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人类N-乙酰化酶2蛋白质三维结构的计算机模拟技术的研究进展
被引量：
1
1
作者
朱志远
袁靖
李金恒
《中国药理学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第11期1415-1418,共4页
NAT2是人体内重要的代谢酶,主要参与含氮药物的代谢。目前对NAT2基因序列测定和药物代谢等方面已经进行了大量的研究。近年来人们对蛋白质的三维(立体)结构的模拟越来越关注,但是对NAT2的三维立体结构以及它与药物结合的构效关系等研究...
NAT2是人体内重要的代谢酶,主要参与含氮药物的代谢。目前对NAT2基因序列测定和药物代谢等方面已经进行了大量的研究。近年来人们对蛋白质的三维(立体)结构的模拟越来越关注,但是对NAT2的三维立体结构以及它与药物结合的构效关系等研究仅处在一个起步阶段。该文对NAT2三维立体结构的构建的研究进展作一综述,着重介绍蛋白质立体结构的构建方法和工具的研究情况。
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关键词
NAT2
蛋白质三维结构
结构模拟
暂未订购
新冠病毒相关蛋白TMPRSS2结构与功能的生信分析及表达载体构建
被引量：
1
2
作者
徐本锦
李卓禧
+13 位作者
范蕾
李璟
严荣荣
杜淼
宣焱
门杰
陈晓聪
汤文婷
侯艳香
宋彬妤
杨娅男
刘晓梁
余骏骁
刘玲
《中国药理学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第8期1218-1226,共9页
目的人源TMPRSS2是一种跨膜丝氨酸蛋白酶,本文对该蛋白结构与功能进行系统生物信息学分析,优化密码子并构建原核表达载体,以探究其参与SARS-CoV-2侵染宿主细胞的分子机制。方法利用分子克隆技术构建重组表达载体pET-22b-TMPRSS2;采用Pro...
目的人源TMPRSS2是一种跨膜丝氨酸蛋白酶,本文对该蛋白结构与功能进行系统生物信息学分析,优化密码子并构建原核表达载体,以探究其参与SARS-CoV-2侵染宿主细胞的分子机制。方法利用分子克隆技术构建重组表达载体pET-22b-TMPRSS2;采用Protparam、NetPhos3.1、Blast、Clustal X2和MEGA7.0等分析工具对TMPRSS2蛋白的同源性、功能位点、亚细胞定位、三维结构和进化特点等进行生信分析。结果原核表达质粒构建正确;TMPRSS2蛋白属于中等分子量蛋白,由492个氨基酸残基构成,理论等电点为8.12,分子消光系数为118145 L·mol^(-1)·cm^(-1),半衰期30 h;TMPRSS2有15个潜在的糖基化位点,49个可能的磷酸化位点,无信号序列,是一种跨膜的亲水性蛋白。此外,该蛋白有13个潜在的B细胞表位及7个T细胞表位。二级结构分析显示,Random coil在TMPRSS2蛋白中占比最高(0.4533),其次是Extended strand(0.2520)。序列对比和进化分析显示,与人源TMPRSS2序列一致性最高且亲缘关系最近的是Pan troglodytes,其次是Gorilla。结论人源TMPRSS2蛋白在进化上保守,功能重要。本研究结果有助于揭示TMPRSS2蛋白的结构和作用机理,为新冠肺炎的诊疗提供思路,加速了靶向TMPRSS2蛋白的新型药物研发进程。
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关键词
新冠病毒
TMPRSS2
生信分析
载体构建
结构与功能
进化分析
暂未订购
题名
人类N-乙酰化酶2蛋白质三维结构的计算机模拟技术的研究进展
被引量：
1
1
作者
朱志远
袁靖
李金恒
机构
中国人民解放军第
南京军区南京总医院
出处
《中国药理学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第11期1415-1418,共4页
基金
国家自然科学基金资助项目(No30472055)
文摘
NAT2是人体内重要的代谢酶,主要参与含氮药物的代谢。目前对NAT2基因序列测定和药物代谢等方面已经进行了大量的研究。近年来人们对蛋白质的三维(立体)结构的模拟越来越关注,但是对NAT2的三维立体结构以及它与药物结合的构效关系等研究仅处在一个起步阶段。该文对NAT2三维立体结构的构建的研究进展作一综述,着重介绍蛋白质立体结构的构建方法和工具的研究情况。
关键词
NAT2
蛋白质三维结构
结构模拟
Keywords
N-acetyltransferase 2
three-dimension structure ofthe protein
structure simulation
分类号
R-05 [医药卫生]
R341.81 [医药卫生—基础医学]
暂未订购
题名
新冠病毒相关蛋白TMPRSS2结构与功能的生信分析及表达载体构建
被引量：
1
2
作者
徐本锦
李卓禧
范蕾
李璟
严荣荣
杜淼
宣焱
门杰
陈晓聪
汤文婷
侯艳香
宋彬妤
杨娅男
刘晓梁
余骏骁
刘玲
机构
山西医科大学汾阳学院医学检验系
山西医科大学汾阳学院基础医学部
山西医科大学汾阳学院山西省汾阳医院检验科
山西医科大学汾阳学院科技中心
出处
《中国药理学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第8期1218-1226,共9页
基金
山西省基础研究计划(自由探索类)项目(No.20210302123397)
山西省高等学校科技创新项目(No.2020L0749)
+3 种基金
国家级大学生创新创业训练计划项目(No.202117114001)
山西省高等学校大学生创新创业训练计划重点项目(No.S202117114008)
吕梁市科技计划项目(No.2020SHFZ29)
山西医科大学汾阳学院引进人才启动金项目(No.2020A01)。
文摘
目的人源TMPRSS2是一种跨膜丝氨酸蛋白酶,本文对该蛋白结构与功能进行系统生物信息学分析,优化密码子并构建原核表达载体,以探究其参与SARS-CoV-2侵染宿主细胞的分子机制。方法利用分子克隆技术构建重组表达载体pET-22b-TMPRSS2;采用Protparam、NetPhos3.1、Blast、Clustal X2和MEGA7.0等分析工具对TMPRSS2蛋白的同源性、功能位点、亚细胞定位、三维结构和进化特点等进行生信分析。结果原核表达质粒构建正确;TMPRSS2蛋白属于中等分子量蛋白,由492个氨基酸残基构成,理论等电点为8.12,分子消光系数为118145 L·mol^(-1)·cm^(-1),半衰期30 h;TMPRSS2有15个潜在的糖基化位点,49个可能的磷酸化位点,无信号序列,是一种跨膜的亲水性蛋白。此外,该蛋白有13个潜在的B细胞表位及7个T细胞表位。二级结构分析显示,Random coil在TMPRSS2蛋白中占比最高(0.4533),其次是Extended strand(0.2520)。序列对比和进化分析显示,与人源TMPRSS2序列一致性最高且亲缘关系最近的是Pan troglodytes,其次是Gorilla。结论人源TMPRSS2蛋白在进化上保守,功能重要。本研究结果有助于揭示TMPRSS2蛋白的结构和作用机理,为新冠肺炎的诊疗提供思路,加速了靶向TMPRSS2蛋白的新型药物研发进程。
关键词
新冠病毒
TMPRSS2
生信分析
载体构建
结构与功能
进化分析
Keywords
SARS-CoV-2
TMPRSS2
bioinformatics analysis
vector construction
structure and function
evolutionary analysis
分类号
R341.81 [医药卫生—基础医学]
R373 [医药卫生—病原生物学]
R392.11 [医药卫生—免疫学]
R394 [医药卫生—医学遗传学]
R977.6 [医药卫生—药品]
暂未订购
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
人类N-乙酰化酶2蛋白质三维结构的计算机模拟技术的研究进展
朱志远
袁靖
李金恒
《中国药理学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2008
1
暂未订购
2
新冠病毒相关蛋白TMPRSS2结构与功能的生信分析及表达载体构建
徐本锦
李卓禧
范蕾
李璟
严荣荣
杜淼
宣焱
门杰
陈晓聪
汤文婷
侯艳香
宋彬妤
杨娅男
刘晓梁
余骏骁
刘玲
《中国药理学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
1
暂未订购
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