三阴性乳腺癌具有代谢重编程特征,糖酵解途径的异常激活是其关键特征之一。乳酸作为糖酵解途径的终产物,可在细胞、器官及组织间发挥信号传导功能,从而促进肿瘤的侵袭与转移。近期研究首次揭示乳酸可作为底物参与新型翻译后修饰乳酸化...三阴性乳腺癌具有代谢重编程特征,糖酵解途径的异常激活是其关键特征之一。乳酸作为糖酵解途径的终产物,可在细胞、器官及组织间发挥信号传导功能,从而促进肿瘤的侵袭与转移。近期研究首次揭示乳酸可作为底物参与新型翻译后修饰乳酸化。因此,围绕乳酸化相关基因在三阴性乳腺癌中的作用展开探讨。利用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)下载151例三阴性乳腺癌样本和113例癌旁样本的转录组数据及其相应的临床信息。通过差异分析、通路富集、单因素和多因素Cox分析得到乳酸化预后基因。在TCGA-TNBC训练队列中构建乳酸化相关基因的预后模型,GSE21653、GSE58812和METABRIC-TNBC作为验证队列进行模型验证。根据乳酸化风险评分将样本分为高乳酸化风险组和低乳酸化风险组,生存分析、受试工作者曲线和列线图进一步验证模型性能,并进一步分析该模型与免疫细胞浸润及药物敏感性的关联。结果显示,基于4个乳酸化相关基因建立的预后模型,对三阴性乳腺癌患者具有良好的预后预测能力。生存分析结果表明,高乳酸化风险评分与患者不良预后显著相关,高风险组患者的总体生存率均低于低风险组。同时,高低乳酸化风险组的患者在肿瘤免疫微环境浸润特征及药物反应敏感性方面均表现出显著差异。这一发现提示,乳酸化相关基因有望成为三阴性乳腺癌的新型分子生物标志物及潜在治疗靶点。展开更多
目的对一个牙本质生长不全Ⅱ型家系疾病基因进行定位。方法提取该家系18个成员的外周血DNA;在染色体4q21上选择6个短串联重复序列(short tandem repeat,STR)位点,即D4S1534、GATA62A11、DSP(P)、DMP1、SPP1和D4S1563;用连锁分析法分析...目的对一个牙本质生长不全Ⅱ型家系疾病基因进行定位。方法提取该家系18个成员的外周血DNA;在染色体4q21上选择6个短串联重复序列(short tandem repeat,STR)位点,即D4S1534、GATA62A11、DSP(P)、DMP1、SPP1和D4S1563;用连锁分析法分析该家系疾病基因与上述6个STR位点的连锁关系并进行染色体单倍型分析。结果有2个位点最大LOD值>3,分别是位点GATA62A11,得到最大连锁值3.86,(θ=0);位点DSP(P)最大连锁值4.72(θ=0)。单倍型分析显示疾病基因位于4q21上的D4S1534-DMP1区域内。结论牙本质生长不全Ⅱ型家系的疾病基因定位在4q21上。展开更多
文摘三阴性乳腺癌具有代谢重编程特征,糖酵解途径的异常激活是其关键特征之一。乳酸作为糖酵解途径的终产物,可在细胞、器官及组织间发挥信号传导功能,从而促进肿瘤的侵袭与转移。近期研究首次揭示乳酸可作为底物参与新型翻译后修饰乳酸化。因此,围绕乳酸化相关基因在三阴性乳腺癌中的作用展开探讨。利用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)下载151例三阴性乳腺癌样本和113例癌旁样本的转录组数据及其相应的临床信息。通过差异分析、通路富集、单因素和多因素Cox分析得到乳酸化预后基因。在TCGA-TNBC训练队列中构建乳酸化相关基因的预后模型,GSE21653、GSE58812和METABRIC-TNBC作为验证队列进行模型验证。根据乳酸化风险评分将样本分为高乳酸化风险组和低乳酸化风险组,生存分析、受试工作者曲线和列线图进一步验证模型性能,并进一步分析该模型与免疫细胞浸润及药物敏感性的关联。结果显示,基于4个乳酸化相关基因建立的预后模型,对三阴性乳腺癌患者具有良好的预后预测能力。生存分析结果表明,高乳酸化风险评分与患者不良预后显著相关,高风险组患者的总体生存率均低于低风险组。同时,高低乳酸化风险组的患者在肿瘤免疫微环境浸润特征及药物反应敏感性方面均表现出显著差异。这一发现提示,乳酸化相关基因有望成为三阴性乳腺癌的新型分子生物标志物及潜在治疗靶点。
文摘目的对一个牙本质生长不全Ⅱ型家系疾病基因进行定位。方法提取该家系18个成员的外周血DNA;在染色体4q21上选择6个短串联重复序列(short tandem repeat,STR)位点,即D4S1534、GATA62A11、DSP(P)、DMP1、SPP1和D4S1563;用连锁分析法分析该家系疾病基因与上述6个STR位点的连锁关系并进行染色体单倍型分析。结果有2个位点最大LOD值>3,分别是位点GATA62A11,得到最大连锁值3.86,(θ=0);位点DSP(P)最大连锁值4.72(θ=0)。单倍型分析显示疾病基因位于4q21上的D4S1534-DMP1区域内。结论牙本质生长不全Ⅱ型家系的疾病基因定位在4q21上。
