以贵州铜仁5个群体60份地方茶树资源为材料,利用简化基因组测序(genotyping by sequencing,GBS)鉴定全基因组单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点,通过系统进化树分析、主成分分析和遗传结构分析评价地方茶树资源...以贵州铜仁5个群体60份地方茶树资源为材料,利用简化基因组测序(genotyping by sequencing,GBS)鉴定全基因组单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点,通过系统进化树分析、主成分分析和遗传结构分析评价地方茶树资源遗传关系。结果表明:依据次要等位基因频率>0.05及数据完整度>0.80的筛选过滤条件,共得到6749675个SNP位点,基因型完整度为92.75%;群体系统进化树分析、主成分分析和群体遗传结构分析结果均显示同一区域内地方茶树材料亲缘关系较近,且均将贵州铜仁地方茶树资源划分为两大类群,德江、沿河县塘坝乡和沿河县后坪乡样本为一类群,印江和石阡样本为一类群,表明其可能来源于不同祖先。这一研究可为深入探究地方茶树起源和演变过程、种质创新、品种选育和合理保护地方茶树基因资源提供可靠依据。展开更多
文摘以贵州铜仁5个群体60份地方茶树资源为材料,利用简化基因组测序(genotyping by sequencing,GBS)鉴定全基因组单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点,通过系统进化树分析、主成分分析和遗传结构分析评价地方茶树资源遗传关系。结果表明:依据次要等位基因频率>0.05及数据完整度>0.80的筛选过滤条件,共得到6749675个SNP位点,基因型完整度为92.75%;群体系统进化树分析、主成分分析和群体遗传结构分析结果均显示同一区域内地方茶树材料亲缘关系较近,且均将贵州铜仁地方茶树资源划分为两大类群,德江、沿河县塘坝乡和沿河县后坪乡样本为一类群,印江和石阡样本为一类群,表明其可能来源于不同祖先。这一研究可为深入探究地方茶树起源和演变过程、种质创新、品种选育和合理保护地方茶树基因资源提供可靠依据。
