热激蛋白70(Heat shock protein 70,Hsp70)是一类结构保守的分子伴侣型应激蛋白,在调控植物生长发育和响应生物与非生物胁迫方面起着重要作用。本研究以花魔芋基因组为基础,利用生物信息学方法对花魔芋(Amorphophallus konjac)Hsp70(AkH...热激蛋白70(Heat shock protein 70,Hsp70)是一类结构保守的分子伴侣型应激蛋白,在调控植物生长发育和响应生物与非生物胁迫方面起着重要作用。本研究以花魔芋基因组为基础,利用生物信息学方法对花魔芋(Amorphophallus konjac)Hsp70(AkHsp70)基因家族的理化性质、基因结构、系统进化和表达特性等进行分析。结果表明,AkHsp70包含30个成员,分为4类;AkHsp70编码的蛋白长度为303~845个氨基酸,均为亲水性蛋白;基因家族成员的内含子数量为0~11,含有2~15个保守基序。基于转录组测序数据构建的基因表达谱热图分析结果表明22个AkHsp70基因在须根(XG2)、块茎(KG2)、叶柄(J2)和叶(Y2)4个组织中的表达存在显著差异,且表现出组织特异性,其中有8个基因在KG2中高表达,6个在KG2和J2中高表达,4个在XG2和KG2中高表达,3个在J2中高表达,1个在XG2和Y2中高表达。在生物胁迫下,有18个AkHsp70在软腐病叶(Y2B)中高表达。本研究为深入阐明AkHsp70家族基因在花魔芋发育过程和生物胁迫响应中的功能提供参考。展开更多
为了调查花生仁内生细菌种类多样性,应用Illumina Mi Seq高通量测序技术测定花生仁内生细菌的16S r DNA-V4变异区序列,并采用Mothur软件整理及统计样品序列数目和操作分类单元(OTUs)数量,分析物种的丰度、分布和α多样性.研究获得用于...为了调查花生仁内生细菌种类多样性,应用Illumina Mi Seq高通量测序技术测定花生仁内生细菌的16S r DNA-V4变异区序列,并采用Mothur软件整理及统计样品序列数目和操作分类单元(OTUs)数量,分析物种的丰度、分布和α多样性.研究获得用于分析的有效序列和OTU数分别为69 284和25;稀疏曲线表明测序深度充分,OTU的数量接近于饱和.花生仁内生细菌主要分布于食酸菌属(Acidovorax)和希瓦氏菌属(Shewanella),丰度分别为83.33%和16.67%.且内生细菌的Chao1指数为25.00,Shannon指数为1.29.展开更多
文摘热激蛋白70(Heat shock protein 70,Hsp70)是一类结构保守的分子伴侣型应激蛋白,在调控植物生长发育和响应生物与非生物胁迫方面起着重要作用。本研究以花魔芋基因组为基础,利用生物信息学方法对花魔芋(Amorphophallus konjac)Hsp70(AkHsp70)基因家族的理化性质、基因结构、系统进化和表达特性等进行分析。结果表明,AkHsp70包含30个成员,分为4类;AkHsp70编码的蛋白长度为303~845个氨基酸,均为亲水性蛋白;基因家族成员的内含子数量为0~11,含有2~15个保守基序。基于转录组测序数据构建的基因表达谱热图分析结果表明22个AkHsp70基因在须根(XG2)、块茎(KG2)、叶柄(J2)和叶(Y2)4个组织中的表达存在显著差异,且表现出组织特异性,其中有8个基因在KG2中高表达,6个在KG2和J2中高表达,4个在XG2和KG2中高表达,3个在J2中高表达,1个在XG2和Y2中高表达。在生物胁迫下,有18个AkHsp70在软腐病叶(Y2B)中高表达。本研究为深入阐明AkHsp70家族基因在花魔芋发育过程和生物胁迫响应中的功能提供参考。
文摘为了调查花生仁内生细菌种类多样性,应用Illumina Mi Seq高通量测序技术测定花生仁内生细菌的16S r DNA-V4变异区序列,并采用Mothur软件整理及统计样品序列数目和操作分类单元(OTUs)数量,分析物种的丰度、分布和α多样性.研究获得用于分析的有效序列和OTU数分别为69 284和25;稀疏曲线表明测序深度充分,OTU的数量接近于饱和.花生仁内生细菌主要分布于食酸菌属(Acidovorax)和希瓦氏菌属(Shewanella),丰度分别为83.33%和16.67%.且内生细菌的Chao1指数为25.00,Shannon指数为1.29.
