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不同感染来源间日疟原虫抗叶酸类药物相关基因的研究 被引量:2
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作者 董莹 邓艳 +5 位作者 陈梦妮 徐艳春 毛祥华 王剑 孙艾明 薛靖波 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第2期103-111,共9页
目的分析云南省不同感染来源间日疟原虫抗叶酸类药物抗性相关基因二氢叶酸还原酶基因(Pvdhfr)和二氢叶酸合成酶基因(Pvdhps)的突变特点。方法收集2012年8月-2016年12月寄生虫病防治信息管理系统登记报告的云南省间日疟病例血样和流行病... 目的分析云南省不同感染来源间日疟原虫抗叶酸类药物抗性相关基因二氢叶酸还原酶基因(Pvdhfr)和二氢叶酸合成酶基因(Pvdhps)的突变特点。方法收集2012年8月-2016年12月寄生虫病防治信息管理系统登记报告的云南省间日疟病例血样和流行病学史等信息。提取疟原虫DNA,巢式PCR扩增Pvdhfr和Pvdhps基因并测序,测序序列与Gen Bank中的间日疟原虫Pvdhfr(登录号为X98123)、Pvdhps基因(登录号为PVX_123230)参比序列比对。用MEGA 5.04、Arlequin 3.5.1分析Pvdhfr和Pvdhps基因的单倍型、期望杂合度(He)、遗传分化指数(Fst)等。用Network 4.6.0、Arc Gis10.1构建单倍型网络进化图和突变型分布图。结果 共收集1 203份疟疾病例血样,缅甸、非洲、云南本地感染病例血样分别为1 060、79和64份。Pvdhfr、Pvdhps基因PCR扩增产物分别测序成功272份和708份。分析结果显示,Pvdhfr基因的272条序列存在53种单倍型,He为0.243,其中云南本地分离株群体的He最高,为0.667;12个位点均为野生型的频率是8.1%(22/272),其余52种单倍型在12个位点上存在单点或双重、三重、四重、五重、六重错义突变的不同突变型。Pvdhps基因的708条序列存在35种单倍型,He为0.153,其中缅甸感染分离株群体的He最高,为0.142;5个位点均为野生型的频率是36.2%(256/708),其余34种单倍型在5个位点形成29种错义突变,产生单点、双重、三重、四重等多种突变型。Pvdhfr及Pvdhps基因均以野生型为起始,再按单重突变到多重突变的路径逐步进化。Pvdhfr基因的野生型和突变型血样中,Pvdhps基因突变型的比例分别为18.2%(4/22)和65.6%(147/224)。Pvdhps、Pvdhfr基因突变型的血样分别分布在14和9个州(市),且以缅甸感染血样占多数,分别占97.3%(440/452)和95.4%(144/151)。结论云南省不同感染来源间日疟原虫抗叶酸类药物抗性相关基因Pvdhfr、Pvdhps的突变率、突变程度均高。 展开更多
关键词 间日疟原虫 抗叶酸类药物 二氢叶酸还原酶 二氢叶酸合成酶 抗性相关基因 突变 分析
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不同感染来源恶性疟原虫裂殖子表面蛋白3基因多态性分析及抗原表位预测 被引量:2
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作者 董莹 邓艳 +4 位作者 徐艳春 陈梦妮 毛祥华 孙艾明 王剑 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第3期210-217,共8页
目的分析云南省不同感染来源恶性疟原虫裂殖子表面蛋白3(PfMSP-3)基因和抗原表位多态性。方法收集2012年8月-2016年12月寄生虫病防治信息管理系统登记报告的云南省本地和输入恶性疟病例的血样和流行病学史等信息。提取血样的疟原虫DNA,... 目的分析云南省不同感染来源恶性疟原虫裂殖子表面蛋白3(PfMSP-3)基因和抗原表位多态性。方法收集2012年8月-2016年12月寄生虫病防治信息管理系统登记报告的云南省本地和输入恶性疟病例的血样和流行病学史等信息。提取血样的疟原虫DNA,半巢式PCR扩增PfMSP-3基因并测序,与Gen Bank中的恶性疟原虫Pf3D7、PfK1分离株的参比序列LN999944.1、U08851.1进行比对。用MEGA 5.04、Arlequin 3.5.2.2分析PfMSP-3基因的单倍型、期望杂合度(He)、群体间遗传分化指数(Fst)。用Network 4.6.0构建单倍型网络进化图。用Dna SP 5.10计算核苷酸的非同义(Ka)、同义置换率(Ks)。用IEDB在线预测软件预测PfMSP-3肽链T细胞、B细胞抗原表位。结果共收集190份恶性疟病例血样,其中181份扩增出长1 100 bp的PfMSP-3片段,测序成功167份(缅甸121份、非洲37份、云南本地感染9份)。序列比对结果显示,167条DNA序列存在36种单倍型,He为0.409±0.183,Ka/Ks为0.98。各单倍型沿Pf3D7型(Ⅰ)、过渡型(Ⅱ)及PfK1型(Ⅲ)等3种方向进化:H_1、H_9等7种单倍型为Pf3D7型,H_7、H_8等6种单倍型为过渡型,H_2、H_3等23种单倍型为PfK1型。Pf3D7型、过渡型和PfK1型序列的占比分别为49.7%(83/167)、12.6%(21/167)和37.7%(63/167)。PfMSP-3基因在非洲与缅甸恶性疟原虫群体间的分化程度最高,Fst=0.049;在非洲与云南本地感染恶性疟原虫群体间最小,Fst=0.032。抗原表位分析结果显示,36种单倍型的PfMSP-3肽链亲水性高于疏水性,指数分别为1.050~2.535和-2.583^-3.544。T细胞抗原表位活性为-1.1;B细胞抗原表位活性平均>0.5,且表现为Pf3D7型>过渡型>PfK1型。结论云南省不同感染来源恶性疟原虫的PfMSP-3基因存在3类基因型,不同基因型PfMSP-3蛋白B细胞抗原表位活性的预测值较T细胞高。 展开更多
关键词 恶性疟原虫 裂殖子表面蛋白3 抗原表位 多态性 云南省
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基于虚拟仿真技术的仪器分析实验教学改革思考与探索 被引量:12
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作者 欧丽娟 孙爱明 +3 位作者 罗建新 刘宁 张萍 王津津 《广州化工》 CAS 2020年第10期179-180,215,共3页
针对我校仪器分析实验教学存在的问题和教学现状,以虚拟仿真技术为依托,介绍了虚拟仿真技术辅助实验教学的优点。以教学实践中原子吸收光谱仿真实训为例,提出了“虚拟仿真软件预习操作——多媒体课堂理论教学——虚拟仿真模拟实验操作... 针对我校仪器分析实验教学存在的问题和教学现状,以虚拟仿真技术为依托,介绍了虚拟仿真技术辅助实验教学的优点。以教学实践中原子吸收光谱仿真实训为例,提出了“虚拟仿真软件预习操作——多媒体课堂理论教学——虚拟仿真模拟实验操作——实体实验操作”的仪器分析实验教学新模式,旨在增强学生的学习兴趣和主动性,提高学生的实践动手能力和创新能力。 展开更多
关键词 虚拟仿真 仪器分析实验 教学模式
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应用型人才培养背景下仪器分析实验教学改革与探讨 被引量:6
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作者 欧丽娟 孙爱明 刘开建 《广州化工》 CAS 2018年第8期123-124,共2页
仪器分析实验是化工专业的一门专业基础实践课程,是培养学生对大型仪器掌握和应用能力的重要途径。在应用型人才培养背景下,针对传统的仪器分析实验教学存在的问题,从虚拟仿真教学模式、实验内容、寓教于研和师资队伍建设四个方面进行... 仪器分析实验是化工专业的一门专业基础实践课程,是培养学生对大型仪器掌握和应用能力的重要途径。在应用型人才培养背景下,针对传统的仪器分析实验教学存在的问题,从虚拟仿真教学模式、实验内容、寓教于研和师资队伍建设四个方面进行了探索。通过改革,既培养了化工专业学生的综合检测能力,又提高了学生解决问题的实践能力、创新能力和综合素质,为应用型人才的培养打下了坚实的基础。 展开更多
关键词 应用型人才 仪器分析实验 教学改革
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云南省疟疾报告病例恶性疟原虫PfKelch13基因突变与青蒿素耐药性的关联性分析 被引量:1
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作者 孙艾明 王剑 +4 位作者 董莹 陈梦妮 徐艳春 邓艳 毛祥华 《生物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第1期21-25,共5页
对缅甸境内恶性疟病例的Pf Kelch13基因突变与青蒿素耐药的关联性及Pf Kelch13基因在种群间的分化差异进行了分析。结果表明云南省疟疾报告病例Pf Kelch13基因序列中,单倍型共有13种,He为0.0481,错义突变序列占34.7%(66/190),F446I的突... 对缅甸境内恶性疟病例的Pf Kelch13基因突变与青蒿素耐药的关联性及Pf Kelch13基因在种群间的分化差异进行了分析。结果表明云南省疟疾报告病例Pf Kelch13基因序列中,单倍型共有13种,He为0.0481,错义突变序列占34.7%(66/190),F446I的突变率最高,为25.3%(48/190);缅甸境内病例基因序列中,单倍型共有19种,He为0.0440,错义突变序列占58.8%(114/194),F446I的突变率最高,为43.3%(84/194),云南恶性疟种群Pf Kelch13基因kelch结构域遗传多样性相对较高,两个种群的遗传分化指数Fst=0.0410(P<0.05),群体内、群体间的变异分别占95.90%和4.10%,以缅甸境内病例推算的青蒿素耐药性产生与Pf Kelch13基因kelch结构域446位点突变的OR值为1.640(95%CI:1.284~2.095),与12种位点突变的OR值为1.840(95%CI:1.412~2.398)。研究结果表明,云南省疟疾报告病例与缅甸境内病例的恶性疟原虫分离株种群在Pf Kelch13基因kelch结构域上的分化程度低,以缅甸病例分离株推算出的Pf Kelch13基因突变与青蒿素耐药性产生的遗传关联程度适用于云南报告病例的恶性疟原虫种群。 展开更多
关键词 恶性疟病例 PfKelch13 青蒿素耐药性 关联性分析
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基于聚腺嘌呤单链DNA-金纳米簇的荧光法高灵敏快速检测汞离子 被引量:9
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作者 欧丽娟 安学忠 +4 位作者 罗建新 王凌云 薄恒 孙爱明 陈兰兰 《光谱学与光谱分析》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2021年第1期164-167,共4页
聚腺嘌呤-金纳米簇(聚A-AuNCs)制备简单,快速,且具有优良的荧光性能和光学稳定性。基于聚A单链DNA为模板合成的金纳米簇,构建了一种灵敏、简单、快速的新传感方法用于检测汞离子。以柠檬酸钠为还原剂,通过水浴加热法合成金纳米簇。用荧... 聚腺嘌呤-金纳米簇(聚A-AuNCs)制备简单,快速,且具有优良的荧光性能和光学稳定性。基于聚A单链DNA为模板合成的金纳米簇,构建了一种灵敏、简单、快速的新传感方法用于检测汞离子。以柠檬酸钠为还原剂,通过水浴加热法合成金纳米簇。用荧光光谱仪和透射电镜对金纳米簇的荧光性能和微观形貌进行了表征。结果表明:合成的金纳米簇为球形,分散性良好,平均粒径约为7 nm。金纳米簇在280 nm紫外光激发下,于471 nm处发射出强烈的蓝色荧光,且金纳米簇的光学稳定性良好。溶液在4℃下避光保存1个月,金纳米簇的荧光强度变化很小。当汞离子存在时,汞离子与纳米金之间的高亲和力,可以有效地猝灭金纳米簇的荧光。文中讨论了反应体系中缓冲溶液pH值和反应时间对传感器性能的影响,发现缓冲溶液pH值对该方法的影响不大。汞离子对金纳米簇的荧光猝灭反应非常迅速,1 min之内就可以完成,所以后续反应仅需简单的混合即可进行荧光的测定。在最优化实验条件下,对一系列汞离子浓度进行了检测,线性方程为:y=-335.57 x+541.35,检测线性范围在0.01~1μmol·L^-1之间,相关系数为0.9926。根据空白的三倍标准偏差原则确定检测下限为3 nmol·L^-1。该方法选择性好,通过9种金属离子的加入对金纳米簇的荧光信号并无明显影响,验证了金纳米簇对汞离子检测的特异性。用该方法检测了环境水样中的汞离子,加标回收率在95.33%~103.8%之间,相对标准偏差(RSD)不大于4%,可用于实际样品中Hg 2+的检测。该法仅需将溶液简单混合即可实现对汞离子的检测,具有操作简便、快速、灵敏度高和选择性好等优点。 展开更多
关键词 金纳米簇 荧光法 汞离子检测
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Fluorescent Sensor for Melamine Based on Its Copper Complex Interrupted of AT-dsDNA Copper Nanoparticles 被引量:3
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作者 OU Li-juan sun ai-ming +3 位作者 LÜXiao-ong CHEN Si-yu WANG Ling-yun LUO Jian-xin 《光谱学与光谱分析》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2017年第12期3947-3952,共6页
A novel turn-off strategy was developed for the melamine(Mel)detection based on melamine-Cu conjugate and subsequent interrupted the formation of AT-dsDNA copper nanoparticles(AT-dsDNA CuNPs).The coordination of melam... A novel turn-off strategy was developed for the melamine(Mel)detection based on melamine-Cu conjugate and subsequent interrupted the formation of AT-dsDNA copper nanoparticles(AT-dsDNA CuNPs).The coordination of melamine to copper cannot make the reduction of Cu^(2+)to Cu^(0)enough in the AT24-CuNPs synthesis process,and thereby results in the fluorescence intensity of CuNPs decreasing.Under the optimum conditions,the concentration of melamine showed a good linear relation with the fluorescence response of CuNPs in the range of 1~150μmol·L^(-1).The detection limit was 0.5μmol·L^(-1).Furthermore,good recov-eries were obtained while the proposed method was applied to the analysis of melamine in milk samples. 展开更多
关键词 Copper nanoparticles Cu-Mel complex Label-free sensor Melamine detection
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基于熵权法的区间数多指标决策方法及应用 被引量:1
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作者 孙爱民 《陕西能源职业技术学院论坛》 2020年第1期14-18,40,共6页
以区间数的距离及规范化理论为基础探讨属性值为区间数的多指标决策问题。分别构建了基于熵权法的区间数T0PSIS评价模型、基于熵权法的区间数灰色关联评价模型、基于熵权法的区间数T0PSIS-灰色关联组合评价模型。实例分析表明三种模型... 以区间数的距离及规范化理论为基础探讨属性值为区间数的多指标决策问题。分别构建了基于熵权法的区间数T0PSIS评价模型、基于熵权法的区间数灰色关联评价模型、基于熵权法的区间数T0PSIS-灰色关联组合评价模型。实例分析表明三种模型的算法的有效性及评价结果的合理性,基于区间数的T0PSIS-灰色关联组合评价模型对方案的排序更具稳定性和实用性。 展开更多
关键词 多指标决策 熵权法 区间数 TOPSIS 灰色关联度
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基于金纳米簇荧光猝灭-恢复的Hg^(2+)检测新方法
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作者 杨发国 欧丽娟 +3 位作者 罗建新 孙爱明 段娇杰 王传奇 《广州化工》 CAS 2021年第20期69-71,98,共4页
金纳米簇(AuNCs)作为一种荧光探针,已经被广泛应用于小分子、蛋白质、核酸等的检测。本文利用金纳米簇优越的荧光性质,设计了一种基于金纳米簇荧光猝灭与恢复的汞离子(Hg^(2+))检测传感新方法。半胱氨酸(Cys)中的巯基(-S)与AuNCs的Au-S... 金纳米簇(AuNCs)作为一种荧光探针,已经被广泛应用于小分子、蛋白质、核酸等的检测。本文利用金纳米簇优越的荧光性质,设计了一种基于金纳米簇荧光猝灭与恢复的汞离子(Hg^(2+))检测传感新方法。半胱氨酸(Cys)中的巯基(-S)与AuNCs的Au-S化学键合反应,AuNCs的荧光发生猝灭。在Hg^(2+)存在下,Cys中的巯基与Hg^(2+)具有更强的键合力,Cys优先和Hg^(2+)结合,形成比Au-S更稳定的复合物,AuNCs不能将Cys从汞离子中竞争下来,从而使金纳米簇的荧光恢复,且恢复程度与Hg^(2+)浓度在10-600 nmol/L范围内呈良好的线性关系,并用于检测环境水样中的汞离子,回收率好。 展开更多
关键词 金纳米簇 猝灭 恢复 汞离子
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