目的基于网络药理学和分子对接方法,预测二氯乙酸盐(dichloroacetate,DCA)对脓毒症及肝损伤的潜在药物靶点,并通过动物模型进行验证。方法本研究通过公共数据库对DCA的潜在药物靶点进行预测,进一步利用DisGeNET数据库,分别收集脓毒症和...目的基于网络药理学和分子对接方法,预测二氯乙酸盐(dichloroacetate,DCA)对脓毒症及肝损伤的潜在药物靶点,并通过动物模型进行验证。方法本研究通过公共数据库对DCA的潜在药物靶点进行预测,进一步利用DisGeNET数据库,分别收集脓毒症和肝损伤相关疾病基因,并与DCA靶点取交集,构建药物靶点与疾病基因的蛋白质相互作用网络,并对关键治疗靶点进行分子对接。最终,建立脓毒症合并肝损伤小鼠模型,给予DCA干预,干预后6 h,取各组小鼠肝组织进行质谱蛋白定量分析,并对DCA预测靶点进行组间比较。结果分子对接结果显示,DCA与PPARA、F2、HSP90AA1、PDK1、ARG1、NOS3、CAT等靶点具有良好的结合力,在小鼠模型中发现仅CAT和PDK1在两组间差异有统计学意义。DCA对脓毒症和肝损伤的互作靶点主要富集于代谢与免疫相关的生物学行为。京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析表明,DCA对疾病的互作靶点主要富集在白细胞介素-17(interleukin-17,IL-17)信号通路、Toll样受体(toll-like re-ceptors,TLR)信号通路等。结论DCA对脓毒症和肝损伤表现出显著的药理活性,过氧化氢酶(CAT)和丙酮酸脱氢酶激酶1(PDK1)是DCA在脓毒症肝损伤中的潜在关键靶点。展开更多
文摘目的基于网络药理学和分子对接方法,预测二氯乙酸盐(dichloroacetate,DCA)对脓毒症及肝损伤的潜在药物靶点,并通过动物模型进行验证。方法本研究通过公共数据库对DCA的潜在药物靶点进行预测,进一步利用DisGeNET数据库,分别收集脓毒症和肝损伤相关疾病基因,并与DCA靶点取交集,构建药物靶点与疾病基因的蛋白质相互作用网络,并对关键治疗靶点进行分子对接。最终,建立脓毒症合并肝损伤小鼠模型,给予DCA干预,干预后6 h,取各组小鼠肝组织进行质谱蛋白定量分析,并对DCA预测靶点进行组间比较。结果分子对接结果显示,DCA与PPARA、F2、HSP90AA1、PDK1、ARG1、NOS3、CAT等靶点具有良好的结合力,在小鼠模型中发现仅CAT和PDK1在两组间差异有统计学意义。DCA对脓毒症和肝损伤的互作靶点主要富集于代谢与免疫相关的生物学行为。京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析表明,DCA对疾病的互作靶点主要富集在白细胞介素-17(interleukin-17,IL-17)信号通路、Toll样受体(toll-like re-ceptors,TLR)信号通路等。结论DCA对脓毒症和肝损伤表现出显著的药理活性,过氧化氢酶(CAT)和丙酮酸脱氢酶激酶1(PDK1)是DCA在脓毒症肝损伤中的潜在关键靶点。
