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线粒体HIGD1A表达受抑加重多柔比星引起的H9c2心肌细胞焦亡
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作者 贺忠梅 杨靖宇 +3 位作者 钟祺 裴旭婷 高丽娟 曹济民 《中国病理生理杂志》 北大核心 2026年第1期80-87,共8页
目的:探讨缺氧诱导的基因结构域家族成员1A(hypoxia-induced gene domain family member 1A,HIGD1A)在多柔比星(doxorubicin,DOX)诱导的大鼠H9c2心肌细胞焦亡中的作用及机制。方法:以大鼠H9c2心肌细胞为研究对象,实验分为以下7组:对照组... 目的:探讨缺氧诱导的基因结构域家族成员1A(hypoxia-induced gene domain family member 1A,HIGD1A)在多柔比星(doxorubicin,DOX)诱导的大鼠H9c2心肌细胞焦亡中的作用及机制。方法:以大鼠H9c2心肌细胞为研究对象,实验分为以下7组:对照组、DOX组、沉默对照(siNC)组、沉默Higd1a(siHigd1a)组、siNC+DOX组、siHigd1a+DOX组和siHigd1a+DOX+MCC950[核苷酸结合寡聚化结构域样受体蛋白3(nucleotide-binding oligomerization domain-like receptor protein 3,NLRP3)抑制剂]组。DOX(5μmol/L)处理24 h构建大鼠H9c2心肌细胞损伤模型,利用siRNA沉默Higd1a基因。采用DHE染色检测各组细胞中活性氧(reactive oxygen species,ROS)含量;TMRE染色法评估线粒体功能;Western blot法检测各组细胞焦亡相关蛋白的表达量;利用乳酸脱氢酶试剂盒检测心肌细胞的损伤情况。结果:与对照组相比,DOX处理使H9c2心肌细胞活力显著下降(P<0.01),HIGD1A的mRNA和蛋白表达量均显著降低(P<0.05)。与siNC+DOX组相比,沉默Higd1a后加重DOX诱导的ROS生成与线粒体膜电位下降(P<0.01),并且增加NLRP3、焦孔蛋白D剪切片段(gasdermin D cleaved fragment,GSDMD CL)、cleaved caspase-1、白细胞介素18(interleukin-18,IL-18)表达量(P<0.01),促进心肌细胞损伤标志物乳酸脱氢酶(lactate dehydrogenase,LDH)释放(P<0.01)。进一步加入NLRP3抑制剂MCC950可部分逆转沉默Higd1a导致的心肌细胞焦亡增加(P<0.05)。结论:DOX处理可下调大鼠H9c2心肌细胞HIGD1A表达,沉默Higd1a基因通过促进线粒体功能障碍及心肌细胞焦亡参与DOX导致的心肌细胞损伤,其机制与抑制ROS/NLRP3信号途径介导的心肌细胞焦亡有关。 展开更多
关键词 缺氧诱导的基因结构域家族成员1A 多柔比星 心肌细胞 细胞焦亡
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4个养殖区域的草鱼群体遗传多样性评估
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作者 朱嫣然 常玉梅 +4 位作者 黄晶 鲁翠云 沈玉帮 宋红梅 户国 《水产科学》 北大核心 2026年第1期25-35,共11页
采用30个微卫星分子标记及线粒体细胞色素b(Cytb)基因综合评估了4个养殖区域(珠江、苏州、梅河口和肇东)及1个天然水体江段(抚远)随机打捞的草鱼群体的遗传多样性,旨在为草鱼的选育提供参考。试验结果显示,5个群体之间基于微卫星位点多... 采用30个微卫星分子标记及线粒体细胞色素b(Cytb)基因综合评估了4个养殖区域(珠江、苏州、梅河口和肇东)及1个天然水体江段(抚远)随机打捞的草鱼群体的遗传多样性,旨在为草鱼的选育提供参考。试验结果显示,5个群体之间基于微卫星位点多态性信息的遗传多样性指数——平均等位基因、有效等位基因、观测杂合度、期望杂合度和多态信息含量等参数均无显著性差异(P>0.05);遗传分化系数揭示,5个群体两两间均在统计学上具有显著性的遗传分化(P<0.05),抚远野生群体和其他4个养殖群体的两两间遗传分化系数均大于0.05,4个养殖群体间仅梅河口和肇东养殖群体间遗传分化系数大于0.05;哈迪-温伯格平衡检验显示,抚远野生群体偏离平衡位点最少,仅有6个,4个养殖群体偏离平衡位点为9~13个。Structure结果表明,这5个草鱼群体可分为3个主要种群来源,即苏州-珠江-肇东种群、梅河口种群和抚远种群。线粒体Cytb基因序列分析显示,4个养殖群体与抚远野生群体之间具有广泛的共享单倍型,表明5个草鱼群体间遗传背景可能存在交叉。试验结果表明,5个草鱼群体均呈现出良好的遗传多样性,可为草鱼群体选育提供丰富的遗传资源,但草鱼4个养殖群体间的遗传变异资源趋于相似,导致选育潜力可能受限。 展开更多
关键词 草鱼 线粒体细胞色素B 微卫星 遗传多样性
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太湖新银鱼入侵种群与原产种群的遗传多样性比较研究
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作者 曹贻宁 任静 +5 位作者 王东 翟东东 刘红艳 熊飞 刘明典 段辛斌 《水产科学》 北大核心 2026年第2期296-304,共9页
为了解太湖新银鱼入侵地与原产地之间的遗传多样性差异,探讨入侵地的入侵来源、入侵途径及过程,本研究采用线粒体细胞色素b(Cyt b)基因序列作为分子标记,分析了6个原产地和10个入侵地共416尾太湖新银鱼的遗传多样性和遗传结构。研究表... 为了解太湖新银鱼入侵地与原产地之间的遗传多样性差异,探讨入侵地的入侵来源、入侵途径及过程,本研究采用线粒体细胞色素b(Cyt b)基因序列作为分子标记,分析了6个原产地和10个入侵地共416尾太湖新银鱼的遗传多样性和遗传结构。研究表明:6个原产地的整体遗传多样性(单倍型多样性:0.777;核苷酸多样性:0.00265)高于10个入侵地(单倍型多样性:0.661;核苷酸多样性:0.00123),可能与奠基者效应有关;但绥江和巫山的遗传多样性反而高于原产地,这可能是由于入侵地的多次引种,弥补了奠基者效应造成的遗传多样性下降。分子方差变异分析显示,太湖新银鱼群体间的遗传分化系数(F_(st))为0.436(P<0.05),表明太湖新银鱼群体间存在显著的遗传分化,两两群体间遗传分化系数也证实了这一点。非加权组平均法聚类分析显示,10个入侵地与巢湖、洞庭湖和洪泽湖聚为一支,太湖、鄱阳湖、泊湖聚为另一支,表明入侵地的源种群可能是巢湖、洞庭湖和洪泽湖。单倍型网络图呈星状分布,表明太湖新银鱼的单倍型是由少数几个古老的单倍型发育而来,其中单倍型Hap3具有入侵优势,在很多入侵地都有Hap3的存在。综上所述,太湖新银鱼的遗传多样性整体较高,可能是其能够广泛入侵成功的内在机制之一,多次引种能够提高太湖新银鱼的遗传多样性,因此要避免多次引种。本研究可为太湖新银鱼的种群管理提供基础数据,同时也为入侵地生态环境的保护、可持续发展提供理论依据。 展开更多
关键词 太湖新银鱼 遗传多样性 入侵来源 入侵过程
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可翻译环状RNA研究进展
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作者 邹光福 周敏 黄川 《遗传》 北大核心 2026年第3期244-261,共18页
环状RNA是一类在真核细胞中广泛存在、结构稳定且功能多样的单链RNA分子。除了作为直接调控因子,环状RNA也能通过编码功能性蛋白间接参与多种生理病理进程。目前,环状RNA翻译的分子机制与研究手段、其编码蛋白与重大疾病的关联,以及其... 环状RNA是一类在真核细胞中广泛存在、结构稳定且功能多样的单链RNA分子。除了作为直接调控因子,环状RNA也能通过编码功能性蛋白间接参与多种生理病理进程。目前,环状RNA翻译的分子机制与研究手段、其编码蛋白与重大疾病的关联,以及其作为药用蛋白表达载体的应用前景,已成为生物医学领域的前沿焦点。本文从上述3个方面对可翻译环状RNA的研究现状进行了归纳总结,旨在为环状RNA的前沿研究提供借鉴和参考。 展开更多
关键词 环状RNA 翻译调控 内部核糖体进入位点 m6A RNA结合蛋白
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Vrtn基因纯合敲除导致小鼠胚胎致死的多阶段转录组学分析
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作者 邓雅鑫 丁宝君 +4 位作者 李鸿春 陈松 张莹 周波 张震 《遗传》 北大核心 2026年第3期313-330,共18页
Vrtn基因是新近发现的与胚胎发育和干细胞多能性相关的基因,其纯合敲除(Vrtn^(–/–))导致小鼠在胚胎期E12.5左右死亡。为阐明其致死机制,本研究整合形态学观察、多阶段转录组学分析及功能验证实验,揭示了由于Vrtn缺失引发的小鼠胚胎发... Vrtn基因是新近发现的与胚胎发育和干细胞多能性相关的基因,其纯合敲除(Vrtn^(–/–))导致小鼠在胚胎期E12.5左右死亡。为阐明其致死机制,本研究整合形态学观察、多阶段转录组学分析及功能验证实验,揭示了由于Vrtn缺失引发的小鼠胚胎发育紊乱。形态学观察显示,Vrtn^(–/–)胚胎在E9.0、E9.5、E10.0、E10.5和E11.0发育期均呈现显著异常,表现为体轴缩短、神经管闭合缺陷、体节分化异常及心血管发育畸形,并伴随胚胎整体发育迟缓。通过转录组测序并结合qRT-PCR验证发现,Vrtn缺失一方面下调了与体节形成(Hoxa2、Hes5)、神经发育(Nefm、Nefl)及造血系统(Hbb-bh1、Klf1)相关基因表达;另一方面异常激活了细胞凋亡通路(Crabp2、Fam162a)和脂质代谢(Apom、Apoe)相关基因。TUNEL染色显示,Vrtn^(–/–)胚胎内细胞凋亡水平显著升高,同时Hif-1α免疫荧光检测表明缺氧应激反应被异常激活。甲状腺激素转运(Ttr)、DNA损伤应激(Ddit4)及脂质代谢(Apoa4、Apoa1)相关基因的广泛异常表达共同加剧了胚胎发育失衡,最终导致胚胎死亡。跨物种分析发现,在人类胚胎干细胞中敲降VRTN显著抑制血管生成核心基因(VEGFA、COL1A1和HES1)的表达,该结果与公共数据库中VRTN与缺氧响应的强关联性一致。综上所述,本研究阐明了Vrtn作为胚胎发育的调控基因,通过协调体节发生、神经分化、血管生成及缺氧应激响应等多个发育进程来维持胚胎稳态。这一发现不仅加深了对Vrtn基因在胚胎发育中作用机制的认识,也为解析相关遗传性疾病的发病机制提供了新视角。 展开更多
关键词 Vrtn基因 基因敲除 转录组 胚胎致死
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L1PA上的m^(6)A修饰对于多能性与全能性的调控机制
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作者 朱学昊 常展赫 +1 位作者 高绍荣 高亚威 《中国细胞生物学学报》 2026年第2期241-249,共9页
转座子元件占据近一半的哺乳动物基因组,在不同物种之间具有高度的多样性,并在调控进化及哺乳动物的生理与发育过程中产生新的遗传功能。在人类和小鼠发育过程中,转座子,尤其是LTR的广泛沉默对于正常发育至关重要,但其背后的分子机制与... 转座子元件占据近一半的哺乳动物基因组,在不同物种之间具有高度的多样性,并在调控进化及哺乳动物的生理与发育过程中产生新的遗传功能。在人类和小鼠发育过程中,转座子,尤其是LTR的广泛沉默对于正常发育至关重要,但其背后的分子机制与调控通路仍未被完全阐明。团队前期研究发现,在小鼠胚胎干细胞中,染色质相关RNA(caRNA)上富含由METTL3写入的m^(6)A修饰;METTL3缺失会导致caRNA降解受阻、染色质开放增强,揭示m^(6)A可通过RNA直接调控染色质状态。同时,团队也发现FTO是调控L1 RNA上m^(6)A的重要去甲基化酶,FTO缺失导致L1 RNA上m^(6)A积累及转录抑制,引发L1-contain基因下调和2C基因异常激活,进一步强调m^(6)A-LINE1轴在染色质稳态中的核心作用。为探究在人类体系中m^(6)A修饰是否存在与小鼠类似的作用,该研究在na??ve态人胚胎干细胞中抑制METTL3,发现全能性相关转录本大量激活,包括ERV1与ERVL-MaLR等8C阶段特异LTR,并伴随染色质开放度显著提升,使细胞状态向8C-like全能阶段回溯。值得注意的是,靶向擦除灵长类特异的L1PA家族上的m^(6)A修饰即可模拟METTL3抑制效应,表明L1PA是驱动人类8C程序重启的关键上游元件。机制上,L1PA RNA上的m^(6)A决定其对染色质调控因子的选择性招募:m^(6)A的存在抑制EP300在ERV1区域的结合,同时促进KAP1在ERVL-MaLR区域的富集,从而抑制两类LTR的异常激活,并维持分化所需的染色质压缩状态。当m^(6)A减少时,这一平衡被打破,导致EP300介导的H3K27ac积累增强、KAP1-H3K9me3沉默通路受损,最终触发8C基因网络与LTR程序的重新激活。综上,该研究系统揭示了在naïve人胚胎干细胞中抑制LTR活性所依赖的、进化上保守但具有物种特异性的m^(6)A-L1-LTR三者互作的跨通路调控轴,并强调了重复序列RNA上的m^(6)A修饰在调节染色质状态、驱动细胞命运转换过程中所发挥的关键而保守的调控作用。 展开更多
关键词 m^(6)A修饰 多能性 全能性 L1PA LTR
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利用细胞“穹窿体”探察基因活动
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作者 John Travis 《科技导报》 北大核心 2026年第2期14-15,共2页
一种神秘的蛋白质外壳经过改造,能够捕获细胞在长达1周内产生的信使RNA,从而记录其基因活动历史在大多数动物细胞中,存在着数以千计的桶状结构,它们是生物学最大的谜团之一。尽管研究人员尚未阐明这些“穹窿体”(vaults)的功能,但现在... 一种神秘的蛋白质外壳经过改造,能够捕获细胞在长达1周内产生的信使RNA,从而记录其基因活动历史在大多数动物细胞中,存在着数以千计的桶状结构,它们是生物学最大的谜团之一。尽管研究人员尚未阐明这些“穹窿体”(vaults)的功能,但现在报告了这种令人费解的颗粒的一种新用途。研究团队对穹窿体进行了改造,使其能够收集RNA,并记录细胞群体在长达7 d内的几乎所有基因活动,为探究细胞的“过去”提供了前所未有的视角。 展开更多
关键词 细胞 穹窿体 记录 基因活动 生物学 改造 RNA
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基于全转录物组测序的长江江豚性别差异非编码RNA表达谱及功能分析
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作者 魏玲霞 余进祥 +5 位作者 刘芳宁 李彩刚 尹恒 杨英 翁佳桥 阙江龙 《中国生物化学与分子生物学报》 北大核心 2026年第1期122-132,共11页
长江江豚(Neophocaena asiaeorientalis)是我国特有的淡水鲸类,种群数量仅约1200头,属极度濒危物种。雌雄长江江豚在生长发育方面存在显著差异,为解析其性别差异的分子调控机制,本研究聚焦于非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)——一类关... 长江江豚(Neophocaena asiaeorientalis)是我国特有的淡水鲸类,种群数量仅约1200头,属极度濒危物种。雌雄长江江豚在生长发育方面存在显著差异,为解析其性别差异的分子调控机制,本研究聚焦于非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)——一类关键的基因表达调控因子,在性别决定与分化中扮演重要角色。基于全转录物组测序技术,系统分析了雌雄长江江豚血液中ncRNA的差异表达谱及其功能注释。结果显示,共鉴定出205个差异表达环状RNA(雌性上调87个,下调118个)、122个差异表达的长非编码RNA(雌性上调54个,下调68个)和48个差异表达的微RNA(雌性上调32个,下调16个)。功能富集分析表明,这些差异表达的ncRNA通过能量代谢(例如ATP结合、PI3K-Akt通路)、免疫调节及信号转导等核心生物学过程协同调控两性分化。荧光定量PCR对关键下游基因(MAPK1、IRS1、ALAD和C1QC)的验证结果,与测序数据揭示的调控趋势一致,为差异ncRNA的功能提供了间接实验证据。本研究系统揭示了ncRNA在长江江豚性别差异中的多维调控网络,为理解其生理分化机制及制定濒危物种保护策略提供了分子层面的理论依据。 展开更多
关键词 长江江豚 性别差异 非编码RNA 差异表达基因 功能富集分析
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FOXQ1通过Wnt/β-Catenin通路调控鼻咽癌细胞增殖、凋亡、侵袭及迁移的研究
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作者 刘洋君 濮邵辉 +2 位作者 刘思奇 何宇飞 陈思伶 《生物医学工程与临床》 2026年第1期71-76,共6页
目的探讨叉头框蛋白1(FOXQ1)基因通过Wnt/β-Catenin信号通路,参与调控鼻咽癌增殖、凋亡、侵袭及迁移。方法采用实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)检测人鼻咽正常上皮细胞NP69和鼻咽癌细胞系CNE-2、HONE-1和SUNE-1中FOXQ1 mRNA表达... 目的探讨叉头框蛋白1(FOXQ1)基因通过Wnt/β-Catenin信号通路,参与调控鼻咽癌增殖、凋亡、侵袭及迁移。方法采用实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)检测人鼻咽正常上皮细胞NP69和鼻咽癌细胞系CNE-2、HONE-1和SUNE-1中FOXQ1 mRNA表达量。针对表达最显著的CNE-2细胞随机分为3组,分别为对照组、FOXQ1过表达组与低表达组。3组连续培养48 h,CCK8检测细胞增殖率,流式细胞术检测细胞凋亡率,Transwell小室检测侵袭和迁移细胞数,Western blot检测Wnt和β-Catenin蛋白表达量。结果与NP69相比,CNE-2、HONE-1和SUNE-1中FOXQ1 mRNA表达量均明显升高,且CNE-2中表达量最高(1.003±0.002、4.032±0.265、3.065±0.185、3.265±0.201。F=105.632,P<0.001)。过表达组细胞增殖率、侵袭和迁移细胞数、Wnt和β-Catenin蛋白表达量比对照组均明显增加,细胞凋亡率下降;而低表达组细胞增殖率、侵袭和迁移细胞数、Wnt和β-Catenin蛋白表达量均明显下降,细胞凋亡率上升(对照组、过表达组和低表达组的侵袭细胞数:8.3±1.2、18.9±3.6和3.2±0.3;F=16.659,P<0.001。迁移细胞数:22.4±3.8、43.6±5.9和11.2±2.1;F=22.315,P<0.001。Wnt蛋白:0.568±0.086、0.809±0.112和0.346±0.077;F=19.657,P<0.001。β-Catenin蛋白:0.602±0.097、0.922±0.103和0.421±0.068;F=13.624,P<0.001。细胞凋亡率:10.3±2.4、2.3±0.3和23.5±4.2;F=34.659,P<0.001)。结论FOXQ1基因高表达可能促进了鼻咽癌细胞的增殖、侵袭及迁移,抑制了细胞凋亡,与Wnt/β-Catenin信号通路的激活密切相关。 展开更多
关键词 鼻咽癌 叉头框蛋白Q1 WNT/Β-CATENIN信号通路 细胞增殖 细胞凋亡 细胞侵袭 细胞迁移
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苏云金芽孢杆菌杀虫蛋白基因型鉴定及对鳞翅目害虫高毒力菌株筛选
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作者 丰硕 黄国强 +3 位作者 程佳旭 曹伟平 贾海民 宋健 《华北农学报》 北大核心 2026年第1期184-193,共10页
苏云金芽孢杆菌(Bt)能够产生多种杀虫蛋白,是重要的生防资源。为了发掘对鳞翅目害虫高毒力的Bt菌株,缓解害虫抗性压力并扩大资源储备,以河北地区土壤样品中分离的109株Bt菌株为研究对象,通过油镜观察伴孢晶体形状,利用40对通用引物(包括... 苏云金芽孢杆菌(Bt)能够产生多种杀虫蛋白,是重要的生防资源。为了发掘对鳞翅目害虫高毒力的Bt菌株,缓解害虫抗性压力并扩大资源储备,以河北地区土壤样品中分离的109株Bt菌株为研究对象,通过油镜观察伴孢晶体形状,利用40对通用引物(包括cry、cyt、vip 3种基因型)PCR鉴定所有菌株的基因型。以小菜蛾、斜纹夜蛾等5种鳞翅目害虫为靶标,筛选高杀虫活性菌株,并利用SDS-PAGE分析其晶体蛋白。结果表明,伴孢晶体形状主要是圆球形(90株),少部分为菱形(19株)。杀虫蛋白基因型检出率为93.6%,主要包括29种不同的cry基因型、1种cyt基因型以及3种vip基因型,91株具有至少2种杀虫蛋白基因型的组合,其中26株含有6种以上,多为cry+vip型。室内生测发现19株对小菜蛾等多种鳞翅目害虫的高毒力菌株,主要表达130,65 ku的蛋白,包含杀鳞翅目的cry1类、cry2类、cry15类等基因型,与PCR鉴定结果一致。获得了对鳞翅目害虫广谱、高毒力的Bt菌株,并初步明确了其杀虫基因,对新型Bt产品的开发具有重要意义。 展开更多
关键词 苏云金芽孢杆菌 基因型 鳞翅目害虫 杀虫活性
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基于RNAi技术沉默暗黑鳃金龟神经肽F基因的转录组分析
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作者 陈杨 田冬冬 +4 位作者 魏煊凌 曲明静 杜龙 李晓 姚永生 《花生学报》 北大核心 2026年第1期12-22,33,共12页
神经肽F(Neuropeptide F,NPF)是无脊椎动物特有的一类神经肽,在昆虫生长发育、生理活动及行为调控中发挥重要作用,但其在花生重要地下害虫——暗黑鳃金龟中的生物学功能尚不明确。本研究通过RNA干扰(RNAi)技术沉默暗黑鳃金龟成虫神经肽... 神经肽F(Neuropeptide F,NPF)是无脊椎动物特有的一类神经肽,在昆虫生长发育、生理活动及行为调控中发挥重要作用,但其在花生重要地下害虫——暗黑鳃金龟中的生物学功能尚不明确。本研究通过RNA干扰(RNAi)技术沉默暗黑鳃金龟成虫神经肽F基因,利用比较转录组学方法分析NPF表达下调后头部和触角组织的基因表达变化。结果表明,NPF干扰72 h后基因表达显著抑制,沉默效率达73.24%;基于转录组数据从头部和触角中分别鉴定到677个和805个差异表达基因。GO与KEGG富集分析显示,这些基因显著富集于免疫反应和代谢过程等相关通路。NPF缺失导致Toll/Imd信号通路中多个关键基因下调,表明NPF可能正向调控昆虫先天免疫;同时,糖代谢和脂代谢相关基因表达显著改变,提示NPF在能量稳态中起重要调节作用。此外,触角中“感觉系统”通路的基因表达显著改变,暗示NPF可能参与化学感知与嗅觉调控。本研究从转录组学角度揭示了NPF在暗黑鳃金龟生理调控中的多重作用,为探索暗黑鳃金龟神经肽调控机制及开发绿色防控新策略提供了理论依据。 展开更多
关键词 暗黑鳃金龟 神经肽F RNA干扰 转录组学
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调控元件间的协同效应可使黏连蛋白对远端增强子功能变得非必需
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作者 赵林(编译) 《广东药科大学学报》 2026年第1期50-50,共1页
增强子是调控启动子转录的关键遗传元件,但它如何跨越长距离基因组间隔实现调控,人们仍不清楚。本研究构建了多能干细胞模型,可在不干扰细胞周期的前提下,诱导性破坏黏连蛋白介导的染色质环挤出过程。研究发现,转录失调表现出细胞类型... 增强子是调控启动子转录的关键遗传元件,但它如何跨越长距离基因组间隔实现调控,人们仍不清楚。本研究构建了多能干细胞模型,可在不干扰细胞周期的前提下,诱导性破坏黏连蛋白介导的染色质环挤出过程。研究发现,转录失调表现出细胞类型特异性,并且携带远端增强子的基因座对黏连蛋白环挤出的依赖程度存在差异。利用比较基因组编辑技术,研究人员发现增强子-启动子间的通讯即使跨越仅20 kb的距离,也依赖于黏连蛋白的功能。然而,启动子近端调控元件能够介导长距离且不依赖黏连蛋白的增强子调控作用,这种作用甚至可跨越强效的CTCF绝缘子位点。值得注意的是,即使环挤出过程被破坏,转录动态及胚胎发育过程中细胞命运分化基本上仍保持稳健。本研究不仅建立了在增强子生物学中研究黏连蛋白功能的新范式,还从机制层面深化了对细胞类型及基因组环境特异性的理解。 展开更多
关键词 增强子 染色质环挤出 黏连蛋白
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单细胞测序技术解析肾脏病理生理机制的研究进展
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作者 秦松言 石彩凤 周阳 《中国病理生理杂志》 北大核心 2026年第1期169-176,共8页
肾脏作为一个高度分化的器官,包含多种功能特异的细胞类型,如肾小球内皮细胞、足细胞、肾小管上皮细胞等。鉴于肾脏疾病的多样性和复杂性,传统治疗手段往往难以实现精准医疗。单细胞测序技术能够深度解析细胞在健康与疾病状态下的基因... 肾脏作为一个高度分化的器官,包含多种功能特异的细胞类型,如肾小球内皮细胞、足细胞、肾小管上皮细胞等。鉴于肾脏疾病的多样性和复杂性,传统治疗手段往往难以实现精准医疗。单细胞测序技术能够深度解析细胞在健康与疾病状态下的基因表达差异,精确绘制肾脏内部的细胞异质性图谱。这不仅有助于全面理解肾脏在不同病理生理条件下的细胞响应机制,如炎症反应、细胞凋亡、纤维化等,还能为疾病的早期诊断和预后评估提供新的分子标志物,发现新的治疗靶点,为开发精准有效的治疗策略奠定基础。本文综述了单细胞测序方法及单细胞转录组学技术在肾脏病理生理中的应用,旨在为该领域的研究提供参考。 展开更多
关键词 单细胞测序 肾脏疾病 基因标志 肾脏细胞类型
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水稻抗稻瘟病基因克隆及其育种应用研究进展 被引量:4
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作者 肖宁 吴云雨 +6 位作者 王如意 赵均良 余玲 高鹏 郝泽芸 宁约瑟 李爱宏 《生命科学》 2025年第5期558-566,共9页
水稻是我国的主要粮食作物,由稻瘟菌侵染引起的稻瘟病是危及粮食安全的主要病害之一。长期的应用实践表明,利用抗性基因培育抗病品种是防控稻瘟病最经济、有效和环保的途径。本文概述了稻瘟病抗病基因克隆进展,综述了近期稻瘟病抗病基... 水稻是我国的主要粮食作物,由稻瘟菌侵染引起的稻瘟病是危及粮食安全的主要病害之一。长期的应用实践表明,利用抗性基因培育抗病品种是防控稻瘟病最经济、有效和环保的途径。本文概述了稻瘟病抗病基因克隆进展,综述了近期稻瘟病抗病基因育种进展以及面临的主要问题与挑战,提出加大种质资源稻瘟病抗性鉴定和创新智能设计育种新策略等下阶段重点研究方向。 展开更多
关键词 水稻 稻瘟病 抗病基因 抗病育种 稻瘟菌
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2023~2024年河北省秦皇岛市新冠病毒基因组变异监测分析
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作者 文明新 王悦 +2 位作者 王晨 于良 罗永松 《现代检验医学杂志》 2026年第1期152-155,共4页
目的实时监测河北省秦皇岛市新冠病毒变异株流行趋势和变化特征,掌握各亚型基因组变异特征,为制定本土防控政策提供依据。方法收集河北省秦皇岛市2023年10月~2024年9月本土新冠病毒感染患者鼻咽拭子样本,共296例,采用二代测序技术进行... 目的实时监测河北省秦皇岛市新冠病毒变异株流行趋势和变化特征,掌握各亚型基因组变异特征,为制定本土防控政策提供依据。方法收集河北省秦皇岛市2023年10月~2024年9月本土新冠病毒感染患者鼻咽拭子样本,共296例,采用二代测序技术进行新冠病毒全基因组测序和分析。结果经过Pangolin分型分析,2023年第四季度主要流行变异株为HK.3,占比63%,EG.5系列占比37%;2024年第一季度主要流行变异株为HK.3,占比47%,JN.1系列变异株占比42%;2024年第二季度主要流行变异株为JN.1系列,占比83%;2024年第三季度主要流行变异株为XDV.1,占比55%,JN.1系列占比24%。基因组变异分析显示:JN.1变异株相较其上一代变异株BA.2.86在刺突蛋白受体结合结构域(RBD)上出现了L455S氨基酸变异。XDV.1变异株是奥密克戎(Omicron)亚系中的一个多重组变异株,相较JN.1变异株,在刺突蛋白RBD上出现了F456L氨基酸变异。结论2023年10月~2024年9月,秦皇岛市主要流行株为Omicron HK.3变异株、JN.1系列变异株和XDV.1变异株。在刺突蛋白RBD上,JN.1系列变异株和XDV.1变异株分别出现了特有的氨基酸变异:L455S和F456L。 展开更多
关键词 新型冠状病毒 全基因组测序 变异监测 刺突蛋白
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台湾金线莲S-腺苷甲硫氨酸合成酶基因克隆及生物信息学分析
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作者 李楚柔 黄勃诚 +1 位作者 张杭颖 杨琳 《湖南农业科学》 2026年第1期22-28,共7页
为了研究S-腺苷甲硫氨酸合成酶基因(SAMS)的功能,根据转录组测序数据,扩增台湾金线莲S-腺苷甲硫氨酸合成酶基因(Af SAMS)的开放阅读框(ORF)序列,并采用生物信息学分析该扩增序列的生理生化特征。结果表明:Af SAMS基因开放阅读框由1191... 为了研究S-腺苷甲硫氨酸合成酶基因(SAMS)的功能,根据转录组测序数据,扩增台湾金线莲S-腺苷甲硫氨酸合成酶基因(Af SAMS)的开放阅读框(ORF)序列,并采用生物信息学分析该扩增序列的生理生化特征。结果表明:Af SAMS基因开放阅读框由1191个碱基对构成,编码产生由396个氨基酸残基组成的多肽链;蛋白分子式预测为C_(1898)H_(2968)N_(508)O_(601)S_(16),相对分子质量43032.45 Da,等电点(pI)为4.97,不稳定指数为25.39,属于稳定蛋白;该蛋白脂肪族氨基酸指数为80.96,符合胞内稳定酶的结构特征,GRAVY指数为-0.246,是亲水蛋白;蛋白质二级结构中α-螺旋占比35.61%,β-折叠占比15.15%,β-转角占比6.82%,无规则卷曲占比42.42%;蛋白质三级结构与铁皮石斛(XP_020681927.1)、美人蕉(WOK96063.1)相似度较高。 展开更多
关键词 S-腺苷甲硫氨酸合成酶 基因克隆 生物信息学 台湾金线莲
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维莫非尼通过Raf-MEK-ERK通路抑制EV病毒A71基因组复制和组装作用的实验研究
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作者 霍惠子 杨思妹 林立辉 《现代检验医学杂志》 2026年第2期100-104,153,共6页
目的研究维莫非尼(VEM)对肠道病毒A组71型(EV-A71)的体外抑制作用及可能机制。方法以EV-A71病毒和人横纹肌肉瘤(RMS)细胞系CCL-136为研究对象,细胞计数试剂盒-8(CCK-8)法检测药物细胞毒性;致细胞病变效应(CPE)抑制实验评估VEM对EV-A71... 目的研究维莫非尼(VEM)对肠道病毒A组71型(EV-A71)的体外抑制作用及可能机制。方法以EV-A71病毒和人横纹肌肉瘤(RMS)细胞系CCL-136为研究对象,细胞计数试剂盒-8(CCK-8)法检测药物细胞毒性;致细胞病变效应(CPE)抑制实验评估VEM对EV-A71感染后CCL-136细胞的保护作用;实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测培养上清中的病毒载量和细胞中病毒基因组复制水平;药物作用时间实验分析VEM对EV-A71复制周期的影响;蛋白质印迹(Western blot)检测病毒组装水平和Raf蛋白激酶(Raf)/丝裂原激活蛋白激酶激酶(MEK)/细胞外信号调节激酶(ERK)通路相关蛋白表达。结果与0μmol/L VEM和瑞德西韦(REM)相比,11.11~100μmol/L VEM和REM处理后CCL-136细胞存活率逐渐降低,差异具有统计学意义(F=62.874、94.632,均P<0.001)。0.05~100μmol/L VEM和REM处理后EV-A71诱导的CCL-136细胞CPE形成抑制率逐渐升高,差异具有统计学意义(F=62.874、94.632,均P<0.001)。与对照组相比,0.05~100μmol/L VEM处理后EV-A71感染CCL-136细胞的病毒载量逐渐降低(F=473.847,P<0.001)。与EV71组相比,病毒感染-1~4h时,EV71+VEM组培养液上清液中病毒滴度降低,差异具有统计学意义(t=4.698~42.114,均P<0.05);病毒感染-1~8h时,EV71+VEM组上清液和胞质中病毒mRNA水平及衣壳蛋白(VP)2/VP0比值均降低,差异具有统计学意义(t_(mRNA)=45.098、101.451,t_(VP2/VP0)=6.839、23.552,均P<0.01)。各组干预2、4、6和8h后,与EV71组相比,EV71+VEM组细胞中磷酸化(p)-MEK和p-ERK水平升高,差异具有统计学意义(t_(P-MEK)=11.455~19.305,t_(P-ERK)=5.196~25.497,均P<0.05)。结论VEM可能通过激活Raf/MEK/ERK通路,抑制EV-A71病毒基因组复制和组装,发挥抗病毒活性。 展开更多
关键词 维莫非尼 肠道病毒A组71型 Raf蛋白激酶/丝裂原激活蛋白激酶激酶/细胞外信号调节激酶 复制 组装
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石松叶绿体基因组密码子偏好性分析及其与易混品种的分子鉴别
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作者 郑梦迪 马向阳 +2 位作者 尹念念 陈斯琪 冯言熙 《中国农业科技导报(中英文)》 北大核心 2026年第2期55-62,共8页
为探究石松的叶绿体基因组密码子使用偏好性及其影响因素,并为石松的快速精准鉴别提供更科学的分子鉴别方法,通过GenBank获取5种石松科植物的31条psbA-trnH序列,利用ClustalW进行序列对比,用MEGA11计算种内和种间K2P(kimura2-parameter... 为探究石松的叶绿体基因组密码子使用偏好性及其影响因素,并为石松的快速精准鉴别提供更科学的分子鉴别方法,通过GenBank获取5种石松科植物的31条psbA-trnH序列,利用ClustalW进行序列对比,用MEGA11计算种内和种间K2P(kimura2-parameter)遗传距离,并构建系统发育树;同时利用mEMBOSS、CodonW和SPSS软件进行中性绘图分析、ENC-plot分析、PR2-plot分析、最优密码子的筛选和对应性分析。结果表明,5种植物各自的最大种内遗传距离小于彼此之间的最小种间遗传距离。系统发育树结果显示,各物种均可独立分支,具有良好的单系性。石松叶绿体基因组密码子第3位碱基的A/U含量显著高于G/C含量。同义密码子相对使用度(relative synonymous codon usage,RSCU)>1的密码子多以A/U结尾。石松叶绿体基因组有9个最优密码子,且密码子偏好性受突变压力、自然选择等多种因素的共同影响。利用psbA-trnH序列能够有效区分5种石松科植物。以上研究结果为石松科植物及其药材的鉴定提供了分子生物学依据。 展开更多
关键词 石松 PSBA-TRNH 分子鉴别 密码子偏好性
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玉米PEBP基因家族的生物信息学分析
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作者 刘佳敏 王虹 《中国农业科技导报(中英文)》 北大核心 2026年第2期20-29,共10页
磷脂酰乙醇胺结合蛋白(phosphatidylethanolamine-binding protein,PEBP)在调控植物开花、结实、种子萌发等过程中发挥着重要作用。为鉴定玉米PEBP基因,对玉米全基因组序列进行分析。结果表明,共获得24个玉米PEBP基因,不均匀地分布在9... 磷脂酰乙醇胺结合蛋白(phosphatidylethanolamine-binding protein,PEBP)在调控植物开花、结实、种子萌发等过程中发挥着重要作用。为鉴定玉米PEBP基因,对玉米全基因组序列进行分析。结果表明,共获得24个玉米PEBP基因,不均匀地分布在9条染色体上,结构高度保守,可分为FT-like、TFL1-like、MFT-like 3个亚家族;编码的肽链长度为172~192个氨基酸残基,理论等电点为6.41~9.30,分子量为18.88~21.94 kD。共线性分析发现,玉米PEBP基因与水稻间有28对共线性基因。表达数据分析表明,各亚家族基因的表达具有较强的组织特异性。研究结果为进一步研究玉米PEBP基因家族的功能与分子机制奠定了基础。 展开更多
关键词 玉米 磷脂酰乙醇胺结合蛋白 生物信息学分析 PEBP基因家族
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微小RNA,大时代:安布罗斯与鲁夫昆的科研征途及启示
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作者 陈彪 焦宇昊 +5 位作者 申梦茹 彭安婷 朱玥玮 芮杨梦琳 王春秀 郝锌颖 《科技导报》 北大核心 2025年第17期141-144,共4页
维克托·安布罗斯和加里·鲁夫昆因发现“miRNA及其在转录后基因调控中的作用”而获2024年诺贝尔生理学或医学奖。梳理了2人发现miRNA及其调控作用的科研之路,总结出追寻兴趣深入、不惧暂时驻足、学会化繁为简3点对于科研人员... 维克托·安布罗斯和加里·鲁夫昆因发现“miRNA及其在转录后基因调控中的作用”而获2024年诺贝尔生理学或医学奖。梳理了2人发现miRNA及其调控作用的科研之路,总结出追寻兴趣深入、不惧暂时驻足、学会化繁为简3点对于科研人员勇攀科研高峰至关重要的影响因素。 展开更多
关键词 诺贝尔生理学或医学奖 维克托·安布罗斯 加里·鲁夫昆 MIRNA
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