目的阐明委内瑞拉马脑炎病毒(Venezuelan equine encephalitis virus,VEEV)的遗传多样性与进化动力学特征,解析其分支演化规律、关键变异位点及重组事件,为防控策略提供科学依据。方法从GenBank数据库中收集196条VEEV高质量序列构建分...目的阐明委内瑞拉马脑炎病毒(Venezuelan equine encephalitis virus,VEEV)的遗传多样性与进化动力学特征,解析其分支演化规律、关键变异位点及重组事件,为防控策略提供科学依据。方法从GenBank数据库中收集196条VEEV高质量序列构建分析数据集,进行多序列比对与校正。构建最大似然系统发育树,结合贝叶斯方法进行分支特异性进化动力学分析,包括碱基替换速率和最近共同祖先时间(time to most recent common ancestor,tMRCA)估算。同时对结构蛋白进行选择压力分析和非结构蛋白区域的重组事件计算。结果系统发育分析显示,VEEV可分为5个主要分支,具有明显的地域分布特征和遗传多样性,ⅠC、ⅠD、ⅠE 3个分支被纳入进化动力学分析,其中ⅠD分支的碱基替换速率最高,ⅠC分支最低,推测与其传播范围、宿主适应及地域环境选择压力相关;不同分支的碱基替换速率和最近共同祖先时间支持病毒存在多重进化路径;病毒结构蛋白受强烈负选择作用,鉴定出2个可能具有功能意义的正向选择位点;发现非结构蛋白nsp3中存在超变区,且一起重组事件的重组区域与超变区重合,提示该区域为潜在的重组热点。结论VEEV呈现多分支独立演化模式,结构蛋白中正向选择位点的发现及分支特异性进化速率差异为病毒适应性进化提供新证据,研究结果从基因组层面揭示了VEEV的重要进化特征,为其快速准确检测、疫苗设计与未来疫情预警提供了科学支持。展开更多
目的采用剂量反应Meta分析方法,定量评估气温与人群登革热发病率之间的关联。方法系统检索中国知网、万方数据库、维普网、PubMed、Embase和Web of Science等数据库中2024年12月31日前发表的登革热发病相关的观察性研究。由2名研究者独...目的采用剂量反应Meta分析方法,定量评估气温与人群登革热发病率之间的关联。方法系统检索中国知网、万方数据库、维普网、PubMed、Embase和Web of Science等数据库中2024年12月31日前发表的登革热发病相关的观察性研究。由2名研究者独立完成文献筛选、数据提取及偏倚风险评估。采用限制性立方样条模型进行两阶段剂量反应Meta分析。结果共纳入14项研究。剂量反应Meta分析显示,气温与登革热发病风险呈显著非线性关系。周平均气温低于16℃时,发病风险接近基线;在16~28℃区间内,发病风险几乎呈指数增长;气温超过30℃时,风险增长趋缓,于32~34℃达到平台期。结论气温与登革热发病风险存在明确的非线性剂量反应关系,依据不同气温阈值制定防控策略,对提升登革热防控效果具有重要意义。展开更多
文摘目的阐明委内瑞拉马脑炎病毒(Venezuelan equine encephalitis virus,VEEV)的遗传多样性与进化动力学特征,解析其分支演化规律、关键变异位点及重组事件,为防控策略提供科学依据。方法从GenBank数据库中收集196条VEEV高质量序列构建分析数据集,进行多序列比对与校正。构建最大似然系统发育树,结合贝叶斯方法进行分支特异性进化动力学分析,包括碱基替换速率和最近共同祖先时间(time to most recent common ancestor,tMRCA)估算。同时对结构蛋白进行选择压力分析和非结构蛋白区域的重组事件计算。结果系统发育分析显示,VEEV可分为5个主要分支,具有明显的地域分布特征和遗传多样性,ⅠC、ⅠD、ⅠE 3个分支被纳入进化动力学分析,其中ⅠD分支的碱基替换速率最高,ⅠC分支最低,推测与其传播范围、宿主适应及地域环境选择压力相关;不同分支的碱基替换速率和最近共同祖先时间支持病毒存在多重进化路径;病毒结构蛋白受强烈负选择作用,鉴定出2个可能具有功能意义的正向选择位点;发现非结构蛋白nsp3中存在超变区,且一起重组事件的重组区域与超变区重合,提示该区域为潜在的重组热点。结论VEEV呈现多分支独立演化模式,结构蛋白中正向选择位点的发现及分支特异性进化速率差异为病毒适应性进化提供新证据,研究结果从基因组层面揭示了VEEV的重要进化特征,为其快速准确检测、疫苗设计与未来疫情预警提供了科学支持。
文摘目的采用剂量反应Meta分析方法,定量评估气温与人群登革热发病率之间的关联。方法系统检索中国知网、万方数据库、维普网、PubMed、Embase和Web of Science等数据库中2024年12月31日前发表的登革热发病相关的观察性研究。由2名研究者独立完成文献筛选、数据提取及偏倚风险评估。采用限制性立方样条模型进行两阶段剂量反应Meta分析。结果共纳入14项研究。剂量反应Meta分析显示,气温与登革热发病风险呈显著非线性关系。周平均气温低于16℃时,发病风险接近基线;在16~28℃区间内,发病风险几乎呈指数增长;气温超过30℃时,风险增长趋缓,于32~34℃达到平台期。结论气温与登革热发病风险存在明确的非线性剂量反应关系,依据不同气温阈值制定防控策略,对提升登革热防控效果具有重要意义。
