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基于数据挖掘及网络药理学分析中医药治疗骨髓炎用药规律及核心药物作用机制
1
作者
陈晖
柯道泽
+4 位作者
卢泽声
魏毓麟
王松洋
黄培镇
曾展鹏
《新中医》
2025年第21期180-186,共7页
目的:基于文献数据挖掘分析中医药治疗骨髓炎的用药规律,并应用网络药理学方法分析核心药物的作用靶点。方法:检索中国学术期刊服务平台(CNKI)、万方数据库、维普中文科技期刊数据库、PubMed、Embase、WebofScience自建库至2025年3月1...
目的:基于文献数据挖掘分析中医药治疗骨髓炎的用药规律,并应用网络药理学方法分析核心药物的作用靶点。方法:检索中国学术期刊服务平台(CNKI)、万方数据库、维普中文科技期刊数据库、PubMed、Embase、WebofScience自建库至2025年3月1日公开发表的中医药治疗骨髓炎的文献,全文阅读获取中药处方数据,运用Excel、Python、Cytoscape3.10.3、SPSS Modeler18.0进行中药频次、性味归经统计及关联规则分析、聚类分析。以获得的核心中药为研究对象,从中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取有效成分及靶点,通过UniProt数据库校正,在比较毒理基因组学数据库(CTD)、GeneCards数据库、人类孟德尔遗传数据库(OMIM)检索与骨髓炎相关的疾病基因,进行交集分析获得共同基因,利用Cytoscape获得核心靶点蛋白质互作(PPI)网络图。将药物-疾病交集靶点导入Metascape数据库进行基因本体(GO)功能及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:纳入文献246篇,处方249首,中药204味、32类,补气药、清热解毒药、补血及活血止痛药最多。药物药性以温、寒、平为主,药味以甘、苦、辛居多,归经以肝、脾、肺三经为主。关联规则分析得出关联性最强的药物组合为蒲公英-金银花、白术-黄芪、党参-黄芪,聚类分析获得5组处方。以“当归-金银花-甘草-黄芪”为核心药物,获得137个活性成分及对应靶点242个,与骨髓炎靶点11888取交集获得217个交集靶点。交集靶点GO分析主要富集到有机环状化合物反应、异源物质刺激反应等生物过程,膜微区、膜微结构域等细胞组成,以及类泛素蛋白连接酶结合、激酶结合等分子功能;KEGG通路富集主要涉及癌症通路、脂质与动脉粥样硬化通路以及转录失调等。筛选出3个关键活性成分槲皮素、豆甾醇、甘草酚及前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)、肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素(IL)-6、蛋白激酶1(AKT1)、信号转导和转录激活因子3(STAT3)等核心靶点。分子对接验证显示关键活性成分及核心靶点对接结合能均<-5kcal/mol。结论:骨髓炎的病因病机为热毒蕴结、气血不足、瘀滞和肝肾亏虚,标本兼治、扶正祛邪是基本治则,有清热解毒、活血化瘀、益气养血、补益肝肾等法,核心药物可能通过槲皮素、豆甾醇、甘草酚、山奈酚等成分作用于TNF、IL-6、AKT1、STAT3等靶点,干预炎症因子生成、影响成骨细胞分化、调控血管生成,发挥治疗骨髓炎的作用。
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关键词
骨髓炎
中医药
数据挖掘
用药规律
网络药理学
药物靶点
作用机制
原文传递
题名
基于数据挖掘及网络药理学分析中医药治疗骨髓炎用药规律及核心药物作用机制
1
作者
陈晖
柯道泽
卢泽声
魏毓麟
王松洋
黄培镇
曾展鹏
机构
广州中医药大学第一临床医学院
广州中医药大学第一附属医院
出处
《新中医》
2025年第21期180-186,共7页
基金
国家中医药传承创新中心科研专项项目(2022QN10)。
文摘
目的:基于文献数据挖掘分析中医药治疗骨髓炎的用药规律,并应用网络药理学方法分析核心药物的作用靶点。方法:检索中国学术期刊服务平台(CNKI)、万方数据库、维普中文科技期刊数据库、PubMed、Embase、WebofScience自建库至2025年3月1日公开发表的中医药治疗骨髓炎的文献,全文阅读获取中药处方数据,运用Excel、Python、Cytoscape3.10.3、SPSS Modeler18.0进行中药频次、性味归经统计及关联规则分析、聚类分析。以获得的核心中药为研究对象,从中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取有效成分及靶点,通过UniProt数据库校正,在比较毒理基因组学数据库(CTD)、GeneCards数据库、人类孟德尔遗传数据库(OMIM)检索与骨髓炎相关的疾病基因,进行交集分析获得共同基因,利用Cytoscape获得核心靶点蛋白质互作(PPI)网络图。将药物-疾病交集靶点导入Metascape数据库进行基因本体(GO)功能及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:纳入文献246篇,处方249首,中药204味、32类,补气药、清热解毒药、补血及活血止痛药最多。药物药性以温、寒、平为主,药味以甘、苦、辛居多,归经以肝、脾、肺三经为主。关联规则分析得出关联性最强的药物组合为蒲公英-金银花、白术-黄芪、党参-黄芪,聚类分析获得5组处方。以“当归-金银花-甘草-黄芪”为核心药物,获得137个活性成分及对应靶点242个,与骨髓炎靶点11888取交集获得217个交集靶点。交集靶点GO分析主要富集到有机环状化合物反应、异源物质刺激反应等生物过程,膜微区、膜微结构域等细胞组成,以及类泛素蛋白连接酶结合、激酶结合等分子功能;KEGG通路富集主要涉及癌症通路、脂质与动脉粥样硬化通路以及转录失调等。筛选出3个关键活性成分槲皮素、豆甾醇、甘草酚及前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)、肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素(IL)-6、蛋白激酶1(AKT1)、信号转导和转录激活因子3(STAT3)等核心靶点。分子对接验证显示关键活性成分及核心靶点对接结合能均<-5kcal/mol。结论:骨髓炎的病因病机为热毒蕴结、气血不足、瘀滞和肝肾亏虚,标本兼治、扶正祛邪是基本治则,有清热解毒、活血化瘀、益气养血、补益肝肾等法,核心药物可能通过槲皮素、豆甾醇、甘草酚、山奈酚等成分作用于TNF、IL-6、AKT1、STAT3等靶点,干预炎症因子生成、影响成骨细胞分化、调控血管生成,发挥治疗骨髓炎的作用。
关键词
骨髓炎
中医药
数据挖掘
用药规律
网络药理学
药物靶点
作用机制
Keywords
Osteomyelitis
Chinese medicine
Data mining
Medication patterns
Network pharmacology
Medicine targets
Mechanism of action
分类号
R285 [医药卫生—中药学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于数据挖掘及网络药理学分析中医药治疗骨髓炎用药规律及核心药物作用机制
陈晖
柯道泽
卢泽声
魏毓麟
王松洋
黄培镇
曾展鹏
《新中医》
2025
0
原文传递
已选择
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参考文献
引证文献
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