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贵州省印江土家族苗族自治县微小扇头蜱携带RNA病毒分析
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作者 唐继霞 何贤海 +11 位作者 吴胜春 孟娇 陈醒醒 陈秋 林祉君 代义松 吴家红 江佳富 孙毅 曹务春 余福勋 詹琳 《中国媒介生物学及控制杂志》 CAS 2024年第5期621-626,共6页
目的了解贵州省印江土家族苗族自治县(印江县)蜱携带病毒的潜在威胁。方法在印江县采集牛体表寄生蜱。通过蜱的形态学特征和16S rDNA基因扩增鉴定蜱的种类。病毒宏基因组测序由Illumina平台完成。获得的病毒序列通过质控和组装后与美国... 目的了解贵州省印江土家族苗族自治县(印江县)蜱携带病毒的潜在威胁。方法在印江县采集牛体表寄生蜱。通过蜱的形态学特征和16S rDNA基因扩增鉴定蜱的种类。病毒宏基因组测序由Illumina平台完成。获得的病毒序列通过质控和组装后与美国国立生物技术信息中心中登录的病毒序列进行比对分析,构建系统发育树,进一步了解其遗传进化特征。结果2023年7月共采集蜱23只,均为微小扇头蜱。病毒宏基因组测序表明,蜱携带的蜱媒病毒包括白纤病毒科、弹状病毒科和楚病毒科3个病毒科和一些未分类的病毒。本研究获得了白纤病毒科尤库病毒属中1株核苷酸长度为5008 bp的Lihan病毒序列。遗传进化分析发现贵州省蜱携带的Lihan蜱病毒与2019年在重庆市微小扇头蜱中发现的Lihan蜱病毒分离株序列(ON812189)同源性最高,而与埃及裂谷热病毒(DQ375403)和中国的发热伴血小板减少综合征病毒(JQ733567)(即现大别班达病毒)处于不同遗传进化分支。结论在贵州省印江县的蜱中发现了3个科的病毒,分别为白纤病毒科、弹状病毒科和楚病毒科。需要更多的研究来进一步了解这些蜱携带病毒的致病性和公共卫生学意义,尤其是本研究中发现的Lihan病毒。 展开更多
关键词 病毒宏基因组学 蜱 RNA病毒 贵州 印江
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贵州省罗甸县山羊体表寄生蜱携带柯克斯体属细菌的基因特征分析 被引量：1
2
作者 陈秋 何贤海 +9 位作者 孟娇 吴胜春 唐继霞 林祉君 余福勋 江佳富 孙毅 曹务春 詹琳 周远忠 《中国媒介生物学及控制杂志》 CAS 2024年第4期417-421,共5页
目的了解山羊体表寄生蜱携带的柯克斯体属细菌的基本特点。方法采集贵州省罗甸县山区散养山羊体表寄生蜱,单只提取蜱DNA,制备混合DNA样品进行细菌16S rRNA扩增子高通量测序。同时对个体蜱DNA样本进行柯克斯体属特异引物聚合酶链式反应检... 目的了解山羊体表寄生蜱携带的柯克斯体属细菌的基本特点。方法采集贵州省罗甸县山区散养山羊体表寄生蜱,单只提取蜱DNA,制备混合DNA样品进行细菌16S rRNA扩增子高通量测序。同时对个体蜱DNA样本进行柯克斯体属特异引物聚合酶链式反应检测,结合DNA测序验证高通量测序的结果。结果共采集66只蜱,其中63只为长角血蜱,3只为微小扇头蜱。通过高通量测序获得柯克斯体共生菌序列17条,采用柯克斯体属16S rRNA基因PCR扩增对单只蜱样本进行鉴定,电泳阳性率为28.78%(19/66)。遗传进化分析提示本研究发现的柯克斯体共生体与以色列株(JQ480818)和泰国株(KC170759)在同一分支。结论贵州罗甸县散养山羊体表寄生蜱中柯克斯体共生菌携带率较高,其致病性及公共卫生意义还待进一步研究。 展开更多
关键词 蜱 柯克斯体属 高通量测序 贵州
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