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确定脊柱骨关节炎潜在药物靶点的孟德尔随机化分析
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作者 赵瑞凯 王玉 +2 位作者 郭晓辉 孙泽华 王旭 《中国组织工程研究》 北大核心 2026年第29期7749-7754,共6页
背景:脊柱骨关节炎作为常见的退行性脊柱疾病,严重影响患者的生活质量,但其确切的分子机制尚未明确。目的:通过孟德尔随机化分析方法识别与脊柱骨关节炎有因果关系的血浆蛋白,为该疾病领域寻找新的潜在治疗靶点提供借鉴。方法:蛋白质数... 背景:脊柱骨关节炎作为常见的退行性脊柱疾病,严重影响患者的生活质量,但其确切的分子机制尚未明确。目的:通过孟德尔随机化分析方法识别与脊柱骨关节炎有因果关系的血浆蛋白,为该疾病领域寻找新的潜在治疗靶点提供借鉴。方法:蛋白质数据从deCODEGenetics公司的数据库获取(共纳入35559例冰岛个体,检测了4907种血浆蛋白的遗传关联信息,https://www.decode.com/summarydata/),脊柱骨关节炎的数据从骨关节炎遗传学联盟获取(共有826690个样本,可通过https://msk.hugeamp.org/downloads.html免费下载),所有数据均为开源并符合伦理要求。使用Wald比值法或逆方差加权法评估4907个血浆蛋白与脊柱骨关节炎之间的因果关系,对P值进行Bonferroni校正。此外进行Steiger方向性检验排除反向因果、共定位分析排除连锁不平衡、表型扫描排除水平多效性、外部验证排除偶然发现。最终借助在线分析工具Enrichr对靶向因果蛋白的小分子化合物进行筛选,并针对排名最前的化合物实施分子对接,旨在预测它们与蛋白质的结合模式及能量,从而明确最稳定且可能的结合方式。结果与结论:①4907中蛋白中筛选出了1553个蛋白的1878个显著蛋白质数量性状位点,孟德尔随机化分析后有4种蛋白被鉴定出与脊柱骨关节炎存在较强的因果关系,分别为单核CD14、白细胞介素12β亚基(IL12B)、肝细胞生长因子样蛋白(MST1)以及Semaphorin-4A(SEMA4A),其中IL12B与脊柱骨关节炎呈负相关,其余则与脊柱骨关节炎呈正相关;②同时药物预测结果显示,靶向CD14的特斯米利芬、靶向IL12B的孟鲁司特、靶向MST1的萘胺和靶向SEMA4A的水仙碱在分子对接中均表现出良好的结合能力,最低结合能均低于-6.0kJ/mol;③综合分析表明,这4种血浆蛋白质或可作为临床脊柱骨关节炎筛查、预防及干预的潜在生物标志物或药物研发靶点,亦可为国内人群开展相关研究提供理论依据和参考价值。 展开更多
关键词 血浆蛋白 脊柱骨关节炎 孟德尔随机化 贝叶斯共定位 表型扫描 分子对接
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高顶鳞皮蚌F和M型线粒体基因组全序列结构比较及双单亲遗传下的进化分析
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作者 谢玲莉 姜敏 +2 位作者 姜潮 刘湘蓉 刘凯 《水生生物学报》 北大核心 2026年第1期94-105,共12页
为探讨蚌类在DUI机制下的进化特征,本文通过测序和比较高顶鳞皮蚌F与M型线粒体基因组,并结合系统发育分析和选择压力分析开展研究。结果表明,高顶鳞皮蚌F/M型线粒体全基因组序列全长分别为15768和17008 bp,A+T含量在两型中均约64%,呈AT... 为探讨蚌类在DUI机制下的进化特征,本文通过测序和比较高顶鳞皮蚌F与M型线粒体基因组,并结合系统发育分析和选择压力分析开展研究。结果表明,高顶鳞皮蚌F/M型线粒体全基因组序列全长分别为15768和17008 bp,A+T含量在两型中均约64%,呈AT偏好性;共编码37个基因,包括13个蛋白质编码基因(PCGs),22个tRNA和2个rRNA,其中26个基因位于轻链、11个基因位于重链;tRNA结构存在缺陷,F/M型trnS缺失tψc环,M型trnY缺失DHU环;相对密码子使用频率(RSCU)分析显示TTT在F型(RSCU=1.55)和M型(RSCU=1.63)中均为使用频率最高的密码子;系统发育树显示F/M型线粒体明确分化为两大单系群;基因选择压力分析提示M型Ka/Ks值高于F型,atp8为潜在的性别分化相关基因。本研究系统揭示了高顶鳞皮蚌F和M型线粒体基因组的结构差异、碱基组成、密码子特征及非编码区布局,支持了蚌类F与M型基因组在系统发育上的并行进化模式,不仅为该物种线粒体基因组的深入比较和应用研究提供基础数据,更有助于深化对DUI现象的理解。 展开更多
关键词 线粒体基因组 双单亲遗传 系统发育分析 高顶鳞皮蚌
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CAPN3靶向的细胞周期调控因子鉴定及其在消化器官发育和功能中的作用研究
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作者 王明韫 丁锋 +1 位作者 苏保纯 彭金荣 《中国细胞生物学学报》 2026年第2期294-314,共21页
CAPN3是钙离子依赖的半胱氨酸蛋白酶calpain家族的成员。在斑马鱼中的研究发现,Capn3b(CAPN3同源蛋白)可被核仁蛋白Def招募至核仁以裂解p53、Chk1和Wee1等调控细胞周期的蛋白质,进而调控肝脏发育和再生,提示DEF-CAPN3/Def-Capn3b蛋白裂... CAPN3是钙离子依赖的半胱氨酸蛋白酶calpain家族的成员。在斑马鱼中的研究发现,Capn3b(CAPN3同源蛋白)可被核仁蛋白Def招募至核仁以裂解p53、Chk1和Wee1等调控细胞周期的蛋白质,进而调控肝脏发育和再生,提示DEF-CAPN3/Def-Capn3b蛋白裂解途径在细胞周期调控中发挥重要作用。但是,CAPN3是否靶向其他细胞周期调控因子却不得而知。该研究利用体外酶活实验系统检测了人CAPN3(hCAPN3)对29个人细胞周期素和13个细胞周期相关因子的裂解情况,最终鉴定出CCAR2、CCNL1、RBL1、RBL24个蛋白是hCAPN3的新底物。接着,该研究利用CRISPR-Cas9技术针对这4个蛋白的编码基因分别构建了斑马鱼同源基因的突变体。通过利用肝脏、胰腺和肠道特异性探针进行原位杂交分析发现,rbl1基因敲除显著延缓斑马鱼肝脏发育,rbl2基因敲除显示出对肠道发育的潜在影响。虽然rbl1突变体可活可育,但RNA-seq数据分析发现,成鱼肝细胞代谢活性相关基因表达显著上调,而昼夜节律和免疫应答等相关基因表达显著下调,说明rbl1突变体肝脏功能发生紊乱。该研究成果拓展了对DEF-CAPN3/Def-Capn3b复合物在细胞周期调控中的功能及作用机制的认识。 展开更多
关键词 CAPN3 DEF Rbl1 细胞周期 蛋白降解 肝脏发育
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西藏地区MTHFR C677T基因多态性与高血压、高同型半胱氨酸血症及高脂血症的相关性研究
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作者 李鹏昌 穆丹妮 +8 位作者 刘治娟 刘小星 泽吉普赤 田丽萍 李洪雷 侯立安 李丹丹 吴洁 邱玲 《协和医学杂志》 北大核心 2026年第1期280-285,共6页
目的探究西藏地区藏族人群MTHFR C677T基因多态性与高血压、高同型半胱氨酸血症及高脂血症的相关性。方法采用整群抽样法,抽取林芝市、拉萨市及日喀则市、阿里地区的常住藏族居民进行研究,分析MTHFR C677T基因型在高血压、高同型半胱氨... 目的探究西藏地区藏族人群MTHFR C677T基因多态性与高血压、高同型半胱氨酸血症及高脂血症的相关性。方法采用整群抽样法,抽取林芝市、拉萨市及日喀则市、阿里地区的常住藏族居民进行研究,分析MTHFR C677T基因型在高血压、高同型半胱氨酸血症及高脂血症人群中的差异,并采用多因素Logistic回归分析高血压、高同型半胱氨酸血症及高脂血症与TT基因型的相关性。结果本研究共纳入符合纳入标准的受试者574名,平均年龄为(40.64±12.67)岁,其中男性占比为46.7%(268/574),女性占比为53.3%(306/574)。所在地区方面,林芝市、拉萨市及日喀则市、阿里地区分别占比34.8%(200/574)、33.1%(190/574)、32.1%(184/574)。平均收缩压为(117.89±18.98)mm Hg,平均舒张压为(79.74±14.88)mm Hg。高血压组TT基因型频率显著高于非高血压组(12.32%比5.96%,P=0.013),高同型半胱氨酸组TT基因型频率显著高于非高同型半胱氨酸组(9.41%比3.31%,P=0.010),高脂血症组与非高脂血症组TT基因型频率组间比较差异无统计学意义(P>0.05)。与CC/CT基因型相比,TT基因型与高血压(OR=2.855,95%CI:1.393~5.990)、高同型半胱氨酸血症(OR=4.788,95%CI:1.617~14.180)具有相关性,而与高脂血症无显著相关性。结论MTHFR C677T TT基因型与西藏藏族人群高血压、高同型半胱氨酸血症显著相关,提示该基因多态性可能是高原地区上述疾病的遗传风险因素之一。 展开更多
关键词 MTHFR C677T 基因多态性 高血压 高同型半胱氨酸血症 高脂血症 藏族 高原地区
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基于SNP位点解析中国东南沿海黄鳍棘鲷对4种环境因子的适应性
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作者 赵彦博 刘龙晖 +1 位作者 黄张帆 黎中宝 《水生生物学报》 北大核心 2026年第1期152-162,共11页
本研究基于单核苷酸多态性(SNP)位点,解析了黄鳍棘鲷(Acanthopagrus latus)对4种环境因子(温度、盐度、pH和溶解氧)的适应性机制。通过对10个地理群体99个个体的2b-RAD测序,共得到81044个高质量SNP位点,并结合采样海域的环境因子数据进... 本研究基于单核苷酸多态性(SNP)位点,解析了黄鳍棘鲷(Acanthopagrus latus)对4种环境因子(温度、盐度、pH和溶解氧)的适应性机制。通过对10个地理群体99个个体的2b-RAD测序,共得到81044个高质量SNP位点,并结合采样海域的环境因子数据进行了基因组关联分析(GWAS)。结果显示,与温度、盐度、pH和溶解氧显著相关的SNP位点分别为275、274、344和266个。这些位点上的基因GO富集到3大分类的结果相同,主要富集在细胞过程、细胞和细胞部分以及结合等条目中,涉及细胞周期、代谢、免疫反应等重要功能。KEGG注释结果显示,与4种环境因子显著相关的基因在有机系统和环境信息处理这两个分类上富集到的条目最多,富集到其余3个分类中条目较少。此外与多种环境因子相关的基因在轴突引导、GnRH分泌、神经活性配体−受体相互作用等通路中显著富集,说明这些与环境因子相关的基因并不是孤立发挥作用,而是组成了复杂的基因调控网络。本研究不仅揭示了黄鳍棘鲷不同地理群体对环境因子的潜在适应性机制,还为海洋鱼类的本地适应性研究提供了新的视角,为黄鳍棘鲷的生态保护和渔业资源管理提供了科学依据。 展开更多
关键词 SNP 环境因子 本地适应性 黄鳍棘鲷
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中国人群中鉴定出的46个HLA新等位基因的特征分析
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作者 李冬妹 张丹 +4 位作者 敬媛媛 王洁 王丽君 李伟 贾延军 《临床输血与检验》 2025年第6期821-829,共9页
目的分析在中国人群中鉴定出的46个HLA新等位基因的特征,为造血干细胞移植患者选择HLA基因相合供者提供帮助。方法根据PCR直接测序法(polymerase chain reaction sequence-based typing,PCR-SBT)及单等位基因组特异性测序得到的新等位... 目的分析在中国人群中鉴定出的46个HLA新等位基因的特征,为造血干细胞移植患者选择HLA基因相合供者提供帮助。方法根据PCR直接测序法(polymerase chain reaction sequence-based typing,PCR-SBT)及单等位基因组特异性测序得到的新等位基因序列,分析碱基突变类型和位置、氨基酸突变类型和性质变化,构建蛋白分子三维结构模型。结果46个HLA新等位基因包括A位点11个、B位点13个、C位点13个、DRB1位点3个、DQB1位点6个。碱基突变数57个,其中53个为点突变,3个缺失,1个插入。氨基酸突变既有同义突变(12个),也有错义突变(40个)以及移码突变(4个)。氨基酸的性质有22个未发生改变,其余30个则发生了不同的性质改变。HLA-Ⅰ类分子突变的位置大多发生在胞外区,包括α1结构域(13个)、α2结构域(11个)、α3结构域(15个),也有少部分发生在跨膜区(4个)、胞浆区(1个),还有1个发生在先导序列。HLA-Ⅱ类分子的所有突变都发生在胞外区,包括β1结构域9个和β2结构域2个。三个缺失突变的新等位基因都发生了蛋白质翻译的提前终止。对4个多碱基突变的新等位基因核酸片段序列在EMBL-EBI数据库中进行查找比对,分析其突变可能是通过基因转换而生成的。结论我们对这些新等位基因的分析展示了可能促成HLA多态性进化的不同机制,这些资料将有助于临床医生为造血干细胞移植患者找到HLA基因相合的供者,提高配型成功率。 展开更多
关键词 人类白细胞抗原 HLA多态性 点突变 基因转换 新等位基因
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Cohesin variants and meiotic timing shape chromosome segregation accuracy
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作者 Yuanyuan Liu Bohan Liu +6 位作者 Shuo Wang Li Zhao Qian Li Feifei Qi Ruoxi Wang Jun Zhou Jinmin Gao 《Journal of Genetics and Genomics》 2026年第2期293-304,共12页
The frequency of aneuploid gamete formation increases with maternal age,yet the effects of genetic variants on meiotic chromosome segregation accuracy during aging remain poorly understood.Using the multicellular orga... The frequency of aneuploid gamete formation increases with maternal age,yet the effects of genetic variants on meiotic chromosome segregation accuracy during aging remain poorly understood.Using the multicellular organism Caenorhabditis elegans,we investigate the impact of mutations in the conserved cohesin complex on age-associated meiotic errors.Point mutations in the head domain of the cohesin component SMC-1,which alter local hydrophobicity,cause meiotic defects that vary with age.A severe mutation causes incomplete synapsis and defective crossover formation,and a minor one causes age-related diakinesis bivalent abnormalities.Notably,while the mild mutation causes defects only in aged worms,worms with the severe mutation exhibit significantly alleviated phenotypes with age.Genetic and cytological analyses suggest that this alleviation results from a slowed meiotic progression during early prophase,which restores impaired cohesin loading.These findings reveal that cohesin variants,meiotic progression speed during early prophase,and the overall duration of meiosis collectively shape the accuracy of meiotic chromosome segregation. 展开更多
关键词 MEIOSIS Chromosome segregation COHESIN SMC-1 Reproductive aging Caenorhabditis elegans
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小麦抗赤霉病的遗传基础与育种应用 被引量:1
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作者 李国强 贾海燕 +5 位作者 孔忠新 杨阳 李娜 谢全 袁阳 马正强 《生命科学》 2025年第5期548-557,共10页
赤霉病是全球范围的毁灭性小麦穗部病害,严重威胁小麦生产和食品安全。选育和推广抗赤霉病品种是防治赤霉病最有效的策略。然而由于小麦赤霉病抗性的复杂性,传统抗赤霉病育种进展无法满足小麦产业发展的需求。过去20多年来,围绕小麦抗... 赤霉病是全球范围的毁灭性小麦穗部病害,严重威胁小麦生产和食品安全。选育和推广抗赤霉病品种是防治赤霉病最有效的策略。然而由于小麦赤霉病抗性的复杂性,传统抗赤霉病育种进展无法满足小麦产业发展的需求。过去20多年来,围绕小麦抗赤霉病的遗传基础解析取得了一系列重要成果,并在利用分子育种技术改良小麦赤霉病抗性方面取得了关键突破。本文主要从小麦抗赤霉病种质资源发掘、抗赤霉病QTL的定位和克隆以及分子育种等方面综述小麦抗赤霉病研究方面的最新进展,并探讨目前存在的问题和未来发展前景。 展开更多
关键词 小麦 赤霉病抗性 QTL 精细定位 克隆 分子育种
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基于GenBank数据库的真核生物遗传数据时空格局分析 被引量:1
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作者 彭欣 刘传 黄晓磊 《生物多样性》 北大核心 2025年第8期22-32,共11页
遗传数据在生物多样性研究和保护实践中发挥着越来越重要的作用,然而研究者应用这些数据时常面临数据质量缺陷、地理或类群分布不均等方面的制约,尽管陆生脊椎动物的遗传数据格局已有较深入研究,但全球植物、真菌和其他动物类群的遗传... 遗传数据在生物多样性研究和保护实践中发挥着越来越重要的作用,然而研究者应用这些数据时常面临数据质量缺陷、地理或类群分布不均等方面的制约,尽管陆生脊椎动物的遗传数据格局已有较深入研究,但全球植物、真菌和其他动物类群的遗传数据空间分布模式仍缺乏系统的实证研究。本文采用多尺度分析方法,系统评估了动物、植物和真菌三大真核生物界的遗传数据现状、元数据完整性以及遗传数据的时空动态趋势。结果表明,动物界拥有约2.7亿条序列和1.6万个基因组数据,超过植物界(约1.4亿条,0.7万个)和真菌界(约0.2亿条,1.7万个)。遗传数据的地理元数据缺失现象普遍存在,其中真菌ITS序列的经纬度缺失最为严重(缺失率92.07%),其次是植物rbcL(83.19%)和动物COI(26.40%)。时空分布格局显示,全球尺度上遗传数据呈现明显的“北半球中心化”特征,北美、西欧和东亚地区占据主导地位,而南半球普遍数据匮乏;同时观察到动物COI和植物rbcL数据呈下降趋势,而真菌ITS数据快速增长。中国区域则表现出独特的“南动物、东植物、北真菌”分布格局,而西北地区数据积累明显不足;时间维度上,中国植物和真菌数据持续增长,而动物数据保持稳定。这些发现揭示了遗传数据质量缺陷和分布失衡已成为制约生物多样性研究的重要瓶颈。为此,我们建议建立严格的元数据存档标准,重点加强南半球和中国西北部等数据薄弱区域的科研投入,并通过构建国际科研合作网络促进全球数据资源的均衡配置,从而提升遗传数据在生物多样性研究和保护实践中的应用价值。 展开更多
关键词 遗传数据 DNA条形码 基因组 时空分布格局
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新工科视域下遗传学课程改革与实践——以细胞质遗传为例
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作者 张云芳 陈楚 +1 位作者 张海军 李高峰 《淮北师范大学学报(自然科学版)》 2025年第4期87-91,共5页
为培养新工科创新型人才,针对遗传学课程专业支撑薄弱、特色育人不足、学科本位现象等问题,以细胞质遗传为例,结合一流课程申报过程中的成果和经验,开展课程改革:梳理细胞质遗传对专业毕业要求支撑,厘清目标导向;重塑课程内容,融合前沿... 为培养新工科创新型人才,针对遗传学课程专业支撑薄弱、特色育人不足、学科本位现象等问题,以细胞质遗传为例,结合一流课程申报过程中的成果和经验,开展课程改革:梳理细胞质遗传对专业毕业要求支撑,厘清目标导向;重塑课程内容,融合前沿研究、学科交叉和实践应用于一体;更新教学模式,提升学生创新思维和综合能力。课程改革强化对专业支撑,促进课程特色育人,落实学生主体地位,为培养新工科创新型人才提供参考。 展开更多
关键词 新工科 细胞质遗传 创新型人才 跨学科教学 项目式教学
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不同品种薄壳山核桃染色体核型分析
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作者 贺义昌 陈忠 +3 位作者 李晚根 涂业苟 叶甜甜 左继林 《南方林业科学》 2025年第3期1-5,共5页
【目的】鉴定不同品种薄壳山核桃的亲缘关系,揭示其遗传多样性,获得种质资源研究和遗传育种基础数据。【方法】以江西省主栽的4个薄壳山核桃优良品种‘波尼’‘威奇塔’‘金华’‘肖尼’为研究材料,采用常规染色体压片法,对其染色体数... 【目的】鉴定不同品种薄壳山核桃的亲缘关系,揭示其遗传多样性,获得种质资源研究和遗传育种基础数据。【方法】以江西省主栽的4个薄壳山核桃优良品种‘波尼’‘威奇塔’‘金华’‘肖尼’为研究材料,采用常规染色体压片法,对其染色体数目、核型公式、染色体长短、核型对称性类型、核型不对称系数、染色体长度组成等指标进行研究,并对其核型进行聚类分析。【结果】4个不同品种薄壳山核桃染色体数目均为2n=2X=32,染色体数目稳定;‘波尼’‘威奇塔’和‘金华’染色体核型类型均为2B型,‘肖尼’染色体核型为2A型;最长与最短染色体比值范围为1.93~2.78,平均臂比范围为1.83~2.23,核型不对称系数范围为61.66%~66.08%;从进化角度来看,4个品种的薄壳山核桃进化程度比较高,进化程度由高到低依次为‘波尼’‘金华’‘肖尼’‘威奇塔’;聚类分析结果表明‘波尼’‘金华’和‘肖尼’的遗传距离最小,‘威奇塔’与其他品种的遗传距离最大。【结论】不同品种薄壳山核桃遗传特性具有明显差异,这为薄壳山核桃种质资源收集和良种培育提供思路。 展开更多
关键词 薄壳山核桃 染色体 核型分析 核型不对称系数
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基因组进化过程中的基因丢失机制与功能研究进展
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作者 周熠 刘勇波 《生物技术通报》 北大核心 2025年第6期38-48,共11页
基因丢失在生物中广泛存在,是基因组进化的重要机制,对生物的环境适应和物种分化具有重要意义。然而,基因丢失如何发生以及会造成怎样影响等尚未完全阐明。本文综述了基因丢失的分子机制、功能和偏好性等方面的研究进展。基因丢失主要由... 基因丢失在生物中广泛存在,是基因组进化的重要机制,对生物的环境适应和物种分化具有重要意义。然而,基因丢失如何发生以及会造成怎样影响等尚未完全阐明。本文综述了基因丢失的分子机制、功能和偏好性等方面的研究进展。基因丢失主要由DNA复制错误、转座活动和染色体结构变异等内在机制引发,并受到遗传漂变和自然选择等进化因素的影响。基因丢失可能通过优化资源利用、简化代谢途径和增强环境适应性,从而提高生物的生存和繁殖能力。然而,关键功能基因的丢失可能削弱生物对环境变化的适应能力,并进一步增加生存风险。基因丢失表现出非随机的偏好性,受基因功能、表达水平、剂量敏感性、基因组位置和蛋白质网络结构等因素影响。基因丢失与基因复制、水平基因转移等机制相互作用,共同维持了基因组“获得-丢失”的动态平衡。未来研究应进一步关注基因丢失的代价与风险,解析其在调控适应性策略中的具体机制及其对环境适应的影响,并探讨其在物种分化和适应性进化中的作用,从而推动其在遗传及生物工程育种等领域的应用。 展开更多
关键词 基因丢失 基因组进化 适应性进化 基因功能 丢失偏好性
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基于未折叠蛋白反应基因特征的儿童脓毒症预测模型构建及分子亚型鉴定
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作者 刘爽 冯雯 顾雪锋 《生物信息学》 2025年第2期131-142,共12页
通过分析来自GEO数据库的儿童脓毒症转录组数据,探究了未折叠蛋白反应在该疾病发生机制中的作用。首先利用随机森林和支持向量机算法筛选了诊断模型的候选基因包括EXOSC4,EIF2AK3,CEBPB,WIPI1,EXOSC6,EXTL2和SRPRB,使用多因素逻辑回归... 通过分析来自GEO数据库的儿童脓毒症转录组数据,探究了未折叠蛋白反应在该疾病发生机制中的作用。首先利用随机森林和支持向量机算法筛选了诊断模型的候选基因包括EXOSC4,EIF2AK3,CEBPB,WIPI1,EXOSC6,EXTL2和SRPRB,使用多因素逻辑回归构建诊断模型,并利用外部数据集对其进行了验证。接着,分析了这些基因与免疫细胞浸润的相关性,发现它们与中性粒细胞的浸润具有强相关性。此外,通过一致性聚类将儿童脓毒症患者分成了三个亚型,比较了它们在临床特征和炎症因子表达方面的差异。最后,通过加权基因共表达网络分析筛选出每个亚型的核心基因,并发现这三个亚型在免疫系统、代谢和细胞死亡等生物学过程上存在显著差异。药物预测结果显示不同亚型的患者可能对不同种类的药物具有不同的敏感性。总之,这项研究为儿童脓毒症的诊断和精准治疗提供了新的思路。 展开更多
关键词 儿童脓毒症 未折叠蛋白反应 免疫浸润 诊断模型 机器学习
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基于极端混合池全基因组重测序的茄子果实硬度基因定位 被引量:1
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作者 乔军 刘婧 +1 位作者 李素文 王利英 《华北农学报》 北大核心 2025年第3期44-50,共7页
为系统研究果实硬度相关基因,通过基因组重测序BSA方法定位果实硬度关联区间,并根据其对应的参考基因组共线性区段和基因注释信息预测候选基因,为下一步基因克隆奠定基础。以稳定遗传的软肉自交系C18与硬肉自交系LE4杂交,F2后代的果实... 为系统研究果实硬度相关基因,通过基因组重测序BSA方法定位果实硬度关联区间,并根据其对应的参考基因组共线性区段和基因注释信息预测候选基因,为下一步基因克隆奠定基础。以稳定遗传的软肉自交系C18与硬肉自交系LE4杂交,F2后代的果实硬度分离呈正态分布。在F2群体中分别选取30株软肉和30株硬肉单株构建极端混合池,对混合池样本和双亲材料分别开展30×和10×覆盖度的全基因组重测序。重测序共获得1891040个单核苷酸多态性(SNPs)标记及376603个插入缺失(InDels)标记,用于果实硬度性状的全基因组定位。BSA定位峰值位于茄子第6号染色体,从72610411到75329951 bp,共计2.71 Mb。根据通路富集和基因功能注释,筛选到候选基因Smechr0601726.1和Smechr0601735.1。综上,通过基因组重测序BSA分析可知,茄子果实硬度可能由2个重要的候选基因进行调控,Smechr0601726.1编码多聚半乳糖醛酸酶基因,与果实硬度直接相关;Smechr0601735.1与抗坏血酸和阿糖二酸代谢密切相关,编码抗坏血酸过氧化物酶,与果实发育和硬度形成有关,可以延缓果实软化。 展开更多
关键词 茄子 极端混合池 全基因组重测序 果实硬度 基因定位
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宁夏汉族人群细胞色素P4501B1 SNP rs1056836分布研究
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作者 戴晓婧 刘春莲 +5 位作者 焦海燕 潘琳 彭亮 陈银涛 霍正浩 赵巍 《中国热带医学》 CAS 2008年第10期1689-1691,共3页
目的研究细胞色素P450(cytochrome P450)1B1基因SNP rs1056836在宁夏地区正常汉族人群中的基因型频率、等位基因频率分布特征。方法应用等位基因特异性扩增(AS-PCR)及DNA测序法对410名宁夏汉族正常成人CYP1B1rs1056836C→G位点基因多态... 目的研究细胞色素P450(cytochrome P450)1B1基因SNP rs1056836在宁夏地区正常汉族人群中的基因型频率、等位基因频率分布特征。方法应用等位基因特异性扩增(AS-PCR)及DNA测序法对410名宁夏汉族正常成人CYP1B1rs1056836C→G位点基因多态性的分布进行测定,并应用χ2检验比较宁夏汉族人群与我国其他地区汉族人群基因频率的分布情况。结果宁夏汉族人群CYP1B1SNP rs1056836的基因型频率分别为C/C31.9%,C/G54.9%,G/G13.2%。结论宁夏汉族CYP1B1SNP rs1056836分布频率与欧美及国内其他地区人群具有显著性差异(P<0.005),并且男女之间也存在显著性差异(P<0.005)。 展开更多
关键词 细胞色素Q343 单核苷酸多态性 宁夏汉族
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小尾寒羊产羔性状的微卫星标记研究 被引量:22
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作者 雷雪芹 陈宏 +5 位作者 徐廷生 袁志发 郭满才 宋世德 雷初朝 孙维斌 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第6期530-535,共6页
选用位于绵羊第6号染色体上与多胎基因(FecB)紧密连锁的微卫星OarAE101、BM1329、BM143和OarHH55以及位于第4号染色体上的OarHH35对小尾寒羊的产羔性状进行标记研究,结果发现5个微卫星基因座在小尾寒羊的PIC都达到了高度多态(PIC>0 5... 选用位于绵羊第6号染色体上与多胎基因(FecB)紧密连锁的微卫星OarAE101、BM1329、BM143和OarHH55以及位于第4号染色体上的OarHH35对小尾寒羊的产羔性状进行标记研究,结果发现5个微卫星基因座在小尾寒羊的PIC都达到了高度多态(PIC>0 5)水平。5个微卫星基因座标记小尾寒羊的产羔性状,以OarAE101效果最好,找到了6个显著标记;其次为BM1329,找到了4个显著标记;BM143和OarHH35分别找到了2个和3个显著标记;在OarHH55基因座上没有找到显著标记。以上所产生的15个显著标记中,与产羔数有极显著正相关(P<0 01)的标记有5个,其相关大小顺序依次为OarAE101的等位基因113bp、BM143的基因型118bp/106bp、OarHH35的等位基因139bp、OarAE101的等位基因103bp和OarAE101的基因型113bp/103bp;与产羔数呈显著正相关(P<0 05)的标记有2个,其相关大小顺序依次为OarHH35的基因型139bp/127bp、BM1329等位基因170bp;与产羔数呈极显著负相关(P<0 01)的标记有4个,其负相关强弱顺序依次为OarAE101基因型111bp/101bp、OarAE101的等位基因111bp、BM1329的等位基因168bp、OarAE101的等位基因101bp;与产羔数呈显著负相关(P<0 05)的标记有4个,其负相关强弱顺序依次为BM143等位基因116bp、BM1329的等位基因186bp、BM1329基因型186bp/168bp。 展开更多
关键词 小尾寒羊 产羔性状 微卫星标记 绵羊 第6号染色体 多胎基因 第4号染色体 等位基因 夹角 相关关系
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中国小麦育成品种和农家种中慢锈基因Lr34/Yr18的分子检测 被引量:62
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作者 杨文雄 杨芳萍 +3 位作者 梁丹 何中虎 尚勋武 夏先春 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第7期1109-1113,共5页
Lr34/Yr18是重要的慢叶锈和慢条锈基因,携带该连锁基因的小麦品种被广泛种植于世界许多国家。利用STS标记csLV34对慢叶锈和慢条锈基因Lr34/Yr18进行分子检测的结果表明,我国231份育成品种(系)中仅有14份材料携带Lr34/Yr18基因,占6.1%。... Lr34/Yr18是重要的慢叶锈和慢条锈基因,携带该连锁基因的小麦品种被广泛种植于世界许多国家。利用STS标记csLV34对慢叶锈和慢条锈基因Lr34/Yr18进行分子检测的结果表明,我国231份育成品种(系)中仅有14份材料携带Lr34/Yr18基因,占6.1%。不同麦区分布频率不同,其中北部冬麦区为零,黄淮冬麦区、长江中下游冬麦区、西南冬麦区和西北春麦区分别为3.0%、21.4%、16.7%和33.3%。在422份农家种中,359份含有Lr34/Yr18基因,占85.1%。Lr34/Yr18基因在不同麦区的分布频率也存在差异,北部冬麦区、黄淮冬麦区、长江中下游冬麦区、西南冬麦区、南部冬麦区和西北春麦区分别为89.6%、77.4%、93.1%、93.8%、96.6%和61.1%。csLV34标记扩增产物为150bp和229bp的片段,能有效鉴别品种是否携带Lr34/Yr18基因,是一个重复性好、准确率高的分子标记,可用于小麦Lr34/Yr18基因的鉴定与选择。 展开更多
关键词 普通小麦 Lr34/Yr18基因 STS标记csLV34 分子标记辅助选择
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荧光原位杂交技术的研究进展 被引量:33
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作者 何世斌 柴连琴 +4 位作者 谭珺隽 沈尧 周萍 马云峰 李立家 《植物科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期199-204,共6页
荧光原位杂交(FISH)是在染色体、间期细胞核和DNA纤维上进行DNA序列定位的一种有效手段。近年来,围绕提高检测的分辨率和灵敏性,不断将免疫染色、量子点和微流控芯片等物理化学技术引入到荧光原位杂交中,促进了它的快速发展。本文主要... 荧光原位杂交(FISH)是在染色体、间期细胞核和DNA纤维上进行DNA序列定位的一种有效手段。近年来,围绕提高检测的分辨率和灵敏性,不断将免疫染色、量子点和微流控芯片等物理化学技术引入到荧光原位杂交中,促进了它的快速发展。本文主要综述了荧光原位杂交的基本原理和发展历程,重点介绍了免疫染色-荧光原位杂交(immuno-FISH)、量子点-荧光原位杂交(QD-FISH)和微流控芯片-荧光原位杂交(FISH on microchip)等多种新技术及其检测特点,如快速、灵敏、动态、多样化等。随着荧光原位杂交技术的不断完善与发展,将在细胞遗传学、表观遗传学及分子生物学等领域发挥更加重要的作用。 展开更多
关键词 荧光原位杂交 免疫染色 量子点 微流控芯片
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一个新的水稻迟熟性基因的遗传分析和分子标记定位 被引量:18
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作者 李仕贵 马玉清 +3 位作者 王文明 刘国庆 周开达 朱立煌 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2000年第2期133-138,共6页
中籼迟熟水稻品系8987含未知的长生育期基因,在杂交水稻育种中有重要的利用价值,应用该品系与4个不同生态类型的水稻品种杂交,对其F1和F2群体进行生育期调查和遗传分析,确认8987的长生育期受1对隐性主效基因控制。以... 中籼迟熟水稻品系8987含未知的长生育期基因,在杂交水稻育种中有重要的利用价值,应用该品系与4个不同生态类型的水稻品种杂交,对其F1和F2群体进行生育期调查和遗传分析,确认8987的长生育期受1对隐性主效基因控制。以(8987X地谷)F2群体为基础,应用RFLP和微卫星标记结合群分法,发现第7染色体的RFLP标记C213与该基因连锁;进一步应用F2分离群体将该基因定位于第7染色体上,暂定名为lf-3。此基因的发现和定位将有助于分子标记辅助选择和杂交水稻的改良。 展开更多
关键词 水稻 生育期 分子标记 迟熟性基因 遗传育种
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利用组织培养和辐射诱变创造高频率小麦与簇毛麦染色体易位 被引量:17
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作者 李洪杰 郭北海 +5 位作者 张艳敏 李义文 杜立群 李银心 贾旭 朱至清 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2000年第6期511-519,共9页
利用荧光原位杂交证明普通小麦与硬粒小麦-簇毛麦双二倍体杂种培养细胞和再生植株中能够发生属间染色体易位,易位染色体不仅有臂间易位,还有小片段易位,表明通过杂种组织培养是创造属间易位的一个可行的方法。辐射处理能够大幅度促... 利用荧光原位杂交证明普通小麦与硬粒小麦-簇毛麦双二倍体杂种培养细胞和再生植株中能够发生属间染色体易位,易位染色体不仅有臂间易位,还有小片段易位,表明通过杂种组织培养是创造属间易位的一个可行的方法。辐射处理能够大幅度促进杂种愈伤组织细胞中的染色体数目和结构变异,特别是易位频率达到7.4%。观察还表明,培养时间对杂种愈伤组织细胞中染色体数目和结构变异都有较大影响,培养细胞的染色体变异在培养的初期阶段就已出现。在一定时间里,随培养时间的延长,未发生变异的细胞频率逐渐下降,染色体数目减少的细胞逐渐增多。培养时间对染色体数目增加的细胞频率影响不大。对于染色体结构变异,培养时间延长主要是提高了端着丝点染色体的频率。在杂种培养细胞中还观察到一定频率的染色体加倍细胞(2n=84),但是培养一段时间后这类细胞就逐渐消失了。 展开更多
关键词 普通小麦 簇毛麦 组织培养 染色体易位 辐射诱变
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