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基于R语言数据挖掘技术的针灸治疗带状疱疹后遗神经痛选穴规律研究 被引量:1
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作者 王玉琳 李磊鑫 +9 位作者 杨添淞 刘佳 林春盛 彭婉莹 赵健 包大鹏 武文鹏 孙申田 曹阳 王迪 《中国中医药信息杂志》 2025年第2期39-44,共6页
目的应用R语言数据挖掘技术分析针灸治疗带状疱疹后遗神经痛(PHN)的选穴规律。方法检索中国知识资源总库(CNKI)、万方数据知识服务平台(万方数据)、维普中文期刊服务平台(维普网)、中国生物医学文献数据库(CBM)2010年1月1日-2023年7月1... 目的应用R语言数据挖掘技术分析针灸治疗带状疱疹后遗神经痛(PHN)的选穴规律。方法检索中国知识资源总库(CNKI)、万方数据知识服务平台(万方数据)、维普中文期刊服务平台(维普网)、中国生物医学文献数据库(CBM)2010年1月1日-2023年7月1日收录的针灸治疗PHN的临床研究文献,利用Excel2016建立数据库,采用R语言对腧穴使用频次、归经、部位、特定穴等进行统计,并进行关联规则分析和聚类分析,得出针灸治疗PHN的选穴特点及规律。结果共纳入198篇文献,包含83个腧穴,总频次为714。高频腧穴为阿是穴、夹脊穴、阳陵泉等,常用经脉为足少阳胆经、足太阴脾经和手阳明大肠经,腧穴多分布于上下肢部,以五输穴、原穴和下合穴居多。核心腧穴为阿是穴、夹脊穴、合谷、曲池,并得到9组关联规则和5个有效聚类。结论针灸治疗带状疱疹后遗神经痛的核心腧穴为阿是穴、夹脊穴、合谷、曲池,主要遵循局部取穴与远端取穴相结合的选穴原则。 展开更多
关键词 针灸 带状疱疹后遗神经痛 数据挖掘 选穴规律 R语言
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张树庭食药用菌学术思想要义及影响
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作者 鲍大鹏 陈明杰 +4 位作者 潘迎捷 刘艳芳 宋春艳 张劲松 谭琦 《食用菌学报》 北大核心 2025年第6期92-111,共20页
张树庭被誉为“国际食药用菌之父”,其学术思想对全球蕈菌学科与产业发展具有深远影响。笔者系统阐述张树庭在蕈菌学科构建、遗传育种、栽培技术、健康价值模型、资源循环利用、生物技术应用、产业标准化与发展路径多方面的理论创新与... 张树庭被誉为“国际食药用菌之父”,其学术思想对全球蕈菌学科与产业发展具有深远影响。笔者系统阐述张树庭在蕈菌学科构建、遗传育种、栽培技术、健康价值模型、资源循环利用、生物技术应用、产业标准化与发展路径多方面的理论创新与实践贡献;总结他在中国食药用菌产业推动、人才培养、国际交流与政策建言等方面的重要贡献;分析他在国际学术组织建设、技术推广与海外影响方面的领导地位;并基于其学术思想,提出对未来学科发展、智能化栽培、生态服务、健康产品创新、三产融合及全球合作方面的启示与建议。张树庭的学术体系与产业实践,不仅为中国乃至世界食药用菌事业的科学化、国际化与可持续发展奠定坚实基础,更在学科建设、产业创新与全球视野等方面为后人提供重要启迪:他强调的农林废弃物资源化利用、食药用菌在健康与环保中的多重价值以及食用菌和药用菌并重发展的理念,至今仍对实现乡村振兴、健康中国和生态文明建设等国家战略具有深刻的现实指导意义。 展开更多
关键词 张树庭 食药用菌 学术思想 产业发展 学科建设
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斑玉蕈营养价值和生物活性研究进展
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作者 吴莹莹 曹智 +2 位作者 鲍大鹏 贾毅 李燕 《食用菌学报》 北大核心 2025年第5期92-106,共15页
斑玉蕈(Hypsizygus marmoreus)因独特的香气和口感,备受消费者青睐。斑玉蕈含蛋白质、氨基酸、多糖、矿质元素、维生素等多种物质,具有抗氧化、抗肿瘤、抗菌、降血压、保护器官和调节免疫等作用。本文综述斑玉蕈的营养和活性成分、药理... 斑玉蕈(Hypsizygus marmoreus)因独特的香气和口感,备受消费者青睐。斑玉蕈含蛋白质、氨基酸、多糖、矿质元素、维生素等多种物质,具有抗氧化、抗肿瘤、抗菌、降血压、保护器官和调节免疫等作用。本文综述斑玉蕈的营养和活性成分、药理作用和应用价值,为斑玉蕈的研究和开发利用提供参考。 展开更多
关键词 斑玉蕈 营养价值 药理作用 应用
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代谢组揭示低温储藏蛹虫草干制品中风味的变化及最佳食用时间 被引量:1
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作者 张瑞婧 邹根 +4 位作者 鲍大鹏 王跃霖 王琨 汪滢 李文强 《菌物学报》 北大核心 2025年第10期46-62,共17页
蛹虫草在采收后含水量高,鲜品容易出现机械损伤和微生物侵染,因此市场上蛹虫草产品主要为干制品及二次加工产物,且主要在室温下储藏,没有真空密封。本研究采用液相色谱-质谱联用仪(LC-MS)和气相色谱-质谱联用仪(GC-MS)共同联用的方法,分... 蛹虫草在采收后含水量高,鲜品容易出现机械损伤和微生物侵染,因此市场上蛹虫草产品主要为干制品及二次加工产物,且主要在室温下储藏,没有真空密封。本研究采用液相色谱-质谱联用仪(LC-MS)和气相色谱-质谱联用仪(GC-MS)共同联用的方法,分析4℃储藏条件下蛹虫草干制品在1–6个月储藏期内出现的主要代谢物的变化,并探究其品质变化。通过代谢组学检测共鉴定出856种非挥发性物质和431种挥发性物质,其中差异显著性分析筛选出159种非挥发性物质和110种挥发性物质。进一步分析发现非挥发性代谢物在储藏前3个月呈现显著波动,3个月后各组分趋于稳定;挥发性成分在储藏2个月达到平衡。本研究为探究蛹虫草干制品食用时间提供了新的见解。 展开更多
关键词 蛹虫草干制品 代谢组学 食用时间
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运动改善脂肪肌肉比的全基因组关联分析和效果预判模型构建
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作者 杨晓琳 包大鹏 +3 位作者 李燕春 晏冰 梅涛 何子红 《体育科学》 北大核心 2025年第7期58-72,共15页
目的:分析高强度间歇训练(high-intensity interval training,HIIT)和抗阻训练(resistance training,RT)干预降低脂肪肌肉比(fat-to-muscle mass ratio,FMR)的效果及个体差异,全基因组筛选效果相关分子标记并分析遗传因素的影响,联合表... 目的:分析高强度间歇训练(high-intensity interval training,HIIT)和抗阻训练(resistance training,RT)干预降低脂肪肌肉比(fat-to-muscle mass ratio,FMR)的效果及个体差异,全基因组筛选效果相关分子标记并分析遗传因素的影响,联合表型和遗传因素构建运动改善FMR效果预判模型。方法:组织身体活动不足成年人进行12周HIIT(n=260)或RT(n=177)运动干预,分析12周干预前后FMR改善效果差异。采用全基因组关联分析(genomewide association studies,GWAS)筛选12周HIIT或RT干预改善FMR效果差异分子标记(P<1.0×10^(-5))。基于GWAS结果计算多基因评分(polygenic scores,PGS),分析PGS与运动降低FMR效果关系,通过随机森林、支持向量机、分布式梯度增强和逻辑回归4种方法构建运动降低FMR效果预判模型。结果:1)12周HIIT或RT干预均引起FMR显著下降(P<0.05),HIIT降低FMR效果优于RT(P<0.05),但2种干预降低FMR效果均存在个体差异(无效率为34.0%和40.1%);2)14个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)与HIIT改善FMR效果显著相关(P<1×10^(-5)),12个SNPs与RT干预改善FMR效果显著相关(P<1×10^(-5)),其中rs2277512显著性达P<5×10^(-8),解释度为14.1%;PGS对HIIT和RT改善FMR效果的解释度分别为53.9%和52.6%;3)基于性别、年龄、PGS、初始BMI、初始肌肉质量、初始脂肪质量和运动方案构建的随机森林模型能够有效预判运动改善FMR效果(AUC=0.935,cut-off=0.339),模型特征中PGS重要性最高。结论:HIIT和RT运动干预后FMR改善效果均存在个体差异,且2种运动方式的PGS解释度均不低于52%;联合表型和遗传因素构建的随机森林预测模型可在运动前预测运动改善FMR效果,为精准健身提供方案选择依据。 展开更多
关键词 脂肪肌肉比 高强度间歇训练 抗阻训练 多基因评分 随机森林模型
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利用转录组挖掘六妹羊肚菌生长发育相关基因
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作者 胡继鹏 鲍大鹏 +4 位作者 杨瑞恒 高贺宇 仝乐涛 徐爱国 唐利华 《食用菌学报》 北大核心 2025年第2期9-19,共11页
对六妹羊肚菌(Morchella sextelata)的菌丝体(M)、幼小子实体(FS)和成熟子实体(FB)进行转录组测序。差异表达基因(DEGs)分析结果显示,FS与M相比共鉴定出13500个DEGs,FB与FS相比共鉴定出957个DEGs。GO功能富集分析表明,FS与M的DEGs主要... 对六妹羊肚菌(Morchella sextelata)的菌丝体(M)、幼小子实体(FS)和成熟子实体(FB)进行转录组测序。差异表达基因(DEGs)分析结果显示,FS与M相比共鉴定出13500个DEGs,FB与FS相比共鉴定出957个DEGs。GO功能富集分析表明,FS与M的DEGs主要富集在碳水化合物代谢过程、膜和催化活性等条目中;FB与FS的DEGs主要富集在氧化还原过程、氧化还原酶活性和呼吸链等条目中。KEGG代谢途径富集分析显示,FS与M的DEGs主要富集在淀粉和蔗糖代谢、氨基糖和核苷酸糖代谢和自噬等通路中;FB与FS比较组的DEGs主要富集在酪氨酸代谢、糖酵解/糖异生、氧化磷酸化等通路中。筛选到与羊肚菌生长发育相关的重要差异表达基因包括编码转录因子、自噬、漆酶和碳水化合物酶(CAZymes)相关基因(ap1、atg8、laccase2、laccase4、bgl2、exg1)。酶活测定结果表明,CAZymes(α-葡萄糖苷酶、β-1,3-葡萄糖苷酶)和漆酶(laccase2和laccase4)在子实体阶段的活性显著高于菌丝体阶段,且在成熟子实体中活性最高。本研究结果可为阐明羊肚菌生长发育机制及相关功能基因挖掘提供参考。 展开更多
关键词 羊肚菌 转录组 生长发育 漆酶 碳水化合物酶
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基于速度的力量训练对精英游泳运动员奥运备赛期跳发表现的影响
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作者 刘也 戴天 +4 位作者 路则鹏 刘昕格 包大鹏 方俊辉 尚明宇 《中国体育科技》 北大核心 2025年第8期13-27,共15页
目的:探究基于速度的力量训练(velocity-based training,VBT)与传统百分比训练(percentage-based training,PBT)对精英游泳运动员奥运会备赛期间游泳跳发相关运动表现的影响。方法:针对备战2024年巴黎奥运会的6名国家游泳队重点运动员,... 目的:探究基于速度的力量训练(velocity-based training,VBT)与传统百分比训练(percentage-based training,PBT)对精英游泳运动员奥运会备赛期间游泳跳发相关运动表现的影响。方法:针对备战2024年巴黎奥运会的6名国家游泳队重点运动员,根据其训练情况配对分为VBT组(n=3)和PBT组(n=3),进行4周(2次/周)的深蹲训练。VBT组采用75%±5%1RM动态负荷,并依据±0.06 m/s平均向心速度阈值进行动态调整;PBT组采用固定的75%1RM负荷方案。采用三维测力台和视频分析系统评估干预前、后运动员的游泳跳发表现(包括起跳反应时、峰值功率、后蹬板力及入水距离)、1RM深蹲、75%1RM深蹲平均向心速度(mean concentric velocity,MCV)、下落跳(drop jump,DJ)、静蹲跳(squat jump,SJ)以及大腿前后群肌肉疲劳状态(肌肉张力、肌肉硬度和肌肉弹性)。同时,每节训练课同步监测训练总恢复质量(total quality recover,TQR)、自觉用力程度(rating of perceived exertion,RPE)及肌肉疼痛评分(visual analogue scale,VAS)。结果:在专项表现方面,VBT组游泳跳发反应时、跳发入水距离、水下15 m用时和后蹬板力增幅分别达8.22%(ES=3.47)、6.11%(ES=0.98)、4.96%(ES=0.74)、10.31%(ES=1.11),提升幅度均优于PBT组(1.07%~6.45%,ES=0.10~0.45)。力量和爆发力指标显示,VBT组1RM深蹲提升18.75%(ES=1.43),75%1RM平均向心速度提升16.92%(ES=0.94),DJ和SJ高度分别提升6.93%(ES=1.10)和12.59%(ES=1.15),提升幅度和效应量均高于PBT组(PC<8.82%,ES=0.13~0.85)。肌肉疲劳状态指标显示,VBT组大腿前群肌肉平均弹性提升25.36%(ES=1.36),后群肌肉张力降低8.54%(ES=0.56),而PBT组仅有微小变化。VBT组干预前、后TQR和RPE高于PBT组,VAS低于PBT组。结论:相较于PBT,VBT通过动态负荷调节可以更有效地提升精英游泳运动员的力量与爆发力,同时显著提高游泳跳发相关运动表现,并优化训练期间的肌肉状态与疲劳恢复。 展开更多
关键词 精英游泳运动员 备赛期训练 基于速度的力量训练 运动表现 肌肉疲劳状态
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糙皮侧耳AQPs基因家族鉴定与表达分析
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作者 胡继鹏 鲍大鹏 +3 位作者 邹根 尚俊军 高贺宇 唐利华 《菌物学报》 北大核心 2025年第3期50-61,共12页
水通道蛋白(AQP)基因家族在真菌的水分运输及多种生理过程中发挥重要作用。本研究通过生物信息学方法系统鉴定糙皮侧耳Pleurotus ostreatus AQP家族成员(PoAQPs),并对其理化性质、亚细胞定位、染色体定位、系统进化关系、保守基序以及... 水通道蛋白(AQP)基因家族在真菌的水分运输及多种生理过程中发挥重要作用。本研究通过生物信息学方法系统鉴定糙皮侧耳Pleurotus ostreatus AQP家族成员(PoAQPs),并对其理化性质、亚细胞定位、染色体定位、系统进化关系、保守基序以及启动子顺式作用元件进行分析。同时,通过RT-qPCR检测PoAQPs基因在不同生长阶段以及水分过剩胁迫条件下的相对表达量。分析显示,糙皮侧耳基因组中共鉴定出5个PoAQPs成员,分为经典AQP和AQGP 2个亚家族,均含有MIP超家族结构域和经典的水通道蛋白三级结构特征;5个PoAQPs基因分布于4条染色体上,亚细胞定位预测结果显示,这些基因均定位于细胞膜;同一亚家族的成员具有相似的保守基序;启动子区域富含大量的激素响应和非生物胁迫相关的调控作用元件;RT-qPCR结果显示,PoAQPs基因在不同生长阶段和水分过剩胁迫条件下的表达存在显著差异,且主要在糙皮侧耳的子实体阶段以及水分过剩胁迫8h中高表达。推测PoAQPs在调控糙皮侧耳的生长发育及非生物胁迫响应中发挥作用,这一发现为深入理解糙皮侧耳的水分调控机制及抗胁迫品种的培育提供了理论支持。 展开更多
关键词 糙皮侧耳 水通道蛋白 基因家族 生物信息学 表达分析
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儿童青少年身体活动不足三联征研究进展与启示
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作者 刘浩崇 杨文璞 +1 位作者 包大鹏 刘昊扬 《中国学校卫生》 北大核心 2025年第9期1361-1364,共4页
儿童青少年身体活动不足三联征(PIT)框架由运动缺乏症状、儿童青少年肌力不足和体育素养缺乏三大核心因素构成,强调身体活动(PA)不足并非单一现象,而是多重因素相互作用导致的恶性循环。研究基于PIT框架,探讨其核心要素及相互关系,并分... 儿童青少年身体活动不足三联征(PIT)框架由运动缺乏症状、儿童青少年肌力不足和体育素养缺乏三大核心因素构成,强调身体活动(PA)不足并非单一现象,而是多重因素相互作用导致的恶性循环。研究基于PIT框架,探讨其核心要素及相互关系,并分析该框架在提升中国儿童青少年PA水平方面的应用价值和实践启示,为解析儿童青少年PA不足的复杂成因提供系统性理论视角,并为制定干预策略提供科学依据。 展开更多
关键词 运动活动 健康促进 儿童 青少年
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6种市售工厂化栽培金针菇的氨基酸组成及蛋白质营养评价 被引量:70
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作者 吴莹莹 鲍大鹏 +2 位作者 王瑞娟 陈洪雨 王红梅 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2018年第10期263-268,共6页
为分析工厂化栽培金针菇的蛋白质营养,本研究测定6种来自不同生产企业的市售金针菇样品中粗蛋白含量及氨基酸组成,分析其中呈味氨基酸的含量,并通过计算蛋白质的氨基酸评分、化学评分、氨基酸比值系数分和必需氨基酸指数,以及预测蛋白... 为分析工厂化栽培金针菇的蛋白质营养,本研究测定6种来自不同生产企业的市售金针菇样品中粗蛋白含量及氨基酸组成,分析其中呈味氨基酸的含量,并通过计算蛋白质的氨基酸评分、化学评分、氨基酸比值系数分和必需氨基酸指数,以及预测蛋白质校正氨基酸计分等非生物学指标,评价金针菇的蛋白质营养价值。结果表明,6种金针菇样品均含有18种水解氨基酸,其中呈味氨基酸含量比例为56.28%~57.37%。必需氨基酸含量接近WHO/FAO模式,其中蛋氨酸、赖氨酸含量丰富,限制氨基酸为缬氨酸和异亮氨酸。6种市售金针菇的氨基酸比值系数分为72.61~82.07,必需氨基酸指数均高于90,与卵清蛋白接近。上述结果表明工厂化栽培的金针菇中呈味氨基酸含量丰富,含有利于人体吸收的优质蛋白,具有较大的风味食品开发潜力,适合与谷物、肉类等进行膳食搭配以促进人体对氨基酸的平衡摄取。 展开更多
关键词 金针菇 氨基酸组成 必需氨基酸 蛋白质 营养评价
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中国食用菌产业实现高质量现代化发展的路径探讨 被引量:39
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作者 鲍大鹏 邹根 +3 位作者 裴晓东 杨瑞恒 李正鹏 谭琦 《食用菌学报》 CSCD 北大核心 2022年第6期103-110,共8页
中国食用菌产业持续保持稳定的增长趋势,是中国农业经济中创新活力最强的产业之一。目前,中国食用菌产业发展正在进入提质增效、转型发展的新阶段,笔者对传统食用菌产业和工厂化食用菌产业实现高质量现代化发展的战略进行思考,描述实现... 中国食用菌产业持续保持稳定的增长趋势,是中国农业经济中创新活力最强的产业之一。目前,中国食用菌产业发展正在进入提质增效、转型发展的新阶段,笔者对传统食用菌产业和工厂化食用菌产业实现高质量现代化发展的战略进行思考,描述实现现代化发展的主要技术路径,助力寻找中国食用菌产业高质量可持续发展的对策。 展开更多
关键词 传统食用菌 工厂化食用菌 现代化 发展路径
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中国食用菌产业发展基本面的认识及其启迪 被引量:21
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作者 鲍大鹏 潘迎捷 谭琦 《菌物研究》 CAS 2022年第3期160-165,共6页
中国食用菌产业近年来的发展中既有精准产业扶贫、大健康产业等有利的政策环境,也遭受了新冠疫情的暂时冲击。在这种形势下,分析了中国食用菌发展长期稳步的基本面及其稳定性和内在性,思考了迎接全球食用菌创新中心转移的对策,加强了食... 中国食用菌产业近年来的发展中既有精准产业扶贫、大健康产业等有利的政策环境,也遭受了新冠疫情的暂时冲击。在这种形势下,分析了中国食用菌发展长期稳步的基本面及其稳定性和内在性,思考了迎接全球食用菌创新中心转移的对策,加强了食用菌产业自主创新和原始创新重要性的认识,提出了中国食用菌产业在创新机制、人才培养和研发投入等方面的变革举措,重申了为实现食用菌强国而共同奋斗的理念和决心。 展开更多
关键词 食用菌产业 基本面 全球食用菌创新中心 自主创新 原始创新
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蟹味菇和白玉菇的蛋白质及氨基酸营养评价与分析 被引量:17
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作者 吴莹莹 鲍大鹏 +6 位作者 李燕 李金鑫 王莹 周陈力 曹娜 高利慧 陈洪雨 《上海农业学报》 2021年第1期13-21,共9页
为分析2种工厂化栽培斑玉蕈(蟹味菇和白玉菇)蛋白的氨基酸组成及营养均衡性,测定了6个不同企业生产的12个斑玉蕈样品的氨基酸含量,并运用主成分分析法(PCA)抽取了各样品的必需氨基酸综合特征,采用多种参数对氨基酸营养均衡性进行了系统... 为分析2种工厂化栽培斑玉蕈(蟹味菇和白玉菇)蛋白的氨基酸组成及营养均衡性,测定了6个不同企业生产的12个斑玉蕈样品的氨基酸含量,并运用主成分分析法(PCA)抽取了各样品的必需氨基酸综合特征,采用多种参数对氨基酸营养均衡性进行了系统评价。结果表明:12个样品均含有18种常见氨基酸,其中8种必需氨基酸(IAA)含量为436.18—533.00 mg∕g pro,含量最高的是Met;各氨基酸评分均值为123.16(Leu)—394.87(Met+Cys),满足多种国际权威氨基酸平衡模式谱的要求。Met+Cys、His、Trp和Thr的氨基酸比值系数相对较贴近模式谱要求。对IAA的化学评分分析发现,斑玉蕈蛋白的氨基酸营养供给略逊于全鸡蛋蛋白。通过PCA可抽取出4个主成分,共解释了90.016%的样品氨基酸组成差异。蟹味菇的总氨基酸含量及其在PC2的得分均高于白玉菇。基于氨基酸营养均衡性分析,推荐将蟹味菇和白玉菇与含硫氨基酸较少的豆类等蔬菜搭配食用,以满足人体对膳食氨基酸的平衡摄取。 展开更多
关键词 斑玉蕈 蟹味菇 白玉菇 蛋白质 主成分分析 必需氨基酸
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斑玉蕈栽培菌株遗传变异与生长速率GWAS分析 被引量:5
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作者 龚明 李燕 +5 位作者 鲍大鹏 尚俊军 杨瑞恒 周陈力 万佳宁 吴莹莹 《食用菌学报》 CSCD 北大核心 2021年第2期18-25,共8页
以38份斑玉蕈(Hypsizygus marmoreus)种质资源为研究对象,采用全基因组重测序获得供试菌株的SNP(single nucleotide polymorphism)数据,结合在不同温度(10、15、20、25、30℃)下的菌丝生长速率测定结果,开展全基因组关联分析(genome wid... 以38份斑玉蕈(Hypsizygus marmoreus)种质资源为研究对象,采用全基因组重测序获得供试菌株的SNP(single nucleotide polymorphism)数据,结合在不同温度(10、15、20、25、30℃)下的菌丝生长速率测定结果,开展全基因组关联分析(genome wide association study,GWAS)。结果表明:供试群体分为4大类群;在实验范围内,20、25℃为斑玉蕈适宜生长温度;GWAS分析显示20、25℃分别存在10、14个与生长速率显著关联的SNP位点,其中1个属于潜在功能性SNP位点。 展开更多
关键词 斑玉蕈 遗传变异 生长速率 SNP GWAS
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草菇UBEV2蛋白同源模建筛选其小分子抑制剂 被引量:4
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作者 万佳宁 尚俊军 +7 位作者 汪滢 李正鹏 王莹 唐利华 茅文俊 汪虹 鲍大鹏 龚明 《食用菌学报》 CSCD 北大核心 2020年第4期35-42,共8页
草菇(Volvariella volvacea)具有典型的低温自溶特征,基于草菇低温自溶与一个泛素结合酶E2(ubiquitin-conjugating enzyme,UBE2)高表达及活性相关,采用虚拟筛选法获得潜在的草菇UBEV2抑制剂小分子化合物。结果表明:在2轮虚拟筛选方法得... 草菇(Volvariella volvacea)具有典型的低温自溶特征,基于草菇低温自溶与一个泛素结合酶E2(ubiquitin-conjugating enzyme,UBE2)高表达及活性相关,采用虚拟筛选法获得潜在的草菇UBEV2抑制剂小分子化合物。结果表明:在2轮虚拟筛选方法得到500个靶中化合物的基础上,综合考虑可与UBEV2上的Thr73、Gly77、Ile78、Phe84、Gly85、Asp86、Tyr87、Asp79形成多个氢键,以及Ile78、Leu83、Phe84、Asp86、His138、Ile141等形成较强的疏水作用,最终人工挑选得到150个小分子化合物,对接打分值区间为6.58~8.06。抗冻实验结果提示筛选的化合物能够减轻低温对草菇的伤害。 展开更多
关键词 草菇 泛素结合酶E2 虚拟筛选 抗冻保鲜
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高强度间歇运动改善定量负荷运动心率效果的全基因组关联分析及预测模型构建 被引量:3
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作者 杨晓琳 李燕春 +8 位作者 包大鹏 梅涛 周多奇 乌云格日勒 聂晶 夏小慧 张之豪 顾壮壮 何子红 《中国运动医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期505-517,共13页
目的:安静心率、运动中心率的增加以及运动后心率恢复是全因死亡率的预测因子,是运动健身中最常用的监控指标。本研究旨在分析高强度间歇运动(high intensity interval training,HIIT)改善定量负荷运动心率个体差异的表型和遗传因素,构... 目的:安静心率、运动中心率的增加以及运动后心率恢复是全因死亡率的预测因子,是运动健身中最常用的监控指标。本研究旨在分析高强度间歇运动(high intensity interval training,HIIT)改善定量负荷运动心率个体差异的表型和遗传因素,构建运动心率改善效果预测模型,为个体化运动健身方案的制定提供依据。方法:240名身体活动不足健康成年人完成12周HIIT,提取血液白细胞DNA进行全基因组解析,通过包括520多万个单核苷酸多态性位点(single nucleotide polymorphisms,SNPs)的全基因组关联分析(genome wide association study,GWAS)筛选影响运动心率改善效果的遗传标记,构建运动心率改善效果分子标记预测模型;计算权重后的多基因预测评分(polygenic predictor score,PPS),联合表型和遗传指标通过线性逐步回归构建运动心率改善效果预测模型。结果:(1)12周HIIT后,定量负荷运动心率显著下降(P<0.05),但效果存在个体差异,27%的受试者未有效降低运动心率(ΔHR≥0);(2)表型指标中初始运动心率、性别和年龄是HIIT改善运动心率效果的预测因子,可解释24.5%的效果差异;(3)基于GWAS筛选出12个效果相关SNPs(P<1×10^(-5)),去除冗余,由其中10个SNPs构建的分子标记预测模型可解释训练效果差异的37.7%,单个SNP的解释度在1.2%~8.1%;PPS高于11.45分时,HIIT对运动心率降低完全无效(ΔHR≥0),当PPS低于-7.728分时,HIIT改善运动心率效果最好(ES<-0.8)。(4)联合表型和遗传指标构建的综合预测模型中,PPS、初始运动心率、性别和年龄是HIIT改善运动心率效果的预测因子,可在62.5%的程度上共同解释HIIT改善运动心率效果个体差异。结论:多基因预测评分、初始运动心率、性别和年龄可有效预测HIIT改善定量负荷运动心率效果个体差异。受试者的PPS高于11.45分时无训练效果,低于-7.728分时效果最佳。基于遗传和表型因素构建的运动心率改善效果预测模型将为制定效益最大化的个体化运动健身方案提供参考依据。 展开更多
关键词 全基因组关联分析 运动心率 高强度间歇运动 多基因预测评分
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全局调控因子LaeA对蛹虫草生长发育和次生代谢的作用 被引量:4
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作者 汪滢 杨占山 +3 位作者 鲍大鹏 李燕 吴莹莹 邹根 《食用菌学报》 CSCD 北大核心 2022年第1期20-26,共7页
通过克隆蛹虫草(Cordyceps militaris)野生型菌株Cm01的laeA基因(CmLaeA)、合成构巢曲霉(Aspergillus nidulans)的laeA基因(AsLaeA),构建不同过表达载体,利用农杆菌(Agrobacterium tumefaciens)介导转化野生型蛹虫草菌株LN9、Cm01,获得... 通过克隆蛹虫草(Cordyceps militaris)野生型菌株Cm01的laeA基因(CmLaeA)、合成构巢曲霉(Aspergillus nidulans)的laeA基因(AsLaeA),构建不同过表达载体,利用农杆菌(Agrobacterium tumefaciens)介导转化野生型蛹虫草菌株LN9、Cm01,获得4个过表达菌株,分别命名为CmLaeALN9(CmLaeA基因转化菌株LN9)、AsLaeALN9(AsLaeA基因转化菌株LN9)、CmLaeACm01(CmLaeA基因转化菌株Cm01)、AsLaeACm01(AsLaeA基因转化菌株Cm01),结果表明:与野生型菌株相比,过表达菌株CmLaeACm01、AsLaeALN9、AsLaeACm01的虫草素含量提高(2.5倍),CmLaeACm01的分生孢子产量提高(1.5倍)、出草时间提前5~7 d。LaeA的调控作用因不同来源的LaeA和不同的宿主菌而异。 展开更多
关键词 蛹虫草 LAEA 子实体发育 虫草素
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斑玉蕈交配型位点结构及其多态性分析 被引量:5
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作者 马丽娟 李晓玲 +3 位作者 鲍大鹏 尚俊军 周陈力 杨瑞恒 《食用菌学报》 CSCD 北大核心 2022年第2期23-30,共8页
为探讨斑玉蕈(Hypsizygus marmoreus)交配型位点结构及其多态性,通过制备双核菌株H3、X3和B3的原生质体及再生获得其单核菌株,分别命名为H3-1、X3-1、B3-1,其他按顺序编号;H3-1、X3-1、B3-1分别与同一菌株的其他单核菌株两两配对,各选取... 为探讨斑玉蕈(Hypsizygus marmoreus)交配型位点结构及其多态性,通过制备双核菌株H3、X3和B3的原生质体及再生获得其单核菌株,分别命名为H3-1、X3-1、B3-1,其他按顺序编号;H3-1、X3-1、B3-1分别与同一菌株的其他单核菌株两两配对,各选取1对亲和单核菌株,两两配对测定交配型,采用生物信息学分析比较基因组重测序后不同单核菌株的A和B交配型位点结构及其多态性。结果表明:双核菌株H3、X3、B3分别分离得到2、13、5对亲和单核菌株,各选取的1对亲和单核菌株两两配对,确定6个单核菌株H3-1、H3-8、X3-1、X3-13、B3-1、B3-2的交配型分别为A1B1、A2B2、A1B3、A3B1、A4B1、A5B4;6个单核菌株的A交配型位点两翼紧邻MIP和B-fg保守基因,且HD2.2结构域共线性良好,单核菌株H3-8和B3-1的A交配型位点结构完全相同,6个单核菌株共包括5种A交配型位点结构,表明A交配型位点具有丰富的多态性;单核菌株X3-1包含5个信息素受体,单核菌株X3-13、H3-1、B3-2均包含7个信息素受体,单核菌株H3-8、B3-1均包含6个信息素受体,6个单核菌株B交配型位点共包括4种,单核菌株H3-1、X3-13、B3-1、H3-8、B3-2均包含1个信息素前体,单核菌株X3-1包含2个信息素前体,B交配型位点结构上下游基因的共线性较差,表明B交配型位点具有丰富的多态性。 展开更多
关键词 斑玉蕈 原生质体 交配型位点 亲和
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短期高原抗阻练习对人骨骼肌的影响及基因芯片分析 被引量:2
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作者 王宁琦 包大鹏 +2 位作者 龚丽景 晏冰 胡扬 《中国运动医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第2期98-108,共11页
目的:通过基因芯片技术筛选短期高原抗阻练习后骨骼肌差异表达基因,运用生物信息学手段筛选关键调控通路,探寻高原抗阻练习对人骨骼肌影响的分子调控机制。方法:12名男性大学生分为对照组(C组,n=6)和训练组(HR组,n=6)。C组和HR组在海拔3... 目的:通过基因芯片技术筛选短期高原抗阻练习后骨骼肌差异表达基因,运用生物信息学手段筛选关键调控通路,探寻高原抗阻练习对人骨骼肌影响的分子调控机制。方法:12名男性大学生分为对照组(C组,n=6)和训练组(HR组,n=6)。C组和HR组在海拔3700米高原(拉萨)暴露10天。两组的饮食和日常生活与平原保持一致。HR组以负重深蹲练习(75%1RM)为主要锻炼方式进行隔日抗阻练习,每组重复10次,组间间歇1分钟,共5组。两组受试者的所有测试均在高原暴露前后的常氧环境中进行,利用核磁共振、双能X线吸收法分别测试大腿肌肉横截面积(cross sectional area,CSA)和体成分;对股外侧肌中部肌肉进行活检;采用Agilent人基因表达谱芯片分析差异表达基因。利用Gene ontology和KEGG数据库对差异基因进行基因注解和通路分析;利用荧光实时定量PCR(RT-qPCR)对HR组芯片进行验证。结果:(1)10天高原暴露后,仅C组的瘦体重和CSA出现显著性下降。(2)通过1.5倍差异基因筛选,HR组有432个差异基因,C组有454个差异基因。(3)经KEGG分析,高原暴露后C组和HR组分别有4条和11条信号通路具有统计学意义,同时发现FOXO(forkhead box)、胰岛素和ErbB(erythroblastic oncogene B)等调控骨骼肌体积的信号通路中有差异基因富集。结论:高原抗阻练习可有效减缓低氧诱导的骨骼肌萎缩,维持肌肉质量。高原抗阻练习对骨骼肌的影响可能涉及FOXO、ErbB以及胰岛素信号通路中相关基因的变化。 展开更多
关键词 高原 抗阻练习 骨骼肌 基因芯片
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异宗配合食用真菌双核体和单核体相关概念辨析 被引量:2
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作者 鲍大鹏 徐建平 +1 位作者 潘迎捷 谭琦 《食用菌学报》 CSCD 北大核心 2024年第4期1-11,共11页
回顾双核体和单核体在食用真菌中的研究历程,明晰其应用范围,详解有性单核体和无性单核体的形成方式,阐明双核体特有的离配和再配生物学现象;运用核相交替和核相互换两个基本概念,描述双核体和单核体之间通过有基因重组和无基因重组发... 回顾双核体和单核体在食用真菌中的研究历程,明晰其应用范围,详解有性单核体和无性单核体的形成方式,阐明双核体特有的离配和再配生物学现象;运用核相交替和核相互换两个基本概念,描述双核体和单核体之间通过有基因重组和无基因重组发生转换的两种路径;阐述交配过程中双核体和单核体承担的雄性角色和雌性角色等性角色,以及可能存在的雄性竞争和雌性挑选等性选择。厘清双核体和单核体相关概念,激励相关研究者能够围绕双核体生物学蕴藏的科学问题展开独立的思考和积极的探索,以促进我国食用真菌学科的建设。 展开更多
关键词 食用真菌 双核体 单核体 核相交替 性角色
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