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单参数法估算取代苯胺的pK_b值 被引量:4
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作者 范强 闫华 +3 位作者 金燕仙 罗海霞 饶卫东 钟爱国 《当代化工》 CAS 2014年第2期165-167,共3页
用密度泛函理论方法 DFT/B3LYP与基组6-31+G(d,p),优化了15种苯胺和取代苯胺分子结构,发现苯环氨基上氢原子的自然原子轨道电荷(NBO)值与其实验碱式电离平衡常数(pKb)值之间具有良好的线性相关性,普遍比其原子核静电势电荷(ESP)值拟合较... 用密度泛函理论方法 DFT/B3LYP与基组6-31+G(d,p),优化了15种苯胺和取代苯胺分子结构,发现苯环氨基上氢原子的自然原子轨道电荷(NBO)值与其实验碱式电离平衡常数(pKb)值之间具有良好的线性相关性,普遍比其原子核静电势电荷(ESP)值拟合较好.计算了17种未知pKb值的取代苯胺化合物的NBO参数,代入拟合出的线性参数方程,发现与流行软件ACD-Labs 6.0检索得到的取代苯胺的pKb实验值非常接近,相对误差(SD)小于±0.1%。 展开更多
关键词 密度泛函理论 自然原子轨道电荷 ACD-Labs 6 0比较分析 取代苯胺 pKb值 COMPARATIVE analysis with ACD-Labs 6 0
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用自然原子轨道电荷估测取代吡啶的pK_a值 被引量:4
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作者 汪志鹏 吴俊勇 +3 位作者 陈丹 许威蕙 郭亚妮 钟爱国 《当代化工》 CAS 2014年第2期162-164,共3页
使用密度泛函理论(DFT)和B3LYP/3-21G基组,优化了24种取代吡啶类分子结构,发现吡啶环上氮原子的自然原子轨道电荷(NBO)值与其实验pKa值之间存在良好的线性关系(R=-0.623 23),比其原子核静电势电荷(ESP)值拟合的好。计算了12种未知pKa值... 使用密度泛函理论(DFT)和B3LYP/3-21G基组,优化了24种取代吡啶类分子结构,发现吡啶环上氮原子的自然原子轨道电荷(NBO)值与其实验pKa值之间存在良好的线性关系(R=-0.623 23),比其原子核静电势电荷(ESP)值拟合的好。计算了12种未知pKa值的多取代吡啶化合物的NBO参数,代入拟合出的线性参数方程,发现与流行软件ACD Lab 6.0预测得到的多取代吡啶的pKa值非常接近,最大偏差ΔpKa小于±0.07,新方法可以估测到pKa值小数点后3位数。 展开更多
关键词 密度泛函理论方法 取代吡啶 自然原子轨道电荷
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基于静电势电荷的抗击埃博拉病毒新药物法匹拉韦及其衍生物水溶解度logS值预测 被引量:2
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作者 裴诗恩 黄颖琦 +5 位作者 吴淑曼 彭自珍 苏凌峰 刘喜灵 陈晗剑 钟爱国 《当代化工》 CAS 2017年第1期31-34,共4页
运用分子中的原子理论(AIM),探讨了以法匹拉韦分子羰基氧原子值为目标,测试了不同基组和泛函选择的依赖性。然后用密度泛函理论(DFT B3LYP)和6-31+G(d,p)基组,优化了20种法匹拉韦及其常见衍生物的分子结构,分别得到11号羰基氧的密立根电... 运用分子中的原子理论(AIM),探讨了以法匹拉韦分子羰基氧原子值为目标,测试了不同基组和泛函选择的依赖性。然后用密度泛函理论(DFT B3LYP)和6-31+G(d,p)基组,优化了20种法匹拉韦及其常见衍生物的分子结构,分别得到11号羰基氧的密立根电荷(MUL-O)、自然原子轨道电荷(NBO-O)、何秀巴赫电荷(HIR-O)和静电势电荷(ESP-O)值,发现11号氧原子的ESP-O电荷值与用ACD Lab6.0预测出来的log S值相关性最好,相关系数达0.986;计算了法匹拉韦及其11种未知衍生物的ESP-O电荷值,代入相关最佳线性方程,发现所得结果与ACD Lab6.0预测结果十分接近,最大误差绝对对数值仅为0.08;分子的静电势图也显示法匹拉韦及其甲基法匹拉韦发挥其药理毒理作用可能的部位在电负性强的羰基氧原子上。 展开更多
关键词 密度泛函理论 法匹拉韦 Mulliken电荷 NBO电荷 ESP电荷 LOG S值
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抗埃博拉病毒药物法匹拉韦及其衍生物pK_b值预测 被引量:2
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作者 李余 裴诗恩 +5 位作者 乔骏驰 彭自珍 苏凌峰 刘喜灵 陈晗剑 钟爱国 《当代化工》 CAS 2016年第7期1503-1505,共3页
运用密度泛函理论(DFT B3LYP)和6-31+G(d,p)基组,优化了20种法匹拉韦衍生物的分子结构,分别得到羰基氧的Mulliken、NBO和ESP电荷值,发现其Mulliken电荷值与用ACD Lab6.0预测出来的p Kb值相关性最好,相关系数达0.976;计算了法匹拉韦及其1... 运用密度泛函理论(DFT B3LYP)和6-31+G(d,p)基组,优化了20种法匹拉韦衍生物的分子结构,分别得到羰基氧的Mulliken、NBO和ESP电荷值,发现其Mulliken电荷值与用ACD Lab6.0预测出来的p Kb值相关性最好,相关系数达0.976;计算了法匹拉韦及其11种衍生物的Mulliken电荷值,带入相关线性方程,发现所得结果与ACD Lab6.0预测结果十分接近,最大误差绝对值仅为0.08,由此也得知法匹拉韦发挥其药理毒理作用可能的部位在羰基氧上。 展开更多
关键词 密度泛函理论 法匹拉韦 Mulliken电荷 NBO电荷 pKb值
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取代乙烷交叉式与重叠式稳定性的密度泛函理论研究 被引量:1
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作者 黄恩玲 裴诗恩 +3 位作者 王杰 王赛龙 陈浩 钟爱国 《当代化工》 CAS 2016年第3期460-461,465,共3页
在密度泛函DFT/B3LYP理论水平优化结构,结合Aug-CC-pVDZ基组计算了17种取代乙烷交叉式与重叠式的电子能量。结果发现,相关能差值(ΔEc)与总能量差值(ΔE)的相关回归系数最高(R^2=0.95),交换能差值(ΔEx)与ΔE相关回归系数次之(R^2=0.93... 在密度泛函DFT/B3LYP理论水平优化结构,结合Aug-CC-pVDZ基组计算了17种取代乙烷交叉式与重叠式的电子能量。结果发现,相关能差值(ΔEc)与总能量差值(ΔE)的相关回归系数最高(R^2=0.95),交换能差值(ΔEx)与ΔE相关回归系数次之(R^2=0.93)。选择ΔEc与ΔEx对ΔE进行多元线性拟合,得到其相关回归系数(R^2=0.95),再用拟合公式计算ΔE(实际),并与计算得到的ΔE(理论)进行线性拟合,得到其相关回归系数R^2=0.95。我们认为,交叉式取代乙烷的构象稳定性主要起源于其分子内的相关能(Ec)和交换能(Ex)作用。 展开更多
关键词 取代乙烷 交叉式 重叠式 稳定性 密度泛函
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用Hirshfeld电荷预报取代苯胺的logP值
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作者 韦亮 苏婉芬 +4 位作者 罗海霞 王赛龙 罗寅辉 刘诗咏 钟爱国 《当代化工》 CAS 2015年第6期1219-1221,共3页
用密度泛函活性理论与方法(DFT/B3LYP)及基组6-31+G(d,p),优化了20种苯胺及其取代苯胺分子的几何结构。结果发现,苯环胺基上N原子的Hirshfeld电荷值(HIR)与其实验油水分配系数(log P)值之间具有良好的线性相关性,普遍比其H原子拟合核静... 用密度泛函活性理论与方法(DFT/B3LYP)及基组6-31+G(d,p),优化了20种苯胺及其取代苯胺分子的几何结构。结果发现,苯环胺基上N原子的Hirshfeld电荷值(HIR)与其实验油水分配系数(log P)值之间具有良好的线性相关性,普遍比其H原子拟合核静电势电荷(ESP)值以及自然电荷值(NBO)拟合的好。计算了20种未知log P值的取代苯胺化合物胺基的11N原子Hirshfeld电荷值,归入拟合出的最佳线性参数方程式,发现与商业软件ACD/Labs6.0预测得到的多取代苯胺及其衍生物分子的log P预测值非常接近,相对偏差(SD)小于±0.15%. 展开更多
关键词 密度泛函理论 自然原子轨道电荷 ACD—Labs 6.0 取代苯胺 LOGP
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用Hartree-Fock法预测取代苯亚硒酸的pK_a值
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作者 张梦阳 裴诗恩 +3 位作者 苏凌峰 刘喜灵 徐娉婷 刘诗咏 《当代化工》 CAS 2015年第11期2546-2548,共3页
采用Gaussion View软件用Hartree-Fock方法及STO-3G基组优化13种已知pK_a实验值的单取代苯亚硒酸化合物,得到它们的Mulliken电荷和NBO电荷,以羟基上的H1、O1原子及Se原子的Mulliken、NBO电荷分别对pK_a实验值做图,得到6个线性拟合方程,... 采用Gaussion View软件用Hartree-Fock方法及STO-3G基组优化13种已知pK_a实验值的单取代苯亚硒酸化合物,得到它们的Mulliken电荷和NBO电荷,以羟基上的H1、O1原子及Se原子的Mulliken、NBO电荷分别对pK_a实验值做图,得到6个线性拟合方程,通过比较它们的相关性大小,R的绝对值越大,相关性越好,选出拟合效果最好的线性回归方程。再选取13种未知pK_a实验值的单取代和多取代苯亚硒酸化合物,算出各自的电荷,用该线性回归方程计算其pK_a值。结果表明,用O1原子的Mulliken电荷值与其实验pK_a值的线性回归方程,来预测未知取代苯亚硒酸的pK_a值具有良好的预测效果。 展开更多
关键词 量化参数 Mulliken电荷 NBO电荷 PKA值
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生物工程酶制剂格列卫的光谱和药理活性的密度泛函研究
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作者 周旺 梅贤柱 +4 位作者 裴诗恩 张梦阳 黄恩玲 秦文杰 刘诗咏 《当代化工》 CAS 2016年第1期41-43,共3页
采用密度泛函理论的B3LYP方法在6-311+G(d,p)基组上,对新型生物工程酶制剂格列卫(GLIVEC)的理化性质进行了理论计算与模拟,得到其分子构型、红外光谱、拉曼光谱、紫外可见光谱、核磁共振图谱等信息,并对分子的IR谱和1HNMR谱进行了指认... 采用密度泛函理论的B3LYP方法在6-311+G(d,p)基组上,对新型生物工程酶制剂格列卫(GLIVEC)的理化性质进行了理论计算与模拟,得到其分子构型、红外光谱、拉曼光谱、紫外可见光谱、核磁共振图谱等信息,并对分子的IR谱和1HNMR谱进行了指认。模拟结果表明,N16,N6所在胺基和C1所在胍基,很可能是格列卫(GLIVEC,甲磺酸伊马替尼)发挥其药理和毒理活性之所在作用位点。 展开更多
关键词 格列卫 密度泛函理论 电子图谱
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新型降糖药利格列汀药理及光谱活性的密度泛函研究
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作者 陈航 周玥 +4 位作者 卢巧君 袁康杰 方伯勇 裴诗恩 刘诗咏 《当代化工》 CAS 2016年第1期57-59,共3页
用密度泛函理论方法(DFT),模拟计算了利格列汀分子的分子-电子吸收光谱,并对其进行了指认。结果表明,利格列汀分子发挥药理活性的亲电和亲核反应中心很可能是氨基(NH2)和N17,而亲电中心则可能是羰基。
关键词 密度泛函理论 利格列汀 电子吸收图谱
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多取代苯胺溶解度和电离常数的单参数预测
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作者 王炎 裴诗恩 +1 位作者 叶余原 黄恩玲 《当代化工》 CAS 2016年第2期229-230,237,共3页
采用DFT理论方法与基组B3LYP/3-21+G,模拟了10种单取代苯胺分子的骨架结构。计算了其苯胺环上氮和氢原子的自然轨道电荷(NBO)和密立根电荷(Mul)值。结果发现,该电荷值与其实验溶解度系数(pK_s)和实验电离平衡常数(p Ka)值间有好的单参... 采用DFT理论方法与基组B3LYP/3-21+G,模拟了10种单取代苯胺分子的骨架结构。计算了其苯胺环上氮和氢原子的自然轨道电荷(NBO)和密立根电荷(Mul)值。结果发现,该电荷值与其实验溶解度系数(pK_s)和实验电离平衡常数(p Ka)值间有好的单参数关联性。另外还计算了10个多取代基的苯胺分子的氮和氢原子的自然轨道电荷和密立根电荷参数,使用拟合出的两线性方程,结果显示新方法预测值与ACD/Labs方法得到的多取代苯胺分子的pK_a/pK_s值接近。 展开更多
关键词 密度泛函理论 苯胺 原子电荷
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