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基于16S rRNA序列的角蟾科部分属间系统关系
被引量:
8
1
作者
郑渝池
莫邦辉
+1 位作者
刘志君
曾晓茂
《Zoological Research》
CAS
CSCD
北大核心
2004年第3期205-213,共9页
采用最大似然法 (ML法 )、最大简约法 (MP法 )、邻接法 (NJ法 )对来自角蟾科Megophryidae (A nura) 8属 17种及外群 2种共 2 5条 4 0 0bp左右的线粒体 16SrRNA序列进行系统发育关系分析。结果表明 ,用于分析的所有角蟾科物种形成两大支 ...
采用最大似然法 (ML法 )、最大简约法 (MP法 )、邻接法 (NJ法 )对来自角蟾科Megophryidae (A nura) 8属 17种及外群 2种共 2 5条 4 0 0bp左右的线粒体 16SrRNA序列进行系统发育关系分析。结果表明 ,用于分析的所有角蟾科物种形成两大支 ,第一支包括Megophrys ,Brachytarsophrys和Atympanophrys ,第二支包括Leptobrachium ,Leptolalax ,Scutiger ,Oreolalax和Vibrissaphora。支持将角蟾科划分为两大类群 ,即第一支属于Megophryini族 ,第二支属于Leptobrachiini族。根据分子钟模型初步推测两类群间的分歧时间大致为 14 2~ 18 7百万年前。在Megophryini族中 ,基因树的拓扑结构不支持Atympanophrys建立后的Megophrys为单系 ;而在Lep tobrachiini族中 ,Leptolalax为一有效属 。
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关键词
16SrRNA
拓扑结构
系统发育
角蟾科
物种
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职称材料
基于线粒体细胞色素b基因序列探讨红喉姬鹟两亚种的分类地位
被引量:
11
2
作者
李伟
张雁云
《Zoological Research》
CAS
CSCD
北大核心
2004年第2期127-131,共5页
以线粒体DNA细胞色素b基因的全序列作为遗传标记 ,探讨红喉姬普通亚种 (Ficedulaparvaal bicilla)和指名亚种 (F .p .parva)的分类地位。应用Kimura 2 parameter法计算出红喉姬普通亚种个体间的遗传距离为 0 1%~ 0 2 % ,而与指...
以线粒体DNA细胞色素b基因的全序列作为遗传标记 ,探讨红喉姬普通亚种 (Ficedulaparvaal bicilla)和指名亚种 (F .p .parva)的分类地位。应用Kimura 2 parameter法计算出红喉姬普通亚种个体间的遗传距离为 0 1%~ 0 2 % ,而与指名亚种之间的遗传距离为 6 4 % ,两亚种之间的遗传距离远远大于种间的遗传距离。结合形态学的特征我们认为 :红喉姬指名亚种和普通亚种应为两个独立种 ,分别为红喉姬 (F .albicilla)和红胸姬 (F .parva) ,两者的分化时间为 3 15~ 3 2
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关键词
线粒体
细胞色素B
基因序列
红喉姬鶲
亚种
分化
遗传标记
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职称材料
多疣壁虎胚胎发育过程中角蛋白的表达分析
3
作者
陈铭月
王飞飞
+2 位作者
李鹏
严洁
周开亚
《南京师大学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第2期99-104,共6页
角蛋白包括α角蛋白和β角蛋白两种类型.迄今α角蛋白被发现存在于所有的脊椎动物中,而β角蛋白仅存在于鸟类和爬行类表皮及其附属物中.本研究通过同源搜索比对鉴定了多疣壁虎(Gekko japonicus)的 1个β角蛋白基因: G.japonicus claw ke...
角蛋白包括α角蛋白和β角蛋白两种类型.迄今α角蛋白被发现存在于所有的脊椎动物中,而β角蛋白仅存在于鸟类和爬行类表皮及其附属物中.本研究通过同源搜索比对鉴定了多疣壁虎(Gekko japonicus)的 1个β角蛋白基因: G.japonicus claw keratin-like(LOC107121854),暂命名为 ge-gprp-13 ,和1个α角蛋白基因: G.japonicus keratinocyte associated protein 2(KRTCAP2),暂命名为 ge-krtcap 2 .利用荧光定量PCR方法比较分析了多疣壁虎 ge-gprp-13和ge-krtcap 2 基因在其胚胎发育过程中的mRNA表达模式.研究结果表明,在多疣壁虎胚胎发育的不同时期,α角蛋白基因( ge-krtcap 2 )和β角蛋白基因(ge-gprp-13)的表达模式不同:在趾部发育的初期,α角蛋白基因先表达,而β角蛋白基因主要在趾部发育的后期进行表达,并且在趾部形成的整个过程中,β角蛋白基因的表达量远远高于α角蛋白基因的表达量.
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关键词
多疣壁虎
α角蛋白
β角蛋白
MRNA表达
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职称材料
题名
基于16S rRNA序列的角蟾科部分属间系统关系
被引量:
8
1
作者
郑渝池
莫邦辉
刘志君
曾晓茂
机构
中国科学院成都生物研究所
出处
《Zoological Research》
CAS
CSCD
北大核心
2004年第3期205-213,共9页
基金
国家自然科学基金资助项目 ( 3 0 0 70 0 90 )
中国科学院知识创新工程项目 (KSCX2 -1-0 9)
中国科学院西南基地创新工程支持
文摘
采用最大似然法 (ML法 )、最大简约法 (MP法 )、邻接法 (NJ法 )对来自角蟾科Megophryidae (A nura) 8属 17种及外群 2种共 2 5条 4 0 0bp左右的线粒体 16SrRNA序列进行系统发育关系分析。结果表明 ,用于分析的所有角蟾科物种形成两大支 ,第一支包括Megophrys ,Brachytarsophrys和Atympanophrys ,第二支包括Leptobrachium ,Leptolalax ,Scutiger ,Oreolalax和Vibrissaphora。支持将角蟾科划分为两大类群 ,即第一支属于Megophryini族 ,第二支属于Leptobrachiini族。根据分子钟模型初步推测两类群间的分歧时间大致为 14 2~ 18 7百万年前。在Megophryini族中 ,基因树的拓扑结构不支持Atympanophrys建立后的Megophrys为单系 ;而在Lep tobrachiini族中 ,Leptolalax为一有效属 。
关键词
16SrRNA
拓扑结构
系统发育
角蟾科
物种
Keywords
Megophryidae
16S rRNA
Phylogeny
Topology
分类号
Q95953 [生物学—动物学]
Q9513 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
基于线粒体细胞色素b基因序列探讨红喉姬鹟两亚种的分类地位
被引量:
11
2
作者
李伟
张雁云
机构
北京师范大学生命科学学院
出处
《Zoological Research》
CAS
CSCD
北大核心
2004年第2期127-131,共5页
基金
国家自然科学基金资助项目 (3 0 170 115 )
文摘
以线粒体DNA细胞色素b基因的全序列作为遗传标记 ,探讨红喉姬普通亚种 (Ficedulaparvaal bicilla)和指名亚种 (F .p .parva)的分类地位。应用Kimura 2 parameter法计算出红喉姬普通亚种个体间的遗传距离为 0 1%~ 0 2 % ,而与指名亚种之间的遗传距离为 6 4 % ,两亚种之间的遗传距离远远大于种间的遗传距离。结合形态学的特征我们认为 :红喉姬指名亚种和普通亚种应为两个独立种 ,分别为红喉姬 (F .albicilla)和红胸姬 (F .parva) ,两者的分化时间为 3 15~ 3 2
关键词
线粒体
细胞色素B
基因序列
红喉姬鶲
亚种
分化
遗传标记
Keywords
Ficedula prava
Subspecies
Taxonomy
Cytochrome b gene
分类号
Q959739 [生物学—动物学]
Q9513 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
多疣壁虎胚胎发育过程中角蛋白的表达分析
3
作者
陈铭月
王飞飞
李鹏
严洁
周开亚
机构
南京师范大学生命科学学院江苏省生物多样性与生物技术重点实验室
出处
《南京师大学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第2期99-104,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(31672269)
江苏省高校优势学科Ⅱ期项目(PAPD)
+1 种基金
江苏省高等学校自然科学研究面上项目(17KJD240001)
江苏高校品牌专业建设工程一期项目-生物科学(PPZY2015B117)
文摘
角蛋白包括α角蛋白和β角蛋白两种类型.迄今α角蛋白被发现存在于所有的脊椎动物中,而β角蛋白仅存在于鸟类和爬行类表皮及其附属物中.本研究通过同源搜索比对鉴定了多疣壁虎(Gekko japonicus)的 1个β角蛋白基因: G.japonicus claw keratin-like(LOC107121854),暂命名为 ge-gprp-13 ,和1个α角蛋白基因: G.japonicus keratinocyte associated protein 2(KRTCAP2),暂命名为 ge-krtcap 2 .利用荧光定量PCR方法比较分析了多疣壁虎 ge-gprp-13和ge-krtcap 2 基因在其胚胎发育过程中的mRNA表达模式.研究结果表明,在多疣壁虎胚胎发育的不同时期,α角蛋白基因( ge-krtcap 2 )和β角蛋白基因(ge-gprp-13)的表达模式不同:在趾部发育的初期,α角蛋白基因先表达,而β角蛋白基因主要在趾部发育的后期进行表达,并且在趾部形成的整个过程中,β角蛋白基因的表达量远远高于α角蛋白基因的表达量.
关键词
多疣壁虎
α角蛋白
β角蛋白
MRNA表达
Keywords
Gekko japonicus
α-keraton
β-keraton
mRNA expression
分类号
Q9513 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于16S rRNA序列的角蟾科部分属间系统关系
郑渝池
莫邦辉
刘志君
曾晓茂
《Zoological Research》
CAS
CSCD
北大核心
2004
8
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
基于线粒体细胞色素b基因序列探讨红喉姬鹟两亚种的分类地位
李伟
张雁云
《Zoological Research》
CAS
CSCD
北大核心
2004
11
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
多疣壁虎胚胎发育过程中角蛋白的表达分析
陈铭月
王飞飞
李鹏
严洁
周开亚
《南京师大学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2019
0
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职称材料
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