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微生物糖苷水解酶19家族几丁质酶的研究进展
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作者 李妍 钱周泽 +5 位作者 王帅奇 吕晨茵 谷天燕 李玲聪 于欢 赵国刚 《微生物学报》 北大核心 2026年第1期51-60,共10页
几丁质是地球上储量仅次于纤维素的第二大可再生资源。几丁质酶是降解几丁质的关键酶类。糖苷水解酶19家族(glycoside hydrolases family 19,GH19)几丁质酶主要存在于高等植物中。近年来,来自微生物的GH19几丁质酶被广泛发现。本文从分... 几丁质是地球上储量仅次于纤维素的第二大可再生资源。几丁质酶是降解几丁质的关键酶类。糖苷水解酶19家族(glycoside hydrolases family 19,GH19)几丁质酶主要存在于高等植物中。近年来,来自微生物的GH19几丁质酶被广泛发现。本文从分布、结构特征、酶学性质及应用等方面综述了微生物来源GH19几丁质酶的研究进展,并对未来的研究方向进行了展望。 展开更多
关键词 微生物GH19几丁质酶 几丁质 酶学性质 应用
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基于转录组学解析芥末精油纳米乳抑制柑橘酸腐菌生长的作用机制
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作者 刘妍 袁楚珊 +3 位作者 程小梅 张小威 李瑞 朱向荣 《食品科学》 北大核心 2026年第1期29-38,共10页
为解析添加柑橘果胶和吐温-80的芥末精油纳米乳(mustard essential oil nanoemulsion contaning citrus pectin and Tween-80,MEO-NE-PT)抑制柑橘酸腐菌生长的作用机制,分别采集经64μL/L MEO-NE-PT处理4 h和未进行处理的白地霉菌丝体... 为解析添加柑橘果胶和吐温-80的芥末精油纳米乳(mustard essential oil nanoemulsion contaning citrus pectin and Tween-80,MEO-NE-PT)抑制柑橘酸腐菌生长的作用机制,分别采集经64μL/L MEO-NE-PT处理4 h和未进行处理的白地霉菌丝体进行转录组测序,共鉴定出2788个差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),其中1364个显著上调,1424个显著下调。DEGs显著富集于氨基糖和核苷酸糖代谢、类固醇生物合成、乙醛酸和二羧酸代谢、淀粉和蔗糖代谢、ABC转运蛋白等途径中,协同破坏细胞结构与功能、切断能量供应、抑制解毒并削弱病原菌将外源毒性物质排出胞外的能力。本研究为柑橘绿色保鲜剂开发提供科学依据。 展开更多
关键词 芥末精油纳米乳 柑橘酸腐病 白地霉 转录组 差异表达基因
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细菌锌摄取调节因子(Zur)的功能研究进展
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作者 李梦燕 陈超 +2 位作者 于基成 刘秋 于放 《微生物学杂志》 北大核心 2026年第1期87-95,共9页
锌摄取调节因子(zinc uptake regulator, Zur)是铁摄取调节因子家族(ferric uptake regulator, FUR)超家族的转录调控因子,以二聚体或多聚体的形式存在于绝大多数细菌中。Zur包含保守的DNA结合结构域和Zn^(2+)结合结构域,后者是Zur识别... 锌摄取调节因子(zinc uptake regulator, Zur)是铁摄取调节因子家族(ferric uptake regulator, FUR)超家族的转录调控因子,以二聚体或多聚体的形式存在于绝大多数细菌中。Zur包含保守的DNA结合结构域和Zn^(2+)结合结构域,后者是Zur识别并结合Zn^(2+)的关键。它利用Zn^(2+)作为辅助因子,通过改变自身构象影响其DNA结合能力来调控锌转运蛋白相关基因的表达,以维持细菌内的锌稳态。越来越多的研究表明,Zur还可以直接或间接地参与多种代谢途径,通过调控代谢途径关键基因的表达,帮助细菌有效应对外部环境的变化,构成了细菌代谢调控网络的重要组成部分。本文综述了Zur在分子结构、Zn^(2+)响应调控、细菌次级代谢调控、毒力产生和应激反应方面的研究进展,为更全面地理解并深入探究细菌代谢调控复杂过程中Zur的潜在功能提供参考。 展开更多
关键词 锌摄取调节因子(Zur) 细菌 转录调控因子 锌稳态 次级代谢
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噬菌体裂解酶作为新型抗菌药物的研究进展
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作者 肖瀛 韩宁筱 +4 位作者 李芹 李小华 林新 徐礼裕 张怀东 《热带生物学报(中英文)》 2026年第1期19-28,共10页
近年来,抗生素的滥用导致细菌耐药性问题日益严重,急需新的安全替代药物。噬菌体裂解酶是噬菌体侵染宿主细菌后产生的一种肽聚糖水解酶,能够水解细菌肽聚糖,导致细菌破裂、死亡并释放子代噬菌体。噬菌体裂解酶因其高度特异性、高效裂解... 近年来,抗生素的滥用导致细菌耐药性问题日益严重,急需新的安全替代药物。噬菌体裂解酶是噬菌体侵染宿主细菌后产生的一种肽聚糖水解酶,能够水解细菌肽聚糖,导致细菌破裂、死亡并释放子代噬菌体。噬菌体裂解酶因其高度特异性、高效裂解活性及不易引起细菌产生耐药性等优势,在治疗细菌感染方面具有巨大的潜力。文章系统综述了噬菌体裂解酶作为新型抗菌药物的研究进展,重点围绕裂解酶的结构组成、作用机制及工程化改造策略,以期为设计高效、高质量的新型噬菌体裂解酶抗菌药物提供理论依据与技术参考。 展开更多
关键词 噬菌体 裂解酶 新型抗菌药物 耐药性 作用机制
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源于鲍曼不动杆菌脱乙酰酶的异源表达及酶学性质研究
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作者 徐丁洋 Josef VOGLMEIR 刘丽 《食品与发酵工业》 北大核心 2026年第2期78-85,共8页
氨基葡萄糖(glucosamine, GlcN)作为一种重要的功能物质和营养物质,在食品工业和医药领域具有广泛的应用前景。然而在工业生产GlcN过程中,酸水解法的普遍应用造成了严重的环境污染。为此,探索一种催化性能优异且符合绿色化学理念的催化... 氨基葡萄糖(glucosamine, GlcN)作为一种重要的功能物质和营养物质,在食品工业和医药领域具有广泛的应用前景。然而在工业生产GlcN过程中,酸水解法的普遍应用造成了严重的环境污染。为此,探索一种催化性能优异且符合绿色化学理念的催化脱乙酰反应方法成为亟待解决的关键问题。该研究成功克隆出一种源于鲍曼不动杆菌的N-乙酰氨基葡萄糖(N-acetylglucosamine, GlcNAc)脱乙酰酶(AcbaCBDA),并通过生物工程技术实现了该酶在大肠杆菌中的异源表达。结果表明,重组蛋白AcbaCBDA表现出显著的GlcNAc脱乙酰活性,其比酶活性达到17.82 U/mg,最适pH值为7.5,最适温度为25℃,Ni^(2+)能显著提高酶活性,Cu^(2+)能有效抑制酶活性,在4℃下酶活性能稳定维持12 h。定点突变分析确定,Asp54和His160是调控AcbaCBDA催化活性的关键氨基酸位点。重组AcbaCBDA显示出良好的催化活性和酶学性质,为开发高效、环保的酶促生产氨基葡萄糖工艺提供了理论参考和技术支持。 展开更多
关键词 氨基葡萄糖 N-乙酰氨基葡萄糖 脱乙酰酶 酶学性质
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肽聚糖水解产物:一类重要的信号分子
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作者 沈盆闪 梁延群 +4 位作者 胡翊伟 陈禹 蔡静晓 余志良 音建华 《微生物学报》 北大核心 2026年第2期516-527,共12页
肽聚糖是细菌细胞壁的关键组分,对维持细菌形态、保持渗透压稳定至关重要。在细菌正常生长过程中,肽聚糖持续进行合成与水解,并维持动态平衡。肽聚糖水解酶是调控肽聚糖稳态的关键酶类,其水解产物可通过肽聚糖循环途径重新参与生物合成... 肽聚糖是细菌细胞壁的关键组分,对维持细菌形态、保持渗透压稳定至关重要。在细菌正常生长过程中,肽聚糖持续进行合成与水解,并维持动态平衡。肽聚糖水解酶是调控肽聚糖稳态的关键酶类,其水解产物可通过肽聚糖循环途径重新参与生物合成。近年来的研究表明,肽聚糖水解产物还可作为一类重要的信号分子调控抗生素耐药性、促进芽孢萌发、介导种间相互作用等关键生理过程,这极大地深化了人们对细菌生理调控机制的理解。因此,本文综述了细菌中肽聚糖水解酶的主要类型,并重点总结了肽聚糖水解产物作为信号分子调控生理过程的最新研究进展,为深入探究细菌肽聚糖的多重生理功能提供理论依据。 展开更多
关键词 细菌细胞壁 肽聚糖 肽聚糖水解产物 信号分子 基因表达调控
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基于转录组测序的新疆伊犁野生阿魏菇子实体发育及多糖合成相关基因的挖掘
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作者 木古丽·木哈西 玛依拉·吐尔地别克 +2 位作者 吾尔恩·阿合别尔迪 王广权 庞克坚 《食品工业科技》 北大核心 2026年第3期163-171,共9页
本研究通过转录组测序及生物信息学分析,探究了伊犁野生阿魏菇(Pleurotus ferulae)子实体和菌丝体阶段的基因表达差异,聚焦其子实体发育及多糖生物合成的分子机制。结果显示,在这两个阶段共表达了6458个基因,但菌丝体特有基因数量(12218... 本研究通过转录组测序及生物信息学分析,探究了伊犁野生阿魏菇(Pleurotus ferulae)子实体和菌丝体阶段的基因表达差异,聚焦其子实体发育及多糖生物合成的分子机制。结果显示,在这两个阶段共表达了6458个基因,但菌丝体特有基因数量(12218个)显著高于子实体(1022个),表明子实体特有基因驱动子实体形态发生和生物活性成分合成。进一步以菌丝体转录组为对照进行比较分析,发现子实体转录组中有5339个显著差异表达基因(DEGs)(上调60个,下调5279个),这些DEGs富集于碳水化合物代谢、能量代谢(氧化磷酸化、TCA循环)及遗传信息处理相关的通路中,揭示子实体发育伴随代谢活性的显著增强。此外,从73条KEGG通路中定位9条多糖合成相关通路,并从中鉴定出23个关键酶基因,其主要涉及丙酮酸代谢、淀粉和蔗糖代谢、糖酵解/葡萄糖生成及氨基糖和核苷酸糖代谢等途径,进一步明确了多糖合成的核心代谢节点。本研究首次构建了阿魏菇发育与多糖合成的分子调控框架,为解析其生物活性多糖合成机制、提升栽培效率与食品加工适应性,以及开发分子标记驱动的品质改良技术提供了关键理论依据和基因资源,为功能性食品开发(如多糖类增稠剂、营养强化剂)及食品工业中高附加值菌菇产品的定向培育奠定了分子基础。 展开更多
关键词 阿魏菇 转录组 差异分析 发育 多糖合成通路
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新型抗菌肽PEP1的生物学特性及其抗菌机制
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作者 朱露瑶 王凤 +6 位作者 杨小艳 黄嘉滢 王诗烨 吴宁榕 胡阳 张怀东 李芹 《福建师范大学学报(自然科学版)》 北大核心 2026年第2期104-112,共9页
通过理性设计合成了新型抗菌肽PEP1,预测其具有非完美两亲性的α-螺旋结构。活性测试显示,抗菌肽PEP1对测试病原菌具有高效杀菌作用,且在有效浓度下对哺乳动物细胞毒性低、溶血率弱。机制研究表明:该肽可破坏细菌细胞膜完整性,并能结合... 通过理性设计合成了新型抗菌肽PEP1,预测其具有非完美两亲性的α-螺旋结构。活性测试显示,抗菌肽PEP1对测试病原菌具有高效杀菌作用,且在有效浓度下对哺乳动物细胞毒性低、溶血率弱。机制研究表明:该肽可破坏细菌细胞膜完整性,并能结合细菌DNA,形成膜破坏与DNA靶向的双重作用机制;分子动力学模拟进一步证实其与细菌膜的高效相互作用。抗菌肽PEP1的非完美两亲性设计可兼顾抗菌活性与生物相容性,其双重作用机制为抗菌肽设计提供了参考。 展开更多
关键词 抗菌肽 理性设计 非完美两亲性 Α-螺旋 双重作用机制
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2,3-二氢-1,3-二甲基-N-(4-甲基苯)-1H-吲哚-3-乙酰胺的抗氧化活性与作用机制
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作者 韩瑞婷 周俊杰 +2 位作者 谢孟芹 俞祥华 冯娜 《五邑大学学报(自然科学版)》 2026年第1期25-32,共8页
为探究吲哚衍生物2,3-二氢-1,3-二甲基-N-(4-甲基苯)-1H-吲哚-3-乙酰胺(3kb)的抗氧化活性及其分子机制,通过体外抗氧化实验和氧化胁迫下的秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans)存活实验筛选活性化合物,发现20μmol/L 3kb处理显著降低... 为探究吲哚衍生物2,3-二氢-1,3-二甲基-N-(4-甲基苯)-1H-吲哚-3-乙酰胺(3kb)的抗氧化活性及其分子机制,通过体外抗氧化实验和氧化胁迫下的秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans)存活实验筛选活性化合物,发现20μmol/L 3kb处理显著降低线虫的活性氧(ROS)水平(P<0.01),并提高谷胱甘肽(GSH)含量33.65%、降低丙二醛(MDA)水平26.88%(P<0.01).实时定量聚合酶链式反应(RT-qPCR)及荧光标记分析表明,3kb通过激活转录因子DAF-16信号通路,上调抗氧化蛋白超氧化物歧化酶-3(SOD-3)和谷胱甘肽S-转移酶-4(GST-4)的表达(P<0.01),其中SOD-3活性增加102.38%、GST-4活性提升22.01%.机制研究发现,3kb促进DAF-16核易位(增加至对照组的4.8倍),且其抗氧化效应依赖于DAF-16通路.本研究首次系统评价该类吲哚衍生物的抗氧化活性,揭示其通过DAF-16通路增强抗氧化防御的分子机制,为开发新型抗氧化剂提供理论依据. 展开更多
关键词 吲哚衍生物 抗氧化活性 秀丽隐杆线虫 DAF-16信号通路 超氧化物歧化酶-3 谷胱甘肽S-转移酶-4
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谢瓦曲霉来源葡萄糖氧化酶的酶学性质及其比活性的优化
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作者 任美琪 王苑 +3 位作者 柏映国 田健 黄火清 杨浩萌 《生物技术进展》 2026年第1期123-130,共8页
研究通过原生质体转化技术将谢瓦曲霉(Aspergillus chevalieri)来源的葡萄糖氧化酶基因(glucose oxidase,AcGox)导入黑曲霉(A.niger)菌株,获得表达的重组AcGox蛋白。结果显示,重组AcGox蛋白的最适pH为6.0,最适温度为32℃,表现出优良的... 研究通过原生质体转化技术将谢瓦曲霉(Aspergillus chevalieri)来源的葡萄糖氧化酶基因(glucose oxidase,AcGox)导入黑曲霉(A.niger)菌株,获得表达的重组AcGox蛋白。结果显示,重组AcGox蛋白的最适pH为6.0,最适温度为32℃,表现出优良的耐酸性和较好的热稳定性。然而,AcGox的比活性仅为70.81 U·mg^(-1),成为限制其应用的关键瓶颈。为解决这一问题,研究在AcGox-5表达菌株基础上,进一步过表达编码核黄素激酶和黄素腺嘌呤二核苷酸(flavin adenine dinucleotide,FAD)合成酶基因,RT-qPCR证实2个基因的转录水平显著上调。最终,优化后的菌株AcGox/FAD/FMN-3生产的Gox比活性提升至111.55 U·mg^(-1),增幅达57.5%。研究证实辅因子FAD的供给水平是限制重组AcGox催化效率的关键因素,为酶工程中“辅因子工程”策略提供了直接实验证据,并为葡萄糖氧化酶的工业化生产提供了可推广的宿主改造方案,推动了Gox的应用。 展开更多
关键词 黑曲霉 谢瓦曲霉 葡萄糖氧化酶 黄素腺嘌呤二核苷酸 高效表达
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氨基酸对巨大芽孢杆菌代谢网络的调控作用
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作者 刘巍 邱鹏飞 +3 位作者 鲍俊萍 朱其立 吕济敏 李洪顺 《安徽农业科学》 2026年第4期116-123,共8页
[目的]探究复合氨基酸对菌株Bacillus megaterium 153-1发酵代谢组分的调控。[方法]在发酵培养基中添加复合氨基酸(总浓度1‰),通过3 L发酵罐制备代谢产物;结合非靶向代谢组学分析差异代谢物,并利用小麦发芽试验和拟南芥根系发育试验验... [目的]探究复合氨基酸对菌株Bacillus megaterium 153-1发酵代谢组分的调控。[方法]在发酵培养基中添加复合氨基酸(总浓度1‰),通过3 L发酵罐制备代谢产物;结合非靶向代谢组学分析差异代谢物,并利用小麦发芽试验和拟南芥根系发育试验验证农学效果。[结果]添加复合氨基酸(ET2处理组)显著上调3-吲哚乙酸、没食子酸等代谢物(FC值>10,P<0.001),苯丙烷类和色氨酸代谢通路是主要调控靶点。通过激活植物生长素合成基因(TAA1、YUC2和YUC8)增强了拟南芥根系发育,小麦平均总芽长提高66.72%,拟南芥根毛密度和侧根数量分别增加84.74%和33.94%。[结论]复合氨基酸通过重编程菌株Bacillus megaterium 153-1的代谢网络,促进植物激素和抗氧化物质的合成,为开发多功能微生物菌剂提供理论依据。 展开更多
关键词 复合氨基酸 代谢组学 植物促生 次级代谢产物
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微生物发酵食品新进展 被引量:5
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作者 乌日娜 赵玉莲 +2 位作者 郭佳 史海粟 安飞宇 《微生物学杂志》 北大核心 2025年第1期1-13,共13页
本综述总结了微生物发酵食品领域的最新研究动态,重点探讨了合成生物学在微生物发酵中的应用,例如二氧化碳转化为淀粉和母乳寡糖生物合成技术的突破。同时,探讨了人工智能在发酵食品生产中的作用,特别是在微生物源鲜味肽开发中的应用,... 本综述总结了微生物发酵食品领域的最新研究动态,重点探讨了合成生物学在微生物发酵中的应用,例如二氧化碳转化为淀粉和母乳寡糖生物合成技术的突破。同时,探讨了人工智能在发酵食品生产中的作用,特别是在微生物源鲜味肽开发中的应用,为食品工业提供了创新的风味解决方案。而食药同源物质则通过微生物转化显著增强了其生物活性,为功能性食品的研发开辟了新方向。此外,还对微生物发酵功能食品的潜在风险进行了评估,并强调了风险防控的重要性。展望未来,微生物发酵食品的发展将更加注重技术创新、消费者健康需求的满足以及行业的可持续发展。 展开更多
关键词 发酵食品 合成生物学 人工智能 风味 食药同源 风险防控
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贝莱斯芽孢杆菌PksN生物信息学及表达分析
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作者 刘伟 闫更轩 +4 位作者 胡基华 田缘 于冲 毛雪 张淑梅 《华北农学报》 北大核心 2025年第S1期292-299,共8页
为探究贝莱斯芽孢杆菌DJ1菌株聚酮合酶PksN的理化性质和结构及聚酮化合物的生物合成过程中PksN的表达情况。利用生物信息学、分子对接技术分析了贝莱斯芽孢杆菌DJ1聚酮合酶PksN的同源序列、理化性质、蛋白结构、配体与受体结合位点、小... 为探究贝莱斯芽孢杆菌DJ1菌株聚酮合酶PksN的理化性质和结构及聚酮化合物的生物合成过程中PksN的表达情况。利用生物信息学、分子对接技术分析了贝莱斯芽孢杆菌DJ1聚酮合酶PksN的同源序列、理化性质、蛋白结构、配体与受体结合位点、小分子化合物和蛋白质互作网络,并利用实时荧光定量PCR测定了贝莱斯芽孢杆菌DJ1发酵不同时间点PksN的表达。结果表明,贝莱斯芽孢杆菌PksN属于PksD家族,与Bacillus的PksN相似性为100%,含有55个开放阅读框,5个保守结构域,其中包括KR结构域。PksN共有2051个氨基酸,分子量为226.05 ku,等电点为5.59,分子式为C_(10028)H_(15719)N_(2753)O_(3050)S_(75),是一种不稳定蛋白,位于细胞质膜,PksN以α-螺旋为主要结构,并预测了聚酮合酶PksN的三级结构。分子对接结果表明,PksN能利用乙酰辅酶A、丙酰辅酶A、异戊酰辅酶A、丙二酰辅酶A、甲基丙二酰辅酶A和乙基丙二酰辅酶A作为底物合成聚酮化合物,互作蛋白中排名前十的蛋白均与聚酮类化合物合成有关,实时荧光定量PCR结果表明,贝莱斯芽孢杆菌DJ1发酵48 h PksN表达量最高,可确定后续提取聚酮化合物的最佳时间点。 展开更多
关键词 贝莱斯芽孢杆菌 聚酮合酶 生物信息 结构预测 分子对接 基因表达
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外源微量添加剂对金耳发酵液多糖含量的影响
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作者 秦鹏 赵玉卉 +4 位作者 赵小亮 郭瑞 杨阿丽 祁正华 胡永军 《微生物学杂志》 北大核心 2025年第4期57-65,共9页
本研究旨在探索不同外源微量添加剂对金耳(Naematelia aurantialba)发酵液胞内外总多糖含量的影响,筛选提高多糖含量的外源微量添加剂,为金耳多糖规模化生产提供参考。利用单因素实验研究13种添加剂对金耳发酵液多糖含量的影响,筛选促... 本研究旨在探索不同外源微量添加剂对金耳(Naematelia aurantialba)发酵液胞内外总多糖含量的影响,筛选提高多糖含量的外源微量添加剂,为金耳多糖规模化生产提供参考。利用单因素实验研究13种添加剂对金耳发酵液多糖含量的影响,筛选促进多糖积累程度最高的3种添加剂,采用响应面法优化其复合添加浓度。单因素实验结果显示,添加甘氨酸、KH_(2)PO_(4)、MgSO_(4)、KCl、KNO_(3)、VB_(2)显著提高了金耳发酵液多糖含量并且提高程度依次降低,其中甘氨酸、KH_(2)PO_(4)、MgSO_(4)提高多糖积累的程度最高,而ZnSO_(4)、CaCl_(2)显著抑制多糖积累并且抑制程度依次增加。响应面实验结果显示,在甘氨酸2.59 g/L、KH_(2)PO_(4)1.36 g/L、MgSO_(4)1.30 g/L的优化复合添加浓度条件下,金耳发酵液多糖含量达(2.659±0.131)g/L,比CK组提高67.02%,其中KH_(2)PO_(4)与MgSO_(4)的协同作用显著提高了金耳发酵液多糖含量。 展开更多
关键词 金耳 液体发酵 添加剂 多糖含量 响应面
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海洋细菌Alteromonas sp.A1-6中褐藻胶裂解酶Alg1264的酶学性质研究
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作者 肖长生 梁潼 +6 位作者 李静 董明俐 单凤娟 晁红军 李鑫 陈静 闫达中 《食品与发酵工业》 北大核心 2025年第21期95-104,共10页
以Alteromonas sp.A1-6的基因组为模板,PCR扩增目的基因alg1264,成功构建重组表达载体pET28a-alg 1264,实现了alg 1264的克隆表达,并对其编码的褐藻胶裂解酶Alg1264的酶学性质和水解产物开展了系统研究。Alg1264的最适pH值为7.0,在pH 5.... 以Alteromonas sp.A1-6的基因组为模板,PCR扩增目的基因alg1264,成功构建重组表达载体pET28a-alg 1264,实现了alg 1264的克隆表达,并对其编码的褐藻胶裂解酶Alg1264的酶学性质和水解产物开展了系统研究。Alg1264的最适pH值为7.0,在pH 5.0~11.0条件下保温1 h后相对酶活力仍能保持在77%以上;最适温度为35℃,在5~35℃保温30 min后相对酶活力仍能保持在86%以上;Mg^(2+)、Ni^(2+)对Alg1264的影响比较小,在5 mmol/L的浓度影响下,其活力维持在85%以上,Cu^(2+)对Alg1264活力基本没影响。Alg1264对有机试剂有良好的耐受性,在5 mmol/Lβ-巯基乙醇或者体积分数20%的二甲基亚砜的处理下,Alg1264的相对酶活力可以维持在80%以上;在5 mmol/L盐酸胍、TritonX-100或者体积分数20%的甲醇、乙醇以及异丙醇存在下,Alg1264的相对酶活力也能维持在60%以上。Alg1264对底物褐藻胶的最大反应速率V max为0.130μmol/min,米氏常数K m为4.034 mg/mL,k cat为52.653 s^(-1),k cat/K m为13.052 mL/(mg·s)。Alg1264对聚β-D-古罗糖醛酸(polyG)具有底物偏好性;液质分析结果显示该酶降解褐藻胶,聚甘露糖醛酸(polyM),polyG生成的终产物主要为单糖、二糖、三糖和少量其他寡糖,故Alg1264是一种同时具有内切和外切酶活力的聚古罗糖醛酸裂解酶。Alg1264具有较好的有机溶剂耐受性、pH稳定性,同时具有明显的聚古罗糖醛酸偏好性,该酶具备的独特性质可能使其在褐藻寡糖制备方面具有巨大的应用潜力。 展开更多
关键词 褐藻胶裂解酶 异源表达 酶学性质 聚古罗糖醛酸偏好性 耐有机试剂
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生物信息学和分子对接分析HuNoVs非结构蛋白NS3
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作者 王道 肖亚梅 刘丹 《微生物学杂志》 北大核心 2025年第1期85-95,共11页
为了深入探究人类诺如病毒(Human noroviruses,HuNoVs)的NS3非结构蛋白的结构特征和小分子药物,运用多种生物信息学方法ProtParam、ProtScale、SignalP 5.0、TMHMM 2.0、NCBI Conserved Domains、SOPMA、SWISS-MODEL、YinOYang 1.2、Net... 为了深入探究人类诺如病毒(Human noroviruses,HuNoVs)的NS3非结构蛋白的结构特征和小分子药物,运用多种生物信息学方法ProtParam、ProtScale、SignalP 5.0、TMHMM 2.0、NCBI Conserved Domains、SOPMA、SWISS-MODEL、YinOYang 1.2、NetPhos 3.1、ABCpred、SYFPEITHI、Prankweb和Discovery Studio等预测NS3蛋白的同源性、理化性质、翻译后修饰位点、二级/三级结构、B/T细胞抗原表位、活性口袋位点及抑制化合物。HuNoVs的NS3蛋白是由363个氨基酸组成的稳定亲水性蛋白,相对分子量为39748.79 Da,理论等电点为6.37;NS3蛋白与其他病毒解旋酶序列相似性为32.52%,无信号肽和跨膜结构,二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主,具有2个功能结构域,38个O-糖基化位点和21个磷酸化位点,7个B-细胞抗原表位和19个T-细胞抗原表位;还存在6个活性口袋位置和5个潜在的小分子抑制化合物。本文为阐明人类诺如病毒非结构蛋白NS3的结构和在病毒性肠胃炎中的作用机制提供了理论依据,也为研发和筛选新疫苗和药物奠定了基础。 展开更多
关键词 人类诺如病毒 非结构蛋白NS3 生物信息学 分子对接
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枯草芽孢杆菌异戊二烯基二磷酸合酶的晶体结构
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作者 罗爽 刘忠川 +2 位作者 金赟 谢天 王刚刚 《应用与环境生物学报》 北大核心 2025年第7期1026-1032,共7页
萜类化合物(terpenoids)是种类最为繁多、结构最为丰富的天然产物,目前对倍半萜、二萜和多萜类化合物的合成研究较多,而对C_(35)萜类化合物的合成了解较少.在枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)中,C_(35)萜类化合物经由三步催化合成途径生... 萜类化合物(terpenoids)是种类最为繁多、结构最为丰富的天然产物,目前对倍半萜、二萜和多萜类化合物的合成研究较多,而对C_(35)萜类化合物的合成了解较少.在枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)中,C_(35)萜类化合物经由三步催化合成途径生成,催化第一步反应的酶是异戊二烯基二磷酸合酶(heptaprenyl diphosphate synthase,BsHepPPS合酶),催化双底物异戊烯基二磷酸(isopentenyl pyrophosphate,IPP)和法尼基二磷酸(farnesyl pyrophosphate,FPP)合成C_(35)直链化合物.为探讨BsHepPPS合酶的催化机制,利用X-射线晶体衍射技术解析枯草芽孢杆菌BsHepPPS合酶的三维晶体结构,分辨率2.48A(1A=10-10m).该酶为异源二聚体,包含HepT大亚基和HepS小亚基.大亚基HepT含两个催化活性中心区域FARM和SARM,关键催化残基高度保守.相比之下,HepS小亚基则与其他HepPPS合酶异源二聚体的小亚基差别较大.BsHepPPS合酶的底物结合口袋以疏水性为主,底物口袋邻近的残基Ala107/Ile104(位于大亚基HepT)和残基Asp97/Ser103(位于小亚基HepS)在对产物链长的调节中发挥着重要作用.BsHepPPS合酶的晶体结构信息揭示了C35萜类化合物合成起始的分子基础;结果为开展BsHepPPS合酶的蛋白质工程改造提供了理论基础,有助于利用该酶生产不同链长的萜类化合物. 展开更多
关键词 萜类化合物 异戊二烯基二磷酸合酶 晶体结构 底物结合口袋
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黑曲霉转录因子ACE1的功能分析及其对β-葡萄糖苷酶表达合成的影响
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作者 王硕 王昕 +3 位作者 叶伟 吕育财 马东旭 龚大春 《微生物学通报》 北大核心 2026年第1期238-253,共16页
【背景】ACE1转录因子广泛存在于产纤维素酶的丝状真菌中,然而其在黑曲霉(Aspergillus niger)中的调控功能有待明确。【目的】在A.niger中敲除和过表达转录因子ACE1,探究其对β-葡萄糖苷酶(β-glucosidase,BGL)表达、菌丝发育和色素合... 【背景】ACE1转录因子广泛存在于产纤维素酶的丝状真菌中,然而其在黑曲霉(Aspergillus niger)中的调控功能有待明确。【目的】在A.niger中敲除和过表达转录因子ACE1,探究其对β-葡萄糖苷酶(β-glucosidase,BGL)表达、菌丝发育和色素合成的调控作用。【方法】以A.niger An-1为出发菌株,利用CRISPR-Cas9基因编辑技术,获得敲除菌株∆ace1、过表达菌株Oace1。于不同诱导环境下,检测各菌株中的BGL酶活变化、菌丝生长、产孢情况及黄色素合成差异。【结果】系统发育树分析发现,A.niger与里氏木霉(Trichoderma reesei)、粗糙脉孢菌(Neurospora crassa)中ACE1的同源性较低。经原生质体转化法将操作质粒和供体片段同时导入,获得缺失突变菌株∆ace1。以微晶纤维素、玉米芯粉为诱导物,纤维二糖为检测底物时,菌株∆ace1的BGL酶活分别下降了86.1%、54.9%;以p-硝基苯酚-α-D-吡喃葡萄糖苷为检测底物时,菌株∆ace1的BGL酶活分别下降了23.7%、63.98%。组装过表达框Pgpd-ace1-Tgla,在kus A位点进行精准插入,成功获得过表达菌株Oace1。以微晶纤维素诱导时,过表达菌株Oace1的BGL酶活是野生菌株An-1的1.37-2.16倍。在以甜菊糖苷和微晶纤维素为碳源的培养基上,缺失菌株∆ace1的菌丝延伸迟缓、分生孢子梗分化延迟,而过表达菌株Oace1与菌株An-1的菌丝形态无差异。在以甜菊糖苷为碳源,进行固、液体培养时,敲除菌株∆ace1生物合成黄色素的能力显著加强。【结论】转录因子ACE1正向调控A.niger的BGL表达和产孢能力,负调控黄色素的合成,增强ACE1表达水平能够有效提升A.niger产BGL能力,本研究为优化A.niger的产酶性能提供新思路。 展开更多
关键词 黑曲霉 ACE1转录因子 Β-葡萄糖苷酶 孢子分化 黄色素
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微生物电解池促进厌氧产气研究进展
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作者 陈鸿伟 吴千云 +3 位作者 宋杨凡 厉彦民 付昱飞 何柳萍 《化学与生物工程》 北大核心 2025年第12期1-9,共9页
微生物电解池(MEC)在低品位能源处理与高级能源生产方面具有巨大潜力。基于MEC厌氧产气原理,分别从加速基质降解、促进难降解化合物和复杂底物降解、提升酶活性、优化微生物群落、强化直接电子传递效率等方面对MEC促进暗发酵和厌氧消化... 微生物电解池(MEC)在低品位能源处理与高级能源生产方面具有巨大潜力。基于MEC厌氧产气原理,分别从加速基质降解、促进难降解化合物和复杂底物降解、提升酶活性、优化微生物群落、强化直接电子传递效率等方面对MEC促进暗发酵和厌氧消化的产气机制进行了探讨,同时对暗发酵和厌氧消化的产气效果、COD去除率进行了对比,最后对MEC在有机废弃物资源化利用、可再生能源生产等领域的应用前景进行了展望。 展开更多
关键词 微生物电解池 暗发酵 厌氧消化 氢气 沼气
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木聚糖酶的大肠杆菌细胞表面展示 被引量:1
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作者 张谦 王宏宇 +5 位作者 赵世琦 彭海燕 吕奕霏 李佥 李宪臻 郭小宇 《微生物学通报》 北大核心 2025年第10期4527-4541,共15页
【背景】木聚糖酶的开发与利用一直是生物学研究的热点之一,但在木聚糖酶的工业应用和生产中存在酶的生产成本较高、游离状态的酶无法重复使用等问题,这些问题限制了木聚糖酶在工业生产中的应用。【目的】构建木聚糖酶(XynT6)在大肠杆菌... 【背景】木聚糖酶的开发与利用一直是生物学研究的热点之一,但在木聚糖酶的工业应用和生产中存在酶的生产成本较高、游离状态的酶无法重复使用等问题,这些问题限制了木聚糖酶在工业生产中的应用。【目的】构建木聚糖酶(XynT6)在大肠杆菌(Escherichia coli)BL21(DE3)中的表面展示菌株,以提高木聚糖酶的重复使用率,最终降低其纯化成本。【方法】通过无限制克隆法将来源于大肠杆菌外膜蛋白A(outer membrane protein A,OMPA)与来源于索诺拉沙漠芽孢杆菌(Bacillus sonorensis)的木聚糖酶XynT6融合,转入BL21(DE3)构建表面展示菌株LOXynB。利用3,5-二硝基水杨酸(3,5-dinitrosalicylic acid,DNS)比色定糖法对该表面展示酶的酶活力、酶学性质及展示系统的稳定性进行探究;利用SDS-PAGE、Western blotting、免疫荧光及流式细胞术鉴定木聚糖酶的表面展示。【结果】构建了木聚糖酶大肠杆菌表面展示菌株LOXynB,经DNS法测得表面展示的LOXynB的酶活力为1778 U/g,与游离形式的木聚糖酶表现出相似的酶学性质,该酶的K_(m)为(37.62±1.82)mmol,V_(max)为(0.49±0.01)mmol/min,较游离酶底物亲和力增强,最大反应速率显著增加;测得表面展示的LOXynB储存56 d循环使用16次依然保持较高的酶活力,结果表明LOXynB具有良好的储存稳定性及重复使用稳定性。【结论】本研究成功将XynT6展示于大肠杆菌表面,为木聚糖酶的工业化生产奠定了基础。 展开更多
关键词 木聚糖酶 表面展示 大肠杆菌 酶学性质
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