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大豆分枝数QTL定位及候选基因筛选
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作者 胡蒙 沙丹 +6 位作者 张晟瑞 谷勇哲 张世碧 李静 孙君明 邱丽娟 李斌 《作物学报》 北大核心 2025年第7期1747-1756,共10页
大豆是重要的粮饲兼用作物。分枝数是影响大豆产量的重要农艺性状之一。本研究以少分枝大豆品种中黄35与多分枝品种中黄13杂交衍生的RIL F_(2:7-8)群体为材料,结合重测序基因型数据构建的高密度遗传连锁图谱,采用QTL IciMapping完备复... 大豆是重要的粮饲兼用作物。分枝数是影响大豆产量的重要农艺性状之一。本研究以少分枝大豆品种中黄35与多分枝品种中黄13杂交衍生的RIL F_(2:7-8)群体为材料,结合重测序基因型数据构建的高密度遗传连锁图谱,采用QTL IciMapping完备复合区间定位方法,在5个种植环境下定位与分枝数相关的QTL。结果显示,在2号、6号、18号和19号染色体上共定位到6个与分枝数相关的QTL。其中位于2号染色体的qVBN02-1在2个环境中均被检测到,平均解释16.07%的表型变异,为新发掘的分枝数稳定主效QTL。该位点区间遗传距离为0.3 cM,物理距离为261.37 kb,包含29个注释基因。经QTL区间内双亲错义SNP筛选,发掘出22个分枝数潜在候选基因。GO注释分析显示,这些基因编码的蛋白涉及多个影响植物生长发育的重要过程。本研究不仅为大豆株型改良提供了分子标记靶位点,也为精细定位大豆分枝数关键基因奠定了基础。 展开更多
关键词 大豆 分枝数 重组自交系 QTL定位 候选基因
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广适高产高蛋白大豆品种中黄13的选育与应用 被引量:21
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作者 王连铮 孙君明 +2 位作者 王岚 李斌 赵荣娟 《大豆科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期1-6,共6页
中黄13是中国农业科学院作物科学研究所大豆高产优质育种团队历经20多年育成的广适高产高蛋白大豆品种。该品种以豫豆8号为母本,中90052-76为父本,经有性杂交利用系谱法选育而成,原品系号为中作975。该品种主要技术特点:一是适应性广。... 中黄13是中国农业科学院作物科学研究所大豆高产优质育种团队历经20多年育成的广适高产高蛋白大豆品种。该品种以豫豆8号为母本,中90052-76为父本,经有性杂交利用系谱法选育而成,原品系号为中作975。该品种主要技术特点:一是适应性广。先后通过国家以及安徽、河南、湖北、陕西、山西、北京、天津、辽宁、四川9个省市审定,适宜种植区域N29°~42°,跨3个生态区13个纬度,是迄今国内纬度跨度最大、适应范围最广的大豆品种。中黄13光周期钝感,蓝光受体基因(Gm CRY1a)研究结果揭示了其适应性广的分子机理。二是高产。在山西省襄垣县创4 686 kg·hm-2的大豆高产记录,在推广面积最大的安徽省区试平均产量3 041 kg·hm-2,增产16. 0%,全部25个试点均增产,产量列参试品种首位。三是优质。蛋白质含量高达45. 8%,百粒重24~26 g,商品品质好。四是多抗。抗倒伏,耐涝,抗花叶病毒病,中抗胞囊线虫病。采用良种良法相结合实现了中黄13大面积推广应用,自2007年以来已连续9年位居全国大豆年种植面积首位;截止2018年,累计推广面积超1亿亩。2009年获国家自主创新产品证书,2010年获第十二届中国国际高新技术交易会优秀产品奖,2010年获北京市科学技术一等奖,2012年获国家科技进步一等奖。2006年授权中国植物新品种权,2008年授权韩国植物新品种权。 展开更多
关键词 大豆 中黄13 广适 高产 高蛋白 选育 应用
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基于人工神经网络的钻井机械钻速预测模型的分析与建立 被引量:35
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作者 刘胜娃 孙俊明 +1 位作者 高翔 王敏 《计算机科学》 CSCD 北大核心 2019年第B06期605-608,共4页
长庆钻井公司的各部门在过去的十几年里积累了海量的各类钻井数据,随着企业云平台的建设完成和投入运营,目前已经利用数据集成技术将各部门的数据进行了汇总和统一规范管理。挖掘这些积累的宝贵数据可以为科学地制定钻井方案提供参考。... 长庆钻井公司的各部门在过去的十几年里积累了海量的各类钻井数据,随着企业云平台的建设完成和投入运营,目前已经利用数据集成技术将各部门的数据进行了汇总和统一规范管理。挖掘这些积累的宝贵数据可以为科学地制定钻井方案提供参考。机械钻速的准确预测对于科学配置钻井资源、降低钻井成本有重要作用。文中介绍了一种基于人工神经网络技术的定向井机械钻速预测模型实现方法,由钻井领域专家确定网络的输入和输出,由数据工程师设计网络拓扑结构和网络训练。实验结果表明,在数据量较充足、数据质量较高的条件下,采用神经网络构建的预测模型的预测准确度较高,完全能够满足用户的需求。 展开更多
关键词 大数据 人工智能 神经网络
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基于高密度遗传图谱定位大豆蛋白质含量相关的QTL 被引量:2
4
作者 刘亭萱 谷勇哲 +3 位作者 张之昊 王俊 孙君明 邱丽娟 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期1532-1541,共10页
大豆是重要的粮食作物和经济作物,其籽粒蛋白约为40%,是优质植物蛋白主要来源之一。挖掘控制大豆高蛋白数量性状位点(Quantitative trait loci,QTL)以及分子标记育种对高蛋白大豆培育具有重要的意义。本研究利用蛋白含量存在明显差异的... 大豆是重要的粮食作物和经济作物,其籽粒蛋白约为40%,是优质植物蛋白主要来源之一。挖掘控制大豆高蛋白数量性状位点(Quantitative trait loci,QTL)以及分子标记育种对高蛋白大豆培育具有重要的意义。本研究利用蛋白含量存在明显差异的中黄35(Zhonghuang 35,ZH35)和中黄13(Zhonghuang 13,ZH13)杂交构建的包含192个株系的重组自交系群体为供试材料,通过对两亲本及RIL群体重测序,构建了包含4879个bin标记的高密度遗传图谱,总遗传距离为3760.71 cM,相邻标记间的遗传距离为0.77 cM。RIL群体及亲本分别于北京顺义和河南濮阳种植,2个环境共检测到15个蛋白含量相关QTL位点,分布于5号、12号、15号、17号、18号、19号和20号染色体,贡献率为4.36%~11.39%。其中,北京顺义和河南濮阳检测到qPro-20-1和qPro-20-3,2个QTL贡献率分别为7.65%和7.58%,重叠区域包括33个基因。本研究有助于精细定位和图位克隆大豆蛋白含量相关基因,并为进一步培育高蛋白大豆品种提供基因资源。 展开更多
关键词 大豆 蛋白质含量 重组自交系 bin图谱 QTL定位
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Rapid HPLC Method for Determination of 12 Isoflavone Components in Soybean Seeds 被引量:25
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作者 sun jun-ming sun Bao-li +3 位作者 HAN Fen-xia YAN Shu-rong YANG Hua Akio Kikuchi 《Agricultural Sciences in China》 CAS CSCD 2011年第1期70-77,共8页
It is important to determine the isoflavone components by high-performance liquid chromatography (HPLC) for the molecular assistant selection of isoflavone in soybean. Based on the standard samples of 12 isoflavone ... It is important to determine the isoflavone components by high-performance liquid chromatography (HPLC) for the molecular assistant selection of isoflavone in soybean. Based on the standard samples of 12 isoflavone components, the isoflavone components were analyzed using the determination of absorbance peaks method by HPLC. The results showed that there were different maximum ultraviolet (UV) absorbance for the aglycones of daidzein, glycitein, and genistein, which were at 250, 257, and 260 nm, respectively. A linear gradient elution of acetonitrile (13-30%) containing 0. 1% acetic acid as a mobile phase was applied on a YMC-C18 column at 35℃. The 12 isoflavone components were determined using the UV detector by HPLC. We concluded that this is a rapid and precise method which adapted to determine the large numbers of samples with microanalysis. 展开更多
关键词 soybean (Glycine max L. Merri) ISOFLAVONE HPLC
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甘蓝型油菜BnCNGC基因家族鉴定及其在核盘菌侵染和PEG处理下的表达特性分析
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作者 陈松余 丁一娟 +5 位作者 孙峻溟 黄登文 杨楠 代雨涵 万华方 钱伟 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期1357-1371,共15页
CNGC是植物中普遍存在的环核苷酸门控通道,对植物的逆境响应有重要作用。系统分析甘蓝型油菜BnCNGC基因家族成员全基因组分布、结构、进化及其响应不同逆境胁迫的表达特性,对于阐明其生物学功能具有重要意义。本研究利用拟南芥和甘蓝CNG... CNGC是植物中普遍存在的环核苷酸门控通道,对植物的逆境响应有重要作用。系统分析甘蓝型油菜BnCNGC基因家族成员全基因组分布、结构、进化及其响应不同逆境胁迫的表达特性,对于阐明其生物学功能具有重要意义。本研究利用拟南芥和甘蓝CNGC蛋白保守结构域及特异基序氨基酸序列在全基因组水平鉴定了甘蓝型油菜BnCNGC家族成员,分析其基因结构、染色体定位、蛋白理化性质、蛋白保守结构域、系统进化及启动子顺式作用元件等。利用转录组数据,筛选甘蓝型油菜逆境响应候选BnCNGC成员,并采用实时荧光定量PCR分析其在核盘菌、PEG模拟干旱胁迫下的表达模式。结果显示,共鉴定到49个甘蓝型油菜BnCNGC成员,分布于除A08、C06的17对染色体上,含有5~10个内含子,其上游1500 bp包含大量逆境胁迫响应元件。BnCNGC家族成员编码的蛋白质含413~801个氨基酸,相对分子量(MW)范围47.62~110.58kD,等电点(pI)范围6.10~9.88。系统进化分析表明,BnCNGC分为Group Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ四类。转录组数据分析表明, BnCNGC9、BnCNGC27和BnCNGC48均参与逆境胁迫响应。实时荧光定量PCR分析表明,甘蓝型油菜叶片中BnCNGC9、BnCNGC27和BnCNGC48均在核盘菌胁迫下表达下调,下调量分别为48.2%~99.1%、79.4%~87.1%和39.7%~92.6%。PEG模拟干旱胁迫时,甘蓝油菜叶片中BnCNGC9在处理24 h后上调3.34倍, BnCNGC48在处理48 h后上调6.27倍, BnCNGC27对干旱胁迫不敏感。 展开更多
关键词 甘蓝型油菜 CNGC基因家族 核盘菌 PEG模拟干旱 表达分析
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Comparative Analysis of Gene Expression Profiling Between Resistant and Susceptible Varieties Infected With Soybean Cyst Nematode Race 4 in Glycine max 被引量:6
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作者 LI Bin sun jun-ming +2 位作者 WANG Lan ZHAO Rong-juan WANG Lian-zheng 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2014年第12期2594-2607,共14页
Soybean cyst nematode (SCN) is one of the most devastating pathogen for soybean. Therefore, identiifcation of resistant germplasm resources and resistant genes is needed to improve SCN resistance for soybean. Soybea... Soybean cyst nematode (SCN) is one of the most devastating pathogen for soybean. Therefore, identiifcation of resistant germplasm resources and resistant genes is needed to improve SCN resistance for soybean. Soybean varieties Huipizhiheidou and Wuzhaiheidou were distributed in China and exhibited broad spectrums of resistance to various SCN races. In this study, these two resistant varieties, combined with standard susceptible varieties (Lee and Essex), were utilized to identify the differentially expressed transcripts after infection with SCN race 4 between resistant and susceptible reactions by using the Affymetrix Soybean Genome GeneChip. Comparative analyses indicated that 21 common genes changed signiifcantly in the resistant group, of which 16 increased and 5 decreased. However, 12 common genes changed signiifcantly in the susceptible group, of which 9 increased and 3 decreased. Additionally, 27 genes were found in common between resistant and susceptible reactions. The 21 signiifcantly changed genes in resistant reaction were associated with disease and defense, cell structure, transcription, metabolism, and signal transduction. The fold induction of 4 from the 21 genes was conifrmed by quantitative RT-PCR (qRT-PCR) analysis. Moreover, the gene ontology (GO) enrichment analyses demonstrated the serine family amino acid metabolic process and arginine metabolic process may play important roles in SCN resistance. This study provided a new insight on the genetic basis of soybean resistance to SCN race 4, and the identiifed resistant or resistant-related genes are potentially useful for SCN-resistance breeding in soybean. 展开更多
关键词 SOYBEAN soybean cyst nematode Affymetrix Soybean Genome GeneChip gene ontology
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Natural variations and geographical distributions of seed carotenoids and chlorophylls in 1167 Chinese soybean accessions 被引量:1
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作者 Berhane S.GEBREGZIABHER ZHANG Sheng-rui +7 位作者 Muhammad AZAM QI Jie Kwadwo G.AGYENIM-BOATENG FENG Yue LIU Yi-tian LI Jing LI Bin sun jun-ming 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2023年第9期2632-2647,共16页
Understanding the composition and contents of carotenoids in various soybean seed accessions is important for their nutritional assessment.This study investigated the variability in the concentrations of carotenoids a... Understanding the composition and contents of carotenoids in various soybean seed accessions is important for their nutritional assessment.This study investigated the variability in the concentrations of carotenoids and chlorophylls and revealed their associations with other nutritional quality traits in a genetically diverse set of Chinese soybean accessions comprised of cultivars and landraces.Genotype,planting year,accession type,seed cotyledon color,and ecoregion of origin significantly influenced the accumulation of carotenoids and chlorophylls.The mean total carotenoid content was in the range of 8.15–14.72μg g–1 across the ecoregions.The total carotenoid content was 1.2-fold higher in the landraces than in the cultivars.Soybeans with green cotyledons had higher contents of carotenoids and chlorophylls than those with yellow cotyledons.Remarkably,lutein was the most abundant carotenoid in all the germplasms,ranging from 1.35–37.44μg g–1.Carotenoids and chlorophylls showed significant correlations with other quality traits,which will help to set breeding strategies for enhancing soybean carotenoids without affecting the other components.Collectively,our results demonstrate that carotenoids are adequately accumulated in soybean seeds,however,they are strongly influenced by genetic factors,accession type,and germplasm origin.We identified novel germplasms with the highest total carotenoid contents across the various ecoregions of China that could serve as the genetic materials for soybean carotenoid breeding programs,and thereby as the raw materials for food sectors,pharmaceuticals,and the cosmetic industry. 展开更多
关键词 accession type carotenoid CHLOROPHYLL ECOREGION geographical distribution Pearson’s correlation soybean(Glycine max L.Merrill)
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百令胶囊联合糖皮质激素对狼疮性肾炎患者血清白介素-6、胱抑素C和同型半胱氨酸水平的影响 被引量:5
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作者 孙俊明 冯英 潘星 《黑龙江医学》 2022年第13期1590-1592,共3页
目的:探讨百令胶囊联合糖皮质激素对狼疮性肾炎(LN)患者血清白介素-6(IL-6)、胱抑素C(Cys-C)和同型半胱氨酸(Hcy)水平的影响。方法:选择2018年6月—2020年6月上海市东方医院吉安医院收治的82例LN患者作为研究对象,按随机数表法分为两组... 目的:探讨百令胶囊联合糖皮质激素对狼疮性肾炎(LN)患者血清白介素-6(IL-6)、胱抑素C(Cys-C)和同型半胱氨酸(Hcy)水平的影响。方法:选择2018年6月—2020年6月上海市东方医院吉安医院收治的82例LN患者作为研究对象,按随机数表法分为两组,每组各41例。对照组采用泼尼松治疗,观察组采用泼尼松联合百令胶囊治疗。比较两组患者临床疗效、Cys-C、Hcy、白蛋白(ALB)、IL-6、白介素-18(IL-18)、γ-干扰素(IFN-γ)、系统性狼疮性疾病活动度(SLEDAI)及不良反应。结果:观察组治疗总有效率(92.68%)高于对照组,差异有统计学意义(χ^(2)=4.479,P<0.05);治疗后观察组白蛋白(ALB)为(39.62±7.21)g/L高于对照组(75.61%),Cys-C(0.93±0.36)为mg/L、Hcy为(9.21±3.19)mmol/L,均低于对照组,差异有统计学意义(t=4.834、8.402、5.540,P<0.05);治疗后观察组IL-6为(24.94±4.12)pg/mL、IL-18为(38.66±10.09)pg/mL、IFN-γ为(34.16±7.55)pg/mL、SLEDAI评分为(7.49±2.24)分,均低于对照组,差异有统计学意义(t=3.049、3.097、2.918、6.534,P<0.05);两组患者不良反应比较,差异无统计学意义(P>0.05)。结论:LN患者采用百令胶囊、泼尼松联合治疗有利于抑制病情进展,改善患者肾功能,降低IL-6、IL-18、IFN-γ水平,降低病情活动度,临床应用不良反应少。 展开更多
关键词 狼疮性肾炎 百令胶囊 泼尼松 白介素-6 胱抑素C 同型半胱氨酸 白蛋白
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单季晚稻全生育期主要病虫害轻简化施药技术研究 被引量:2
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作者 凌代芬 孙俊铭 +2 位作者 张向前 秦学峰 韦刚 《安徽农业科学》 CAS 2023年第14期128-132,共5页
[目的]明确水稻全生育期轻简化施药技术方案对稻蓟马、二化螟、稻纵卷叶螟、纹枯病、稻瘟病、稻曲病防治效果及对水稻秧苗素质、产量的影响。[方法]通过田间试验研究水稻全生育期轻简化施药技术方案对稻蓟马、二化螟、稻纵卷叶螟、纹枯... [目的]明确水稻全生育期轻简化施药技术方案对稻蓟马、二化螟、稻纵卷叶螟、纹枯病、稻瘟病、稻曲病防治效果及对水稻秧苗素质、产量的影响。[方法]通过田间试验研究水稻全生育期轻简化施药技术方案对稻蓟马、二化螟、稻纵卷叶螟、纹枯病、稻瘟病、稻曲病的防治效果及壮苗效果、增产效果、减药效果。[结果]水稻全生育期轻简化施药技术,主抓播种前种子药剂处理、移栽前施送嫁药和破口前施保穗药3个关键环节的预防性用药,对稻蓟马、稻纵卷叶螟、纹枯病、稻瘟病、稻曲病均具有较好的防治效果,对水稻秧苗有明显的促进生长作用,增产效果明显,药剂施用量(有效成分量)明显减少。[结论]水稻全生育期主要病虫害轻简化施药技术“三前三防、两期两治”减药控害增产效果明显。 展开更多
关键词 水稻主要病虫害 单季晚稻 全生育期 轻简化 施药技术
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快速破坏性髋关节病2例并文献复习 被引量:2
11
作者 陈振南 何亚标 +1 位作者 孙俊明 林政 《风湿病与关节炎》 2021年第3期38-40,57,共4页
快速破坏性髋关节病(rapidly destructive coxarthrosis,RDC)是排除其他因素引起的关节破坏性疾病,为少见类型的髋骨关节炎[1-5]。RDC被描述为一种进展快速、股骨头短期内破坏吸收、患者疼痛症状严重、不同于股骨头坏死一般病程的髋关... 快速破坏性髋关节病(rapidly destructive coxarthrosis,RDC)是排除其他因素引起的关节破坏性疾病,为少见类型的髋骨关节炎[1-5]。RDC被描述为一种进展快速、股骨头短期内破坏吸收、患者疼痛症状严重、不同于股骨头坏死一般病程的髋关节破坏性疾病。由于本病临床发生率较低,因此很多研究都是以回顾性为主。本文通过对漳州市中医院骨二区收治的2例RDC资料进行回顾性分析,并结合相关文献进行讨论。 展开更多
关键词 快速破坏性髋关节病 治疗 医案 文献复习
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江西吉安地区高尿酸血症患病情况及危险因素分析 被引量:3
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作者 方路 潘星 +6 位作者 孙俊明 徐柳青 陶敏 蒋晓露 刘娜 聂正玉 庄守纲 《井冈山大学学报(自然科学版)》 2019年第5期101-106,共6页
目的了解江西省吉安市人群高尿酸血症患病特点及相关危险因素分析。方法在2018年1月1日至7月30日期间于吉安医院体检的人群中,随机抽取1000名16岁及以上吉安常住居民体检者作为研究样本,统计不同年龄段、不同性别者高尿酸血症的患病率,... 目的了解江西省吉安市人群高尿酸血症患病特点及相关危险因素分析。方法在2018年1月1日至7月30日期间于吉安医院体检的人群中,随机抽取1000名16岁及以上吉安常住居民体检者作为研究样本,统计不同年龄段、不同性别者高尿酸血症的患病率,并应用Logistic回归模型进行高尿酸血症相关危险因素分析。结果1000名体检者中高尿酸血症患病率为23.3%(95%CI 20.68%~25.92%),其中男性患病率28.08%(95%CI 24.44%~31.73%)明显高于女性患病率16.59%(95%CI 13.01%~20.16%),具有统计学意义(P<0.001)。多因素logistic回归分析显示收缩压(OR=1.014,95%CI=1.005-1.023,P=0.002)、甘油三酯(OR=1.263,95%CI=1.106-1.443,P=0.001)、低密度脂蛋白(OR=1.376,95%CI=1.026-1.845,P=0.033)升高,肾小球滤过率(OR=0.985,95%CI=0.977-0.993,P<0.001)和高密度脂蛋白(OR=0.612,95%CI=0.402-0.931,P=0.022)降低是高尿酸血症的独立危险因素。结论在江西省吉安地区人群中,收缩压、甘油三酯、低密度脂蛋白升高,肾小球滤过率和高密度脂蛋白降低是高尿酸血症的独立危险因素。积极控制血压、血脂,保护肾脏功能,对于预防和治疗高尿酸血症具有重要意义。 展开更多
关键词 高尿酸血症 患病率 危险因素
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