目的:基于网络药理学方法探讨丹参-牡丹皮配伍治疗膝骨性关节炎(knee osteoarthritis,KOA)的作用机制。方法:在中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCM...目的:基于网络药理学方法探讨丹参-牡丹皮配伍治疗膝骨性关节炎(knee osteoarthritis,KOA)的作用机制。方法:在中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)检索并筛选丹参-牡丹皮活性成分及相关靶点蛋白,利用UniPort数据库进行靶点蛋白名转化。构建丹参-牡丹皮活性成分-靶点网络。在人类基因数据库(the human gene database,GeneCards)、Disgenet数据库、在线人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man,OMIM)、药物靶标数据库(therapeutic targetdatabase,TTD)、DrugBank数据库检索KOA疾病相关靶点。筛选丹参-牡丹皮作用于KOA的活性成分靶点。利用Cytoscape 3.7.2软件及其插件Bisogenet、CytoNCA对靶点进行交集分析并构建蛋白-蛋白互作(protein-protein interactions,PPI)网络图。将直接作用靶点输入核心靶基因功能注释数据库(the database for annotation visualization and integrated discovery,DAVID)进行基因本体论(gene ontology,GO)功能和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析。结果:筛选出丹参65个活性成分,牡丹皮11个活性成分。获得丹参靶点蛋白932个,牡丹皮靶点蛋白237个。通过UniPort数据库转化最终获得作用靶点214个。筛选出KOA疾病靶点1207个,得到药物与疾病共同作用靶点97个。IL-6、VEGF、TP53、ESR1、MMP、MYC、CXCL8、FOS、JUN、TNF等可能是丹参-牡丹皮治疗KOA的关键靶点;GO功能富集分析获得349个富集结果,其中包括分子功能、细胞组分、生物过程;KEGG通路富集分析获得90个相关通路。结论:丹参-牡丹皮的有效成分包括槲皮素、木樨草素等,它们通过作用于IL-6、VEGFA、TNF、MMP等靶点,主要介导MAPK信号通路,从而调控软骨细胞的凋亡与退变,减少细胞外基质的降解,抑制骨吸收,介导炎症反应,促进血管新生,加速炎症吸收和代谢分解,最终减缓软骨组织的病损进展,发挥抗KOA的治疗作用。展开更多
文摘目的:基于网络药理学方法探讨丹参-牡丹皮配伍治疗膝骨性关节炎(knee osteoarthritis,KOA)的作用机制。方法:在中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)检索并筛选丹参-牡丹皮活性成分及相关靶点蛋白,利用UniPort数据库进行靶点蛋白名转化。构建丹参-牡丹皮活性成分-靶点网络。在人类基因数据库(the human gene database,GeneCards)、Disgenet数据库、在线人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man,OMIM)、药物靶标数据库(therapeutic targetdatabase,TTD)、DrugBank数据库检索KOA疾病相关靶点。筛选丹参-牡丹皮作用于KOA的活性成分靶点。利用Cytoscape 3.7.2软件及其插件Bisogenet、CytoNCA对靶点进行交集分析并构建蛋白-蛋白互作(protein-protein interactions,PPI)网络图。将直接作用靶点输入核心靶基因功能注释数据库(the database for annotation visualization and integrated discovery,DAVID)进行基因本体论(gene ontology,GO)功能和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析。结果:筛选出丹参65个活性成分,牡丹皮11个活性成分。获得丹参靶点蛋白932个,牡丹皮靶点蛋白237个。通过UniPort数据库转化最终获得作用靶点214个。筛选出KOA疾病靶点1207个,得到药物与疾病共同作用靶点97个。IL-6、VEGF、TP53、ESR1、MMP、MYC、CXCL8、FOS、JUN、TNF等可能是丹参-牡丹皮治疗KOA的关键靶点;GO功能富集分析获得349个富集结果,其中包括分子功能、细胞组分、生物过程;KEGG通路富集分析获得90个相关通路。结论:丹参-牡丹皮的有效成分包括槲皮素、木樨草素等,它们通过作用于IL-6、VEGFA、TNF、MMP等靶点,主要介导MAPK信号通路,从而调控软骨细胞的凋亡与退变,减少细胞外基质的降解,抑制骨吸收,介导炎症反应,促进血管新生,加速炎症吸收和代谢分解,最终减缓软骨组织的病损进展,发挥抗KOA的治疗作用。
