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骨肉瘤转移中差异表达的失巢凋亡相关基因的生物信息学分析
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作者 廖长胜 王韦韦 +3 位作者 贺方正 李锡勇 杨溯 韩鹏飞 《长治医学院学报》 2024年第6期418-423,共6页
目的:探讨失巢凋亡相关基因作为与骨肉瘤转移相关的潜在生物标志物及其相关通路。方法:从基因表达数据库(GEO)下载GSE21257和GSE33382数据集,采用稳健排序整合法(RRA)分析及批次矫正差异分析鉴定差异表达基因(DEGs),并与人类基因数据库... 目的:探讨失巢凋亡相关基因作为与骨肉瘤转移相关的潜在生物标志物及其相关通路。方法:从基因表达数据库(GEO)下载GSE21257和GSE33382数据集,采用稳健排序整合法(RRA)分析及批次矫正差异分析鉴定差异表达基因(DEGs),并与人类基因数据库中失巢凋亡相关基因取交集,获得与骨肉瘤转移相关的失巢凋亡相关差异基因,对获得的失巢凋亡相关差异基因进行富集分析、GENEMANIA在线分析、免疫浸润、免疫细胞差异分析及免疫细胞相关性分析。结果:筛选并鉴定了4个与失巢凋亡相关的关键基因,分别是钙黏素2基因(CDH2)、热休克蛋白1A基因(HSPA1A)、整合素β2基因(ITGB2)、钙粒蛋白A(S100A8);免疫细胞差异分析显示,转移组中中性粒细胞、肥大休眠细胞等免疫细胞浸润水平增加,而非转移组调节性T细胞等免疫细胞浸润水平降低;失巢凋亡相关差异基因与免疫细胞的相关性分析结果显示,HSPA1A、CDH2、ITGB2和S100A8与不同免疫细胞群体表现出相关性,表明失巢凋亡相关基因可能参与肿瘤转移过程中的免疫调控。结论:HSPA1A、CDH2、ITGB2和S100A8基因可作为骨肉瘤转移的潜在生物标志物。 展开更多
关键词 骨肉瘤 转移 失巢凋亡基因 免疫浸润 生信分析
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