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大豆抗胞囊线虫病种质rhg_1和Rhg_4位点的单核苷酸多态性(SNPs)
被引量：
19
1
作者
邱丽娟
常汝镇
+4 位作者
王文辉
perry cregan
Dechun Wang
Yiwu Chen
马凤鸣
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
2003年第2期89-93,共5页
研究以 5 7份中美大豆抗胞囊线虫病种质资源为实验材料 ,利用基于检测微珠的单碱基延伸方法 ,对与大豆胞囊线虫病 (SCN)抗性基因rhg1和Rhg4紧密连锁的SNPs进行分析 ,目的是阐明我国大豆抗性种质在这两个位点的SNPs等位变异分布频率 ,为...
研究以 5 7份中美大豆抗胞囊线虫病种质资源为实验材料 ,利用基于检测微珠的单碱基延伸方法 ,对与大豆胞囊线虫病 (SCN)抗性基因rhg1和Rhg4紧密连锁的SNPs进行分析 ,目的是阐明我国大豆抗性种质在这两个位点的SNPs等位变异分布频率 ,为中国大豆种质抗SCN资源的利用奠定基础。分析结果表明 ,SNPs的抗性等位基因与中国大豆种质综合抗性的关系比不同生理小种的抗性关系更为密切。在rhg1和Rhg4位点 ,美国的 9份抗性种质中 ,有 7份抗性种质的SNPs均为纯合抗病基因型 ,而中国 4 8份抗性种质中有 32份 ,分别占鉴定总数的 77 8%和 6 6 7% ,推测大豆抗SCN种质中 ,以rhg1和Rhg4这两个基因协同作用表现出的抗性可能占多数 ,但还存在其他的抗性机制。
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关键词
大豆胞囊线虫病
rhg1
Rhg4
单核苷酸多态性
基因
抗性
大豆
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职称材料
大豆高密度SNP标记遗传图谱构建方法的比较
被引量：
3
2
作者
谭瑞娟
文自翔
+5 位作者
顾翠华
王德春
宋启建
perry cregan
邢小萍
李洪连
《河南农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第6期671-676,共6页
以对大豆猝死病抗性不同的大豆品系U01-390489×E07080所衍生的F4:5代96个家系的C2连锁群上50个多态性SNP标记位点为基础数据,对比分析了利用Joinmap4.0及Icimapping 2个软件不同计算方法所构建的遗传图谱的异同及优劣.结果表明,Ici...
以对大豆猝死病抗性不同的大豆品系U01-390489×E07080所衍生的F4:5代96个家系的C2连锁群上50个多态性SNP标记位点为基础数据,对比分析了利用Joinmap4.0及Icimapping 2个软件不同计算方法所构建的遗传图谱的异同及优劣.结果表明,Icimapping构建的图谱长度较Joinmap4.0所建图谱短,Icimapping包含的几种算法构建的图谱长度相近,Joinmap中Regression的计算方法所构建的遗传图谱与soybase上的一致图谱长度最为接近,Maximum Likelihood算法得出的图谱长度与Fixed Order算法图谱长度相近.Icimapping的构建的图谱中,较多的标记聚集于同一位点,其中的几种算法相近.Joinmap中regression算法的图谱结果乱序标记较多,Maximum Likelihood构建的图谱乱序标记较少,与Fixed Order的结果更为接近.研究结果表明,Joinmap的Maximum Likelihood算法更适合于高密度的SNP标记的图谱构建.
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关键词
大豆
单核苷酸多态性
大豆遗传连锁图谱
算法
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职称材料
题名
大豆抗胞囊线虫病种质rhg_1和Rhg_4位点的单核苷酸多态性(SNPs)
被引量：
19
1
作者
邱丽娟
常汝镇
王文辉
perry cregan
Dechun Wang
Yiwu Chen
马凤鸣
机构
中国农业科学院作物品种资源研究所
USDA-ARS Soybean and Alfalfa Research Lab
Michigan State University
东北农业大学农学院
出处
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
2003年第2期89-93,共5页
基金
出国留学基金
国家 973项目 (G19980 10 2 0 3 )
国家科技攻关 ( 2 0 0 1BA5 11B0 6)资助
文摘
研究以 5 7份中美大豆抗胞囊线虫病种质资源为实验材料 ,利用基于检测微珠的单碱基延伸方法 ,对与大豆胞囊线虫病 (SCN)抗性基因rhg1和Rhg4紧密连锁的SNPs进行分析 ,目的是阐明我国大豆抗性种质在这两个位点的SNPs等位变异分布频率 ,为中国大豆种质抗SCN资源的利用奠定基础。分析结果表明 ,SNPs的抗性等位基因与中国大豆种质综合抗性的关系比不同生理小种的抗性关系更为密切。在rhg1和Rhg4位点 ,美国的 9份抗性种质中 ,有 7份抗性种质的SNPs均为纯合抗病基因型 ,而中国 4 8份抗性种质中有 32份 ,分别占鉴定总数的 77 8%和 6 6 7% ,推测大豆抗SCN种质中 ,以rhg1和Rhg4这两个基因协同作用表现出的抗性可能占多数 ,但还存在其他的抗性机制。
关键词
大豆胞囊线虫病
rhg1
Rhg4
单核苷酸多态性
基因
抗性
大豆
Keywords
Soybean
Soybean cyst nematode(SCN)
SNP
rhg 1
Rhg 4
Gene
Resistance
分类号
S435.13 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
大豆高密度SNP标记遗传图谱构建方法的比较
被引量：
3
2
作者
谭瑞娟
文自翔
顾翠华
王德春
宋启建
perry cregan
邢小萍
李洪连
机构
河南农业大学植物保护学院
密歇根州立大学植物土壤微生物系
美国农业部农业研究服务中心
出处
《河南农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第6期671-676,共6页
基金
美国北方中心区大豆研究项目(无编号)
文摘
以对大豆猝死病抗性不同的大豆品系U01-390489×E07080所衍生的F4:5代96个家系的C2连锁群上50个多态性SNP标记位点为基础数据,对比分析了利用Joinmap4.0及Icimapping 2个软件不同计算方法所构建的遗传图谱的异同及优劣.结果表明,Icimapping构建的图谱长度较Joinmap4.0所建图谱短,Icimapping包含的几种算法构建的图谱长度相近,Joinmap中Regression的计算方法所构建的遗传图谱与soybase上的一致图谱长度最为接近,Maximum Likelihood算法得出的图谱长度与Fixed Order算法图谱长度相近.Icimapping的构建的图谱中,较多的标记聚集于同一位点,其中的几种算法相近.Joinmap中regression算法的图谱结果乱序标记较多,Maximum Likelihood构建的图谱乱序标记较少,与Fixed Order的结果更为接近.研究结果表明,Joinmap的Maximum Likelihood算法更适合于高密度的SNP标记的图谱构建.
关键词
大豆
单核苷酸多态性
大豆遗传连锁图谱
算法
Keywords
soybean
single nucleic polymorphism
soybean genetic linkage group
algorithm
分类号
S565.1 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
大豆抗胞囊线虫病种质rhg_1和Rhg_4位点的单核苷酸多态性(SNPs)
邱丽娟
常汝镇
王文辉
perry cregan
Dechun Wang
Yiwu Chen
马凤鸣
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
2003
19
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
大豆高密度SNP标记遗传图谱构建方法的比较
谭瑞娟
文自翔
顾翠华
王德春
宋启建
perry cregan
邢小萍
李洪连
《河南农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013
3
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职称材料
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