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大兴安岭地区野生芍药居群表型多样性 被引量：1
1
作者 汤嘉莹 张进坤 +3 位作者 胡继文 王福德 辛培尧 麻文俊 《植物研究》 北大核心 2025年第2期299-314,共16页
芍药(Paeonia lactiflora)是芍药科(Paeoniaceae)芍药属(Paeonia)多年生草本宿根花卉,在我国东北、华北和西北等地区广泛分布,但由于人为破坏和环境变化,其种质资源骤减。该研究以东北大兴安岭地区12个野生芍药居群的256个单株为材料,... 芍药(Paeonia lactiflora)是芍药科(Paeoniaceae)芍药属(Paeonia)多年生草本宿根花卉,在我国东北、华北和西北等地区广泛分布,但由于人为破坏和环境变化,其种质资源骤减。该研究以东北大兴安岭地区12个野生芍药居群的256个单株为材料,收集了23个表型性状数据,利用巢式方差分析、Pearson相关性分析、主成分分析和聚类分析等方法,探究其表型变异规律与多样性水平。株高、冠幅、茎基粗等15个数量性状的变异系数和Shannon-Wiener指数均值分别为25.88%(12.34%~92.78%)和1.843,小叶类型、小叶内卷程度、花色等8个质量性状的Shannon-Wiener指数均值为1.146。11个表型性状在居群间和居群内均存在极显著差异(P<0.01),居群间表型分化系数均值为25.72%。相关性分析表明,15个数量性状间大多存在显著或极显著相关。花径与纬度、湿度、降水等指标呈负相关,与海拔、日照时间、温度呈正相关;花瓣数量与纬度呈正相关,与日照时间呈负相关;复叶长与降水量呈正相关,表明温度和地理因子对野生芍药花表型性状的影响大于茎叶表型性状。主成分分析共提炼出4个主成分,累计贡献率为88.678%。聚类分析可将野生芍药12个居群分为3类:第1类为P3居群,花部特征为多头大花型,具较强观赏性;第2类包括P7、P9两个居群,株高、茎粗、莛数量、复叶、顶小叶等茎叶性状指标值较其他居群更大,表现为长势旺盛;第3类的9个居群表现为复叶、顶小叶短窄,花径较宽而花梗较短的类型。大兴安岭地区野生芍药表型多样性和变异水平较高,且居群内变异为主要来源。该研究可为更好地保护利用野生芍药资源提供依据。 展开更多
关键词 芍药 表型变异 多样性分析 环境因子
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考虑温度场的含裂纹埋地管道的力学响应数值分析
2
作者 张有兴 刘俊麟 +5 位作者 王伟 赵天骄 陶玉林 吕小明 胡锋 史耕源 《化工设备与管道》 北大核心 2025年第4期74-81,共8页
弯管段作为油气管道系统中易失效的结构,当弯管处存在缺陷会严重影响结构性能,从而直接影响到管道系统运行安全。文章利用FLAC3D建立了考虑温度场的含裂纹埋地管道-土体相互作用三维模型,分析了在覆土环境及运行工况条件下弯管应力分布... 弯管段作为油气管道系统中易失效的结构,当弯管处存在缺陷会严重影响结构性能,从而直接影响到管道系统运行安全。文章利用FLAC3D建立了考虑温度场的含裂纹埋地管道-土体相互作用三维模型,分析了在覆土环境及运行工况条件下弯管应力分布规律,研究了不同裂纹尺寸与不同工况参数下含裂纹埋地弯管裂纹处应力、应力强度因子以及不同位置处应力变化规律。研究结果表明:弯管内侧拱内壁应力高于直管段,且裂纹处发生应力重分布,存在应力集中;在研究的裂纹尺寸参数和工况参数中,裂纹深度与运行内压为影响裂纹处结构安全性的较敏感参数;裂纹轴向边缘区域应力及其敏感性高,环向边缘区域应力及其敏感性低。文章的研究为含裂纹埋地弯管的力学安全分析提供了一定的理论依据。 展开更多
关键词 弯管 裂纹 温度场 有限差分 应力强度因子
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云南金花茶的遗传多样性评价和核心种质构建
3
作者 张珊珊 阮孙美 杨文忠 《植物研究》 北大核心 2025年第6期909-918,共10页
云南金花茶(Camellia fascicularis)作为国家二级重点保护植物和云南省极小种群野生植物,其种群重建与保护亟待科学指导。该研究采用Hyper-seq技术的简化基因组测序方法,对3个野生种群(马关(MG)、蒙自(MZ)和河口(HK))和2个迁地保护种群... 云南金花茶(Camellia fascicularis)作为国家二级重点保护植物和云南省极小种群野生植物,其种群重建与保护亟待科学指导。该研究采用Hyper-seq技术的简化基因组测序方法,对3个野生种群(马关(MG)、蒙自(MZ)和河口(HK))和2个迁地保护种群(昆明树木园(KMSMY)和文山树木园(WSSMY))共计133份云南金花茶种质开展遗传多样性评估、群体遗传结构解析及核心种质筛选。结果显示:云南金花茶遗传多样性较高,期望杂合度(H_(E))平均值为0.2326,观测杂合度(H_(O))平均值为0.3659,核苷酸多样性(P_(i))平均值为0.3725;迁地保护种群(KMSMY和WSSMY)的遗传多样性略低于MG种群,高于MZ种群和HK种群,但这2个迁地保护种群的H_(E)、H_(O)和P_(i)均未达到物种水平的90%。群体遗传结构分析表明,云南金花茶5个种群的133个个体可以分为4类,其中MG和KMSMY种群显示出较复杂的遗传结构和遗传背景。群体遗传分化显示,云南金花茶不同种群间的遗传分化程度极高(F_(st)=0.4103)。基于遗传距离,从133份种质中提取出27份核心种质,可有效代表云南金花茶的遗传多样性。该研究首次从基因组层面解析云南金花茶的遗传特征,为制定该濒危物种的就地保护策略、优化迁地保育方案及科学开展种群重建提供了关键理论支撑。 展开更多
关键词 极小种群野生植物 云南金花茶 遗传多样性 群体遗传结构 核心种质 种群重建
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大菱鲆生长和耐高温性状的遗传参数估计 被引量：46
4
作者 刘宝锁 张天时 +3 位作者 孔杰 王清印 栾生 曹宝祥 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第11期1601-1606,共6页
对来自40个家系的753尾大菱鲆个体进行耐高温实验,测定其生长和耐高温性状。基于是否考虑全同胞家系效应,建立了两种动物模型,用于估算大菱鲆生长和耐高温性状的遗传参数。利用WOMBAT程序采用平均信息约束极大似然法估计各模型中性状的... 对来自40个家系的753尾大菱鲆个体进行耐高温实验,测定其生长和耐高温性状。基于是否考虑全同胞家系效应,建立了两种动物模型,用于估算大菱鲆生长和耐高温性状的遗传参数。利用WOMBAT程序采用平均信息约束极大似然法估计各模型中性状的方差组分,用似然比检验法进行不同模型的差异检验。方差组分分析结果显示,估计体质量遗传参数时,采用模型Ⅰ效果较好,相应遗传力为(0.22±0.09);估计肥满度时,两模型间差异不显著,其遗传力范围为(0.21±0.18)～(0.39±0.11);估计耐热性时,采用模型Ⅰ比较理想,遗传力为(0.026±0.034)。表型和遗传相关分析结果表明,体质量与肥满度、耐热性的表型相关系数分别为0.13和0.04,肥满度与耐热性的表型相关系数为0.13;体质量与肥满度、耐热性遗传相关系数分别为0.01和-1.00,肥满度与耐热性的遗传相关系数为0.05。研究结果表明,没有考虑全同胞家系效应的模型Ⅰ是估计大菱鲆生长和耐高温性状遗传参数的较好模型。 展开更多
关键词 大菱鲆 生长 耐高温 遗传参数 动物模型
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凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)病原副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)的表型及分子特征 被引量：44
5
作者 张晓君 陈翠珍 +3 位作者 阎斌伦 房海 秦国民 徐静 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期654-662,共9页
采用常规的形态及生理生化特性检验及分子生物学等方法,对引起凡纳滨对虾幼虾发生毁灭性死亡的病原菌进行了致病性、表型生物学及分子生物学的系统研究。结果表明,分离菌为弧菌属(Vibrio Pacini 1954)的副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyti... 采用常规的形态及生理生化特性检验及分子生物学等方法,对引起凡纳滨对虾幼虾发生毁灭性死亡的病原菌进行了致病性、表型生物学及分子生物学的系统研究。结果表明,分离菌为弧菌属(Vibrio Pacini 1954)的副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus),对凡纳滨对虾、中国对虾及日本对虾仔虾均有强致病性。分离鉴定的4株副溶血弧菌具有淀粉酶、明胶酶、卵磷脂酶活性,但不具有蛋白酶、脂肪酶活性,KP溶血均呈阴性,且均具有K抗原;代表菌株(JGB080708-1株)的16S rRNA基因序列(长度为1456bp,GenBank登录号为GQ205448)和gyrB基因序列(长度为1195bp,GenBank登录号为GQ205453)与副溶血弧菌的两种基因序列相似性均可达98%以上。病原菌的耐药性检测结果显示,对供试49种抗菌药物中的林可霉素等6种药物耐药。 展开更多
关键词 凡纳滨对虾 副溶血弧菌 16S RRNA基因 gyrB基因
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中国对虾(Fenneropenaeus chinensis)人工选育群体不同世代的微卫星分析 被引量：49
6
作者 张天时 王清印 +2 位作者 刘萍 李健 孔杰 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2005年第1期72-80,共9页
采用微卫星DNA技术对中国对虾人工选育快速生长基础群体和4个连续世代共计100个个体进行了遗传分析。对8个基因位点进行了扩增,共得到71个等位基因。每个位点的等位基因数从6到16不等,其大小在159—600bp之间,PIC(PolymorphismInformati... 采用微卫星DNA技术对中国对虾人工选育快速生长基础群体和4个连续世代共计100个个体进行了遗传分析。对8个基因位点进行了扩增,共得到71个等位基因。每个位点的等位基因数从6到16不等,其大小在159—600bp之间,PIC(PolymorphismInformationContent)值为0.6628—0.9051,基因型数为17—67。5个世代群体的平均杂合度分别为0.7188、0.5687、0.6188、0.6438、0.66937。从F检验的数据来看,配对比较Fst值表明5个世代群体间的遗传分化程度较弱。Fis值的计算结果表明,有5个群体位点杂合度处于过剩状态,但对整个群体而言,5个世代群体均表现为一定程度的杂合子缺失。通过计算每个位点的等位基因数(na)、有效等位基因数(αe)、基因型数目(G)、最高频率等位基因的频率(F),以及基于基因型的P值,比较了5个群体的遗传变化。另外,5个世代群体间的相似性系数以及彼此间的遗传距离,体现出人工选育群体间的遗传分化程度较低,说明5个世代群体间的遗传分化程度较低,还有较大的选育潜力,可以继续保持遗传响应。 展开更多
关键词 中国对虾 微卫星 遗传变异 选择育种
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泥鳅(Misgurnus anguillicaudatus)病原霍乱弧菌(Vibrio cholerae)的表型与分子鉴定 被引量：26
7
作者 邴旭文 阎斌伦 +2 位作者 张晓君 秦蕾 毕可然 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期692-698,共7页
从江苏连云港某养殖场养殖死亡的泥鳅肝脏、血液及腹水中分离出大量优势生长的细菌,人工感染试验证明其对泥鳅具有很强的致病性。采用表观分类学及分子生物学方法,对分离菌进行了形态特征、理化特性、胞外酶活性及溶血活性等生物学性状... 从江苏连云港某养殖场养殖死亡的泥鳅肝脏、血液及腹水中分离出大量优势生长的细菌,人工感染试验证明其对泥鳅具有很强的致病性。采用表观分类学及分子生物学方法,对分离菌进行了形态特征、理化特性、胞外酶活性及溶血活性等生物学性状检验;用PCR方法同时扩增其16SrRNA和gyrB基因,分析了16SrRNA和gyrB两种基因序列的同源性,并构建了系统发生树,通过基因序列分析,比较了两种基因在相似细菌的检测和鉴定能力;基于16SrRNA和gyrB基因的系统发育学分析表明分离菌(LD081008B-1)所扩增的16SrRNA和gyrB基因序列均与GenBank数据库中霍乱弧菌具有较高的相似性,且gyrB基因用于细菌种间鉴定更具优越性;16SrRNA基因序列长度为1446bp(GenBank登录号:GQ205447),gyrB基因序列长度为1207bp(GenBank登录号:GQ205452);根据分离菌的表型特征及分子特征,判定病原菌为弧菌属(VibrioPacini1854)的霍乱弧菌(Vibriocholerae)。胞外酶活性及溶血活性检测表明分离菌均具有蛋白酶、卵磷脂酶、淀粉酶、明胶酶及DNA酶活性,在含7%家兔脱纤血液营养琼脂培养基上呈β型溶血。分离菌的耐药谱测定结果显示,除对供试49种抗菌药物中的杆菌肽耐药外,对其它48种药物敏感或高度敏感。 展开更多
关键词 泥鳅 霍乱弧菌 生物学特性 16S RRNA基因 gyrB基因
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应用微卫星标记进行大豆种质多样性和遗传变异性分析 被引量：30
8
作者 刘峰 东方阳 +2 位作者 邹继军 陈受宜 庄炳昌 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2000年第7期628-633,共6页
微卫星标记又称SSR标记是近年来发展的一种新型的分子标记，可有效地进行基因型鉴定、系谱分析并可估算材料间的遗传距离。用5对SSR引物对15份大豆材料进行扩增，共得到21条多态性条带。每个SSR座位的等位基因数目为3～6个，基因多样性... 微卫星标记又称SSR标记是近年来发展的一种新型的分子标记，可有效地进行基因型鉴定、系谱分析并可估算材料间的遗传距离。用5对SSR引物对15份大豆材料进行扩增，共得到21条多态性条带。每个SSR座位的等位基因数目为3～6个，基因多样性范围为0.439～0.668，对这些材料进行了遗传距离分析。家系分析表明微卫星DNA经过多世代的减数分裂后产生了突变，在RILF8代中有的个体在个别SSR座位等位基因的大小在较小范围内由于重复单位数目的增加或减小而变化。 展开更多
关键词 遗传距离 基因多样性 突变频率 大豆 微卫星标记
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仿刺参(Apostichopus japonicus)mtDNA三个基因片段的序列分析 被引量：19
9
作者 李颖 刘萍 +3 位作者 孙慧玲 马甡 高天翔 王清印 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期143-153,共11页
采用PCR技术对中国烟台、威海和莱州三个地点仿刺参的16S rRNA、COI、IrRNA-COI三个mtDNA基因片段进行了扩增和测序,分别得到了长度约为570bp、640bp和900bp的三段序列,分析了三个采样点样品的遗传多样性。结果表明,每段基因序列扩增均... 采用PCR技术对中国烟台、威海和莱州三个地点仿刺参的16S rRNA、COI、IrRNA-COI三个mtDNA基因片段进行了扩增和测序,分别得到了长度约为570bp、640bp和900bp的三段序列,分析了三个采样点样品的遗传多样性。结果表明,每段基因序列扩增均获得两种单倍型,已在Genbank中注册(注册号码:AY852278—AY852283)。通过比较,三个地点样品的序列差异不显著,无缺失、插入、颠换的现象,只有个别位点出现转换,其中16S rRNA序列最为保守,16S rRNA、COI、IrRNA-COI三段序列A+T的平均含量为56·2%、59·2%、61·8%,均大于G+C含量。三个采样点样品同源性为99·84%—99·96%。将获得的仿刺参DNA序列和Genbank中的来自东太平洋8个外群进行基因序列比较,结果发现,不同目、科的海参的序列差异显著。采用DNAsp统计了各类位点数;MEGA2·1分析了碱基组成和遗传距离,构建了系统树。系统树体现的分类关系与这些物种的形态学分类关系完全一致。 展开更多
关键词 仿刺参 MTDNA 16S RRNA基因 COI基因 序列比较
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斑点叉尾基础群体生长和存活性状遗传参数估计 被引量：21
10
作者 栾生 边文冀 +6 位作者 邓伟 胡红浪 孔杰 秦钦 陈校辉 钟立强 黄太寿 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第9期1313-1321,共9页
研究估计了斑点叉尾基础群体(G0)体质量、体长和存活性状的遗传参数,为制定育种目标、综合选择指数和选择方法提供基础参数。实验利用5个斑点叉尾引进群体,通过双列杂交和巢式交配设计,产生全同胞和半同胞家系。每个家系内的稚、幼... 研究估计了斑点叉尾基础群体(G0)体质量、体长和存活性状的遗传参数,为制定育种目标、综合选择指数和选择方法提供基础参数。实验利用5个斑点叉尾引进群体,通过双列杂交和巢式交配设计,产生全同胞和半同胞家系。每个家系内的稚、幼鱼经过中间暂养、个体标记等阶段后,混合放入一个池塘进行生长和存活测试。利用两性状动物模型和公母畜阈模型分别估计生长和存活性状的方差组分和遗传参数。通过最佳线性无偏预测法估计所有个体生长和存活性状的育种值。斑点叉尾基础群体收获体质量和体长遗传力分别为0.41±0.074和0.32±0.064,属于高遗传力水平,并且统计检验显著(P<0.05)。尽管在两性状动物模型中设置标记体质量和标记体长作为协变量进行校正,但是由于加性遗传效应和共同环境效应混淆在一起无法剖分,遗传力估计值偏高。收获体质量和收获体长的表型和遗传相关系数分别为0.93和0.97,表现为高度线性正相关。存活性状的遗传力为0.037±0.016,表现为低遗传力,但统计检验仍达到显著水平(P<0.05)。家系生长(收获体质量和收获体长)和存活性状育种值间的相关系数分别为0.065和0.100,表现为低度线性遗传正相关,并且统计检验不显著(P>0.05)。因此在制定育种方案时,生长和存活性状都可纳入育种目标,利用多性状选择指数方法同时选择。 展开更多
关键词 斑点叉尾鮰 基础群体 生长 存活 遗传参数
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华山新麦草自然居群的遗传结构和种内遗传多态性研究 被引量：17
11
作者 刘占林 李珊 +2 位作者 阎桂琴 宋颐 赵桂仿 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2001年第8期769-777,共9页
华山新麦草为我国特有种，仅分布在陕西华山。应用５种酶系统共１３个基因位点对采自华山１３个亚居群的华山新麦草进行等位酶分析。研究结果发现，多态性位点的比例（Ｐ）为６９％，每个位点等位基因的平均数（Ａ）为１．８，平均每个... 华山新麦草为我国特有种，仅分布在陕西华山。应用５种酶系统共１３个基因位点对采自华山１３个亚居群的华山新麦草进行等位酶分析。研究结果发现，多态性位点的比例（Ｐ）为６９％，每个位点等位基因的平均数（Ａ）为１．８，平均每个位点的预期杂合性（Ｈｅ）为０．３４４，Ｓｉｍｐｓｏｎ指数为０．９９８，证明华山新麦草居群内有较高的遗传多态性和克隆多样性．固定指数（Ｆ）显示有意义的负值（－０．２５２），与预期的随机交配相比较，居群内有过多的杂合体，这可能与华山新麦草的交配系统和繁育方式有关。平均的遗传距离为 ０．０４６（变化范围： ０～ ０．１３９），大约有９１％的遗传变异存在于亚居群内。应用间接法测得华山新麦草自然居群间的基因流（Ｎｍ）为２．７７，明显低于一般风媒传粉植物（５．２４）．暗示华山新麦草自然居群的基因流水平似乎正处于一种临界状态，有进一步分化的潜能，但受多种因素的影响． 展开更多
关键词 华山新麦草 等位酶 遗传结构 克隆多样性 大麦属 种质资源
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内蒙古中东部草原区克氏针茅种群遗传分化的RAPD研究 被引量：14
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作者 赵念席 高玉葆 +4 位作者 王金龙 陈磊 阮维斌 任安芝 刘惠芬 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期560-566,共7页
采用 RAPD-PCR技术对内蒙古中东部草原分布的 7个克氏针茅 (Stip a krylovii Roshev.)种群进行了分析。从 10 0个 10碱基随机引物中筛选出 2 1个有效引物 ,共扩增出 2 2 9条稳定的 DNA带 ,其中 171条带具有多态性 ,多态性百分比 (PPB)为... 采用 RAPD-PCR技术对内蒙古中东部草原分布的 7个克氏针茅 (Stip a krylovii Roshev.)种群进行了分析。从 10 0个 10碱基随机引物中筛选出 2 1个有效引物 ,共扩增出 2 2 9条稳定的 DNA带 ,其中 171条带具有多态性 ,多态性百分比 (PPB)为74.67%。将每个扩增产物看作一个独立的性状 ,按其有无列出二元数据矩阵 ,计算 Jaccard、简单匹配系数 (SM)和 Dice遗传相似性系数 ,通过 UPGMA法构建分子标记聚类图 ;并通过主成分分析 (PCA)和主轴法分析 (PAF) ,将 7个种群分类 ;统计各个种群特异性 DNA带 ,计算占总扩增条带的百分数。结果表明 :(1)不同地理种群之间扩增结果差异明显 ,具有丰富的遗传多样性 ;(2 )不同地理种群间存在一定程度的分化 ,这种分化是与种群之间的实际距离相联系的 ,相距越远 ,种群相似程度越低 ,进一步分析表明种群的分化是与所处生境逐渐旱化相一致的 ;(3 )聚类图上将 7个种群分为 3类 ,PCA和 PAF分析通过 3个成分或因子也将 7个种群分为 3类 ,支持了聚类图的分类结果 ;(4)特异性位点所占百分比与种群所处生境也有一定的联系 ,它与环境干燥度的相关系数为 0 .76(P<0 .0 5)。 展开更多
关键词 内蒙古 草原 克氏针茅 种群 遗传分化 RAPD 地理种群 分子生物学
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基于表型数据的辣椒核心种质构建研究 被引量：19
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作者 雷刚 周坤华 +2 位作者 方荣 吴茵 陈学军 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期804-810,共7页
以收集保存的603份辣椒种质为材料,根据果形指数大小将其分成5组。基于28个性状的表型数据,采用简单比例、平方根比例、对数比例及遗传多样性指数比例法计算各组内取样份数,比较4种组内取样比例法、6种总体取样规模和2种取样方法在构建... 以收集保存的603份辣椒种质为材料,根据果形指数大小将其分成5组。基于28个性状的表型数据,采用简单比例、平方根比例、对数比例及遗传多样性指数比例法计算各组内取样份数,比较4种组内取样比例法、6种总体取样规模和2种取样方法在构建辣椒核心种质中的作用和效果。结果表明:(1)简单比例、平方根比例、对数比例、遗传多样性指数比例法入选的材料份数占预选核心种质份数依次为24.2%、22.2%、21.1%、17.8%,说明遗传多样性指数比例法对各组取样数量的修正能力最强,使取样更加均衡。(2)当总体取样规模为15%时,遗传多样性指数比例法构建的预选核心种质遗传多样性指数(I)达到最大,表型保留比例(RPR)超过98%;当总体取样规模超过20%时,RPR值、变异系数(CV)和极差符合率(CR)虽然平缓增加,但I值反而减小;说明15%为合适的总体取样规模。(3)利用对数比例法和多样性比例法,在15%的总体取样规模下,聚类取样构建的核心种质I值、RPR值、CV值及CR值均高于随机取样。(4)该研究根据所获得的优化方案最终在表型水平建立了包含91份种质的辣椒核心种质。 展开更多
关键词 辣椒 表型数据 核心种质 取样规模 取样方法
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罗氏沼虾抗病选育群体的抗病性能及其遗传多样性分析 被引量：17
14
作者 朱其建 戴习林 +5 位作者 邹卫丽 蒋飞 苏建 过正乾 王海洋 丁福江 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第10期1468-1478,共11页
为深入了解罗氏沼虾抗病选育群体的抗病力和遗传信息,通过人工注射溶藻弧菌感染16个罗氏沼虾选育群体,并利用微卫星分子标记对选育群体进行遗传结构分析。结果显示,16个选育群体抗溶藻弧菌感染能力存在明显差别,并从中鉴定出抗病力强的... 为深入了解罗氏沼虾抗病选育群体的抗病力和遗传信息,通过人工注射溶藻弧菌感染16个罗氏沼虾选育群体,并利用微卫星分子标记对选育群体进行遗传结构分析。结果显示,16个选育群体抗溶藻弧菌感染能力存在明显差别,并从中鉴定出抗病力强的群体3个（SCR11-6、SCR11-11和SCR11-16）,其在感染溶藻弧菌感染后的成活率达80%;抗病力比较强的群体7个;抗病力一般的群体4个,成活率为65%～70%;抗病力差的群体2个,成活率为35%～50%。8对微卫星引物共检测到53个等位基因,每对引物的等位基因数为5～9个,平均为6.625个,多态信息含量（PIC）为0.629 4～0.829 4,平均为0.732 3。16个群体的平均PIC为0.493 2～0.695 6,平均观测杂合度为0.506 2～0.651 3,平均期望杂合度为0.551 9～0.733 2,遗传相似系数平均为0.655 2,遗传距离平均为0.434 4。并对DP和SP两群体罗氏沼虾个体扩增出的差异条带进行统计,分析其与罗氏沼虾抗病性状的相关性。结果表明,5个微卫星位点SUGbp8-103b、SUGbp8-101c、MRMB11、SUGbp8-137和MRMC2分别在203、263、185、335和96 bp等位基因与罗氏沼虾抗病性状存在一定的相关性,其中,位点MRMB11在185 bp等位基因跟抗病性有极显著的正相关性,相关系数为0.282。研究表明,16个选育群体中有4个群体的抗病力较强,同时与其它12个选育群体相比,这4个群体遗传多样性也比较丰富,这些罗氏沼虾群体的筛选为罗氏沼虾抗病新品种的培育奠定了重要基础。 展开更多
关键词 罗氏沼虾 选育 抗病力 微卫星 遗传多样性
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人工养殖与选育对罗氏沼虾遗传多样性的影响 被引量：22
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作者 陈雪峰 杨国梁 +7 位作者 孔杰 栾生 张宇飞 王军毅 高强 罗坤 宫金华 叶少群 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期866-873,共8页
为探讨人工养殖与选择育种对罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)遗传多样性的影响,实验测定了孟加拉野生群体、缅甸野生群体、浙江养殖群体、广西养殖群体及选育群体"南太湖2号"共111只罗氏沼虾核糖体转录间隔区2(Internal ... 为探讨人工养殖与选择育种对罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)遗传多样性的影响,实验测定了孟加拉野生群体、缅甸野生群体、浙江养殖群体、广西养殖群体及选育群体"南太湖2号"共111只罗氏沼虾核糖体转录间隔区2(Internal transcribed spacer 2,ITS2)基因序列,结果发现58个碱基变异位点,定义56个单倍型。在5个群体中,孟加拉野生群体的遗传多样性最高(平均核苷酸差异数K和核苷酸多态性指数Pi分别为7.186和0.0155),依次为缅甸野生群体、浙江养殖群体、广西养殖群体,选育群体"南太湖2号"遗传多样性最低(K和Pi分别为3.032和0.0065)。5个群体间配对Fst分析表明,养殖群体与野生群体遗传分化显著(P<0.01),选育群体"南太湖2号"不仅与野生群体遗传分化显著,同时还与广西养殖群体产生了显著的遗传分化(P<0.01)。系统树显示,孟加拉野生群体和缅甸野生群体聚为一支,浙江养殖群体、广西养殖群体和选育群体"南太湖2号"则聚为另一支。研究结果表明,人工养殖和选育降低了罗氏沼虾的遗传多样性水平,并导致群体间发生了显著的遗传分化。 展开更多
关键词 罗氏沼虾 ITS2基因 遗传多样性 遗传分化
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青藏高原和新疆地区垂穗披碱草种质的SRAP及RAPD分析 被引量：20
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作者 苗佳敏 张新全 +4 位作者 陈智华 钟金城 陈仕勇 马啸 白史且 《草地学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期306-316,共11页
使用SRAP和RAPD标记对采集自我国青藏高原和新疆地区的64份垂穗披碱草(Elymus nutans Griseb.)进行遗传多样性和亲缘关系分析,并测其遗传变异和各地理类群的遗传多样性水平。结果表明:2种标记都显示供试材料具有较高的遗传多样性水平(PP... 使用SRAP和RAPD标记对采集自我国青藏高原和新疆地区的64份垂穗披碱草(Elymus nutans Griseb.)进行遗传多样性和亲缘关系分析,并测其遗传变异和各地理类群的遗传多样性水平。结果表明:2种标记都显示供试材料具有较高的遗传多样性水平(PPB=85.86%,90.39%),且新疆地区材料的遗传多样性水平高于青藏高原地区,它们分别得到相似但并不完全相同的聚类图,相似生态地理环境的材料可以聚为一类;2种标记的分子方差分析(AMOVA)揭示了地理类群内部和地理类群间分别有48.23%,39.87%和51.77%,60.13%的变异;通过2种标记的比较分析,SRAP能更高效地对垂穗披碱草种质进行遗传变异分析;青藏高原和新疆地区的材料存在明显的遗传分化,气候和山脉等生态地理条件以及繁育系统等可能是使材料发生遗传变异的重要因素。这些结果将为垂穗披碱草种质的育种以及种质资源的收集和保存提供基础依据。 展开更多
关键词 垂穗披碱草 SRAP RAPD 遗传变异 分子方差分析
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贵州绿茶中咖啡碱和儿茶素含量分析 被引量：27
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作者 李俊 郭晓关 +3 位作者 庞宏宇 朱福建 王震 赖飞 《茶叶科学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期480-484,共5页
对贵州省243份绿茶样品中咖啡碱和儿茶素类物质采用高效液相色谱方法进行检测。结果表明:贵州省绿茶中儿茶素含量范围为9.14%～27.28%,平均含量15.71%;咖啡碱含量为1.08%～3.33%,平均含量2.24%。各地区茶叶儿茶素品质指数多数为1000～20... 对贵州省243份绿茶样品中咖啡碱和儿茶素类物质采用高效液相色谱方法进行检测。结果表明:贵州省绿茶中儿茶素含量范围为9.14%～27.28%,平均含量15.71%;咖啡碱含量为1.08%～3.33%,平均含量2.24%。各地区茶叶儿茶素品质指数多数为1000～2000,其中黔南地区的最高为1975.51;各地区的儿茶素苦涩味指数主要在8.00～17.04之间,黔西南地区的苦涩味指数最低为8.00。据此分析可得,贵州绿茶具有很高的利用价值,春茶适合开发高品质的名优茶,秋茶适合用于茶叶深加工或有效成分的提取。 展开更多
关键词 贵州绿茶 有效成分 儿茶素 咖啡碱
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刺参(Apostichopus japonicus)EST序列中微卫星分布分析及其标记的筛选 被引量：20
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作者 孙国华 杨建敏 +3 位作者 宋志乐 孙孝德 王卫军 张宇 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期133-139,共7页
利用微卫星查找软件对现已公布的6632条刺参ESTs的数据库中2—6个碱基重复单元组成的简单序列重复进行筛选,进而对其微卫星的丰度和分布进行比较研究。共发现微卫星序列416个,占整个ESTs数据库的6.48%;其中含双碱基重复序列146个,数量最... 利用微卫星查找软件对现已公布的6632条刺参ESTs的数据库中2—6个碱基重复单元组成的简单序列重复进行筛选,进而对其微卫星的丰度和分布进行比较研究。共发现微卫星序列416个,占整个ESTs数据库的6.48%;其中含双碱基重复序列146个,数量最多,占ESTs数据库中发现微卫星序列总数的65.86%;三、四、五、六碱基重复序列分别占微卫星序列总数的26.68%、1.68%、0.24%、5.53%。对含有SSR位点符合微卫星引物设计的EST序列利用Primer软件结合人工方法设计合成引物21对,其中13对有扩增产物且均为多态位点。扩增产物变性聚丙烯酰胺胶电泳,统计每个微卫星标记等位基因数目,计算等位基因频率、观测杂合度、期望杂合度等统计学指标的评价。结果表明,在13个微卫星位点上,等位基因的数目从3到8不等,等位基因长度从175—382bp,观测杂合度和期望杂合度分别为0.158—0.650和0.198—0.841,所筛选微卫星标记可于遗传分析。 展开更多
关键词 刺参 微卫星 表达序列标签 等位基因
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基于线粒体D-loop区与COI基因序列比较分析养殖与野生银鲳群体遗传多样性 被引量：54
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作者 彭士明 施兆鸿 侯俊利 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期19-25,共7页
运用线粒体D-loop区与COI基因片段序列比较分析了养殖与野生银鲳群体的遗传多样性。研究结果显示,线粒体D-loop区片段中,A、T、C与G4种核苷酸的平均含量分别为40.00%、30.55%、16.75%和12.70%,A+T的含量为70.55%,明显高于G+C的含量。CO... 运用线粒体D-loop区与COI基因片段序列比较分析了养殖与野生银鲳群体的遗传多样性。研究结果显示,线粒体D-loop区片段中,A、T、C与G4种核苷酸的平均含量分别为40.00%、30.55%、16.75%和12.70%,A+T的含量为70.55%,明显高于G+C的含量。COI基因片段中,A、T、C和G的平均含量分别为25.85%、33.90%、21.30%和18.85%,A+T的含量(59.75%)同样高于G+C的含量。基于D-loop序列分析所得出的两群体总的变异位点、单倍型数、单倍型多样性、核苷酸多样性及平均核苷酸差异数分别为19、15、0.895、0.007和2.505。基于COI基因所得出的两群体总的变异位点、单倍型数、单倍型多样性、核苷酸多样性及平均核苷酸差异数分别为33、17、0.713、0.004和2.239。基于线粒体D-loop区与COI基因片段序列的研究结果均显示,养殖银鲳群体的遗传多样性低于野生群体的遗传多样性。养殖群体基于线粒体D-loop区与COI基因片段分析得出的单倍型多样性分别为0.562与0.571,野生群体基于线粒体D-loop区与COI基因片段分析得出的单倍型多样性分别为0.891与0.801。基于D-loop序列的分子方差(AMOVA)分析结果显示,养殖与野生银鲳群体间具有较高的遗传分化,而基于COI基因片段AMOVA分析结果显示,两群体间并无明显的遗传分化。研究表明,线粒体D-loop区与COI基因均可作为检测银鲳群体遗传多样性的有效标记,但线粒体D-loop区作为反映银鲳群体间遗传多样的敏感度要高于COI基因。 展开更多
关键词 银鲳 线粒体DNA 养殖 野生 遗传多样性
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斑节对虾家系氨氮耐受性的比较 被引量：22
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作者 黄建华 李永 +3 位作者 杨其彬 苏天凤 朱彩艳 江世贵 《南方水产科学》 CAS 北大核心 2012年第6期37-43,共7页
以非洲(F)、泰国(T)、印尼(Y)3个地理群体的野生斑节对虾(Penaeus monodon)为亲本构建家系,通过96 h氨氮急性毒性试验对其中45个家系进行氨氮耐受性的比较研究。结果表明,在96 h高氨氮的胁迫下各家系的死亡率为15.56%～100%,斑节对虾家... 以非洲(F)、泰国(T)、印尼(Y)3个地理群体的野生斑节对虾(Penaeus monodon)为亲本构建家系,通过96 h氨氮急性毒性试验对其中45个家系进行氨氮耐受性的比较研究。结果表明,在96 h高氨氮的胁迫下各家系的死亡率为15.56%～100%,斑节对虾家系间对氨氮的耐受性差异极显著(P<0.01)。其中死亡率低于30%的高氨氮耐受性家系有7个,死亡率在30%～60%的中等氨氮耐受性家系有29个,死亡率高于60%的低氨氮耐受性家系9个。不同父本和母本来源的家系氨氮耐受性由高到低分别为来源非洲、印尼和泰国。不同交配组合氨氮耐受性由高到低分别为F♀×F♂、Y♀×Y♂、Y♀×T♂、T♀×Y♂和T♀×T♂。对印尼和泰国杂交组合家系的氨氮耐受性进行杂交优势分析,结果表明,杂交组合在氨氮耐受性表现出一定的杂交优势(1.98%～19.80%),其中Y♀×T♂组合的杂交优势高于T♀×Y♂组合。 展开更多
关键词 斑节对虾 家系 氨氮 耐受性
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