目的:利用网络药理学方法探究参苓白术散治疗功能性腹泻(functional diarrhea,FD)的作用机制。方法:在中药系统网络药理学分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)筛选参苓...目的:利用网络药理学方法探究参苓白术散治疗功能性腹泻(functional diarrhea,FD)的作用机制。方法:在中药系统网络药理学分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)筛选参苓白术散中各中药的有效成分及相关作用靶点;在人类基因数据库(the human gene database,GeneCards)、PharmGKB数据库、DrugBank数据库、在线人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man,OMIM)及药物靶标数据库(therapeutic targetdatabase,TTD)中检索FD疾病相关靶点;使用R Studio 4.1.2对FD靶点及参苓白术散中的中药有效成分作用靶点取交集,使用STRING数据库对交集靶点进行蛋白-蛋白互作(protein-protein interactions,PPI)网络分析,结果导入Cytoscape 3.9.0中筛选关键靶点,然后对交集靶点进行基因本体论(gene ontology,GO)功能和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,并对关键靶点进行分子对接验证。结果:共筛选出160种中药有效成分,1936个靶点;疾病靶点7329个;参苓白术散中主要有效成分为刺槐素、山柰酚、木犀草素和槲皮素;关键靶点为TNF、CDK4、RB1、IL-6、CDK1、CDK2等;涉及脂质和动脉粥样硬化、PI3K/ATK等信号通路。结论:参苓白术散通过多成分、多靶点、多途径发挥治疗FD的作用。展开更多
目的:利用网络药理学和分子对接探讨白头翁汤治疗溃疡性结肠炎(ulcerative colitis UC)的活性化合物,研究其治疗UC的机制。方法:从中药系统药理学数据库(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis plat...目的:利用网络药理学和分子对接探讨白头翁汤治疗溃疡性结肠炎(ulcerative colitis UC)的活性化合物,研究其治疗UC的机制。方法:从中药系统药理学数据库(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)中检索白头翁汤的有效成分及相关靶点,从OMIM、DrugBank数据库获得UC相关靶点。利用Cytoscape构建中药复方目标网络,利用STRING数据库构建目标蛋白-蛋白质相互作用网络。基因本体论(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析核心基因,获得相关的靶点通路。将白头翁汤的主要活性化合物与白细胞介素4(interleukin-4,IL-4)和环氧合酶2(prostaglandin-endoperoxide synthase 2,PTGS2)进行分子对接。结果:目标-靶点网络包括43个主要化合物和66个靶点,包括PTGS2、IL-4、IL-17、IL-8、胱天蛋白酶3(caspase-3,CASP3)、肿瘤蛋白P53(tumor protein 53,TP53)、丝裂原活化蛋白激酶1(mitogen-activated protein kinase 1,MAPK1)、基质金属蛋白酶9(matrix metalloproteinase 9,MMP9)等,GO和KEGG富集分析结果显示主要富集在AKT、IL-4、IL-17、RGE-RAGE等信号通路。对接结果表明槲皮素和黄柏碱是主要成分,分别与PTGS2和IL-4有较高的亲和力。结论:白头翁汤治疗UC的主要机制可能是通过槲皮素和黄柏碱对PTGS2和IL-2多条信号通路进行调节,如IL-4、IL-17、AKT信号通路等。该研究对进一步挖掘白头翁汤治疗UC的临床疗效和作用机制奠定了一定的基础。展开更多
文摘目的:利用网络药理学方法探究参苓白术散治疗功能性腹泻(functional diarrhea,FD)的作用机制。方法:在中药系统网络药理学分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)筛选参苓白术散中各中药的有效成分及相关作用靶点;在人类基因数据库(the human gene database,GeneCards)、PharmGKB数据库、DrugBank数据库、在线人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man,OMIM)及药物靶标数据库(therapeutic targetdatabase,TTD)中检索FD疾病相关靶点;使用R Studio 4.1.2对FD靶点及参苓白术散中的中药有效成分作用靶点取交集,使用STRING数据库对交集靶点进行蛋白-蛋白互作(protein-protein interactions,PPI)网络分析,结果导入Cytoscape 3.9.0中筛选关键靶点,然后对交集靶点进行基因本体论(gene ontology,GO)功能和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,并对关键靶点进行分子对接验证。结果:共筛选出160种中药有效成分,1936个靶点;疾病靶点7329个;参苓白术散中主要有效成分为刺槐素、山柰酚、木犀草素和槲皮素;关键靶点为TNF、CDK4、RB1、IL-6、CDK1、CDK2等;涉及脂质和动脉粥样硬化、PI3K/ATK等信号通路。结论:参苓白术散通过多成分、多靶点、多途径发挥治疗FD的作用。
文摘目的:利用网络药理学和分子对接探讨白头翁汤治疗溃疡性结肠炎(ulcerative colitis UC)的活性化合物,研究其治疗UC的机制。方法:从中药系统药理学数据库(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)中检索白头翁汤的有效成分及相关靶点,从OMIM、DrugBank数据库获得UC相关靶点。利用Cytoscape构建中药复方目标网络,利用STRING数据库构建目标蛋白-蛋白质相互作用网络。基因本体论(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析核心基因,获得相关的靶点通路。将白头翁汤的主要活性化合物与白细胞介素4(interleukin-4,IL-4)和环氧合酶2(prostaglandin-endoperoxide synthase 2,PTGS2)进行分子对接。结果:目标-靶点网络包括43个主要化合物和66个靶点,包括PTGS2、IL-4、IL-17、IL-8、胱天蛋白酶3(caspase-3,CASP3)、肿瘤蛋白P53(tumor protein 53,TP53)、丝裂原活化蛋白激酶1(mitogen-activated protein kinase 1,MAPK1)、基质金属蛋白酶9(matrix metalloproteinase 9,MMP9)等,GO和KEGG富集分析结果显示主要富集在AKT、IL-4、IL-17、RGE-RAGE等信号通路。对接结果表明槲皮素和黄柏碱是主要成分,分别与PTGS2和IL-4有较高的亲和力。结论:白头翁汤治疗UC的主要机制可能是通过槲皮素和黄柏碱对PTGS2和IL-2多条信号通路进行调节,如IL-4、IL-17、AKT信号通路等。该研究对进一步挖掘白头翁汤治疗UC的临床疗效和作用机制奠定了一定的基础。
