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题名生物序列分析
被引量：1
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作者
t.p.speed
史定华
王斌宾
顾燕红
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机构
美国加州大学伯克利分校统计系
上海大学数学系
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出处
《自然杂志》
北大核心
2002年第5期254-258,共5页
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文摘
这次演讲将回顾近 1 0多年来应用某些随机模型于生物序列分析的研究工作 .这些模型本身有很长的历史 ,可追溯到 3 0多年以前 ,尽管从那时起 ,这些模型已经产生了很多新的变种 .在生物序列分析中模型的作用是归总那些涉及到在生物信息学中已知的模体 (motif)或域 (domain)的信息 ,并且提供一种工具在另一序列片段中寻找模体或域的实例 (instance) .我们将逐步介绍模体模型 ,从非常简单的 ,非随机情况开始 ,进而是更复杂的情况 ,直至近来的关于模体的剖面隐马氏模型 .第二个例子是来自利用一个或两个物种的序列数据进行基因发现 ,其中广义隐马氏模型或广义成对 (pair)
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关键词
生物序列分析
正则表达
剖面
隐马氏模型
生物分子
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Keywords
motif, regular expression, profile, hidden Markov model
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分类号
Q71
[生物学—分子生物学]
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