计算生物学前沿进展及其应用态势分析 被引量：1

1

作者 江源 袁银池 +3 位作者 李虹 刘樱霞 江洪波 毛开云 《生命科学》 2025年第1期26-36,共11页

计算思维与技术已成为生命科学研究的关键因素,促进了计算机科学与生物学间的融合。计算生物学推动科学家采用新方法建模、分析及解释,利用计算工具深化科学知识。计算生物学研究从基因调控解码到细胞信号转导理解,有望引领开创性发现。... 计算思维与技术已成为生命科学研究的关键因素,促进了计算机科学与生物学间的融合。计算生物学推动科学家采用新方法建模、分析及解释,利用计算工具深化科学知识。计算生物学研究从基因调控解码到细胞信号转导理解,有望引领开创性发现。2024年,计算生物学在分子(基因组、RNA、蛋白质)模型、细胞图谱和空间组学等领域获得了很大突破。同时,研发投入的持续增加和个性化药物需求的不断攀升,共同推动了相关市场的蓬勃发展。然而,当前的计算生物学尚未构建起一个相对完备的研究体系。众多计算生物学的方法和理论尚待完善,面对更为复杂的生物学问题,科学家们仍在寻找合适的计算手段和方法以开展深入研究。 展开更多

关键词 计算生物学 人工智能 分子模型 细胞图谱 空间组学

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基于改进CRITIC-云模型法的机场鸟击风险评价 被引量：3

2

作者 刘振江 王正 +3 位作者 曹玉洁 蔡姝崴 陈伟 路凯丽 《生态环境学报》 北大核心 2025年第1期135-144,共10页

选取我国东部沿海某机场周围8km范围作为调查区域,根据土地类型进行样线与样点调查法,全年记录到140种鸟类数据。通过对影响鸟击的显性条件和隐性条件分析,确定鸟类集群数量、平均体质量、飞行高度、网捕数量、飞行速度等5个指标为风险... 选取我国东部沿海某机场周围8km范围作为调查区域,根据土地类型进行样线与样点调查法,全年记录到140种鸟类数据。通过对影响鸟击的显性条件和隐性条件分析,确定鸟类集群数量、平均体质量、飞行高度、网捕数量、飞行速度等5个指标为风险评价指标,建立鸟击风险评价指标体系,借助各指标数据特征以区间形式制定等级划分标准。针对鸟情数据冗余与极端值情况,对传统的CRITIC法和云模型法进行改进,得到改进CRITIC-云模型法,并运用到机场鸟击风险评价中。结合鸟类指标数据与传统CRITIC-云模型法和传统CRITIC-云模型L法(传统云模型法)评价结果进行对比分析,发现改进CRITIC-云模型法避免了模型受单个等级区间的影响,能够全面性、综合性评价鸟类的风险等级,评价结果更加准确,与鸟击风险评价方面适配性更高。确定风险评价等级IV级与V级的鸟类为高危鸟种,共26种,其中1种为国家一级重点野生保护动物,5种为国家二级重点野生保护动物。通过对高危鸟种活动环境进行分析,将其归纳为海洋活动鸟类、海洋与陆地活动鸟类、陆地活动鸟类,分别从鸟类性状的生活习性、繁殖特征、生物学特性等3个方面进行阐述,结合机场周边环境制定有效的防范措施。 展开更多

关键词 鸟击风险评价 改进CRITIC法 云模型 最大隶属度 高危鸟种 防范措施

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基于随机森林预测蛋白质变体折叠速率

3

作者 张非凡 张颖 +1 位作者 马莹雪 吕军 《内蒙古大学学报(自然科学版)》 2025年第2期174-186,共13页

蛋白质单点突变引起的折叠速率变化的准确预测,对于探索序列如何编码折叠这一蛋白质折叠的基本问题有积极意义。搜集了1329个由实验测定的蛋白质单点突变体折叠速率数据,并采用AlphaFold2预测了所有变体的结构数据。为了比较不同模型之... 蛋白质单点突变引起的折叠速率变化的准确预测,对于探索序列如何编码折叠这一蛋白质折叠的基本问题有积极意义。搜集了1329个由实验测定的蛋白质单点突变体折叠速率数据,并采用AlphaFold2预测了所有变体的结构数据。为了比较不同模型之间的预测性能,选出其中190个变体作为盲测集,其余作为训练集。按照突变位点所处一级结构位置(N端、中间和C端)、二级结构位置(螺旋、股和其他)以及三级结构位置(暴露、埋藏和部分埋藏)的不同,将变体蛋白分别归类到27个类别中。提取了残基的物化性质、取代得分以及接触势等1325个序列和结构特征。首先基于随机森林算法在每个类别的训练集上对特征进行重要性排序,并分别选择最优的3个特征,进一步将这些选出的特征再次输入到随机森林回归模型对变体相对于野生型的折叠速率改变量进行预测。结果表明,在盲测集上预测值与实验值之间的皮尔逊相关系数为0.403,平均绝对误差为0.613,优于现有的最好模型。 展开更多

关键词 蛋白质单点突变 折叠速率 氨基酸性质 结构性质 随机森林算法

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参与天然态相互作用的关键残基总数决定蛋白质折叠速率

4

作者 刘洋 王坤 +1 位作者 张颖 吕军 《内蒙古大学学报(自然科学版)》 2025年第4期389-395,共7页

理解影响蛋白质折叠速率的因素对于阐明蛋白质折叠的潜在机制至关重要。提出了一种新方法来发现影响蛋白质折叠速率的关键因素。该方法通过定义“有效长度”这一参数,来量化特定结构类蛋白质天然态中参与非局域相互作用的关键残基数量... 理解影响蛋白质折叠速率的因素对于阐明蛋白质折叠的潜在机制至关重要。提出了一种新方法来发现影响蛋白质折叠速率的关键因素。该方法通过定义“有效长度”这一参数,来量化特定结构类蛋白质天然态中参与非局域相互作用的关键残基数量。通过在标准数据集上的验证,发现有效长度与蛋白质折叠速率之间存在显著的负相关性(Pearson相关系数r=-0.91)。基于有效长度的一元线性回归模型达到了迄今为止对蛋白质折叠速率的最高预测准确度。结果表明,蛋白质折叠速率主要受限于少数关键残基参与的非局域相互作用的形成。研究结果不仅为蛋白质折叠动力学研究提供了新的见解,也为蛋白质工程和设计提供了重要的理论指导。 展开更多

关键词 蛋白质折叠速率 非局域相互作用 关键残基 相关性 预测

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积雪草提取物的植物化学成分及其在植物自身防御机制中的生态学功能探析

5

作者 李志凌 白静 《中文科技期刊数据库(全文版)自然科学》 2025年第12期189-192,共4页

本文综述了其提取物中各类化学成分的结构特征及其含量影响因素,并系统分析了其在植物自身防御机制中的作用,包括抗病原微生物、增强抗逆性、信号传导及调控共生微生物等。进一步探讨了积雪草提取物在土壤养分循环、杂草抑制、食草动物... 本文综述了其提取物中各类化学成分的结构特征及其含量影响因素,并系统分析了其在植物自身防御机制中的作用,包括抗病原微生物、增强抗逆性、信号传导及调控共生微生物等。进一步探讨了积雪草提取物在土壤养分循环、杂草抑制、食草动物调节等方面的生态学功能。研究表明,积雪草提取物在维持生态系统稳定和促进绿色农业发展中具有重要应用价值。 展开更多

关键词 积雪草 三萜皂苷 植物化学成分 生态功能

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大豆干旱胁迫下miRNA与mRNA荧光定量PCR内参基因的筛选 被引量：15

6

作者 刘伟灿 王骐 +10 位作者 周永刚 邓宇 赵利旦 王兴超 靳京 董园园 王南 王法微 陈欢 李晓薇 李海燕 《西北农林科技大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2016年第2期61-67,共7页

【目的】通过分析大豆中候选内参基因的稳定性,筛选大豆干旱胁迫处理条件下适合成熟miRNA、前体miRNA及靶基因mRNA荧光定量PCR的内参基因。【方法】以干旱胁迫处理后的大豆根和叶片为材料,选择了5个成熟miRNAs和5个传统的看家基因作为... 【目的】通过分析大豆中候选内参基因的稳定性,筛选大豆干旱胁迫处理条件下适合成熟miRNA、前体miRNA及靶基因mRNA荧光定量PCR的内参基因。【方法】以干旱胁迫处理后的大豆根和叶片为材料,选择了5个成熟miRNAs和5个传统的看家基因作为候选内参基因,利用GeNorm和NormFinder程序对10个候选内参基因的稳定性进行评价。【结果】在干旱胁迫下,大豆根、叶片中,成熟miRNA定量最合适的单个内参基因分别为miR156a、miR167a,最合适的内参基因组合分别为miR1520d与miR156a、miR1520d与miR167a。前体miRNA和靶基因mRNA定量最合适的单个内参基因分别为Fbox、Act11,最合适的内参基因组合分别为Act11与Fbox、Act11与EF1A。【结论】筛选出大豆干旱胁迫条件下成熟miRNA、前体miRNA及其对应靶基因mRNA的荧光定量PCR的内参基因,最稳定内参基因数目为2个。 展开更多

关键词 大豆 干旱胁迫 荧光定量PCR 内参基因 成熟miRNA 前体miRNA 靶基因mRNA

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分光光度法测定蒙古栎叶中多酚的含量 被引量：13

7

作者 张国友 唐玲 +2 位作者 陈玮 何兴元 黄伟 《中国科学院研究生院学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期319-322,共4页

以没食子酸为标准品,使用福林酚试剂(FC),通过分光光度法,对蒙古栎树叶中植物多酚含量进行了测定.首先从方法的稳定性、线性关系、精确性和准确性角度,对FC法进行了调整,确定了以没食子酸为标准的最佳反应条件.结果表明,最佳反应条件为0... 以没食子酸为标准品,使用福林酚试剂(FC),通过分光光度法,对蒙古栎树叶中植物多酚含量进行了测定.首先从方法的稳定性、线性关系、精确性和准确性角度,对FC法进行了调整,确定了以没食子酸为标准的最佳反应条件.结果表明,最佳反应条件为0.15mL FC试剂(1mol/L),0.15mL 10%体积分数的Na2CO3,25℃反应80min后于760nm处测吸光值.使用调整后的方法测得结果为:蒙古栎叶中总酚含量为6.39%,RSD为1.90%.方法操作简单,结果重现性好,可用来测定蒙古栎叶中总酚的含量. 展开更多

关键词 蒙古栎 多酚 福林酚法 分光光度法

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生物计量及其在检验检疫中的应用研究 被引量：8

8

作者 俞晓平 叶子弘 +6 位作者 蒋家新 伍义行 董胜张 王为民 卢秀莲 张明洲 黄光荣 《中国计量学院学报》 2008年第4期289-295,共7页

随着现代生物技术的发展和国际贸易的加剧,以生物检测标准和基准比对等为基础的生物计量和相关技术成为提高国际贸易有效性和安全性的重要手段.文章综述了生物计量的国内外研究进展,同时阐述了生物计量的意义、定义、存在的问题和应用范... 随着现代生物技术的发展和国际贸易的加剧,以生物检测标准和基准比对等为基础的生物计量和相关技术成为提高国际贸易有效性和安全性的重要手段.文章综述了生物计量的国内外研究进展,同时阐述了生物计量的意义、定义、存在的问题和应用范围,提出了生物计量今后发展的方向. 展开更多

关键词 生物计量 基标准 标准物质 检测方法 检验检疫

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大豆Pre-miRNAs作为内参基因在盐碱胁迫下的表达稳定性分析 被引量：4

9

作者 周永刚 王骐 +11 位作者 刘伟灿 邓宇 李晰亮 靳京 邓文波 赵利旦 王兴超 王南 王法微 李晓薇 董园园 李海燕 《西北农林科技大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2016年第1期61-67,共7页

【目的】对比大豆Pre-miRNAs候选内参基因和传统内参基因的表达稳定性,筛选出适合盐、碱胁迫条件下RT-qPCR分析的最稳定内参基因。【方法】选用了6个保守的Pre-miRNAs基因和4个常规的内参基因作为候选内参基因,通过RT-qPCR的方法,利用Ge... 【目的】对比大豆Pre-miRNAs候选内参基因和传统内参基因的表达稳定性,筛选出适合盐、碱胁迫条件下RT-qPCR分析的最稳定内参基因。【方法】选用了6个保守的Pre-miRNAs基因和4个常规的内参基因作为候选内参基因,通过RT-qPCR的方法,利用GeNorm和NormFinder软件,评价了10个候选内参基因在大豆盐、碱胁迫条件下的稳定性。【结果】大豆盐胁迫下,叶中表达最稳定的基因组合是Pre-miR166和Pre-miR172,表达最稳定的单一基因是FboX;根中表达最稳定的基因组合是Act11和EF1A,表达最稳定的单一基因是Act11。大豆碱胁迫下,叶中表达最稳定的基因组合是Pre-miR393和Pre-miR172,表达最稳定的单一基因是Pre-miR393;根中表达最稳定的基因组合是Act11和60S,表达最稳定的单一基因是Pre-miR172。【结论】大豆Pre-miRNAs可以与传统内参基因一样作为内参定量目的基因。 展开更多

关键词 大豆 盐胁迫 碱胁迫 荧光定量PCR Pre-miRNAs(前体miRNAs) 内参基因

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化学模式识别在原产地域产品保护中的应用 被引量：3

10

作者 俞晓平 徐路 +2 位作者 卢秀莲 叶子弘 林欣大 《中国计量学院学报》 2009年第1期15-21,共7页

介绍了常用的化学模式识别方法,并且对化学模式识别在原产地域产品保护中的应用进行了综述.最后展望了原产地域产品表征和化学模式识别模型优化的发展趋势.

关键词 化学模式识别 原产地域产品 模型优化

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2023年计算生物学科技发展态势 被引量：2

11

作者 毛开云 江源 +3 位作者 袁银池 张华 周丽萍 江洪波 《生命科学》 CSCD 2024年第1期11-20,共10页

计算生物学借助大量生物数据的模拟与分析,探寻生物体及生态系统的结构和功能,从而加深对生物体的认识与理解。得益于算法的持续优化和计算机性能的提高,计算生物学逐步克服了大量数据处理和分析的难题。2023年,计算生物学在基因组学、... 计算生物学借助大量生物数据的模拟与分析,探寻生物体及生态系统的结构和功能,从而加深对生物体的认识与理解。得益于算法的持续优化和计算机性能的提高,计算生物学逐步克服了大量数据处理和分析的难题。2023年,计算生物学在基因组学、蛋白质结构解析与预测、药物研发、疾病诊断与预测等多个应用领域取得突破性进展。随着技术的进步和数据的积累,计算生物学在未来的发展前景非常广阔,但仍存在数据质量问题、算法和模型复杂度、实验验证的难度、多学科交叉融合的挑战,以及伦理和社会问题等诸多难点需突破。 展开更多

关键词 计算生物学 深度学习 人工智能 蛋白质结构

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血清白蛋白序列中的相似氨基酸突变特点分析 被引量：3

12

作者 陆会宁 齐燕姣 +3 位作者 冯树华 李世玺 赵娅敏 金能智 《生物信息学》 2015年第3期179-185,共7页

血清白蛋白是必不可少的生命物质,在生命运动和发展延续中起着重要的作用。它不仅能维持正常的血浆渗透压,最重要的是能够储存和运输众多的内源性和外源性物质。本文利用生物信息学的方法分析了几种不同物种的血清白蛋白的结构信息和疏... 血清白蛋白是必不可少的生命物质,在生命运动和发展延续中起着重要的作用。它不仅能维持正常的血浆渗透压,最重要的是能够储存和运输众多的内源性和外源性物质。本文利用生物信息学的方法分析了几种不同物种的血清白蛋白的结构信息和疏水性特点,研究表明人、牛、猴、兔、狼、猫的血清白蛋白序列均属于亲水性蛋白质,在100 bp以内的疏水性值差别比较明显。通过对血清白蛋白进行多序列比对分析,发现兔血清白蛋白的氨基酸突变的数目是最多的。在这几种血清白蛋白序列中,氨基酸突变更容易发生在结构相似、极性相似和能量比较接近的氨基酸之间,如D和L、E和D。对于人血清白蛋白来说,从疏水性的丙氨酸A到酸性的谷氨酸E的突变比较多,使得人血清白蛋白在进化过程中的亲水性增强,是个很好的储存和运输小分子的载体。这些基于生物信息学方面的血清白蛋白的突变及其进化关系的研究,为进一步研究药物与血清白蛋白的相互作用在其他物种中表现和特点提供了良好的基础。 展开更多

关键词 血清白蛋白 序列比对 突变 疏水性

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Magnetospirillum sp.AMB-1菌株培养及磁小体形成条件的研究 被引量：1

13

作者 孙忆晨 陶玉贵 +2 位作者 魏胜华 曹宁 葛飞 《安徽工程大学学报》 CAS 2012年第3期13-16,共4页

本文通过改变基础螺菌培养基中琥珀酸添加量、氮源、铁源种类及含量以及培养条件,观察各因素对Magnetospirillum sp.AMB-1生长量及磁小体形成量的影响.单因素实验结果表明:其最适生长温度为30℃,pH为6.9,250mL锥形瓶中装液量为70%,在添... 本文通过改变基础螺菌培养基中琥珀酸添加量、氮源、铁源种类及含量以及培养条件,观察各因素对Magnetospirillum sp.AMB-1生长量及磁小体形成量的影响.单因素实验结果表明:其最适生长温度为30℃,pH为6.9,250mL锥形瓶中装液量为70%,在添加0.80g琥珀酸、并以0.12g NaNO3为氮源、2.0μmol/L奎尼酸铁为铁源的基础螺菌培养基中按2%的接种量,静置培养4d后,趋磁细菌的吸光度可达0.853,磁小体的形成量Cmag值为1.673. 展开更多

关键词 趋磁细菌 磁小体 培养

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基于双核酸频率分布特征的细菌亲缘关系定量分析 被引量：1

14

作者 张宇镭 赵立平 《中国微生态学杂志》 CAS CSCD 2006年第4期261-263,共3页

目的采用生物信息学方法定量分析细菌的亲缘关系。方法抽取全基因组核酸序列的双核苷酸频率特征向量,表征数字特征。采用Pearson相关系数分析特征向量之间的距离。结果以119个细菌的全基因组核酸序列为研究对象,两两比对的结果为:越是... 目的采用生物信息学方法定量分析细菌的亲缘关系。方法抽取全基因组核酸序列的双核苷酸频率特征向量,表征数字特征。采用Pearson相关系数分析特征向量之间的距离。结果以119个细菌的全基因组核酸序列为研究对象,两两比对的结果为:越是相近的物种,Pearson相关系数越大,PCC距离越小。结论该方法对细菌亲缘关系的定量描述做了有益的探索。 展开更多

关键词 Pearson相关性系数 双核酸频率特征向量 基因组特征

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阿托伐他汀对心肌肥大的抑制作用及FoxO1表达的影响 被引量：1

15

作者 刘薇 郑强菘 郭万刚 《西部医学》 2012年第3期453-455,共3页

目的探讨阿托伐他汀(atorvastatin)对血管紧张素Ⅱ(AngⅡ)诱导的肥大心肌细胞的抑制作用及对转录因子FoxO1表达的影响。方法将H9C2细胞分为3组,对照组:未给予任何干预;心肌肥大组:给予AngⅡ(10-7 mol/L)刺激细胞;阿托伐他汀组:预先给予a... 目的探讨阿托伐他汀(atorvastatin)对血管紧张素Ⅱ(AngⅡ)诱导的肥大心肌细胞的抑制作用及对转录因子FoxO1表达的影响。方法将H9C2细胞分为3组,对照组:未给予任何干预;心肌肥大组:给予AngⅡ(10-7 mol/L)刺激细胞;阿托伐他汀组:预先给予atorvastatin(10-5 mol/L),30min后AngⅡ(10-7 mol/L)刺激细胞。western-blotand real time PCR检测H9C2细胞FoxO1蛋白及mRNA含量,脑钠肽(brain natriuretic pepide,BNP)作为判断心肌肥大的指标。结果 AngⅡ诱导心肌细胞肥大后FoxO1表达较正常心肌细胞明显降低(P<0.05),而给予阿托伐他汀干预的肥大心肌细胞其FoxO1表达较肥大心肌明显升高(P<0.05)。结论阿托伐他汀可能通过上调FoxO1表达,从而抑制心肌肥大。 展开更多

关键词 阿托伐他汀 血管紧张素Ⅱ 心肌肥大 FOXO1

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生物计量与标准物质:分析结果有效一致的保障 被引量：3

16

作者 李亮 《生物技术进展》 2020年第6期F0002-F0002,共1页

2006年,联合国工业发展组织(United Nations Industrial Development Organization,UNIDO)和国际标准化组织(International Organization for Standardization,ISO)正式提出国家质量基础设施(national quality infrastructure,NQI)的概... 2006年,联合国工业发展组织(United Nations Industrial Development Organization,UNIDO)和国际标准化组织(International Organization for Standardization,ISO)正式提出国家质量基础设施(national quality infrastructure,NQI)的概念,将计量、标准化、合格评定(主要包含认证认可、检验检测)并称为国家质量基础的三大支柱。 展开更多

关键词 UNIDO 国际标准化组织 三大支柱 合格评定 检验检测 认证认可

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计算变异学创立背景及其用途(英文) 被引量：5

17

作者 严少敏 吴光 《广西科学院学报》 2010年第2期130-139,共10页

为了克服生物信息学和计算生物学中字母或数字不受序列长度、氨基酸组成和位置、相邻氨基酸影响的缺陷,根据自然界普遍存在的随机性原理,创立计算变异学。计算变异学用氨基酸对可预测性、氨基酸分布概率和变异概率3种方法量化整个蛋白... 为了克服生物信息学和计算生物学中字母或数字不受序列长度、氨基酸组成和位置、相邻氨基酸影响的缺陷,根据自然界普遍存在的随机性原理,创立计算变异学。计算变异学用氨基酸对可预测性、氨基酸分布概率和变异概率3种方法量化整个蛋白质及每个氨基酸,用活的、动态的测量指标量化分析蛋白质。计算变异学方法可以应用于研究蛋白质进化、遗传病定量诊断,分析蛋白质结构与功能、药物设计和病毒变异预测等领域。 展开更多

关键词 氨基酸对可预测性 氨基酸分布概率 氨基酸变异概率 蛋白质 计算变异学

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基于气体定律的模拟肺的数学模型 被引量：3

18

作者 陈夫华 蔡永铭 陈华艳 《数理医药学杂志》 2011年第2期127-129,共3页

模拟肺是使用呼吸机的必备用物,用来检测呼吸机功能及调节参数。基于气体定律和肺的顺应性建立模拟肺的数学模型,得出肺的一些相关参数,包括内部压强以及体积的变化方程,为模拟肺的压强和体积的监测提供理论依据,可以更好地帮助临床测... 模拟肺是使用呼吸机的必备用物,用来检测呼吸机功能及调节参数。基于气体定律和肺的顺应性建立模拟肺的数学模型,得出肺的一些相关参数,包括内部压强以及体积的变化方程,为模拟肺的压强和体积的监测提供理论依据,可以更好地帮助临床测试肺功能,检测呼吸机功能,及时发现异常并进行处理。 展开更多

关键词 气体定律 模拟肺 顺应性

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生物体的比例效应问题

19

作者 郑连斌 栗淑媛 《生物学通报》 北大核心 2003年第8期18-20,共3页

从比例效应的视角分析了生物界中常见的一些现象。

关键词 生物体 比例效应 体表面积 体积

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细胞培养液中细菌、真菌多重荧光定量PCR检测方法的建立及验证 被引量：4

20

作者 孙锈锈 徐逸梦 +2 位作者 周宇荀 李凯 肖君华 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2024年第3期335-342,共8页

目的建立细胞培养液中常见细菌和真菌的多重荧光定量PCR检测方法,并进行验证。方法选取金黄色葡萄球菌NUC基因、生孢梭菌COLA基因和白色念珠菌ITS-2区段基因,分别设计1组引物及探针,并以辣椒UBI3基因作为外标基因,建立金黄色葡萄球菌、... 目的建立细胞培养液中常见细菌和真菌的多重荧光定量PCR检测方法,并进行验证。方法选取金黄色葡萄球菌NUC基因、生孢梭菌COLA基因和白色念珠菌ITS-2区段基因,分别设计1组引物及探针,并以辣椒UBI3基因作为外标基因,建立金黄色葡萄球菌、生孢梭菌和外标基因的三重反应体系及白色念珠菌和外标基因的两重反应体系。验证方法的引物特异性、线性范围、检测限、专属性、抗干扰性和精密性。采用建立的方法对100份293T细胞培养液样本进行检测,同时与普通PCR法进行比较。结果3对引物于不同退火温度(56、57、58、59℃)下均可扩增出对应3种菌约100 bp的特异性基因条带,大小与预期相符;3种菌标准品质粒在5.80×10^(6)~5.80×10^(2)copies/μL范围内,与Ct均呈良好的线性关系,标准曲线方程分别为:Y=-3.373 X+37.48、Y=-3.557X+36.59、Y=-3.536 X+39.78,R^(2)均>0.99,扩增效率均在90%~110%范围内;3种菌的检测限均为101CFU/mL;3种菌的引物及探针在易发生交叉反应的6种细胞基因组DNA上无特异性扩增;293T细胞、酵母菌、大肠埃希菌、支原体的基因组DNA对检测无影响;重复性和中间精密性验证CV均<15%。100份细胞培养液样本中,检出14份阳性及86份阴性样本,随机挑选的3个阳性和2个阴性样本普通PCR法检测结果与建立的方法一致。结论建立的用于检测细胞培养液中细菌、真菌的多重荧光定量PCR法具有良好的专属性、抗干扰性和精密性,且简便易操作、成本低、灵敏度高,可快速检测细胞培养过程中的污染情况。 展开更多

关键词 细胞培养液 细菌 真菌 多重荧光定量PCR

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