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基于转录组测序的新疆伊犁野生阿魏菇子实体发育及多糖合成相关基因的挖掘
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作者 木古丽·木哈西 玛依拉·吐尔地别克 +2 位作者 吾尔恩·阿合别尔迪 王广权 庞克坚 《食品工业科技》 北大核心 2026年第3期163-171,共9页
本研究通过转录组测序及生物信息学分析,探究了伊犁野生阿魏菇(Pleurotus ferulae)子实体和菌丝体阶段的基因表达差异,聚焦其子实体发育及多糖生物合成的分子机制。结果显示,在这两个阶段共表达了6458个基因,但菌丝体特有基因数量(12218... 本研究通过转录组测序及生物信息学分析,探究了伊犁野生阿魏菇(Pleurotus ferulae)子实体和菌丝体阶段的基因表达差异,聚焦其子实体发育及多糖生物合成的分子机制。结果显示,在这两个阶段共表达了6458个基因,但菌丝体特有基因数量(12218个)显著高于子实体(1022个),表明子实体特有基因驱动子实体形态发生和生物活性成分合成。进一步以菌丝体转录组为对照进行比较分析,发现子实体转录组中有5339个显著差异表达基因(DEGs)(上调60个,下调5279个),这些DEGs富集于碳水化合物代谢、能量代谢(氧化磷酸化、TCA循环)及遗传信息处理相关的通路中,揭示子实体发育伴随代谢活性的显著增强。此外,从73条KEGG通路中定位9条多糖合成相关通路,并从中鉴定出23个关键酶基因,其主要涉及丙酮酸代谢、淀粉和蔗糖代谢、糖酵解/葡萄糖生成及氨基糖和核苷酸糖代谢等途径,进一步明确了多糖合成的核心代谢节点。本研究首次构建了阿魏菇发育与多糖合成的分子调控框架,为解析其生物活性多糖合成机制、提升栽培效率与食品加工适应性,以及开发分子标记驱动的品质改良技术提供了关键理论依据和基因资源,为功能性食品开发(如多糖类增稠剂、营养强化剂)及食品工业中高附加值菌菇产品的定向培育奠定了分子基础。 展开更多
关键词 阿魏菇 转录组 差异分析 发育 多糖合成通路
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微生物发酵食品新进展 被引量:2
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作者 乌日娜 赵玉莲 +2 位作者 郭佳 史海粟 安飞宇 《微生物学杂志》 北大核心 2025年第1期1-13,共13页
本综述总结了微生物发酵食品领域的最新研究动态,重点探讨了合成生物学在微生物发酵中的应用,例如二氧化碳转化为淀粉和母乳寡糖生物合成技术的突破。同时,探讨了人工智能在发酵食品生产中的作用,特别是在微生物源鲜味肽开发中的应用,... 本综述总结了微生物发酵食品领域的最新研究动态,重点探讨了合成生物学在微生物发酵中的应用,例如二氧化碳转化为淀粉和母乳寡糖生物合成技术的突破。同时,探讨了人工智能在发酵食品生产中的作用,特别是在微生物源鲜味肽开发中的应用,为食品工业提供了创新的风味解决方案。而食药同源物质则通过微生物转化显著增强了其生物活性,为功能性食品的研发开辟了新方向。此外,还对微生物发酵功能食品的潜在风险进行了评估,并强调了风险防控的重要性。展望未来,微生物发酵食品的发展将更加注重技术创新、消费者健康需求的满足以及行业的可持续发展。 展开更多
关键词 发酵食品 合成生物学 人工智能 风味 食药同源 风险防控
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外源微量添加剂对金耳发酵液多糖含量的影响
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作者 秦鹏 赵玉卉 +4 位作者 赵小亮 郭瑞 杨阿丽 祁正华 胡永军 《微生物学杂志》 北大核心 2025年第4期57-65,共9页
本研究旨在探索不同外源微量添加剂对金耳(Naematelia aurantialba)发酵液胞内外总多糖含量的影响,筛选提高多糖含量的外源微量添加剂,为金耳多糖规模化生产提供参考。利用单因素实验研究13种添加剂对金耳发酵液多糖含量的影响,筛选促... 本研究旨在探索不同外源微量添加剂对金耳(Naematelia aurantialba)发酵液胞内外总多糖含量的影响,筛选提高多糖含量的外源微量添加剂,为金耳多糖规模化生产提供参考。利用单因素实验研究13种添加剂对金耳发酵液多糖含量的影响,筛选促进多糖积累程度最高的3种添加剂,采用响应面法优化其复合添加浓度。单因素实验结果显示,添加甘氨酸、KH_(2)PO_(4)、MgSO_(4)、KCl、KNO_(3)、VB_(2)显著提高了金耳发酵液多糖含量并且提高程度依次降低,其中甘氨酸、KH_(2)PO_(4)、MgSO_(4)提高多糖积累的程度最高,而ZnSO_(4)、CaCl_(2)显著抑制多糖积累并且抑制程度依次增加。响应面实验结果显示,在甘氨酸2.59 g/L、KH_(2)PO_(4)1.36 g/L、MgSO_(4)1.30 g/L的优化复合添加浓度条件下,金耳发酵液多糖含量达(2.659±0.131)g/L,比CK组提高67.02%,其中KH_(2)PO_(4)与MgSO_(4)的协同作用显著提高了金耳发酵液多糖含量。 展开更多
关键词 金耳 液体发酵 添加剂 多糖含量 响应面
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海洋细菌Alteromonas sp.A1-6中褐藻胶裂解酶Alg1264的酶学性质研究
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作者 肖长生 梁潼 +6 位作者 李静 董明俐 单凤娟 晁红军 李鑫 陈静 闫达中 《食品与发酵工业》 北大核心 2025年第21期95-104,共10页
以Alteromonas sp.A1-6的基因组为模板,PCR扩增目的基因alg1264,成功构建重组表达载体pET28a-alg 1264,实现了alg 1264的克隆表达,并对其编码的褐藻胶裂解酶Alg1264的酶学性质和水解产物开展了系统研究。Alg1264的最适pH值为7.0,在pH 5.... 以Alteromonas sp.A1-6的基因组为模板,PCR扩增目的基因alg1264,成功构建重组表达载体pET28a-alg 1264,实现了alg 1264的克隆表达,并对其编码的褐藻胶裂解酶Alg1264的酶学性质和水解产物开展了系统研究。Alg1264的最适pH值为7.0,在pH 5.0~11.0条件下保温1 h后相对酶活力仍能保持在77%以上;最适温度为35℃,在5~35℃保温30 min后相对酶活力仍能保持在86%以上;Mg^(2+)、Ni^(2+)对Alg1264的影响比较小,在5 mmol/L的浓度影响下,其活力维持在85%以上,Cu^(2+)对Alg1264活力基本没影响。Alg1264对有机试剂有良好的耐受性,在5 mmol/Lβ-巯基乙醇或者体积分数20%的二甲基亚砜的处理下,Alg1264的相对酶活力可以维持在80%以上;在5 mmol/L盐酸胍、TritonX-100或者体积分数20%的甲醇、乙醇以及异丙醇存在下,Alg1264的相对酶活力也能维持在60%以上。Alg1264对底物褐藻胶的最大反应速率V max为0.130μmol/min,米氏常数K m为4.034 mg/mL,k cat为52.653 s^(-1),k cat/K m为13.052 mL/(mg·s)。Alg1264对聚β-D-古罗糖醛酸(polyG)具有底物偏好性;液质分析结果显示该酶降解褐藻胶,聚甘露糖醛酸(polyM),polyG生成的终产物主要为单糖、二糖、三糖和少量其他寡糖,故Alg1264是一种同时具有内切和外切酶活力的聚古罗糖醛酸裂解酶。Alg1264具有较好的有机溶剂耐受性、pH稳定性,同时具有明显的聚古罗糖醛酸偏好性,该酶具备的独特性质可能使其在褐藻寡糖制备方面具有巨大的应用潜力。 展开更多
关键词 褐藻胶裂解酶 异源表达 酶学性质 聚古罗糖醛酸偏好性 耐有机试剂
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生物信息学和分子对接分析HuNoVs非结构蛋白NS3
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作者 王道 肖亚梅 刘丹 《微生物学杂志》 北大核心 2025年第1期85-95,共11页
为了深入探究人类诺如病毒(Human noroviruses,HuNoVs)的NS3非结构蛋白的结构特征和小分子药物,运用多种生物信息学方法ProtParam、ProtScale、SignalP 5.0、TMHMM 2.0、NCBI Conserved Domains、SOPMA、SWISS-MODEL、YinOYang 1.2、Net... 为了深入探究人类诺如病毒(Human noroviruses,HuNoVs)的NS3非结构蛋白的结构特征和小分子药物,运用多种生物信息学方法ProtParam、ProtScale、SignalP 5.0、TMHMM 2.0、NCBI Conserved Domains、SOPMA、SWISS-MODEL、YinOYang 1.2、NetPhos 3.1、ABCpred、SYFPEITHI、Prankweb和Discovery Studio等预测NS3蛋白的同源性、理化性质、翻译后修饰位点、二级/三级结构、B/T细胞抗原表位、活性口袋位点及抑制化合物。HuNoVs的NS3蛋白是由363个氨基酸组成的稳定亲水性蛋白,相对分子量为39748.79 Da,理论等电点为6.37;NS3蛋白与其他病毒解旋酶序列相似性为32.52%,无信号肽和跨膜结构,二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主,具有2个功能结构域,38个O-糖基化位点和21个磷酸化位点,7个B-细胞抗原表位和19个T-细胞抗原表位;还存在6个活性口袋位置和5个潜在的小分子抑制化合物。本文为阐明人类诺如病毒非结构蛋白NS3的结构和在病毒性肠胃炎中的作用机制提供了理论依据,也为研发和筛选新疫苗和药物奠定了基础。 展开更多
关键词 人类诺如病毒 非结构蛋白NS3 生物信息学 分子对接
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枯草芽孢杆菌异戊二烯基二磷酸合酶的晶体结构
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作者 罗爽 刘忠川 +2 位作者 金赟 谢天 王刚刚 《应用与环境生物学报》 北大核心 2025年第7期1026-1032,共7页
萜类化合物(terpenoids)是种类最为繁多、结构最为丰富的天然产物,目前对倍半萜、二萜和多萜类化合物的合成研究较多,而对C_(35)萜类化合物的合成了解较少.在枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)中,C_(35)萜类化合物经由三步催化合成途径生... 萜类化合物(terpenoids)是种类最为繁多、结构最为丰富的天然产物,目前对倍半萜、二萜和多萜类化合物的合成研究较多,而对C_(35)萜类化合物的合成了解较少.在枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)中,C_(35)萜类化合物经由三步催化合成途径生成,催化第一步反应的酶是异戊二烯基二磷酸合酶(heptaprenyl diphosphate synthase,BsHepPPS合酶),催化双底物异戊烯基二磷酸(isopentenyl pyrophosphate,IPP)和法尼基二磷酸(farnesyl pyrophosphate,FPP)合成C_(35)直链化合物.为探讨BsHepPPS合酶的催化机制,利用X-射线晶体衍射技术解析枯草芽孢杆菌BsHepPPS合酶的三维晶体结构,分辨率2.48A(1A=10-10m).该酶为异源二聚体,包含HepT大亚基和HepS小亚基.大亚基HepT含两个催化活性中心区域FARM和SARM,关键催化残基高度保守.相比之下,HepS小亚基则与其他HepPPS合酶异源二聚体的小亚基差别较大.BsHepPPS合酶的底物结合口袋以疏水性为主,底物口袋邻近的残基Ala107/Ile104(位于大亚基HepT)和残基Asp97/Ser103(位于小亚基HepS)在对产物链长的调节中发挥着重要作用.BsHepPPS合酶的晶体结构信息揭示了C35萜类化合物合成起始的分子基础;结果为开展BsHepPPS合酶的蛋白质工程改造提供了理论基础,有助于利用该酶生产不同链长的萜类化合物. 展开更多
关键词 萜类化合物 异戊二烯基二磷酸合酶 晶体结构 底物结合口袋
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微生物电解池促进厌氧产气研究进展
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作者 陈鸿伟 吴千云 +3 位作者 宋杨凡 厉彦民 付昱飞 何柳萍 《化学与生物工程》 北大核心 2025年第12期1-9,共9页
微生物电解池(MEC)在低品位能源处理与高级能源生产方面具有巨大潜力。基于MEC厌氧产气原理,分别从加速基质降解、促进难降解化合物和复杂底物降解、提升酶活性、优化微生物群落、强化直接电子传递效率等方面对MEC促进暗发酵和厌氧消化... 微生物电解池(MEC)在低品位能源处理与高级能源生产方面具有巨大潜力。基于MEC厌氧产气原理,分别从加速基质降解、促进难降解化合物和复杂底物降解、提升酶活性、优化微生物群落、强化直接电子传递效率等方面对MEC促进暗发酵和厌氧消化的产气机制进行了探讨,同时对暗发酵和厌氧消化的产气效果、COD去除率进行了对比,最后对MEC在有机废弃物资源化利用、可再生能源生产等领域的应用前景进行了展望。 展开更多
关键词 微生物电解池 暗发酵 厌氧消化 氢气 沼气
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幽门螺杆菌CagA诱导胃部炎癌转化的研究进展 被引量:4
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作者 顾晓 邢莹莹 《中国药科大学学报》 北大核心 2025年第1期132-138,共7页
幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,Hp)目前已被列为能导致胃癌发生的Ⅰ类致病菌,近年来,对于幽门螺杆菌感染如何引起胃癌的发生和发展的研究备受瞩目。细胞毒力相关基因A(CagA)作为Hp的首要毒力因子,目前已经有大量研究报道其可以作为Hp... 幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,Hp)目前已被列为能导致胃癌发生的Ⅰ类致病菌,近年来,对于幽门螺杆菌感染如何引起胃癌的发生和发展的研究备受瞩目。细胞毒力相关基因A(CagA)作为Hp的首要毒力因子,目前已经有大量研究报道其可以作为Hp产生胃部感染、定植以及促使宿主细胞发生炎癌转化等的关键外分泌毒素发挥功能,感染CagA阳性菌株的患者相比于CagA阴性菌株感染患者具有更高患肿瘤的概率。本文基于前期研究,从毒力蛋白CagA的递送方式、生物活性、免疫调控以及相关分子机制层面对Hp感染所诱导胃癌的发生以及发展过程进行阐述。 展开更多
关键词 胃癌 幽门螺杆菌 CAGA 炎癌转化 分子机制
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太阳能驱动的无机半导体-微生物杂化体系在二氧化碳固定和生物制造中的应用 被引量:3
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作者 何为 席京 +2 位作者 贺天培 陈娜 袁荃 《无机化学学报》 北大核心 2025年第1期35-44,共10页
随着全球经济的快速发展,传统化石能源消耗显著增加,导致了二氧化碳(CO_(2))的大量排放,这对自然生态造成了显著的影响。近年来,由太阳能驱动的以大气中CO_(2)为原料的第3代绿色生物制造技术引起了全球广泛关注。过去数年间,研究者们在... 随着全球经济的快速发展,传统化石能源消耗显著增加,导致了二氧化碳(CO_(2))的大量排放,这对自然生态造成了显著的影响。近年来,由太阳能驱动的以大气中CO_(2)为原料的第3代绿色生物制造技术引起了全球广泛关注。过去数年间,研究者们在太阳能驱动的无机半导体-微生物杂化体系领域开展了大量的工作,这对CO_(2)固定以及生物制造领域具有深远的影响。本综述围绕如何构筑高性能无机半导体-微生物杂化体系,分别从无机半导体材料的结构性能优化、无机半导体-微生物界面的构筑以及微生物代谢通路的定向重构3个维度进行了全面综述。最后,本综述展望了无机半导体-微生物杂化体系领域的发展趋势。 展开更多
关键词 半导体-微生物杂化体系 CO_(2)固定 生物制造
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高活性脂肪酶的发掘、评价及在甘油二脂合成中应用 被引量:1
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作者 徐远志 胡珊 +3 位作者 代思泽 游帅 郑明明 单凯 《生物技术通报》 北大核心 2025年第11期177-189,共13页
【目的】针对国产脂肪酶催化效率低、热稳定性差等问题,筛选高活性脂肪酶菌株,解析催化特性用于酶法高效制备甘油二酯。【方法】采用中性红橄榄油平板初筛及对硝基苯酚比色法复筛的方法,从富含油脂的土壤中筛选高产脂肪酶菌株,结合形态... 【目的】针对国产脂肪酶催化效率低、热稳定性差等问题,筛选高活性脂肪酶菌株,解析催化特性用于酶法高效制备甘油二酯。【方法】采用中性红橄榄油平板初筛及对硝基苯酚比色法复筛的方法,从富含油脂的土壤中筛选高产脂肪酶菌株,结合形态学与16S rDNA序列分析进行菌种鉴定,通过PCR扩增获得高活性脂肪酶基因序列,探究其酶学性质,建立无溶剂体系评价其甘油二酯合成效率。【结果】从18份土壤样品中成功发掘到一株高产脂肪酶菌株E12C,胞外酶活为(80826.4±1838.9)U/L,经形态学与16S rDNA序列鉴定为洋葱伯克霍尔德菌(Burkholderia cepacia),命名为B.cepacian OCRI-Lip100,已保藏于中国典型培养物保藏中心。该脂肪酶命名为Lip-12c,最适反应温度为60℃、最适反应pH为9.0,在此条件下酶活为(190761.2±5181.5)U/L,比活力为(39254.5±271.3)U/g蛋白,显著高于进口脂肪酶,在40-70℃和pH 5.0-10.0范围可维持较高活性,金属离子Na^(+)和Mg^(2+)对酶活性提升效果显著。在无溶剂体系中40℃酶法水解橄榄油4 h,甘油二酯含量达33.5%。【结论】土壤中发掘的高产脂肪酶菌株B.cepacian OCRI-Lip100,在无溶剂体系中展现高效的甘油二酯合成能力,不仅丰富了现有脂肪酶菌种资源库,还为功能脂质的高效生物制造提供了技术支撑。 展开更多
关键词 脂肪酶 洋葱伯克霍尔德菌 分离鉴定 酶学性质 甘油二酯
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鲁甸青花椒精油对金黄色葡萄球菌的抑菌活性及机制研究 被引量:1
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作者 舒娟 张雪研 +1 位作者 宋爽 范江平 《食品工业科技》 北大核心 2025年第23期178-189,共12页
为进一步揭示青花椒精油(Zanthoxylum schinifolium essential oils,ZSEOs)对金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus,SA)的抑菌作用机制,本研究以鲁甸县青花椒为原料,采用超临界CO_(2)萃取法提取ZSEOs,利用气相色谱-质谱法(Gas chromato... 为进一步揭示青花椒精油(Zanthoxylum schinifolium essential oils,ZSEOs)对金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus,SA)的抑菌作用机制,本研究以鲁甸县青花椒为原料,采用超临界CO_(2)萃取法提取ZSEOs,利用气相色谱-质谱法(Gas chromatography-mass spectrometry,GC-MS)鉴定其成分,并在对SA抑菌活性评价的基础上,从菌体生长繁殖、壁膜损伤、与DNA和蛋白质作用及能量代谢4个方面来揭示ZSEOs对SA的抑菌机制。结果表明:ZSEOs中共有65种挥发性成分,主要成分为芳樟醇;其对SA的最小抑菌浓度(Minimum inhibitory concentration,MIC)和最低杀菌浓度(Minimum bactericidal concentration,MBC)分别为6.25、12.5μL/mL,抑菌圈直径大小为11.67±0.55 mm;ZSEOs处理后SA表面疏水性提高、Zeta电位值降低,对壁膜造成损伤,内容物碱性磷酸酶(AKP)、蛋白质大分子发生泄漏;SDS-PAGE电泳、紫外吸收光谱及分子对接模拟实验表明,ZSEOs及其主成分芳樟醇能与DNA发生结合,与蛋白发生作用,从而影响菌体的核酸代谢,干扰蛋白正常生理功能及能量供应,进而达到对SA的抑菌效果。综上所述,ZSEOs通过诱导SA壁膜损伤,使内容物发生泄漏,并与核酸、蛋白发生相互作用,影响SA生理代谢,从而发挥抑菌作用。 展开更多
关键词 青花椒精油(ZSEOs) 芳樟醇 金黄色葡萄球菌(SA) 抑菌活性 抑菌机制
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根癌农杆菌甲氧基脱甲基酶Atu1420的酶学特性表征和定向进化 被引量:1
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作者 王浩 曹安妮 +1 位作者 高欣怡 郭敏亮 《生物技术通报》 北大核心 2025年第3期319-329,共11页
【目的】原儿茶酸是一种应用广泛的酚类化合物,生物合成法生产原儿茶酸是替代高污染的化学合成法的潜在方案,寻找和改良合成原儿茶酸的酶是生物合成法的关键。根癌农杆菌甲氧基脱甲基酶Atu1420是一种能够将香草酸转化为原儿茶酸的酶,本... 【目的】原儿茶酸是一种应用广泛的酚类化合物,生物合成法生产原儿茶酸是替代高污染的化学合成法的潜在方案,寻找和改良合成原儿茶酸的酶是生物合成法的关键。根癌农杆菌甲氧基脱甲基酶Atu1420是一种能够将香草酸转化为原儿茶酸的酶,本研究旨在表征Atu1420的酶学特性,并对其进行改良。【方法】通过大肠杆菌表达了Atu1420,并利用高效液相色谱等方法测定了Atu1420的酶学特性。基于Atu1420的预测结构和催化机制,选择了19个位点对Atu1420进行了定点突变,利用4-氨基安替比林开发了一种可视化检测Atu1420催化活性的方法,用于筛选Atu1420定点突变的变异体。利用alpha Fold对Atu1420变异体的结构进行预测,分析了变异体催化效率提升的潜在机制。【结果】确定了Atu1420的V_(max)为33.5±1.6 nmol/(L·s),米氏常数K_(m)为82.7±3.5μmol/L,转换数k_(cat)为(6.7±0.3)×10^(-1) s^(-1),k_(cat)/K_(m)为8.1×10^(-3) L/(μmol·s),最适p H在7-8之间,最适温度为30℃。本研究在定点突变的变异体中筛选出了5个酶活力增强的变异体,其中活力最强的变异体为G35S,其催化速度比野生型提高66.0%。对这5个位点进行组合突变,在酶活力方面并没有产生明显的叠加效应。结构的比对分析暗示121位精氨酸残基角度的偏转可能是造成变异体催化效率提升的原因。【结论】Atu1420的酶学特性得到了有效的表征,获得了5个催化效率提高的Atu1420变异体,变异体催化效率的提高可能是121位精氨酸残基角度的偏转造成的。 展开更多
关键词 甲氧基脱甲基酶 酶学特性 催化效率 原儿茶酸 香草酸
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北部湾珊瑚共附生真菌Cladosporium sp.SCSIO41206次级代谢产物研究
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作者 王梦芹 帖青清 +3 位作者 黄晓雯 杨斌 刘永宏 李云秋 《广西科学》 北大核心 2025年第2期313-321,共9页
本研究基于单菌多次级代谢产物(OSMAC)策略对一株北部湾珊瑚共附生真菌Cladosporium sp.SCSIO41206中的次级代谢产物进行探究,采用文献数据比对的方法对化合物结构进行鉴定,并对化合物进行酶抑制活性和抗菌活性筛选。结果表明,共分离鉴... 本研究基于单菌多次级代谢产物(OSMAC)策略对一株北部湾珊瑚共附生真菌Cladosporium sp.SCSIO41206中的次级代谢产物进行探究,采用文献数据比对的方法对化合物结构进行鉴定,并对化合物进行酶抑制活性和抗菌活性筛选。结果表明,共分离鉴定出11个化合物:3-isobutylhexahydropyrrolo (1,2-a) pyrazine-1,4-dione (1)、3-benzyl-7-hydroxyhexahydropyrrolo (1,2-a) pyrazine-1,4-dione (2)、环(L-丙氨酸-L-4-羟基-脯氨酸)二肽(3)、环(L-脯氨酸-甘氨酸)二肽(4)、cyclo(D)-Pro-(D)-Ile (5)、环(L-苯丙-甘)二肽(6)、cyclo-(4-S-hydroxy-R-proline-R-isoleucine)(7)、N-phenethylacetamide (8)、N-hydroxy-2-(hydroxyimino)-4-methylpentanamide (9)、quinolactacin A1 (10)、quinolactacin A2 (11),化合物1-11均是首次从北部湾珊瑚来源的枝孢菌属(Cladosporium sp.)中分离获得。活性测试结果表明,化合物2-4、8、10和11对乙酰胆碱酯酶有弱的抑制活性;化合物4、8对胰脂肪酶具有较弱的抑制活性,化合物1-3、5、7、9-11对胰脂肪酶具有弱的抑制活性,化合物6对胰脂肪酶有中等的抑制活性;未筛查到相关的抗菌活性。本研究结果揭示了北部湾枝孢菌属真菌次级代谢产物的多样性特征,可为抗肥胖药物的研发奠定重要的理论基础。 展开更多
关键词 枝孢菌属 次级代谢产物 分离纯化 结构鉴定 酶抑制活性
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异源表达磷脂酶D调控裂殖壶菌磷脂代谢对脂质合成的影响
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作者 童俊 陆涛 +2 位作者 卢英华 陈翠雪 凌雪萍 《食品科学》 北大核心 2025年第22期213-226,共14页
本研究探究异源过表达抗生链霉菌磷脂酶D(phospholipase D,PLD)基因(SaPLD)对裂殖壶菌脂质合成的影响。结果表明,异源表达SaPLD在发酵后期抑制了裂殖壶菌的细胞生长,但明显提高了总油产量和单位细胞的油脂含量。当对SaPLD过表达菌株进... 本研究探究异源过表达抗生链霉菌磷脂酶D(phospholipase D,PLD)基因(SaPLD)对裂殖壶菌脂质合成的影响。结果表明,异源表达SaPLD在发酵后期抑制了裂殖壶菌的细胞生长,但明显提高了总油产量和单位细胞的油脂含量。当对SaPLD过表达菌株进行盐胁迫(12 g/L NaCl)培养时,其最终生物量恢复到野生型菌株的水平,也进一步促进了油脂合成,表明盐胁迫作用可以缓解PLD过表达对菌体的细胞毒性。脂肪酸分析表明SaPLD的过表达提高了饱和脂肪酸的占比,降低了多不饱和脂肪酸的占比,其中二十二碳六烯酸(docosahexaenoic acid,DHA)占比极显著降低,但促进了二十碳五烯酸(eicosapentaenoic acid,EPA)的合成,EPA产量和单位细胞EPA含量分别比野生型提高了约43%和约70%。磷脂组学和基因转录水平分析表明SaPLD在裂殖壶菌中更多地发挥水解作用,其过表达增强了磷脂的水解,促进了磷脂酸的生成,从而提高Kennedy途径合成甘油三酯的通量。综上,EPA合成与饱和脂肪酸合成途径呈正相关,而DHA的减少可能与PLD引起的磷脂水解代谢有关。本研究表明裂殖壶菌中磷脂代谢的调控会影响细胞的生长和油脂合成,并改变多不饱和脂肪酸的合成偏好,这为改造裂殖壶菌生产EPA的研究提供了新的策略。 展开更多
关键词 裂殖壶菌 磷脂酶D 磷脂代谢 二十二碳六烯酸 二十碳五烯酸
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木聚糖酶的大肠杆菌细胞表面展示
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作者 张谦 王宏宇 +5 位作者 赵世琦 彭海燕 吕奕霏 李佥 李宪臻 郭小宇 《微生物学通报》 北大核心 2025年第10期4527-4541,共15页
【背景】木聚糖酶的开发与利用一直是生物学研究的热点之一,但在木聚糖酶的工业应用和生产中存在酶的生产成本较高、游离状态的酶无法重复使用等问题,这些问题限制了木聚糖酶在工业生产中的应用。【目的】构建木聚糖酶(XynT6)在大肠杆菌... 【背景】木聚糖酶的开发与利用一直是生物学研究的热点之一,但在木聚糖酶的工业应用和生产中存在酶的生产成本较高、游离状态的酶无法重复使用等问题,这些问题限制了木聚糖酶在工业生产中的应用。【目的】构建木聚糖酶(XynT6)在大肠杆菌(Escherichia coli)BL21(DE3)中的表面展示菌株,以提高木聚糖酶的重复使用率,最终降低其纯化成本。【方法】通过无限制克隆法将来源于大肠杆菌外膜蛋白A(outer membrane protein A,OMPA)与来源于索诺拉沙漠芽孢杆菌(Bacillus sonorensis)的木聚糖酶XynT6融合,转入BL21(DE3)构建表面展示菌株LOXynB。利用3,5-二硝基水杨酸(3,5-dinitrosalicylic acid,DNS)比色定糖法对该表面展示酶的酶活力、酶学性质及展示系统的稳定性进行探究;利用SDS-PAGE、Western blotting、免疫荧光及流式细胞术鉴定木聚糖酶的表面展示。【结果】构建了木聚糖酶大肠杆菌表面展示菌株LOXynB,经DNS法测得表面展示的LOXynB的酶活力为1778 U/g,与游离形式的木聚糖酶表现出相似的酶学性质,该酶的K_(m)为(37.62±1.82)mmol,V_(max)为(0.49±0.01)mmol/min,较游离酶底物亲和力增强,最大反应速率显著增加;测得表面展示的LOXynB储存56 d循环使用16次依然保持较高的酶活力,结果表明LOXynB具有良好的储存稳定性及重复使用稳定性。【结论】本研究成功将XynT6展示于大肠杆菌表面,为木聚糖酶的工业化生产奠定了基础。 展开更多
关键词 木聚糖酶 表面展示 大肠杆菌 酶学性质
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阿魏酸诱导污叉丝孔菌漆酶活性提升
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作者 吴洁 李静 +1 位作者 罗锋 常鹏 《微生物学报》 北大核心 2025年第9期4088-4100,共13页
【目的】探究阿魏酸对污叉丝孔菌漆酶活性的影响及其分子机制,为微生物降解芳香族化合物提供理论依据。【方法】通过在合成培养基中添加不同浓度的阿魏酸,观察其对污叉丝孔菌生长和漆酶活性的影响;利用转录组和蛋白组技术分析阿魏酸诱... 【目的】探究阿魏酸对污叉丝孔菌漆酶活性的影响及其分子机制,为微生物降解芳香族化合物提供理论依据。【方法】通过在合成培养基中添加不同浓度的阿魏酸,观察其对污叉丝孔菌生长和漆酶活性的影响;利用转录组和蛋白组技术分析阿魏酸诱导下漆酶的转录和蛋白表达水平变化;通过RNAi技术敲降lcc3基因,检测其对漆酶活性及降解多种芳香族化合物能力的影响;利用自建的基于高斯萤光素酶和Nano萤光素酶的双萤光素酶系统鉴定lcc3基因的核心启动子区。【结果】适量添加阿魏酸可显著提高污叉丝孔菌的漆酶活性。转录组和蛋白组分析发现,lcc3基因在阿魏酸诱导下转录水平和表达水平均显著上调。lcc3基因敲降菌株的漆酶活性及降解多种芳香族化合物的活性均显著下降,证实lcc3是污叉丝孔菌降解芳香族化合物相关的漆酶活性的关键基因。此外,通过双萤光素酶系统成功鉴定出lcc3基因的核心启动子区。【结论】本研究揭示了阿魏酸对污叉丝孔菌漆酶活性的诱导作用及其分子机制,证明lcc3基因是阿魏酸诱导的漆酶活性及降解芳香族化合物的关键基因。鉴定lcc3基因核心启动子区为进一步地基因表达调控研究提供了基础,并为微生物漆酶降解芳香族化合物的应用提供了理论支持。 展开更多
关键词 污叉丝孔菌 阿魏酸 漆酶 lcc3 RNAI 双萤光素酶
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三门峡烟株内生放线菌分离及拮抗促生菌株筛选和鉴定
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作者 朱凯 何雷 +4 位作者 杨建新 杨晋燕 王俊 康业斌 徐建强 《农药学学报》 北大核心 2025年第4期747-754,共8页
为了从烟株内筛选出具有拮抗烟草疫霉和促进植物生长特性的内生放线菌,本研究采用组织分离法对来自三门峡地区的健康烟株进行了内生放线菌的分离、纯化,并分析了烟株不同生长时期和不同组织的菌株分离情况;通过平板对峙培养法初筛和菌... 为了从烟株内筛选出具有拮抗烟草疫霉和促进植物生长特性的内生放线菌,本研究采用组织分离法对来自三门峡地区的健康烟株进行了内生放线菌的分离、纯化,并分析了烟株不同生长时期和不同组织的菌株分离情况;通过平板对峙培养法初筛和菌丝生长速率法复筛,评估内生放线菌拮抗烟草疫霉的活性;采用Salkowski比色液显色法测定菌株产3-吲哚乙酸(IAA)能力;综合形态学、生理生化特征和分子生物学鉴定确定拮抗促生菌株的分类地位。结果表明,从4个采样点的团棵期、旺长期、采收期烟株的根、茎、叶中共分离获得250株内生放线菌;烟株不同部位分离的菌株占比为:根部>叶部>茎部,分别为68.80%、19.20%和12.00%;烟株不同生长时期分离的菌株占比为:团棵期>旺长期>采收期,分别为47.20%、42.40%和10.40%;初筛获得对烟草疫霉拮抗活性60%以上的菌株共64株,复筛获得对烟草疫霉有拮抗活性的菌株8株,抑制率为16.06%~70.89%;产IAA能力的菌株7株,产量为17.15~40.09μg/mL;结合初筛和复筛抑菌率以及IAA产量,将T-66和C-77确定为候选菌株,分别鉴定为草原链霉菌(Streptomyces pratensis)和娄彻链霉菌(S. rochei)。本研究筛选到的2个菌株为烟草黑胫病的生物防治提供了新的菌种资源。 展开更多
关键词 烟草黑胫病 烟草疫霉 内生放线菌 抑菌活性 生长促进
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基于二维凝胶电泳和质谱分析微泡菌ALW1代谢三种海带多糖的蛋白质组
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作者 李鹤宾 吴婷 +4 位作者 洪璇 黄秀梅 熊维德 倪辉 朱艳冰 《现代食品科技》 北大核心 2025年第11期332-340,共9页
为了阐明海带降解微泡菌ALW1代谢海带多糖的分子机理,本研究进行ALW1菌株代谢海带多糖的蛋白质组研究,利用二维凝胶电泳(2-DE)和质谱(MS)技术鉴定菌株ALW1代谢三种多糖(昆布多糖、岩藻多糖和果胶)的差异蛋白质。二维凝胶电泳显示了202... 为了阐明海带降解微泡菌ALW1代谢海带多糖的分子机理,本研究进行ALW1菌株代谢海带多糖的蛋白质组研究,利用二维凝胶电泳(2-DE)和质谱(MS)技术鉴定菌株ALW1代谢三种多糖(昆布多糖、岩藻多糖和果胶)的差异蛋白质。二维凝胶电泳显示了202个差异表达的蛋白质斑点,利用质谱最终鉴定了161个蛋白质。聚类分析结果表明,以昆布多糖为碳源培养的细胞内蛋白,与岩藻多糖和果胶培养的细胞内蛋白相比,共鉴定出35种上调蛋白;以岩藻多糖为碳源培养的细胞内蛋白与其他两种蛋白样品相比,共鉴定出88种上调蛋白;以果胶为碳源培养的细胞内蛋白与其他两种蛋白样品相比,共鉴定出68种上调蛋白。GO分析表明,差异表达蛋白质在细胞成分上主要集中在细胞和细胞组成部分,在分子功能上主要集中在催化活性和结合功能上,并且主要参与细胞过程和生物体中的代谢过程。微泡菌ALW1代谢不同海带多糖的蛋白质组研究为该菌株代谢多糖的分子机理,以及利用该菌株生产海带低聚糖和寡糖奠定理论基础。 展开更多
关键词 比较蛋白质组学 微泡菌ALW1 海带多糖 二维凝胶电泳
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链霉菌中双组分系统调控次级代谢产物合成的研究进展
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作者 刘子越 王娇 +2 位作者 赵乐 刘大群 李亚宁 《微生物学报》 北大核心 2025年第8期3468-3491,共24页
链霉菌能够产生多种活性次级代谢产物,可广泛应用于医疗、工业、农业等领域。链霉菌调控次级代谢产物的基因包括途径特异性、多效性以及全局性调控基因。其中,双组分系统作为原核生物中的主要信号转导系统,参与链霉菌的多种生理生化反应... 链霉菌能够产生多种活性次级代谢产物,可广泛应用于医疗、工业、农业等领域。链霉菌调控次级代谢产物的基因包括途径特异性、多效性以及全局性调控基因。其中,双组分系统作为原核生物中的主要信号转导系统,参与链霉菌的多种生理生化反应,并可对次级代谢产物进行全局性调控。特定双组分系统基因的缺失或过表达可显著影响次级代谢产物的生物合成。鉴定双组分系统的功能并揭示其调控机制,有助于通过基因工程手段提高次级代谢产物的生产效率。本文总结了近年来微白黄链霉菌等多种链霉菌中双组分系统的研究现状,尤其对其次级代谢产物合成的调控机制进行了总结和阐述。 展开更多
关键词 链霉菌 双组分系统 次级代谢产物 调控机制
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转录物组和代谢组学探究高盐胁迫对Virgibacillus salexigens羟基四氢嘧啶合成通路的影响 被引量:3
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作者 董梦瑶 龙启福 +2 位作者 邢江娃 高翔 李永臻 《中国生物化学与分子生物学报》 北大核心 2025年第4期586-596,共11页
为了探究高盐对需盐枝芽胞杆菌(Virgibacillus salexigens)合成5-HE代谢通路影响及调控机制,在菌株V.salexigens培养基中分别添加1.5和2.5 mol/L NaCl作为对照组和实验组。利用HPLC检测5-HE的合成量差异,采用转录物组学和代谢组学技术分... 为了探究高盐对需盐枝芽胞杆菌(Virgibacillus salexigens)合成5-HE代谢通路影响及调控机制,在菌株V.salexigens培养基中分别添加1.5和2.5 mol/L NaCl作为对照组和实验组。利用HPLC检测5-HE的合成量差异,采用转录物组学和代谢组学技术分析V.salexigens在不同盐浓度下的差异基因和差异代谢物,并用qRT-PCR验证与5-HE合成密切相关的差异基因。结果显示,当NaCl浓度为2.5 mol/L时,5-HE合成量达到最大,为121.9 mg/L;转录物组测得652个差异基因(涉及348个KEGG通路),其中上调基因210个,下调基因442个,主要富集在嘌呤代谢、苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸的生物合成、丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢、硫代谢和生物素代谢等通路。qRT-PCR验证结果显示,与5-HE合成相关的13个基因(lysC、asd、ectA、ectB、ectC、ectD、thrB、thrC、ilvA、ilvE、AGXT、YckA和GlnQ)表达量与转录物组测序数据的趋势一致;代谢组学分析共鉴定到1153个代谢物,主要富集在组氨酸代谢、赖氨酸的降解以及精氨酸和脯氨酸的代谢等通路。本研究初步阐明了高盐胁迫对5-HE合成通路的影响,为后续构建5-HE高产菌株提供了参考依据。 展开更多
关键词 需盐枝芽胞杆菌(Virgibacillus salexigens) 高盐胁迫 转录物组学 代谢组学 羟基四氢嘧啶合成通路
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