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用线粒体tRNA基因探讨现存两栖动物三个目间系统发生关系
被引量:
3
1
作者
刘忠权
王义权
周开亚
《Zoological Research》
CAS
CSCD
北大核心
2004年第3期185-190,共6页
现存两栖类 3个目的系统发生关系仍然没有统一意见 ,最广泛被接受的假说是单系起源 ,并且无尾类和有尾类为姐妹群关系而排斥蚓螈类 (蛙类假说 )。然而 ,这一假说一直存在争议。我们在测定了泽蛙线粒体基因组全序列的基础上 ,与已知其他...
现存两栖类 3个目的系统发生关系仍然没有统一意见 ,最广泛被接受的假说是单系起源 ,并且无尾类和有尾类为姐妹群关系而排斥蚓螈类 (蛙类假说 )。然而 ,这一假说一直存在争议。我们在测定了泽蛙线粒体基因组全序列的基础上 ,与已知其他的 6种两栖类进行详细的比较分析 ,同时选择了 11种高等脊椎动物的线粒体全基因序列 ,以硬骨鱼类作外群 ,用 2 2个tRNA基因合并数据进行系统发生重建分析 ,结果表明MP、ML树都强力地支持现生两栖类动物为单系群 ,并且有尾目和蚓螈目为姐妹群关系。这个结果与蛙类假说是相矛盾的 ,与Bolt (1991)在形态学基础上提出的有尾类和蚓螈类为姐妹群关系的假说相一致 ,并得到建立在线粒体和核rRNA基因数据基础上的许多分子研究的支持。另外还探讨了本结果与前人的研究不一致的原因 。
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关键词
两栖类
TRNA基因
系统发生
动物
形态学
线粒体
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职称材料
基于16S rRNA序列的角蟾科部分属间系统关系
被引量:
8
2
作者
郑渝池
莫邦辉
+1 位作者
刘志君
曾晓茂
《Zoological Research》
CAS
CSCD
北大核心
2004年第3期205-213,共9页
采用最大似然法 (ML法 )、最大简约法 (MP法 )、邻接法 (NJ法 )对来自角蟾科Megophryidae (A nura) 8属 17种及外群 2种共 2 5条 4 0 0bp左右的线粒体 16SrRNA序列进行系统发育关系分析。结果表明 ,用于分析的所有角蟾科物种形成两大支 ...
采用最大似然法 (ML法 )、最大简约法 (MP法 )、邻接法 (NJ法 )对来自角蟾科Megophryidae (A nura) 8属 17种及外群 2种共 2 5条 4 0 0bp左右的线粒体 16SrRNA序列进行系统发育关系分析。结果表明 ,用于分析的所有角蟾科物种形成两大支 ,第一支包括Megophrys ,Brachytarsophrys和Atympanophrys ,第二支包括Leptobrachium ,Leptolalax ,Scutiger ,Oreolalax和Vibrissaphora。支持将角蟾科划分为两大类群 ,即第一支属于Megophryini族 ,第二支属于Leptobrachiini族。根据分子钟模型初步推测两类群间的分歧时间大致为 14 2~ 18 7百万年前。在Megophryini族中 ,基因树的拓扑结构不支持Atympanophrys建立后的Megophrys为单系 ;而在Lep tobrachiini族中 ,Leptolalax为一有效属 。
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关键词
16SrRNA
拓扑结构
系统发育
角蟾科
物种
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职称材料
大鲵栖息地环境的初步研究
被引量:
24
3
作者
陶峰勇
王小明
章克家
《四川动物》
CSCD
2004年第2期83-87,共5页
2001年4月至8月,对湖南省壶瓶山自然保护区河流中大鲵(Andriasdavidianus)的栖息洞穴,首次使用量化指标进行分析。通过主成分分析发现,大鲵栖息洞穴处的水深、洞口宽、水流速度和河底的组成是影响大鲵选择洞穴的主要因子,而海拔高度和...
2001年4月至8月,对湖南省壶瓶山自然保护区河流中大鲵(Andriasdavidianus)的栖息洞穴,首次使用量化指标进行分析。通过主成分分析发现,大鲵栖息洞穴处的水深、洞口宽、水流速度和河底的组成是影响大鲵选择洞穴的主要因子,而海拔高度和洞口高的影响不大。同时,对重庆市酉阳县、陕西省太白县、河南省卢氏县大鲵自然保护区和新安县青要山大鲵自然保护区大鲵的栖息河流特征进行了调查。结果表明大鲵的栖息河流类型可分为溪流、U型河流、平底型河流和暗河4类,而且大鲵对其栖息洞穴的质量要求较高。
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关键词
大鲵
栖息地
洞穴
湖南
自然保护区
主成分分析
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职称材料
题名
用线粒体tRNA基因探讨现存两栖动物三个目间系统发生关系
被引量:
3
1
作者
刘忠权
王义权
周开亚
机构
南京师范大学遗传资源研究所
厦门大学生命科学学院
出处
《Zoological Research》
CAS
CSCD
北大核心
2004年第3期185-190,共6页
基金
教育部骨干教师资助计划项目 (GG -180 -2 10 0 2 40 3 -1740 )
教育部留学回国人员启动基金资助~~
文摘
现存两栖类 3个目的系统发生关系仍然没有统一意见 ,最广泛被接受的假说是单系起源 ,并且无尾类和有尾类为姐妹群关系而排斥蚓螈类 (蛙类假说 )。然而 ,这一假说一直存在争议。我们在测定了泽蛙线粒体基因组全序列的基础上 ,与已知其他的 6种两栖类进行详细的比较分析 ,同时选择了 11种高等脊椎动物的线粒体全基因序列 ,以硬骨鱼类作外群 ,用 2 2个tRNA基因合并数据进行系统发生重建分析 ,结果表明MP、ML树都强力地支持现生两栖类动物为单系群 ,并且有尾目和蚓螈目为姐妹群关系。这个结果与蛙类假说是相矛盾的 ,与Bolt (1991)在形态学基础上提出的有尾类和蚓螈类为姐妹群关系的假说相一致 ,并得到建立在线粒体和核rRNA基因数据基础上的许多分子研究的支持。另外还探讨了本结果与前人的研究不一致的原因 。
关键词
两栖类
TRNA基因
系统发生
动物
形态学
线粒体
Keywords
Amphibian
tRNA gene
Phylogenetic relationship
分类号
Q9595 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
基于16S rRNA序列的角蟾科部分属间系统关系
被引量:
8
2
作者
郑渝池
莫邦辉
刘志君
曾晓茂
机构
中国科学院成都生物研究所
出处
《Zoological Research》
CAS
CSCD
北大核心
2004年第3期205-213,共9页
基金
国家自然科学基金资助项目 ( 3 0 0 70 0 90 )
中国科学院知识创新工程项目 (KSCX2 -1-0 9)
中国科学院西南基地创新工程支持
文摘
采用最大似然法 (ML法 )、最大简约法 (MP法 )、邻接法 (NJ法 )对来自角蟾科Megophryidae (A nura) 8属 17种及外群 2种共 2 5条 4 0 0bp左右的线粒体 16SrRNA序列进行系统发育关系分析。结果表明 ,用于分析的所有角蟾科物种形成两大支 ,第一支包括Megophrys ,Brachytarsophrys和Atympanophrys ,第二支包括Leptobrachium ,Leptolalax ,Scutiger ,Oreolalax和Vibrissaphora。支持将角蟾科划分为两大类群 ,即第一支属于Megophryini族 ,第二支属于Leptobrachiini族。根据分子钟模型初步推测两类群间的分歧时间大致为 14 2~ 18 7百万年前。在Megophryini族中 ,基因树的拓扑结构不支持Atympanophrys建立后的Megophrys为单系 ;而在Lep tobrachiini族中 ,Leptolalax为一有效属 。
关键词
16SrRNA
拓扑结构
系统发育
角蟾科
物种
Keywords
Megophryidae
16S rRNA
Phylogeny
Topology
分类号
Q95953 [生物学—动物学]
Q9513 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
大鲵栖息地环境的初步研究
被引量:
24
3
作者
陶峰勇
王小明
章克家
机构
华东师范大学生命科学学院
出处
《四川动物》
CSCD
2004年第2期83-87,共5页
基金
美国野生生物保护学会(WCS)
Denver基金会
上海市曙光计划和上海市重点学科以及教育部跨世纪优秀人才培养计划资助
文摘
2001年4月至8月,对湖南省壶瓶山自然保护区河流中大鲵(Andriasdavidianus)的栖息洞穴,首次使用量化指标进行分析。通过主成分分析发现,大鲵栖息洞穴处的水深、洞口宽、水流速度和河底的组成是影响大鲵选择洞穴的主要因子,而海拔高度和洞口高的影响不大。同时,对重庆市酉阳县、陕西省太白县、河南省卢氏县大鲵自然保护区和新安县青要山大鲵自然保护区大鲵的栖息河流特征进行了调查。结果表明大鲵的栖息河流类型可分为溪流、U型河流、平底型河流和暗河4类,而且大鲵对其栖息洞穴的质量要求较高。
关键词
大鲵
栖息地
洞穴
湖南
自然保护区
主成分分析
Keywords
Chinese giant salamander(Andrias davidianus)
habitual den
river type
principle components analysis
分类号
Q958 [生物学—动物学]
Q9595 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
用线粒体tRNA基因探讨现存两栖动物三个目间系统发生关系
刘忠权
王义权
周开亚
《Zoological Research》
CAS
CSCD
北大核心
2004
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
基于16S rRNA序列的角蟾科部分属间系统关系
郑渝池
莫邦辉
刘志君
曾晓茂
《Zoological Research》
CAS
CSCD
北大核心
2004
8
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
大鲵栖息地环境的初步研究
陶峰勇
王小明
章克家
《四川动物》
CSCD
2004
24
在线阅读
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职称材料
已选择
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