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水稻籽粒镉积累QTL定位及候选基因分析 被引量:7
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作者 潘晨阳 叶涵斐 +8 位作者 周维永 王盛 李梦佳 路梅 李三峰 朱旭东 王跃星 饶玉春 戴高兴 《植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期25-32,共8页
水稻(Oryzasativa)是全世界重要的经济作物之一,稻田镉(Cd)污染和镉积累问题严重威胁世界水稻的产量和品质以及人类健康,如何降低水稻中镉积累已成为热点问题。以籼稻品种华占(HZ)为父本、粳稻品种热研2号(Nekken2)为母本,连续自交多代... 水稻(Oryzasativa)是全世界重要的经济作物之一,稻田镉(Cd)污染和镉积累问题严重威胁世界水稻的产量和品质以及人类健康,如何降低水稻中镉积累已成为热点问题。以籼稻品种华占(HZ)为父本、粳稻品种热研2号(Nekken2)为母本,连续自交多代后得到120个重组自交系群体,对其镉积累进行检测和分析,同时利用遗传图谱进行QTL作图。结果共检测到7个QTLs,分别位于水稻第2、3、9和12号染色体上,其中1个LOD值高达4.97。对这些QTL区间内与耐金属离子胁迫相关的候选基因进行定量分析,发现LOCOs02g50240、LOCOs02g52780、LOCOs09g31200、LOCOs09g35030和LOCOs09g37949这5个基因在双亲间的表达量差异显著,结合亲本对不同金属离子的浓度积累数据,推测LOCOs02g50240、LOCOs09g31200及LOCOs09g35030的高表达可能极大地提高了水稻对镉离子的吸收和胁迫耐受能力。通过QTL挖掘和分析,发现这些基因与水稻籽粒的镉积累有关,可能影响水稻耐镉胁迫的能力。研究结果为进一步筛选和培育耐镉胁迫的水稻品种创造了条件,为阐明水稻镉积累的分子调控机制奠定了基础。 展开更多
关键词 水稻 镉积累 QTL定位 候选基因 离子胁迫 遗传图谱
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水稻黄绿叶调控基因YGL18的克隆与功能解析 被引量:8
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作者 杨凯如 贾绮玮 +9 位作者 金佳怡 叶涵斐 王盛 陈芊羽 管易安 潘晨阳 辛德东 方媛 王跃星 饶玉春 《植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期276-287,共12页
叶色突变体往往伴随着叶绿素含量变化及叶绿体结构异常,是研究叶绿体发育与光合作用相关基因功能的重要材料。该研究通过甲基磺酸乙酯(EMS)诱变籼稻(Oryzasativasubsp.indica)品种华占(HZ)获得黄绿叶突变体,将其命名为ygl18(yellow-gree... 叶色突变体往往伴随着叶绿素含量变化及叶绿体结构异常,是研究叶绿体发育与光合作用相关基因功能的重要材料。该研究通过甲基磺酸乙酯(EMS)诱变籼稻(Oryzasativasubsp.indica)品种华占(HZ)获得黄绿叶突变体,将其命名为ygl18(yellow-green leaf 18)。与野生型相比,黄绿叶突变体ygl18自三叶期起叶片开始变黄且程度不断加深,同时伴随着光合速率与叶绿素含量下降,且结实率、千粒重及有效穗数均显著降低。透射电镜观察结果显示,ygl18的叶绿体结构紊乱,基质片层疏松,发育受到抑制,与叶片出现黄绿色表型一致。遗传分析表明,ygl18突变性状受1对隐性等位核基因控制,这对等位基因位于水稻第3号染色体长臂标记InDel2和InDel3之间115.2 kb范围内。进一步研究发现该突变体表型是编码铁氧还蛋白FdC2的基因LOC_Os03g48040的5’UTR发生突变所致。通过CRISPR转基因实验验证了该基因对表型的控制作用。研究结果揭示了叶色调控网络的遗传基础,可为今后选育高光效水稻品种提供新线索。 展开更多
关键词 水稻 叶色变异 遗传分析 图位克隆 铁氧还蛋白
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水稻叶片水势的QTL定位与候选基因分析 被引量:3
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作者 潘晨阳 张月 +11 位作者 林晗 陈芊羽 杨凯如 姜嘉骥 李梦佳 芦涛 王珂欣 路梅 王盛 叶涵斐 饶玉春 胡海涛 《植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第3期275-283,共9页
为探究叶片水势(LWP)相关基因在水稻(Oryzasativa)抗旱中的作用及其遗传机制,以热研2号(Nekken2)和华占(HZ)为亲本以及构建的120个重组自交系(RILs)群体为实验材料,对水稻分蘖期叶片水势进行检测,并利用前期基于高通量测序构建的分子遗... 为探究叶片水势(LWP)相关基因在水稻(Oryzasativa)抗旱中的作用及其遗传机制,以热研2号(Nekken2)和华占(HZ)为亲本以及构建的120个重组自交系(RILs)群体为实验材料,对水稻分蘖期叶片水势进行检测,并利用前期基于高通量测序构建的分子遗传连锁图谱进行数量性状基因座(QTL)分析。结果表明,共检测到5个与水稻分蘖期叶片水势相关的QTLs,分别位于第2、3、4、11和12号染色体上,LOD值均达2.5以上,其中位于4号染色体物理距离24066261–30847136 bp内QTL的LOD值高达5.15。对这些QTL区间内与水势相关的候选基因进行定量分析,发现LOCOs02g56630、LOCOs02g57720、LOCOs02g57580、LOCOs04g43730、LOCOs04g46490、LOCOs04g44570和LOCOs04g44060这7个基因在双亲间表达量差异显著。位于4号染色体QTL区间内LOCOs04g46490基因的表达在两亲本间存在显著差异。对基因LOCOs04g46490进行测序分析,发现该基因在两亲本间共存在6处差异,从而导致氨基酸序列的改变。通过QTL挖掘及相关基因表达分析,发现这些基因与水稻叶片水势调控相关,可能间接影响水稻的抗旱性。检测到的QTL位点对水势相关基因精细定位和克隆具有重要参考价值,有助于进一步理解水稻叶片水势的遗传基础,并为培育耐旱水稻新品种提供有利的基因资源。 展开更多
关键词 水稻 叶片水势 抗旱 遗传图谱 QTL定位
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水稻叶绿素含量QTL定位与候选基因表达分析 被引量:6
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作者 金佳怡 罗怿婷 +8 位作者 杨惠敏 芦涛 叶涵斐 谢继毅 王珂欣 陈芊羽 方媛 王跃星 饶玉春 《植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期394-403,共10页
水稻(Oryza sativa)是我国主要粮食作物之一。提高水稻叶片叶绿素含量,进而提高其光合作用效率是实现高产稳产的重要途径之一。该研究以父系籼稻品种华占(HZ)、母系粳稻品种热研2号(Nekken2)及其构建的120个重组自交系(RILs)为实验材料... 水稻(Oryza sativa)是我国主要粮食作物之一。提高水稻叶片叶绿素含量,进而提高其光合作用效率是实现高产稳产的重要途径之一。该研究以父系籼稻品种华占(HZ)、母系粳稻品种热研2号(Nekken2)及其构建的120个重组自交系(RILs)为实验材料,在分蘖期和成熟期分别对亲本及其后代剑叶的叶绿素含量(SPAD值)进行测定,同时基于已构建的高密度遗传连锁图谱进行QTL定位。结果共挖掘到20个与叶绿素含量相关的QTLs(分蘖期7个,成熟期13个),LOD值最高达4.77。利用qRT-PCR方法检测QTL区间内与叶绿素含量相关的候选基因的表达,发现LOC_Os06g11780、LOC_Os06g12360、LOC_Os06g39716、LOC_Os08g42610、LOC_Os02g18500、LOC_Os03g21240、LOC_Os03g21400、LOC_Os03g21780、LOC_Os03g30950及LOC_Os03g40550基因的表达量在双亲间差异显著。结合基因表达量及亲本叶绿素表型数据,推测LOC_Os06g11780、LOC_Os06g12360和LOC_Os08g42610的高表达极大地提高了水稻叶绿素含量,进而有效提高植物光合产能。研究结果为筛选和培育高光能利用效率的水稻新品种提供了有利的遗传资源,并为揭示水稻叶绿素含量的动态变化规律及分子调控机制奠定了重要基础。 展开更多
关键词 候选基因 叶绿素含量 遗传图谱 水稻 光合作用 QTL定位
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水稻抽穗期QTL定位及候选基因分析 被引量:6
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作者 魏和平 芦涛 +9 位作者 贾绮玮 邓飞 朱浩 岂泽华 王玉玺 叶涵斐 殷文晶 方媛 穆丹 饶玉春 《植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期588-595,共8页
水稻(Oryza sativa)抽穗期是决定产量和品质的重要性状,在育种、制种及引种驯化过程中发挥重要作用。将热研2号(O.sativa subsp.japonica cv.‘Nekken2’)和华占(O.sativa subsp.indica cv.‘HZ’)杂交获得F_(1)代,经连续多代自交得到12... 水稻(Oryza sativa)抽穗期是决定产量和品质的重要性状,在育种、制种及引种驯化过程中发挥重要作用。将热研2号(O.sativa subsp.japonica cv.‘Nekken2’)和华占(O.sativa subsp.indica cv.‘HZ’)杂交获得F_(1)代,经连续多代自交得到120个重组自交系(RILs)群体。在常规水肥管理条件下,对120个RILs株系的抽穗时间进行统计分析。利用已构建好的高密度遗传图谱,对水稻抽穗期相关性状进行QTL定位分析,结果共检测到11个QTLs,分别位于第1、3、4、5、6、8和12号染色体上,其中1个LOD值高达5.75。通过分析QTLs区间内的候选基因,筛选出可能影响两亲本抽穗期的相关基因,并利用实时定量PCR进行基因表达量分析,发现LOC_Os03g03070、LOC_Os03g50310、LOC_Os03g55389、LOC_Os04g55510、LOC_Os08g07740和LOC_Os08g01670共6个基因在双亲间的表达量差异显著,其中LOC_Os03g50310在Nekken2中的表达量比HZ高3.6倍。对双亲间候选基因LOC_Os03g50310进行测序分析,发现该基因在5′UTR、CDS区及3′UTR存在4处差异,其中CDS区的单核苷酸多态性(SNP)差异引发单个氨基酸改变。研究通过挖掘水稻抽穗期QTL位点为进一步克隆水稻抽穗期相关基因和品种选育提供了新线索。 展开更多
关键词 水稻 抽穗期 QTL定位 候选基因 单核苷酸多态性
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水稻籽粒维生素E QTL挖掘及候选基因分析 被引量:3
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作者 叶涵斐 殷文晶 +8 位作者 管易安 杨凯如 陈芊羽 俞淑颖 朱旭东 辛德东 章薇 王跃星 饶玉春 《植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期157-170,共14页
维生素E(VE)是稻米营养品质的重要指标。水稻(Oryza sativa)是我国种植最广泛的粮食作物,增加其籽粒的VE含量是实现国民营养强化的一条便捷有效的途径。该研究以籼稻华占(HZ)为父本,粳稻热研2号(Nekken2)为母本,构建120个重组自交系(RI... 维生素E(VE)是稻米营养品质的重要指标。水稻(Oryza sativa)是我国种植最广泛的粮食作物,增加其籽粒的VE含量是实现国民营养强化的一条便捷有效的途径。该研究以籼稻华占(HZ)为父本,粳稻热研2号(Nekken2)为母本,构建120个重组自交系(RILs)群体。采用高效液相色谱法(HPLC)对RILs群体的VE各组分含量进行测定,并基于构建的高密度分子遗传图谱进行QTL定位,谱系分析后挖掘到122个VE总量和分量相关QTLs,分布在12条染色体上。其中qT3α/to2-1的LOD值高达10.32,qT3α2-1的LOD值高达9.91,另有多个控制各异构体含量的主效QTLs,且区间内包含OsGGR1、OsGGR2、OsTC及OsγTMT等VE生物合成基因。通过qRT-PCR检测亲本中VE合成基因的表达量,发现在华占中候选基因的表达量均极显著高于热研2号,推测这些基因的高表达是华占生育酚及生育三烯酚含量高于热研2号的原因。研究挖掘到的QTL数目较多,LOD值也较大,为进一步筛选和培育高VE含量的水稻新品种奠定了分子基础,同时为揭示水稻VE生物合成的分子调控机制提供了重要基因资源。 展开更多
关键词 水稻 维生素E QTL定位 候选基因 稻米质量
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A rice XANTHINE DEHYDROGENASE gene regulates leaf senescence and response to abiotic stresses 被引量:4
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作者 Jiangmin Xu Chenyang Pan +9 位作者 Han Lin hanfei ye Sheng Wang Tao Lu Qianyu Chen Kairu Yang Mei Lu Qian Qian Deyong Ren Yuchun Rao 《The Crop Journal》 SCIE CSCD 2022年第2期310-322,共13页
Xanthine dehydrogenase, a member of the molybdenum enzyme family, participates in purine metabolism and catalyzes the generation of ureides from xanthine and hypoxanthine. However, the mechanisms by which xanthine deh... Xanthine dehydrogenase, a member of the molybdenum enzyme family, participates in purine metabolism and catalyzes the generation of ureides from xanthine and hypoxanthine. However, the mechanisms by which xanthine dehydrogenase affects rice growth and development are poorly understood. In the present study, we identified a mutant with early leaf senescence and reduced tillering that we named early senescence and less-tillering 1(esl1). Map-based cloning revealed that ESL1 encodes a xanthine dehydrogenase, and it was expressed in all tissues. Chlorophyll content was reduced and chloroplast maldevelopment was severe in the esl1 mutant. Mutation of ESL1 led to decreases in allantoin, allantoate, and ABA contents. Further analysis revealed that the accumulation of reactive oxygen species in esl1 resulted in decreased photosynthesis and impaired chloroplast development, along with increased sensitivity to abscisic acid and abiotic stresses. Ttranscriptome analysis showed that the ESL1 mutation altered the expression of genes involved in the photosynthesis process and reactive oxygen species metabolism.Our results suggest that ESL1 is involved in purine metabolism and the induction of leaf senescence.These findings reveal novel molecular mechanisms of ESL1 gene-mediated plant growth and leaf senescence. 展开更多
关键词 Xanthine dehydrogenase Leaf senescence Abiotic stresses Purine metabolism
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