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茶树WCOR413基因家族鉴定与表达调控分析
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作者 刘恩贝 吴叶蝶 +5 位作者 徐苗苗 凌名杏 彭靖 王洁 王新超 王璐 《茶叶科学》 北大核心 2026年第1期1-19,共19页
低温胁迫严重影响茶树的生长发育,以及茶叶的产量与品质。WCOR413基因家族在植物抗寒过程中发挥重要作用,然而茶树中该家族尚未得到系统鉴定。基于茶树泛基因组和冷驯化转录组数据,结合生物信息学及实时荧光定量PCR(RT-qPCR)分析,对茶树... 低温胁迫严重影响茶树的生长发育,以及茶叶的产量与品质。WCOR413基因家族在植物抗寒过程中发挥重要作用,然而茶树中该家族尚未得到系统鉴定。基于茶树泛基因组和冷驯化转录组数据,结合生物信息学及实时荧光定量PCR(RT-qPCR)分析,对茶树WCOR413(CsWCOR413)基因家族成员进行全面鉴定。结果表明,该家族包含6个成员(CsWCOR413-1~CsWCOR413-6),根据蛋白质的保守结构域可分为质膜定位和内膜/类囊体膜定位两类。启动子元件分析发现,该家族基因可能受到多种转录因子的调控,从而灵敏地响应低温、脱水及脱落酸(ABA)等信号。RT-qPCR分析明确了CsWCOR413基因家族的表达模式,其中CsWCOR413-1主要在叶片中表达,响应茉莉酸(JA)和ABA信号,且受低温胁迫显著诱导;CsWCOR413-5则响应短时低温胁迫和钙离子信号。冷驯化转录组及加权基因共表达网络分析(Weighted correlation network analysis,WGCNA)表明,CsWCOR413-1的表达在自然冷驯化期间显著上调,且与低温信号响应核心转录因子CsCBF3存在高度共表达关系。亚细胞定位试验发现,CsWCOR413-1定位于细胞膜和细胞质中。通过双萤光素酶试验,明确了CsCBF1和CsCBF3可直接结合CsWCOR413-1的启动子并激活其表达。本研究系统阐明了CsWCOR413基因家族的特性及表达模式,揭示了CsWCOR413-1受CsCBF1和CsCBF3转录调控的分子机制,表明该基因可能在茶树响应低温胁迫中发挥重要作用。 展开更多
关键词 茶树 WCOR413基因家族 低温胁迫 泛基因组 表达调控
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转录因子CsMYB75-like-2调控茶树花青素合成的分子机制研究
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作者 周慧 崔悠 +5 位作者 陈雯剑 杜悦阳 张欢 苏鸿锋 张凯凯 张凌云 《茶叶科学》 北大核心 2026年第1期20-34,共15页
花青素作为植物重要的次生代谢产物,赋予植物多彩的颜色,吸引昆虫授粉,抵抗生物和非生物胁迫,对植物生长发育和繁殖具有重要意义。以高花青素茶树品种‘紫娟’为试验材料,探究R2R3-MYB型转录因子CsMYB75-like-2对茶树花青素合成的调控... 花青素作为植物重要的次生代谢产物,赋予植物多彩的颜色,吸引昆虫授粉,抵抗生物和非生物胁迫,对植物生长发育和繁殖具有重要意义。以高花青素茶树品种‘紫娟’为试验材料,探究R2R3-MYB型转录因子CsMYB75-like-2对茶树花青素合成的调控机制。结果表明,CsMYB75-like-2属于花青素合成的SG6亚族,该基因在紫化茶树品种中的表达量显著高于绿色茶树品种,且在幼嫩组织特异性高表达,不同茶树品种中CsMYB75-like-2的蛋白编码区高度保守。亚细胞定位和酵母转录活性试验证实,CsMYB75-like-2是一个核膜共定位的激活型转录因子;遮阴试验表明,CsMYB75-like-2及下游基因(CsDFR和CsFLS)的表达水平与花青素含量呈正相关。与CsMYB75-like-1功能不同,CsMYB75-like-2对花青素合成关键基因CsANS无直接调控作用;其与CsMYB308、CsMYB114等MYB家族成员形成互作调控网络。研究结果可为解析茶树花青素合成分子机制及紫化茶树品种选育提供理论依据。 展开更多
关键词 茶树 花青素 CsMYB75-like-2 调控机制
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RNA疗法技术创新与治疗应用年度发展态势 被引量:1
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作者 杨若南 施慧琳 +3 位作者 王琼 张永娟 孙迟临 李祯祺 《生命科学》 2026年第2期294-307,共14页
随着化学修饰技术、递送技术的协同创新突破,以小核酸药物与mRNA药物为代表的RNA疗法领域正快速迈向临床转化与应用拓展的新阶段,并迅速崛起为全球生物医药创新的核心前沿。本文系统梳理分析了2025年RNA疗法在技术、基础和临床研究及产... 随着化学修饰技术、递送技术的协同创新突破,以小核酸药物与mRNA药物为代表的RNA疗法领域正快速迈向临床转化与应用拓展的新阶段,并迅速崛起为全球生物医药创新的核心前沿。本文系统梳理分析了2025年RNA疗法在技术、基础和临床研究及产业化方面的研究进展,研判未来发展趋势,并提出未来重点方向。研究发现,序列设计、化学修饰技术与递送系统不断优化演进,向精细化、智能化与多器官递送发展,人工智能赋能显著提升研发效率与精准度。同时,对RNA疗法作用机制、治疗策略及新兴技术潜力的不断深化与探索,共同推动RNA疗法在临床应用上从遗传病、传染病等向癌症、心血管疾病等慢性病延伸,产业规模进一步扩大,而中国正成为关键技术发源地。 展开更多
关键词 RNA疗法 小核酸药物 mRNA疫苗/药物 递送技术
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基于RNA切割型DNAzyme的肿瘤标志物检测技术研究进展
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作者 胥欣悦 李健慧 +4 位作者 李玉娇 由田田 吴拥军 刘利娥 丁丽华 《分析测试学报》 北大核心 2026年第2期452-460,共9页
肿瘤标志物是由肿瘤细胞或机体响应肿瘤存在时异常产生/释放的一类生物活性物质,主要包括蛋白质、核酸、循环肿瘤细胞、小细胞外囊泡、代谢物等,可在血液、体液或组织中检测到。这些肿瘤标志物的含量较低,特别是在癌症发展的初期,因此,... 肿瘤标志物是由肿瘤细胞或机体响应肿瘤存在时异常产生/释放的一类生物活性物质,主要包括蛋白质、核酸、循环肿瘤细胞、小细胞外囊泡、代谢物等,可在血液、体液或组织中检测到。这些肿瘤标志物的含量较低,特别是在癌症发展的初期,因此,高灵敏度、高准确度的检测技术在癌症的早期筛查、疗效监测与预后评估、复发预警、精准医疗中具有重要意义。RNA切割型DNAzyme是同时具备分子识别和催化切割活性的双功能核酸酶,这一独特性质使其在痕量或超痕量的肿瘤标志物的精准检测中展现出显著的应用潜力。该文系统综述了RNA切割型DNAzyme的工作原理,重点分析了该酶在肿瘤标志物检测中的应用及最新进展。在此基础上,进一步梳理了RNA切割型DNAzyme在多重肿瘤标志物同步检测方面的研究动态,尤其是在微流控芯片、微阵列芯片及即时检测(POCT)分析中的应用。最后,对该酶的未来研究方向和应用前景进行了总结与展望。 展开更多
关键词 RNA切割型DNAzyme 肿瘤标志物 检测 核酸催化 分子识别
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circHERC4_041通过编码蛋白质抑制心肌成纤维细胞纤维化表型作用 被引量:1
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作者 高原 周川孟 +8 位作者 伍华燕 王娅 吴茹诗 关佩莹 方俊涛 徐金东 刘宇鹏 胡志琴 单志新 《中国生物化学与分子生物学报》 北大核心 2025年第3期393-403,共11页
越来越多的研究表明,环状RNA在心肌纤维化中发挥重要调节作用。人环状RNA表达谱芯片检测结果提示,环状RNA circHERC4_041在心衰患者心肌中表达增加,RT-qPCR验证发现,与健康器官捐献者(n=18)心肌组织相比,心衰患者(n=19)中circ HERC4_04... 越来越多的研究表明,环状RNA在心肌纤维化中发挥重要调节作用。人环状RNA表达谱芯片检测结果提示,环状RNA circHERC4_041在心衰患者心肌中表达增加,RT-qPCR验证发现,与健康器官捐献者(n=18)心肌组织相比,心衰患者(n=19)中circ HERC4_041的表达显著升高。荧光原位杂交(FISH)检测证实,circHERC4_041在人心肌细胞AC16胞质中丰富存在。利用腺病毒介导在小鼠心肌成纤维细胞(mCFs)中过表达circHERC4_041可抑制mCFs中纤维化相关蛋白质表达。细胞增殖检测实验、细胞划痕和Transwell实验结果显示,过表达circHERC4_041时,mCFs的增殖和迁移能力被抑制(P<0.001)。序列分析提示,circHERC4_041包含潜在的核糖体进入序列和开放阅读框,蛋白质免疫印迹检测证实,circHERC4_041可翻译516个氨基酸的HERC4-516aa蛋白质,其主要定位于细胞胞质中。细胞功能实验证实,circHERC4_041通过特异翻译HERC4-516aa来抑制心肌成纤维细胞的纤维化表型(P<0.05)。通过IP-MS筛选和Co-IP鉴定证实,HERC4-516aa与转谷氨酰胺酶2(TGM2)具有特异的相互结合作用,并通过蛋白酶体途径促进TGM2降解。而利用腺病毒介导在mCFs中过表达TGM2可逆转HERC4-516aa对mCFs纤维化表型的抑制作用。本文证实,circHERC4_041翻译的HERC4-516aa蛋白质通过与TGM2相互作用,有效抑制心肌成纤维细胞的纤维化表型。 展开更多
关键词 心肌纤维化 环形RNA circHERC4_041 翻译 心肌成纤维细胞
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一种快速高效的中药材DNA提取方法的建立和优化
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作者 尹显梅 陈顺璐 +3 位作者 陈翔 钱思洁 尹鸿翔 蒋桂华 《成都中医药大学学报》 2026年第1期57-62,81,共7页
目的:建立一种快速、高效的DNA提取方法,解决中药材成分复杂,DNA提取困难的问题,以便于利用DNA分子鉴定技术实现中药材及其成药当中原料药的真伪鉴定。方法:针对中药材来源多样,成分复杂的特点,对传统CTAB法和试剂盒法进行改进和优化,... 目的:建立一种快速、高效的DNA提取方法,解决中药材成分复杂,DNA提取困难的问题,以便于利用DNA分子鉴定技术实现中药材及其成药当中原料药的真伪鉴定。方法:针对中药材来源多样,成分复杂的特点,对传统CTAB法和试剂盒法进行改进和优化,考察药材粉末的CTAB加入比例、蛋白酶K和α-高聚淀粉酶的加入量以及水浴温度和水浴时间。结果:当加入药材粉末15 mg,CTAB 300 m L,蛋白酶K(20 mg/m L) 20μL、α-高聚淀粉酶(75 mg/m L) 20μL,95℃水浴1-5 min,DNA提取效率最高。结论:本文创新性采用复合酶解体系DNA提取法,相比于传统CTAB法和试剂盒法,大大减少了提取时间,提高了提取效率,适用于根茎类、花叶类等各类中药材,并且在富含淀粉的中药材的DNA提取方法中优势显著,为中药材的分子鉴定奠定了基础。 展开更多
关键词 中药材 DNA提取 蛋白酶K α-高聚淀粉酶 分子鉴定
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RNA二级结构预测方法的研究进展 被引量:1
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作者 郝泽洲 羊艳玲 +3 位作者 赵贺龙 周亮 姚旭峰 吴韬 《生物工程学报》 北大核心 2026年第2期611-631,共21页
RNA二级结构作为结构生物学研究的重要内容,在维持分子稳定性和调控多种生物学功能中发挥重要作用。由于通过实验方法解析RNA二级结构的过程复杂且成本较高,发展高效准确的预测方法已成为RNA二级结构研究的重要方向。计算生物学作为重... RNA二级结构作为结构生物学研究的重要内容,在维持分子稳定性和调控多种生物学功能中发挥重要作用。由于通过实验方法解析RNA二级结构的过程复杂且成本较高,发展高效准确的预测方法已成为RNA二级结构研究的重要方向。计算生物学作为重要分析工具,为结构生物学提供了理论基础和算法支持,在预测RNA二级结构方面展现出巨大潜力,在生物医学相关领域得到了广泛关注。本文首先综述了RNA二级结构预测的主要计算方法,包括能量方法、多序列方法、传统机器学习方法、深度学习方法和基于三级结构的RNA二级结构预测方法,并对比分析了各类算法的优缺点;然后探讨了相关技术在生物医学领域中的应用,重点对RNA结合蛋白位点识别进行了总结;最后对RNA二级结构预测方法的发展前景进行了展望。本文可为相关研究提供重要参考。 展开更多
关键词 结构生物学 RNA二级结构 预测 计算生物学 RNA结合蛋白
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茶树‘大面白’线粒体基因组结构特征及其密码子偏好性分析 被引量:3
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作者 尹明华 张牧彤 +3 位作者 徐子林 欧阳茜 王美暄 李文婷 《茶叶科学》 北大核心 2025年第1期61-78,共18页
茶树‘大面白’(Camellia sinensis cv.‘Damianbai’)是上饶市广信区自主培育的国家级品种,其线粒体基因组结构特征及密码子偏好性尚不清楚。以‘大面白’为试验材料,采用高通量测序技术对其线粒体全基因组进行测序、组装、注释,采用... 茶树‘大面白’(Camellia sinensis cv.‘Damianbai’)是上饶市广信区自主培育的国家级品种,其线粒体基因组结构特征及密码子偏好性尚不清楚。以‘大面白’为试验材料,采用高通量测序技术对其线粒体全基因组进行测序、组装、注释,采用生物信息学软件对其线粒体基因组的结构特征和密码子偏好性进行分析。结果表明,‘大面白’线粒体基因组全长886354 bp,结构为完整单环状分子,GC含量为45.76%;共注释到78个功能基因,包括41个蛋白质编码基因,33个tRNA基因,4个rRNA基因;共检测到59个SSR(主要为A/T单核苷酸重复)和100个Longrepeat(主要为正向重复和回文重复)。‘大面白’线粒体基因组密码子偏好性较弱,密码子偏好以A/U结尾,密码子使用偏好性主要受自然选择的影响,受内部突变压力的影响小;‘大面白’线粒体基因组的最优密码子为14个(AAU、GAU、CAU、UUU、AUU、GCU、GGA、ACU、GUU、CGA、UUA、UUG、UCA、UCU)。11个近缘物种的线粒体基因组在基因区与‘大面白’线粒体基因组具有高度同源性;‘大面白’线粒体基因组与‘凌云白毫’(ON782577)线粒体基因组的共线性最高,两者的基因排列顺序基本一致;‘大面白’线粒体基因组与其叶绿体基因组之间具有62个高度同源性的基因片段;‘大面白’与‘凌云白毫’单独聚成一小分支,两者亲缘关系较近。本研究分析了‘大面白’线粒体基因组序列特征及系统发育进化关系,为加强‘大面白’种质鉴定及其资源多样性的开发利用提供了参考依据。 展开更多
关键词 ‘大面白’ 线粒体基因组 结构特征 密码子偏好性
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长非编码RNA在相分离调控中的作用
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作者 杨新玲 张栋栋 常晓彤 《中国生物化学与分子生物学报》 北大核心 2025年第3期384-392,共9页
相分离是细胞内生物分子由单一均相混合物形成2种不相溶的液滴凝聚体过程,是细胞内分子凝聚体和无膜细胞器形成的主要驱动力。相分离不仅在多种生理活动中发挥重要的动态调控作用,而且调控神经退行性疾病和癌症等多种疾病的发生发展。... 相分离是细胞内生物分子由单一均相混合物形成2种不相溶的液滴凝聚体过程,是细胞内分子凝聚体和无膜细胞器形成的主要驱动力。相分离不仅在多种生理活动中发挥重要的动态调控作用,而且调控神经退行性疾病和癌症等多种疾病的发生发展。已有研究发现,长非编码RNA(lncRNA)与相分离密切相关,这为理解lncRNA的作用机制打开了新的视角,成为近年来非编码RNA领域的研究热点。本文重点介绍了LncRNA SLERT作为分子伴侣与DDX21蛋白相互作用,影响核仁纤维中心区/高密度纤维区(FC/DFCs)的相分离;LINC00657(NORAD)与PUM蛋白形成NP小体,驱动PUM蛋白的相分离而抑制其活性,促进基因组的稳定性;dilncRNA调控DNA损伤应答小RNAs(DDRNA)、p53结合蛋白1(53BP1)的相分离,lncRNA LINP1相分离液滴与Ku蛋白结合促进DNA损伤修复;LncRNA SNHG9、MELTF-AS1、MALR分别驱动LATS1、YBX1、ILF3蛋白质的相分离发挥促癌lncRNAs作用,GIRGL、LncFASA分别调控CAPRIN1、PRDX1的相分离在癌症发展中发挥抑癌基因作用;lncRNA XIST通过相分离驱动X染色体失活的研究。总之,本文综述了lncRNAs通过调节相分离在细胞核无膜细胞器的形成、基因组稳定性与DNA损伤修复、肿瘤发生发展和X染色体失活等病理生理过程中的最新研究进展。本文表明长非编码RNA可通过调节相分离,参与多种病理生理过程,有望为相分离介导的疾病的治疗提供新的方向。 展开更多
关键词 相分离 长非编码RNA 无膜细胞器 DNA损伤修复 癌症 X染色体失活
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RNA接近自复制临界点
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作者 Robert F.Service 《科技导报》 北大核心 2026年第4期15-16,共2页
某些RNA分子可生成自身镜像,暗示类似分子或为生命出现的起点。如今,RNA看似被其耀眼的表亲DNA所掩盖,但许多科学家认为,在生命诞生之初,RNA分子曾是舞台主角。它们既能存储遗传信息,又能自我复制,或曾触发演化进程,催生日益复杂的生命... 某些RNA分子可生成自身镜像,暗示类似分子或为生命出现的起点。如今,RNA看似被其耀眼的表亲DNA所掩盖,但许多科学家认为,在生命诞生之初,RNA分子曾是舞台主角。它们既能存储遗传信息,又能自我复制,或曾触发演化进程,催生日益复杂的生命形式。 展开更多
关键词 生命起源 自我复制 遗传信息 科学家 RNA DNA
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以mRNA技术培育生物医药产业新质生产力的实证分析——以浙江省为例
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作者 劳慧敏 李超 +1 位作者 沈泓 周武源 《中国现代应用药学》 北大核心 2025年第15期2721-2725,共5页
目的探讨浙江省如何利用mRNA技术培育生物医药产业新质生产力,以提升产业竞争力,缩小与全球领先地区的差距。方法通过文献调研、专利分析和实地考察,综合评估浙江省在mRNA领域的科研实力、创新平台、产业化基础,并识别其在技术壁垒、资... 目的探讨浙江省如何利用mRNA技术培育生物医药产业新质生产力,以提升产业竞争力,缩小与全球领先地区的差距。方法通过文献调研、专利分析和实地考察,综合评估浙江省在mRNA领域的科研实力、创新平台、产业化基础,并识别其在技术壁垒、资金短缺、产业链协同不足和监管审批滞后等方面面临的主要挑战。结果浙江省在mRNA研究和产业化方面已具备一定基础,但与国际先进水平相比,仍存在关键技术储备不足、融资难度大、产业链协同性弱和监管审批效率低等问题。提出的对策包括加强关键技术研发、优化资金和人才资源配置、促进产学研医深度合作和完善政策环境。结论浙江省需通过强化mRNA技术攻关、提升资源配置效率、深化产业合作和优化政策支持,以加速mRNA技术在生物医药产业的转化应用,培育产业新动能,提升整体竞争力,形成具有全球影响力的生物医药产业新质生产力。 展开更多
关键词 信使核糖核酸 生物医药产业 新质生产力 实证分析 浙江省
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lncRNA663调控CLDN10表达及猪流行性腹泻病毒复制的功能分析
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作者 吴作林 梁海江 +3 位作者 吴哲豫 杨松柏 赵阿勇 钦伟云 《畜牧兽医学报》 北大核心 2026年第2期945-954,共10页
猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)是一种引起仔猪急性腹泻、呕吐及脱水等临床症状的冠状病毒,对全球猪养殖业造成了严重的经济损失。越来越多的研究报道长链非编码RNA(lncRNA)在猪冠状病毒中发挥着重要的调控作... 猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)是一种引起仔猪急性腹泻、呕吐及脱水等临床症状的冠状病毒,对全球猪养殖业造成了严重的经济损失。越来越多的研究报道长链非编码RNA(lncRNA)在猪冠状病毒中发挥着重要的调控作用,然而,关于lncRNA663在PEDV感染中的调控作用和机制研究尚未有相关报道。基于前期高通量转录组数据分析,笔者发现lncRNA 663与紧密连接蛋白CLDN10具有共表达趋势,因此本研究以lncRNA 663和CLDN10为试验对象,探索其在PEDV感染中的调控作用。本研究qRT-PCR和Western blot结果显示,PEDV感染IPEC-J2细胞后上调了lncRNA 663和CLDN10的表达水平(P<0.05),DSS处理则显著降低了lncRNA 663和CLDN10的表达水平(P<0.05)。亚细胞定位预测发现lncRNA 663主要定位于细胞质,RPISeq预测发现lncRNA663和CLDN10高度互作(SVM:0.98,RF:0.8);功能试验结果显示,siRNAs敲低lncRNA 663后,CLDN10的mRNA和蛋白表达水平显著下降,PEDV复制水平亦同步降低(P<0.05)。进一步通过AlphaFold3和ChimeraX进行结构预测,发现CLDN10可能与PEDV S蛋白形成7个氢键结合位点,提示其可能参与病毒侵染过程。综上所述,本研究初步揭示lncRNA 663通过调控CLDN10表达促进PEDV复制的可能机制,为深入解析病毒与宿主非编码RNA互作关系及干预靶点提供参考。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 长链非编码RNA CLDN10 肠道屏障
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痛性糖尿病周围神经病变的营养感知机制:基于背根神经节多组学测序发现枢纽miRNA-mRNA调控网络
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作者 高堂清 罗静雅 +2 位作者 赵梦雪 吴畏 杨海红 《陆军军医大学学报》 北大核心 2026年第6期757-767,共11页
目的痛性糖尿病周围神经病变(painful diabetic peripheral neuropathy,PDPN)是糖尿病常见的破坏性并发症,其临床表现及发病机制复杂。从PDPN进展来看,营养感知如何改变基因转录是非常值得探讨的科学问题。然而其潜在的分子机制,尤其是... 目的痛性糖尿病周围神经病变(painful diabetic peripheral neuropathy,PDPN)是糖尿病常见的破坏性并发症,其临床表现及发病机制复杂。从PDPN进展来看,营养感知如何改变基因转录是非常值得探讨的科学问题。然而其潜在的分子机制,尤其是背根神经节(dorsal root ganglia,DRG)中的转录后调控机制与PDPN之间的关联仍然知之甚少。因此,本研究采用整合的多组学方法,在成熟的PDPN大鼠模型的DRG中全面描绘了miRNA和mRNA的表达图谱并分析其调控脉络。方法选取18只雄性SD大鼠(4~5周龄,体质量90~100 g),随机分为阴性对照组(vehicle control)和PDPN组,利用链脲佐菌素(streptozotocin,STZ)诱导大鼠发生糖尿病,构建PDPN大鼠模型。取两组(n=3)的L4-L6 DRG组织,进行miRNA和mRNA高通量测序。通过生物信息学分析筛选差异表达的miRNAs(DEmiRs)和mRNAs(DEGs),并进行GO和KEGG富集分析,整合数据构建了miRNA-mRNA调控网络,最后通过RT-qPCR进行初步验证,并与人源相关数据进行分析比对。结果鉴定出11个显著上调和7个显著下调的DemiRs(|log_(2)FC|>1,P<0.05),以及416个上调和110个下调的DEGs(|log_(2)FC|>1,P<0.05)。KEGG通路分析显示DEGs显著富集于神经活性配体—受体相互作用和脂质代谢等与疼痛和糖尿病代谢密切相关的通路(阈值P<0.05)。通过构建miRNA-mRNA调控网络,结果显示Ms4a2、Itgax、Wnt3、Tnn以及上游miRNA可能是调节PDPN进展的核心枢纽。结论本研究初步系统地描绘了PDPN模型中DRG的miRNA-mRNA互作图谱,显示Ms4a2、Itgax、Wnt3、Tnn以及上游miRNA可能调节PDPN进展的营养感知机制,揭示了let-7i-5p、miR-9a-5p、miR-543-5p、miR-199a-5p、miR-324-5p、miR-702-3p、Ikzf3、Klhl6、Igsf6、Tmc8、Tmc1、Lmx1a、Cldn16、Vwc2、Cyp2c23等多个PDPN的潜在靶点,发现了鞘脂代谢很可能是联系代谢改变与PDPN发生之间的重要通路。从新的角度,初步探讨了PDPN进展的营养感知机制。 展开更多
关键词 痛性糖尿病周围神经病变 鞘脂代谢 营养感知 miRNA-mRNA
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食品香菇源性成分荧光PCR检测方法研究
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作者 苏丽娜 李凤新 +2 位作者 吴杰 曾宪东 郑剑 《生物技术进展》 2026年第1期149-156,共8页
香菇具有重要的食药用价值,市场上掺假的情况屡有发生,传统的形态学鉴定方法难以对香菇深加工产品进行鉴定,建立香菇源性成分分子生物学检测方法具有重要意义。根据香菇线粒体烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶亚单位1(nicotinamide adenine d... 香菇具有重要的食药用价值,市场上掺假的情况屡有发生,传统的形态学鉴定方法难以对香菇深加工产品进行鉴定,建立香菇源性成分分子生物学检测方法具有重要意义。根据香菇线粒体烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶亚单位1(nicotinamide adenine dinucleotide dehydrogenase subunit 1, ND1)基因序列设计特异性引物和探针,建立食品中香菇源性成分实时荧光PCR检测方法。结果表明,方法仅对花菇、厚菇、薄菇、野生香菇有扩增,对其他常见的28种食用菌均无交叉反应,方法的检出限分别为100 copies·μL^(-1)和0.05%(质量分数),且具有很好的重复性,实际应用检测准确。该方法特异性好、灵敏度高,稳定且实用,可以满足食品中香菇源性成分的检测需求。 展开更多
关键词 香菇 烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶亚单位1 实时荧光PCR 源性成分检测
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茶树PATL基因家族鉴定及CsPATL1上游转录调控分析 被引量:1
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作者 王金波 谢思艺 +3 位作者 窦祥亚 申小华 田娜 刘硕谦 《茶叶科学》 北大核心 2025年第2期191-200,共10页
Patellin(PATL)基因家族对植物生长发育和环境适应性有着重要影响。对茶树PATL(CsPATL)基因家族进行了系统鉴定和详细分析,通过多种生物信息学方法,成功鉴定出CsPATL家族的5个成员,并对其蛋白序列的理化性质进行了分析,结果表明,CsPATL... Patellin(PATL)基因家族对植物生长发育和环境适应性有着重要影响。对茶树PATL(CsPATL)基因家族进行了系统鉴定和详细分析,通过多种生物信息学方法,成功鉴定出CsPATL家族的5个成员,并对其蛋白序列的理化性质进行了分析,结果表明,CsPATL家族的5个成员编码氨基酸232~585个,蛋白质分子质量为26.31~64.69 kDa,等电点为4.65~9.35。同时,对这些基因的染色体定位及其启动子序列中的顺式元件进行了详细分析,发现这些基因不均匀地分布在4条染色体上,主要参与植物激素响应、非生物胁迫响应和光响应。通过酵母单杂交试验、凝胶电泳迁移试验和双荧光素酶试验验证了Cshdz7可以直接结合CsPATL1的启动子并促进CsPATL1的表达。这些发现为理解CsPATL家族基因在茶树发育调控中的作用提供了新的视角。 展开更多
关键词 茶树 基因家族 CsPATL1 启动子 转录调控
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小分子靶标适配体的筛选与鉴定策略 被引量:1
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作者 张小娟 王梁华 《中国生物化学与分子生物学报》 北大核心 2025年第11期1656-1667,共12页
小分子通常指分子量小于1 kD的天然化合物,它们在生物科学、医药卫生和环境科学等多领域有重要的研究价值。适配体(aptamers)作为一种新型的生物识别元件,可特异地与小分子等靶标以高亲和力结合。它们是由指数富集的配体系统进化(system... 小分子通常指分子量小于1 kD的天然化合物,它们在生物科学、医药卫生和环境科学等多领域有重要的研究价值。适配体(aptamers)作为一种新型的生物识别元件,可特异地与小分子等靶标以高亲和力结合。它们是由指数富集的配体系统进化(systematic evolution of ligands by exponential enrichment,SELEX)技术筛选而得的单链短核苷酸序列。与大分子靶标的适配体相比,小分子靶标的适配体常表现出筛选困难、亲和力低和特异性差等缺点。为了解决这些瓶颈问题,本文提供了一些小分子靶标适配体筛选与鉴定的策略。首先,设计小分子靶标适配体的筛选方案时,本文提出需将关注点放在文库设计、SELEX方法、扩增方法、筛选进程监测方法和适配体序列分析方法等关键环节或方法的选择上,依据实际情况选择或设计适宜的策略。其次,适配体的结构与亲和力直接影响着它们的应用,本文简要介绍了适配体二级结构和三级结构的分析方法以及常见的6种亲和力鉴定方法。最后,本文讨论了小分子靶标适配体筛选与鉴定中存在的一些问题,展望了未来发展前景。全文旨在为小分子靶标适配体筛选与鉴定的多个环节提供研究策略,为提高适配体筛选与鉴定效率提供参考。 展开更多
关键词 小分子 适配体 指数富集的配体系统进化 结构分析 亲和力鉴定
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鼻咽癌组织中lncRNA ANCR表达与临床病理特征的相关性研究 被引量:1
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作者 高妍 王忠巧 《实用临床医药杂志》 2025年第3期1-5,共5页
目的探讨鼻咽癌组织中长链非编码RNA抗分化非编码RNA(lncRNA ANCR)表达与临床病理特征的相关性。方法随机纳入2015年6月—2019年6月在本院病理确诊鼻咽癌的115例患者为研究对象,采用实时荧光定量PCR法检测肿瘤组织与癌旁正常组织中lncRN... 目的探讨鼻咽癌组织中长链非编码RNA抗分化非编码RNA(lncRNA ANCR)表达与临床病理特征的相关性。方法随机纳入2015年6月—2019年6月在本院病理确诊鼻咽癌的115例患者为研究对象,采用实时荧光定量PCR法检测肿瘤组织与癌旁正常组织中lncRNA ANCR表达量。分析lncRNA ANCR表达与性别、年龄、病理类型、最大直径、分化级别、临床分期、淋巴结转移的相关性。随访60个月,记录患者肿瘤进展和总生存情况。结果肿瘤组织中lncRNA ANCR表达量高于癌旁正常组织,差异有统计学意义(P<0.001)。最大直径≥3 cm、低分化、Ⅲ~Ⅳ期、淋巴结转移阳性患者肿瘤组织中lncRNA ANCR表达量高于最大直径<3 cm、中高分化、Ⅰ~Ⅱ期、淋巴结转移阴性患者,差异有统计学意义(P<0.001)。肿瘤进展、死亡患者肿瘤组织中lncRNA ANCR表达量高于肿瘤未进展、存活患者,差异有统计学意义(P<0.001)。多因素Logistic回归分析显示,最大直径≥3 cm、Ⅲ~Ⅳ期、淋巴结转移阳性、lncRNA ANCR表达量与肿瘤进展密切相关,Ⅲ~Ⅳ期和lncRNA ANCR表达量与死亡密切相关(P<0.001)。受试者工作特征(ROC)曲线显示,肿瘤组织中lncRNA ANCR表达量预测肿瘤进展和死亡的曲线下面积(AUC)分别为0.899和0.842(P<0.001)。Kaplan-Meier生存曲线显示,肿瘤组织中lncRNA ANCR高表达组5年生存率低于lncRNA ANCR低表达组,差异有统计学意义(P<0.01)。结论肿瘤组织中lncRNA ANCR高表达可能参与鼻咽癌的恶性发展,与临床预后密切相关。 展开更多
关键词 鼻咽癌 长链非编码RNA 抗分化非编码RNA 恶性肿瘤 病理特征
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‘白毫早’叶绿体与线粒体基因组密码子偏好性分析
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作者 曾文娟 刘珊 +4 位作者 文聪 张其湘 黄静 龚意辉 陈致印 《茶叶科学》 北大核心 2025年第4期587-603,共17页
密码子使用偏好性作为基因表达调控与分子进化的关键驱动机制,在植物细胞器基因组演化中具有重要生物学意义。以茶树品种‘白毫早’(Camellia sinensis cv.‘Baihaozao’)为对象,系统解析其叶绿体(52个基因)与线粒体(29个基因)基因组的... 密码子使用偏好性作为基因表达调控与分子进化的关键驱动机制,在植物细胞器基因组演化中具有重要生物学意义。以茶树品种‘白毫早’(Camellia sinensis cv.‘Baihaozao’)为对象,系统解析其叶绿体(52个基因)与线粒体(29个基因)基因组的密码子使用模式及进化驱动力。结果表明:(1)叶绿体基因组平均有效密码子数(ENC=44.57±4.59)显著低于线粒体基因组(ENC=51.87±5.31),两者均呈现弱偏好性特征。中性分析揭示,叶绿体偏好性主要由自然选择主导(GC3s与ENC相关性R^(2)=0.016),而线粒体则受自然选择与突变压力协同调控(R^(2)=0.11),与双子叶植物细胞器基因组的进化约束差异规律一致。(2)相对同义密码子使用度(Relative synonymous codon usage,RSCU)分析表明,两类细胞器基因组均显著偏好以A/U结尾的同义密码子,其中叶绿体高表达基因(如ndhA、rps14)表现出更强的A/U末端偏好性,暗示翻译选择对高表达基因的优化作用。(3)通过多变量统计筛选,确定18个叶绿体最优密码子(GCA、GCU等)及18个线粒体最优密码子(GCA、AGA等),其中GCA在两类细胞器中均被优选,显示跨细胞器功能基因的适应性趋同。本研究阐明了‘白毫早’细胞器基因组密码子使用特征的异质性及其进化驱动力,为茶树分子育种中外源基因的适配性优化及跨细胞器表达调控网络的构建提供了理论依据。 展开更多
关键词 白毫早 叶绿体基因组 线粒体基因组 密码子使用偏好性 最优密码子
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‘槠叶齐’叶绿体与线粒体基因组密码子偏好性分析
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作者 曾文娟 朱友鹏 +4 位作者 陈嘉欣 李洪玉 王双辉 龚意辉 陈致印 《茶叶科学》 北大核心 2025年第2期201-218,共18页
密码子使用偏好性作为基因表达调控与分子进化的重要驱动力,在植物细胞器基因组研究中具有特殊意义。‘槠叶齐’(Camellia sinensis cv.‘Zhuyeqi’)作为中国重要的茶树品种,其细胞器基因组密码子使用模式尚未见系统报道。本研究对‘槠... 密码子使用偏好性作为基因表达调控与分子进化的重要驱动力,在植物细胞器基因组研究中具有特殊意义。‘槠叶齐’(Camellia sinensis cv.‘Zhuyeqi’)作为中国重要的茶树品种,其细胞器基因组密码子使用模式尚未见系统报道。本研究对‘槠叶齐’52个叶绿体编码基因和29个线粒体编码基因开展系统生物学分析。结果表明:(1)‘槠叶齐’叶绿体基因组(ENC=44.64±3.25)和线粒体基因组(ENC=51.98±3.47)均呈现弱密码子偏好性,其中叶绿体偏好性主要受自然选择驱动(GC3s与ENC相关性R2=0.482),而线粒体受自然选择与突变压力共同作用(R2=0.312);(2)相对同义密码子使用度(RSCU)分析揭示两个细胞器基因组均显著偏好以A/U结尾的同义密码子,其中叶绿体基因组高表达基因(rpoC2、psbA等)呈现更强的密码子偏好;(3)通过多参数筛选获得20个叶绿体最优密码子(GCA、GCU等)和23个线粒体最优密码子(GCC、AGG等)。本研究阐明了‘槠叶齐’细胞器基因组密码子使用特征及其进化驱动力,为茶树分子育种体系优化和外源基因高效表达提供了重要理论依据。 展开更多
关键词 槠叶齐 叶绿体基因组 线粒体基因组 密码子使用偏好性 最优密码子
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