目的:通过数据挖掘和网络药理学探究中医药治疗溃疡性结肠炎常用中药及作用机制。方法:通过检索中国知网、维普网、万方医学、PubMed、EmBase等数据库中关于中药口服法治疗溃疡性结肠炎的相关文献,获取文献中的中药并对其进行频数和频...目的:通过数据挖掘和网络药理学探究中医药治疗溃疡性结肠炎常用中药及作用机制。方法:通过检索中国知网、维普网、万方医学、PubMed、EmBase等数据库中关于中药口服法治疗溃疡性结肠炎的相关文献,获取文献中的中药并对其进行频数和频率分析。使用中药系统药理学数据库和分析平台筛选频次前五名中药的有效成分及相关靶点,使用GeneCards数据库检索溃疡性结肠炎的基因靶点,并与中药相关靶点进行映射,得到中药治疗溃疡性结肠炎的潜在作用靶点,采用Cytoscape软件构建“成分-靶点”网络图。将潜在作用靶点导入String数据库,获得蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)关系,使用Cytoscape软件进行PPI网络可视化,并筛选核心靶点。使用R软件对靶点进行基因本体论(Gene Ontology,GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)信号通路富集分析。结果:本次检索共获得有效文献213篇,涉及不同中药134味,主要包括补虚药、清热药、理气药、解表药等,使用频次最高的前6味中药为黄连、甘草、白术、黄芩、黄芪、白芍。基于TCMSP数据库获取5味中药(除甘草)有效成分55个,靶点212个;在GnenCards数据库中检索得到1226个靶点基因,与有效成分靶点进行映射得到103个潜在作用靶点。GO富集分析得到生物过程1865个、细胞组分39个、分子功能98个;KEGG富集到123条相关通路。结论:中药治疗溃疡性结肠炎作用途径复杂,涉及多靶点、多通路,具有“小分散大集中”的特点。展开更多
文摘目的:通过数据挖掘和网络药理学探究中医药治疗溃疡性结肠炎常用中药及作用机制。方法:通过检索中国知网、维普网、万方医学、PubMed、EmBase等数据库中关于中药口服法治疗溃疡性结肠炎的相关文献,获取文献中的中药并对其进行频数和频率分析。使用中药系统药理学数据库和分析平台筛选频次前五名中药的有效成分及相关靶点,使用GeneCards数据库检索溃疡性结肠炎的基因靶点,并与中药相关靶点进行映射,得到中药治疗溃疡性结肠炎的潜在作用靶点,采用Cytoscape软件构建“成分-靶点”网络图。将潜在作用靶点导入String数据库,获得蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)关系,使用Cytoscape软件进行PPI网络可视化,并筛选核心靶点。使用R软件对靶点进行基因本体论(Gene Ontology,GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)信号通路富集分析。结果:本次检索共获得有效文献213篇,涉及不同中药134味,主要包括补虚药、清热药、理气药、解表药等,使用频次最高的前6味中药为黄连、甘草、白术、黄芩、黄芪、白芍。基于TCMSP数据库获取5味中药(除甘草)有效成分55个,靶点212个;在GnenCards数据库中检索得到1226个靶点基因,与有效成分靶点进行映射得到103个潜在作用靶点。GO富集分析得到生物过程1865个、细胞组分39个、分子功能98个;KEGG富集到123条相关通路。结论:中药治疗溃疡性结肠炎作用途径复杂,涉及多靶点、多通路,具有“小分散大集中”的特点。
