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凡纳滨对虾组织中虾青素的分析方法建立、分布特征及功能探究
1
作者 贾佳 刘怡凤 +2 位作者 赵倩倩 孙玥 包振民 《中国海洋大学学报(自然科学版)》 北大核心 2026年第4期39-48,99,共11页
为探究虾青素在凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)体内的分布特征,本研究建立了一种虾青素提取与定量分析方法,确定甲醇为最佳萃取溶剂,采用1∶50固液比单次萃取,结合“甲醇萃取-四氢呋喃复溶”联用检测方案。饲料中虾青素添加量分别为0... 为探究虾青素在凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)体内的分布特征,本研究建立了一种虾青素提取与定量分析方法,确定甲醇为最佳萃取溶剂,采用1∶50固液比单次萃取,结合“甲醇萃取-四氢呋喃复溶”联用检测方案。饲料中虾青素添加量分别为0(对照组)、40、80、120 mg/kg,进行投喂实验,探究不同添加量虾青素对凡纳滨对虾的影响,并定量分析虾青素分布、体色变化及酶活性。研究表明,虾青素能够改善对虾体色,使其向红橙色转变,并在肝胰腺、腹神经索和表皮中积累最为显著。此外,虾青素能够提高肝胰腺总抗氧化能力(Total antioxidant capacity, T-AOC),增强超氧化物歧化酶(Superoxide dismutase, SOD)、过氧化氢酶(Catalase, CAT)、碱性磷酸酶(Alkaline phosphatase, AKP)和谷胱甘肽过氧化物酶(Glutathione peroxidase, GSH-Px)活性,同时降低丙二醛(Malondialdehyde, MDA)含量,表明虾青素可有效增强凡纳滨对虾的抗氧化与免疫功能。 展开更多
关键词 凡纳滨对虾 虾青素 定量方法 抗氧化 免疫功能
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哺乳动物可变多聚腺苷酸化 被引量：1
2
作者 张宇 池红霞 +2 位作者 杨乌日吐 左永春 邢永强 《生物化学与生物物理进展》 北大核心 2025年第1期32-49,共18页
随着测序技术的快速发展,哺乳动物可变多聚腺苷酸化(alternative polyadenylation,APA)得到了更加精准的检测。APA通过改变poly(A)尾巴的长度和位置,精细地调控基因的表达,参与疾病发生、胚胎发育等生命过程。哺乳动物APA的研究主要聚... 随着测序技术的快速发展,哺乳动物可变多聚腺苷酸化(alternative polyadenylation,APA)得到了更加精准的检测。APA通过改变poly(A)尾巴的长度和位置,精细地调控基因的表达,参与疾病发生、胚胎发育等生命过程。哺乳动物APA的研究主要聚焦于以下三个方面:第一,基于转录组数据识别APA事件,并阐明其特征;第二,研究APA与基因表达调控的相互关系,揭示其在生命调控中的重要作用;第三,挖掘APA与疾病发生、胚胎发育、分化等生命过程的内在联系,为疾病的诊治、胚胎发育调控机制的解析等提供新的视角和方法。本文详细阐述了APA的分类、发生机制及功能,系统总结了基于多种转录组数据的APA识别方法和APA数据资源,对APA研究进行了总结与展望,强调了测序技术对哺乳动物APA研究的推动作用。未来,随着测序技术的进一步发展,哺乳动物APA的调控机制将更加明晰。 展开更多
关键词 可变多聚腺苷酸化 调控机制 转录组 识别方法 数据资源
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基于Point Transformer方法的鱼类三维点云模型分类 被引量：2
3
作者 胡少秋 段瑞 +3 位作者 张东旭 鲍江辉 吕华飞 段明 《水生生物学报》 北大核心 2025年第2期146-155,共10页
为实现对不同鱼类的精准分类,研究共采集110尾真实鱼类的三维模型,对获取的3D模型进行基于预处理、旋转增强和下采样等操作后,获取了1650尾实验样本。然后基于Point Transformer网络和2个三维分类的对比网络进行数据集的分类训练和验证... 为实现对不同鱼类的精准分类,研究共采集110尾真实鱼类的三维模型,对获取的3D模型进行基于预处理、旋转增强和下采样等操作后,获取了1650尾实验样本。然后基于Point Transformer网络和2个三维分类的对比网络进行数据集的分类训练和验证。结果表明,利用本实验的目标方法Point Transformer获得了比2个对比网络更好的分类结果,整体的分类准确率能够达到91.9%。同时对所使用的三维分类网络进行有效性评估,3个模型对于5种真实鱼类模型的分类是有意义的,其中Point Transformer的模型ROC曲线准确率最高,AUC面积最大,对于三维鱼类数据集的分类最为有效。研究提供了一种可以实现对鱼类三维模型进行精准分类的方法,为以后的智能化渔业资源监测提供一种新的技术手段。 展开更多
关键词 点云处理 Point Transformer 三维模型 鱼类分类
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复合模式层析在双特异性抗体纯化工艺开发中的应用
4
作者 魏利 刘道琴 +9 位作者 于雪莲 徐婷 陈楚楚 高海鸰 王春艳 吴婷婷 王如意 窦颖辉 范清林 宋礼华 《中国生物制品学杂志》 2025年第8期951-961,共11页
目的利用复合模式层析技术去除双特异性抗体(bispecific antibody,BsAb,简称双抗)生产过程中的聚集体,在保证目的蛋白回收率的前提下,尽可能提高产品纯度、去除杂质残留。方法利用复合模式层析(阴离子和疏水)结合实验设计(Design of Exp... 目的利用复合模式层析技术去除双特异性抗体(bispecific antibody,BsAb,简称双抗)生产过程中的聚集体,在保证目的蛋白回收率的前提下,尽可能提高产品纯度、去除杂质残留。方法利用复合模式层析(阴离子和疏水)结合实验设计(Design of Experiments,DoE)方法对一种IgG-like的对称型双抗在流穿模式下的纯化工艺进行开发,建立高纯度、高回收率的纯化工艺,明确复合模式层析在流穿模式中的关键工艺参数——上样样品和平衡液的pH和电导、保留时间、上样载量,以及关键工艺参数对聚集体去除的影响趋势、聚集体在收获液不同出峰时间点的分布情况等。结果经CHO细胞培养收获的含双抗蛋白的细胞上清进行3步层析工艺纯化后,目的双抗蛋白的体积排阻高效液相色谱(size exclusion high-performance liquid chromatography,SEC-HPLC)纯度>99%,宿主细胞蛋白(host cell protein,HCP)残留<20 ppm,宿主DNA残留低于检测下限。结论复合模式层析在去除约7%聚集体的同时仍能保持93%以上的目的蛋白回收率,在双抗纯化工艺开发中具有广阔的应用前景。 展开更多
关键词 双特异性抗体 复合模式层析 实验设计 聚集体 宿主细胞蛋白 宿主DNA
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荧光定量PCR与LAMP检测IHHNV的特异性和灵敏性比较 被引量：19
5
作者 赵哲 任春华 +3 位作者 江晓 张吕平 冯娟 胡超群 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期984-989,共6页
传染性皮下及造血器官坏死病毒(IHHNV)是世界各地养殖对虾的重要病毒性病原之一,给对虾养殖业造成严重经济损失。研究建立了检测IHHNV的荧光定量PCR和环介导等温核酸扩增(Loop-mediated isothermal amplification,LAMP)两种技术,并对它... 传染性皮下及造血器官坏死病毒(IHHNV)是世界各地养殖对虾的重要病毒性病原之一,给对虾养殖业造成严重经济损失。研究建立了检测IHHNV的荧光定量PCR和环介导等温核酸扩增(Loop-mediated isothermal amplification,LAMP)两种技术,并对它们的特异性和灵敏性进行了比较。结果显示,所建立的荧光定量PCR检测IHHNV的方法最低检测限度为6个DNA拷贝/反应,在待扩增DNA浓度为6.038×104-6.038×109cps/mL范围时,模板浓度与循环阈值Ct之间的相关性良好,决定系数r2为0.99521;对5份白斑综合症病毒基因组DNA和10份健康对虾基因组DNA样品进行荧光定量PCR检测,结果都为阴性;这说明荧光定量PCR检测IHHNV方法具有灵敏度高、特异性高和精确性高等优点。同样,所建立的LAMP检测IHHNV的方法在60min反应时间内也可检测到最低为6个拷贝的DNA模板,反应产物加入荧光染料SYBR Green I后反应液呈现明显的亮绿色,且特异的检测IHHNV DNA模板;这说明所建立的LAMP检测IHHNV的方法具有荧光定量PCR方法相当的灵敏度、特异性和精确性。考虑到LAMP检测方法操作更为简单、方便,而且不需要昂贵的仪器,LAMP检测IHHNV的方法更适合于对虾养殖现场检测的推广使用。 展开更多
关键词 荧光定量PCR LAMP IHHNV 特异性 灵敏度
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鱼类致病性豚鼠气单胞菌单克隆抗体-胶体金检测方法的建立 被引量：17
6
作者 黄艺丹 汪开毓 +1 位作者 郑建 黄锦炉 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期509-516,共8页
以福尔马林灭活的豚鼠气单胞菌按2.5×107个/只和5.0×107个/只分成两个剂量组免疫BALB/c小鼠,通过杂交瘤技术制备针对豚鼠气单胞菌的单克隆抗体(McAb),用间接ELISA法对所需的杂交瘤细胞株进行特异性筛选,获得了2株可分泌特异性... 以福尔马林灭活的豚鼠气单胞菌按2.5×107个/只和5.0×107个/只分成两个剂量组免疫BALB/c小鼠,通过杂交瘤技术制备针对豚鼠气单胞菌的单克隆抗体(McAb),用间接ELISA法对所需的杂交瘤细胞株进行特异性筛选,获得了2株可分泌特异性McAb的杂交瘤细胞,并分别命名为3F3和2C9C3。经过鉴定,这两株McAb能够特异性的针对豚鼠气单胞菌,其抗体亚类分别为IgG1型和IgM型;腹水效价分别为10-6和10-5;相对亲和力较高;3F3针对豚鼠气单胞菌脂多糖表位,而2C9C3针对非脂多糖抗原位点。利用实验制备的McAb建立了以McAb为基础的双抗夹心法膜式超灵敏胶体金快速检测方法,所研制的豚鼠气单胞菌胶体金快速检测卡灵敏度好,特异性高,重复性好,检测时间快,操作简便,为水产上豚鼠气单胞菌的快速鉴定和诊断以及该菌流行的监测提供有力的工具。 展开更多
关键词 豚鼠气单胞菌 单克隆抗体 生物特性 胶体金
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Mapmaker3.0和作图软件使用 被引量：9
7
作者 王竹林 杨睿 +2 位作者 杨兴圣 刘曙东 胡甘 《实验室研究与探索》 CAS 北大核心 2012年第11期62-65,共4页
构建各种生物体的遗传连锁图谱成为分子遗传学和作物育种领域QTL定位的热点。Mapmaker3.0是当前普遍用于遗传连锁距离计算的软件。Mapmaker3.0的使用首先要准备标记数据文件,然后用Sequence命令输入欲分析的标记座位,接着键入Group命令... 构建各种生物体的遗传连锁图谱成为分子遗传学和作物育种领域QTL定位的热点。Mapmaker3.0是当前普遍用于遗传连锁距离计算的软件。Mapmaker3.0的使用首先要准备标记数据文件,然后用Sequence命令输入欲分析的标记座位,接着键入Group命令指导程序将Sequence中的标记分为不同的连锁群,接下来,程序在一个连锁群内部决定最有可能的标记排列次序,计算一个连锁群中所有的标记每一个可能的次序最大似然图谱,比较这些图谱的可能性并找出最合适图谱,这部分工作用Compare命令完成,再用sequence和map命令得到标记之间的连锁数据。之后,将这些数据按Genemap或MapDraw分析软件所要求的数据格式输入,通过对这2个软件的正确使用,就可得到需要的遗传连锁图谱图形文件。 展开更多
关键词 Mapmaker3 0 Genemap MapDraw 遗传连锁图谱 连锁距离
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第三代测序技术的方法原理及其在生物领域的应用 被引量：21
8
作者 张子敬 刘燕蓉 +8 位作者 张顺进 贺花 李佳霄 刘贤 吕世杰 李志明 王二耀 雷初朝 黄永震 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2020年第6期11-15,共5页
在自然界中,生物DNA的碱基序列包含着生物体中绝大多数的遗传信息,破译这些碱基序列就成了探索生命奥秘的至关重要的课题。随着第二代测序技术(Next-Generation Sequencing,NGS)的发展和应用,其弊端正在显现,而第三代单分子测序技术在... 在自然界中,生物DNA的碱基序列包含着生物体中绝大多数的遗传信息,破译这些碱基序列就成了探索生命奥秘的至关重要的课题。随着第二代测序技术(Next-Generation Sequencing,NGS)的发展和应用,其弊端正在显现,而第三代单分子测序技术在一定程度上可以弥补NGS技术在应用中的一些不足。本文阐述了第三代单分子测序技术的2个测序原理,介绍其在基因组、转录组、表观遗传学等方面的应用现状,同时对其未来发展进行展望。 展开更多
关键词 第三代测序技术 原理 生物 应用
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孔石莼多糖及其硫酸酯化衍生物抗肿瘤活性的体外实验研究 被引量：11
9
作者 王凯 綦慧敏 +2 位作者 李玉磊 徐海亭 刘顺梅 《中国海洋药物》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期19-23,共5页
目的研究孔石莼多糖(U)及其硫酸酯化衍生物(HU)对不同肿瘤细胞株生长的影响。方法利用体外细胞培养模型,应用CCK-8法分析孔石莼多糖U及其硫酸酯化衍生物对不同肿瘤细胞生长的影响。结果孔石莼多糖U及其硫酸酯化衍生物HU对人肝癌细胞HepG... 目的研究孔石莼多糖(U)及其硫酸酯化衍生物(HU)对不同肿瘤细胞株生长的影响。方法利用体外细胞培养模型,应用CCK-8法分析孔石莼多糖U及其硫酸酯化衍生物对不同肿瘤细胞生长的影响。结果孔石莼多糖U及其硫酸酯化衍生物HU对人肝癌细胞HepG2、人肺癌细胞SPC-A-1、人胃癌细胞CDX2、人乳腺癌细胞MDA-MB-231均具有一定的抑制作用,但作用又有明显差异。对孔石莼多糖(U)进行硫酸酯化衍生化后增强了对HepG2、SPC-A-1、CDX2及MDA-MB-231肿瘤细胞的抑制作用。结论孔石莼多糖(U)及其硫酸酯化衍生物(HU)对不同肿瘤细胞生长具有一定的抑制作用,硫酸酯化孔石莼多糖(HU)对肿瘤细胞的抑制作用强于孔石莼多糖(U)。 展开更多
关键词 孔石莼多糖U 硫酸酯化衍生物 抗肿瘤 体外细胞培养
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基于第三代测序技术的基因组组装方法及其在烟草中的应用 被引量：7
10
作者 卢鹏 金静静 +3 位作者 李泽锋 曹培健 范楷 许亚龙 《烟草科技》 EI CAS CSCD 北大核心 2018年第2期87-94,共8页
第三代测序技术凭借着片段读长更长的优势在基因组研究中得到广泛应用。为此,回顾了测序技术的发展,总结了三代测序技术的优缺点,重点对第三代测序技术的基因组组装方法,包括数据预处理、序列组装、组装之后的序列修补和序列的染色体定... 第三代测序技术凭借着片段读长更长的优势在基因组研究中得到广泛应用。为此,回顾了测序技术的发展,总结了三代测序技术的优缺点,重点对第三代测序技术的基因组组装方法,包括数据预处理、序列组装、组装之后的序列修补和序列的染色体定位方法进行了追踪和统计,同时介绍了测序技术和基因组组装方法在烟草基因组研究中的应用。 展开更多
关键词 第三代测序 基因组 组装 烟草
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福尔马林保存鱼类标本中大片段DNA的提取 被引量：8
11
作者 夏颖哲 张春光 +2 位作者 陈宜瑜 盛岩 孙悦华 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期485-491,共7页
从福尔马林保存的鱼类标本中获得高质量DNA是比较困难的。我们对前人的方法进行了如下改进:1)在标本的前处理过程中,通过长时间的缓冲液浸泡、短暂的加温、真空干燥来消除福尔马林对样品的影响;2)在样品消化过程中,加入相对过量的蛋白酶... 从福尔马林保存的鱼类标本中获得高质量DNA是比较困难的。我们对前人的方法进行了如下改进:1)在标本的前处理过程中,通过长时间的缓冲液浸泡、短暂的加温、真空干燥来消除福尔马林对样品的影响;2)在样品消化过程中,加入相对过量的蛋白酶K和还原剂;3)提取DNA后立即进行PCR反应,并增加反应的循环次数和提高退火温度。通过这些改进,我们成功地从福尔马林保存的鱼类标本中提取出了高质量DNA;通过对比不同方法(福尔马林、酒精及冰冻)处理过的标本的DNA测序结果,表明该方法是值得信赖的;标本从死亡到用福尔马林处理之间的时间延搁可能是影响所提取的DNA质量的重要因素。 展开更多
关键词 福尔马林 DNA 固定标本
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PEG定点修饰重组人睫状神经营养因子及其生物活性评价 被引量：7
12
作者 冯翠 王祺 +5 位作者 张纯 秦培勇 郑秀玉 王健 刘永东 苏志国 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期15-21,共7页
采用分子质量为40k Da的马来酰亚胺聚乙二醇(m PEG-MAL),对重组人睫状神经营养因子突变体CNTF-C17的第17位半胱氨酸巯基进行定点修饰,通过离子交换层析获得单修饰产物Mono-PEG-CNTF-C17,并对其结构及体内外活性进行评价。实验结果表明,... 采用分子质量为40k Da的马来酰亚胺聚乙二醇(m PEG-MAL),对重组人睫状神经营养因子突变体CNTF-C17的第17位半胱氨酸巯基进行定点修饰,通过离子交换层析获得单修饰产物Mono-PEG-CNTF-C17,并对其结构及体内外活性进行评价。实验结果表明,在p H 7.5的Tris-HCl缓冲液体中,蛋白质与修饰剂的为1∶3,4℃下反应12h,修饰率可达到90%以上,修饰混合物通过一步阴离子交换层析可获得纯度98%以上的单修饰产物。荧光光谱(FL)及圆二色(CD)图谱显示Mono-PEG-CNTF-C17与原蛋白二、三级结构一致。TF-1.CN5a.1细胞增殖活性检测表明,MonoPEG-CNTF-C17的比活达到了6.51×105IU/mg,体内循环半衰期相对原蛋白显著提高了30.3倍。该研究可为开发CNTF长效产品提供基础。 展开更多
关键词 马来酰亚胺聚乙二醇 CNTF-C^12 单修饰物 重组人睫状神经营养因子 分离纯化
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CVTree在454高通量测序分析菌群结构中的应用 被引量：10
13
作者 华蔚颖 徐昭 +3 位作者 张梦晖 李旻 张晨虹 赵立平 《中国微生态学杂志》 CAS CSCD 2010年第4期312-316,共5页
目的探究将基于短串频度的CVTree方法用于反映菌群结构的16S rRNA基因的454高通量测序数据分析的可行性,为快速分析高通量菌群结构数据提供新的方法。方法对一个四世同堂的中国家庭7名成员肠道菌群和不同基因型及饮食类型的小鼠肠道菌群... 目的探究将基于短串频度的CVTree方法用于反映菌群结构的16S rRNA基因的454高通量测序数据分析的可行性,为快速分析高通量菌群结构数据提供新的方法。方法对一个四世同堂的中国家庭7名成员肠道菌群和不同基因型及饮食类型的小鼠肠道菌群用454高通量方法获得16S rRNA基因的V3区的测序数据,用CVTree的方法进行菌群结构的比较分析。结果通过选取合适的短串长度,CVTree的方法能准确检测到各样本间的聚类关系,其结果与之前文献报道的基于Unifrac算法的结果相一致。结论CVTree能快速、有效地处理16S rRNA基因的454高通量测序数据,实现对不同菌群结构相似性的比较分析。 展开更多
关键词 CVTree 454高通量测序 菌群结构
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植物染色体倍性鉴定方法研究进展 被引量：47
14
作者 陶抵辉 李小红 +3 位作者 王利群 周杰良 陈涌 霍稳根 《生命科学研究》 CAS CSCD 2009年第5期453-458,共6页
对植物染色体倍性的间接、直接鉴定方法进行了综述,并对各种方法的优越性和不足之处进行了评述.指出植物染色体倍性鉴定应因陋就简,多采用早期鉴定和破坏性较小的鉴定方法,同时各种鉴定方法综合运用,对不同植物采用不同的鉴定办法,为育... 对植物染色体倍性的间接、直接鉴定方法进行了综述,并对各种方法的优越性和不足之处进行了评述.指出植物染色体倍性鉴定应因陋就简,多采用早期鉴定和破坏性较小的鉴定方法,同时各种鉴定方法综合运用,对不同植物采用不同的鉴定办法,为育种实践服务. 展开更多
关键词 染色体:倍性鉴定 流式细胞仪
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可视荧光硅橡胶标志用于西伯利亚鲟幼鱼标志的初步评价 被引量：4
15
作者 张涛 庄平 +7 位作者 章龙珍 刘鉴毅 赵峰 高露姣 冯广朋 黄晓荣 闫文罡 田美平 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期639-641,共3页
在渔业和水产养殖的研究中,常采用标记（Marking） 或标志（Tagging）方法来区分不同的个体或种群.标志技术在鱼类个体生长、存活和种群补充和生产力研究中广泛应用,标志回捕（Mark recapture）已成为评估渔业资源状况和洄游习性研究中... 在渔业和水产养殖的研究中,常采用标记（Marking） 或标志（Tagging）方法来区分不同的个体或种群.标志技术在鱼类个体生长、存活和种群补充和生产力研究中广泛应用,标志回捕（Mark recapture）已成为评估渔业资源状况和洄游习性研究中的重要研究手段.此外,标志技术在选择育种上也得到了应用,用以快速有效地区分不同选育群体.如何提高标志榆测率和保持率,以及怎样 减少标志操作对研究对象生长和存活影响,是研究和选择标志方法时应考虑的主要问题. 展开更多
关键词 西伯利亚鲟 荧光硅橡胶标志 生长 存活 标志保持率
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南极放线菌N-1产抑菌成分的响应面优化 被引量：4
16
作者 倪孟祥 毕启瑞 +1 位作者 郭润妮 顾觉奋 《中国海洋药物》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期11-20,共10页
目的本研究旨在对南极放线菌N-1的发酵工艺进行优化,以提高发酵液中抑菌成分的活性。方法本实验以抑菌活性(琼脂扩散法)为指导,对该菌的碳源、氮源、无机盐等培养基组成进行单因素考察,以期得到显著性影响因素,然后利用Plackett-Burman... 目的本研究旨在对南极放线菌N-1的发酵工艺进行优化,以提高发酵液中抑菌成分的活性。方法本实验以抑菌活性(琼脂扩散法)为指导,对该菌的碳源、氮源、无机盐等培养基组成进行单因素考察,以期得到显著性影响因素,然后利用Plackett-Burman试验设计,最陡爬坡设计以及Box-Behnken组合设计对显著性影响因素进一步进行优化。结果通过这些条件的优化,最终得到南极放线菌N-1的最佳发酵条件为小米12.68g/L、NaNO36.67g/L、MgSO4.7H2O 0.31g/L、FeSO4.7H2O 0.03g/L、黄豆粉7.50g/L,CaCO30.60g/L,NaCl 20g/L,pH=6.0,温度28℃,转速200r.min-1。与优化前相比,发酵液的活性提高了5.94倍;菌体湿重提高了1.55倍。结论利用响应面法(RSM)对南极放线菌N-1的发酵条件进行优化之后,提高了该菌的菌体密度的同时,更加提高了发酵液中抑菌活性物质的抑菌能力,为活性天然产物的发现奠定了较好的基础。 展开更多
关键词 南极放线菌 N-1 Plackett—Burman design 响应面法(RSM) BOX-BEHNKEN设计 优化
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超声辅助热乙醇提取法测定浮游植物叶绿素a的方法优化 被引量：26
17
作者 梁兴飞 郭宗楼 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期856-861,共6页
浮游植物长期以来一直被作为水质的指标生物,而浮游植物的种群生物量（Phytoplankton biomass）是水生态系统的一个重要指标。叶绿素a存在于所有浮游植物体内,占细胞干重的1%-2%,
关键词 超声辅助 热乙醇 叶绿素A 方法优化
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利用生物信息学资源设计简并引物 被引量：8
18
作者 王少峡 陈丽媛 +1 位作者 张竞秋 王振英 《天津师范大学学报（自然科学版）》 CAS 2006年第2期26-29,共4页
根据已知序列设计简并引物以分离基因家族内的其他新成员,是发现新基因的一条捷径.介绍了利用生物信息学资源设计简并引物的各个步骤:利用在线服务滚动式搜索家族所有成员序列;对家族成员序列进行多序列对比;确定合适的保守区域;利用专... 根据已知序列设计简并引物以分离基因家族内的其他新成员,是发现新基因的一条捷径.介绍了利用生物信息学资源设计简并引物的各个步骤:利用在线服务滚动式搜索家族所有成员序列;对家族成员序列进行多序列对比;确定合适的保守区域;利用专业软件设计引物;并对引物进行修饰等. 展开更多
关键词 生物信息学 简并引物 基因家族
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以主要流行EV71 VP1基因高度保守区为靶点的TaqMan荧光定量PCR检测方法的建立 被引量：4
19
作者 胡晓星 彭杰 +3 位作者 冯悦 刘丽 张阿梅 夏雪山 《生命科学研究》 CAS CSCD 2016年第3期189-195,共7页
在我国,肠道病毒71型(enterovirus 71,EV71)C4型是引起手足口病的主要流行基因型。为建立EV71C4型TaqMan荧光定量PCR检测方法,在C4型EV71VP1基因的高保守区,设计合成引物和TaqMan探针,将包含此目的区段的基因片段克隆到pcDNA3.1载体中,... 在我国,肠道病毒71型(enterovirus 71,EV71)C4型是引起手足口病的主要流行基因型。为建立EV71C4型TaqMan荧光定量PCR检测方法,在C4型EV71VP1基因的高保守区,设计合成引物和TaqMan探针,将包含此目的区段的基因片段克隆到pcDNA3.1载体中,通过体外转录获得标准品,并以梯度稀释的标准品为模板建立工作曲线,进而在优化反应条件的基础上建立TaqMan荧光实时定量PCR检测方法。实验中,所设计引物、探针的高度保守性保证了C4型EV71的高效扩增。经反应条件优化,引物和探针的最佳工作浓度分别为300 nmol/L和200 nmol/L,在1×10~301×10~3拷贝数检测范围内具有良好的线性关系(R^2=1),灵敏度可达到10~2 copies/μL。通过对该方法进行检验发现,批间和组间重复实验的变异系数均小于0.5%,且该方法对柯萨奇A16(coxsackievirus A16,CA16)柯萨奇B1(coxsackievirus B1,CB1)人轮状病毒(human rotavirus,HRV)单纯疱疹病毒2型(herpes Simplex virus type 2,HSV-2)均无交叉反应,对6份EV71阳性样本检出率为100%。以上数据表明,文中建立的TaqMan荧光定量PCR方法可为我国主要流行C4型EV71感染的快速诊断及疾病监控提供有效途径。 展开更多
关键词 肠道病毒71型 VP1基因 高保守区 TAQMAN探针 荧光定量PCR 检测
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脂肪酶活力测定中终止反应方法的比较分析 被引量：7
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作者 滕昆 张吉福 +2 位作者 牛福星 杜丽琴 韦宇拓 《广西科学》 CAS 2014年第2期115-118,共4页
【目的】寻找一种准确有效的脂肪酶活力测定中的终止反应方法,以进行脂肪酶酶学性质研究。【方法】比较分析前人研究脂肪酶常用的终止方法(无水乙醇法、EDTA法、三氯乙酸法、碳酸钠法、沸水浴法)对酶活力的抑制效果和吸光值的稳定性。... 【目的】寻找一种准确有效的脂肪酶活力测定中的终止反应方法,以进行脂肪酶酶学性质研究。【方法】比较分析前人研究脂肪酶常用的终止方法(无水乙醇法、EDTA法、三氯乙酸法、碳酸钠法、沸水浴法)对酶活力的抑制效果和吸光值的稳定性。【结果】无水乙醇法对酶活的抑制率为97.56%,终止反应后5min内净吸光值减少5%;EDTA法对酶活抑制率为32.94%,终止反应后10min内净吸光值增加5%;三氯乙酸法对酶活的抑制率为99.46%,终止反应后10min内净吸光值增加了0.47%;碳酸钠法对酶活抑制率为76.44%,终止反应后10min内净吸光值增加了0.53%;沸水浴法对酶活抑制率为99.51%,终止反应后10min内净吸光值减少0.77%,但沸水浴会导致剩余底物的大量分解。【结论】三氯乙酸法是一种准确有效的终止脂肪酶活力测定反应的方法,可用于脂肪酶酶学性质的研究。 展开更多
关键词 脂肪酶 酶活测定 终止反应 抑制效果
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