目的探究Y染色体丢失(loss of Y chromosome,LOY)在膀胱癌中的作用及临床意义。方法收集2018年1月至2019年10月在广西医科大学第一附属医院接受全膀胱切除术的44例男性膀胱癌组织样本及临床资料。基于Y染色体转录特征(Y chromosome tran...目的探究Y染色体丢失(loss of Y chromosome,LOY)在膀胱癌中的作用及临床意义。方法收集2018年1月至2019年10月在广西医科大学第一附属医院接受全膀胱切除术的44例男性膀胱癌组织样本及临床资料。基于Y染色体转录特征(Y chromosome transcriptional signature,YchrS),采用单样本基因集富集分析(single-sample gene set enrichment analysis,ssGSEA)对患者的全转录组测序数据进行评分,将患者分成高YchrS评分组和低YchrS评分组。采用Kaplan-Meier法评估两组患者预后,并通过差异表达分析及基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)揭示其潜在的分子特征。利用质谱流式细胞术(cytometry by time of flight,CyTOF)分析两组肿瘤中免疫细胞的多样性。基于公共数据库的单细胞转录组测序数据(HRA000212),通过细胞分化轨迹及细胞通讯分析LOY上皮细胞的特征。使用CMap数据库识别潜在有效治疗药物。结果低YchrS评分组膀胱癌患者表现出更短的总生存期(P=0.006)及更高的肿瘤分级(P=0.036)。该组上调基因富集于细胞周期调控、DNA复制及染色体分离等相关生物过程(P<0.05),并表现出p53抑制基因的评分升高和p53诱导基因的评分降低(均P<0.001)。相较于其他上皮细胞,LOY上皮细胞的免疫相关信号通路激活,且与髓系细胞和T细胞存在较强的相互作用。CyTOF分析显示,低YchrS评分组表现为调节性T(regulatory T,Treg)细胞富集,CD4+T细胞的CD279(PD-1)表达上调。CMap数据库分析结果显示,周期蛋白依赖性激酶(cyclin-dependent kinase,CDK)抑制剂(如哌柏西利)和组蛋白脱乙酰酶(histone deacetylase,HDAC)抑制剂是低YchrS评分组膀胱癌患者的潜在治疗药物。结论LOY与膀胱癌患者不良预后密切相关,其促癌机制可能与p53抑制及免疫抑制有关。CDK抑制剂和HDAC抑制剂是LOY膀胱癌患者潜在的治疗药物。展开更多
文摘目的探究Y染色体丢失(loss of Y chromosome,LOY)在膀胱癌中的作用及临床意义。方法收集2018年1月至2019年10月在广西医科大学第一附属医院接受全膀胱切除术的44例男性膀胱癌组织样本及临床资料。基于Y染色体转录特征(Y chromosome transcriptional signature,YchrS),采用单样本基因集富集分析(single-sample gene set enrichment analysis,ssGSEA)对患者的全转录组测序数据进行评分,将患者分成高YchrS评分组和低YchrS评分组。采用Kaplan-Meier法评估两组患者预后,并通过差异表达分析及基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)揭示其潜在的分子特征。利用质谱流式细胞术(cytometry by time of flight,CyTOF)分析两组肿瘤中免疫细胞的多样性。基于公共数据库的单细胞转录组测序数据(HRA000212),通过细胞分化轨迹及细胞通讯分析LOY上皮细胞的特征。使用CMap数据库识别潜在有效治疗药物。结果低YchrS评分组膀胱癌患者表现出更短的总生存期(P=0.006)及更高的肿瘤分级(P=0.036)。该组上调基因富集于细胞周期调控、DNA复制及染色体分离等相关生物过程(P<0.05),并表现出p53抑制基因的评分升高和p53诱导基因的评分降低(均P<0.001)。相较于其他上皮细胞,LOY上皮细胞的免疫相关信号通路激活,且与髓系细胞和T细胞存在较强的相互作用。CyTOF分析显示,低YchrS评分组表现为调节性T(regulatory T,Treg)细胞富集,CD4+T细胞的CD279(PD-1)表达上调。CMap数据库分析结果显示,周期蛋白依赖性激酶(cyclin-dependent kinase,CDK)抑制剂(如哌柏西利)和组蛋白脱乙酰酶(histone deacetylase,HDAC)抑制剂是低YchrS评分组膀胱癌患者的潜在治疗药物。结论LOY与膀胱癌患者不良预后密切相关,其促癌机制可能与p53抑制及免疫抑制有关。CDK抑制剂和HDAC抑制剂是LOY膀胱癌患者潜在的治疗药物。
