目的:基于网络药理学与分子对接研究苏黄止咳胶囊治疗支气管哮喘(bronchial asthma,BA)的作用机制。方法:运用R语言进行差异性分析;通过中药系统药理学(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platf...目的:基于网络药理学与分子对接研究苏黄止咳胶囊治疗支气管哮喘(bronchial asthma,BA)的作用机制。方法:运用R语言进行差异性分析;通过中药系统药理学(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)平台和中国科学院上海有机化学研究所化学专业数据库(Shanghai Institute of Organic Chemistry of CAS.Chemistry Database,CASC)筛选药物有效成分及靶点,通过基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)筛选疾病靶点,使用韦恩(Venny)2.1.0筛选药物与疾病的共同靶点,导入检索蛋白质相互作用数据库(Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins,STRING)进行分析,构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络图,运用R语言进行基因本体(gene ontology,GO)功能和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析,通过AutoDuck Vina 1.5.6、PyMOL软件进行分子对接验证。结果:从麻黄-前胡药对中筛选出36个有效成分,与BA相交的核心靶点25个,获得了木犀草素、丹参酮ⅡA、槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、豆甾醇等核心成分。分子对接结果表明,乳胶颗粒蛋白-木犀草素(JUN-Luteolin)、热休克蛋白-丹参酮ⅡA(HSP90AA1-TanshinoneⅡA)、乳胶颗粒蛋白-槲皮素(JUN-Quercetin)等之间具有关键结合活性。结论:苏黄止咳胶囊可能具有减轻气道炎症的作用,并参与调控支气管中核心蛋白质表达水平,其治疗BA的机制可能是通过调控晚期糖基化终产物及其受体(advanced glycation end products/receptor for advanced glycation end products,AGE/RAGE)、脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B(phosphatidylinositol 3-kinase,PI3K/Akt)、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)等信号通路和多种生物过程来实现。展开更多
文摘目的:基于网络药理学与分子对接研究苏黄止咳胶囊治疗支气管哮喘(bronchial asthma,BA)的作用机制。方法:运用R语言进行差异性分析;通过中药系统药理学(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)平台和中国科学院上海有机化学研究所化学专业数据库(Shanghai Institute of Organic Chemistry of CAS.Chemistry Database,CASC)筛选药物有效成分及靶点,通过基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)筛选疾病靶点,使用韦恩(Venny)2.1.0筛选药物与疾病的共同靶点,导入检索蛋白质相互作用数据库(Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins,STRING)进行分析,构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络图,运用R语言进行基因本体(gene ontology,GO)功能和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析,通过AutoDuck Vina 1.5.6、PyMOL软件进行分子对接验证。结果:从麻黄-前胡药对中筛选出36个有效成分,与BA相交的核心靶点25个,获得了木犀草素、丹参酮ⅡA、槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、豆甾醇等核心成分。分子对接结果表明,乳胶颗粒蛋白-木犀草素(JUN-Luteolin)、热休克蛋白-丹参酮ⅡA(HSP90AA1-TanshinoneⅡA)、乳胶颗粒蛋白-槲皮素(JUN-Quercetin)等之间具有关键结合活性。结论:苏黄止咳胶囊可能具有减轻气道炎症的作用,并参与调控支气管中核心蛋白质表达水平,其治疗BA的机制可能是通过调控晚期糖基化终产物及其受体(advanced glycation end products/receptor for advanced glycation end products,AGE/RAGE)、脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B(phosphatidylinositol 3-kinase,PI3K/Akt)、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)等信号通路和多种生物过程来实现。
