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有一未配对残基T的DNA [d(TCGCGCG)]_2结构特征的NMR研究
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作者 张友杰 王可玉 p.n.borer 《中国科学(B辑)》 CSCD 北大核心 1994年第1期23-28,共6页
具有交替的嘧啶-嘌呤序列和5′端有一未配对残基T的DNA七聚体[d(TCGCGCG)]_2可以作为研究DNA双螺旋的双链-单链联结构象特征的模本。DNA的这种联结方式存在于它们的复制和转录过程中。用NOESY和TOCSY/HOHAHA实验对其共振峰作了指定。对... 具有交替的嘧啶-嘌呤序列和5′端有一未配对残基T的DNA七聚体[d(TCGCGCG)]_2可以作为研究DNA双螺旋的双链-单链联结构象特征的模本。DNA的这种联结方式存在于它们的复制和转录过程中。用NOESY和TOCSY/HOHAHA实验对其共振峰作了指定。对七个不同混合时间的NOE强度进行了定量分析,用双自旋近似法计算了质子间的距离,揭示了这个分子中令人感兴趣的结构特征。用P.E.COSY实验测定了该DNA双螺旋各糖质子间偶合常数,鉴定了各糖的构象。从而获得了该DNA七聚体在溶液中的结构特征。就整体结构而言,该DNA分子仍属B族DNA,但结构有了很大变化,特别是在端基区。未配对的残基具有不同寻常的顺式构象。为DNA双链-单链联结部分构象提供了有用的借鉴。 展开更多
关键词 DNA 构象 NMR 七聚核甙酸
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DNA的^(13)C化学位移与其链间嘌呤-嘌呤碰撞的相关性
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作者 张友杰 王可玉 +1 位作者 p.n.borer G.C.Levy 《中国科学(B辑)》 CSCD 北大核心 1991年第12期1259-1266,共8页
本文发现并间接证实了DNA的^(13)C化学位移与其结构参数(主轴螺旋扭曲角Ω,碱基平面滚动角ρ,主链扭曲角δ和螺旋浆式扭曲角ω)之间存在着相关性,文中阐明了与这些结构参数相关的碳及其理论上的解释。这些碳的化学位移相对变化明显地反... 本文发现并间接证实了DNA的^(13)C化学位移与其结构参数(主轴螺旋扭曲角Ω,碱基平面滚动角ρ,主链扭曲角δ和螺旋浆式扭曲角ω)之间存在着相关性,文中阐明了与这些结构参数相关的碳及其理论上的解释。这些碳的化学位移相对变化明显地反映出DNA链间嘌呤-嘌呤碰撞(立体障碍)所引起的DNA双螺旋局部结构的变化,并与Calladine-Dickerson加和函数Σ作了比较。从DNA的^(13)C NMR谱可以得到有关其构象的信息,从而有可能通过^(13)C谱观测DNA在溶液中的Ω,ρ,δ和ω等结构参数。 展开更多
关键词 脱氧核糖核酸 NMR 嘌呤 碰撞
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THE CORRELATION BETWEEN ^(13)C CHEMICAL SHIFTS OF DNA AND INTERSTRAND PURINE-PURINE CLASH
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作者 张友杰 王可玉 +1 位作者 p.n.borer G.C.LEVY 《Science China Chemistry》 SCIE EI CAS 1992年第12期1416-1424,共9页
The correlation between ^(13)C chemical shifts of DNA and structure parameters (the mainaxis helix twist angle Ω, base--plane roll angle ρ, main chain torsion angle δ and pro-peller twist angle ω) has been discove... The correlation between ^(13)C chemical shifts of DNA and structure parameters (the mainaxis helix twist angle Ω, base--plane roll angle ρ, main chain torsion angle δ and pro-peller twist angle ω) has been discovered and proved indirectly. The carbons relating tothe structure parameters have been found and interpreted theoretically. Relative variationsin chemical shifts of these carbons obviously reflect purine-purine clash (steric hindrance)and have been compared with sum functions Σ of Calladine--Dickerson rules. It would bepossible to provide the information about conformation of DNA from ^(13)C NMR spectra andto observe the structure parameters of Ω,ρ,δ and ω of DNA in solution. 展开更多
关键词 DNA ^(13)C NMR purine-purine clash Calladine-Dickerson rules
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