株鼠疫耶尔森菌(鼠疫疫苗株EV... 目的采用两种微量法检测青海高原野生型鼠疫噬菌体的宿主谱,为今后噬菌体生态学研究和基于宿主范围噬菌体分类研究提供科学依据。方法基于OmniLog TM微生物鉴定系统微量法和微量点滴法,检测3株鼠疫噬菌体对2株鼠疫耶尔森菌(鼠疫疫苗株EV 76、614F)和4株非鼠疫耶尔森菌(假结核耶尔森菌PTB3、PTB5、大肠杆菌V517、小肠结肠炎耶尔森菌52302-2)的裂解情况。结果476号、087号和072204号鼠疫噬菌体均能成功感染鼠疫疫苗株EV 76、614F并依赖其生长繁殖,且基于OmniLog TM系统33℃培养48 h也能够观察到试验孔中四唑类染料颜色随着噬菌体数量的增加和宿主菌数量的减少而变淡。利用微量点滴法检测3株鼠疫噬菌体对4株非鼠疫耶尔森菌敏感性结果显示,28℃和37℃时476号鼠疫噬菌体对假结核耶尔森菌PTB5敏感,而087号和072204号对其不敏感;476号、087号和072204号鼠疫噬菌体对假结核耶尔森菌PTB3、大肠杆菌V517、小肠结肠炎耶尔森菌52302-2这3株非鼠疫耶尔森菌均不敏感,且基于OmniLog TM系统观察到试验孔与对照孔中细菌生长曲线和四唑类染料颜色分别呈现相似对应的结果。然而,以鼠疫疫苗株EV 76、614F为宿主菌,37℃时072204号鼠疫噬菌体微量点滴于固体培养基上不显示噬菌斑。结论基于OmniLog TM检测系统的噬菌体宿主范围测定法可以作为一种替代传统检测宿主谱的测定方法,在噬菌体与宿主菌相互作用研究中具有较好的应用价值。 展开更多
关键词 噬菌体 鼠疫菌 宿主谱 OmniLog TM微生物鉴定系统 点滴法
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喜马拉雅旱獭血清中鼠疫噬菌体特异性抗体检测 被引量:1
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作者 杨建国 游培松 +9 位作者 张晓璐 李光辉 李翔 李胜 冯建萍 金泳 赵海红 王永顺 谷昕玥 李存香 《医学动物防制》 2024年第8期770-773,共4页
目的利用微量板法间接检测青海省兴海县喜马拉雅旱獭血清中特异性鼠疫噬菌体抗体,为该地区鼠疫流行态势分析、噬菌体与哺乳动物机体免疫系统的相互作用提供理论依据。方法采用微量板法经间接血细胞凝集试验,检测497份采集于2020—2021... 目的利用微量板法间接检测青海省兴海县喜马拉雅旱獭血清中特异性鼠疫噬菌体抗体,为该地区鼠疫流行态势分析、噬菌体与哺乳动物机体免疫系统的相互作用提供理论依据。方法采用微量板法经间接血细胞凝集试验,检测497份采集于2020—2021年青海省兴海县喜马拉雅旱獭血清中的鼠疫耶尔森菌荚膜蛋白FraI抗体,再以1株温和性鼠疫噬菌体和1株裂解性鼠疫噬菌体为抗原,采用微量板法和双层琼脂平板法间接检测喜马拉雅旱獭血清中的鼠疫噬菌体抗体。结果采用微量板法经间接血细胞凝集试验检测497份喜马拉雅旱獭血清中鼠疫耶尔森菌荚膜蛋白FraI抗体,均为阴性;其次497份血清分别与2株不同类型鼠疫噬菌体进行中和试验,基于点滴法在上述血清中均未检测到鼠疫噬菌体免疫抗体,间接提示兴海县鼠疫耶尔森菌的数量可能与特定噬菌体的出现相关。结论2010—2019年兴海县鼠疫疫源地未发现动物间鼠疫流行,喜马拉雅旱獭血清中未检出特异性鼠疫噬菌体抗体可能与当地的鼠疫流行形式和强度有关。 展开更多
关键词 噬菌体 喜马拉雅旱獭 血清 免疫抗体 流行病学 鼠疫
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1例输入性类鼻疽的病原学诊断及溯源分析
10
作者 杨红霞 王春雨 +3 位作者 王洋 郝瑞娥 赵启玉 郑霄 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期76-81,共6页
目的对1例输入性类鼻疽患者进行病原学诊断及溯源分析,为山西省类鼻疽防控提供科学依据。方法患者血培养阳性,分离菌株鉴定为泰国伯克霍尔德菌。采用生化试验及微生物质谱仪进行菌株鉴定,核酸提取后进行全基因组测序,分析MLST型和耐药... 目的对1例输入性类鼻疽患者进行病原学诊断及溯源分析,为山西省类鼻疽防控提供科学依据。方法患者血培养阳性,分离菌株鉴定为泰国伯克霍尔德菌。采用生化试验及微生物质谱仪进行菌株鉴定,核酸提取后进行全基因组测序,分析MLST型和耐药基因携带情况,同时构建系统进化树。结果此次分离株经生化试验及微生物质谱仪检测均鉴定为类鼻疽伯克霍尔德菌,MLST型为ST366,全基因测序分析与海南省3个分离株进化亲缘关系较近,同源性较高。结论此例类鼻疽病例经分子溯源分析及流行病学调查确定为海南省输入,提示医疗机构及疾控部门应加强对类鼻疽的认识,提高诊疗能力。 展开更多
关键词 类鼻疽 类鼻疽伯克霍尔德菌 MLST分型 全基因测序 分子溯源
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鼠疫耶尔森菌低钙应答V抗原人源单克隆抗体筛选与鉴定
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作者 张黎 郑滨洋 +5 位作者 张琪 吴海莲 潘红星 朱凤才 吴海生 周剑芳 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期15-20,共6页
目的筛选抗低钙应答V抗原(LcrV)的人源单克隆抗体,分析抗体基因特点,检测抗体与抗原结合的特异性、亲和力及功能。方法使用PCR方法从鼠疫疫苗临床试验志愿者外周血细胞cDNA扩增抗体轻、重链可变区基因片段,构建ScFv噬菌体抗体文库。用L... 目的筛选抗低钙应答V抗原(LcrV)的人源单克隆抗体,分析抗体基因特点,检测抗体与抗原结合的特异性、亲和力及功能。方法使用PCR方法从鼠疫疫苗临床试验志愿者外周血细胞cDNA扩增抗体轻、重链可变区基因片段,构建ScFv噬菌体抗体文库。用LcrV对文库进行富集筛选,将获得的抗体基因表达成人IgG1后,测定抗体与LcrV抗原结合的特异性、亲和力、免疫调节功能以及保护能力。结果成功构建了鼠疫耶尔森菌人源ScFv抗体文库,库容量为7.54×10^(8)。抗体文库经LcrV筛选后获得了3株抗LcrV抗体,命名为RV-B4、RV-D1和RV-E8。3株抗体重链为VH1-46和VH3-30,轻链分别为VL1-51、VK3-20和VK1-39。3株抗体经ELISA及Western blot验证均与LcrV特异性结合,其与V抗原结合的解离常数(KD)分别为2.1 nmol/L、1.24 nmol/L和42 nmol/L。RV-D1体外降低人THP-1分泌TNF-α,动物攻毒试验中未发现抗LcrV抗体的保护效果。结论从鼠疫疫苗免疫人群获得了靶向低钙应答V抗原的人源抗体,以结合抗体为主,不能有效阻断病菌感染。所获得的单抗为鼠疫免疫基础研究、鼠疫诊断应用提供了候选材料。 展开更多
关键词 鼠疫耶尔森菌 低钙应答V抗原 噬菌体展示 重组抗体 保护效果
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青海省三江源地区鼠疫耶尔森菌基因组单核苷酸多态性分析研究
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作者 柏吉祥 靳娟 +7 位作者 李胜 辛有全 杨晓艳 张丽 金泳 李翔 应凯业 何建 《中国媒介生物学及控制杂志》 CAS 2024年第6期639-643,共5页
目的通过全基因组单核苷酸多态性(SNP)分析,了解青海省三江源地区鼠疫自然疫源地鼠疫耶尔森菌(鼠疫菌)种群结构特点,为该地区鼠疫科学防控提供理论依据。方法选取三江源地区81株代表性鼠疫菌,通过比对全基因组测序数据中的2298个SNPs位... 目的通过全基因组单核苷酸多态性(SNP)分析,了解青海省三江源地区鼠疫自然疫源地鼠疫耶尔森菌(鼠疫菌)种群结构特点,为该地区鼠疫科学防控提供理论依据。方法选取三江源地区81株代表性鼠疫菌,通过比对全基因组测序数据中的2298个SNPs位点的变异情况,用MEGA 6.0软件完成系统发育树,分析该地区鼠疫菌种群结构及分布特征。结果81株鼠疫菌分布在3个SNPs分支中,分别为1.IN、2.ANT和0.PE。在整个三江源地区鼠疫自然疫源地中1.IN支群为该地区优势种群,均为喜马拉雅旱獭自然疫源地鼠疫菌,2.ANT和0.PE支群散在分布于玉树藏族自治州的称多县、囊谦县、曲麻莱县,青海田鼠鼠疫自然疫源地鼠疫菌仅存在0.PE4C支群。结论三江源地区鼠疫菌全基因组SNP呈现明显的地区分布特征,可为该地区鼠疫疫情流行病学调查提供科学提示。 展开更多
关键词 鼠疫菌 全基因组 单核苷酸多态性 基因分型 三江源地区
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基于OmniLog TM系统评价鼠疫噬菌体在不同培养基中的生长情况
13
作者 李翔 赵海红 +3 位作者 吴海生 张青雯 祁芝珍 李存香 《医学动物防制》 2024年第8期747-749,754,共4页
目的2022年11月利用OmniLog TM微生物鉴定系统评价诊断用鼠疫噬菌体在赫金格尔消化液培养基(简称“赫氏肉汤”)、溶菌肉汤(luria-bertani,LB)液体培养基和IF-A培养基中的生长情况,为鼠疫噬菌体的筛选和生物学特性鉴定提供科学依据。方... 目的2022年11月利用OmniLog TM微生物鉴定系统评价诊断用鼠疫噬菌体在赫金格尔消化液培养基(简称“赫氏肉汤”)、溶菌肉汤(luria-bertani,LB)液体培养基和IF-A培养基中的生长情况,为鼠疫噬菌体的筛选和生物学特性鉴定提供科学依据。方法以鼠疫弱毒菌EV 76株为宿主菌,基于OmniLog TM微生物鉴定系统,利用无菌96孔微量培养板在33℃环境作用48h,检测诊断用鼠疫噬菌体分别在赫氏肉汤、LB液体培养基和IF-A培养基中的生长情况。结果以赫氏肉汤、LB液体培养基为培养介质,试验列生长曲线几乎呈一条横线,且细菌浓度的对数值不超过100,对照组列中宿主菌呈对应的S型生长曲线;试验孔中四唑类染料的颜色随着噬菌体数量的减少和宿主菌数量的增多而逐渐加深。以IF-A培养基为培养介质,其试验列未显示任何生长曲线。结论三种液体培养基鼠疫噬菌体生长情况相比较,赫氏肉汤更优用于鼠疫耶尔森菌与噬菌体的相互作用研究,IF-A培养基更适合于其他微生物的生长。 展开更多
关键词 赫金格尔消化液培养基 Luria-bertani液体培养基 IF-A培养基 鼠疫噬菌体 微生物鉴定系统 生长曲线 四唑染料 指纹图谱
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鼠疫菌培养基及培养条件的优化 被引量:1
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作者 冯建萍 《青海畜牧兽医杂志》 2024年第1期60-61,共2页
本试验对鼠疫菌培养基制备过程中涉及鼠疫菌生长的诸因素进行优化并作效果评价,目的在于筛选出适合鼠疫菌生长的优质培养基,从而保证鼠疫防控工作的顺利开展。
关键词 鼠疫菌 培养基 培养优化
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甘肃高台县喜马拉雅旱獭分布范围及鼠疫发生风险调查分析 被引量:1
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作者 安文静 席进孝 +5 位作者 何爱伟 王鼎盛 徐大琴 蒲秀华 杨欢 戎宾国 《中国人兽共患病学报》 CSCD 北大核心 2024年第12期1194-1198,共5页
目的开展甘肃省张掖市高台县喜马拉雅旱獭分布范围调查,分析鼠疫发生的风险,为该地鼠疫防控提供科学依据。方法采用现场调查和全球定位系统(GPS)相结合的方法开展高台县喜马拉雅旱獭分布范围、自然地理景观特征的调查。采用查阅资料和... 目的开展甘肃省张掖市高台县喜马拉雅旱獭分布范围调查,分析鼠疫发生的风险,为该地鼠疫防控提供科学依据。方法采用现场调查和全球定位系统(GPS)相结合的方法开展高台县喜马拉雅旱獭分布范围、自然地理景观特征的调查。采用查阅资料和入户走访等方法调查旱獭分布区人口信息和风俗习惯。采用弓形夹法捕获喜马拉雅旱獭,采集血液、肝、脾、心、肺、肾、股骨及体表媒介动物等样本,按照《鼠疫诊断标准》(WS279-2008)进行病原学、血清学检测。结果高台县新坝镇旱獭分布在16个村庄(53.33%),其中和平村(100%)分布最广,其次为照一村(79.17%)、西上村(55.32%),其余均在50%以下。旱獭直接威胁村民方面,和平村、东大村、照一村均为100%,西上村为90.59%,其余均在50%以下。旱獭染蚤率为30.77%(16/52)、蚤指数为1.48(77/52),主要体表媒介动物是硬蜱、体虱、谢氏山蚤、斧形盖蚤,分别占72.31%(517/715)、16.92%(121/715)、6.43%(46/715)、4.20%(30/715)。采集旱獭肝、脾组织各52份,体表媒介动物75组715匹,细菌学培养均未发现鼠疫杆菌,RIHA检测鼠疫F1抗原均为阴性;采集旱獭血清52份,IHA检测鼠疫特异性F1抗体均为阴性。结论张掖市高台县存在人间鼠疫发生的风险,建议将高台县纳入甘肃省鼠情调查和疫源地检索县,同时加强健康宣传教育和医务人员培训,做好重点人员的管控和应急储备,必要时进行保护性灭獭灭蚤,防止鼠疫的发生和流行。 展开更多
关键词 喜马拉雅旱獭 分布范围 鼠疫发生风险 高台县
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海南省类鼻疽伯克霍尔德菌临床分离株的基因岛特征和毒力因子分析
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作者 符晓莹 李欢 +5 位作者 李沙 王立程 王崇圳 黎元莉 陈海 朱雄 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期359-368,390,共11页
目的分析类鼻疽伯克霍尔德菌(Burkholderia pseudomallei)临床分离株的基因岛(genomic island,GI)特征和毒力因子差异,为类鼻疽病的诊疗研究提供依据。方法收集B.pseudomallei临床分离株,PCR检测和测序分析毒力相关GI,在Islandviewr 4... 目的分析类鼻疽伯克霍尔德菌(Burkholderia pseudomallei)临床分离株的基因岛(genomic island,GI)特征和毒力因子差异,为类鼻疽病的诊疗研究提供依据。方法收集B.pseudomallei临床分离株,PCR检测和测序分析毒力相关GI,在Islandviewr 4平台上提交全基因组序列注释格式文件,整合SIGI-HMM与IslandPath-DIMOB两种算法预测GI,通过序列比对分析GI独特性和毒力因子差异。结果共收集到52株B.pseudomallei临床分离株,结果显示,52个基因组按进化距离分为3个分枝,其中82.69%(43/52)菌株集中在分枝1。52个B.pseudomallei基因组共识别出828个GI,按序列相似性聚类为157个GI cluster。GI在基因组中占比达2.05%~6.38%。GI cluster1和2存在全部菌株中,但84个(53.50%)GI cluster只聚类到单个基因组。10个GI cluster很可能是特有的,其中5个来源同属细菌,2个来源其他属,3个来源不确定。25个GI cluster与毒力相关,B.pseudomallei BP76和BP169含有其中8个,是所有菌株中毒力相关GI最多的。52株B.pseudomallei的毒力基因除了fhaB1、fhaB2、BPSL1661、cheY1、wzM、tssH-5/clpV、tssA-5、boaA和boaB存在差异,其余都表现一致。与泰国和澳大利亚B.pseudomallei临床菌株比较,boaA、boaB、cheY1和chbp在两个国家的菌株中都表现出差异,同时fhaB1、fhaB3和bimA在澳大利亚菌株中表现出差异。结论海南地区B.pseudomallei GI具有保守性和独特性,通过特有GI和毒力因子研究,可以发现菌株水平基因转移(Horizontal gene transfer,HGT)的来源和分子水平的毒力差异。 展开更多
关键词 类鼻疽伯克霍尔德菌 基因组 基因岛 毒力因子 水平基因转移
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鼠疫耶尔森菌LPS结构变异机制及其免疫逃逸功能研究进展
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作者 冯文静 张源 杜宗敏 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第9期860-866,共7页
鼠疫是鼠疫耶尔森菌(以下简称鼠疫菌)引起的一种自然疫源性传染病。鼠疫菌不仅能编码多种毒力因子破坏宿主免疫信号传导,还能修饰其脂多糖的结构,逃逸宿主免疫监视并强烈抑制宿主的免疫响应,是其高致病性形成的重要分子机制之一。鼠疫菌... 鼠疫是鼠疫耶尔森菌(以下简称鼠疫菌)引起的一种自然疫源性传染病。鼠疫菌不仅能编码多种毒力因子破坏宿主免疫信号传导,还能修饰其脂多糖的结构,逃逸宿主免疫监视并强烈抑制宿主的免疫响应,是其高致病性形成的重要分子机制之一。鼠疫菌LPS缺乏O抗原,脂质A结构也具有特殊的温度转换调控机制,在不同温度下可形成具有不同数目酰基侧链的脂质A,在其逃逸宿主固有免疫识别和清除中发挥重要作用。本文将对鼠疫菌脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)的生物合成调控、结构变异及其免疫逃逸机制的研究进展做一综述,为研究病原菌利用LPS结构修饰逃避宿主固有免疫防御的分子机制提供借鉴。 展开更多
关键词 鼠疫菌 脂多糖 免疫逃逸
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胶体金免疫层析法快速检测鼠疫耶尔森菌F1抗体 被引量:17
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作者 胡孔新 王静 +7 位作者 周蕾 闫中强 李伟 姚李四 牛春莉 李瑾 马颖 陈维娜 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期198-201,共4页
目的建立检测鼠疫耶尔森菌F1抗体的胶体金标记免疫层析方法。方法胶体金标记纯化鼠疫F1抗原,双抗原夹心法原理制成免疫层析检测试纸条,并对兔、羊、人和黄鼠血清进行检测评价。结果用80份不同动物种属的阴性血清进行检测,未出现非特异... 目的建立检测鼠疫耶尔森菌F1抗体的胶体金标记免疫层析方法。方法胶体金标记纯化鼠疫F1抗原,双抗原夹心法原理制成免疫层析检测试纸条,并对兔、羊、人和黄鼠血清进行检测评价。结果用80份不同动物种属的阴性血清进行检测,未出现非特异性反应,对5份恢复期病人血清、13份免疫兔血清和2份免疫羊血清检测也取得阳性结果,对于8份I HA临界阳性(滴度1∶20)的达乌尔黄鼠血清检出阳性6份。结论建立了可以用于现场快速检测鼠疫F1抗体的胶体金免疫层析方法。 展开更多
关键词 鼠疫菌 F1抗原 胶体金 免疫层析法
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青海高原鼠疫菌DFR分型及空间分布特征的研究 被引量:11
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作者 杨晓艳 魏柏青 +8 位作者 辛有全 靳娟 何建 熊浩明 魏荣杰 祁美英 李存香 金泳 代瑞霞 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期387-389,396,共4页
目的青海高原鼠疫菌DFR分型及空间分布特征的研究。方法对分离到的青海省839株鼠疫菌,根据鼠疫菌差异区段(Different Region,DFR)分型,使用23个DFR和PMT1(质粒验证引物)的扩增引物,对被试菌株DNA进行PCR扩增。并运用青海省地方病预防控... 目的青海高原鼠疫菌DFR分型及空间分布特征的研究。方法对分离到的青海省839株鼠疫菌,根据鼠疫菌差异区段(Different Region,DFR)分型,使用23个DFR和PMT1(质粒验证引物)的扩增引物,对被试菌株DNA进行PCR扩增。并运用青海省地方病预防控制所地理信息系统(GIS)进行鼠疫菌基因型的空间分布特征的分析。结果 839株青海省鼠疫菌共包括11个基因型,即1b、5、7、8、10、14、21、30、32、44、36,其中32、44、36型为新基因型,青海高原以5型和8型为主,祁连山南麓和青海湖环湖地区的菌株绝大多数属于基因型8型,占56.14%(471/839);位于青南高原的菌株,其基因型主要为5型,占23.12%(194/839)。青藏高原青海田鼠鼠疫疫源地鼠疫菌基因组型全部为14型,占1.19%(10/839)。结论在青海省分离的鼠疫菌中,喜马拉雅旱獭鼠疫疫源地鼠疫菌的基因型以5型和8型为主,青海田鼠疫源地鼠疫菌以基因型14型为主。 展开更多
关键词 青海高原 鼠疫菌 DFR分型 GIS 疫源地
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气候变化与鼠疫流行的耦合分析 被引量:22
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作者 李海蓉 王五一 +1 位作者 杨林生 谭见安 《中国人兽共患病杂志》 CSCD 北大核心 2005年第10期887-891,共5页
目的研究气候变化与人间鼠疫流行之间的关系。方法选择内蒙古和福建省分别作为我国北方和南方鼠疫疫源地和历史鼠疫病区的典型省,采用对比分析和相关分析的方法,研究气候变化(降水变化以旱涝指数表示,气温变化以冷暖指数表示)与人间鼠... 目的研究气候变化与人间鼠疫流行之间的关系。方法选择内蒙古和福建省分别作为我国北方和南方鼠疫疫源地和历史鼠疫病区的典型省,采用对比分析和相关分析的方法,研究气候变化(降水变化以旱涝指数表示,气温变化以冷暖指数表示)与人间鼠疫发病强度之间的关系。结果在北方地区,人间鼠疫发病强度与前一年和当年的旱涝指数及冷暖指数呈显著负相关;而在南方地区,人间鼠疫的发病强度仅与当年秋季的冷暖指数有显著负相关性。结论气候变化与鼠疫流行之间的关系有明显的区域差异。降水丰富及气候温暖利于北方鼠疫的流行与传播;降水变化对南方鼠疫的流行没有明显的影响,秋冬季的气温与南方鼠疫的流行强度有一定的正相关关系。 展开更多
关键词 气候变化 鼠疫流行 旱涝指数 冷暖指数
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