Dof转录因子家族具有保守的Dof(DNA binding with one zine finger,Dof)结构域,是植物中一类特有的转录因子,参与植物的生长发育和响应逆境胁迫等过程。目前,关于甜菜BvDof转录因子家族全基因组鉴定的研究还未见报道。本研究基于甜菜基...Dof转录因子家族具有保守的Dof(DNA binding with one zine finger,Dof)结构域,是植物中一类特有的转录因子,参与植物的生长发育和响应逆境胁迫等过程。目前,关于甜菜BvDof转录因子家族全基因组鉴定的研究还未见报道。本研究基于甜菜基因组数据,利用生物信息学技术对甜菜BvDof转录因子家族进行全基因组鉴定,并对其理化性质、基因结构、保守结构域、系统进化、共线性、启动子顺式作用元件、盐胁迫下的表达模式及蛋白质互作网络进行分析。共鉴定到24个甜菜BvDof转录因子家族成员,它们不均等分布在甜菜基因组9条染色体中的7条上;BvDof转录因子家族成员具有相似的基因结构,在Dof结构域中均具有1个保守的C2-C2锌指结构;甜菜BvDof转录因子家族分为7个亚家族(Ⅰ~Ⅶ);在甜菜全基因组中BvDof基因间只有一对重复基因,为BvDof 1和BvDof7;上游2000 bp启动子中包含多种与光响应、激素响应和非生物胁迫响应有关的顺式作用元件;甜菜BvDof转录因子家族24个基因均能应答盐胁迫,并且部分基因呈现叶和根的表达特异性;甜菜BvDof转录因子能够与控制光周期、激素应答和盐应答的蛋白质相互作用。本研究为进一步开展甜菜BvDof转录因子家族耐逆功能研究奠定了重要的理论基础。展开更多
文摘Dof转录因子家族具有保守的Dof(DNA binding with one zine finger,Dof)结构域,是植物中一类特有的转录因子,参与植物的生长发育和响应逆境胁迫等过程。目前,关于甜菜BvDof转录因子家族全基因组鉴定的研究还未见报道。本研究基于甜菜基因组数据,利用生物信息学技术对甜菜BvDof转录因子家族进行全基因组鉴定,并对其理化性质、基因结构、保守结构域、系统进化、共线性、启动子顺式作用元件、盐胁迫下的表达模式及蛋白质互作网络进行分析。共鉴定到24个甜菜BvDof转录因子家族成员,它们不均等分布在甜菜基因组9条染色体中的7条上;BvDof转录因子家族成员具有相似的基因结构,在Dof结构域中均具有1个保守的C2-C2锌指结构;甜菜BvDof转录因子家族分为7个亚家族(Ⅰ~Ⅶ);在甜菜全基因组中BvDof基因间只有一对重复基因,为BvDof 1和BvDof7;上游2000 bp启动子中包含多种与光响应、激素响应和非生物胁迫响应有关的顺式作用元件;甜菜BvDof转录因子家族24个基因均能应答盐胁迫,并且部分基因呈现叶和根的表达特异性;甜菜BvDof转录因子能够与控制光周期、激素应答和盐应答的蛋白质相互作用。本研究为进一步开展甜菜BvDof转录因子家族耐逆功能研究奠定了重要的理论基础。
