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小麦TaPOD家族的全基因组鉴定及表达分析 被引量:3
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作者 琚吉浩 马超 +6 位作者 王添宁 吴毅 董钟 方美娥 陈钰姝 张均 付国占 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期779-792,共14页
过氧化物酶(Peroxidase,POD)家族成员在调节植物生长发育和响应逆境胁迫中起重要作用。为系统探究小麦(Triticum aestivum L.)TaPOD基因家族的功能及其表达模式,本研究利用生物信息学的方法鉴定了小麦TaPOD基因家族成员,对其理化性质、... 过氧化物酶(Peroxidase,POD)家族成员在调节植物生长发育和响应逆境胁迫中起重要作用。为系统探究小麦(Triticum aestivum L.)TaPOD基因家族的功能及其表达模式,本研究利用生物信息学的方法鉴定了小麦TaPOD基因家族成员,对其理化性质、启动子顺式作用元件、进化特征做了预测分析,并通过小麦转录组和实时荧光定量PCR(Real Time Quantitative,RT-qPCR)分析了其在不同组织、外源激素及逆境胁迫下的表达模式。结果表明,目前基因组测序小麦中包含659个TaPOD基因家族成员,蛋白质序列长度在206~518个氨基酸之间;系统发育分析表明,小麦TaPOD家族成员分为I~VII组且每组成员数量不等;序列比对显示小麦TaPOD家族成员具有5个保守基序,且基因结构等方面存在很大差异,预示着功能存在多样性;染色体定位发现其数量在小麦的21条染色体上分布不均匀,其中2B染色体上数量最多;通过种内共线性分析发现,小麦TaPOD基因共有396个重复事件,同源性较高且进化过程非常保守,主要通过片段复制和串联复制进行扩增,且Ka/Ks比率显示仅有4对家族成员受到了正向的自然选择压力;顺式作用元件分析表明,上游2 kb区域中存在23种与生长发育和抗逆性相关的结合元件;基因表达模式分析显示,86.5%TaPOD基因在小麦根系中表达量较高;通过RT-qPCR检测发现TaPOD基因表达量与激素诱导和非生物胁迫密切相关。上述结果为深入研究TaPOD基因在调控小麦生长发育与逆境胁迫中的功能提供初步的理论基础。 展开更多
关键词 小麦 TaPOD基因家族 生物信息学 共线性分析 基因表达
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A Note on the Continuity of the Generalized Curve Subdivision Scheme with Tension Parameter
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作者 ZHANG Nan fang mei-e 《Computer Aided Drafting,Design and Manufacturing》 2015年第1期37-39,共3页
A generalized non-stationary curve subdivision (GNS for short) scheme of arbitrary order k≥3 with a parameter has been proposed by Fang et al. in the paper (Fang Mei-e et al., CAGD, 2010(27): 720-733). It has ... A generalized non-stationary curve subdivision (GNS for short) scheme of arbitrary order k≥3 with a parameter has been proposed by Fang et al. in the paper (Fang Mei-e et al., CAGD, 2010(27): 720-733). It has been proved that the proposed scheme of order k generates C^k-2 continuous curves for k≥4. But the proof of the smoothness in this paper is uncompleted. Moreover, the Cl-continuity of the third order scheme has not been discussed. For this reason, in this paper, we provide a full corrected proof of the smoothness of the GNS scheme of order k for k≥3. 展开更多
关键词 non-stationary subdivision scheme tension parameter SMOOTHNESS B-SPLINE asymptotical equivalence
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