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三峡大坝建设对其上、下游沉积物细菌多样性及多功能性的影响
1
作者 郑开凯 彭春兰 +2 位作者 高千红 严海涛 闫金波 《湖泊科学》 北大核心 2026年第1期184-192,共9页
三峡大坝建设显著改变了长江水沙通量,但其对沉积物中微生物介导的多功能性(碳、氮、磷循环)的影响尚未明确。本研究基于16S扩增子测序、共现网络分析和结构方程模型,探究三峡大坝对上下游沉积物细菌群落组成、多样性及多功能性的影响... 三峡大坝建设显著改变了长江水沙通量,但其对沉积物中微生物介导的多功能性(碳、氮、磷循环)的影响尚未明确。本研究基于16S扩增子测序、共现网络分析和结构方程模型,探究三峡大坝对上下游沉积物细菌群落组成、多样性及多功能性的影响。结果表明,上游沉积物细菌群落以假单胞菌门(约25.5%)为主,下游以脱硫杆菌门(约24.8%)为主。三峡大坝显著降低了下游沉积物的细菌α多样性,且α多样性与水分(减少约35.39%)、阳离子交换量(减少约49.64%)和溶解性有机碳(减少约49.88%)的减少显著相关。结构方程模型显示,沉积物细菌α多样性通过削弱细菌网络相互作用显著降低沉积物多功能性。本研究揭示了三峡大坝对下游沉积物生态功能的影响,建议通过长期监测沉积物中溶解性有机碳和阳离子交换量,以优化水文管理,减缓生物多样性损失。 展开更多
关键词 三峡大坝 沉积物 物质循环 细菌群落组成 生态多功能性
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天津滨海地区不同碘化物浓度地下水微生物群落结构特征
2
作者 谢定昇 李梦娣 +1 位作者 张翠霞 李海明 《水文地质工程地质》 北大核心 2026年第1期263-276,共14页
微生物对碘化物(以I−计)在地下水中的迁移富集有重要影响,进而影响水资源安全。目前关于微生物在I−迁移富集中作用的研究多集中于实验室条件下对特定微生物的培养,对于自然环境下微生物群落与I−的相互作用的研究较为有限。为了解不同I−... 微生物对碘化物(以I−计)在地下水中的迁移富集有重要影响,进而影响水资源安全。目前关于微生物在I−迁移富集中作用的研究多集中于实验室条件下对特定微生物的培养,对于自然环境下微生物群落与I−的相互作用的研究较为有限。为了解不同I−浓度的地下水中微生物群落结构特征,针对天津滨海地区不同I−浓度地下水中的微生物群落,采用Mantel test检验、α多样性、LEfSe分析、共现网络及PICRUSt2分析等对相关微生物数据进行分析。结果表明:(1)地下水样品中共检测到相对丰度>0.01%的微生物23门、42纲、122目、215科、392属,其中变形菌门、拟杆菌门、弯曲杆菌门、放线菌门为微生物群落优势门类;(2)地下水微生物群落与pH值、Na^(+)、Ca^(2+)、Mn^(2+)、总溶解性固体浓度等水化学环境因子有正相关关系;(3)微生物群落的多样性、生态系统复杂性、丰富度随I−浓度梯度上升而下降;随I−浓度梯度上升,物种覆盖范围有所扩大,群落结构逐渐由聚集到离散,各物种相对独立性提高。研究成果可为天津及类似滨海地区地下水微生物-碘相互作用机制研究提供一定参考。 展开更多
关键词 高碘 地下水 水化学 微生物群落 多样性 差异性
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黄河口潮间带沉积物夏秋季微生物群落特征及其对环境因素的响应 被引量：1
3
作者 姜珊 赵张琪 +4 位作者 蒋之琛 李学刚 张均龙 张德超 沙忠利 《海洋科学》 北大核心 2025年第5期13-23,共11页
为探究黄河口潮间带沉积物夏秋季微生物群落结构的组成及影响因素,采集8个站位的96个表层沉积物样品,采用高通量测序技术,分析夏秋季沉积物微生物群落结构的组成,并探讨不同环境因子对微生物群落结构的影响。潮间带沉积物中最优势菌门... 为探究黄河口潮间带沉积物夏秋季微生物群落结构的组成及影响因素,采集8个站位的96个表层沉积物样品,采用高通量测序技术,分析夏秋季沉积物微生物群落结构的组成,并探讨不同环境因子对微生物群落结构的影响。潮间带沉积物中最优势菌门为变形菌门(Proteobacteria),较优势菌门为拟杆菌门(Bacteroidetes)和脱硫菌门(Desulfobacterota)。秋季和夏季的α多样性存在显著差异,且秋季物种丰富度和均匀度均高于夏季。采用主成分分析(PCA)结合多元方差置换分析(PERMANOVA)研究β多样性,发现夏秋季样本的微生物群落结构存在显著分离现象。通过LEfSe分析发现,夏秋两季存在显著性的属水平类群共计37个,其中夏季9个,秋季28个。夏季和秋季的微生物丰度均与环境因子存在较强的相关性,且不同季节的微生物受不同的环境因子影响,表现出不同的丰度变化。经过FAPROTAX功能注释,夏秋季丰度均较高的是和氮、硫代谢相关的功能。通过代谢差异进行分析发现.秋季样本中显著上调的主要为自养代谢功能,而夏季样本中显著上调的则为与分解代谢相关的功能。 展开更多
关键词 黄河口 潮间带沉积物 微生物群落结构
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纳木错秋季水体可培养细菌优势种生态位及种间联结分析
4
作者 郑艳艳 贺凯 +1 位作者 德吉 郭小芳 《水生态学杂志》 北大核心 2026年第2期183-194,共12页
分析高原湖泊微生物分布特征及其适应机制,为认识纳木错水体微生物多样性及物种间关系提供基础数据。2021年10月(秋季)在纳木错设置20个样点进行样品的采集,采用涂布平板法分离湖水中的可培养细菌,菌株的鉴定采用16S rDNA基因序列分析... 分析高原湖泊微生物分布特征及其适应机制,为认识纳木错水体微生物多样性及物种间关系提供基础数据。2021年10月(秋季)在纳木错设置20个样点进行样品的采集,采用涂布平板法分离湖水中的可培养细菌,菌株的鉴定采用16S rDNA基因序列分析结合经典分类方法,运用生态位宽度、生态位重叠值等方法对浮游细菌优势种间的相互关系进行分析,通过总体联结性、χ^(2)检验以及共同出现百分比(PC)等方法分析优势种的种间联结性,运用相关性分析和冗余分析对优势种和理化因子间的关系进行分析。结果表明:纳木错秋季水体中共分离到637株可培养细菌共46种,隶属于4门7纲14目20科25属,其中优势种(Y>0.02)共11种。浮游细菌优势种生态位宽度变化范围为1.815~9.715,其中生态位宽度最大的是马氏副球菌(Paracoccus marcusii),表现出较强的生态适应性;生态位宽度最小的是嗜中温副莱茵海默氏菌(Pararheinheimera mesophila),生态适应性较弱。优势种生态位重叠值变化范围为0.035~0.890,生态位重叠值大于0.6的种对数占总对数的9.09%,表明各优势种的资源利用和生存能力较弱,空间异质性较大,总体上生态位重叠程度不高,对资源的共同利用率较低。纳木错秋季水体可培养细菌优势种间总体上呈负联结,但未达显著水平(χ^(2)<3.841),种间联结较为松散,优势菌种间未达到相对的动态平衡。冗余分析结果显示,优势种的菌群分布主要受pH、电导率和TN的影响。 展开更多
关键词 优势种 细菌 生态位 种间联结 纳木错
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岩溶土壤中微生物研究进展与展望
5
作者 李强 张浩 邹肖肖 《广西植物》 北大核心 2025年第3期426-437,共12页
土壤微生物在岩溶生态系统中扮演着重要角色,其通过参与营养物质循环对生态系统的功能提升产生深远影响。该文重点梳理了植被恢复、地质背景、土壤性质以及土壤动物对土壤微生物群落的影响,阐明了岩溶植被-土壤-微生物之间的关系。此外... 土壤微生物在岩溶生态系统中扮演着重要角色,其通过参与营养物质循环对生态系统的功能提升产生深远影响。该文重点梳理了植被恢复、地质背景、土壤性质以及土壤动物对土壤微生物群落的影响,阐明了岩溶植被-土壤-微生物之间的关系。此外,该文还指出了当前研究中亟待解决的关键问题,即岩溶土壤团聚体层面微生物分布规律、凋落物对土壤微生物功能的影响、土壤动物与微生物之间的耦合关系、土壤微生物在碳氮循环中的作用、土壤微生物资源的开发与利用。通过以上问题的研究,将为深入理解岩溶微生物地球化学循环过程和制定有效的生态恢复策略以及土壤管理措施提供科学依据。 展开更多
关键词 土壤微生物 植被恢复 岩溶 理化性质 土壤动物
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黄河三角洲高盐地下水中微生物群落结构与环境驱动机制
6
作者 支传顺 胡晓农 +6 位作者 白晶 牧辉 武显仓 杨帆 常文博 卫如春 李玉喜 《地学前缘》 北大核心 2026年第1期95-106,共12页
黄河三角洲浅层地下水广泛呈高盐特征,受历史海侵、蒸发浓缩等因素影响,水化学演化复杂,地下水微生物群落演替尚缺乏系统认识。本文采集25组浅层地下水、2组黄河水及1组海水样品,通过水化学分析、稳定同位素示踪与宏基因组测序等方法,... 黄河三角洲浅层地下水广泛呈高盐特征,受历史海侵、蒸发浓缩等因素影响,水化学演化复杂,地下水微生物群落演替尚缺乏系统认识。本文采集25组浅层地下水、2组黄河水及1组海水样品,通过水化学分析、稳定同位素示踪与宏基因组测序等方法,识别地下水盐分来源,解析不同盐度条件下微生物群落结构、演替规律及其主控因子。结果表明,地下水TDS变幅为1.0~35.0 g/L,以Cl^(-)Na型水为主,δD、δ^(18)O及Br/Cl比值特征共同指示受海水混合与蒸发浓缩双重作用影响。地下水中微生物群落以细菌为主(相对丰度67.7%~98.6%),古菌次之(1.0%~32.0%),真核生物与病毒占比较低。细菌优势类群包括Pseudomonadota与Candidatus Omnitrophota,前者在高盐地下水中富集,后者偏好分布于低盐环境。古菌中Candidatus Woesearchaeota广泛分布,Candidatus Lokiarchaeota、Candidatus Thermoprofundales等类群在高盐样品中占据生态优势。PCoA与LEfSe分析表明不同盐度条件下微生物群落显著分化,细菌随盐度变化明显,而古菌具有更强的耐盐适应性。RDA分析表明,TDS、SO^(2-)_(4)、Fe^(2+)和NH_(4)^(+)是高盐样品的主控因子,NO_(3)^(-)、pH和ORP对低盐群落影响较大。本研究揭示了高盐地下水中微生物群落的演替特征及其环境驱动机制,为理解滨海地下水系统中盐度胁迫下的微生物响应与生态功能提供了理论支撑。 展开更多
关键词 高盐地下水 黄河三角洲 微生物群落结构 宏基因组测序 同位素示踪
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根际微生物降解石油污染土壤中多环芳烃的机制及组学技术应用研究进展
7
作者 徐自强 李云昊 +4 位作者 赵子馨 赵敏 朱洁滢 白雪莹 黄萱 《生物加工过程》 2025年第5期512-520,596,共10页
随着石油化工行业的快速发展,石油污染所导致的生态失衡和环境恶化问题愈加严峻,传统的物理和化学修复方法由于成本高、效果有限,难以应对日益严重的污染挑战。生物修复法,特别是根际修复技术,因其成本低、操作简便和适应性广泛,成为解... 随着石油化工行业的快速发展,石油污染所导致的生态失衡和环境恶化问题愈加严峻,传统的物理和化学修复方法由于成本高、效果有限,难以应对日益严重的污染挑战。生物修复法,特别是根际修复技术,因其成本低、操作简便和适应性广泛,成为解决石油污染问题的有力工具。根际修复通过植物与根际微生物的相互作用,可以有效去除土壤中的原油污染物,尤其对多环芳烃(PAHs)的降解具有优势。鉴于根际微生物群落在PAHs降解过程中的重要性,本文综述了细菌、真菌降解PAHs的机制以及基于宏基因组学、宏转录组学、宏蛋白质组学和代谢组学等组学技术的研究进展,并对上述组学方法的优缺点进行了总结归纳,旨在为根际修复技术的进一步研究提供理论依据和实验方向。 展开更多
关键词 根际微生物 组学 石油污染 土壤 多环芳烃(PAHs)
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锁阳和白刺内生细菌的分离培养及合成菌群的构建
8
作者 李娜 彭瑜 +7 位作者 石勇 吴志华 张玉颖 涂思送 操时婷 向景 陈世龙 邢睿 《中国野生植物资源》 2025年第9期68-76,共9页
目的:分离锁阳和白刺内生细菌并构建合成菌群,为筛选促进锁阳种子萌发的功能菌群、提升锁阳人工种植效率提供基础。方法:采用高通量分离培养法,分离并鉴定锁阳茎和白刺根内生细菌;基于基因组代谢模型计算菌株间竞争性、互补性指数及代... 目的:分离锁阳和白刺内生细菌并构建合成菌群,为筛选促进锁阳种子萌发的功能菌群、提升锁阳人工种植效率提供基础。方法:采用高通量分离培养法,分离并鉴定锁阳茎和白刺根内生细菌;基于基因组代谢模型计算菌株间竞争性、互补性指数及代谢物转移潜力,筛选合成菌群。结果:获得352个ASV,隶属4门75属;锁阳和白刺共分离出45株25种细菌(白刺根36株21种,锁阳茎9株4种);构建代谢模型筛选出10组低竞争(平均竞争指数<0.7)、高互补(平均互补指数>0.1)且代谢物转移潜力强的合成菌群,其中1组(含Mycolicibacterium stellerae等4株菌)综合性能最优。结论:高通量分离结合代谢模型分析可高效构建功能协同的合成菌群,为锁阳种子萌发菌群开发奠定理论和技术基础。 展开更多
关键词 锁阳 白刺 内生细菌 高通量分离培养 合成菌群
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秸秆还田年限对设施土壤磷素分布及淋溶的影响 被引量：2
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作者 孙玉禄 李杨 +5 位作者 刘晓辉 高晓梅 敖静 宋立群 马妍 李鑫 《微生物学杂志》 北大核心 2025年第1期68-75,共8页
为研究秸秆还田年限对土壤磷素分布及淋溶的影响,采用随机区组设计的方法,检测在使用不同年限秸秆还田的大棚中,不同深度的土壤全磷、有效磷、微生物量磷和土壤中性磷酸酶活性数据,分析秸秆还田年限对土壤磷素分布及淋溶的影响。结果表... 为研究秸秆还田年限对土壤磷素分布及淋溶的影响,采用随机区组设计的方法,检测在使用不同年限秸秆还田的大棚中,不同深度的土壤全磷、有效磷、微生物量磷和土壤中性磷酸酶活性数据,分析秸秆还田年限对土壤磷素分布及淋溶的影响。结果表明,秸秆还田可以显著增加0~40 cm土壤全磷、有效磷和微生物量磷的含量,显著提高耕作层土壤中性磷酸酶活性。0~20 cm土壤,J7的全磷、有效磷、微生物量磷、中性磷酸酶活性分别比CK提高41%、125%、85%、42%;20~40 cm土壤,J7分别比CK提高30%、157%、116%、56%,并能够降低土壤中全磷和有效磷向下的迁移,效果为J7>J5>J3>J1>CK。秸秆还田还能显著增加土壤的磷活化系数,促进植物对土壤磷素的有效利用。为有效解决磷淋溶造成的农业面源污染问题提供了更多的解决途径。 展开更多
关键词 秸秆还田年限 设施农业 磷素分布 淋溶 微生物量磷
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蓝藻-细菌互作及其对碳、氮循环的影响研究进展 被引量：2
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作者 张玉晴 刘佳音 +6 位作者 蔡元锋 张民 史小丽 杜瑛珣 苏雅玲 施丽梅 吴庆龙 《湖泊科学》 北大核心 2025年第2期339-353,共15页
藻类与细菌之间存在多种互作关系,二者间的相互作用会影响水体初级生产力、藻类群落组成、藻类之间的竞争和演替以及藻类水华的发展等。藻菌间的多种紧密互作和代谢耦联对水体中碳、氮、磷、硫等多种生源要素的循环产生影响。在淡水生... 藻类与细菌之间存在多种互作关系,二者间的相互作用会影响水体初级生产力、藻类群落组成、藻类之间的竞争和演替以及藻类水华的发展等。藻菌间的多种紧密互作和代谢耦联对水体中碳、氮、磷、硫等多种生源要素的循环产生影响。在淡水生态系统中,蓝藻水华仍然是威胁水环境健康的重要因素,部分水体中形成了周而复始发生蓝藻水华的稳定状态。蓝藻与其附生细菌间的互作和代谢关联是蓝藻水华维持的关键,在水体碳氮循环中发挥了重要作用。本文综述了蓝藻与细菌间的互作对蓝藻生长、产毒、群体维持和多样性的影响以及影响藻菌互作的因素,综述了蓝藻藻际环境中碳氮相关功能微生物类群以及藻菌互作对水生态系统中碳氮循环的影响,分析了蓝藻群体颗粒、附着作用和环境因素(如温度、营养盐、新型污染物和铁硫磷元素等)对藻菌之间碳氮代谢关联和转化的影响及其对环境的反馈机制,并探讨了藻菌互作中碳氮转化过程与转化通量的主要研究方法,为深入了解蓝藻水华介导的藻菌互作机制和水体生源要素循环的微生物过程提供参考。 展开更多
关键词 蓝藻 藻菌互作 碳氮循环 环境因素
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帕米尔盘羊食性与肠道微生物季节变化特征 被引量：2
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作者 张丽娇 迪拉拉·托留 +3 位作者 徐文轩 吴永杰 汪沐阳 杨维康 《生态学报》 北大核心 2025年第2期629-643,共15页
肠道微生物对宿主代谢和环境适应有重要影响,其种类组成主要受宿主食物组成与进化遗传的影响。开展野生动物肠道微生物和食性研究有助于揭示肠道微生物如何提高宿主对环境胁迫的适应能力,可为濒危动物保护提供指导。采集暖季与冷季各12... 肠道微生物对宿主代谢和环境适应有重要影响,其种类组成主要受宿主食物组成与进化遗传的影响。开展野生动物肠道微生物和食性研究有助于揭示肠道微生物如何提高宿主对环境胁迫的适应能力,可为濒危动物保护提供指导。采集暖季与冷季各12份帕米尔盘羊(Ovis ammon polii)的新鲜粪样,利用DNA宏条形码技术和16S rRNA测序技术,分析帕米尔盘羊冷暖季的食物与肠道微生物组成及其季节性差异。结果表明帕米尔盘羊共采食36科57属植物,其冷暖季食物组成具有显著差异,但主要食物均为蔷薇科(Rosaceae)与苋科(Amaranthaceae)植物。帕米尔盘羊冷季营养生态位宽度为3.18,暖季为2.94。该种肠道微生物α多样性与β多样性均呈现显著的季节差异,多种食物与肠道微生物丰度呈现显著相关性。帕米尔盘羊肠道微生物随着其食物组成的季节性变化而变化。肠道微生物功能预测显示,宿主在食物缺乏的冷季酯类化合物的生物合成、蛋白质消化与吸收代谢相关的功能基因的相对丰度显著增加,这有助于宿主更有效地利用氮和能量沉积,提高了盘羊在严酷冬季的适应能力。研究结果有助于深入理解高原生态系统野生动物与其肠道微生物与之间的相互作用关系,为濒危物种保护管理提供科学依据。 展开更多
关键词 帕米尔盘羊 DNA宏条形码技术 16S rRNA 食性 肠道微生物 新疆塔什库尔干野生动物自然保护区
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鸭绿江入海口湿地土壤细菌群落结构和组装机制 被引量：1
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作者 宋宇 高明 +3 位作者 曲贵伟 张春鹏 李晓玲 李富祥 《水生态学杂志》 北大核心 2025年第2期214-222,共9页
为了探究鸭绿江入海口湿地中土壤细菌的群落多样性、结构及其组装机制,利用高通量测序技术对滩涂盐土、碱蓬草盐土、沼泽土、水稻土、草甸土和棕壤等6种典型土壤的细菌群落进行16S rRNA基因扩增子测序,并基于系统发育二进制的零模型分析... 为了探究鸭绿江入海口湿地中土壤细菌的群落多样性、结构及其组装机制,利用高通量测序技术对滩涂盐土、碱蓬草盐土、沼泽土、水稻土、草甸土和棕壤等6种典型土壤的细菌群落进行16S rRNA基因扩增子测序,并基于系统发育二进制的零模型分析(model analysis)解析细菌群落组装机制。结果表明,变形菌门(Proteobacteria)平均相对丰度最高(38.5%),其次为酸杆菌门(Acidobacteria,18.2%)和拟杆菌门(Bacteroidetes,9.7%)。6种土壤类型细菌群落的α多样性和β多样性整体差异显著(P<0.05)。主要菌门和菌属与环境因子的冗余分析(RDA)结果表明,土壤有机碳(SOC)、全氮(TN)、电导率(EC)、全硫(TS)和pH是主要影响因子。基于零模型的群落组装分析表明,鸭绿江口湿地土壤细菌群落组装以随机性为主导,其中扩散限制贡献最大,在群落组装中占40.52%。研究结果可为鸭绿江口湿地生态管理提供参考。 展开更多
关键词 湿地 细菌多样性 群落结构 组装机制 鸭绿江口
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互花米草入侵对天津滨海湿地土壤无机磷解磷菌群落组成和多样性的影响 被引量：1
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作者 张慧敏 李宁宁 +7 位作者 李俊颖 钟晓莹 胡曰会 朱琳 冀佳佳 龚佩聪 郭宏宇 王银华 《天津师范大学学报(自然科学版)》 北大核心 2025年第2期41-48,共8页
互花米草入侵是当前我国滨海湿地生态系统所面临的重要生态问题之一.为探究互花米草入侵对滨海湿地土壤解磷菌群落的影响,采集天津滨海湿地中不同互花米草入侵程度样地的土壤样品,采用无机磷培养基分离土壤无机磷解磷菌,比较不同样地的... 互花米草入侵是当前我国滨海湿地生态系统所面临的重要生态问题之一.为探究互花米草入侵对滨海湿地土壤解磷菌群落的影响,采集天津滨海湿地中不同互花米草入侵程度样地的土壤样品,采用无机磷培养基分离土壤无机磷解磷菌,比较不同样地的群落组成和多样性差异,并对组成与土壤理化性质间的相关关系进行冗余分析(RDA).结果显示:随互花米草入侵程度的增加,天津滨海湿地土壤无机磷解磷菌的数量显著增加;互花米草入侵明显改变了群落组成,总体上互花米草入侵提高了土壤无机磷解磷菌的群落多样性.RDA结果显示:对天津滨海湿地土壤无机磷解磷菌群落组成起主导作用的土壤因子为铵态氮含量(解释度37.30%)、总氮含量(解释度33.40%)、pH值(解释度31.40%)、有机质含量(解释度29.30%)和有效磷含量(解释度29.20%).综上,互花米草入侵提高了天津滨海湿地土壤无机磷解磷菌的数量及群落多样性,从而促进了滨海湿地土壤中的磷循环过程,这可能进一步促进了互花米草在滨海湿地中的入侵. 展开更多
关键词 滨海湿地 互花米草 生物入侵 解磷菌 群落组成 多样性
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三个地理种群野生棘胸蛙肠道微生物多样性和功能分析 被引量：1
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作者 李晗 万刚 +5 位作者 王岩峰 朱飘 郑荣泉 阳钢 朱灵红 胡晓晓 《野生动物学报》 北大核心 2025年第2期376-385,共10页
研究不同生活环境下棘胸蛙(Quasipaa spinosa)肠道微生物的差异,利用16S rRNA高通量测序技术,对中国东部(浙江)、中部(广东和江西)和西部(广西和贵州)3个地理种群的棘胸蛙进行肠道菌群的多样性和功能分析。测序结果显示:东部、中部和西... 研究不同生活环境下棘胸蛙(Quasipaa spinosa)肠道微生物的差异,利用16S rRNA高通量测序技术,对中国东部(浙江)、中部(广东和江西)和西部(广西和贵州)3个地理种群的棘胸蛙进行肠道菌群的多样性和功能分析。测序结果显示:东部、中部和西部地区共有OTU 530个,各地区特有OTU分别为48、123、118个。西部地区棘胸蛙肠道菌群的物种丰富度和多样性最高,3个地理种群棘胸蛙的优势菌门均为拟杆菌门(Bacteroidetes)、变形菌门(Proteobacteria)和厚壁菌门(Firmicutes)。在属水平上,西部地理种群的阿克曼菌属(Akkermansia)、沙雷氏菌属(Serratia)丰度显著高于其他2个地理种群,东部地理种群的小螺菌属(Mucispirillum)丰度较其他2个地理种群高。3个地理种群棘胸蛙肠道微生物功能也存在共性,主要集中于新陈代谢中的能量代谢、碳水化合物代谢和氨基酸代谢等方面。本研究从肠道微生物角度探究棘胸蛙的环境适应性,为其生态保护和健康养殖提供新的理论依据。 展开更多
关键词 棘胸蛙 地理种群 肠道微生物 生态保护
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小型城市湿地微生物组及其固碳基因潜力分析 被引量：1
15
作者 林明海 胡连信 +1 位作者 郝丽萍 王泽峰 《生物工程学报》 北大核心 2025年第6期2415-2431,共17页
小型城市湿地分布广泛,易受人类活动的影响,是重要的碳源和碳汇。微生物在碳循环中起重要驱动作用,但目前对小型城市湿地中原核生物多样性及其在固碳和碳代谢中的作用研究较少。为深入了解小型城市湿地中微生物驱动的碳循环过程,解析微... 小型城市湿地分布广泛,易受人类活动的影响,是重要的碳源和碳汇。微生物在碳循环中起重要驱动作用,但目前对小型城市湿地中原核生物多样性及其在固碳和碳代谢中的作用研究较少。为深入了解小型城市湿地中微生物驱动的碳循环过程,解析微生物群落和相关功能类群的组成,本研究系统分析了湖州市3处小型湿地微生物组的组成、元素代谢途径及与生境理化性质的联系,并与若尔盖高原自然湿地进行了比较。基于16SrRNA基因扩增子和宏基因组测序分析了物种及功能组成,组装出60个中高质量的基因组(metagenome-assembled genomes,MAGs),包括55个细菌和5个古菌物种,分析了其在2种类型湿地中的分布情况和推动元素循环的功能潜力,尤其关注了固碳途径。发现数种细菌的基因组几乎编码了完整的卡尔文循环、还原三羧酸循环、还原乙酰辅酶A途径以及还原型甘氨酸途径,其中包括隶属于Syntrophorhabdus属(脱硫杆菌门)和UBA4417属(拟杆菌门)的潜在的新型固碳细菌,且这些菌种在湿地微生物组中具有相对较高的丰度。揭示这些功能类群推动元素循环的基因潜力,对增强小型城市湿地的碳汇功能具有重要的科学意义。 展开更多
关键词 小型城市湿地 宏基因组组装基因组 固碳 原核生物 还原型甘氨酸途径
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青藏高原盐湖/超盐湖表层沉积物原核生物群落分布格局及其形成机制 被引量：1
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作者 罗钰燕 王宇姝 +2 位作者 乐晶 盛海彦 余玲玲 《生态学报》 北大核心 2025年第10期5025-5042,共18页
高寒盐湖中的原核微生物是生物地球化学循环的重要参与者,它们对环境变化具有非常灵敏的响应。探究高寒盐湖中原核微生物群落多样性与结构可以体现原核微生物群落的生态功能及盐湖表层沉积物的理化性质变化。用Illumina高通量测序技术... 高寒盐湖中的原核微生物是生物地球化学循环的重要参与者,它们对环境变化具有非常灵敏的响应。探究高寒盐湖中原核微生物群落多样性与结构可以体现原核微生物群落的生态功能及盐湖表层沉积物的理化性质变化。用Illumina高通量测序技术对青海湖和茶卡湖中共24个表层沉积物样本进行研究,通过β⁃多样性分解方法探讨原核微生物多样性在盐湖表层沉积物的分布格局以及形成机制,并用偏最小二乘法结构方程模型(Partial least square⁃structural equation modeling,PLS⁃SEM)量化青海湖和茶卡湖表层沉积物中盐度对原核微生物群落多样性的影响,同时,通过分子生态网络分析的方法揭示不同盐湖下原核微生物种间的相互作用关系。结果表明,电导率(Electrical conductivity,EC)是影响青海湖和茶卡湖原核微生物分布与多样性的最重要因素,其他环境因子,例如:酸碱度(pH)、有效氮(Available nitrogen,AN)、有效钾(Available potassium,AK)和总氮(Total nitrogen,TN)也对原核微生物群落的丰度、多样性和结构组成产生了重要影响。与青海湖相比,茶卡湖表层沉积物中原核微生物的丰富度和多样性较低,表明高盐度可能限制了茶卡盐湖原核微生物的生长。在细菌门水平上,变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)在青海湖和茶卡湖细菌群落中均占主导地位。而在古菌门水平中,广古菌门(Euryarchaeota)是青海湖和茶卡湖中共有的优势菌种。青海湖和茶卡湖中原核微生物群落的总β⁃多样性均受嵌套(nestedness)组分贡献较大,这与环境限制原核微生物扩散相关。此外,相比青海湖,茶卡湖中的原核微生物群落正相互作用更多,这表明了原核微生物在高盐环境中生态位异化较少,应对胁迫采取的是增强合作的关系。本研究为原核微生物在不同盐胁迫下的生态策略提供了新的见解,有助于加深对青藏高原盐湖表层沉积物中原核微生物群落复杂动态的理解。 展开更多
关键词 原核生物群落 表层沉积物 青藏高原 共生网络 β⁃多样性组分
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班公湖水体细菌多样性和群落分布格局 被引量：1
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作者 王东旭 周迪 +5 位作者 陈康 熊仁康 陈博 罗央措姆 德吉 郭小芳 《微生物学通报》 北大核心 2025年第3期992-1012,共21页
【背景】细菌是湖泊生态系统中的主要驱动者,其群落结构会对湖泊的环境变化产生高度响应。班公湖地区特殊的地理位置和高海拔环境造就了其独特的微生物生态系统,目前鲜见对班公湖细菌的研究。【目的】探究班公湖水体细菌多样性和群落分... 【背景】细菌是湖泊生态系统中的主要驱动者,其群落结构会对湖泊的环境变化产生高度响应。班公湖地区特殊的地理位置和高海拔环境造就了其独特的微生物生态系统,目前鲜见对班公湖细菌的研究。【目的】探究班公湖水体细菌多样性和群落分布格局,于2023年9月对阿里地区班公湖东岸、西岸、湖心、湖底4个区域共计20个样点进行采样。【方法】基于16S rRNA基因高通量测序技术进行样品分析,通过α多样性分析认识细菌群落之间的差异,利用Spearman相关系数衡量班公湖水体理化因子与α多样性指数之间的相关性。【结果】共得到14886条OTU,已注释的OTU分别属于47门470属。班公湖水体细菌群落主要由变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinomycetota)、拟杆菌门(Bacteroidota)和疣微菌门(Verrucomicrobiota)组成。α多样性指数分析显示,班公湖水体细菌群落多样性和丰富度均较高,群落结构较为复杂。Spearman相关系数表明,总磷(total phosphorus,TP)与电导率(electric conductivity,EC)是影响班公湖水体细菌的主要环境因子。【结论】阐明了班公湖水体细菌群落多样性和分布格局,并揭示了水体理化因子对细菌群落的影响,为未来班公湖的收缩或扩张变化后的水体细菌群落动态研究提供参考依据。 展开更多
关键词 高原湖泊 班公湖 细菌 多样性 群落结构
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纳木措流域岸边带湿地产甲烷古菌群落多样性与分布特征 被引量：1
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作者 刘源 杜剑卿 +2 位作者 马丽媛 杨刚 田建卿 《生物多样性》 北大核心 2025年第1期67-80,共14页
高寒河流型湿地生态系统是甲烷排放的重要区域。产甲烷古菌是湿地生境中甲烷产生的主要来源之一,其群落组成变化显著影响全球碳循环过程。然而,高寒河流型湿地产甲烷古菌群落的组成与分布特征尚不明确。因此,本研究以青藏高原纳木措湖... 高寒河流型湿地生态系统是甲烷排放的重要区域。产甲烷古菌是湿地生境中甲烷产生的主要来源之一,其群落组成变化显著影响全球碳循环过程。然而,高寒河流型湿地产甲烷古菌群落的组成与分布特征尚不明确。因此,本研究以青藏高原纳木措湖尼亚曲流域为研究对象,利用mcr A基因扩增子测序技术,对横向(岸边带湿地、过渡带、高寒草甸)和纵向(4,980 m、4,843 m、4,777 m、4,752 m 4个海拔梯度)两个维度上的土壤产甲烷古菌进行分析,探讨其多样性、群落结构及分布模式。结果表明,从岸边带湿地至过渡带再到高寒草甸,产甲烷古菌群落的α多样性逐渐降低,岸边带湿地群落组成显著不同于高寒草甸和过渡带。在所有样点中,氢营养型甲烷杆菌属(Methanobacterium)是最主要的产甲烷古菌(高寒草甸、过渡带和岸边带湿地的平均相对丰度依次为45.78%、42.90%及34.17%)。中性群落模型表明,随机过程是岸边带湿地产甲烷古菌群落构建的主要驱动因素,但随机过程对高寒草甸及过渡带群落贡献较少。FEAST溯源分析表明,横向维度上,高寒草甸和过渡带对岸边带湿地产甲烷古菌群落的贡献率分别为17.62%和13.04%;纵向维度上,低海拔(样点S4)岸边带湿地产甲烷古菌群落主要由河流上游岸边带湿地(49.71%)和高寒草甸(21.45%)输入,表明高寒草甸是岸边带湿地产甲烷古菌群落的重要物种库。本研究揭示了高寒流域土壤产甲烷古菌群落的多样性组成及分布模式,对理解高寒生态系统功能具有重要意义。 展开更多
关键词 岸边带湿地 产甲烷古菌 群落组装 微生物来源
原文传递
鸭绿江口湿地土壤微生物群落结构与碳循环的宏基因组学
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作者 宋宇 高明 +2 位作者 张春鹏 曲贵伟 李富祥 《水生态学杂志》 北大核心 2025年第5期258-268,共11页
研究鸭绿江口湿地土壤微生物群落结构与碳循环,为合理开发利用、恢复和保护湿地生态功能提供依据。利用宏基因组测序技术研究了2022年9月鸭绿江口湿地滩涂盐土、沼泽土、水稻土、草甸土和棕壤5种土壤微生物群落多样性、组成、碳循环功... 研究鸭绿江口湿地土壤微生物群落结构与碳循环,为合理开发利用、恢复和保护湿地生态功能提供依据。利用宏基因组测序技术研究了2022年9月鸭绿江口湿地滩涂盐土、沼泽土、水稻土、草甸土和棕壤5种土壤微生物群落多样性、组成、碳循环功能基因组成及来源微生物物种,并探讨了土壤理化因子对微生物群落结构和碳循环功能基因的影响。结果表明,细菌和真菌群落间Chao1指数差异不显著(P>0.05),Shannon指数差异显著(P<0.05),古菌群落间的Chao1指数和Shannon指数均差异显著;细菌菌门以变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和螺旋菌门(Nitrospirae)为主,古菌菌门则以奇古菌门(Thaumarchaeota)、泉古菌门(Crenarchaeota)、广古菌门(Euryarchaeota)为优势菌门。真菌菌门中子囊菌门(Ascomycota)、毛霉门(Mucoromycota)、担子菌门(Basidiomycota)占绝对优势。主要菌门与理化因子的冗余分析结果显示:土壤有机碳、总磷、电导率和pH为细菌主要影响因子;总磷、总硫和电导率为古菌菌门主要影响因子;电导率、总磷、总硫和总氮为真菌菌门主要影响因子。基于DiTing数据库检测到114个基因家族参与的29个碳通路,参与各功能循环途径的土壤类型和基因丰度均有差异。WL(Wood-Ljungdahipathway)碳固定途径及以甲醇和乙酸为底物合成甲烷途径只发生在沼泽土中,滩涂盐土在rTCA和甲烷代谢中贡献最大,水稻土在CO_(2)合成甲烷途径中占较大优势。土壤微生物碳循环基因与理化因子间的曼特尔检验结果表明pH、总氮、土壤有机碳和总磷是主要影响因素。桑基图分析结果显示碳循环主要来源于变形菌门、广古菌门、奇古菌门、放线菌门和拟杆菌门等5个菌门及对应的18个菌属。 展开更多
关键词 宏基因组 微生物群落结构 碳循环 鸭绿江口湿地
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台湾冷泉中厌氧细菌的分离培养和多样性研究
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作者 杨晓宇 张晓华 +1 位作者 王晓磊 史晓翀 《中国海洋大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2025年第1期95-106,共12页
针对目前台湾冷泉厌氧可培养细菌类群多样性的认知不足的现状,本研究旨在深入探究研究区域小尺度范围内可培养厌氧微生物多样性及分布规律。为此,本研究利用12种厌氧培养基,包括厌氧MA(2216E)、改良2216E(以下称为MA+、1/MA)、R2A、4种... 针对目前台湾冷泉厌氧可培养细菌类群多样性的认知不足的现状,本研究旨在深入探究研究区域小尺度范围内可培养厌氧微生物多样性及分布规律。为此,本研究利用12种厌氧培养基,包括厌氧MA(2216E)、改良2216E(以下称为MA+、1/MA)、R2A、4种SPG厌氧培养基、3种NMS以及DZJ培养基,对采集自台湾冷泉的沉积物、海水、动物样品中的厌氧菌进行富集、分离和培养,然后通过16S rRNA基因测序对分离纯化后的菌株进行分类鉴定。研究结果表明,台湾冷泉厌氧细菌具有较高的多样性,从台湾冷泉共分离鉴定厌氧菌375株,它们分属3个门(变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)和放线菌门(Actinobacteria))、29个属、49个种,其中γ-变形菌纲占绝对优势地位,优势类群包括弧菌属(Vibrio)、希瓦氏菌属(Shewanella)、肠杆菌属(Enterobacter)和葡萄球菌属(Staphylococcus)等。此外,还发现了15株(3种)潜在的海洋新菌。本研究还发现,不同培养基对不同类群的影响不同且程度各异,如MA(2216E)培养基对γ-变形菌纲分离培养效率较高,而SPG培养基在获得新菌方面具有优势。 展开更多
关键词 冷泉 可培养细菌 厌氧细菌 多样性 16S rRNA
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