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茄子全基因组SNP标记的开发
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作者 肖熙鸥 聂珩 +1 位作者 林文秋 吴彩玉 《园艺学报》 北大核心 2025年第1期88-100,共13页
茄子(Solanum melongena L.)是中国重要的茄科蔬菜之一,其具有十分丰富的遗传多样性,对茄子种质资源进行精准评价是利用茄子种质资源的基础。利用40份茄子(Solanum melongena L.)种质资源的重测序数据,筛选了268个SNP位点用于五引物扩... 茄子(Solanum melongena L.)是中国重要的茄科蔬菜之一,其具有十分丰富的遗传多样性,对茄子种质资源进行精准评价是利用茄子种质资源的基础。利用40份茄子(Solanum melongena L.)种质资源的重测序数据,筛选了268个SNP位点用于五引物扩增受阻突变体系(penta-primer amplification refractory mutation system,PARMS)-SNP标记的开发,成功获得原创性的120个PARMS-SNP标记。利用这些标记对224份茄子高代自交系进行基因分型,并进一步进行群体结构、PCA主成分分析和遗传树分析。结果表明该224份材料可以分为两个组。同时根据多态性信息含量(polymorphic information content,PIC)值筛选了48个核心PARMS-SNP标记,并且构建了能够将224份材料进行区分的指纹图谱。 展开更多
关键词 茄子 SNP标记 遗传多样性分析 指纹图谱
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利用酵母双杂交筛选菠萝AcSWEET11的互作蛋白 被引量:1
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作者 林文秋 刘胜辉 +3 位作者 张秀梅 张红娜 李运合 吴青松 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2024年第9期1791-1800,共10页
SWEET(sugars will eventually be exported transporter)基因在植物开花过程中具有重要的作用,但AcSWEET11在菠萝成花中的作用机制尚不清楚。通过鉴定成花过程中与AcSWEET11的互作蛋白,为菠萝成花机制的解析奠定基础。本研究利用共转... SWEET(sugars will eventually be exported transporter)基因在植物开花过程中具有重要的作用,但AcSWEET11在菠萝成花中的作用机制尚不清楚。通过鉴定成花过程中与AcSWEET11的互作蛋白,为菠萝成花机制的解析奠定基础。本研究利用共转化的方法在菠萝成花过程的cDNA膜文库中筛选AcSWEET11的互作蛋白,分析候选蛋白的表达量。结果表明,pBT3-STE-AcSWEET11+pPR3-N对NMY51酵母细胞无毒性,但有自激活活性。进一步研究结果显示,在TDO/3?AT培养基和QDO培养基上自激活受到抑制。利用该系统筛选到了81个阳性克隆,经测序鉴定出48个与AcSWEET11互作的候选蛋白,包括E3 ubiquitin-protein ligase RING1-like、Trehalose-phosphate synthase 7、Cytochrome P450、TranscriptionfactorLUX等。GO和KEGG分析结果显示,48个蛋白主要分布在细胞进程、代谢过程、刺激反应和催化活性等生物过程,参与脂类代谢、氨基酸代谢和碳水化合物代谢、信号转导和运输与分解代谢等新陈代谢途径。Trehalose-phosphate synthase 7(XP_020105459.1)、Protein TIFY 3-like(XP_020082835.1)、40S ribosomal protein S27(XP_020092770.1)、Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like(XP_020112516.1)等4个基因与AcSWEET11表达趋势一致,在菠萝成花过程中下调表达;Dihydrolipoyl dehydrogenase 2(XP_020113798.1)、Putative lipid-transfer protein DIR1(XP_020086640.1)、clathrin assembly protein At4g32285(XP_020108161.1)等3个基因在菠萝成花过程中上调表达。这些结果表明,AcSWEET11可能通过与Trehalose-phosphatesynthase7等蛋白发生互作,参与菠萝成花过程。本研究进一步丰富了AcSWEET11的蛋白互作网络,为AcSWEET11在菠萝成花中的调控机制的解析奠定基础。 展开更多
关键词 菠萝 AcSWEET11 酵母双杂交 互作蛋白
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菠萝新品种‘金筒菠萝’
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作者 何业华 刘朝阳 +13 位作者 栾爱萍 龚雪 刘佳柔 张伟 林顺权 胡桂兵 刘成明 夏靖娴 林文秋 陈程杰 谢桃 马均 何坚驰 陈少华 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期453-454,共2页
‘金筒菠萝’是从广东省中山市‘神湾’菠萝的无性繁殖群体中通过单株选择育成的菠萝新品种,丰产稳产,果实短筒形,平均单果质量720 g,果皮、果肉金黄,肉质爽脆,香气浓郁,纤维含量少,果心较爽脆,适宜广东省菠萝产区种植。定植第二年产量... ‘金筒菠萝’是从广东省中山市‘神湾’菠萝的无性繁殖群体中通过单株选择育成的菠萝新品种,丰产稳产,果实短筒形,平均单果质量720 g,果皮、果肉金黄,肉质爽脆,香气浓郁,纤维含量少,果心较爽脆,适宜广东省菠萝产区种植。定植第二年产量约37 485 kg·hm^(-2)。 展开更多
关键词 菠萝 品种
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乙烯利对5个菠萝品种成花及品质的影响 被引量:1
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作者 普跃 林文秋 +6 位作者 刘朝阳 刘胜辉 吴青松 孙伟生 陆新华 高玉尧 贺军军 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期505-516,共12页
【目的】筛选出不同菠萝品种适宜的乙烯利催花质量浓度,为菠萝成熟期调节及新品种推广提供参考依据。【方法】利用25~1000 mg·L^(-1)乙烯利对Josapine、台农4号、MD-2、台农21号和台农22号5个菠萝品种进行灌心处理,探究不同乙烯利... 【目的】筛选出不同菠萝品种适宜的乙烯利催花质量浓度,为菠萝成熟期调节及新品种推广提供参考依据。【方法】利用25~1000 mg·L^(-1)乙烯利对Josapine、台农4号、MD-2、台农21号和台农22号5个菠萝品种进行灌心处理,探究不同乙烯利质量浓度对各菠萝品种成花率、抽蕾期、果实内外品质及畸形率的影响。【结果】除台农22号外,各菠萝品种随着乙烯利质量浓度的增加成花率显著提升。其中,Josapine和台农4号诱导成花的最佳质量浓度为400 mg·L^(-1),MD-2和台农21号诱导成花的最佳质量浓度为800 mg·L^(-1)。当处理质量浓度大于400 mg·L^(-1)时,Josapine、台农4号和台农21号抽蕾期进一步缩短,MD-2抽蕾期则逐渐延长。当乙烯利质量浓度大于200 mg·L^(-1)时,Josapine、MD-2和台农22号纵横径、单果质量等形态指标呈下降趋势。随着乙烯利质量浓度的升高,各品种可滴定酸含量呈下降趋势;相反地,可溶性固形物含量随质量浓度的升高呈上升的趋势。此外,5个菠萝品种在乙烯利诱导下均有畸形果产生,其中Josapine在高质量浓度乙烯利作用下,畸形率最高,达到65.52%,而MD-2畸形率仅为6.67%。【结论】Josapine最适乙烯利催花质量浓度为400 mg·L^(-1);台农4号、MD-2和台农21号最适质量浓度为800 mg·L^(-1);而单一乙烯利不能诱导台农22号成花。 展开更多
关键词 菠萝 乙烯利 成花 抽蕾期 品质
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Synthesis of Pt/PMA-MIL-101 Catalyst and Its Performance in n-Heptane Isomerization
5
作者 Zhang Wei Guo Qiang +5 位作者 Wang Yingjun Suo Yanhua lin wenqiu Hu Tengyu Li Tong Liu Shetian 《China Petroleum Processing & Petrochemical Technology》 SCIE CAS CSCD 2024年第3期63-72,共10页
Hydroisomerization of n-heptane is an efficient method for producing gasoline with a high octane number.The focus of this study was to find a highly efficient catalyst that could both promote the conversion of n-hepta... Hydroisomerization of n-heptane is an efficient method for producing gasoline with a high octane number.The focus of this study was to find a highly efficient catalyst that could both promote the conversion of n-heptane and inhibit the cracking side reaction.MIL-101(Cr)is a chromium-based metal-organic framework(MOF)with good hydrothermal stability,and exhibits a three-dimensional pore structure that is similar to that of zeolites.Using phosphomolybdic acid(PMA;H3PMo12O40·xH2O)can increase the number of Brønsted acid sites on MIL-101(Cr),which contributes to improving the catalytic performance during isomerization.In this study,0.4%Pt/PMA-MIL-101(Cr)catalyst was successfully crystallized at 220℃using a hydrothermal synthetic method.The results showed that the synthesized samples were mesoporousmicroporous composite materials with the typical octahedral structure,and the MIL-101(Cr)framework was not damaged following modification with PMA.It was found that 0.4%Pt30%PMA-MIL-101(Cr)exhibited the best performance for isomerization of n-heptane,with a conversion rate and selectivity at 260°C of 47.6%and 96.6%,respectively.After five hours of reaction,the conversion rate and selectivity of the catalyst remained above 38%and 80%,respectively. 展开更多
关键词 MIL-101(Cr) N-HEPTANE ISOMERIZATION phosphomolybdic acid CATALYSIS
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菠萝对乙烯利诱花的敏感性差异研究 被引量:14
6
作者 张红娜 刘胜辉 +5 位作者 孙伟生 李运合 孙光明 林文秋 张秀梅 吴青松 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2018年第6期1087-1094,共8页
为了解造成2种不同类型菠萝品种对乙烯敏感性差异的发生环节,进一步揭示乙烯促进菠萝成花的分子机制,本研究以乙烯敏感型‘巴厘’菠萝品种和乙烯钝感型‘台农16’菠萝品种为试材,对乙烯催花过程中成花基因及乙烯信号转导途径中乙烯受体... 为了解造成2种不同类型菠萝品种对乙烯敏感性差异的发生环节,进一步揭示乙烯促进菠萝成花的分子机制,本研究以乙烯敏感型‘巴厘’菠萝品种和乙烯钝感型‘台农16’菠萝品种为试材,对乙烯催花过程中成花基因及乙烯信号转导途径中乙烯受体、信号转导和核内调控等过程涉及基因的表达特征进行了分析。结果表明:Ac ERS1a、Ac ETR2a、Ac ETR2b、Ac CTR1、Ac ENI2和Ac ERFs等基因在2种成花类型中的差异可能是导致2个品种对乙烯信号感知敏感度不同的重要原因;Ac ERS1a、Ac ERS1b、Ac ETR2a和Ac ETR2b等乙烯受体可能参与乙烯诱导菠萝成花信号的感知,然后通过Ac CTR1下调和Ac ENI2上调将信号转导至核内调控基因(Ac EIN3和Ac ERFs),从而启动菠萝成花关键基因Ac FT和花器官形态建成重要基因Ac AP1的表达,引起菠萝成花的生物学效应,这将为进一步阐明乙烯诱导菠萝成花的分子机制提供参考,也为利用基因工程手段开展菠萝新品种选育奠定了基础。 展开更多
关键词 菠萝 乙烯 信号转导 受体 基因表达
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马铃薯TCP基因家族全基因组鉴定与分析 被引量:4
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作者 肖熙鸥 林文秋 +4 位作者 冯雪峰 高晓敏 邹华芬 李可 金辉 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2018年第24期7933-7938,共6页
TCP (Teosinte branched1/Cincinnata/proliferating cell factor)是植物特有的转录因子,在植物的生长发育过程中发挥着重要的作用。马铃薯(Solanum tuberosum L.)是世界范围重要的粮食作物,有着重要的价值。为研究马铃薯StTCPs基因家... TCP (Teosinte branched1/Cincinnata/proliferating cell factor)是植物特有的转录因子,在植物的生长发育过程中发挥着重要的作用。马铃薯(Solanum tuberosum L.)是世界范围重要的粮食作物,有着重要的价值。为研究马铃薯StTCPs基因家族子在马铃薯基因组中的数量与分布,本研究利用生物信息学方法,对马铃薯St TCPs家族成员进行全基因组鉴定,并且对其基因结构,染色体定位以及进化关系进行预测和分析。研究结果表明,马铃薯StTCPs家族共包含43个成员,可以分为ClassⅠ和ClassⅡ两类。染色体定位结果表明,马铃薯StTCPs不均匀地分布于11条染色体上,其中3号染色体分布的成员最多,包含10个家族成员。蛋白结构分析表明,StTCPs包含一个b-HLH结构域。本研究系统的分析了马铃薯StTCPs基因家族成员,为其后续功能的研究提供了良好的基础。 展开更多
关键词 马铃薯(Solanum tuberosum) TCP转录因子 全基因组检索
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茄子PARMS反应体系的建立与优化 被引量:3
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作者 肖熙鸥 赵秋芳 +3 位作者 林文秋 欧雄常 冯恩友 莫定鸣 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2021年第18期6074-6079,共6页
本研究基于茄子自交系WT和L6-5重测序数据设计SNP特异引物,通过对反应体积、DNA用量和引物浓度等参数进行优化,建立了茄子PARMS(Penta-primer amplification re-fractory mutation system)SNP分型体系。研究结果表明最佳反应体系为6μL... 本研究基于茄子自交系WT和L6-5重测序数据设计SNP特异引物,通过对反应体积、DNA用量和引物浓度等参数进行优化,建立了茄子PARMS(Penta-primer amplification re-fractory mutation system)SNP分型体系。研究结果表明最佳反应体系为6μL,其中1μL DNA模板(10~100 ng/μL),3μL PARMS mix(2×),0.45μL引物混合物(100μmol/L),1.55μL ddH2O。利用WT和L6-5的F2群体验证该体系的稳定性,获得了较好的SNP分型结果。本研究建立的PARMS-SNP分型体系,为开展茄子种质资源遗传多样性分析、基因定位、指纹图谱构建和分子标记辅助选择等提供了技术支持。 展开更多
关键词 茄子 SNP PARMS 反应体系优化
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利用HPLC分析菠萝愈伤组织DNA甲基化水平 被引量:2
9
作者 林文秋 肖熙鸥 +4 位作者 张红娜 刘胜辉 孙伟生 李运合 吴青松 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2018年第11期2220-2224,共5页
建立菠萝DNA甲基化水平的HPLC测定方法,分析菠萝愈伤组织DNA甲基化水平变化,为进一步研究菠萝体细胞无性系变异机理奠定基础。通过对流动相和水解温度等条件的优化,建立菠萝DNA甲基化水平的检测方法。结果表明,分离C和5m-C的最佳流动相... 建立菠萝DNA甲基化水平的HPLC测定方法,分析菠萝愈伤组织DNA甲基化水平变化,为进一步研究菠萝体细胞无性系变异机理奠定基础。通过对流动相和水解温度等条件的优化,建立菠萝DNA甲基化水平的检测方法。结果表明,分离C和5m-C的最佳流动相为甲醇∶磷酸二氢钾∶三乙胺为10∶90∶0.2(V/V),pH 3.0,DNA的最佳水解温度为90℃。利用此体系分析菠萝愈伤组织和胚性愈伤组织的DNA甲基化变化,结果表明,菠萝愈伤组织在分化过程中DNA总甲基化水平呈动态变化,变化范围为5.14%~96.86%。此外,胚性愈伤组织甲基化水平低于非胚性愈伤组织。推测DNA甲基化影响菠萝愈伤组织的分化及胚性愈伤组织的形成。 展开更多
关键词 菠萝 愈伤组织 DNA甲基化 HPLC
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茄子Enhanced disease susceptibility 1互作蛋白的初步筛选与分析 被引量:2
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作者 肖熙鸥 林文秋 +4 位作者 李可 冯雪峰 李威 邹华芬 金辉 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2018年第8期1580-1584,共5页
前期研究表明,茄子Enhanced disease susceptibility 1(SmEDS1)正调控茄子青枯病抗性,但是其抗病机理有待进一步研究。为筛选SmEDS1的互作蛋白,本研究构建pGBK7-SmEDS1诱饵载体,并利用酵母双杂交技术对相应的均一化cDNA酵母文库进行筛... 前期研究表明,茄子Enhanced disease susceptibility 1(SmEDS1)正调控茄子青枯病抗性,但是其抗病机理有待进一步研究。为筛选SmEDS1的互作蛋白,本研究构建pGBK7-SmEDS1诱饵载体,并利用酵母双杂交技术对相应的均一化cDNA酵母文库进行筛选。从2次独立的实验中筛选到9个克隆,其非冗余地编码6种蛋白,即TCP转录因子、DNAJ分子伴侣、SnRK1蛋白α亚基、氰酸酯酶、CIP4蛋白和1个未知蛋白。基于这些蛋白的功能,推测SmEDS1可能通过与本研究筛选到TCP转录因子互作调控水杨酸的合成,进而调控茄子的青枯病抗性。 展开更多
关键词 茄子 EDS1 互作蛋白 青枯病
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菠萝离体再生植株的遗传稳定性及DNA甲基化分析 被引量:1
11
作者 林文秋 肖熙鸥 +4 位作者 刘胜辉 孙伟生 吴青松 姚艳丽 张秀梅 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2022年第11期3623-3633,共11页
为了探讨菠萝再生植株的遗传及表观遗传变异情况,本研究以‘台农21号’菠萝再生植株为试材,利用流式细胞技术(FCM)、简单重复序列(SSR)和甲基化敏感扩增多态性(MSAP)分析DNA序列、染色体倍性及DNA甲基化的变化。结果表明:再生植株存在... 为了探讨菠萝再生植株的遗传及表观遗传变异情况,本研究以‘台农21号’菠萝再生植株为试材,利用流式细胞技术(FCM)、简单重复序列(SSR)和甲基化敏感扩增多态性(MSAP)分析DNA序列、染色体倍性及DNA甲基化的变化。结果表明:再生植株存在叶刺、花序颜色等性状的变异。进一步分析结果表明,仅有1株出现了染色体非整倍加倍,其变异率为2.27%。检测到39条条带具有多态性,多态性比率为16.66%,其相似系数为0.84~1.00。再生植株DNA甲基化水平(总甲基化率53.53%~61.34%)低于母株(总甲基化率为67.90%),且同时存在甲基化(甲基化率7.50%~21.29%)和去甲基化(去甲基化率18.47%~39.05%)的模式,但以去甲基化为主。可见,组培环境能够诱导菠萝再生植株发生遗传及DNA甲基化的变异,但以DNA甲基化变异为主。本研究将为菠萝工厂化育苗及新种质的创制提供基础。 展开更多
关键词 菠萝 再生植株 染色体倍性 多态性 DNA甲基化
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pBBR1MCS2-Tac-EGFP广宿主载体适宜标记Ralstonia solanacearum 被引量:1
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作者 肖熙鸥 林文秋 +3 位作者 陈卓 邹春香 金辉 邹华芬 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2021年第6期1700-1705,共6页
利用标记基因追踪病原菌在植物体内的入侵和定殖,是研究病原菌-寄主互作的重要手段。本研究利用电转化法将广宿主载体pBBR1MCS2-Tac-EGFP导入青枯雷尔氏菌(Ralstonia solanacearum)GMI1000菌株中,获得了青枯雷尔氏菌带绿色荧光标记的转... 利用标记基因追踪病原菌在植物体内的入侵和定殖,是研究病原菌-寄主互作的重要手段。本研究利用电转化法将广宿主载体pBBR1MCS2-Tac-EGFP导入青枯雷尔氏菌(Ralstonia solanacearum)GMI1000菌株中,获得了青枯雷尔氏菌带绿色荧光标记的转化子。转接试验结果表明,转化子的抗生素抗性和绿色荧光强度有良好的遗传稳定性。pBBR1MCS2-Tac-EGFP不影响GMI1000菌株的致病力,且EGFP蛋白能够在植物中稳定表达。灌根法接种试验结果表明,病原菌在第1天即完成对根系的侵染,并在第6天扩散至其他组织,随后造成植株萎蔫。研究结果表明所获转化子可用于后续的病原菌侵染机理等方面的研究。 展开更多
关键词 青枯雷尔氏菌 绿色荧光标记 侵染动态 pBBR1MCS2-Tac-EGFP载体
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菠萝果眼形成的组织形态学观察 被引量:3
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作者 吴竞 何业华 +11 位作者 张伟 刘朝阳 龚雪 薛彪 刘佳柔 栾爱萍 林文秋 甘吉昌 钟乙中 廖志婵 邱梦青 李晶晶 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期293-303,共11页
以不同菠萝种质的顶芽、花和果实为材料,通过组织切片和解剖观察果眼形成过程,测定和分析果眼相关组织器官的动态变化。菠萝果眼形成过程分为花腔分化、花腔发育和果眼发育3个阶段。花腔是果眼的早期形态,其分化和发育过程约需70d;而坐... 以不同菠萝种质的顶芽、花和果实为材料,通过组织切片和解剖观察果眼形成过程,测定和分析果眼相关组织器官的动态变化。菠萝果眼形成过程分为花腔分化、花腔发育和果眼发育3个阶段。花腔是果眼的早期形态,其分化和发育过程约需70d;而坐果标志着果眼发育阶段的起始。花腔形态分化是从花萼分化开始,至花盘(含花托和子房)分化结束;催花后14 d顶芽基部首先出现花萼原基分化,自下而上,35 d时花腔分化结束,花序顶部花腔形态分化完成时间比基部迟7 d左右。形态分化完成后进入花腔发育阶段,催花36~42 d是花腔膨大高峰期,此时深、浅果眼品种的花腔深度开始出现显著差异,此后膨大逐渐减缓;品种间花盘的绝对生长量相差不大,花腔的加深主要取决于花萼的生长。坐果后进入果眼发育期,随着果实迅速膨大,萼筒背腹面生长不均衡,宿萼向内弯曲;但宿萼弯曲速度和生长停止时间因品种而异,浅果眼品种‘MD-2’宿萼伸长生长量小、内弯迅速,深果眼品种‘金筒’宿萼则生长量较大、内弯缓慢。果眼加深主要在坐果后14 d内,坐果约70 d时果眼的形态和大小已不再变化。根据成熟果实中部果眼的深浅,可将菠萝种质划分为浅(果眼深<0.9 cm)、中(果眼深0.9~1.2 cm)、深(果眼深> 1.2 cm)3个类型;不同类型品种间花盘深度没有明显差异(约0.29 cm),果眼深浅差异主要由宿萼高度的不同引起,而宿萼的弯曲程度和生长量是导致类型间宿萼高度及小果凸出度出现差异的主要原因。因此,菠萝果眼形成始于花芽分化,花萼生长发育对果眼的形态和深浅产生重大影响,品种间果眼形态差异主要由坐果14d内萼筒部背腹面生长量不均衡引起,而果眼深浅差异主要发生在花萼发育的前7 d(催花36~42 d)。 展开更多
关键词 菠萝 花腔分化 果眼 花萼
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矮凤梨短营养生长期突变材料‘14-1’的性状鉴定 被引量:2
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作者 栾爱萍 贺军虎 +6 位作者 刘佳柔 龚雪 方少秋 夏靖娴 林文秋 许文天 何业华 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期143-148,共6页
菠萝栽培种(Ananas comosus var. comosus)的营养生长期较长,制约了其新品种选育效率。收集和筛选营养生长期较短的种质,可为短营养生长期菠萝新品种的选育创制中间材料。从境外收集了23份易成花的野生种质材料,自2008年起进行栽培、繁... 菠萝栽培种(Ananas comosus var. comosus)的营养生长期较长,制约了其新品种选育效率。收集和筛选营养生长期较短的种质,可为短营养生长期菠萝新品种的选育创制中间材料。从境外收集了23份易成花的野生种质材料,自2008年起进行栽培、繁殖和性状鉴定。通过对营养生长期的比较和观察,从矮凤梨(A. comosus var. nanus)的体胚苗中发现了1份营养生长期显著缩短的突变材料‘14-1’,其营养生长期约6个月(原品种约12个月),1年开花2次,具有极易成花等特点。‘14-1’无性繁殖后代遗传性状稳定,可作为短营养生长期菠萝育种的亲本资源。 展开更多
关键词 矮凤梨 短营养生长期 性状鉴定 体细胞胚发生 突变材料
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CRISPR/Cas9基因编辑技术在果树作物中的应用研究进展 被引量:6
15
作者 何玉坤 欧阳嫣惟 +3 位作者 张秀梅 林文秋 潘晓璐 张红娜 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期870-881,共12页
成簇规律间隔短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)/CRISPR相关蛋白9(Cas9)已成为一种有价值的基因组编辑工具,能够在特定选择的位点改变DNA序列,可以在作物基因组的靶点位置精确地实现... 成簇规律间隔短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)/CRISPR相关蛋白9(Cas9)已成为一种有价值的基因组编辑工具,能够在特定选择的位点改变DNA序列,可以在作物基因组的靶点位置精确地实现删除、替换或插入特定序列,引入理想的目标性状。该工具具有简单、高效、成本低以及功能强大等特性,在柑橘、葡萄、香蕉和草莓等果树中已实现多种类型的应用,包含产生白化表型、调控童期和花期、调控果实品质以及创造矮化和抗病虫害品种等。综述了CRISPR/Cas9系统及其作用过程,介绍了新开发的精准编辑技术,包括单碱基编辑器、引导编辑及CRISPR/Cpf1多基因编辑系统,并详细阐述了CRISPR/Cas9系统在果树基因组编辑中的应用进展,包括果树种类、目标基因及目标性状等,归纳了CRISPR/Cas9系统实现高效编辑所遇到的遗传转化和再生体系、脱靶效应和启动子选择问题,最后提出了不断优化遗传转化和再生体系、合理选择靶位点和设计sgRNA、植物内源启动子及新编辑技术的解决策略。 展开更多
关键词 果树 CRISPR/Cas9 基因编辑
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利用SALF-seq简化基因组测序分析茄子种质资源遗传多样性 被引量:4
16
作者 冯恩友 肖熙鸥 +3 位作者 林文秋 莫定鸣 冯晓赓 马飞骏 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2022年第23期7940-7949,共10页
为研究茄子种质资源的亲缘关系,本研究利用SLAF-seq (Specific-Locus Amplified Fragment Sequencing)简化基因组测序对40份茄子高代自交系进行简化基因组测序,利用获得的SNP (Single nucleotide polymorphism)标记进行遗传结构分析。... 为研究茄子种质资源的亲缘关系,本研究利用SLAF-seq (Specific-Locus Amplified Fragment Sequencing)简化基因组测序对40份茄子高代自交系进行简化基因组测序,利用获得的SNP (Single nucleotide polymorphism)标记进行遗传结构分析。本研究共获得700 639个SLAF标签和1 248 593 SNPs。结果表明,SNP数量在每条染色体上和同一条染色上的不同位置差异较大,注释结果表明SNP和InDel主要发生在基因间隔区。利用获得的SNPs多样性可以将40份材料分为3个类群。SNP分类结果与根据青枯病抗性分类结果基本一致,而与根据果形果色分类结果不一致,通过筛选,获得了高质量的122个perfect SNPs。本研究结果为杂组合的选配提供了参考,同时所开发的SNP位点为KSAP高通量基因分型奠定了良好的基础。 展开更多
关键词 茄子 SLAF-seq 遗传多样性 SNP位点
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菠萝PARMS反应体系的建立 被引量:1
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作者 高云飞 林文秋 +4 位作者 吴青松 张秀梅 孙伟生 刘胜辉 姚艳丽 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2023年第2期225-232,共8页
单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)广泛分布在植物的基因组中,具有丰富的DNA变异形式。基于单核苷酸多态性开发的标记被认为是极具应用前景的分子标记。五引物扩增受阻突变体系(Penta-primer amplification re-fracto... 单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)广泛分布在植物的基因组中,具有丰富的DNA变异形式。基于单核苷酸多态性开发的标记被认为是极具应用前景的分子标记。五引物扩增受阻突变体系(Penta-primer amplification re-fractory mutation system,PARMS)是一种基于单核苷酸多态性的新型基因分型技术,具有通量高、准确性高、成本低和耗时短等优点。因此,建立高效、简便可行的PARMS分型技术对菠萝种质资源的鉴定、基因定位的开展以及分子辅助选择育种体系的建立具有重要意义。本研究以3份表型差异显著的菠萝种质资源为材料,基于130份菠萝种质资源的重测序数据分析结果,设计特异引物SNP31。结果显示,SNP31可将菠萝种质资源进行较好地分型,可用于后续反应体系的优化。为了建立适用于菠萝的PARMS-SNP分型体系,对PARMS的反应体积、引物浓度、DNA的提取方法和DNA浓度等参数进行优化。研究结果表明,反应体积、引物浓度以及DNA的浓度均能影响基因型信号点的荧光信号值。在较大或较小的反应体积下基因型信号点的荧光信号值均降低,最适的反应体积为6μL。随着引物和DNA浓度的增加,基因型信号点的荧光信号值增加,最佳的引物和DNA浓度分别为100μmol/L和25 ng/μL。此外,不同基因组DNA的提取方法均能对3份种质实现较好的PARMS-SNP分型。因此,PARMS-SNP分型体系的最佳反应体系为:反应总体积6μL,DNA(25 ng)1μL,PARMS mix 3μL,Primer mix(100μmol/L)0.45μL,ddH2O 1.55μL。利用65份菠萝种质资源验证该体系的准确性和稳定性,获得了较好的PARMS-SNP分型结果。本研究建立的PARMS-SNP分型体系为开展菠萝种质资源遗传多样性分析、遗传图谱的构建、基因定位及分子标记辅助选择提供基础。 展开更多
关键词 菠萝 SNP PARMS 反应体系
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以反复心力衰竭及肾周感染为特征的免疫球蛋白G4相关疾病1例
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作者 蔡凤丹 杨海峰 +3 位作者 林文秋 梁嘉华 陈雪吟 包崑 《安徽医药》 CAS 2021年第12期2466-2470,共5页
目的探讨免疫球蛋白G4(IgG4)相关疾病(IgG4-related disease,IgG4-RD)的临床表现、诊断和治疗。方法回顾分析2020年1月广州中医药大学第二附属医院收治的1例IgG4-RD病人的临床资料,并结合文献进行探讨总结。结果该51岁男性病人主要以反... 目的探讨免疫球蛋白G4(IgG4)相关疾病(IgG4-related disease,IgG4-RD)的临床表现、诊断和治疗。方法回顾分析2020年1月广州中医药大学第二附属医院收治的1例IgG4-RD病人的临床资料,并结合文献进行探讨总结。结果该51岁男性病人主要以反复心力衰竭及肾周感染为起病表现,经颌下肿物、肾活检穿刺确诊为IgG4-RD,通过激素治疗后症状改善出院,经随访复查病人血肌酐水平由725μmol/L降至107μmol/L,心脏射血分数由68%上升至75%,提示病人心、肾功能均有所恢复未再复发。结论IgG4-RD可累及多个器官损害,临床表现多样,容易混淆,诊断难度大,而反复心力衰竭发作亦可能作为IgG4-RD的早期起病表现,因此,在临床诊疗中应注意鉴别,减少误诊。 展开更多
关键词 自身免疫疾病 心力衰竭 肾周炎 肾功能不全 免疫球蛋白G4相关疾病 感染 心血管
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铁催化甲烷无氧裂解制氢和碳纳米材料研究进展 被引量:2
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作者 林文秋 马守涛 +6 位作者 崔艳红 姜震 张微 刘金艳 郭强 所艳华 汪颖军 《化学与粘合》 CAS 2022年第6期522-527,共6页
随着国家对空气质量和环保要求的日渐提高,能高效制氢且不会产生污染空气造成温室效应的制氢工艺是实现碳减排的有效手段。甲烷催化分解是一种无氧裂解制氢技术,也是甲烷的低温裂解。甲烷裂解的最终产物是氢和固体碳,能有效减少碳氢化... 随着国家对空气质量和环保要求的日渐提高,能高效制氢且不会产生污染空气造成温室效应的制氢工艺是实现碳减排的有效手段。甲烷催化分解是一种无氧裂解制氢技术,也是甲烷的低温裂解。甲烷裂解的最终产物是氢和固体碳,能有效减少碳氢化合物的产生。在过渡金属催化剂中,铁能在高温下保持稳定,促使甲烷裂解朝正反应方向进行,并会产生高附加值的薄壁碳纳米管。综述了甲烷裂解制氢的优点、铁基催化剂类型、反应器类型以及催化剂再生方法。 展开更多
关键词 铁基催化剂 甲烷裂解 碳纳米管
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镍基催化剂催化甲烷裂解制氢研究进展 被引量:1
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作者 刘金艳 马守涛 +6 位作者 姜震 崔艳红 张微 郭强 林文秋 所艳华 汪颖军 《化学与粘合》 CAS 2023年第1期66-69,89,共5页
满足碳氢化合物零排放的甲烷裂解制氢工艺对我国2030年达成碳达峰目标和2060年实现碳中和具有重要意义,而该工艺最常用的催化剂(镍基催化剂)反应后产生的积碳的形貌仍不可控,因此,综述了不同种类的金属助剂对镍基催化剂的性能和形成的... 满足碳氢化合物零排放的甲烷裂解制氢工艺对我国2030年达成碳达峰目标和2060年实现碳中和具有重要意义,而该工艺最常用的催化剂(镍基催化剂)反应后产生的积碳的形貌仍不可控,因此,综述了不同种类的金属助剂对镍基催化剂的性能和形成的碳纳米材料的性质和形貌的影响,展望了今后镍基催化剂催化甲烷裂解制氢的研究重点。 展开更多
关键词 甲烷裂解 氢气 催化剂 碳纳米材料
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