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花苜蓿抗旱耐盐EST-SSR标记筛选 被引量：8
1
作者 刘洁 胡蝶 +2 位作者 楚海家 闫娟 李建强 《植物科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第5期493-499,共7页
为了给花苜蓿(Medicago ruthenica Trautv.)抗旱耐盐的生态适应性研究提供特异的遗传标记,在已公布的70对鹰嘴豆抗旱耐盐EST-SSR标记中筛选出稳定性好、多态性高的8对引物,并用这8对引物对挑选出的11个居群的286个个体进行扩增,获得111... 为了给花苜蓿(Medicago ruthenica Trautv.)抗旱耐盐的生态适应性研究提供特异的遗传标记,在已公布的70对鹰嘴豆抗旱耐盐EST-SSR标记中筛选出稳定性好、多态性高的8对引物,并用这8对引物对挑选出的11个居群的286个个体进行扩增,获得111个等位基因。平均等位基因数为13.88;平均观察杂合度为0.497;平均预期杂合度为0.687;多态信息含量从0.313到0.883不等,平均值为0.649。以上结果表明,筛选出来的8个EST-SSR标记可以用于花苜蓿的遗传多样性分析,而且遗传多样性处于较高水平。多态性丰富的EST-SSR引物适用于花苜蓿生态适应性进化分析,对揭示花苜蓿抗旱耐盐基因型的遗传变异和地理分布格局以及探讨花苜蓿抗旱耐盐的适应性分化机制有重要意义。 展开更多
关键词 花苜蓿 EST—SSR标记 抗旱耐盐 引物筛选
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干旱胁迫下甘蔗幼苗cDNA文库构建与乙烯反应转录因子cDNA筛选研究 被引量：2
2
作者 贺俐 许东风 吴杨 《广东农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第21期154-156,167,共4页
以甘蔗幼苗叶片为材料,建立了干旱胁迫下的甘蔗幼苗cDNA文库。文库质量鉴定结果表明,文库的滴度为1.4×106PFU/mL,重组率约为96.2%,扩增后的滴度为1.6×109PFU/mL,容量约为2.8×109PFU,插入片段大小在0.5-2.0 kb之间。利用... 以甘蔗幼苗叶片为材料,建立了干旱胁迫下的甘蔗幼苗cDNA文库。文库质量鉴定结果表明,文库的滴度为1.4×106PFU/mL,重组率约为96.2%,扩增后的滴度为1.6×109PFU/mL,容量约为2.8×109PFU,插入片段大小在0.5-2.0 kb之间。利用基于PCR技术的96孔文库筛选方法,从文库中筛选到1个响应干旱胁迫的目标基因的全长cDNA,经生物信息学分析,推测候选基因为乙烯反应转录因子(ethylene response factor,ERF)基因。 展开更多
关键词 甘蔗 干旱 CDNA文库 乙烯反应转录因子(ERF)
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薰衣草CBF途径相关耐寒基因挖掘与调控网络分析 被引量：7
3
作者 蔺海娇 梁雨晨 +4 位作者 李玲 马军 张璐 兰振颖 苑泽宁 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期131-144,共14页
为探究薰衣草(Lavandula angustifolia Mill.)的耐冷机制,使用转录组学方法对薰衣草响应冷处理的分子调控网络进行挖掘分析。CBF转录因子和其靶基因COR形成的CBF-COR调控网络在增强植物耐冷胁迫中作用显著。本研究中共发现7个CBF基因(La... 为探究薰衣草(Lavandula angustifolia Mill.)的耐冷机制,使用转录组学方法对薰衣草响应冷处理的分子调控网络进行挖掘分析。CBF转录因子和其靶基因COR形成的CBF-COR调控网络在增强植物耐冷胁迫中作用显著。本研究中共发现7个CBF基因(LaCBF)和11个COR基因(LaCOR)在冷处理下的表达具有显著差异,同时在CBF信号调控通路中发现4个上游基因LaICE1、LaCAMTA3、LaEBF1、LaCCA1对冷胁迫有响应,认为这些基因共同形成的冷信号调控网络在薰衣草抵御低温中起到了重要作用。 展开更多
关键词 薰衣草 低温胁迫 转录组学分析 CBF转录因子
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基于RNA-Seq技术的野生和圈养塔里木马鹿皮肤组织转录组比较分析 被引量：2
4
作者 布威海丽且姆·阿巴拜科日 单文娟 +1 位作者 马合木提·哈力克 钟林强 《野生动物学报》 北大核心 2023年第1期76-89,共14页
为探寻野生和圈养塔里木马鹿(Cervus elaphus yarkandensis)的基因表达谱是否存在差异,并进一步筛选该物种适应干旱环境的相关基因,利用RNA-Seq技术对野生和圈养塔里木马鹿的皮肤组织进行转录组测序,对测序数据质控后比对参考基因组,筛... 为探寻野生和圈养塔里木马鹿(Cervus elaphus yarkandensis)的基因表达谱是否存在差异,并进一步筛选该物种适应干旱环境的相关基因,利用RNA-Seq技术对野生和圈养塔里木马鹿的皮肤组织进行转录组测序,对测序数据质控后比对参考基因组,筛选差异表达基因并对其进行功能注释和富集分析,利用qRT-PCR方法对转录组测序结果进行可靠性检测。结果显示:与圈养塔里木马鹿相比,在野生塔里木马鹿皮肤组织中共有3 303个差异表达基因,包括上调表达基因1 535个,下调表达基因1 768个,其中上调表达基因显著富集在221个GO terms和12个KEGG通路上,下调表达基因显著富集在1 104个GO terms和38个KEGG通路上;qRT-PCR分析结果显示,转录组测序结果可靠。相比于圈养塔里木马鹿,皮肤和表皮发育相关基因、DNA损伤修复相关基因、转谷氨酰胺酶编码基因和热休克蛋白家族基因在野生塔里木马鹿皮肤组织中上调表达,表明这些基因可能直接或间接参与塔里木马鹿在极端干旱炎热环境中的皮肤保护策略,通过最大限度地减少水分流失和调节体温来保护机体免受外界刺激的损伤。皮肤发育相关基因(K2C6A)、热应激相关基因(HSPA4、TRAP1和HSPH1)和氧化应激相关基因(PRDX2和PRDX6)在塔里木马鹿干旱环境适应性中可能发挥潜在作用。 展开更多
关键词 塔里木马鹿 环境适应性 转录组 差异表达基因
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蝙蝠核心生物钟基因Per1昼夜表达节律与适应性进化研究 被引量：1
5
作者 王慧 许宁宁 +1 位作者 李昕彤 冯江 《兽类学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期259-267,共9页
长期以来,生物钟相关研究一直是生命科学领域的热点话题。以往研究表明核心生物钟基因Per1广泛参与哺乳动物昼夜节律调控。然而,Per1基因在具有不同昼夜节律活动模式的哺乳动物中是否发生了遗传位点改变,以及这些改变是否促进了哺乳动... 长期以来,生物钟相关研究一直是生命科学领域的热点话题。以往研究表明核心生物钟基因Per1广泛参与哺乳动物昼夜节律调控。然而,Per1基因在具有不同昼夜节律活动模式的哺乳动物中是否发生了遗传位点改变,以及这些改变是否促进了哺乳动物昼夜活动模式的形成和稳定仍有待研究。本研究通过荧光定量PCR、基因克隆测序与分子进化分析方法,对核心生物钟基因Per1开展了深入的分子进化分析,明确了Per1基因在夜行性蝙蝠脑区的昼夜振荡规律,由休息状态到睡眠状态对应着Per1基因表达量的由高到低,睡眠状态的表达量最低,而由觉醒状态到活动状态对应着Per1基因表达量的持续升高,与Per1基因维持中枢生物钟调控功能高度相关;检测到Per1基因序列上的15个潜在受正选择位点与2个显著受正选择位点,其中在夜行性动物中检测到的显著受正选择的1118A氨基酸位点恰好位于该基因编码蛋白的功能域上;通过滑窗分析结果显示,Per1基因在夜行性哺乳动物中的进化速率均普遍高于其在日行性哺乳动物中的进化速率,可能促进了哺乳动物夜行性活动模式的形成和稳定。本研究为深入理解哺乳动物自身稳态维持与适应环境周期性变化的关键分子基础提供新的认知,为生物钟相关研究提供思路和参考。 展开更多
关键词 生物钟 夜行性哺乳动物 Per1基因 昼夜节律 适应性进化
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不同海拔高原鼠兔个性特征与SERT基因多态性关联
6
作者 朱红娟 李婧 +3 位作者 王苏芹 唐琦 蓝贤勇 曲家鹏 《兽类学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期540-552,共13页
个性特征是指动物个体间稳定、可遗传的行为差异,与相关基因多态性有关,反映了动物对环境的适应模式,探究个性相关基因变异,将有助于更好地理解动物对环境的适应与进化机制。本文以高原鼠兔(Ochotona curzoniae)为对象,研究了5个不同海... 个性特征是指动物个体间稳定、可遗传的行为差异,与相关基因多态性有关,反映了动物对环境的适应模式,探究个性相关基因变异,将有助于更好地理解动物对环境的适应与进化机制。本文以高原鼠兔(Ochotona curzoniae)为对象,研究了5个不同海拔地区高原鼠兔的个性(探究性、勇敢性和温顺性)差异特征,并检测了个性相关基因5-羟色胺转运体(SERT)的单核苷酸多态性(SNP)和mRNA表达。结果发现,高海拔地区高原鼠兔的探究性和勇敢性显著高于低海拔地区,而高海拔地区高原鼠兔SERT基因mRNA表达量显著低于低海拔地区,提示不同海拔高原鼠兔个性特征差异可能与SERT基因mRNA表达有所关联。进一步检测不同海拔地区高原鼠兔SERT基因多态性及其分布差异情况,发现该基因存在6个SNP(其中5个位于外显子3,1个位于外显子5);不同海拔地区鼠兔基因分布差异分析显示外显子5的c.A1063C同义突变与海拔之间存在显著相关,高海拔地区该位点CC基因型分布频率显著高于低海拔地区;c.A1063C的基因型虽然与探究性、勇敢性无显著相关,但与温顺性显著相关。综上所述,随着海拔升高,高原鼠兔探究性和勇敢性增加,这有利于动物获取更多的食物资源,进而增加其生存机会。与此同时,SERT基因多态性显示与不同海拔地区的生存环境相适应的特征,且与温顺性有关,暗示不同海拔高原鼠兔个性差异可能与SERT基因SNP的差异有关。本研究从基因表达与突变的角度尝试阐述高原鼠兔适应不同海拔环境的行为差异,显示了不同海拔地区高原鼠兔行为生存策略潜在的分子机制。 展开更多
关键词 个性特征 海拔 5-羟色胺转运体 高原鼠兔
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基于基因组学的高海拔适应研究进展 被引量：1
7
作者 蒲旭欣 陈中叶 +3 位作者 高萌泽 何访访 崔云斌 邹登朗 《青海草业》 2023年第2期25-28,共4页
关于生物适应性机制的研究一直被学者重视,生物的适应性体现为不同环境的影响下,物种为提高存活率而演化出不同的表型,如生理、形态、组织、行为等。随着分子生物学和分析技术的发展,更多复杂性状的调控被发现并研究,这对于分析基因型... 关于生物适应性机制的研究一直被学者重视,生物的适应性体现为不同环境的影响下,物种为提高存活率而演化出不同的表型,如生理、形态、组织、行为等。随着分子生物学和分析技术的发展,更多复杂性状的调控被发现并研究,这对于分析基因型和表型的关联以及生物多样性的研究有重大意义。在高海拔环境下生存的生物在极端恶劣环境下经历了漫长的自然选择后,各自有不同程度的表型和通过遗传的适应。本文从基因组学的角度入手,详细对高海拔地区生物的遗传与适应机制方面进行了阐述,以期对相关领域的研究提供参考和对未来高海拔生物适应机制研究奠定基础。 展开更多
关键词 基因组学 高海拔 适应
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