糜子叶绿体基因组密码子使用偏性的分析 被引量：61

1

作者 刘慧 王梦醒 +4 位作者 岳文杰 邢光伟 葛玲巧 聂小军 宋卫宁 《植物科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期362-371,共10页

密码子使用偏性(CUB)是生物体重要的进化特征,对研究物种进化、基因功能以及外源基因表达等具有重要科学意义。本研究利用糜子(Panicum miliaceum L.)叶绿体基因组中筛选出的53条蛋白编码序列,对其密码子使用模式及偏性进行了分析。结... 密码子使用偏性(CUB)是生物体重要的进化特征,对研究物种进化、基因功能以及外源基因表达等具有重要科学意义。本研究利用糜子(Panicum miliaceum L.)叶绿体基因组中筛选出的53条蛋白编码序列,对其密码子使用模式及偏性进行了分析。结果表明,糜子叶绿体基因的有效密码子数(ENC)在37.14~61之间,多数密码子的偏性较弱。相对同义密码子使用度(RSCU)分析发现,RSCU>1的密码子有32个,其中28个以A、U结尾,表明第3位密码子偏好使用A和U碱基。中性分析发现,GC_3与GC_(12)的相关性不显著,回归曲线斜率为0.2129,表明密码子偏性主要受到自然选择的影响;而ENC-plot分析发现大部分基因落在曲线的上方及周围,表明突变也影响了密码子偏性的形成。进一步的对应性分析发现,第1轴为主要影响因素,解释了17.92%的差异,其与ENC、GC_3S值的相关性均达到显著水平,但与CBI、GCall不相关。最后,9个密码子被鉴定为糜子叶绿体基因组的最优密码子,糜子叶绿体基因组的密码子使用偏性可能受选择和突变共同作用。 展开更多

关键词 糜子 叶绿体 密码子偏好性 最优密码子

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青藏高原垂穗披碱草遗传变异的地理因素分析 被引量：36

2

作者 严学兵 郭玉霞 +1 位作者 周禾 王堃 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期328-333,共6页

采用等位酶标记对我国青藏高原地区垂穗披碱草的9个种群进行遗传变异和系统关系分析.结果表明,不同种群间遗传距离范围在0.010 6-0.377 8,种群间遗传距离和地理环境关系密切.采用聚类分析和二维、三维Mantel检验,对青藏高原垂穗披碱草(E... 采用等位酶标记对我国青藏高原地区垂穗披碱草的9个种群进行遗传变异和系统关系分析.结果表明,不同种群间遗传距离范围在0.010 6-0.377 8,种群间遗传距离和地理环境关系密切.采用聚类分析和二维、三维Mantel检验,对青藏高原垂穗披碱草(Elymusnutans Griseb.)不同种群间遗传距离与环境条件的关系(纬度、经度和海拔)进一步分析发现,海拔和地理位置(纬度和经度)均明显影响垂穗披碱草种群遗传差异.种群间遗传距离和海拔(R=0.476 8)、地理位置(R=0.447 1)均呈现显著正相关,种群间遗传距离随着海拔、地理位置差距的增大而增加,但海拔是影响其遗传结构的最重要因素,其次是经纬度. 展开更多

关键词 披碱草 遗传距离 地理位置 海拔

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短枝木麻黄种群苗期表型多样性评价 被引量：10

3

作者 胡盼 仲崇禄 +4 位作者 张勇 姜清彬 陈羽 陈珍 KHONGSAK Pinyopusarerk 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期1013-1020,共8页

以来源于大洋洲原生种源区、亚洲原生种源区、亚洲引种次生区以及非洲引种次生区4个区域的20个种源短枝木麻黄种子和当年生幼苗为材料,通过种子千粒重以及幼苗苗高、地径、一级侧枝粗度、一级侧枝长度等7个性状对短枝木麻黄表型多样性... 以来源于大洋洲原生种源区、亚洲原生种源区、亚洲引种次生区以及非洲引种次生区4个区域的20个种源短枝木麻黄种子和当年生幼苗为材料,通过种子千粒重以及幼苗苗高、地径、一级侧枝粗度、一级侧枝长度等7个性状对短枝木麻黄表型多样性进行了研究,以探讨种群苗期表型遗传差异,为短枝木麻黄早期遗传选择和遗传改良提供基本资料。结果表明:(1)短枝木麻黄种子千粒重在区域间和区域内种源间差异极显著,且千粒重具有显著的地理变异模式,随经度的增大而降低。(2)当年生幼苗苗高、地径在不同区域间及区域内种源间均存在极显著差异,其中泰国干东港种源幼苗生长最好(苗高76.6cm,地径4.64mm),而种源汤加的幼苗生长最差(苗高28.3cm,地径2.58mm)。(3)当年生幼苗一级侧枝粗度、一级侧枝长度、二级侧枝长度、每小枝节数和齿叶数在不同区域间及区域内种源间均存在极显著差异,其中齿叶数在区域间的变异系数最大(82.15%)。(4)通径分析表明,一级侧枝长度对苗高具有显著的正向影响作用,而一级侧枝粗度和二级侧枝长度对地径具有显著正向影响作用,它们可作为短枝木麻黄优良新品种筛选的参考因子。 展开更多

关键词 短枝木麻黄 苗期 种源 表型 变异

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披碱草属野生居群表型多样性及其与环境关系研究 被引量：20

4

作者 祁娟 曹文侠 闫伟红 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第5期1027-1033,共7页

以来自8省区38个披碱草属野生居群的22个表型性状为调查对象,利用变异系数及多样性指数法对性状内和性状间及种间的表型变异进行分析,并对表型性状与地理气象因子间的关系进行相关性分析,用平均聚类法对38个居群进行分类,以揭示不同来... 以来自8省区38个披碱草属野生居群的22个表型性状为调查对象,利用变异系数及多样性指数法对性状内和性状间及种间的表型变异进行分析,并对表型性状与地理气象因子间的关系进行相关性分析,用平均聚类法对38个居群进行分类,以揭示不同来源披碱草属种质资源表型多样性。结果显示:(1)营养器官性状中旗叶至穗基部长变异系数最高(44.695%),穗部性状中的每穗小穗数变异系数最高(77.005%)。(2)披碱草、麦宾草、圆柱披碱草与老芒麦这4个种间总体平均多样性指数为0.920～1.560,披碱草最高,麦宾草次之,圆柱披碱草最低。(3)表型性状变异受海拔、经度及年均温的影响较大。(4)UPGMA聚类结果将所有材料分成4组,披碱草属植物性状的表型特征没有严格按地理距离而聚类。研究表明,披碱草属植物野生种质材料具有丰富的表型多样性,表型性状与环境之间关系密切,采集过程中应尽量保持居群的完整性,最大程度地保护中国披碱草属牧草的遗传多样性。 展开更多

关键词 披碱草属 表型多样性 聚类分析 环境因子

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中国胶州湾赤潮异弯藻rDNA ITS区序列分析 被引量：2

5

作者 黎瑞宝 章群 +1 位作者 马奔 邓春兴 《广东农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第10期159-161,共3页

测定了采自中国胶州湾赤潮异弯藻X2藻株18S rDNA ITS区基因序列,结合GenBank中下载的37条同源序列,分析序列特征并构建分子系统树。发现534 bp序列中有可变位点16个、简约信息位点1个,可变位点和简约信息位点分别占全序列的3.0%和0.19%... 测定了采自中国胶州湾赤潮异弯藻X2藻株18S rDNA ITS区基因序列,结合GenBank中下载的37条同源序列,分析序列特征并构建分子系统树。发现534 bp序列中有可变位点16个、简约信息位点1个,可变位点和简约信息位点分别占全序列的3.0%和0.19%,序列间相似性为97%,A+T含量(47.8%)略小于C+G含量(52.2%)。在分子系统树上,全部序列聚类在一起,遗传距离在0.0000~0.0242之间,说明全部赤潮异弯藻遗传多样性极低。赤潮异弯藻的生长和繁殖受到外界环境因子的较大制约,而人为因素如船只压舱水等则是其传播的主要途径。 展开更多

关键词 赤潮 异弯藻 18S RDNA ITS

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进化的不可逆规律

6

作者 宋秀英 赵晓明 +1 位作者 李明山 赵毅 《山西农业大学学报》 CAS 1992年第2期175-179,共5页

进化的不可逆规律包括两个水平的内容:一是生物形态解剖结构进化的不可逆转,二是物种灭绝失传不可再生。进化不可逆性实质上是时间不可逆性在生物学上的反映,具体表现为突变的季莫维也夫—里绍夫斯基效应和遗传结构的缺失效应。进化的... 进化的不可逆规律包括两个水平的内容:一是生物形态解剖结构进化的不可逆转,二是物种灭绝失传不可再生。进化不可逆性实质上是时间不可逆性在生物学上的反映,具体表现为突变的季莫维也夫—里绍夫斯基效应和遗传结构的缺失效应。进化的不可逆性不论有什么表现形式其唯一的本质就是生物遗传信息组织性持续不断地增长。 展开更多

关键词 不可逆性 组织性 遗传信息 进化

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蕨类植物psaA基因的分子进化研究 被引量：5

7

作者 吴筱娉 森林 +3 位作者 陈楠 张潇 马朝霞 张钦宇 《植物科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期177-185,共9页

采用"放松分子钟"模型、氨基酸位点正选择模型和分子内共进化网络估算方法,对蕨类植物光合系统Ⅰ核心蛋白PSAA编码基因psaA的进化趋势进行了研究。结果显示,叶绿体基因psaA编码区全序列具备成为蕨类植物系统发育关系重建位点... 采用"放松分子钟"模型、氨基酸位点正选择模型和分子内共进化网络估算方法,对蕨类植物光合系统Ⅰ核心蛋白PSAA编码基因psaA的进化趋势进行了研究。结果显示,叶绿体基因psaA编码区全序列具备成为蕨类植物系统发育关系重建位点的潜力,与rbcL基因联合后能构建高后验概率的系统发育树;蕨类植物的PSAA蛋白中存在一些曾经历正选择的氨基酸位点,其中29个位点聚合成为16个共进化组,通过共进化网络的方式协同影响光合系统Ⅰ的内部调整,提升其在被子植物兴起后光合环境下的适应能力。本文对蕨类植物进化潜能与分子机理的研究结果为揭示蕨类植物适应新生境提供了科学依据,也为植物系统分类学研究提供了分子依据。 展开更多

关键词 蕨类植物 薄囊蕨 光合系统Ⅰ 适应性进化 共进化

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唐古特虎耳草谱系地理学研究 被引量：9

8

作者 更吉卓玛 李彦 +2 位作者 贾留坤 夏铭泽 高庆波 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第2期370-380,共11页

利用叶绿体基因(trnL-trnF和rpl16)对青藏高原地区的18个唐古特虎耳草(Saxifraga tangutica Engl.)居群(209个个体)进行谱系地理学研究,以揭示唐古特虎耳草的现有遗传结构及其历史演化过程。结果表明:(1)从209个个体中共检测到74个单倍... 利用叶绿体基因(trnL-trnF和rpl16)对青藏高原地区的18个唐古特虎耳草(Saxifraga tangutica Engl.)居群(209个个体)进行谱系地理学研究,以揭示唐古特虎耳草的现有遗传结构及其历史演化过程。结果表明:(1)从209个个体中共检测到74个单倍型,且只有单倍型H5在居群中广泛分布,71.62%的单倍型为居群特有单倍型。(2)分子变异分析(AMOVA)显示,91.85%的遗传变异来源于居群内,居群间遗传分化不明显(F_(ST)=0.081);遗传分化系数N_(ST)(0.109)大于G_(ST)(0.097,P>0.05)但不显著,表明唐古特虎耳草在其整个分布范围内没有明显的谱系地理结构。(3)中性检验表明,Tajima’s D(-2.045 07,P<0.05)和Fu&Li’D*值(-3.629 27,P<0.05)均为显著的负值,结合单峰的错配分布曲线,表明该物种经历过近期扩张。研究推测,唐古特虎耳草在第四纪冰期时可能存在多个微型避难所,由于第四纪冰期气候的反复波动,使得原来连续的居群片段化,避难所内的居群单独进化,从而形成了大量特有单倍型;唐古特虎耳草居群对第四纪冰期气候波动的反应可能更多的表现为垂直海拔高度的迁移,而非大规模的水平迁移。 展开更多

关键词 唐古特虎耳草 普系地理学 叶绿体DNA 遗传多样性 青藏高原

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大仓鼠种群生境片断化的遗传效应研究 被引量：2

9

作者 赵庆华 徐来祥 《曲阜师范大学学报（自然科学版）》 CAS 2007年第2期96-100,共5页

利用原仓鼠微卫星引物扩增曲阜吴村、平邑柏林和卞桥三个地理种群的大仓鼠基因组DNA,并对长约550 bp的特异片段回收测序,利用DAMBE、DNASP4.10及MEGA3.0软件分析所得序列.结果表明,在三个地理种群内及种群间均检测到不同数目的SNPs存在... 利用原仓鼠微卫星引物扩增曲阜吴村、平邑柏林和卞桥三个地理种群的大仓鼠基因组DNA,并对长约550 bp的特异片段回收测序,利用DAMBE、DNASP4.10及MEGA3.0软件分析所得序列.结果表明,在三个地理种群内及种群间均检测到不同数目的SNPs存在,种群内多态信息含量表现为柏林>吴村>卞桥.种群间则以曲阜吴村和平邑卞桥间含量最高.在被检测序列496 bp中共检测到6个信息位点,其中4个转换、2个颠换;以平邑柏林和卞桥间含量最低,仅检测到2个信息位点且均为转换.三个地理种群的遗传分化系数(Gst)平均约为0.18,产生的基因流Nm为1.03-1.18,该结果揭示由于生境片断化导致的不同地理种群之间基因流的降低,将会对种群间的遗传分化产生重要的作用. 展开更多

关键词 大仓鼠 单核苷酸多态性(SNPs) 生境片断化 基因流 遗传效应

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野生二粒小麦与栽培小麦农艺性状及籽粒营养组分比较研究 被引量：1

10

作者 韦小宝 詹志杰 +1 位作者 严俊 程剑平 《山地农业生物学报》 2017年第1期40-44,60,共6页

为丰富小麦的遗传背景、提升小麦的品质,以来自于以色列Hermon地区的110个野生二粒小麦和2份国外栽培小麦为供试材料,并测定其农艺性状和籽粒多组分营养成分,以发掘新的基因资源。结果发现,野生二粒小麦与栽培小麦籽粒蛋白质、植酸、氨... 为丰富小麦的遗传背景、提升小麦的品质,以来自于以色列Hermon地区的110个野生二粒小麦和2份国外栽培小麦为供试材料,并测定其农艺性状和籽粒多组分营养成分,以发掘新的基因资源。结果发现,野生二粒小麦与栽培小麦籽粒蛋白质、植酸、氨基酸、总酚和农艺性状指标达到显著差异水平。网络相关性分析显示,野生二粒小麦与栽培小麦在籽粒营养性状间都呈现出较多的正相关,但是野生二粒小麦籽粒营养性状与农艺性状多呈现负相关。对两年环境中野生二粒小麦群体籽粒可溶性蛋白质和多组分营养含量的筛选中,发现基因型HP1籽粒氮素营养表现出极低值。同时,基因型HP143籽粒可溶性蛋白质的含量表现出较高值。通过对两个环境下小麦群体籽粒可溶性蛋白质和多组分营养物质含量的主成分分析发现,基因型HP143存在明显的分离,且HP143籽粒多组分营养性状的含量都较高。筛选到的小麦籽粒各组分含量极端的基因型个体,将为今后小麦遗传与育种研究提供有效的基因材料。对这些差异进行研究为改良小麦品种提供了遗传基础。 展开更多

关键词 野生二粒小麦 栽培小麦 籽粒多组分营养 农艺性状

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群体基因组分析揭示短耳犬蝠适应城市化的遗传学基础 被引量：1

11

作者 王菲 赵华斌 《兽类学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期644-651,共8页

短耳犬蝠(Cynopterus brachyotis)是栖息在城市的典型蝙蝠物种。已发表的研究表明,短耳犬蝠的遗传多样性显著降低与快速城市化紧密相关,但该物种适应城市环境的遗传学基础仍缺乏研究。本研究基于已发表的短耳犬蝠历史样本(1931年)和当... 短耳犬蝠(Cynopterus brachyotis)是栖息在城市的典型蝙蝠物种。已发表的研究表明,短耳犬蝠的遗传多样性显著降低与快速城市化紧密相关,但该物种适应城市环境的遗传学基础仍缺乏研究。本研究基于已发表的短耳犬蝠历史样本(1931年)和当代样本(2011—2012年)的群体基因组重测序数据,通过位点突变频率、基于群体遗传分化的选择信号检测方法、基于单倍型的选择信号检测方法和受选择基因座检测方法,探究了快速城市化对短耳犬蝠的影响及其适应城市化的遗传学基础。研究结果表明:短耳犬蝠历史群体中鉴定到669个受选择基因,基因功能富集主要集中在视觉和嗅觉等通路;在当代群体中鉴定到2013个受选择基因,这些基因除了参与视觉和嗅觉相关通路外,还在免疫、味觉和听觉等通路中发挥作用。该结果提示,快速城市化可能影响短耳犬蝠的感官系统和免疫系统;为了适应快速城市化,短耳犬蝠可能在免疫、味觉和听觉等功能方面发生了适应性演化。 展开更多

关键词 短耳犬蝠 城市化 群体基因组 选择信号

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生态遗传雄性不育理论与两系杂交植物Ⅰ．生态遗传雄性不育理论 被引量：24

12

作者 何觉民 戴君惕 +4 位作者 邹应斌 张海清 刘雄伦 欧仕益 周美兰 《湖南农学院学报》 CSCD 1994年第1期1-5,共5页

笔者根据植物雄性不育既受遗传影响，又受生态条件制约的事实，提出生态遗传雄性不育理论．该理论认为，植物雄性不育是不育基因在一定生态条件下的表达．所谓不育基因，可以是直接阻碍雄性发育的遗传因素，也可以是决定雄性发育需要某... 笔者根据植物雄性不育既受遗传影响，又受生态条件制约的事实，提出生态遗传雄性不育理论．该理论认为，植物雄性不育是不育基因在一定生态条件下的表达．所谓不育基因，可以是直接阻碍雄性发育的遗传因素，也可以是决定雄性发育需要某种生态条件的遗传特性．所谓生态条件，包括影响植物雄性生长发育的温度、光照、水分、营养、化学物质等物理、化学、生物因素．生态因素可分为自然生态因素和人工生态因素两类．植物品种间雄性对于不利生态条件的忍耐能力存在巨大差异，这就是两系杂交植物的基础． 展开更多

关键词 生态遗传学 雄性不育 杂交 植物

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蓼子朴核型分析

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作者 王波 胡超越 《塔里木大学学报》 2022年第4期25-31,共7页

本试验采用一般染色体制片技术,对蓼子朴水培生长的新根进行预处理、固定、制片、镜检以及拍照等过程,获得清晰的含中期染色体的图片后进行核型分析。结果表明:塔里木盆地周边的蓼子朴染色体数目是2n=2x=16,染色体相对长度由2n=16=4L+2M... 本试验采用一般染色体制片技术,对蓼子朴水培生长的新根进行预处理、固定、制片、镜检以及拍照等过程,获得清晰的含中期染色体的图片后进行核型分析。结果表明:塔里木盆地周边的蓼子朴染色体数目是2n=2x=16,染色体相对长度由2n=16=4L+2M2+6M1+4S组成,蓼子朴核型公式为K(2n)=2x=16=14m(2SAT)+2sm,最长染色体与最短染色体的比值为2.41,臂比值大小在1.07~2.88之间,12.5%的染色体臂比值大于2,在核型分类上属于2B,且核型不对称系数(AS.K%)为53.9%。由此可知,蓼子朴的核型属于由对称向不对称演化的过渡类型,对蓼子朴核型分析有助于解决沙生植物驯化栽培、降低沙漠化等生态问题,为进一步确定其进化程度及遗传工程等奠定基础。 展开更多

关键词 蓼子朴 龙胆紫 核型分析 染色体制片

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基因环境相互作用的流行病学方法

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作者 Ottman R 张宏健 +1 位作者 关晓明 许芝林 《国外医学（遗传学分册）》 1991年第5期256-261,共6页

复杂疾病的遗传模式在“外显率低”(具有遗传易感性的未受累个体)和“散发”(不具有遗传易感性的受累个体)的概念中,通常包含着环境的作用。这些概念隐含着原因不明的病因学相关。本文论及了流行病学方法是如何用于研究遗传易感性和其... 复杂疾病的遗传模式在“外显率低”(具有遗传易感性的未受累个体)和“散发”(不具有遗传易感性的受累个体)的概念中,通常包含着环境的作用。这些概念隐含着原因不明的病因学相关。本文论及了流行病学方法是如何用于研究遗传易感性和其它风险因素之间关系的,同时描述了遗传与环境作用之间关系的五种可能模式,并试举了适合于每种孟德尔疾病的例子,然后给出了家族中疾病风险的预测,并讨论了检验这些模式的研究设计。模式假定所研究的疾病有多基因遗传和非遗传的原因,本文只简要地讨论了涉及一种分离的可测量的风险因素和遗传易感性原因。 展开更多

关键词 基因 环境 流行病学 相互作用

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