为确定凝胶电泳后条带中DNA的长度和浓度,该文提出了一种通过DNA荧光强度精确分析DNA长度及浓度的有效方法。对D2000 DNA ladder进行凝胶电泳,采集图像并进行处理。利用荧光强度与DNA浓度之间的线性关系以及迁移距离与DNA长度的线性关...为确定凝胶电泳后条带中DNA的长度和浓度,该文提出了一种通过DNA荧光强度精确分析DNA长度及浓度的有效方法。对D2000 DNA ladder进行凝胶电泳,采集图像并进行处理。利用荧光强度与DNA浓度之间的线性关系以及迁移距离与DNA长度的线性关系进行数据分析。结果显示:采用SYBR Green I作为荧光染料电泳DNA时,图像中各像素点中的绿色与红色灰度值可以反映DNA的特征信息,且绿色灰度值明显高于红色灰度值;对于小于2000 bp的DNA片段,其分子量与迁移距离呈反比例函数关系,当二者分别取对数时,其相关系数达0.971,可用于建立DNA分子量与迁移距离的数学模型以计算DNA分子量;通过计算电泳峰峰值及电泳峰积分面积,发现对于浓度比为2∶1的两个DNA条带,二者的比值为2.16与1.96、2.11与1.94、2.16与1.93,表明电泳峰积分面积能更有效地反映DNA的真实浓度值。该研究对于核酸凝胶电泳仪的开发具有重要应用价值。展开更多
肽基水凝胶作为生物活性材料在药学、纳米材料化学、组织工程等领域受到广泛关注。肽水凝胶的设计往往遵循自下而上的思路,即基于分子自组装的方法,以微观结构为基础扩展到宏观结构的形成。这种从微观角度出发的方法缺乏具体的模型阐述...肽基水凝胶作为生物活性材料在药学、纳米材料化学、组织工程等领域受到广泛关注。肽水凝胶的设计往往遵循自下而上的思路,即基于分子自组装的方法,以微观结构为基础扩展到宏观结构的形成。这种从微观角度出发的方法缺乏具体的模型阐述,初学者往往难以上手。因此,我们根据以β-折叠为基本自组装结构的肽基水凝胶的研究,总结了氨基酸对于肽自组装行为以及凝胶结构与应用的影响,期望可以帮助研究者在设计多肽序列时可以尽快地找到切入点,开发出具有特殊功能的肽基水凝胶材料。As bioactive materials, peptide-based hydrogels have attracted extensive attention in the fields of pharmacy, nanomaterial chemistry, tissue engineering, etc. The design of hydrogels often follows the bottom-up approach, that is the method based on molecular self-assembly, extending from microstructure to the formation of macrostructure. But this method from the micro-perspective lacks specific model elaboration, making it difficult to get started for beginners. Therefore, based on some studies on peptide-based hydrogels with β-sheet as the basic self-assembly structure, we summarized the influence of different amino acid sequences on peptide self-assembly behavior, and the structure and application of gel, hoping to help researchers find the entry point as soon as possible when designing peptide sequences, and design and develop peptide-based hydrogel materials with special functions.展开更多
文摘为确定凝胶电泳后条带中DNA的长度和浓度,该文提出了一种通过DNA荧光强度精确分析DNA长度及浓度的有效方法。对D2000 DNA ladder进行凝胶电泳,采集图像并进行处理。利用荧光强度与DNA浓度之间的线性关系以及迁移距离与DNA长度的线性关系进行数据分析。结果显示:采用SYBR Green I作为荧光染料电泳DNA时,图像中各像素点中的绿色与红色灰度值可以反映DNA的特征信息,且绿色灰度值明显高于红色灰度值;对于小于2000 bp的DNA片段,其分子量与迁移距离呈反比例函数关系,当二者分别取对数时,其相关系数达0.971,可用于建立DNA分子量与迁移距离的数学模型以计算DNA分子量;通过计算电泳峰峰值及电泳峰积分面积,发现对于浓度比为2∶1的两个DNA条带,二者的比值为2.16与1.96、2.11与1.94、2.16与1.93,表明电泳峰积分面积能更有效地反映DNA的真实浓度值。该研究对于核酸凝胶电泳仪的开发具有重要应用价值。
文摘肽基水凝胶作为生物活性材料在药学、纳米材料化学、组织工程等领域受到广泛关注。肽水凝胶的设计往往遵循自下而上的思路,即基于分子自组装的方法,以微观结构为基础扩展到宏观结构的形成。这种从微观角度出发的方法缺乏具体的模型阐述,初学者往往难以上手。因此,我们根据以β-折叠为基本自组装结构的肽基水凝胶的研究,总结了氨基酸对于肽自组装行为以及凝胶结构与应用的影响,期望可以帮助研究者在设计多肽序列时可以尽快地找到切入点,开发出具有特殊功能的肽基水凝胶材料。As bioactive materials, peptide-based hydrogels have attracted extensive attention in the fields of pharmacy, nanomaterial chemistry, tissue engineering, etc. The design of hydrogels often follows the bottom-up approach, that is the method based on molecular self-assembly, extending from microstructure to the formation of macrostructure. But this method from the micro-perspective lacks specific model elaboration, making it difficult to get started for beginners. Therefore, based on some studies on peptide-based hydrogels with β-sheet as the basic self-assembly structure, we summarized the influence of different amino acid sequences on peptide self-assembly behavior, and the structure and application of gel, hoping to help researchers find the entry point as soon as possible when designing peptide sequences, and design and develop peptide-based hydrogel materials with special functions.
