2024年10月23日,浙江大学良渚实验室沈宁/刘志红教授团队在《自然·通讯》(Nature Communications)发表了题为“SpliceTransformer predicts tissue-specific splicing linked to human diseases”的研究论文(DOI:10.1038/s41467-02...2024年10月23日,浙江大学良渚实验室沈宁/刘志红教授团队在《自然·通讯》(Nature Communications)发表了题为“SpliceTransformer predicts tissue-specific splicing linked to human diseases”的研究论文(DOI:10.1038/s41467-024-53088-6),开发了基于Transformer架构的多模态深度学习模型SpliceTransformer(简称SpTransformer)。该方法可以用于解析和组织特异性剪接变异相关的疾病,筛选出特异性影响某些人体组织的突变及基因。通过对多个突变数据库,共涉及超过17万个样本的全外显子组测序数据的分析,研究者发现组织特异性剪接和基因的组织特异性表达之间存在相对独立性,即使是在多种组织中普遍表达的基因也可能通过剪接变异对特定组织产生重要影响,进而可能引发相关疾病。该研究为理解疾病背后的遗传因素提供了除基因表达水平以外的重要视角。游宁远博士研究生为论文第一作者。研究得到国家自然科学基因、浙江省重点研发计划等支持。展开更多
2024年10月18日,浙江大学医学院闵军霞、王福俤教授团队联合张岩教授团队在《先进科学》(Advanced Science)发表题为“The intestinal transporter SLC30A1 plays a critical role in regulating systemic zinc homeostasis”的研究论文...2024年10月18日,浙江大学医学院闵军霞、王福俤教授团队联合张岩教授团队在《先进科学》(Advanced Science)发表题为“The intestinal transporter SLC30A1 plays a critical role in regulating systemic zinc homeostasis”的研究论文(DOI:10.1002/advs.202406421),阐明了肠道金属离子转运体溶质载体家族30成员1(SLC30A1)(ZnT1)在肠道上皮细胞的特殊定位是调控机体锌离子稳态的关键因素,揭示了其在维持正常的肠道屏障及功能中发挥着重要作用,并通过冷冻电镜解析了SLC30A1的蛋白结构,构建了SLC30A1选择性转运锌离子的途径模式。展开更多
目的 克隆人腺病毒 3型 (Ad3)六邻体 - L 1(Hexon- L 1)、六邻体 - L 2 (Hexon- L 2 )区基因 ,构建含有该基因的重组质粒 ,并进行测序鉴定 ,为进一步构建表达载体 ,制备基因工程疫苗打下基础。方法 从 Ad3感染的 He L a细胞中提取 Ad3...目的 克隆人腺病毒 3型 (Ad3)六邻体 - L 1(Hexon- L 1)、六邻体 - L 2 (Hexon- L 2 )区基因 ,构建含有该基因的重组质粒 ,并进行测序鉴定 ,为进一步构建表达载体 ,制备基因工程疫苗打下基础。方法 从 Ad3感染的 He L a细胞中提取 Ad3DNA,用 PCR方法扩增 Hexon- L 1、Hexon- L 2基因 ,将得到的片段定向克隆到克隆载体 p U C19质粒中 ,对克隆片段进行 DNA测序鉴定。结果 构建了重组质粒 p UC19Hexon,测序结果与 Genebank中该序列进行同源性比较证明克隆的片段为 Ad3六邻体序列。结论 成功克隆了 Ad3的 Hexon- L 1、Hexon- L 2区基因。展开更多
文摘2024年10月23日,浙江大学良渚实验室沈宁/刘志红教授团队在《自然·通讯》(Nature Communications)发表了题为“SpliceTransformer predicts tissue-specific splicing linked to human diseases”的研究论文(DOI:10.1038/s41467-024-53088-6),开发了基于Transformer架构的多模态深度学习模型SpliceTransformer(简称SpTransformer)。该方法可以用于解析和组织特异性剪接变异相关的疾病,筛选出特异性影响某些人体组织的突变及基因。通过对多个突变数据库,共涉及超过17万个样本的全外显子组测序数据的分析,研究者发现组织特异性剪接和基因的组织特异性表达之间存在相对独立性,即使是在多种组织中普遍表达的基因也可能通过剪接变异对特定组织产生重要影响,进而可能引发相关疾病。该研究为理解疾病背后的遗传因素提供了除基因表达水平以外的重要视角。游宁远博士研究生为论文第一作者。研究得到国家自然科学基因、浙江省重点研发计划等支持。
文摘2024年10月18日,浙江大学医学院闵军霞、王福俤教授团队联合张岩教授团队在《先进科学》(Advanced Science)发表题为“The intestinal transporter SLC30A1 plays a critical role in regulating systemic zinc homeostasis”的研究论文(DOI:10.1002/advs.202406421),阐明了肠道金属离子转运体溶质载体家族30成员1(SLC30A1)(ZnT1)在肠道上皮细胞的特殊定位是调控机体锌离子稳态的关键因素,揭示了其在维持正常的肠道屏障及功能中发挥着重要作用,并通过冷冻电镜解析了SLC30A1的蛋白结构,构建了SLC30A1选择性转运锌离子的途径模式。
文摘目的 克隆人腺病毒 3型 (Ad3)六邻体 - L 1(Hexon- L 1)、六邻体 - L 2 (Hexon- L 2 )区基因 ,构建含有该基因的重组质粒 ,并进行测序鉴定 ,为进一步构建表达载体 ,制备基因工程疫苗打下基础。方法 从 Ad3感染的 He L a细胞中提取 Ad3DNA,用 PCR方法扩增 Hexon- L 1、Hexon- L 2基因 ,将得到的片段定向克隆到克隆载体 p U C19质粒中 ,对克隆片段进行 DNA测序鉴定。结果 构建了重组质粒 p UC19Hexon,测序结果与 Genebank中该序列进行同源性比较证明克隆的片段为 Ad3六邻体序列。结论 成功克隆了 Ad3的 Hexon- L 1、Hexon- L 2区基因。
