目的研究大连市2023—2024年分离的18株布鲁氏菌基因组特征,为布鲁氏菌分子溯源、毒力基因分析以及耐药机制的研究提供数据支持。方法对大连市2023—2024年分离自患者的18株布鲁氏菌进行生化鉴定和全基因组测序,利用基因组分析软件对全...目的研究大连市2023—2024年分离的18株布鲁氏菌基因组特征,为布鲁氏菌分子溯源、毒力基因分析以及耐药机制的研究提供数据支持。方法对大连市2023—2024年分离自患者的18株布鲁氏菌进行生化鉴定和全基因组测序,利用基因组分析软件对全基因组数据进行质控和基因组组装,同时从NCBI下载布鲁氏菌基因组序列,对组装基因组开展多位点序列分型(MLST)、全基因组单核苷酸多态性分析(whole-genome Single Nucleotide Polymorphism,wgSNP)、毒力基因和耐药基因分析。结果MLST分型结果:18株布鲁氏菌均为羊种布鲁氏菌ST8型。wgSNP结果:18株本地菌株和其他22株菌株被分为40个SNP型,所有菌株间均存在SNP差异,总SNP数为20590。通过系统发育分析,40株菌被分为3个主进化分支,2株本地菌株与呼和浩特、河北分离的菌株亲缘关系较近,位于主进化分支1上;4株本地菌株与通辽分离的菌株亲缘关系较近,位于主进化分支2上;其余12株本地菌株与其他19株菌株亲缘关系较近,均位于主进化分支3上,12株本地菌株与2株北京分离株、2株呼伦贝尔分离株位于主进化分支3的亚分支3b上,其他种的布鲁氏菌参考株均位于主进化分支3的亚分支3a上。DL230017BRU与DL231021BRU、DL240794BRU与DL240723BRU之间的SNP数均为2。18株菌株均有LPS、T4SS等13种毒力基因和adeF、Brucella suis mprF两种耐药基因。结论没有足够的流行病学信息支持这18株菌株为同一来源,且部分菌株与国内其他地区分离的菌株亲缘关系较近,但这些菌株具有潜在的致病性和耐药性,有必要开展连续监测,为布鲁氏菌病防控提供依据。展开更多
目的分析湖北省部分地区2017—2022年新确证HIV-1感染者的新发感染状况及其影响因素。方法采用限制性抗原亲和力法对免疫印迹法试验结果为HIV-1抗体阳性的样本进行新发感染检测,分析判定为新近感染的样本的人口学特征,采用logistic回归...目的分析湖北省部分地区2017—2022年新确证HIV-1感染者的新发感染状况及其影响因素。方法采用限制性抗原亲和力法对免疫印迹法试验结果为HIV-1抗体阳性的样本进行新发感染检测,分析判定为新近感染的样本的人口学特征,采用logistic回归模型分析新发感染的影响因素。结果403例新确证HIV-1感染者被判定为新发感染的比例为19.11%(77/403)。新确证HIV-1感染者中以年龄≤24岁(新发感染比例为40.00%)、未婚(29.41%)、大专及以上(31.37%)、来自自愿咨询检测(Voluntary counseling and testing,VCT)门诊(40.00%)的感染者新发感染比例较高,差异有统计学意义。多因素二元logistic回归分析结果显示,年龄≤24岁(aOR=4.346,95%CI:1.342~14.075)和来自VCT门诊(aOR=6.761,95%CI:1.460~31.319)的新确证HIV-1感染者更可能为新发感染。结论湖北省部分地区近年艾滋病新发感染比例相对较低,应持续加强青少年群体艾滋病防治干预措施,推进VCT门诊建设,以实现感染者的早发现早诊治。展开更多
文摘目的研究大连市2023—2024年分离的18株布鲁氏菌基因组特征,为布鲁氏菌分子溯源、毒力基因分析以及耐药机制的研究提供数据支持。方法对大连市2023—2024年分离自患者的18株布鲁氏菌进行生化鉴定和全基因组测序,利用基因组分析软件对全基因组数据进行质控和基因组组装,同时从NCBI下载布鲁氏菌基因组序列,对组装基因组开展多位点序列分型(MLST)、全基因组单核苷酸多态性分析(whole-genome Single Nucleotide Polymorphism,wgSNP)、毒力基因和耐药基因分析。结果MLST分型结果:18株布鲁氏菌均为羊种布鲁氏菌ST8型。wgSNP结果:18株本地菌株和其他22株菌株被分为40个SNP型,所有菌株间均存在SNP差异,总SNP数为20590。通过系统发育分析,40株菌被分为3个主进化分支,2株本地菌株与呼和浩特、河北分离的菌株亲缘关系较近,位于主进化分支1上;4株本地菌株与通辽分离的菌株亲缘关系较近,位于主进化分支2上;其余12株本地菌株与其他19株菌株亲缘关系较近,均位于主进化分支3上,12株本地菌株与2株北京分离株、2株呼伦贝尔分离株位于主进化分支3的亚分支3b上,其他种的布鲁氏菌参考株均位于主进化分支3的亚分支3a上。DL230017BRU与DL231021BRU、DL240794BRU与DL240723BRU之间的SNP数均为2。18株菌株均有LPS、T4SS等13种毒力基因和adeF、Brucella suis mprF两种耐药基因。结论没有足够的流行病学信息支持这18株菌株为同一来源,且部分菌株与国内其他地区分离的菌株亲缘关系较近,但这些菌株具有潜在的致病性和耐药性,有必要开展连续监测,为布鲁氏菌病防控提供依据。
文摘目的分析湖北省部分地区2017—2022年新确证HIV-1感染者的新发感染状况及其影响因素。方法采用限制性抗原亲和力法对免疫印迹法试验结果为HIV-1抗体阳性的样本进行新发感染检测,分析判定为新近感染的样本的人口学特征,采用logistic回归模型分析新发感染的影响因素。结果403例新确证HIV-1感染者被判定为新发感染的比例为19.11%(77/403)。新确证HIV-1感染者中以年龄≤24岁(新发感染比例为40.00%)、未婚(29.41%)、大专及以上(31.37%)、来自自愿咨询检测(Voluntary counseling and testing,VCT)门诊(40.00%)的感染者新发感染比例较高,差异有统计学意义。多因素二元logistic回归分析结果显示,年龄≤24岁(aOR=4.346,95%CI:1.342~14.075)和来自VCT门诊(aOR=6.761,95%CI:1.460~31.319)的新确证HIV-1感染者更可能为新发感染。结论湖北省部分地区近年艾滋病新发感染比例相对较低,应持续加强青少年群体艾滋病防治干预措施,推进VCT门诊建设,以实现感染者的早发现早诊治。
