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微生物学通报2025年度优秀编委
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作者 周宁一 《微生物学通报》 北大核心 2026年第1期I0005-I0005,共1页
为了感谢和表彰编委们在审稿、投稿、宣传期刊、组织主题刊/专栏等方面的突出贡献,《微生物学通报》编辑部经过统计各项数据提交主编核定,评选出《微生物学通报》2025年度优秀编委。按姓名拼音排序。
关键词 微生物学通报 宣传期刊 投稿 审稿 编委
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绿色木霉产内切葡聚糖酶的分离纯化及其酶学性质
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作者 李永丽 胡建华 刘占英 《内蒙古工业大学学报(自然科学版)》 2026年第2期113-120,共8页
绿色木霉(Trichoderma viride,CICC13002)中的内、外切葡聚糖酶的相对分子质量及等电点差别很小,将内切葡聚糖酶分离出来较为困难。采用盐析、透析、凝胶过滤层析的方法从绿色木霉发酵液中分离纯化内切葡聚糖酶,利用SDS-PAGE电泳对其纯... 绿色木霉(Trichoderma viride,CICC13002)中的内、外切葡聚糖酶的相对分子质量及等电点差别很小,将内切葡聚糖酶分离出来较为困难。采用盐析、透析、凝胶过滤层析的方法从绿色木霉发酵液中分离纯化内切葡聚糖酶,利用SDS-PAGE电泳对其纯度和相对分子质量进行检测,探究温度和pH对酶活的影响。经分离纯化得到内切葡聚糖酶相对分子质量为41.7 ku,纯化倍数为4.50,回收率为33.71%,比酶活力达到22.94 U/mg。该酶最适作用温度为50℃,最适pH为7.0。温度低于60℃时、pH在6.0~8.0之间该酶具有良好的热稳定性和酸碱稳定性,相对酶活保持在70%以上。动力学参数K_(m)和v_(max)分别为14.4 mg/mL、0.0546 mg/(mL·min)。结果显示,利用盐析沉淀、透析、凝胶过滤层析的分离方法对绿色木霉(CICC13002)产生的内切葡聚糖酶具有较好的分离纯化效果,为后续研究金属离子对该酶的影响提供数据支撑。 展开更多
关键词 绿色木霉 内切葡聚糖酶 分离纯化 酶学性质
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微生物学通报2024年度优秀论文
3
作者 周宁一 《微生物学通报》 北大核心 2026年第1期I0002-I0002,共1页
为了鼓励和表彰优秀作者,吸引优秀科研成果在我刊首发,提升《微生物学通报》的学术影响力,编辑部在2024年度发表的论文当中,依据论文的传播数据,并结合专家的评审意见,评选出了10篇2024年度优秀学术论文,并颁发优秀学术论文证书。
关键词 优秀论文 2024年度 微生物学通报
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EGCG干预大鼠肝癌形成过程中对肠道菌群结构的影响
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作者 唐艳萍 蔡政民 +3 位作者 唐亚梅 唐嘉营 李霜 李科志 《中国肿瘤生物治疗杂志》 北大核心 2026年第2期190-198,共9页
目的:探讨绿茶单体表没食子儿茶素没食子酸酯(EGCG)对大鼠肝癌发生过程中肠道菌群结构变化的影响。方法:建立二乙基亚硝胺(DEN)诱导的肝癌大鼠模型。将26只SD大鼠随机分成3组,分别为正常对照组、肝癌组和EGCG干预组。从实验开始第1天起,... 目的:探讨绿茶单体表没食子儿茶素没食子酸酯(EGCG)对大鼠肝癌发生过程中肠道菌群结构变化的影响。方法:建立二乙基亚硝胺(DEN)诱导的肝癌大鼠模型。将26只SD大鼠随机分成3组,分别为正常对照组、肝癌组和EGCG干预组。从实验开始第1天起,EGCG干预组每日给予EGCG(40 mg/kg)灌胃,正常对照组和肝癌组给予等量生理盐水灌胃,1次/日,持续至第20周。灌胃结束后,采集大鼠粪便样本,提取DNA,进行高通量16S rRNA V3-V4区测序;处死大鼠,取肝,观察肿瘤形成情况,并计算肝癌发生率。对测序数据进行生物信息学分析:经质控、聚类获得操作分类单元(OTU)表,据此计算α多样性指数(包括Observed species、Chao1、Shannon和Simpson指数),并进行β多样性分析。同时,对物种进行分类学注释,比较各组间菌群组成与丰度差异。结果:EGCG干预组大鼠(8只)肝脏肿瘤形成率明显低于肝癌组(10只)(50%vs 100%,P=0.023),正常对照组(8只)大鼠无肿瘤发生。在肠道菌群方面,肝癌组操作分类单元(OTU)数量远低于正常对照组(P<0.001),而EGCG干预组OTU数量总体上高于肝癌组(P=0.021)。α多样性分析显示,肝癌组Shannon指数低于正常对照组(P<0.05);此外,与肝癌组相比,EGCG干预组的Observed species指数、Chao1指数、Shannon指数和Simpson指数均显著提高(P<0.05)。β多样性分析及主坐标分析(PCoA)表明,三组肠道菌群结构存在显著分离(PERMANOVA,R^(2)=0.3918,P=0.001),其中EGCG干预组群落结构介于肝癌组与正常对照组之间,并更接近于正常对照组。肝癌组大鼠较正常大鼠肠道菌群中链球菌等潜在致病菌富集,丁酸产生相关菌(如丁酸球菌属、瘤胃球菌属等)丰度显著降低(P<0.05)。相比之下,在EGCG干预肝癌发生过程中,大鼠肠道菌群结构相对稳定。厚壁菌门/拟杆菌门比值较肝癌组显著提高(P<0.05),益生菌(如双歧杆菌属、乳杆菌属等)和丁酸产生相关菌(如丁酸球菌属)富集。结论:EGCG干预可降低DEN诱导的大鼠肝癌发生率,并有助于稳定肠道菌群结构,其作用可能与增加菌群多样性、促进益生菌及丁酸产生菌富集、恢复菌群平衡有关。 展开更多
关键词 表没食子儿茶素没食子酸酯 肝癌 肠道菌群 高通量测序
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一株莫哈韦芽孢杆菌的脱氮性能评价及其氮转化机理研究
5
作者 田相利 王路平 +4 位作者 刘云慧 解玉萌 张丽雯 刘剑锋 姚志国 《中国海洋大学学报(自然科学版)》 北大核心 2026年第4期15-26,共12页
本文为探究菌株C3的脱氮性能与机理,以分离自黄海冷水团底泥的莫哈韦芽孢杆菌C3(Bacillus mojavensis C3)为对象开展研究。研究表明,在初始无机氮浓度为21mg/L的氮源培养基中,菌株C3可有效去除水体中NH_(4)^(+)-N、NO_(2)^(-)-N和NO_(3)... 本文为探究菌株C3的脱氮性能与机理,以分离自黄海冷水团底泥的莫哈韦芽孢杆菌C3(Bacillus mojavensis C3)为对象开展研究。研究表明,在初始无机氮浓度为21mg/L的氮源培养基中,菌株C3可有效去除水体中NH_(4)^(+)-N、NO_(2)^(-)-N和NO_(3)^(-)-N,去除率分别为85.95%、75.89%和96.29%,最大氮去除速率分别为0.36、0.36和0.50mg/(L∙h)。氮平衡分析表明,系统中无机氮通过同化作用和异养硝化-好氧反硝化作用(HN-AD)去除。其中,同化途径主导了菌株无机氮转化,通过异养硝化-好氧反硝化作用释放至大气的氮占系统总氮的13.29%~16.83%。^(15)N同位素示踪结果发现,当以^(15)NH_(4)^(+)-N、^(15)NO_(2)^(-)-N和^(15)NO_(3)^(-)-N为唯一氮源时,菌株C3仅产生^(15)N_(2)O,不产生^(15)N_(2),表明N_(2)O是其脱氮的主要气体产物。使用氨氧化抑制剂探究了菌株C3的硝化途径,发现添加不同浓度的烯丙基硫脲对氨氮去除率和氮损失无显著影响,表明菌株C3中可能存在一种具有特殊酶结构的新型氨氧化酶,能将NH_(4)^(+)-N转化为NH_(2)OH。全基因组测序分析表明,在氮同化过程中,氮源的利用主要通过谷氨酸脱氢酶(GDH)途径(胞外NO_(3)^(-)/NO_(2)^(-)/NH_(4)^(+)→胞内NH_(4)^(+)→谷氨酸→菌体蛋白)和谷氨酰胺合成酶/谷氨酸合酶(GS/GOGAT)途径(胞外NO_(3)^(-)/NO_(2)^(-)/NH_(4)^(+)→胞内NH_(4)^(+)→谷氨酰胺→谷氨酸→菌体蛋白)。研究结果显示,菌株C3通过异养硝化-好氧反硝化(HN-AD)途径实现氮异化,包括异养硝化作用(NH_(4)^(+)→NH_(2)OH→NO→N_(2)O)和好氧反硝化作用(NO_(3)^(-)→NO_(2)^(-)→NO→N_(2)O)。本研究为查明莫哈韦芽孢杆菌的氮转化机理提供了重要信息,并为菌株C3在海水养殖废水处理中的潜在应用提供了科学依据。 展开更多
关键词 氮同化 异养硝化 好氧反硝化 氮去除 全基因组分析 莫哈韦芽孢杆菌
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土壤细菌16S rRNA基因实时荧光定量PCR标准品的制备及稳定性探究
6
作者 朱璧如 廖万金 徐冰 《生物学杂志》 北大核心 2026年第1期97-102,共6页
实时荧光定量PCR(qPCR)被越来越多地用于测量微生物的绝对数量,使用该方法的关键是制备合适的标准品并建立稳定的实验方案。本研究成功构建了一个含有土壤细菌16S rRNA基因全长的质粒标准品,该标准品可以被4对细菌16S rRNA基因的通用引... 实时荧光定量PCR(qPCR)被越来越多地用于测量微生物的绝对数量,使用该方法的关键是制备合适的标准品并建立稳定的实验方案。本研究成功构建了一个含有土壤细菌16S rRNA基因全长的质粒标准品,该标准品可以被4对细菌16S rRNA基因的通用引物扩增。使用其中2对引物进行绝对定量qPCR实验,熔解曲线均为单峰,标准曲线的扩增效率分别为87.4%和71.9%,拟合优度均大于0.99。1 d内使用同一套梯度稀释的标准品进行3次qPCR实验,使用TE或TE_(0.1)缓冲液进行稀释或4℃低温存放均能提高标准曲线扩增效率和拟合优度的稳定性。质粒标准品-20℃存放30 d后,标准曲线的扩增效率和拟合优度并未显著降低,但在不同时间测得的扩增效率有波动,使用TE或TE_(0.1)缓冲液进行标准品稀释可减小这种波动。保证标准品在存放和使用过程中的稳定性,有助于提高不同空间和时间进行绝对定量qPCR实验的准确性和复现性。 展开更多
关键词 绝对定量qPCR 质粒克隆 标准曲线 扩增效率 拟合优度
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非编码sRNA对细菌适应不同环境压力的调控作用
7
作者 刘欢 寇家豪 +4 位作者 刘青 赵洁 王江威 刘俊杰 赵燕妮 《微生物学通报》 北大核心 2026年第3期1176-1187,共12页
细菌在复杂多变的环境中生存,需要快速响应温度、p H、渗透压、金属离子浓度等不同环境压力。近年来,非编码小RNA(small RNA,sRNA)被广泛认为是细菌环境适应性调控的关键因子。sRNA的长度通常为40-500 nt,在细菌中普遍存在。它们通常通... 细菌在复杂多变的环境中生存,需要快速响应温度、p H、渗透压、金属离子浓度等不同环境压力。近年来,非编码小RNA(small RNA,sRNA)被广泛认为是细菌环境适应性调控的关键因子。sRNA的长度通常为40-500 nt,在细菌中普遍存在。它们通常通过碱基互补配对与靶标mRNA相互作用,调控其稳定性或翻译效率,在转录后水平快速实现对外界环境变化的适应。本文综述了sRNA在细菌适应不同环境条件变化中的调控作用的研究进展,对于揭示细菌如何在多变环境中维持生存和致病性机理具有重要意义。 展开更多
关键词 非编码sRNA 环境压力 细菌
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基于高通量测序分析猕猴桃根际土壤微生物群落特征
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作者 雷高 权淑静 +6 位作者 张永战 刘玲 李珊珊 慕琦 刘德海 赵俊坤 杨文玲 《中国酿造》 北大核心 2026年第1期166-171,共6页
采用常规检测方法检测南阳市西峡县奎文村(KW)、屈原岗村(QYG)、王营村(WY)猕猴桃根际土壤样品的基本理化指标,采用Illumina Mi Seq高通量测序技术分析其微生物群落多样性,并分析两者间的相关性。结果表明,3个样品的pH、有效磷含量、速... 采用常规检测方法检测南阳市西峡县奎文村(KW)、屈原岗村(QYG)、王营村(WY)猕猴桃根际土壤样品的基本理化指标,采用Illumina Mi Seq高通量测序技术分析其微生物群落多样性,并分析两者间的相关性。结果表明,3个样品的pH、有效磷含量、速效钾含量、碱解氮含量差异显著(P<0.05)。3个样品细菌群落多样性及物种丰度无显著差异(P>0.05),QYG样品真菌群落多样性最高,KW样品最低,但3个样品真菌群落的物种丰度无显著差异(P>0.05)。从3个样品中共注释到51个细菌门和16个真菌门,包括16个优势细菌门和6个优势真菌门,其中芽孢杆菌门(Bacillota)和放线菌门(Actinomycetota)作为潜在的猕猴桃溃疡病生防细菌,在3个样品中均为优势菌门。土壤理化性质对猕猴桃根际土壤微生物群落分布具有显著影响,其中,芽孢杆菌门与速效钾含量呈极显著负相关(P<0.01),放线菌门与速效钾含量呈显著正相关(P<0.05),与p H呈显著负相关(P<0.05);pH与罗兹菌门(Rozellomycota)呈高度显著正相关(P<0.001)。该研究结果为猕猴桃溃疡病生防细菌的筛选鉴定了基础。 展开更多
关键词 猕猴桃 根际土壤 微生物多样性 高通量测序 群落结构
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有氧运动训练对女性毒品成瘾人群肠道菌群结构的影响
9
作者 王航平 张建磊 +1 位作者 白若兰 杨帆 《微生物学杂志》 北大核心 2026年第1期56-66,共11页
为探究有氧运动训练对女性毒品成瘾人群肠道菌群结构的影响,招募100名女性毒品成瘾者为实验对象进行12周有氧运动干预。在运动干预前后分别对受试者进行粪便样本采集,采用16S rRNA基因高通量测序技术分析吸食不同类型毒品女性成瘾人群... 为探究有氧运动训练对女性毒品成瘾人群肠道菌群结构的影响,招募100名女性毒品成瘾者为实验对象进行12周有氧运动干预。在运动干预前后分别对受试者进行粪便样本采集,采用16S rRNA基因高通量测序技术分析吸食不同类型毒品女性成瘾人群运动前后肠道菌群的组成。结果表明,12周有氧运动干预可引起女性毒品成瘾人群肠道菌群物种多样性和优势群落菌属的丰度变化。主成分分析结果显示,运动前后传统毒品运动干预组(MC组)、新型毒品运动干预组(MX组)肠道菌群结构存在显著差异。在纲、目、科水平上,MC组在实验前后物种存在显著差异(P<0.05),运动后纲水平上放线菌(Actinobacteria)和红蝽菌科(Coriobacteriaceae)丰度显著提高。在科、目水平上,MX组实验前后物种存在显著差异(P<0.05),运动后双歧杆菌科(Bifidobacteriaceae)和双歧杆菌目(Bifidobacteriales)丰度显著提高。本研究旨在从肠道微生物角度,为运动干预改善女性毒品成瘾人群身心健康提供参考。 展开更多
关键词 肠道菌群 16S rRNA基因 基因测序 毒品成瘾 有氧运动 菌群结构
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海洋二甲基巯基丙酸内盐趋化微生物研究进展
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作者 张晓华 龚炯 张蕴慧 《中国海洋大学学报(自然科学版)》 北大核心 2026年第3期1-9,共9页
本文回顾了海洋中二甲基巯基丙酸内盐(Dimethylsulfoniopropionate,DMSP)的相关研究,简述了其在海洋中的分布情况,指出其作为一种广泛分布于海洋的重要含硫化合物,在全球碳硫循环中具有关键作用,且是温室气体二甲基硫(Dimethyl sulfide,... 本文回顾了海洋中二甲基巯基丙酸内盐(Dimethylsulfoniopropionate,DMSP)的相关研究,简述了其在海洋中的分布情况,指出其作为一种广泛分布于海洋的重要含硫化合物,在全球碳硫循环中具有关键作用,且是温室气体二甲基硫(Dimethyl sulfide,DMS)的主要前体物质,强调了微生物DMSP趋化性在DMSP利用及温室气体释放过程中的重要性。本文分析了藻-菌共生和珊瑚生态系统中的主要DMSP趋化微生物类群,介绍了DMSP在这些生态系统中发挥的生态学功能;同时深入探讨了趋化运动的分子信号传导过程,以及其与DMSP裂解过程潜在的耦合机制。此外,还对毛细管实验、微流控芯片技术在趋化性检测中的优势与局限性进行了分析。尽管当前微生物DMSP趋化性在不同海洋生态系统中的作用正逐步被揭示,但目前海洋环境中DMSP趋化类群的多样性、趋化能力的差异以及趋化机制仍存在诸多未知,有待进一步深入研究。未来研究应通过高通量组学技术、原位观测和模型预测相结合的方式,深入探究海洋微生物的DMSP趋化机制,从而全面揭示DMSP趋化微生物在物质循环和温室气体排放过程中的作用,为相关领域的研究提供方向指引。 展开更多
关键词 二甲基巯基丙酸内盐 微生物趋化作用 生物地球化学循环 海洋微生物 微生物生态
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藏野驴源芽孢杆菌的分离及全基因组序列分析
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作者 宋波 杨阿燕 +2 位作者 文国琴 张廷富 秦明森 《江苏农业学报》 北大核心 2026年第3期531-541,共11页
从藏野驴粪便中分离到1株具有生物防治效应的芽孢杆菌菌株TEB-1。本研究基于第三代测序技术对菌株TEB-1进行全基因组测序和多维生物信息学分析,并对测序数据进行基因组装、基因预测、功能注释,并采用antiSMASH等软件对次级代谢产物合成... 从藏野驴粪便中分离到1株具有生物防治效应的芽孢杆菌菌株TEB-1。本研究基于第三代测序技术对菌株TEB-1进行全基因组测序和多维生物信息学分析,并对测序数据进行基因组装、基因预测、功能注释,并采用antiSMASH等软件对次级代谢产物合成基因簇进行深度挖掘与生物合成潜能评估。采用菌丝生长速率法验证菌株TEB-1对2种植物病原真菌暹罗刺盘孢菌和多主棒孢菌的抑制作用,并对菌株TEB-1进行耐药性试验。结果显示,菌株TEB-1的基因组全长为4102747 bp,G+C含量为43.8%,包含4065个编码基因,85个tRNA,30个rRNA基因。生物信息学分析结果显示,该菌株存在丰富的次级代谢产物合成基因簇及多种耐药基因。功能验证结果表明,该菌株无菌发酵液在含量2.5%、5.0%、7.5%、10.0%时对暹罗刺盘孢菌和多主棒孢菌均表现出不同程度的抑制能力,10.0%含量处理时抑菌率分别达51.4%和38.7%。K-B纸片扩散法试验结果显示,TEB-1菌株对氨苄西林、青霉素和林可霉素3种抗生素具有耐药性,对四环素、庆大霉素、氯霉素、红霉素、环丙沙星、复方新诺明及头孢曲松等7种抗生素高度敏感,表明TEB-1菌株兼具显著的抗真菌活性与可控耐药特性。本研究结果为将TEB-1菌株开发为环境友好型生物农药提供了理论依据。 展开更多
关键词 藏野驴 芽孢杆菌 生防菌 全基因组测序 抑菌性
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牛粪中异养硝化细菌的分离鉴定及其硝化能力的研究
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作者 王佳丽 王梓宇 +4 位作者 马咏琪 姜云鹏 安亮嘉 韩向敏 孙丽坤 《微生物学杂志》 北大核心 2026年第1期33-43,共11页
为降低好氧堆肥氮素的损失,提高堆肥肥力,减少环境污染,以牛粪为主要材料,筛选出一株高效异养硝化菌株NB-2,并通过形态学特征及16S rRNA基因序列分析,确认其为粪产碱杆菌(Alcaligenes faecalis)。进一步研究显示,在以柠檬酸三钠为碳源、... 为降低好氧堆肥氮素的损失,提高堆肥肥力,减少环境污染,以牛粪为主要材料,筛选出一株高效异养硝化菌株NB-2,并通过形态学特征及16S rRNA基因序列分析,确认其为粪产碱杆菌(Alcaligenes faecalis)。进一步研究显示,在以柠檬酸三钠为碳源、C/N比为15、温度为35℃以及pH值为9.0的条件下,菌株NB-2的硝化能力显著提升,在好氧发酵32 h时,菌株NB-2的氨氮(NH_(4)^(+)-N)去除率为100%,去除速率高达33.38 mg/(L·h)。本研究结果表明,菌株NB-2应用于堆肥具有减少氮素损失的潜力,同时能提高肥料的质量和效率,从而促进畜牧业的可持续发展。 展开更多
关键词 硝化细菌 氮素转化 异养硝化 粪产碱杆菌(Alcaligenes faecalis) 硝化特性
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淡水鱼养殖场主要病原菌耐药性及全基因组特征研究
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作者 刘海燕 林枞 +1 位作者 陶未来 张安云 《四川大学学报(自然科学版)》 北大核心 2026年第2期457-465,共9页
为揭示淡水鱼重要病原菌的流行、耐药、毒力特征及系统发育关系,本研究采用分离培养和全基因组测序技术,对四川省乐山和眉山市13个淡水鱼养殖场的病鱼样本中分离的重要病原菌进行了系统研究。通过细菌培养法对病原菌进行分离鉴定,采用K-... 为揭示淡水鱼重要病原菌的流行、耐药、毒力特征及系统发育关系,本研究采用分离培养和全基因组测序技术,对四川省乐山和眉山市13个淡水鱼养殖场的病鱼样本中分离的重要病原菌进行了系统研究。通过细菌培养法对病原菌进行分离鉴定,采用K-B纸片扩散法测定其对抗菌药物的敏感性,结合全基因组测序技术分析其耐药基因、毒力因子、多位点序列分型及系统发育关系。结果表明,共鉴定出52株气单胞菌、3株邻单胞菌、5株爱德华氏菌和4株弧菌;病原菌对亚胺培南、复方新诺明和诺氟沙星的耐药性较高,分别达到78.13%、46.88%和45.31%,此外,42.19%的病原菌表现出多重耐药性;在64株病原菌基因组中发现14种一级风险耐药基因(ARGs)和7种二级风险ARGs,气单胞菌中注释到266种毒力因子,弧菌中注释到97种毒力因子;多基因位点序列分型(MLST)分析揭示了淡水鱼养殖场中病原菌的多样性,基于病原菌核心基因SNP构建系统发育树显示,来自不同养殖场的相同序列类型(ST)菌株聚集于同一分支,提示不同养殖场之间可能存在克隆传播和交叉污染的情况。本研究揭示了淡水鱼病原菌耐药性问题的严重性,并指出了克隆传播和交叉感染的可能,作为科学防控提供依据。 展开更多
关键词 淡水鱼养殖场 病原菌 耐药性 交叉感染
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群体感应相关调控子对副溶血弧菌磷酸二酯酶GepA的表达调控
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作者 刘超 李雪 +3 位作者 罗茜 张义全 张苗苗 陆仁飞 《微生物学报》 北大核心 2026年第3期1167-1177,共11页
【目的】研究群体感应系统(quorum sensing,QS)相关调控子AphA、ToxR和QsvR对副溶血弧菌磷酸二酯酶GepA编码基因gepA表达的调控关系。【方法】提取野生株(wild type,WT)和aphA、toxR、qsvR突变株的总RNA,通过实时定量PCR(quantitative r... 【目的】研究群体感应系统(quorum sensing,QS)相关调控子AphA、ToxR和QsvR对副溶血弧菌磷酸二酯酶GepA编码基因gepA表达的调控关系。【方法】提取野生株(wild type,WT)和aphA、toxR、qsvR突变株的总RNA,通过实时定量PCR(quantitative real-time PCR,qPCR)初步分析QS相关调控子对gepA的转录影响;将gepA上游调控区DNA序列克隆入pBBRlux质粒无启动子区的表达生物冷光基因luxCDABE上游,并将lux重组质粒分别导入WT和突变株中,采用lux报告基因融合实验进一步研究QS相关调控子对gepA的调控作用;采用引物延伸(primer extension)法定位gepA的转录起始位点和核心启动子区,并根据引物延伸产物丰度判断QS相关调控子对gepA的调控关系;将gepA的调控区DNA序列克隆入pHRP309质粒中β-半乳糖苷酶基因上游获得LacZ重组质粒,将LacZ重组质粒分别转化入含有pBAD33或pBAD33-qsvR的大肠杆菌EC100λpir中,采用LacZ报告基因融合实验研究在异体宿主中QS相关调控子对gepA转录的调控方式;PCR扩增gepA上游调控区DNA序列,同时表达并纯化QS相关调控子的His重组蛋白,采用凝胶阻滞实验(electrophoresis mobility shift assay,EMSA)研究QS相关调控子是否直接调控gepA的表达。【结果】低密度条件下,qPCR结果显示ΔaphA和ΔtoxR中gepA的转录水平明显低于WT,表明AphA和ToxR激活gepA的转录;lux报告基因融合实验显示,ΔaphA和ΔtoxR中gepA的启动子区转录活性明显低于WT,进一步表明AphA和ToxR促进gepA的转录;引物延伸结果显示,gepA的转录起始位点位于起始密码子ATG上游第30 bp的A,且其转录活性受到AphA的激活;EMSA结果显示,His-AphA和His-ToxR均不能与gepA的调控区DNA序列结合。高密度条件下,qPCR和引物延伸实验结果均显示QsvR抑制gepA的转录;EMSA实验结果显示,His-QsvR直接结合在gepA的启动子区DNA序列上;双质粒报告基因融合实验显示,QsvR可以抑制EC100λpir中gepA的启动子区转录活性。【结论】AphA和ToxR间接激活,而QsvR直接抑制gepA的转录。因此,gepA在低密度条件下转录水平较高,高密度时转录水平明显下降。 展开更多
关键词 副溶血弧菌 群体感应系统 GepA 转录调控
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室温常压等离子体技术在菌株耐受性改造中的应用与研究进展
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作者 刘子龙 崔皓然 +2 位作者 潘韵 王智文 陈涛 《化工进展》 北大核心 2026年第3期1721-1732,共12页
随着诱变技术的不断创新与发展,室温常压等离子体(ARTP)技术因其操作简便、安全性高、突变类型多样及遗传稳定性好等特点,已广泛应用于微生物育种的各个领域。在工业菌株的实际应用中,耐受性问题常常是制约菌株生产性能和稳定性的关键... 随着诱变技术的不断创新与发展,室温常压等离子体(ARTP)技术因其操作简便、安全性高、突变类型多样及遗传稳定性好等特点,已广泛应用于微生物育种的各个领域。在工业菌株的实际应用中,耐受性问题常常是制约菌株生产性能和稳定性的关键因素。由于基因编辑工具的局限性及对微生物基因组信息掌握尚不充分,理性改造策略在很多情况下并不适用。近年来,利用ARTP技术改造菌株耐受性已成为微生物育种的重要研究路径,提升菌株对不同类型胁迫的耐受性,在多种应用场景中发挥了重要作用。此外,ARTP与传统诱变、基因组改组及实验室适应性进化等技术相结合,极大地提升了突变菌株库构建的效率,为复杂表型改良提供了创新技术路径。本文综述了ARTP技术的工作原理与作用机制,重点探讨了ARTP技术在菌株耐受性改造中的应用场景与研究进展,以及ARTP技术与其他技术的联合应用,旨在为菌株耐受性改造提供新的思路与方法。 展开更多
关键词 生物技术 室温常压等离子体 耐受性 传统诱变 实验室适应性进化
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圈养叶食性和果食性灵长类肠道菌群的比较分析
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作者 朱爱玲 詹同彤 +6 位作者 程舸巍 郑晓敏 杨赋斌 张洋 陆幽兰 卢岩 江志 《动物营养学报》 北大核心 2026年第3期2356-2370,共15页
本试验通过分析圈养叶食性和果食性灵长类的肠道菌群,以了解不同食性非人灵长类肠道菌群的特征,为其营养与健康的研究提供参考依据。采用第2代高通量测序方法,对杭州动物园中3种叶食性灵长类[黑叶猴(Trachypithecus francoisi)(n=5)、... 本试验通过分析圈养叶食性和果食性灵长类的肠道菌群,以了解不同食性非人灵长类肠道菌群的特征,为其营养与健康的研究提供参考依据。采用第2代高通量测序方法,对杭州动物园中3种叶食性灵长类[黑叶猴(Trachypithecus francoisi)(n=5)、川金丝猴(Rhinopithecus roxellana)(n=5)和东非黑白疣猴(Colobus guereza)(n=5)]和3种果食性灵长类[德氏长尾猴(Cercopithecus neglectus)(n=5)、非洲绿猴(Chlorocebus sabaeus)(n=5)和北黄颊长臂猿(Nomascus annamensis)(n=5)]的30份粪便样品中的微生物进行16S rDNA V3~V4区测序分析。结果显示:1)从30份粪便样品中共检测出17个门、27个纲、60个目、107个科、294个属和609个种的肠道细菌。门水平上的优势菌群为厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidota)和螺旋体门(Spirochaetota)。2)果食性灵长类肠道菌群α多样性显著高于叶食性灵长类(P<0.05),其β多样性与叶食性灵长类也存在显著差异(P<0.05)。3)相较于果食性灵长类,叶食性灵长类肠道菌群以颤螺菌科(Oscillospiraceae)、Muribaculaceae和克里斯滕森氏菌科(Christensenellaceae)等为优势菌科,这些细菌相对丰度增高可能与纤维素代谢有关;而果食性灵长类肠道菌群的优势菌科为普雷沃氏菌科(Prevotellaceae)和乳杆菌科(Lactobacillaceae)等,这些细菌相对丰度增高或许与简单碳水化合物代谢相关。4)PICRUSt2功能预测结果显示,叶食性灵长类肠道菌群在精氨酸生物合成、半胱氨酸和蛋氨酸代谢以及丁酸代谢等通路的丰度显著高于果食性灵长类(P<0.05)。综上所述,食性对非人灵长类肠道菌群有显著影响,肠道菌群进化出了与宿主食性相适应的结构。 展开更多
关键词 叶食性 果食性 非人灵长类 16S rDNA 肠道菌群
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副干酪乳酪杆菌发酵上清液对海藻希瓦氏菌生物被膜形成及抗生素敏感性的影响
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作者 刘颖 张联平 +4 位作者 范舒怡 翁盼 黄立群 刘斌 黄莹 《安徽农学通报》 2026年第2期97-102,共6页
为探究副干酪乳酪杆菌(Lacticaseibacillus paracasei)46无菌发酵上清液(CFS)对海藻希瓦氏菌(Shewanella algae)H434生物被膜在不同材质表面形成及抗生素敏感性的影响,本研究以实验室保藏菌株为材料,在96孔板微量体系及食品加工常用的... 为探究副干酪乳酪杆菌(Lacticaseibacillus paracasei)46无菌发酵上清液(CFS)对海藻希瓦氏菌(Shewanella algae)H434生物被膜在不同材质表面形成及抗生素敏感性的影响,本研究以实验室保藏菌株为材料,在96孔板微量体系及食品加工常用的不锈钢、聚丙烯(PP)、聚乙烯(PE)材质表面,探究L.paracasei 46 CFS对S.algae H434生物被膜形成能力及抗生素最小生物被膜根除浓度(MBEC)的影响。结果表明,3%CFS可抑制3种材质表面S.algae H434生物被膜形成,其中对不锈钢表面的抑制效果最优,生物被膜菌落数从7.15 lg CFU/mL降至6.20 lg CFU/mL;材质特性上,PP较不锈钢、PE更易滋生S.algae H434生物被膜。在抗生素敏感性方面,L.paracasei 46 CFS预处理可特异性提高S.algae H434生物被膜对氯霉素、链霉素和头孢曲松的敏感性,降低其MBEC(如头孢曲松在3%CFS处理的PP表面MBEC从40μg/mL降至2.5μg/mL),但在测试的CFS浓度范围内对四环素、环丙沙星和甲氧苄啶无明显影响。本研究证实L.paracasei 46 CFS兼具生物被膜抑制及与抗生素的协同作用,为开发食品加工领域抗生物被膜制剂提供参考。 展开更多
关键词 副干酪乳酪杆菌 海藻希瓦氏菌 生物被膜 抗生素耐药性 最小生物被膜根除浓度
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淀粉结合结构域(SBD)在微生物环境适应与碳源竞争中的多功能角色
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作者 彭惠 付自建 《微生物学杂志》 北大核心 2026年第1期1-13,共13页
淀粉结合结构域(Starch-binding domain, SBD)广泛分布于碳水化合物活性酶(CAZymes)的末端,是一个独立的非催化的结构域,也是淀粉颗粒自然降解过程中的重要功能模块。自然界中,SBD可以特异性识别并结合淀粉颗粒或其他多糖,然后将酶的催... 淀粉结合结构域(Starch-binding domain, SBD)广泛分布于碳水化合物活性酶(CAZymes)的末端,是一个独立的非催化的结构域,也是淀粉颗粒自然降解过程中的重要功能模块。自然界中,SBD可以特异性识别并结合淀粉颗粒或其他多糖,然后将酶的催化结构域引导到糖类物质的表面,显著提高了酶的水解效率。SBD能以非水解的方式破坏淀粉颗粒的结构,还能广泛影响酶的多种催化特性,包括底物特异性、环境适应性(如热稳定性、耐盐性与适冷性)和寡聚化状态等。对SBD生理生化功能的深入研究有助于理解微生物在复杂生境中如何竞争碳源和适应环境。本文综述了SBD在陆地和海洋生态系统中的分布情况、SBD与底物的作用机制以及SBD对宿主酶不同功能的影响。此外,总结了SBD功能的研究方法,包括结构域缺失、结合与破坏能力表征等技术。对SBD的深入研究,不仅拓宽了对自然界中微生物碳源竞争方式的认知,也为工业酶理性设计提供了新的改造思路。 展开更多
关键词 淀粉结合结构域 淀粉降解 碳水化合物活性酶 碳源竞争 底物结合作用
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微生物糖苷水解酶19家族几丁质酶的研究进展
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作者 李妍 钱周泽 +5 位作者 王帅奇 吕晨茵 谷天燕 李玲聪 于欢 赵国刚 《微生物学报》 北大核心 2026年第1期51-60,共10页
几丁质是地球上储量仅次于纤维素的第二大可再生资源。几丁质酶是降解几丁质的关键酶类。糖苷水解酶19家族(glycoside hydrolases family 19,GH19)几丁质酶主要存在于高等植物中。近年来,来自微生物的GH19几丁质酶被广泛发现。本文从分... 几丁质是地球上储量仅次于纤维素的第二大可再生资源。几丁质酶是降解几丁质的关键酶类。糖苷水解酶19家族(glycoside hydrolases family 19,GH19)几丁质酶主要存在于高等植物中。近年来,来自微生物的GH19几丁质酶被广泛发现。本文从分布、结构特征、酶学性质及应用等方面综述了微生物来源GH19几丁质酶的研究进展,并对未来的研究方向进行了展望。 展开更多
关键词 微生物GH19几丁质酶 几丁质 酶学性质 应用
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地膜源微塑料对土壤碳循环影响的研究进展
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作者 王宁 胡晓婧 王光华 《土壤与作物》 2026年第1期27-42,共16页
土壤微塑料污染已经成为全球性环境问题,其中农田土壤地膜源微塑料污染正受到日益广泛的关注。本文系统评述了国内外传统地膜与生物可降解地膜源微塑料对土壤有机碳、无机碳和微生物量碳含量的直接与间接影响机制;探讨了不同种类微塑料... 土壤微塑料污染已经成为全球性环境问题,其中农田土壤地膜源微塑料污染正受到日益广泛的关注。本文系统评述了国内外传统地膜与生物可降解地膜源微塑料对土壤有机碳、无机碳和微生物量碳含量的直接与间接影响机制;探讨了不同种类微塑料对土壤碳循环相关酶活性的调控作用;比较了传统地膜与生物可降解地膜源微塑料对土壤碳循环相关微生物群落结构、功能基因丰度及碳代谢途径的差异化影响;揭示了微塑料际富集的关键功能物种及其促进微塑料碳向土壤碳转化的潜在作用;探究了微塑料残留对土壤病毒群落及其介导土壤碳循环过程的影响。基于当前的研究进展,展望了农田生态系统中关于地膜源微塑料研究的重点方向,为深入探究微塑料污染对农田土壤碳储量的潜在影响提供了新的研究思路和参考。 展开更多
关键词 传统微塑料 生物可降解微塑料 土壤碳循环 微塑料际 微生物群落 土壤病毒-宿主互作
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