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澳洲坚果锌指蛋白MiZFP17的亚细胞定位及非生物胁迫下的基因表达分析
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作者 杨祥燕 蔡元保 +3 位作者 叶维雁 李冰 曾黎明 李慧敏 《植物科学学报》 北大核心 2026年第1期51-62,共12页
C3H型锌指蛋白基因在植物生长发育及响应非生物胁迫中发挥重要的调控作用。本研究以澳洲坚果(Macadamia integrifolia Maiden&Betche)‘JW’品种为材料,采用RT-PCR技术克隆锌指蛋白基因MiZFP17,对其编码蛋白进行生物信息学和亚细胞... C3H型锌指蛋白基因在植物生长发育及响应非生物胁迫中发挥重要的调控作用。本研究以澳洲坚果(Macadamia integrifolia Maiden&Betche)‘JW’品种为材料,采用RT-PCR技术克隆锌指蛋白基因MiZFP17,对其编码蛋白进行生物信息学和亚细胞定位分析,并应用实时荧光定量PCR检测该基因在不同器官组织中和非生物胁迫下的表达情况。结果显示,MiZFP17含有3个外显子和2个内含子,其启动子含有丰富的与植物激素、转录因子互作、逆境胁迫等相关的作用元件。MiZFP17蛋白属于串联C3H型锌指蛋白,含有卷曲螺旋区域及2个典型的ZnF_C3H结构域。本氏烟草(Nicotiana benthamiana Domin)瞬时表达系统的亚细胞定位显示,MiZFP17蛋白主要定位于细胞核。实时荧光定量PCR分析显示,MiZFP17在澳洲坚果根、茎、叶、小花、小果及果仁中都有表达,其中小果和果仁的表达量最高,显著高于其他器官组织。在低温和干旱胁迫下,MiZFP17在澳洲坚果叶片中的表达受到显著抑制;在高盐、高温和除草剂胁迫下,其表达则受到显著的诱导作用。因此,主要定位于细胞核的MiZFP17在器官组织的生长发育以及应答低温、干旱、高盐、高温、除草剂等非生物胁迫中可能发挥重要的调控作用。 展开更多
关键词 澳洲坚果 C3H型锌指蛋白 亚细胞定位 非生物胁迫 基因表达分析
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偏关苜蓿MsMYB44基因的克隆、亚细胞定位及表达分析
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作者 李迪娜 王凯 +4 位作者 陶佳丽 许涛 李青秀 朱慧森 岑慧芳 《草地学报》 北大核心 2026年第1期33-42,共10页
MYB(V-myb Avian myeloblastosis viral Oncogene Homolog)基因家族是植物中最大的转录因子家族之一,广泛参与植物的生长发育和逆境胁迫等过程。本研究以‘偏关’苜蓿(Medicago sativa‘Pianguan’)为材料,通过基因克隆、生物信息学分... MYB(V-myb Avian myeloblastosis viral Oncogene Homolog)基因家族是植物中最大的转录因子家族之一,广泛参与植物的生长发育和逆境胁迫等过程。本研究以‘偏关’苜蓿(Medicago sativa‘Pianguan’)为材料,通过基因克隆、生物信息学分析、亚细胞定位及表达模式分析来探究MsMYB44基因的特性。结果显示:‘偏关’苜蓿MsMYB44基因长966 bp,共编码321个氨基酸。MsMYB44蛋白与蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)MtMYB44蛋白高度同源且定位于细胞核内。MsMYB44基因在‘偏关’苜蓿不同生育期的不同部位均有表达,表现出组织表达特异性。MsMYB44基因对干旱、盐胁迫及ABA处理均有响应。干旱胁迫下,MsMYB44相对表达量呈现出先升高后降低再升高的趋势,并在12 h时达到峰值;盐胁迫下,MsMYB44相对表达量在48 h后逐渐升高,且在72 h时达到最高值;ABA处理下,MsMYB44在12 h时相对表达量最高,随后逐渐降低。研究结果有望为阐释MsMYB44基因调控紫花苜蓿非生物胁迫响应机制提供一定理论参考。 展开更多
关键词 MsMYB44 ‘偏关’苜蓿 克隆鉴定 亚细胞定位 表达模式 非生物胁迫
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旱生植物霸王ZxCER6的基因克隆及功能分析
3
作者 未丽 邓育轩 +3 位作者 赵静 刘俊良 马克华 王锁民 《草业学报》 北大核心 2026年第1期154-169,共16页
角质层蜡质在旱生植物霸王抵御不良生境中发挥着重要作用。β-酮脂酰辅酶A合成酶(KCS)是催化蜡质前体物质合成的关键酶。本研究克隆得到霸王ZxKCS6/CER6的cDNA全长1548 bp,具有2个决定底物选择性的高度保守跨膜区和3个酶催化位点,属于... 角质层蜡质在旱生植物霸王抵御不良生境中发挥着重要作用。β-酮脂酰辅酶A合成酶(KCS)是催化蜡质前体物质合成的关键酶。本研究克隆得到霸王ZxKCS6/CER6的cDNA全长1548 bp,具有2个决定底物选择性的高度保守跨膜区和3个酶催化位点,属于缩合酶超家族成员。与其他高等植物同源蛋白的氨基酸序列比对发现,ZxCER6属于KCS家族中CER6亚家族,具有第224位的半胱氨酸高度保守激活位点。系统进化树分析发现,ZxCER6与拟南芥AtCER6的亲缘关系最近。表达模式分析表明,ZxCER6主要在地上部组织中表达,尤其在叶表皮中表达丰度最高;且受50 mmol·L^(-1)NaCl处理的强烈诱导,其表达丰度在36 h时达到峰值。利用表皮特异性启动子驱动ZxCER6在拟南芥中表达发现,干旱处理后转基因拟南芥的地上部干鲜重、叶绿素含量、净光合速率和水分利用效率均显著高于野生型,而离体叶片失水率、叶绿素浸出率和叶片相对质膜透性均低于野生型;转基因植株地上部角质层蜡质含量,尤其是烷烃含量显著增加。表明ZxCER6的超表达可增加转基因植株表皮中烷烃的含量,减少水分散失,从而提高其抗旱性。本研究初步揭示了ZxCER6介导的蜡质积累在荒漠植物霸王抗旱性中的作用,为优良牧草及农作物抗旱性的遗传改良提供了优异的基因资源。 展开更多
关键词 霸王 角质层蜡质 β-酮脂酰辅酶A合成酶 抗旱性
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植物RNA PolⅣ/Ⅴ的结构功能与教学更新
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作者 王翀 管桂萍 +5 位作者 刘虎虎 杨晓娜 何岳东 段希宇 卢向阳 田云 《生命的化学》 2026年第1期181-188,共8页
真核生物RNA聚合酶Ⅳ(polymerasesⅣ,PolⅣ)和Ⅴ(PolⅤ)是植物特有的RNA指导DNA甲基化(RNA-directed DNA methylation,RdDM)通路的核心酶,介导重要的表观遗传调控过程。当前分子生物学教材对其介绍明显不足,制约了学生对该领域的深入理... 真核生物RNA聚合酶Ⅳ(polymerasesⅣ,PolⅣ)和Ⅴ(PolⅤ)是植物特有的RNA指导DNA甲基化(RNA-directed DNA methylation,RdDM)通路的核心酶,介导重要的表观遗传调控过程。当前分子生物学教材对其介绍明显不足,制约了学生对该领域的深入理解。本文基于RNA PolⅣ与RDR2协同组装、RNA PolⅤ转录停滞等最新结构生物学进展,系统阐述其亚基组成、结构特征与功能分工;进而依据建构主义及循证教学原则,提出以概念脚手架和科学叙事法更新教材内容,并引入可视化分析、角色模拟与案例研讨等教学方法,构建了面向知识-能力-素养协同培养的教学范式,为弥合学科前沿与课堂教学的差距提供系统解决方案,并为农林院校分子生物学课程改革与创新人才培养提供了可借鉴的范式。 展开更多
关键词 RNA聚合酶Ⅳ/Ⅴ RNA指导DNA甲基化 模块化教学 形成性评价 教学改革 分子生物学 农林院校
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基于DNA条形码的上海滨海湿地碱蓬属植物遗传多样性分析
5
作者 赵子滔 李敏 +5 位作者 吴庭健 张梅菁 沈茜妤 马绍祖 刘金林 何培民 《上海海洋大学学报》 北大核心 2026年第1期213-227,共15页
为探究上海市滨海湿地碱蓬属(Suaeda)植物种类及其遗传多样性,调查和研究了上海市浦东新区南汇东滩、奉贤区海滩、崇明区东滩等3个滨海湿地11个站位采集的碱蓬属植物种类资源及其遗传多样性。结果表明:经形态学鉴定和基于ITS和mat K序... 为探究上海市滨海湿地碱蓬属(Suaeda)植物种类及其遗传多样性,调查和研究了上海市浦东新区南汇东滩、奉贤区海滩、崇明区东滩等3个滨海湿地11个站位采集的碱蓬属植物种类资源及其遗传多样性。结果表明:经形态学鉴定和基于ITS和mat K序列条形码分析的分子鉴定,上海市滨海湿地碱蓬属植物为盐地碱蓬和碱蓬2个种。仅在崇明岛发现碱蓬,7株样品之间遗传距离为0,表明该群体与外界没有基因交流。崇明、浦东、奉贤等地盐地碱蓬在ITS和matK序列上均存在2~3个单倍型,遗传距离D<0.05,说明大多数为群体内部遗传变异。奉贤群体的遗传多样性最低(H_(d)=0.419±0.113,P_(i)=0.0009和H_(d)=0.133±0.112,P_(i)=0.0004),浦东群体遗传多样性最高(H_(d)=0.629±0.086,P_(i)=0.0015和H_(d)=0.475±0.141,P_(i)=0.0043)。浦东与崇明、奉贤的群体间存在中度分化(0.05<F_(ST)<0.15,P<0.05;N_(m)>1),崇明与奉贤的群体间存在高度分化(0.15<F_(ST)<0.25,P<0.05;N_(m)<1)。本研究为上海市滨海湿地碱蓬属植物保护和种群恢复奠定了坚实基础。 展开更多
关键词 碱蓬属 遗传多样性 分子鉴定 ITS MATK 上海
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太白贝母种子低温萌发过程中C3H基因家族鉴定及表达分析
6
作者 袁媛 董家帮 +5 位作者 徐艳姣 李炎 张晓玉 吴靓 陈永生 梁艳丽 《广西植物》 北大核心 2026年第1期110-122,共13页
为解析C3H基因在太白贝母种子萌发过程中的作用,基于低温萌发转录组数据,该研究通过生物信息学的方法对太白贝母C3H基因家族进行系统鉴定及表达分析,筛选出5个低温高表达候选基因并解析其对赤霉素(GA3)和脱落酸(ABA)的响应机制。结果表... 为解析C3H基因在太白贝母种子萌发过程中的作用,基于低温萌发转录组数据,该研究通过生物信息学的方法对太白贝母C3H基因家族进行系统鉴定及表达分析,筛选出5个低温高表达候选基因并解析其对赤霉素(GA3)和脱落酸(ABA)的响应机制。结果表明:(1)C3H家族65个成员中7个为稳定亲水蛋白、58个不稳定亲水蛋白,蛋白长度差异显著(197~1451 aa),仅FtC3H43和FtC3H50定位于叶绿体/内质网,其余位于细胞核。(2)保守基序分析发现,Motif1和Motif3普遍存在C3H蛋白中;系统进化分析结果显示,196条C3H蛋白被聚类为5个不同的分支,分别标记为I-Ⅴ,太白贝母C3H成员与拟南芥和水稻表现出较近的亲缘关系。(3)GA3处理下,FtC3H22和FtC3H35在A-C时期促进萌发,FtC3H40在A期、FtC3H46在E期响应调控;ABA处理时FtC3H46显著上调,而FtC3H22和FtC3H35下调,推测FtC3H46参与ABA介导的抗寒途径,FtC3H22和FtC3H35则正向调控萌发。该研究揭示了C3H蛋白家族在太白贝母种子萌发过程中的重要作用和复杂调控机制。 展开更多
关键词 太白贝母 C3H 种子萌发 生物信息分析 表达模式
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水母雪兔子GPAT家族全基因组鉴定及表达分析
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作者 胡国瑾 曾思恒 +3 位作者 杜明阳 多杰措 熊辉岩 段瑞君 《广西植物》 北大核心 2026年第1期123-136,共14页
甘油-3-磷酸酰基转移酶(GPAT)在植物生长发育和适应逆境胁迫过程中具有重要作用,为探究GPAT基因家族成员对高山植物水母雪兔子(Saussurea medusa)适应高山极端生境时发挥的作用,该研究采用HMM和BLASTp方法对SmGPAT基因家族成员进行全基... 甘油-3-磷酸酰基转移酶(GPAT)在植物生长发育和适应逆境胁迫过程中具有重要作用,为探究GPAT基因家族成员对高山植物水母雪兔子(Saussurea medusa)适应高山极端生境时发挥的作用,该研究采用HMM和BLASTp方法对SmGPAT基因家族成员进行全基因组鉴定,对家族成员的理化性质、染色体定位、基因结构、保守基序和顺式作用元件进行分析,并基于转录组数据和qRT-PCR技术分析SmGPAT家族成员的组织表达模式。结果表明:(1)共鉴定出15个SmGPAT家族成员,随机分布在10条染色体上,分别编码357~566个氨基酸,蛋白质相对分子质量为40.16~63.86 kD,等电点为5.93~10.02,亲脂系数为79.56~104.60,亚细胞定位预测位于线粒体或内质网(除SmGPAT7以外)。(2)系统进化分析发现,SmGPAT家族分为3个亚族(Group 1-Group 3),各亚族的基因结构和保守基序相似。SmGPAT家族蛋白质二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主,各亚族蛋白质三级结构模型相似。(3)顺式作用元件预测分析结果显示,SmGPAT家族含有大量逆境胁迫响应、激素响应和光响应相关的元件。(4)不同组织转录组数据分析结果表明,SmGPAT家族成员在叶和花中的表达量较茎和根高,并且qRT-PCR结果与转录组结果基本一致。综上认为,水母雪兔子中鉴定出的15个SmGPAT家族成员在不同组织间的表达模式存在差异,其中在花和叶中表达量较高,推测其在水母雪兔子叶和花发育过程中发挥重要作用,该研究为进一步开展SmGPAT基因在适应高山极端环境过程中的功能研究提供理论基础。 展开更多
关键词 水母雪兔子 甘油-3-磷酸酰基转移酶 基因家族 生物信息学分析 组织特异性表达
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基于高通量转录组测序的崖柏两型叶发育研究
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作者 金江群 蒋乐晓 +2 位作者 刘燕琴 刘春雷 罗舜 《中国野生植物资源》 2026年第1期36-44,共9页
目的:研究崖柏2种叶型发育的分子机制,挖掘导致差异形成的关键基因。方法:以针叶和鳞叶为材料进行高通量转录组测序,筛选与叶型发育相关的基因并进行RT-qPCR验证。结果:转录组测序后,将Unigene比对到NR、Swiss-Prot、Pfam、eggNOG、GO、... 目的:研究崖柏2种叶型发育的分子机制,挖掘导致差异形成的关键基因。方法:以针叶和鳞叶为材料进行高通量转录组测序,筛选与叶型发育相关的基因并进行RT-qPCR验证。结果:转录组测序后,将Unigene比对到NR、Swiss-Prot、Pfam、eggNOG、GO、KEGG等数据库进行注释,共获得31892个Unigene注释信息。差异表达基因共4744个,其中有3413个基因上调表达,1331个基因下调表达。差异基因主要参与植物病原体互作、植物激素信号转导、MAPK信号等代谢通路。对其中6个差异基因进行RT-qPCR分析,结果显示,6个基因的表达量变化趋势与转录组测序结果基本一致。结论:通过对崖柏2种叶型转录组测序,初步揭示了崖柏叶片发育调控的候选基因,为柏科植物两型叶发育研究提供科学依据。 展开更多
关键词 崖柏 转录组 两型叶 叶形态建成
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黄毛蕨麻的叶绿体基因组及系统发育启示
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作者 杭黎明 张志平 李琴琴 《现代园艺》 2026年第5期13-16,共4页
为探讨黄毛蕨麻(Argentina luteopilosa)与蕨麻属相关物种间的系统亲缘关系,研究了黄毛蕨麻(Argentina luteopilosa)的叶绿体全基因组特征及其系统发育位置。结果表明,其叶绿体基因组全长为156 289 bp,总GC含量为37.0%,编码129个基因,... 为探讨黄毛蕨麻(Argentina luteopilosa)与蕨麻属相关物种间的系统亲缘关系,研究了黄毛蕨麻(Argentina luteopilosa)的叶绿体全基因组特征及其系统发育位置。结果表明,其叶绿体基因组全长为156 289 bp,总GC含量为37.0%,编码129个基因,其中核糖体RNA基因8个、转运RNA基因37个、蛋白质编码基因84个。对黄毛蕨麻与已报道的其他18个蕨麻属类群进行叶绿体比较基因组分析,显示蕨麻属物种的叶绿体基因组结构、大小、GC含量、基因内容和基因排列都保守。系统发育分析表明,黄毛蕨麻与川滇蕨麻(A.fallens)、银叶蕨麻(A.leuconota var.leuconota)、脱毛银叶蕨麻(A.leuconota var.brachyphyllaria)、总梗蕨麻(A.peduncularis)具有最为密切的亲缘关系。研究结果为蕨麻属物种鉴定、叶绿体基因组进化和系统发育研究提供了理论基础。 展开更多
关键词 黄毛蕨麻 蕨麻属 叶绿体基因组 蔷薇科
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基于 DNA 条形码对兜兰属(Paphiopedilum)植物的亲缘关系分析
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作者 张梅 祖奎玲 +3 位作者 童琪 何选泽 龙婷 杨加文 《分子植物育种》 北大核心 2026年第1期179-190,共12页
兜兰属(Paphiopedilum)隶属于兰科(Orchidaceae)杓兰亚科(Subfam.Cypripedioideae),该属植物具有重要的观赏价值,也是中国重要的保护植物。本研究通过整合兜兰属植物的基因及分布数据,应用基因组学、形态学以及生物地理学的研究方法,探... 兜兰属(Paphiopedilum)隶属于兰科(Orchidaceae)杓兰亚科(Subfam.Cypripedioideae),该属植物具有重要的观赏价值,也是中国重要的保护植物。本研究通过整合兜兰属植物的基因及分布数据,应用基因组学、形态学以及生物地理学的研究方法,探讨兜兰属植物的亲缘关系。选取中国18个兜兰属的物种和1个外类群为研究对象,获取19个物种的核基因(ITS)和叶绿体基因(matK,rbcL,rpoC1,trnL)片段,建立兜兰属的系统发育树,同时结合形态地理学的方法,揭示兜兰属的亲缘关系及进化历程。结果表明,核基因与叶绿体单独建树,在树形上表现出显著差异,且分辨率较低。因此,基于核基因和叶绿体基因联合数据,进一步重建兜兰属的系统发育关系。根据联合数据构建的系统树,确认2个大分支,并得到花瓣与萼片的大小关系以及囊口边缘是否内弯这一形态学证据的强力支持。顶部大分支分为5个亚分支,底部为一单独的亚分支,共确定了6个亚分支。部分亚分支得到广义宏观形态性状的支持。该系统发育关系的重建对于全面理解兜兰属演化关系以及地理分布式样具有重要的启发。 展开更多
关键词 兰科 兜兰属 分子系统学 分类学 形态地理学
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Flg22重组蛋白的原核诱导及与flg22短肽的功能比较
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作者 王萌媛 程科 +1 位作者 杨澜 赵惠萍 《热带作物学报》 北大核心 2026年第2期364-371,共8页
Flg22是细菌鞭毛蛋白(flagellin)N端保守的22个氨基酸合成肽段,在调节植物免疫应答调节中发挥重要作用,也常被用于免疫细胞功能研究。由于人工合成的flg22短肽成本较高,其规模化应用受限。因此,本研究拟探究flg22蛋白原核诱导表达的适... Flg22是细菌鞭毛蛋白(flagellin)N端保守的22个氨基酸合成肽段,在调节植物免疫应答调节中发挥重要作用,也常被用于免疫细胞功能研究。由于人工合成的flg22短肽成本较高,其规模化应用受限。因此,本研究拟探究flg22蛋白原核诱导表达的适宜条件并验证其功能,评估其替代商用flg22短肽的可行性。本研究通过合成pET32a-flg22原核表达载体,比较28℃与37℃诱导温度下的蛋白表达效率,并分别检测经flg22短肽及不同浓度flg22蛋白处理的木薯中活性氧(reactive oxygen species,ROS)的爆发动态,验证其功能。结果显示:28℃为flg22蛋白诱导的最佳温度;ROS测定结果表明,在一定浓度范围内,ROS峰值强度随flg22蛋白浓度增加呈递增趋势。进一步将60、600μg/mL的flg22重组蛋白及2.27μg/mL flg22短肽分别外源喷施于木薯叶片,3 d后,接种木薯萎焉致病变种Xam(Xanthomonas axonopodis pv.Manihotis,Xam)病原菌,与无菌水处理相比,经flg22蛋白或flg22短肽处理的木薯植株均表现出对Xam的显著抑菌效果,且60、600μg/mL flg22蛋白的抑菌效果均显著优于flg22短肽。本研究初步筛选出flg22重组蛋白的原核表达条件,并验证其在诱导植物防御响应的功能与短肽具有一致性,为以flg22重组蛋白替代商用短肽提供初步的理论依据。 展开更多
关键词 原核诱导表达 flg22 短肽 病原菌 ROS
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4种大苞苣苔属植物叶绿体基因组特征及适应性进化分析
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作者 杨圣洁 王力生 +3 位作者 邓永彪 李文海 李萌 赵博 《西北农业学报》 北大核心 2026年第2期327-338,共12页
明确大苞苣苔属植物叶绿体基因组结构特征,为其物种鉴定以及不同生境的适应性进化研究提供科学依据。对叶绿体基因组进行Illumina HiSeq高通量测序,组装后对其叶绿体基因组特征进行分析,构建系统发育树,用EasyCodeML v1.21软件进行适应... 明确大苞苣苔属植物叶绿体基因组结构特征,为其物种鉴定以及不同生境的适应性进化研究提供科学依据。对叶绿体基因组进行Illumina HiSeq高通量测序,组装后对其叶绿体基因组特征进行分析,构建系统发育树,用EasyCodeML v1.21软件进行适应性进化分析。结果表明:4个大苞苣苔属物种的叶绿体基因组均具有典型的四分体结构,长度为154047~154056 bp,共编码132~134个基因;密码子碱基均偏向使用A和U 2种碱基结尾;检测到173个简单重复序列;系统发育分析支持红花大苞苣苔是白花大苞苣苔的一个变种;适应性进化分析检测到12个具有阳性选择位点的叶绿体蛋白编码基因,大部分与光合作用、脂肪酸合成和蛋白质合成相关。4个大苞苣苔属物种的叶绿体基因组特征类似,12个叶绿体蛋白编码基因的适应性进化可能有助于该属物种对丹霞和喀斯特极端生境的适应。 展开更多
关键词 大苞苣苔属 叶绿体基因组 结构特征 系统发育分析 适应性进化分析
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青绿苔草CbSH4基因克隆及基因编辑靶点筛选
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作者 黄扬洁 滕珂 +5 位作者 范希峰 岳跃森 张辉 温海峰 尹淑霞 刘凌云 《草地学报》 北大核心 2026年第2期437-446,共10页
青绿苔草(Carex breviculmis)是一种节水抗旱的重要乡土物种,具有绿期长、耐阴、结实率高等优点。但在实际采收过程中,种子极易落粒的问题限制了种子机械化收获和大规模生产应用。为探究SH4基因在青绿苔草落粒过程中的功能,进一步利用... 青绿苔草(Carex breviculmis)是一种节水抗旱的重要乡土物种,具有绿期长、耐阴、结实率高等优点。但在实际采收过程中,种子极易落粒的问题限制了种子机械化收获和大规模生产应用。为探究SH4基因在青绿苔草落粒过程中的功能,进一步利用基因编辑技术创制低落粒新种质,本研究克隆青绿苔草CbSH4基因并进行基因编辑靶点筛选。结果表明,CbSH4编码319个氨基酸残基,其编码产物是亲水性蛋白,与康藏嵩草(Carex littledalei)亲缘关系最近。CbSH4含有1个高度保守的Myb4 DNA结合域,属于典型的MYB转录因子。烟草瞬时表达结果显示,CbSH4定位于细胞核和细胞质。实时荧光定量结果表明,CbSH4在穗中的相对表达量显著高于根和叶,在不同发育时期的离区中均有表达。同时,为了在青绿苔草中实现高效的基因编辑,本研究设计了3个特异性靶点,利用sgRNA体外转录和筛选,获得切割效率58.3%的sgRNA1,可用于后续青绿苔草基因编辑。本研究成功克隆了CbSH4并完成初步功能分析,筛选出了高效基因编辑靶点,为创制低落粒的青绿苔草新种质提供了基础。 展开更多
关键词 青绿苔草 SH4基因 亚细胞定位 表达分析 靶点筛选 落粒性
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茄科作物高效双碱基编辑新工具的开发与应用
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作者 田鹏 李亚栋 +7 位作者 张敬敬 田哲娟 康忱 高秀瑞 李冰 刘伟 武彦荣 吴志明 《华北农学报》 北大核心 2026年第1期39-48,共10页
旨在开发一款高效适配茄科作物的双碱基编辑工具,以突破现有碱基编辑系统在茄科作物中适配性差、编辑效率低等问题。研究将核酸酶功能部分丧失的Cas9缺口酶(nCas9)与高效腺嘌呤脱氨酶ABE8e、优化型胞嘧啶脱氨酶sdd7-mini及尿嘧啶糖基化... 旨在开发一款高效适配茄科作物的双碱基编辑工具,以突破现有碱基编辑系统在茄科作物中适配性差、编辑效率低等问题。研究将核酸酶功能部分丧失的Cas9缺口酶(nCas9)与高效腺嘌呤脱氨酶ABE8e、优化型胞嘧啶脱氨酶sdd7-mini及尿嘧啶糖基化抑制剂UGI等元件进行融合,依据茄科作物的启动子偏好性和密码子使用频率进行系统性优化,最终构建双碱基编辑器TPDBE-S。在番茄和茄子原生质体瞬时转化试验中,该编辑器表现出极高的编辑效率。在本氏烟草稳定转化体系中,通过靶向PDS基因验证,5个阳性转基因家系中有4个出现明显白化表型,证实其稳定编辑能力。该编辑器的编辑窗口与ABE8e和sdd7-mini的特性高度一致,且对茄科作物密码子偏好性和启动子活性的优化显著提升了编辑效率与适配性。TPDBE-S的构建采用模块化设计,基于tRNA自切割机制的多靶点表达盒可通过一步基因合成实现快速组装,成本低且操作简便。该工具填补了茄科作物专用双碱基编辑空白。 展开更多
关键词 茄子 基因编辑 双碱基编辑 番茄 编辑效率
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普通烟草短叶柄突变基因精细定位与候选基因分析
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作者 沈忱 汪季涛 +8 位作者 王新峰 陈梦 谢贺 张福建 徐勤青 董洪旭 李硕伦 吴新儒 王浩军 《中国烟草科学》 北大核心 2026年第1期14-22,共9页
为阐明普通烟草叶柄形成的分子机制,通过构建近等基因系对1个控制烟草短叶柄的显性突变基因的遗传效应进行了精确评估,通过扩大定位群体和全基因组重测序开发新的分子标记,应用其对该基因进行了精细定位,并对候选基因进行了生物信息学... 为阐明普通烟草叶柄形成的分子机制,通过构建近等基因系对1个控制烟草短叶柄的显性突变基因的遗传效应进行了精确评估,通过扩大定位群体和全基因组重测序开发新的分子标记,应用其对该基因进行了精细定位,并对候选基因进行了生物信息学预测和分析。结果表明:该基因在突变体中主要控制短叶柄的形成,对叶部其他性状无明显影响。该基因位于NtaSR1第7染色体(Chr 7)上一个210 kb的区间内,其中一个KNOXⅠ家族基因Nta07g20040.1被确定为候选基因。在突变体中,Nta07g20040.1在编码区未发生序列改变,但在其上、下游区域共发现4个符合甲基磺酸乙酯(EMS)诱变模式的SNP突变,且均不存在于野生型无叶柄烟草和祖先种林烟草中,推测上述SNP突变可能引起了Nta07g20040.1的功能获得型显性突变,进而导致烟草叶耳退化和叶柄形成。Nta07g20040.1在普通烟草中有1个高度同源基因Nta08g17660.1,氨基酸序列比对结果表明,二者分别来自祖先种林烟草和绒毛状烟草。 展开更多
关键词 普通烟草 叶柄 显性突变 甲基磺酸乙酯 KNOXⅠ基因
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马铃薯YTH基因家族鉴定及其干旱胁迫响应表达模式分析
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作者 肖俊飞 乔岩 +4 位作者 任盼荣 秦雪雪 杨芳 祁伟亮 王芳 《干旱地区农业研究》 北大核心 2026年第1期41-52,共12页
YTH蛋白是一类含有YTH结构域的蛋白质,能够特异性结合RNA,参与N^(6)-甲基腺嘌呤(m^(6)A)修饰,在生物逆境响应中发挥关键作用。本研究前期通过转录组测序发现5个响应干旱的YTH基因。为解析其干旱响应机制,以马铃薯品种‘费乌瑞它’为材料... YTH蛋白是一类含有YTH结构域的蛋白质,能够特异性结合RNA,参与N^(6)-甲基腺嘌呤(m^(6)A)修饰,在生物逆境响应中发挥关键作用。本研究前期通过转录组测序发现5个响应干旱的YTH基因。为解析其干旱响应机制,以马铃薯品种‘费乌瑞它’为材料,利用HMMER模型鉴定出21个含YTH结构域的基因,结合生物信息学分析(染色体定位、基因结构、进化关系、顺式元件预测)与干旱表达验证,解析其特征及模式,并通过STRING构建PPI网络揭示功能关联。结果显示:这些YTH基因分布于5条染色体上,其中响应干旱胁迫的5个基因分别为StYTH1.1、StYTH1.3、StYTH1.4、StYTH1.5及StYTH2.1。此外,StYTH3.1和StYTH4.1存在结构和保守基序丢失现象。系统进化树及基因结构分析发现,马铃薯YTH家族划分为3个亚族;共线性分析结果表明基因复制事件推动了马铃薯YTH家族的进化。系统发育树显示,马铃薯YTH基因与番茄的亲缘关系更为接近。此外,在StYTH 1.1/1.2/1.3/1.4/1.5/3.1/6.1/6.2/8.1上均存在干旱诱导性的MYB结合位点以及多个与植物激素相关的功能元件。STRING数据库预测出StYTH蛋白的20个伙伴蛋白,与5个StYTH蛋白共同构成复杂的蛋白互作网络,其主要参与调控mRNA的剪切修饰、生物胁迫与非生物胁迫,调节脱落酸、水杨酸等信号通路。 展开更多
关键词 马铃薯 干旱胁迫 YTH基因家族 全基因组分析 表达模式 m^(6)A修饰
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三浅裂野牵牛ItfGAD基因家族全基因组鉴定与表达分析
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作者 李倩 田煜文 +9 位作者 黄旭升 罗状 郑亚婷 赵彩良 任豫超 吴宇浩 贺立恒 贾峥嵘 张红梅 贾小云 《植物科学学报》 北大核心 2026年第1期85-96,共12页
三浅裂野牵牛(Ipomoea trifida(Kunth)G.Don)为二倍体,是甘薯(Ipomoea batatas(L.)Lam.)的野生近缘种,其基因组结构简单,便于基因定位和功能研究,可为解析甘薯复杂的六倍体基因信息及功能提供参考。谷氨酸脱羧酶(Glutamate decarboxylas... 三浅裂野牵牛(Ipomoea trifida(Kunth)G.Don)为二倍体,是甘薯(Ipomoea batatas(L.)Lam.)的野生近缘种,其基因组结构简单,便于基因定位和功能研究,可为解析甘薯复杂的六倍体基因信息及功能提供参考。谷氨酸脱羧酶(Glutamate decarboxylase,GAD)作为γ-氨基丁酸(γ-aminobutyric acid,GABA)支路合成途径的关键酶基因,对GABA的合成有着重要的作用。本研究利用生物信息学方法在三浅裂野牵牛全基因组中共鉴定获得15个ItfGADs基因家族成员,根据其在染色体上的顺序分别命名为ItfGAD1~ItfGAD15。结果显示,ItfGADs蛋白大多数为酸性蛋白,各成员的氨基酸序列长度为476~537 aa,等电点为5.69~8.7。ItfGADs蛋白的二级结构分析结果表明,它们均以α-螺旋和无规则卷曲为主。亚细胞定位预测结果发现,11个ItfGAD蛋白定位于细胞质中。ItfGADs蛋白均含有一个相对保守的PLP氨基酸结合位点。系统进化分析结果表明,15个ItfGADs家族成员可分为4个进化分支,不同ItfGADs成员之间保守基序、外显子和内含子数目及分布差异较大。转录组表达谱数据和qRT-PCR实验结果均显示,ItfGADs基因家族成员在三浅裂野牵牛不同组织和不同胁迫处理下具有表达特异性。其中,ItfGAD4在茎中的表达量最高;ItfGAD5和ItfGAD14在根中的表达量相对较高;ItfGAD6、ItfGAD9和ItfGAD12在叶中的表达量最高。在盐、干旱胁迫下,各基因在根与叶组织中响应时间、表达峰值、变化趋势各不相同,推测它们可能参与三浅裂野牵牛的胁迫响应并在特定组织发挥重要作用。 展开更多
关键词 三浅裂野牵牛 GAD基因家族 非生物胁迫 表达分析
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Universal single-copy ortholog benchmark gene set for bryophytes
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作者 Xuping Zhou Tao Peng +2 位作者 Jin Yu Shanshan Dong Yang Liu 《Journal of Genetics and Genomics》 2026年第2期357-359,共3页
Modern land plants comprise two main lineages:tracheophytes and bryophytes.The latter include mosses,liverworts,and hornworts.Bryophytes are second only to angiosperms in diversity,with approximately 22,000 species(Sh... Modern land plants comprise two main lineages:tracheophytes and bryophytes.The latter include mosses,liverworts,and hornworts.Bryophytes are second only to angiosperms in diversity,with approximately 22,000 species(Shaw,2008).They are characterized by a life cycle dominated by haploid gametophytes,with unbranched diploid sporophytes attached to the gametophytes,producing spores for sexual reproduction(Shaw and Renzaglia,2004).Bryophytes have demonstrated great adaptability to modern ecosystems,thriving in environments ranging from deserts to wetlands and from tropical to polar regions(Degola et al.,2022).This adaptability suggests that bryophytes may have evolved an effective genetic toolkit for stress tolerance.Advances in genome sequencing and assembly technologies offer great opportunities to decipher the genetic toolkit and study the evolution of resistance and environmental adaptation in bryophytes. 展开更多
关键词 haploid gametophyteswith environmental adaptation life cycle unbranched diploid sporophytes tracheophytes modern land plants genome sequencing BRYOPHYTES
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梭梭WOX转录因子家族鉴定及HaWOX29和HaWOX54在根生长中的功能研究
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作者 孙朗 任燕萍 +5 位作者 娜菲莎·木则帕尔 谌能双 马丽 程聪 李俐 张桦 《草业学报》 北大核心 2026年第1期192-205,共14页
荒漠植物梭梭具有发达的根系,其侧根可寄生中药肉苁蓉,使得梭梭在荒漠治理和荒漠区社会发展中具有重要的生态和经济价值。WOX转录因子参与植物根的生长发育,本研究从梭梭全基因组数据中鉴定出64个WOX转录因子家族成员,根据前期转录组分... 荒漠植物梭梭具有发达的根系,其侧根可寄生中药肉苁蓉,使得梭梭在荒漠治理和荒漠区社会发展中具有重要的生态和经济价值。WOX转录因子参与植物根的生长发育,本研究从梭梭全基因组数据中鉴定出64个WOX转录因子家族成员,根据前期转录组分析结果,筛选克隆了在根中表达量高的HaWOX29和HaWOX54;qPCR分析表明,HaWOX29和HaWOX54在根中的表达量明显高于其他组织,干旱、盐及高温胁迫下下调表达,低温和吲哚乙酸(IAA)、脱落酸(ABA)、水杨酸(SA)处理下上调表达;利用农杆菌介导法侵染梭梭种胚,获得过表达HaWOX29和HaWOX54的植株,表型和根系扫描分析发现过表达HaWOX29的梭梭平均主根根长是转空载体对照组的2.49倍;过表达HaWOX54植株主根根长是空载体的2.08倍,平均分支数是4.34倍。因此初步推测HaWOX29基因可能参与梭梭主根的伸长,HaWOX54基因可能参与梭梭侧根的发育和主根的伸长。本研究筛选鉴定参与梭梭根生长发育的WOX转录因子,为研究梭梭根发育的分子机制和筛选优异的梭梭种质资源提供了理论和技术指导。 展开更多
关键词 梭梭 WOX转录因子 根发育 分子机制
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The role of m^(6)A in plant development,stress response,and agricultural practices
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作者 Jin Qi Shaoxia Li +3 位作者 Jun Su Yushi Lu Wenjin Yu Changxia Li 《Horticultural Plant Journal》 2026年第1期19-35,共17页
N6-methyladenosine(m^(6)A)modification,the most abundant internal modification in messenger RNA(mRNA)and long non-coding RNA(lncRNA),has emerged as a critical epitranscriptomic regulatory mechanism in eukaryotes.While... N6-methyladenosine(m^(6)A)modification,the most abundant internal modification in messenger RNA(mRNA)and long non-coding RNA(lncRNA),has emerged as a critical epitranscriptomic regulatory mechanism in eukaryotes.While the importance of m^(6)A modification in various biological processes has been recognized,a comprehensive understanding of its diverse roles in plant biology and agricultural applications remains fragmented.This review analyzes recent advances inm^(6)A modification's biological functions in plants.m^(6)A modification plays crucial roles in multiple aspects of plant life,including seed germination,organ development,and reproductive structure formation.Furthermore,m^(6)A has been found to significantly influence plant responses to environmental stresses,including salt,drought,temperature,and heavy metal exposure.We also uncover m^(6)A involvement in important agricultural traits.This review provides insights into the mechanistic understanding of m^(6)A modification in plants and highlights its applications in agricultural improvement,offering a foundation for future research in crop enhancement and stress resistance. 展开更多
关键词 N6-methyladenosine Epitranscriptomics Plant development STRESS Agricultural production
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