目的分析深圳市人源布鲁菌分离株多位点可变数目串联重复序列分析(multiple-locus variablenumber tandem repeat analysis,MLVA)分型,探讨布鲁菌在该地区的遗传变异情况及溯源调查,为制定有效的预防控制策略提供科学依据。方法基于全...目的分析深圳市人源布鲁菌分离株多位点可变数目串联重复序列分析(multiple-locus variablenumber tandem repeat analysis,MLVA)分型,探讨布鲁菌在该地区的遗传变异情况及溯源调查,为制定有效的预防控制策略提供科学依据。方法基于全基因测序数据,采用MLVA分型方法,收集2005—2024年深圳市保存的191株人源布鲁菌分离株进行基因型分析,并使用BioNumerics v 7.6软件进行聚类分析,同时计算辛普森指数。结果基于MLVA-8分型,将191株菌株划分为13个基因型,羊种菌10种(42、43、45、58、63、114、115、196及2种未知型),猪种菌1种(4型)及牛种菌2种(36、113型),其中羊种42、43、63型占总数的89.01%。基于MLVA-11分型,分为14种,羊种布鲁菌均为“东地中海”组。基于MLVA-16分型对191株菌进行聚类分析结果显示,深圳市所有菌株分为3个群,123个基因型,呈现基因型别的多样性。辛普森指数0.000~0.900,Panel 1和Panel 2A多样性均低于Panel 2B。结论MLVA能有效进行布鲁菌的种属鉴定、菌株遗传多样性分析及分子流行病学溯源。深圳市人源布鲁菌MLVA分型显示,高度基因多态性及基因型共享,深圳市人感染布鲁菌病流行呈现散发病例及由共同来源引起的多种暴发事件,可能涉及跨区域传播和本地续发。因此,减少布鲁菌感染源在不同区域间的频繁流动,可能是控制人源布鲁菌病流行的有效措施。展开更多
文摘目的分析深圳市人源布鲁菌分离株多位点可变数目串联重复序列分析(multiple-locus variablenumber tandem repeat analysis,MLVA)分型,探讨布鲁菌在该地区的遗传变异情况及溯源调查,为制定有效的预防控制策略提供科学依据。方法基于全基因测序数据,采用MLVA分型方法,收集2005—2024年深圳市保存的191株人源布鲁菌分离株进行基因型分析,并使用BioNumerics v 7.6软件进行聚类分析,同时计算辛普森指数。结果基于MLVA-8分型,将191株菌株划分为13个基因型,羊种菌10种(42、43、45、58、63、114、115、196及2种未知型),猪种菌1种(4型)及牛种菌2种(36、113型),其中羊种42、43、63型占总数的89.01%。基于MLVA-11分型,分为14种,羊种布鲁菌均为“东地中海”组。基于MLVA-16分型对191株菌进行聚类分析结果显示,深圳市所有菌株分为3个群,123个基因型,呈现基因型别的多样性。辛普森指数0.000~0.900,Panel 1和Panel 2A多样性均低于Panel 2B。结论MLVA能有效进行布鲁菌的种属鉴定、菌株遗传多样性分析及分子流行病学溯源。深圳市人源布鲁菌MLVA分型显示,高度基因多态性及基因型共享,深圳市人感染布鲁菌病流行呈现散发病例及由共同来源引起的多种暴发事件,可能涉及跨区域传播和本地续发。因此,减少布鲁菌感染源在不同区域间的频繁流动,可能是控制人源布鲁菌病流行的有效措施。
