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结直肠癌“炎-癌”转化关键基因筛选及中药的预测分析 被引量：2
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作者 葛雨竹 闫艳 +5 位作者 李静 徐秀泉 杨晓帆 葛笑兰 张梦娟 王利利 《阜阳师范大学学报(自然科学版)》 2024年第4期34-43,共10页
利用生物信息学方法筛选溃疡性结肠炎(Ulcerative colitis, UC)向结直肠癌(Colorectal cancer, CRC)发展的关键差异基因,预测能够干预CRC“炎-癌”转化进程的中药及其潜在治疗靶点与免疫机制。从GEO基因表达数据库获取GSE3629基因芯片... 利用生物信息学方法筛选溃疡性结肠炎(Ulcerative colitis, UC)向结直肠癌(Colorectal cancer, CRC)发展的关键差异基因,预测能够干预CRC“炎-癌”转化进程的中药及其潜在治疗靶点与免疫机制。从GEO基因表达数据库获取GSE3629基因芯片后筛选差异表达基因,并进行GO和KEGG富集分析;运用STRING数据库构建蛋白-蛋白互作网络,Cytoscape软件筛选关键基因;使用GEPIA平台对关键基因进一步分析,筛选显著影响结直肠癌预后的基因;再利用TIMER平台评估关键基因与CRC免疫浸润及突变基因的关联度;筛选得到的基因与Coremine Medical数据库相映射,预测潜在治疗作用的中药。筛选出的DEGs主要参与信号通路;生信分析提示7个关键基因显著影响CRC预后,其中COX4I1对CRC预后、免疫浸润与基因突变关联均具统计学意义;筛选得到干预CRC“炎-癌”转化进程的潜在中药大多味苦性寒归肺经。CRC“炎-癌”转化机制复杂,其中COX4I1等可作为潜在生物标志物,多味中药具有干预其转化的潜在价值,该研究可为CRC转化机制和治疗药物的研究提供参考方向。 展开更多
关键词 溃疡性结肠炎 结直肠癌 生物信息学 中药预测
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