目的克隆新疆来源细粒棘球蚴的低密度脂蛋白受体相关蛋白(Low density lipoprotein receptor-related protein of Echinococcus granulosus sensu stricto-Xinjiang,EgLRP-Xinjiang)的基因序列,并分析其生物学信息。方法通过基因克隆技...目的克隆新疆来源细粒棘球蚴的低密度脂蛋白受体相关蛋白(Low density lipoprotein receptor-related protein of Echinococcus granulosus sensu stricto-Xinjiang,EgLRP-Xinjiang)的基因序列,并分析其生物学信息。方法通过基因克隆技术获得EgLRP基因的全长序列,并利用生物信息学方法预测EgLRP蛋白的生理生化特征、信号肽、跨膜区域、蛋白结构、进化树以及蛋白互作关系等生物学信息。结果基因克隆结果显示,EgLRP-Xinjiang与NCBI数据库中的EgLRP基因序列的相似性为99.84%。生物信息学分析结果显示,EgLRP的cDNA全长序列8205 bp,编码2734个氨基酸,存在1个信号肽和1个跨膜区域。EgLRP蛋白具有碳水化合物运输和代谢相关的超家族蛋白YvrE(YvrE super family)的特征结构域。进化树结果显示,EgLRP与多房棘球绦虫、微口膜绦虫的亲缘关系较近;与智人、小鼠等物种的亲缘关系较远。EgLRP蛋白与细粒棘球绦虫中的DVL-3、Intersectin-1和Wnt等蛋白存在相互作用,与mTOR、Wnt、Notch等信号通路密切相关。结论本研究成功克隆出EgLRP基因,其编码蛋白具有糖代谢相关特征结构域,且与代谢相关信号通路之间存在关联,可能参与细粒棘球绦虫的糖代谢等能量代谢过程,为研发新型抗包虫病药物靶点提供了研究基础。展开更多
文摘目的克隆新疆来源细粒棘球蚴的低密度脂蛋白受体相关蛋白(Low density lipoprotein receptor-related protein of Echinococcus granulosus sensu stricto-Xinjiang,EgLRP-Xinjiang)的基因序列,并分析其生物学信息。方法通过基因克隆技术获得EgLRP基因的全长序列,并利用生物信息学方法预测EgLRP蛋白的生理生化特征、信号肽、跨膜区域、蛋白结构、进化树以及蛋白互作关系等生物学信息。结果基因克隆结果显示,EgLRP-Xinjiang与NCBI数据库中的EgLRP基因序列的相似性为99.84%。生物信息学分析结果显示,EgLRP的cDNA全长序列8205 bp,编码2734个氨基酸,存在1个信号肽和1个跨膜区域。EgLRP蛋白具有碳水化合物运输和代谢相关的超家族蛋白YvrE(YvrE super family)的特征结构域。进化树结果显示,EgLRP与多房棘球绦虫、微口膜绦虫的亲缘关系较近;与智人、小鼠等物种的亲缘关系较远。EgLRP蛋白与细粒棘球绦虫中的DVL-3、Intersectin-1和Wnt等蛋白存在相互作用,与mTOR、Wnt、Notch等信号通路密切相关。结论本研究成功克隆出EgLRP基因,其编码蛋白具有糖代谢相关特征结构域,且与代谢相关信号通路之间存在关联,可能参与细粒棘球绦虫的糖代谢等能量代谢过程,为研发新型抗包虫病药物靶点提供了研究基础。
