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组氨酸三联体超家族蛋白的研究进展
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作者 张凯琼 欧阳松应 关洪鑫 《福建师范大学学报(自然科学版)》 北大核心 2026年第1期48-56,共9页
组氨酸三联体(histidine triad,HIT)蛋白广泛存在于不同的生物体中,是一类核苷酸水解酶/转移酶超家族,其特征性催化基序为HxHxH,主要包括HINT、FHIT、GALT三大分支。组氨酸三联体超家族蛋白在DNA修复、信号转导及疾病进程中扮演关键角色... 组氨酸三联体(histidine triad,HIT)蛋白广泛存在于不同的生物体中,是一类核苷酸水解酶/转移酶超家族,其特征性催化基序为HxHxH,主要包括HINT、FHIT、GALT三大分支。组氨酸三联体超家族蛋白在DNA修复、信号转导及疾病进程中扮演关键角色,其异常表达或突变也与多种疾病的发生有关,如癌症、神经退行性疾病等。因此,对组氨酸三联体超家族蛋白的结构特点及催化机制进行系统性的梳理比较,可以为理解该家族蛋白在不同生理过程中的作用机制提供帮助,也可以为基于该家族蛋白的小分子药物设计提供参考,并最终服务于癌症等疾病的早期诊断和治疗。 展开更多
关键词 组氨酸三联体家族 核苷酸水解酶 核苷酸转移酶 功能 机制
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生物酶活性测试技术研究进展 被引量:1
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作者 侯晓妮 刘明东 +3 位作者 吕昊 叶德萍 马丽侠 周李华 《生物技术进展》 2025年第1期58-66,共9页
生物酶在工业、农业、医药、环境保护等领域生产中发挥着巨大的作用。活性作为生物酶的主要性能参数,直接影响着生物酶的质量和应用。随着科学技术的发展,生物酶活性检测也产生了许多新技术新方法。回顾了国内外生物酶活性主流的测试技... 生物酶在工业、农业、医药、环境保护等领域生产中发挥着巨大的作用。活性作为生物酶的主要性能参数,直接影响着生物酶的质量和应用。随着科学技术的发展,生物酶活性检测也产生了许多新技术新方法。回顾了国内外生物酶活性主流的测试技术和方法,包括光谱法、电化学法、色谱法、放射性标记法、质谱法、表面等离子体共振法、表面增强拉曼光谱法,综述了不同方法的基本原理、适用条件及优缺点,并提出了生物酶活性测试结果的准确性和可靠性的建议,以期对生物酶活性检测、方法选取、质量控制和产品应用提供指导。 展开更多
关键词 生物酶 活性 光谱法 电化学法 色谱法 质谱法 表面等离子体共振法 表面增强拉曼光谱法
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基于深度学习探究胰蛋白酶催化蛋白质的特异性酶切预测
3
作者 刘洋 黄峻洪 +6 位作者 岑幸仪 肖楚乔 李谆淳 陈选 李桂香 徐巨才 刘磊 《现代食品科技》 北大核心 2025年第11期68-76,共9页
胰蛋白酶催化蛋白质的特异性酶切预测对于蛋白质的理论降解和结构分析具有重要意义。该研究采用卷积神经网络和长短期记忆网络构建了一种基于深度学习的胰蛋白酶催化蛋白质酶解预测模型,并探讨了不同超参数对模型性能的影响。结果表明:... 胰蛋白酶催化蛋白质的特异性酶切预测对于蛋白质的理论降解和结构分析具有重要意义。该研究采用卷积神经网络和长短期记忆网络构建了一种基于深度学习的胰蛋白酶催化蛋白质酶解预测模型,并探讨了不同超参数对模型性能的影响。结果表明:较低的学习率、较高的Batch size和较浅的卷积层数对模型训练的稳定性和收敛性有利,可保障较好的预测效果,模型的较优工作参数为:学习率0.001、Batch size 512、卷积层数1。在此条件下,模型在PXD010627数据集上的准确率为0.950、特异性为0.987、精确度为0.986、召回率为0.961、F1分数为0.973,显示出良好的预测能力和稳定性。进一步应用于不同物种的公开数据集,模型的准确率均保持在0.920以上,AUC值、精确率、召回率和F1分数均在0.900~0.989之间,说明模型在胰蛋白酶催化蛋白质特异性酶切预测体系中具备较强的泛化能力,可有效提升酶切位点预测的准确性和可靠性。本研究将有望为蛋白质组学鉴定及空间结构分析提供了一种新思路,推动蛋白质酶解研究与生物信息学的发展。 展开更多
关键词 胰蛋白酶 酶切预测 深度学习 蛋白酶解 蛋白质组学
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生物酶联合作用改善烟梗梗丝品质的实验研究
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作者 李建军 董振山 +8 位作者 吕阳波 胡志忠 胡超 叶子煜 桂文亮 梁儒葵 欧莉莉 陆彩玲 徐石磊 《湖北大学学报(自然科学版)》 2025年第5期776-784,共9页
为了探究生物酶处理对梗丝品质的影响,利用纤维素酶、果胶酶和漆酶对梗丝进行处理。烟梗切丝后烘干前喷洒单一或复合酶液,40~50℃发酵1.5~2.0 h,发酵结束后对不同处理方式的梗丝进行感官评价,检测梗丝生物大分子底物含量、透射电镜观察... 为了探究生物酶处理对梗丝品质的影响,利用纤维素酶、果胶酶和漆酶对梗丝进行处理。烟梗切丝后烘干前喷洒单一或复合酶液,40~50℃发酵1.5~2.0 h,发酵结束后对不同处理方式的梗丝进行感官评价,检测梗丝生物大分子底物含量、透射电镜观察梗丝超微结构变化。结果显示:单一或复合生物酶发酵梗丝后一定程度上改善梗丝品质评分,其改善作用与梗丝的纤维素、半纤维素、果胶含量均降低及超微结构破坏有关。单一酶以纤维素发酵改善效果明显,两种及两种以上酶改善效果优于单一酶。纤维素单独及漆酶、果胶酶联合发酵梗丝可以改善梗丝感官得分,该效果与降解细胞壁成分、破坏细胞结构有关,联合酶发酵效果更佳。 展开更多
关键词 生物酶 烟梗丝 感官评价
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β-甘露聚糖酶的性质、热稳定性改造及应用研究进展
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作者 高小朋 关福豪 +2 位作者 郭超 王超 刘玉春 《西安工程大学学报》 2025年第1期33-43,共11页
探讨β-甘露聚糖酶的性质、热稳定性及其在工业应用中的进展。β-甘露聚酶是一种能够水解β-1,4甘露糖苷键的内切糖苷水解酶,广泛应用于饲料、食品加工、纺织工业和生物燃料等领域。首先总结了β-甘露聚糖酶的基本特性,包括其在动植物... 探讨β-甘露聚糖酶的性质、热稳定性及其在工业应用中的进展。β-甘露聚酶是一种能够水解β-1,4甘露糖苷键的内切糖苷水解酶,广泛应用于饲料、食品加工、纺织工业和生物燃料等领域。首先总结了β-甘露聚糖酶的基本特性,包括其在动植物和微生物中的分布,以及不同来源酶的最适反应条件和稳定性。随后,分析了影响β-甘露聚糖酶热稳定性的金属离子结合结构域、碳水化合物结合结构域、柔性区域和盐桥等结构因素,提出分子改造策略以提高其稳定性。通过结构改造提高β-甘露聚糖酶的热稳定性对其在工业中的应用至关重要,并讨论β-甘露聚糖酶在工业中的应用,特别是在饲料中作为益生元的应用,以及在食品加工、洗涤和纺织行业中的潜在用途,指出β-甘露聚糖酶的多功能性和对提高行业效率及可持续性的影响。最后对β-甘露聚糖酶新酶资源的挖掘、结构改造策略的优化,以及平衡酶的热稳定性和催化活性的未来研究方向进行了展望。 展开更多
关键词 Β-甘露聚糖酶 分子改造 热稳定性 酶学性质 理性设计
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黄嘌呤氧化酶在微生物代谢中的调控机制与酶活性研究
6
作者 杨平 《工业微生物》 2025年第2期19-21,共3页
文章探讨黄嘌呤氧化酶(XO)对大肠杆菌代谢的调控机制及其对尿酸代谢的影响。实验采用CRISPR-Cas9技术敲除了XO基因。q RT-PCR结果显示,XO基因敲除组的mRNA表达量显著降低。过表达实验通过构建pET28a表达载体,XO过表达菌株的酶活提高。... 文章探讨黄嘌呤氧化酶(XO)对大肠杆菌代谢的调控机制及其对尿酸代谢的影响。实验采用CRISPR-Cas9技术敲除了XO基因。q RT-PCR结果显示,XO基因敲除组的mRNA表达量显著降低。过表达实验通过构建pET28a表达载体,XO过表达菌株的酶活提高。酶活性测定和酶动力学分析表明,R258A突变体的酶活性显著提升,尿酸转化速率提高,而E402Q突变体的酶活性显著下降。酶活性和酶动力学揭示了R258和E402位点在XO催化机制中的关键作用。文章为黄嘌呤氧化酶在工业微生物中的应用和优化提供理论依据,并为未来通过定向突变技术提升酶性能奠定了基础。 展开更多
关键词 黄嘌呤氧化酶 大肠杆菌 酶活性 定点突变 基因工程
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酶结构中通道分析与改造的研究进展
7
作者 刘璐 杨志钧 +1 位作者 邵雷 吴锴 《工业微生物》 2025年第4期33-37,51,共6页
酶的理性设计主要围绕活性中心周边展开,但近年来,其研究已逐渐延伸至其他外围残基甚至远端残基领域。酶结构中的通道可连接外界溶剂和酶的活性中心,对酶的催化活性、底物特异性、立体选择性等参数具有重要影响。因此,组成通道的周边氨... 酶的理性设计主要围绕活性中心周边展开,但近年来,其研究已逐渐延伸至其他外围残基甚至远端残基领域。酶结构中的通道可连接外界溶剂和酶的活性中心,对酶的催化活性、底物特异性、立体选择性等参数具有重要影响。因此,组成通道的周边氨基酸已成为理性设计的热点之一。文章介绍了酶结构中通道的识别与分析方法,综述了代表性的酶通道改造案例,并分析了通道结构与酶催化功能间的构效关系。 展开更多
关键词 酶通道分析 酶改造 理性设计 分子动力学模拟
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分散泛菌DJL-B醇脱氢酶的重组表达与固定化研究 被引量:2
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作者 田红 庞立 +4 位作者 杨文韬 陈晓 王婧涵 夏菠 蒋立文 《食品工业科技》 北大核心 2025年第9期176-184,共9页
为了提高重组醇脱氢酶在大肠杆菌BL21(DE3)中的表达水平,本研究通过单因素实验探讨了诱导温度、诱导时间以及IPTG浓度对酶表达量的影响。并在此基础上,进一步通过海藻酸钠包埋法研究了重组醇脱氢酶的固定化,以提升其对香叶醇转化的应用... 为了提高重组醇脱氢酶在大肠杆菌BL21(DE3)中的表达水平,本研究通过单因素实验探讨了诱导温度、诱导时间以及IPTG浓度对酶表达量的影响。并在此基础上,进一步通过海藻酸钠包埋法研究了重组醇脱氢酶的固定化,以提升其对香叶醇转化的应用价值。结果表明,重组醇脱氢酶在大肠杆菌BL21(DE3)中的最适表达条件为:诱导温度28℃,诱导时间20 h,IPTG浓度0.1 mmol/L。固定化的条件为:固定化温度20℃、海藻酸钠浓度3.5%、加酶量500μL。同时固定化酶表现出良好的机械稳定性,经重复使用5次后,相对酶活性仍保持在60%左右,显示出较好的重复使用性。研究结果为工业上利用固定化酶催化法制备香叶醛提供了重要的理论参考,具有良好的应用前景。 展开更多
关键词 醇脱氢酶 异源表达 固定化 香叶醛 生物转化
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绿色产色链霉菌Tü57中的5’-磷酸核糖水解酶与双加氧酶的功能表征
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作者 曾馨阅 张昕玥 +2 位作者 于乐 龚蓉 陈文青 《生物加工过程》 2025年第6期700-706,共7页
核苷类天然产物在医药等领域展现出广阔的应用前景。通过生物信息学分析,本研究成功鉴定到了绿色产色链霉菌Tü57中的2种重要酶:5’磷酸核糖水解酶TpdB和Fe^(2+)/α酮戊二酸依赖的双加氧酶TpdC,并对其催化功能进行了详细探究。体外... 核苷类天然产物在医药等领域展现出广阔的应用前景。通过生物信息学分析,本研究成功鉴定到了绿色产色链霉菌Tü57中的2种重要酶:5’磷酸核糖水解酶TpdB和Fe^(2+)/α酮戊二酸依赖的双加氧酶TpdC,并对其催化功能进行了详细探究。体外生化实验结果表明:TpdB能够高效水解5甲基单磷酸尿苷,生成胸腺嘧啶(thymine),过夜反应的转化率可达88%。随后,TpdC则将胸腺嘧啶依次氧化生成5羟甲基尿嘧啶、5醛基尿嘧啶和5羧基尿嘧啶,仅需6 h即可实现底物的完全转化。本研究通过揭示TpdB和TpdC的催化功能,为核苷类化合物后修饰酶的功能改造、新酶挖掘以及相关核苷类药物分子的生物智造奠定了基础。 展开更多
关键词 核苷类天然产物 绿色产色链霉菌Tü57 5’磷酸核糖水解酶 Fe2+/α酮戊二酸依赖双加氧酶
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海洋弧菌NH1产几丁质酶的发酵条件优化及酶学性质研究 被引量:1
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作者 郭汉忠 张旭东 +3 位作者 伍俊林 李永成 夏光华 张雪莹 《中国食品学报》 北大核心 2025年第4期196-208,共13页
以胶体几丁质作为唯一碳源,从渔港沉积物中筛选到能够分泌胞外几丁质酶的弧菌,将其命名为弧菌NH1。通过响应面试验,确定弧菌NH1的最适发酵条件为:11 g/L胶体几丁质,11 g/L酵母粉,0.6 g/L K2HPO4,0.02 g/L FeSO4·7H2O,初始p H 6.98... 以胶体几丁质作为唯一碳源,从渔港沉积物中筛选到能够分泌胞外几丁质酶的弧菌,将其命名为弧菌NH1。通过响应面试验,确定弧菌NH1的最适发酵条件为:11 g/L胶体几丁质,11 g/L酵母粉,0.6 g/L K2HPO4,0.02 g/L FeSO4·7H2O,初始p H 6.98,接种量1%,装液量20%,温度30℃,培养时间24 h。在此条件下,酶活力为60.93 U/L,较优化前提高了2.4倍。对几丁质酶的酶学特性进行研究,发现其最适反应p H值为7.0,最适反应温度为50℃,在pH 5.0~9.0和温度低于45℃有较好的稳定性,Fe2+对酶活有激活作用。底物特异性结果表明,该几丁质酶对α-几丁质、胶体几丁质、虾壳粉、淀粉、纤维素和壳聚糖均具有水解活性。SDS-PAGE及酶谱分析表明几丁质酶的分子质量约63 ku。另外,当以虾壳粉作为底物进行酶解时,N-乙酰-D-葡萄糖胺为唯一水解产物。 展开更多
关键词 弧菌NH1 几丁质酶 发酵优化 酶学性质 降解产物
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一种源于绿僵菌的酪氨酸蛋白磷酸酶新特征序列鉴定及其酶学特性分析 被引量:1
11
作者 谭泽 朱培 +1 位作者 李振轮 杨水英 《生物工程学报》 北大核心 2025年第9期3579-3588,共10页
酪氨酸蛋白磷酸酶(protein tyrosine phosphatase,PTP)是调控细胞过程的关键酶,其催化活性依赖特征序列(H/V)CX5R(S/T),其中半胱氨酸和精氨酸为关键残基。绿僵菌胞外磷酸酶mRNA前体剪接产生2个差异基因序列,其中较长序列包含新序列HCPTP... 酪氨酸蛋白磷酸酶(protein tyrosine phosphatase,PTP)是调控细胞过程的关键酶,其催化活性依赖特征序列(H/V)CX5R(S/T),其中半胱氨酸和精氨酸为关键残基。绿僵菌胞外磷酸酶mRNA前体剪接产生2个差异基因序列,其中较长序列包含新序列HCPTPMLS,该序列与PTP特征序列相似但缺失精氨酸残基。为了鉴定新特征序列和分析其酶学特性,本研究通过毕赤酵母异源表达系统对2个基因的编码蛋白进行表达纯化,并系统比较了两者的酶学特性。结果显示,包含新序列HCPTPMLS的L蛋白酶活最适pH为5.5,对磷酸化酪氨酸活性最高,其磷酸酶活性被Ag^(+)、Zn^(2+)、Cu^(2+)、钼酸盐和钨酸盐抑制,而被Ca^(2+)和EDTA促进;未含新序列的AcP101蛋白酶活最适pH为6.5,对底物对硝基苯磷酸酯的活性远高于其他底物(P<0.05),其活性受NaF和酒石酸盐抑制,但被Mg^(2+)和Mn^(2+)增强。功能表征表明,L蛋白具有典型PTP特性,AcP101蛋白为酸性磷酸酶,PTP特征序列中精氨酸残基的缺失并不影响其催化活性。本研究首次验证了精氨酸缺失型PTP特征序列的功能,研究结果拓宽了PTP的特征序列范围,为磷酸酶分类鉴定提供了新依据。 展开更多
关键词 蛋白特征序列 磷酸酶特性 酪氨酸蛋白磷酸酶 基因表达 金龟子绿僵菌
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来源于耐热微泡菌的新型酰胺水解酶的鉴定、酶学性质表征、底物结合模式分析及分子改造 被引量:1
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作者 徐娜娜 闫明珠 +4 位作者 王浩 梁宵 刘卫东 秦慧民 高健 《生物工程学报》 北大核心 2025年第9期3567-3578,共12页
赭曲霉毒素A(ochratoxin A,OTA)广泛分布于食品和饲料中,具有较强的肝毒性和肾毒性,严重威胁着人类和动物的健康。生物酶法降解霉菌毒素被认为是一种防治霉菌毒素污染的非常有前景的方法。本研究获得了一个来源于耐热微球菌(Microbulbif... 赭曲霉毒素A(ochratoxin A,OTA)广泛分布于食品和饲料中,具有较强的肝毒性和肾毒性,严重威胁着人类和动物的健康。生物酶法降解霉菌毒素被认为是一种防治霉菌毒素污染的非常有前景的方法。本研究获得了一个来源于耐热微球菌(Microbulbifer thermotolerans)的新型赭曲霉毒素A水解酶(Microbulbifer thermotolerans amidohydrolase,Mi ADH)。经大肠杆菌异源重组表达纯化后,对其水解活性和水解产物、酶学性质以及底物结合模式进行了研究。研究发现Mi ADH能够将OTA降解为赭曲霉素α(ochratoxinα,OTα)和苯丙氨酸,具备脱毒能力。其最适温度为70℃,最适pH为8.0,Cu^(2+)对Mi ADH活性的抑制作用最强。Mi ADH展现出良好的耐热性,具备工业应用潜力。三维结构模型与底物对接分析指导下的理性设计揭示了影响底物结合的重要氨基酸,并获得了活力提高的多个突变体,其中突变体V324A的活力最高,是野生型的4.2倍。Mi ADH的鉴定丰富了赭曲霉毒素A降解酶库,为食品和饲料工业中赭曲霉毒素A的生物法脱毒提供了新的候选酶。 展开更多
关键词 赭曲霉毒素A 酰胺水解酶 表达纯化 酶学性质 蛋白质工程
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植物乳植杆菌胆盐水解酶的原核表达、酶学特性及生物信息学分析 被引量:1
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作者 闫智豪 时间 +4 位作者 朱玉红 周进 王国康 甘玲 郭建华 《食品与发酵工业》 北大核心 2025年第13期29-37,共9页
胆盐水解酶(bile salt hydrolase,BSH)是由肠道菌群中部分微生物产生并且广泛分布于动物胃肠道中的一种胞内酶,具有优良的胆酸盐水解活性。该研究旨在克隆并原核表达植物乳植杆菌胆盐水解酶(Lactobacillus plantarumbile bile salt hydr... 胆盐水解酶(bile salt hydrolase,BSH)是由肠道菌群中部分微生物产生并且广泛分布于动物胃肠道中的一种胞内酶,具有优良的胆酸盐水解活性。该研究旨在克隆并原核表达植物乳植杆菌胆盐水解酶(Lactobacillus plantarumbile bile salt hydrolase,LpBSH),系统研究其酶学特性和结构特征,为开发新型降脂酶制剂提供理论基础。通过基因工程技术构建重组LpBSH表达系统,测定其酶学性质并进行动力学分析。结合生物信息学方法,对LpBSH的三维结构、活性位点及底物结合口袋进行预测和分析。结果表明,原核表达的LpBSH在最适条件下活性为88.7 U/mL,显著高于野生型。重组LpBSH在pH为6.5时活性最高,并在pH_(4).5~6.5范围内保持较高活性;K+对LpBSH水解活性有轻微促进作用,而重金属离子普遍抑制活性;动力学分析显示,LpBSH催化反应符合Hill方程,表现出底物正协同效应;通过生物信息学分析LpBSH的氨基酸序列并预测其三维结构特征,研究了关于其氨基酸序列、活性位点、底物结合口袋及底物偏好性的关系。该研究为深入理解LpBSH的结构与功能关系及其在动物胆固醇代谢中的作用奠定了基础,并为LpBSH酶制剂的开发提供了科学依据。 展开更多
关键词 植物乳植杆菌 胆盐水解酶 酶学性质 生物信息学
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透明质酸酶研究进展及在糖胺寡糖合成中的应用 被引量:1
14
作者 赵锐 裴旭娟 +2 位作者 李颖甜 刘浩 高伟霞 《食品与发酵工业》 北大核心 2025年第4期354-362,共9页
透明质酸酶是一种能够将大分子糖胺聚糖降解为低分子质量糖胺寡糖的糖苷酶,广泛应用于促进药物吸收以及癌症诊断治疗等领域。通过酶解得到的糖胺寡糖,因其分子质量大小不同而具备各异的生物学功能,对多种疾病展现出良好的治疗效果。研... 透明质酸酶是一种能够将大分子糖胺聚糖降解为低分子质量糖胺寡糖的糖苷酶,广泛应用于促进药物吸收以及癌症诊断治疗等领域。通过酶解得到的糖胺寡糖,因其分子质量大小不同而具备各异的生物学功能,对多种疾病展现出良好的治疗效果。研究表明,不同来源的透明质酸酶展现出独特的底物特异性以及酶解方式,这为定制化生产特定分子质量的糖胺寡糖提供了可能。通过对透明质酸酶进行重组表达,研究人员能够高效集中地生产特定分子质量的糖胺寡糖,以满足医疗保健等行业对不同分子质量糖胺寡糖的需求。该文对常见透明质酸酶的酶学性质、结构功能、重组表达及其在糖胺寡糖合成中的应用进行综述,并探讨透明质酸酶独特降解机制以及生产特定分子质量糖胺寡糖的潜力和目前仍存在的问题。 展开更多
关键词 透明质酸酶 糖胺寡糖 酶学性质 结构功能 重组表达
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靶向CSPGs/PTPσ:多发性硬化症治疗的新途径 被引量:1
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作者 王敬桐 罗富成 陈文利 《生物化学与生物物理进展》 北大核心 2025年第3期592-602,共11页
多发性硬化症(multiple sclerosis,MS)是一种自身免疫性疾病,主要表现为脱髓鞘和神经炎症。作为年轻人中最常见的非创伤性致残原因,MS在全球范围内导致数百万人瘫痪。MS的确切发病机制尚未完全明确,目前尚无治愈方法。硫酸软骨素蛋白聚... 多发性硬化症(multiple sclerosis,MS)是一种自身免疫性疾病,主要表现为脱髓鞘和神经炎症。作为年轻人中最常见的非创伤性致残原因,MS在全球范围内导致数百万人瘫痪。MS的确切发病机制尚未完全明确,目前尚无治愈方法。硫酸软骨素蛋白聚糖(chondroitin sulfate proteoglycans,CSPGs)是一类抑制性细胞外基质分子,其受体蛋白酪氨酸磷酸酶σ(protein tyrosine phosphataseσ,PTPσ)在CSPGs介导的轴突再生抑制中起关键作用。研究表明,CSPGs/PTPσ在MS的发生和发展中也具有重要作用,并在MS病变区域的细胞外基质中上调。动物实验发现,抑制CSPGs/PTPσ信号途径可以促进少突胶质前体细胞(oligodendrocyte precursor cells,OPC)的迁移、分化、髓鞘再生,并恢复运动功能,显示出治疗MS的潜力。本文综述了CSPGs/PTPσ在中枢神经系统髓鞘再生研究中的最新进展,旨在为MS的治疗提供新的策略和靶点。 展开更多
关键词 PTPσ 硫酸软骨素蛋白聚糖 多发性硬化症 髓鞘再生 少突胶质细胞
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UbiA型萜类环化酶研究进展及其在天然产物合成中的作用 被引量:1
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作者 张梦寒 王倩 +1 位作者 徐志超 刘成伟 《生物工程学报》 北大核心 2025年第11期4076-4088,共13页
UbiA型萜类环化酶是近年来在真菌和细菌中发现的一类新型非经典萜类合成酶,能够催化线性萜类前体通过碳正离子机制发生环化,构建复杂的萜类骨架结构,该类酶的发现显著拓展了天然产物生物合成酶的种类和结构多样性来源。本文系统综述了自... UbiA型萜类环化酶是近年来在真菌和细菌中发现的一类新型非经典萜类合成酶,能够催化线性萜类前体通过碳正离子机制发生环化,构建复杂的萜类骨架结构,该类酶的发现显著拓展了天然产物生物合成酶的种类和结构多样性来源。本文系统综述了自2013年首次在烟曲霉(Aspergillus fumigatus)中发现FmaTC以来,共31种UbiA型萜类环化酶的研究进展,涵盖其保守基序特征、系统发育关系、生物合成相关基因簇及产物的结构类型。重点梳理了倍半萜、二萜及二倍半萜等代表性天然产物及其对应的环化酶,探讨了该类酶与细胞色素P450等修饰酶协同作用所产生的化合物,揭示了UbiA家族成员在天然产物多样性形成中的潜在作用。该类酶的发现不仅丰富了萜类生物合成酶库,也为高活性天然产物的生物合成及应用提供了新的研究思路。 展开更多
关键词 UbiA型萜类环化酶 天然产物 生物合成 倍半萜 二萜
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在高于米氏常数的底物浓度下用积分法测定尿酸酶活性 被引量:6
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作者 廖飞 朱小云 +2 位作者 王咏梅 曾昭淳 左渝萍 《第四军医大学学报》 北大核心 2004年第17期1551-1554,共4页
目的 :以尿酸酶为模型 ,考察在底物浓度高于酶米氏常数 (Km)时用积分法测定酶活性 (Vm)的可靠性 .方法 :用 2 93nm光吸收记录尿酸酶反应曲线 .用以反应时间为自变量的积分速度方程 ,以尿酸酶Km 为常数而本底为非线性参数拟合尿酸酶反应... 目的 :以尿酸酶为模型 ,考察在底物浓度高于酶米氏常数 (Km)时用积分法测定酶活性 (Vm)的可靠性 .方法 :用 2 93nm光吸收记录尿酸酶反应曲线 .用以反应时间为自变量的积分速度方程 ,以尿酸酶Km 为常数而本底为非线性参数拟合尿酸酶反应曲线 ,搜寻对应最好拟合的Vm.结果 :此积分法测定Vm 主要受剩余底物浓度影响 ,本底基本没有干扰 .剩余底物低于 2 .5 μmol/L时用 1 0~ 70 μmol/L起始底物所得Vm 无差异 .用 2 5和 70 μmol/L起始底物浓度时初速度和Vm 都与酶量呈正比 .在此两种底物浓度下积分法的下限相同 ,且与初速度法下限无明显差异 .但用积分法测定酶活性的上限明显高于初速度法 ,而且起始底物浓度越低则差异越显著 .结论 :在积分法中使用以反应时间为自变量的积分速度方程拟合酶反应曲线 ,在高于Km 展开更多
关键词 积分法 初速度 尿酸酶 自变量 上限 底物浓度 酶活性测定
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广西眼镜蛇毒磷酸二酯酶分离纯化及部分性质 被引量:6
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作者 韦世秀 舒雨雁 黎红烨 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期278-281,共4页
By successive chromatography on CM-Sepharose CL-6B,Sephadex G-100,Heparin-Sepharose CL-6B, a phosphodiesterase (PDE, EC3.1.4.1) was isolated and purified from Guangxi cobra venom. The final preparation was 89 fold pur... By successive chromatography on CM-Sepharose CL-6B,Sephadex G-100,Heparin-Sepharose CL-6B, a phosphodiesterase (PDE, EC3.1.4.1) was isolated and purified from Guangxi cobra venom. The final preparation was 89 fold pure and had high specific activity. The enzyme showed a single band on SDS-PAGE and IEF. The PDE showed a molecular weight of 110 kD and pI of 7.4. The enzyme consists of 840 amino acid residues and has only a methionine as N-terminal amino acid residues. It was rich in asparagine, leucine and glutamine and poor in sulphur-containing amino acid. It contains 5.38% neutral sugars. It has no acute toxicity and has analgesia effect. 展开更多
关键词 磷酸二酯酶 分离纯化 眼镜蛇毒 性质 广西
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SULF1在胃癌中的表达及其对细胞增殖的影响 被引量:1
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作者 徐蕾 金依颖 +2 位作者 黄楠 马纪 潘秋辉 《检验医学》 2025年第8期810-816,共7页
目的探讨硫酸酯酶1(SULF1)在胃癌中的表达及其对细胞增殖的影响。方法通过基因表达综合数据库(GEO)GSE33335数据集和GSE79973数据集筛选差异表达基因,在癌症基因组图谱数据库(TCGA)中进行验证,选取SULF1基因进行后续分析。通过HPA数据... 目的探讨硫酸酯酶1(SULF1)在胃癌中的表达及其对细胞增殖的影响。方法通过基因表达综合数据库(GEO)GSE33335数据集和GSE79973数据集筛选差异表达基因,在癌症基因组图谱数据库(TCGA)中进行验证,选取SULF1基因进行后续分析。通过HPA数据库分析正常胃上皮组织(简称正常组织)和胃癌组织中SULF1的表达情况。通过Kaplan-Meier Plotter数据库分析血清SULF1水平与胃癌患者总生存期的关系。选取2023年8—9月同济大学附属第十人民医院胃癌患者50例(胃癌组)和健康体检者30名(正常对照组),收集所有研究对象临床资料,并检测血清SULF1水平。检测人胃黏膜细胞系GES-1和人胃癌细胞系AGS、MKN-28、MKN-45、BGC-823、SGC-7901中SULF1蛋白和mRNA的表达情况。构建SULF1敲低稳定细胞株(SULF1敲低组),采用CCK-8实验和克隆形成实验分析细胞的增殖能力。结果通过GEO数据库和TCGA数据库分别筛选和验证了6个差异表达最显著的上调基因。HPA数据库免疫组化分析结果显示,胃癌组织SULF1蛋白呈高表达(P<0.05)。胃癌患者血清SULF1水平高于正常对照者(P<0.001)。SULF1高表达组总生存期明显短于SULF1低表达组(P<0.01)。与对照组(阴性对照组稳定细胞株)比较,SULF1敲低组(BGC-823细胞、SGC-7901细胞)SULF-1蛋白和mRNA相对表达量均降低(P<0.001),细胞增殖能力减弱(P<0.001)。结论SULF1在胃癌中呈高表达,且作为癌基因促进胃癌细胞增殖。SULF1高表达的胃癌患者预后较差。 展开更多
关键词 硫酸酯酶1 胃癌 生物信息学 细胞功能
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联合突变对α-L-鼠李糖苷酶性质的影响
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作者 唐艺玲 刘小琴 +2 位作者 李乐 李利君 倪辉 《食品与生物技术学报》 北大核心 2025年第2期23-32,共10页
【目的】提升α-L-鼠李糖苷酶(EC 3.2.1.40)的催化活性、热稳定性和pH稳定性。【方法】基于已改良的单点突变体,构建了3个联合突变体:K423R-R307Y-D508N、K423R-R307Y-N561D和K389R-R307Y-N561D。【结果】相比于原始酶(wild type,WT),K4... 【目的】提升α-L-鼠李糖苷酶(EC 3.2.1.40)的催化活性、热稳定性和pH稳定性。【方法】基于已改良的单点突变体,构建了3个联合突变体:K423R-R307Y-D508N、K423R-R307Y-N561D和K389R-R307Y-N561D。【结果】相比于原始酶(wild type,WT),K423R-R307Y-D508N在温度为65、70℃时的半衰期均提高了0.24 min,在pH为7.0、8.0时的半衰期分别提高了145.64、4.91 min,但其相对酶活力仅为WT的41.01%;K423RR307Y-N561D在pH为7.0、8.0时的半衰期分别提高了51.42、20.65 min,相对酶活力为WT的63.26%;K389R-R307Y-N561D的相对酶活力是WT的167.20%,在温度为65、70℃时的半衰期分别提高了1.60、1.34 min,但在碱性环境下的pH稳定性未发生明显变化。通过分子对接、分子动力学模拟和MM-PBSA分析发现,K389R-R307Y-N561D的催化结构域Loop区和底部部分α螺旋结构的柔性增大,使酶与底物结合更充分,提升了亲和性;但R307突变引发局部扰动,破坏氢键网络及π-π疏水相互作用,导致结构稳定性下降。【结论】联合突变触发位点补偿机制是α-L-鼠李糖苷酶催化活性与结构稳定性难以协同提升的主要原因。 展开更多
关键词 α-L-鼠李糖苷酶 联合突变 位点组合效应 分子动力学模拟
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