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生物正交反应在我国的研究进展 被引量:7
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作者 汪欣 张贤睿 +2 位作者 黄宗煜 樊新元 陈鹏 《化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2021年第4期406-413,共8页
生物正交反应是指能够在生物体系中进行、且不会与天然生物化学过程相互干扰的一类化学反应.这类反应的出现为科学家对生命进程的原位研究带来了革命性的技术,已经成为化学生物学这一新兴交叉领域的核心方向之一.自这一概念提出的近二... 生物正交反应是指能够在生物体系中进行、且不会与天然生物化学过程相互干扰的一类化学反应.这类反应的出现为科学家对生命进程的原位研究带来了革命性的技术,已经成为化学生物学这一新兴交叉领域的核心方向之一.自这一概念提出的近二十年里,生物正交化学经历了反应类型由单一的“偶联反应”向成键偶联、断键剪切反应并重,应用场景由简单的活细胞体系向更为复杂的生物活体升级的一系列发展历程.同时,在生命科学研究、医药研发、临床诊疗等多个领域展示出了广阔的应用前景.我国化学生物学领域的学者们积极参与并推动了生物正交反应的快速发展,在反应开发、体系优化和实际应用等方面开展了一系列原创工作,取得了瞩目的成绩;尤其是在“生物正交剪切反应”概念的提出与开发应用等方面产生了重要的国际影响.本综述中,分别按照金属介导、光介导和化学小分子介导的生物正交偶联反应以及生物正交剪切反应,对近五年来我国学者在该领域的代表性成果进行系统介绍.最后对生物正交反应的进一步发展与应用加以展望.我们期待更多高效、兼容的生物正交反应得以发展,并提出“遥控生物正交化学”的未来发展目标,期待更多的化学家能够加入生物正交反应的开发拓展与应用探索当中. 展开更多
关键词 生物正交反应 生物正交剪切反应 生物正交偶联反应 遥控生物正交化学 剪切化学
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CUL2-RING泛素连接酶识别羧基端降解子的机制 被引量:1
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作者 许超 樊新元 +1 位作者 高新娇 戚炜 《中国科学:化学》 北大核心 2025年第4期748-760,共13页
细胞生命活动的可塑性调控在分子水平表现为生物大分子动态相互作用与稳态调控.泛素-蛋白酶体系统是调控细胞内蛋白质降解的主要途径,其功能异常是导致肿瘤等疾病发生与发展的重要原因.在泛素化级联通路中,泛素连接酶E3负责识别并催化... 细胞生命活动的可塑性调控在分子水平表现为生物大分子动态相互作用与稳态调控.泛素-蛋白酶体系统是调控细胞内蛋白质降解的主要途径,其功能异常是导致肿瘤等疾病发生与发展的重要原因.在泛素化级联通路中,泛素连接酶E3负责识别并催化底物聚泛素化.近年来,本研究团队综合利用结构生物学、化学生物学与细胞生物学等方法,解析了Cullin 2-RING泛素连接酶复合物组装机制及其识别底物羧基端降解子的分子机制,阐明了复合物活性受类泛素化修饰激活的机理,并发现了若干可用于设计蛋白降解靶向嵌合体的新靶标.最后,本文展望了未来基于泛素连接酶的底物识别机制开发靶向蛋白质降解剂,以及将该技术与新的化学生物学方法相结合开发新工具的可能性. 展开更多
关键词 泛素化修饰 泛素-蛋白酶体系统 泛素连接酶 羧基端降解子 蛋白降解靶向嵌合体(PROTAC)
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Bioorthogonal Cleavage Chemistry:Harnessing the Bond-Break Reactions for Biomolecule Manipulations in Living Systems
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作者 Yuchao Zhu Feng Lin +4 位作者 Ziqi Liu Xin Wang Shubing Wang xinyuan fan Peng R.Chen 《Chinese Journal of Chemistry》 2025年第5期553-566,共14页
Comprehensive Summary The advancement of bioorthogonal cleavage reactions(BCRs)has expanded the scope of the bioorthogonal chemistry toolkit,leading to a diverse array of innovative biological applications.These inclu... Comprehensive Summary The advancement of bioorthogonal cleavage reactions(BCRs)has expanded the scope of the bioorthogonal chemistry toolkit,leading to a diverse array of innovative biological applications.These include but are not limited to precise spatial and temporal activation of intracellular probes,prodrugs,proteins,glycans,and nucleic acids.Herein,we summarize recent efforts by our group to develop BCRs for manipulating functional molecules in living species to meet various needs,along with future perspectives in this exciting field. 展开更多
关键词 Bioorthogona Cleavage reaction Genetic code expansion Amino acids Proteins PRODRUG
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转化化学:医学驱动的化学前沿研究 被引量:1
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作者 陈鹏 李劼 +4 位作者 樊新元 邢曦雯 杨俊林 孟庆峰 张艳 《中国科学基金》 CSSCI CSCD 北大核心 2023年第5期803-810,共8页
本文围绕医学与化学的前沿交叉研究,基于第288期双清论坛的研讨内容,提出通过临床医学的问题和场景来启发化学的前沿研究,进而通过分子科学的创新推动医学问题的解决。这一研究思路有望推动“转化化学”的快速发展,促进化学和医学两个... 本文围绕医学与化学的前沿交叉研究,基于第288期双清论坛的研讨内容,提出通过临床医学的问题和场景来启发化学的前沿研究,进而通过分子科学的创新推动医学问题的解决。这一研究思路有望推动“转化化学”的快速发展,促进化学和医学两个学科的协同创新。同时,本文还凝练了该领域的主要研究方向和若干关键科学问题,指出面临的技术瓶颈,思考未来5~10年的发展目标和资助重点。 展开更多
关键词 医学 化学前沿 分子医学 转化化学 交叉研究
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逆电子需求的狄尔斯-阿尔德反应在生物正交化学领域的发展与应用 被引量:4
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作者 张贤睿 罗惠鑫 +1 位作者 樊新元 陈鹏 《中国科学:化学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第10期1280-1295,共16页
逆电子需求的狄尔斯-阿尔德(IEDDA)反应由于其生物兼容性好、反应专一性高、反应速率快等优点逐渐成为最受关注的生物正交化学反应.因此,研究者围绕IEDDA反应,从包括反应机理、底物合成、效率优化以及反应应用等多个角度进行了深入研究... 逆电子需求的狄尔斯-阿尔德(IEDDA)反应由于其生物兼容性好、反应专一性高、反应速率快等优点逐渐成为最受关注的生物正交化学反应.因此,研究者围绕IEDDA反应,从包括反应机理、底物合成、效率优化以及反应应用等多个角度进行了深入研究与探索,开发了分别用于生物正交偶联和生物正交断键的IEDDA反应.本文首先从反应的发展和优化角度对IEDDA反应进行了介绍,随后归纳总结了IEDDA分别作为偶联反应和断键反应在生物大分子标记、药物运输、药物动力学研究、蛋白质调控与功能激活、前药释放、siRNA激活以及RNA固相纯化等领域的生物应用.最后,对IEDDA反应的进一步研究与应用进行了展望,期待通过对更优反应对的开发以及更广泛生物应用的探索,将生物正交化学的发展与应用推进到一个新的高度. 展开更多
关键词 逆电子需求狄尔斯-阿尔德反应 生物正交化学 生物正交断键反应 生物分子标记 蛋白质激活
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Deciphering life sciences with“live”chemistry——The 2022 Nobel Prize in Chemistry 被引量:2
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作者 xinyuan fan Peng R.Chen 《Science China Chemistry》 SCIE EI CAS CSCD 2023年第1期7-9,共3页
The 2022 Nobel Prize in Chemistry was awarded to Carolyn R.Bertozzi,Morten Meldal andK.Barry Sharpless for their development of click reaction and bioorthogonal chemistry.Our understanding of life sciences has been fu... The 2022 Nobel Prize in Chemistry was awarded to Carolyn R.Bertozzi,Morten Meldal andK.Barry Sharpless for their development of click reaction and bioorthogonal chemistry.Our understanding of life sciences has been fundamentally accelerated by such novel chemistries,and to some extent,revolutionized by the emergence of new chemical tools benefited from these cutting-edge interdisciplinary explorations.In turn,the high demands of more powerful chemical tools for the sophisticated living systems have further promoted the development of new chemistry with newfunctionalities and applications. 展开更多
关键词 NOBEL LIFE promoted
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Proximity Chemistry in Living Systems
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作者 Yanjun Liu Yun Ge +3 位作者 Ruxin Zeng William Shu Ching Ngai xinyuan fan Peng R.Chen 《CCS Chemistry》 CSCD 2023年第4期802-813,共12页
Enzyme-and catalyst-generated reactive species have been leveraged in the past decade to covalently label biomolecules within a short range of a defined site or space inside cells or at the cell–cell interface.Due to... Enzyme-and catalyst-generated reactive species have been leveraged in the past decade to covalently label biomolecules within a short range of a defined site or space inside cells or at the cell–cell interface.Due to their high spatial resolution,such proximity labeling strategies have been coupled with various bioanalytical techniques for dissecting dynamic and complex biological processes.Here,we review the development of enzyme-and catalyst-triggered proximity chemistry and their applications to identifying protein interaction networks as well as cell–cell communications in living systems. 展开更多
关键词 proximity labeling bioorthogonal chemistry spatiotemporal proteomics cell-cell interactions living systems
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